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LotjaGi2g1v0341500.3

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi2g1v0341500
Transcript ID LotjaGi2g1v0341500.3
Related isoforms 3
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description ENHANCED DISEASE RESISTANCE 2; TAIR: AT4G19040.1 ENHANCED DISEASE RESISTANCE 2; Swiss-Prot: sp|F4JSE7|EDR2_ARATH Protein ENHANCED DISEASE RESISTANCE 2; TrEMBL-Plants: tr|A0A151THD4|A0A151THD4_CAJCA Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0341500
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr2:81852842..81862269) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

AGTATTACAAGATTAAATACACGTTGCCTTAAGCTATTTAGAGATTTACCATAGTGATAGTGATTGTGTTCTTCTAAAAT TTTACCCACTTTTTTTTTGTGCAGATGGTTTATGTTTTGTGTGTTTACAACAAGAAAGAAAAGAACCATCGAATTATGGT GAGTGGATTTTCCTCATTCATATATCTTTTTATCCATAAGGAATTTTGTGCAACTTTTAAATAATTTATTCATTTTTTCT TAAATAATATTGTGGATGCTGAATAAATATTTTATTTATCACTCGGGTTGTTGCAGATGGCAGCATTTAATATCCAAGAG GCCCTAATCTGGAAGGAAAAAATTGAGTATGTCATTGATCAGGTCAGTTTTATCAAATTGCATAATCATGCTATGCTCTT TAATGTGGATCAATATCCATCTTCTTAAGTTTCTGGTTAGACTTCATTTCTCCCTGATGTATATCAACATGAAATATGAT AAGCATTTTCGCTGGATACATGGATAAAATGATAGGCTGAAATCTTAGTGACTTTGTAAATTCATCTTAGTAGGACATGT CTTCCTTTCGTGTAAGTTGATGCTATTGAGCTTCAATGTATGCAGCATCAGGGAGCACAGCCATCAAATGGCAACAAGTA TATTTCTTTTGAGTACAAATCTGGAATGGACAATGGGAAGACAGCTTCTTCCTCAGACCGTGAAAGCCAGTAAGTATTTT GGTACTGAGTTTTTCCACCTACAGTTTATTGAAGATGGCAACATTTAATGCTTAATTGCTTTTAATGCTGTTGTTTCCTA TGTTGTTGAATTATGTCTGTCTTCTTTCAGAAAAGTTTTCTATCATTCCAGTCTATTCTTTGGATATGCAACTGAAATAA TTCATTGAGACATGCTATATCATGATTTAGTTATCTTTAGCCTTTTTTCCACTGCTGATCAAATATCATTGTGGGATTCT AATGTTATTGTGCACATCCTTCGATATATTCATGACATCCAATTTTTTTTTTGTTGATCACTAGGTTCAGTGCTCAGGAG GATGAAGATGAGTCTCAACCAAATTTGTTAAGGAGGACAACAATTGGAAATGGTCTACCTTGTTTCCCTTCTGCTTGTGG GATTGCAATTACTCTGCTACAGTCTGTATTTACACCTTGTCTTTTTTGAGCTGCAGGTCCTCCTGAATCAATTTTTGACT GGACACGAGAAATTGATTCAGATTTGTCAAATCAGAATATCAATAACCAAGCATTTTCAAGAAAGCATTGGCGTCTTTTA CAATGCCAAAATGGTTTGTTACATTCATTTACATGATAGTTCAGTTTACTGTTGTGGTGAGAAAAAAGAAGTTATTCCAG GGATATATTCTAATGCTTAAATTATTGGATATGTTGTAATTTATAAAATGAGGTGATTTTCCTTCTGAAATTGACAGGAC TTCGTATTTTTGAAGAACTTCTTGAAGTTGACTACCTTGTGCGTTATTTCCTGTCTCTCATCACTTTTGTTGTTGCTACA TTTCATAGAATATTTTGGGAAACACAATCATCTTCAATTCGGTTCTTTATGTAGCCAAGGAGCTGTAGTAGAGCTATGAA GGCAGTGGGTGTTGTGGAGGCCAGTTGTGAAGAAATTTTTGAGCTTGTAATGAGCATGGATGGGACACGGTTTGAGTAGG TGTTCCACATGCTGCCACTTTTTTATGTTGCTGTGTATTTGTGTTGTCATAGTATAATTTATGACATGTTATGTGTTATT CCTTTTTGTTTCTCAGAAAAATTGTCTTGATGAAGGGAAGGTATCTAAGTTAACAGACATTTTACAAGATTGTGATGTCA TCTAATATGTACTTACATATGTAAAATCAGAATACCTAATATACCCAACATTTTAGTTAGCCACTGCGTTGGAATTTTCA 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CAACAACTGAAAAGAGTTTTACCAATTTCCATTTGCTCCAAGCATAAAAGCTAAGTGATGATTTAATTTGAAGCATAATA ATATCCATTATTCCACCCCAGCTATACCTCAGTTATCGGGGTCTATTTGCTATGTTACCCGTTGTGTGAAAATATTCGAG ACCTATTGTAGGCTTTTTGTCAGTTGCATATGTGAAAGGATTCCATTATTGTAGACCTATACTCGGCAGCATTTAAAAAT GTAATGAAATTCTATGTTGAGCCTTTATTAGACAGGATATGGACTACGAAAGTGGAGCTAATCTCTTCTTTTTTTTCATG ACATTTTTTATGCATTTTTTTATACTGAAGAATTCCATTAAAACTGATTCTCTAAACCAAAAAGCCGTCATTCAATTTGA AAATGTATCTTTGAAGCAATAAAGTTCTCTTAAATGACCTGGGATTTAAATAGTGTCCTCCATGACTGCACCTCGTAATC ACAAACCTGCGTTCTGGCTTAAACACCTAGCTGCAGATGAAGACAGGGCCCCCAAACTAAACCCATCTGCAACAAAATCA CGTTGACTAAGGGAGGGTGGTATATTTTTTAAAATAGGAGGGGTATTGGTTGTCATAATCTCAGACCTCAATTAGGTGAA TTTAATTTCTCTAGTTATTTATAATTTATGTAAGCTGTTTGGTGATGGTTGTCTCTTTTCTGTTGTTGTTTTATTTTTTT GGTAGGCCTTTGCTGACAATACCCCTAATCTTTGGGTGTCTATGCAGGTTGCATCAGAAAAAGGATTTTTCTCCTTTATC ATCAATCTTCAAGTGAGTCCTTCATTGCACTATATGAATCAACTTTGAACTTCAGTGGTTTAAAGTCTTGAAGTAAATTG ATTCACGCTGTTTGGCTGCAGGTGCCCGGATCAACCCACTACAGTATGGTGTTCTATTTTGTGACAAAGGAGCTAGTTCC TGGATCCCTTTTGCAACGGTTTGTTGATGGTGATGATGAATTCCGAAACAGCAGGTTTAAGCTCATCCCATCAGTTCCAA AGGTATTTACTGACATTTGTCATCATATACATCAGACAATTTACACTGGCTTTGCAAGATAAAGTTATTATTTGTGGGTG TGTCATTGTTGTGAATCAAAACCTGATGTCCGCACATTCTTATGTAGTTATTGTCAAGAACCAATTATCCCAAAATCTTA AGCTATTGGGTAATGGACCTTTAATGGTTTTATATTATATTTCTAACACGCTCTCTCACGCAATAGCTCACTTGGGCTTG AAACATGGACAATGCACTAGCCCACCAACCATTTGCTGAAATTAAACTTTTTTTATTAGAATAGTTGGGGCAAGGCAACA AGGATCGAACTCTAGACCACTTGGTCATAGAGGCTCTGATACCATGTCACAGAACCAATTATTCCAAAAGCTTAAGCTGT TGGGTAATGGACTTTTAATGGGTAACATTCACATCTATATATTGACCTATATAACCCTGTAATTCACTTAGTCAATCCCT AAAATTAAGGGATTCCATCTTGTATTGATCTACTATAAATTCAAAAGGCTTACTATCTAATGAAATTTTCAGTTTCATCT AAATTAAATTCTCTCAAGTGTCTCGGCAGCCAAGTTCATAGCTTAGAAAATTAATCTAAAAAAGATGGGTCAAATATAGG ATGTCCAAGTTTATTGAATTTAACCGGTTTTGATCAAGTGCATCCAAGTGTTCATGAAAAAAAGTTTGAAAACTGCTGGT TCAAGCACTTGCTCCAAATATGGAAATATCATTTTGCTTTGTTTACTTTCTGAGGTTTAACTTCATACTTTTTAAAACAA ATGCACCCTCAGTTGATATATGCTACAGCCTGGCACCATTTTGGTGCATATATATTTGGTCTTGTGCTATTGATATGTCT GACTCTTTTGTTCCCATATTTTGGTATCATAGACTAGGACTTTAACATTTACTCCATTTATATTTATGTTTTTTCCTTTT TTGTCTTCCCTTCTTCTATTTGTTATTTATAATTACTATTGTTTGATATAGACATAAGAAACAAAATACTGTTTAATTTT TCTCATTCCTTATTGATTTTCAACTTAAAAAATGCAGGGCTCATGGATTGTACGCCAAAGTGTTGGGAGTACTCCTTGTT TACTGGGAAAGGCAGTTGATTGCAACTATATTCGCGGTCCCAAGTATTTAGAAGTAAGTCATGCAAATTCTATATAAATT TTTCTGTTCTTGTTGTATGAAGTTTCCCATTAATGAATGACTTACATACCCTCACTTTTCTGCCATGATTGTTTAACCAA TTATTTTTTATTTGTAGATTGATGTAGATATTGGTTCTTCTACGGTTGCTAATGGAGTTTTGGGGCTGGTTGTTGGTGTG ATTACAACATTGGTGGTTGATATGGCTTTTCTTGTACAGGTATGTTTTCTATGGTGTAGAATTTTATATGCTAGTAATGA ACATGTTTGATAACTGTTTCCAAAACAGTTTTCAGTTTTTAAAAACTGAAAACTTGTTTGGTAAGATCTGTTTTCAAAAA CAGTTTTTGAAAACAGTTCTCATTTTCAGTTTTTAAAACTAAAAAACCAAAATAGGTAAAAGATGTTTTCAGTTTCAGTT TTTAGTTTTCAGATATCAGTTTTCTAAATGTTCGAAAACATGTCATTCAAACTGTTTTCTTCTTCTGAAAACTATTTTTA AGAATTGTTTCTGAAAACTGTTTTAAAAACTGAAAACTAAAACTGCTATCAAACAGGCTCCTAATCTTGTTTTTTGAAAG TAATGAACATCTAATCAAGTCATGGTATTTTTGTTTTGGGGGGGGGGGGGCAATTGGACTGGATCTATTTGCTTGTTGTA TTCAGTGTGGAAACTTTTATATTCATTTTTTAAATAGCATAATGTTACTATTATTTTACATTTTTCAGGGGAAAAAGTTG TTTTCACTATTTCTTGCACAAAACTTTGAACACAGGGAACAAAGTAAAAAAAAACGTGGCTTCTAGTTTTTTATTAGAAG TAAAAACATCAAATGAAAATATTTCTTTTTTCCTAGCCAAACAGGCCGGAAATCTGTTGCATATAGGACTGGAACCAAAC CATATACTTTTCTTGTTTGAAATCTTCGTACAGTTTTATGTGAACATCTTGAATGGGTTTAAATTCTAAATGTTGGGGAC TTCCTCACACAACCTAGTATTTGTGAGTTAAATAATATTGATAATGACCATATTTGTGGACGGTTTTTTCCTCTCCTTTT TTTCAAATTAAATTGAATATTAGCTTTTGTGGAGGATTCTATCGCAGGAATATTAAATTAAATTATTTTTAAATCGTGGC TTTACTATTATGTCTAGGCACGAATATGTGCTTGTGAGGTAAAAATTGTACTTGGTTATGAATAAGTGCTTGACATGTGA GTAATTTTCACAATGCATTGGTTGTCAGTTCATTGACATATTTTTGGTTGTACTGTTTTTTGTTTTGATAAGCTTTTTGG TTTTTCTGTGGAATGATGATAAAATTGTTACAATTGACAGGCAAATACTCCTGATGAGTTGCCCGAGAGGCTTATTGGAG CTGTTCGTGTTTCTCATTTAGAGCTTAAATCGGCCATAGTCCCGAAACTGGAACCAGATCTATCTTGA 

CDS sequence (LotjaGi2g1v0341500.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGTTTATGTTTTGTGTGTTTACAACAAGAAAGAAAAGAACCATCGAATTATGATGGCAGCATTTAATATCCAAGAGGC CCTAATCTGGAAGGAAAAAATTGAGTATGTCATTGATCAGCATCAGGGAGCACAGCCATCAAATGGCAACAAGTATATTT CTTTTGAGTACAAATCTGGAATGGACAATGGGAAGACAGCTTCTTCCTCAGACCGTGAAAGCCAGTTCAGTGCTCAGGAG GATGAAGATGAGTCTCAACCAAATTTGTTAAGGAGGACAACAATTGGAAATGGTCCTCCTGAATCAATTTTTGACTGGAC ACGAGAAATTGATTCAGATTTGTCAAATCAGAATATCAATAACCAAGCATTTTCAAGAAAGCATTGGCGTCTTTTACAAT GCCAAAATGGACTTCGTATTTTTGAAGAACTTCTTGAAGTTGACTACCTTCCAAGGAGCTGTAGTAGAGCTATGAAGGCA GTGGGTGTTGTGGAGGCCAGTTGTGAAGAAATTTTTGAGCTTGTAATGAGCATGGATGGGACACGGTTTGAATGGGATTG CAGTTTCCAACACGGTAGTTTAGTTGAGGAGGTGGATGGGCATACCGCTATTCTCTATCACCGACTTCTGCTGGACTGGT TCCCAATGTTTGTATGGCCTCGTGATCTTTGTTATGTACGTTACTGGCGGCGAAATGATGATGGAAGTTATGTGGTTTTA TTTCGCTCTAGGGAACATGAGAATTGCAGTCCACAGCCAGGGTGTGTTCGGGCACATATTGAGAGTGGAGGATATAATAT TTCCCCTTTAAAACCTCGAAATGGGAGGCCCAGGACACAAGTCCAGCATCTTATGCAGATTGATTTAAAGGGTTGGGGTG CAGGTTACGTACCATCTTTTCAGCAGCATTGTCTCCGCCAAATGTTAAACAGTGTGGCTGGTTTACGTGAATGGTTTGCC CAAGCGGATGAAAGGAGTGCTCCTCCTCGAATTCCCGTAATGGTTAATATGTCCTCAACAGCTGTCTCTTCAAAGGGTCA GAAGCCAAATGATTTATCTATGCATCCTACTTCCCTCGATCAAATAAATTTTGCAAGTAGAAATTCTGCTTTGATGGATG AATATTCTGATGAAGATGAAGATTTTCAAATAGCAGAACCTGAGCAAGAGGCATTCCAAAGTGATCTTGATAATGATGTG AGAAGAATAGCCTTGGAGGAAGAACCAGCAACTGTGATTGACTTATCTTCCTTCTCGGGTAATTTACGCCGAGATGATCG TGATAATGCTCGGGACTGCTGGAAAATTTCTGATGGAAATAACTTCAGAGTCAGAAGCAAGCATTTTTGCCATGACAAAT CAAAGGTTCCTGCGGGCAAGCATTTGCTGGATCTTGTTGCTGTTGATTGGTTTAAGGACTCAAAAAGAATGGACCATGTG GCTAGGCGTAATGGTTGTGCAGCACAAGTTGCATCAGAAAAAGGATTTTTCTCCTTTATCATCAATCTTCAAGTGCCCGG ATCAACCCACTACAGTATGGTGTTCTATTTTGTGACAAAGGAGCTAGTTCCTGGATCCCTTTTGCAACGGTTTGTTGATG GTGATGATGAATTCCGAAACAGCAGGTTTAAGCTCATCCCATCAGTTCCAAAGGGCTCATGGATTGTACGCCAAAGTGTT GGGAGTACTCCTTGTTTACTGGGAAAGGCAGTTGATTGCAACTATATTCGCGGTCCCAAGTATTTAGAAATTGATGTAGA TATTGGTTCTTCTACGGTTGCTAATGGAGTTTTGGGGCTGGTTGTTGGTGTGATTACAACATTGGTGGTTGATATGGCTT TTCTTGTACAGGCAAATACTCCTGATGAGTTGCCCGAGAGGCTTATTGGAGCTGTTCGTGTTTCTCATTTAGAGCTTAAA TCGGCCATAGTCCCGAAACTGGAACCAGATCTATCTTGA 

Protein sequence (LotjaGi2g1v0341500.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MVYVLCVYNKKEKNHRIMMAAFNIQEALIWKEKIEYVIDQHQGAQPSNGNKYISFEYKSGMDNGKTASSSDRESQFSAQE DEDESQPNLLRRTTIGNGPPESIFDWTREIDSDLSNQNINNQAFSRKHWRLLQCQNGLRIFEELLEVDYLPRSCSRAMKA VGVVEASCEEIFELVMSMDGTRFEWDCSFQHGSLVEEVDGHTAILYHRLLLDWFPMFVWPRDLCYVRYWRRNDDGSYVVL FRSREHENCSPQPGCVRAHIESGGYNISPLKPRNGRPRTQVQHLMQIDLKGWGAGYVPSFQQHCLRQMLNSVAGLREWFA QADERSAPPRIPVMVNMSSTAVSSKGQKPNDLSMHPTSLDQINFASRNSALMDEYSDEDEDFQIAEPEQEAFQSDLDNDV RRIALEEEPATVIDLSSFSGNLRRDDRDNARDCWKISDGNNFRVRSKHFCHDKSKVPAGKHLLDLVAVDWFKDSKRMDHV ARRNGCAAQVASEKGFFSFIINLQVPGSTHYSMVFYFVTKELVPGSLLQRFVDGDDEFRNSRFKLIPSVPKGSWIVRQSV GSTPCLLGKAVDCNYIRGPKYLEIDVDIGSSTVANGVLGLVVGVITTLVVDMAFLVQANTPDELPERLIGAVRVSHLELK SAIVPKLEPDLS 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 1 649 649 0.0
PANTHER 1 649 649 0.0
MobiDBLite 63 102 40 -
SMART 109 321 213 8.2E-49
SUPERFAMILY 113 309 197 8.61E-43
CDD 121 321 201 1.03209E-48
ProSiteProfiles 129 311 183 27.127
Gene3D 129 330 202 1.4E-44
Pfam 155 293 139 2.3E-21
Pfam 434 637 204 3.9E-68

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Lipid binding Interacting selectively and non-covalently with a lipid.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi2g1v0341500.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…