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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi2g1v0313300 |
| Transcript ID | LotjaGi2g1v0313300.2 |
| Related isoforms 3 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Zinc finger MYND domain-containing protein 15; TAIR: AT1G70150.1 zinc ion binding protein; Swiss-Prot: sp|Q8C0R7|ZMY15_MOUSE Zinc finger MYND domain-containing protein 15; TrEMBL-Plants: tr|I1J5F5|I1J5F5_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0313300 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:78810531..78819614) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CGGCTACAAAAGAAACATAATAGCGTGTGATGGTCGGAGCAAGGCAGAGAATGGAGTGCGCGGCAAAGGGGAGCGGAACA CGGTGTAGCGCCACCGCCACGAGACTCTGTGCTCGCTGCGAAGTCGTTGCTTATTGCTCTCTCCCTCACCAGGTTCGCTT CAACTTCTCTTCACCAATTTTCAATCCCATGTCTTTGCTTATTGCATTACTCAAAATCTCAGTTAGCTAGCGTTTCACAT TCACATAGCTTCAATGCTTCGCGTTTTGCCTCATAGATTGCGCACTGGAATCACCACAAACTCGAGTGCGAGAGGTTGCA ACAACAGAAGGAGAGTATCGATGTCGTCAATGATTATCCGTTTACTTTTTCCAATGAAGCCACGTTCAAGGTGATCATTA ATCTTCTCACTACTTTTCAATATGATGAATTTGTTCTCTTTTTTGTGGTGTTTAGCTGATGTTCATGTAATTTTGACAGG TTTGTGCGAAGCAGGAAACTAGATGTTCATTTTTGAGCAAGAGAGGCCTTCATCAAGTGGGAATGTGGATGCATGAATGC CAATGTGGGGCATCATCTGCTTCATTTGATTGTTTAGGGTTTTCTCTTATTTCCTTCCTCTTATGAAATGTATATTTTGG TCGCGATCGAAAGAGCTTAATTGAGCTTATAACATAATCGCTTATTCAAGTATTTGGATAAACTTGTTGAATAGCTTATG GCATATCCATAAGCTGTTTTAAACTTATTTTCAAAAGTTTCTTAGATTACTTTATGTATAAGATCTTATAACTATCGATA AGCTATTTTGAGCTTATTTCAGTAAGTTTTTCAAATTAGCTTATGAAGAAGCTCTTAATGTCGTAAGTGCTTAATTAAGC TGCTTACTTAAACACACCATAATTAAACTTCTATTTGTTCGAGTGAACAGTTATATTTTGAATTGAGAACAATCCAGTAA 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AATGAAAAGGTATAAAGAAGAATCTTATACTCTTTTTCTACAACACTCACACGTACTCATTTATACATGTGAAAAGTTCT TTACCAAATTCAATTTGTTTTAAAACGTTCCGAACTTCATATTACCAATTTACCATCATTTAGTGCCTAGTAAACAGTGA ACTTCGTATTTGACTCATAGTTGCTGAGGGTATTCACTGATCTCCATCCACTTTGTACTGAATATAACTTAACTCGATGA CCTGTCTTTGTGCAGGGTGAAGAAATAATAGTGGTAATTCCATGGCATGAATGGTGGGAGTTGGCTCTTAAAGATGGCTC GAACCCTCAGATAGCCTTGCTTCCCCTGCATCCGGAGTTGCGTGCAAAATTCAACTCTACTGCAGCATGGGAGTATGCGC GGAGCATGTCTGGCAAGCCATATGGTTATCACAATATGATATTCAGTTGGATTGACACAGCAGCTGACAACTATCCTCCA CCTCTTGATGCTCACTTGGTATTAATCCTTTCCTTATTTGTGTAAAGAGTAACACCACTATGCAAGAAAAAAGGTTCGCA GGTTCTCCCCTGTGTTTCTGTAATACTGAACTTCTAAGCAATGAATCAACTAATCTCAACCCTTCATTTATCCTGTGGGT CTCAAATACAAAAGAAACATATATGGCATACTCTCTTGTTGATATTGTAGGCTCTGATTTTCCACGAGTAGTCTGTTTGA ATGACATGTTCTTTGCAGGTAACTTCTGTCATGTCTATGTGGACAAGAATGCAGCCAGCTTATGCTGCAAACATGTGGAA TGAAGCGCTGAATAAGCGGTTAGGGACTGAGGTATATTTTATTTTACTCTTTTACCATATAAAGACATTTACATGTATAT ATTATCTTGTATAACATTTTACCTATTTTTTAGTCAAATTGTTCCCTTTTACCTTGTGTGGAACAATTCTCAGCCAGAAC AAGTAGTGGACATAGGTTTAACTTGTAAATGACCTCGCAGTTTATCTGGTGCTATTTTAACATTGATGGCAAGACAAATT ACAAAAGATTTGAGATAAAACTTCTGTATGGTTTTTTAAATTTTTTTATTTAGGATTTCCTTTTCATATTGCTTGTAAAA TTGGTCTCTAAGGTCTCTTCTGTTGAAACCTTGACTTTGTTACAATATGGAAGTTTTTTTTGTCAAATGTGAATTTTTTT CCAAGTCATGAGTTCATTGATGGTAAATACTATATTCTAGCTTATATATAAATTTCTTAAAGTTTATGTATTGCTTGTAC TAAGCATCAAATGGTTAAATAGTTCCCATCCCAAATTCCATTGAATATGTAAGTCTTAAATTATATTTTATCCATTGCAG GAACTCCAAGAGCATATTATTATTTATCATGAACTGCTGACAAATTTACATTTCGTGGGATCTCATTTCTTTGTGCTTTC AGGGTTTAGATTTACATGATATTCTAGTTGAGACAGAGAAACGTGGGATTACTTTTGATGAATTGCTTACCATTCCTGAA CAAGATGAATGGGTATACAGTGATGGGAAGTCAACAACATGTGTTGCCTTTATTCTTTCAATGTATAAAGAGGCTGGAAT CTTTGGTCCCATTTCTAGCTCAATTCAAGTAACTGAATTCACAGTAAGCCATATGTTTGCCTTGGTTATTGGATTAACCT CCGGTCGTCATAATTGCTCCTCCTTATGTTTCTATGTTGTTATTTGCAGATTCGTGATGCATACATGCTTAGAATATTTG AGGATAACCAAACGCGCCTACCAAGATGGTGCAACAATGAGAATGACGGGCTTCCATTCTGCCAGATTCTTGGTGAATAC AGGATGGAATTGCCTGGCTATAACACGTTGGATCCATATCCTAATATGAACGAGCACTGTCCTTCCCTTCCTCCCACTTA TGATAGGCCTTCACAATGTTAGATCCATCTCATTTCCGTTTCTTGATTTGCTGGTTGTCTGTAACTTGACTACAGGTTAT CTAGTTGTTTGCTAGTGTGCAGTTGACTATAAACCAGGGATAAAATTCAGTATGTAAGTTCACCTTTTCCTTTTTAAGTT GAATTGAAGTATTTATTATACATAATCAAACAACTCTTGGTGGGTATGGTGTGATGATGTAAACTTTCAAATATCAACTC TTAGGATAATTACCTAAGTTTCTTGATGAACATTCATCTCTTGCATAGTCATAAATCATGGTTAATTATTGGATGAAAAA GTAATGGGAGGATATAGAGAGGGACAACGATCTGCATTCCACATGGATCTCTAAATATTTGATATGATGTGGAAAAATTA GTAAACGTATGAGATGTCATGTCATAGTTACTTAAATATGTGGG
CDS sequence (LotjaGi2g1v0313300.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGTCGGAGCAAGGCAGAGAATGGAGTGCGCGGCAAAGGGGAGCGGAACACGGTGTAGCGCCACCGCCACGAGACTCTG TGCTCGCTGCGAAGTCGTTGCTTATTGCTCTCTCCCTCACCAGATTGCGCACTGGAATCACCACAAACTCGAGTGCGAGA GGTTGCAACAACAGAAGGAGAGTATCGATGTCGTCAATGATTATCCGTTTACTTTTTCCAATGAAGCCACGTTCAAGGTT TGTGCGAAGCAGGAAACTAGATGTTCATTTTTGAGCAAGAGAGGCCTTCATCAAGTGGGAATGTGGATGCATGAATGCCA ATGTGGGGCATCATCTGCTTCATTTGATTGTTTAGGGTTAAACAGTGGCTGGGATCTCCCTAGTGTTTTGTGTCCATGTT GTGGGCCTGATTCTCCACTATCAGAGCAATTGCATAGTTGGAGAGACTACTACAAGTGGAGGACCATCCCTCTTGATTCA CCTGTTGCTTTGCTCCTTCACTGGCCACTTACAATATATCATGCTGCTCAACTTGTTGGAAAGTCAACCTTGAATCAAGA AGTCGGAGATAAGTTGTACATACATTACCTTGGACCTGAGAAAGAGCTGCTACAACTTGCTGTGTTTGGAGAATTACAGG CCCTCTTCCCTGGTGTACACATTCATATAGAACTTGTTGGACCTGCAGTTCCTCCTCATAGGGACGGTGAGAAGATCAGC ATTTCTAGGTATCCTTGTTGCAATGAAGATGAGTGTGAGTGCAAACTAGCGAGTGAAAATATGATCATAGGAGCACAAAC TGGTACCACTTCGAAGCTGACATTGCAGCTTTGGCGAGGATTCTACCATGACCGATACATAGATATGGTTAAGAATTCCT CCCCTCACCTTGTGATTGCTCCTAATGGTGGAATTGCTGCCTACTCAAGCTGGTTACCAAGTATTGAGTTAATTAAAAAG ATTGATATCCCAGCTGTTTTTACTGATTATTGTGAGGAAGCTTGTAATCTTGCAGCAAGTTGCATTGAGTCTGTAACTGG ACATCCTCTTAGATTGCCAGTTCAGTTAAATCCTTTCAGGCAGCCTTTGGCCGTGGAAGGCAGCGTGCTGTTGCTTCCCT GCTACTCAAATTGCTTTCTATTTGGGATGTAA
Protein sequence (LotjaGi2g1v0313300.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MVGARQRMECAAKGSGTRCSATATRLCARCEVVAYCSLPHQIAHWNHHKLECERLQQQKESIDVVNDYPFTFSNEATFKV CAKQETRCSFLSKRGLHQVGMWMHECQCGASSASFDCLGLNSGWDLPSVLCPCCGPDSPLSEQLHSWRDYYKWRTIPLDS PVALLLHWPLTIYHAAQLVGKSTLNQEVGDKLYIHYLGPEKELLQLAVFGELQALFPGVHIHIELVGPAVPPHRDGEKIS ISRYPCCNEDECECKLASENMIIGAQTGTTSKLTLQLWRGFYHDRYIDMVKNSSPHLVIAPNGGIAAYSSWLPSIELIKK IDIPAVFTDYCEEACNLAASCIESVTGHPLRLPVQLNPFRQPLAVEGSVLLLPCYSNCFLFGM
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Gene3D | 4 | 59 | 56 | 5.7E-9 | – | |
| PANTHER | 7 | 383 | 377 | 4.9E-171 | – | |
| PANTHER | 7 | 383 | 377 | 4.9E-171 | – | |
| ProSiteProfiles | 16 | 52 | 37 | 9.33 | ||
| SUPERFAMILY | 18 | 57 | 40 | 2.62E-9 | – | |
| Pfam | 18 | 52 | 35 | 3.6E-7 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi2g1v0313300.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…