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LotjaGi2g1v0462400.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi2g1v0462400
Transcript ID LotjaGi2g1v0462400.1
Related isoforms 4
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Chaperone protein dnaJ, putative; TAIR: AT1G21080.1 DNAJ heat shock N-terminal domain-containing protein; Swiss-Prot: sp|Q8GYX8|DNJ10_ARATH Chaperone protein dnaJ 10; TrEMBL-Plants: tr|A0A0L9T7V2|A0A0L9T7V2_PHAAN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0462400
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr2:95584712..95597694) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

TTATTTATTTAGTTTTTTTTTTGCAATACAATTTTGTTTTCTTAAATACTGGTGAAAGGCAAAAAGTCGGAACCACCGCG GTTCGGAGAGGAAACATTTCACGGCAGTCAACTCCCCGGAGTCCGAAGTCCATTCCAATCAGAGGAGGCGGATTACGCCT GAGCGAGGAGAATAACGCCATTTGATTTTGCGTGAGGATAATACTTAAGATTTTCCCTGCTATTGTTTTTATCGCTTTCG TGTTTTTTCTCTTCATACCCTCTTAGGTTAGTAAAAATCTAATAATTCCAGGCGTTTGCTCATTGGAAAGCTCAATCAAG TGCTCATTGAGATGGTAAAGGAGACCGAATACTATGACGTGCTGGGTGTCAGTCCTTCGGCATCCGAAGCTGAGATTAAG AAAGCTTATTACATGAAGGTCCTGGTCTAATCTATCGATCCCTTGCTTGTCCGCCTCATTTGTTTTCTTGTCATGCGCAA AGGGGCTTAATTAATTGATTATTTGGCCTGAAGAGTTGGTATTACGTAGAGCTACACAATTATTTTGCTTTGCAACCTGT AGCGGACCTCAATGGATCCGTCTAATCCAATATACCGTTTGAATAGACACAATATAGCAGATGCCTATGTCCTATGGCTC GATCTGTCAATTCTGTTAGGTTTTGAAAGAGATGTATACTTGCGTCGAGTGCTTTCTCTTTGCAATACAAGACAAGCTAG CTAGCTTTTACACAATGAATTTCAAATGTTAGCGTTTAGCTTTGAAAAATTGAATTAAAATTTCCTTGTGCCTTGTGTTG TACTTGATTTACATTTTCCATAGTTATCAATTTTTTATCATTTTGTACCAAATTGTTAAATATGATCAAGTGGTTTAATC ACATTATTAATTCCTCTTCTCCTGTCATATATGTGCAGGCACGGCAAGTGCATCCAGATAAAAACCCAAATGACCCTCTT 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TTCAACAGATTTATTCTTCTTTCAGGTGGTTCAGAAGGAAAGAGAAGAAAAACTTGCAGACATACTTAAAAATAGACTCA ACCAATATGTCCAAGGAAACAAAGAGGACTTTGTAAATCAAGCAGAAGCTGAAGTAGCTCGGCTCTCCAGTGCAGGTACA ATGTCCTAAGAATAATATAATTCTAGACATGCAGGGAATAGGACTGGTGAAAACAATTTATTCATACAAATTTAAATGAC CAGAGTTCATTGTTACAGCTCATTTGGATGCTTTTTTCATCCTAAATATCAATCCATGGTTGGAAAAAGTTCTTTGAATC AGTAATTCTTTTGTTTAAAAAATCTTGATATGATCAAAAGAATGACTACATGACATGGAAAAAACCTTTTACTTGATCCC AAGTATTTGACTTGCTGTATTGAACAGTAGTAGCCTAACTTTCCGTAGCAGTATTATCACTCATGTGCTTTTGCTGAGTA AATTAGTTGTCATTATACAGCTTATGGGGTTGATATGCTGAATACAATTGGCTACATATACGCTAGGCAGGCAGCAAAAG AGCTAGGAAAGAAAGCAATTTACTTGGGTGTACCTTTTATTGCTGAGTGGTTTAGAAACAAAGGGCACTTCATCAAATCC CAAGTTACAGCAGCAACAGGTGAGCAAACTTTAGTTATACAACTTTTCTTGGCTGTGTTGTGGTTTCTTGATTTCAATCT TAATCTCGTATTATTTTCTACGTTGCATATTTCCTGAGACTTTGGTGCATCAGATTGACCTTGGCCCATTAAGGCTTTGG TTTAAGTGCAGTGCATTTTTTAGTGCCTCTTTCATCAACATGCTATGGGATGGAATTATGTTTGTTGAAGTTATTAAGGA GTGAAGAGGAAGATAAAGACTAATTTCAACATCAACATATCTAACTAAAGTCAAACAAATCTTGGTTCAAAAAGTCAAAC AAATCTAACTAAAGTAAGATATTCAACAATATACATAGGTTATATCTAATCCAACCTAATTAAGGAATTACAAAGAAATA ATTATCTAATAAAATCTGTACAAATCAAATCTACCCTAATTACAGGAAATTACGAAACAAGAAAATGTGAGAATAAAGAG TCAGATCCTGCTAATTATGGTAACTATGTCGTACAACAGGATTGGACGTTGGGCGCTTAAGAAGAGCCAACAAGAAAAGA AGATCAGGGTTGCAAGATGAGAATTTTATGCTGGATGAGTGGTTACACAAGACAAGATAGGATTAGAAATACAATCATTA GAGAGTCGGGGGGGGGGGAGCTTCTATTGTAGAAAAGATGGAAAAAATGATCCATATTGCTCAACCTCACATAGTGGGAA AAGGCTTTGTTGTTGTTGGTGGTGGCGGTGATGGTGATGCTTACTTAGTTACTTGTCATTGTCAACACTGATGGAGTTCG AGACTCTAAAAAATGGGACCTAGTTGGACTTCATTTTTTGTTTTGTTTTCCATTCTTTTCACCTTGAGGACTGTTGAATA TCTGTTTAGATTTAGTTTACTATTAGTATTATCTCATTGAGATATAGTTTAGATTTGTTTCTCTATTTTAGATTAGTATC TATTTAAATAGAGATAATATCTATTTAAATAGAGATAATATCTATTTAAATAGAGATAGGTTTAGATAGATTTAGTTTCT TTTTATCTCTTTGTTAGTCTATATATATTGTAGTTTTCAGTCAAGTATTAATCAATGAAATACACAATAATTATTTTATC AAATTCAAGTTGGTATCAGAGCGAGTTTCGATCCTACCGCTGTGAGGGGGCTCCTCCCCCGTGAGCCCCCTCATGGTGAC CTTCCAAATCTCTTTGGATTATTTTCACTCGTCCTGTGCTTCCGCGCTTGTTCGTTCTAGCCTTTTCTTACGGCCTCGTT TCTTTCTGATTATGGTCCCCTTTGTCTTGGAACCCTATTGACCCTTGTTTCTTAATACTTAAAACAACCGCGCCTTCTTC TTCGGCGCGTGAAGGTAACGCACAAACCTGAACTCGACGCGACGACCACATACATGTTCGTCCGTTGTAGTATAGTTGGT CAGGATATTTGGCTCTCCCTCCTGGTTCTGTTCCAGATGTTGTTTTCTCCAGATTTTCCTTCCTTTAATGCAGTTGCGTG ATTGGAAGAAATTGTGGGAATTGATTCAACAATTGTTTACTCAAGAATTCTTGATTGGAATGACATAATAATTCTTCACT GCCAGCGAGAGTATTGGTTACATGAAGTGGAAATATGGAATGCCAATGCGTTGGGATGGTGATATTGGAAGTTTCTGATG ATGCCAGAATGAAGCAGTACCATGTGGCTCTTTGGTCCAATCCAGTTCTCAATTAGTGTGTTGGGTTGTTCTAGTTTCTT GTTTTTGGTTTCTTGGTTTTGGTTGGCACAGTGTGGTTTTGGAGTTGGAAAAGATTTTTGCTCTCTATTAAAGTGGAGAA TTGGTTTTGCATTGTGTGGTTTGTTGGTGTATAAATTTTGGACTATTTTTGGGAATATCTCTCTCCGGCAGCAGCTGCTT CTCAAGTTAATTATATTTGTTAAAAGCTATGCATATGACATATATGCGCTAGCTTGAGGGGAAGATCTGAATATTGTTAA ATCTTAATTATATTTGTTACAAGCTATGCATATGACATATATGCTATAGTTTGAAGGGAAGTGTTGGATATTGCTAAATA TCCTAATAGAGACCACAGTCAACCACCGCCGACAATCGTTATCCTTGTTGCTGGTTTGGTGGAGGGTGTATTCAAGAAGT GTTTGGTTGGATCTAATTGTATTGCGCTGCATTGTTCTCGCTGGTCCTATTTGTGTTTCGGCCAGGTTTGGTTTTTAAGG TCCTCTATTTGACGTGTGTTGTGGCGCCACCGTTAATGGTCGTCTGGTCTTCCTCTTCCAGTTTGGTTTGTGGGTCTGCT GTGTTTTCTCATCTGCGATGTTTCTTGCTGTTTGAGTTCTTAGTTTGCGTCTCATGGTTCGTGATGCTCTTATTATATTG ATCTTGGCTGACTTTATGCAATTTGGTTTTGTTTGGTTTTGAAGGTGACAGTTCGTTTGTTTTGTCTCGATTGTTTGGTT TTCTGGTTTTAGGGCTTCAGCTGCAAGTTGCGCTGGCCCACTCTCTAGTTGAGAGTTATTGGTTTTGGTTTTAGGGCTCT AGCTGCGAGTTGCGCTGGCCCGCTCTCTAATGTTTGAGAGTTGTCTGTGTCAAAGTTGACACCATTGTTTGTTTTAGAAG CCATCAATCGATCGACCTCAAGTATGTTTTATTTCTGTGTGGTTGTTGTTGGTGAGTTGTTGCTTCAGCCTTGTTTTGTT TTCGGGCGTATTGTTGCTGGTTTTTCGCCCTTGTTTGCTGACTCAGCTACCCTACGACACTCCAGAAGAATTGGTTTTTG TCTTGCATCAATTTCAGCCAGATCAAGTATGAGAAGTTGTCTTTTGCCTGCCCATGGATTTAGCAGAAGTTCGAAAGATT ATTCAATTTGAAGTATGAGAAGTTGGCTTTTATTGCCATGGATTTACTAGAAGTTTGAAAGGTTATTCAATTCAGAAATT CGCCAAGACTGTCATTATTAAGGGATATCTATTAAGATAATTTTTTTCTTGGGTTCGATTTGTTACAAGCTTAAAGCTAA GTAAGCTTTAGCTTGAGGGGGAGTGTTGAATATCTGTTTAGATTTAGTTTACTATTAGTATTATCTCATTGAGATATAGT TTAGATTTGTTTCTCTATTTTAGATTAGTATCTATTTAAATAGAGATAATATCTATTTAAATAGAGATAGGTTTAGATAG ATTTAGTTTCTTTTTATCTCTTTGTTAGTCTATATATATTGTAGTTTTCAGTCAAGTATTAATCAATGAAATACACAATA ATTATTTTATCAAATTCAAGTAGGACAAAGTAAAACACTGGGAGGGATTGGCAAAATATCAGCTTAGTGGTATAGGCATG CGTGGACAAGACCCATATGATAGGTAACTATGTCGTTGCATGATCAAAATAGCTCAACCCCACATAGTGGGAAGAAGCTT TGTTGTCGGTGGTGGCGATGATGGTGATGGCTACTTGTCAACACCGATGGAGTTGGATACTCTAAACAATGGGACCTAGT TGGACTTTTTTTAGCACCCCCTGTTAGGTTAAGGCTTTTATTTGAACTGATAGATAGAAGTTCACACTTGAAACTAACTA TCTATTCACTTTGACTCTCTAGCTTGCAGACATGAATTGCTATACTTTAAAACGTTTGAGTAGGAGACTGACAAATGGTT TTTCTTTGTGTTGATTCTAGGGGCAATTGCTTTGATCCAACTGCAGGAGGATATGAAAAAGCAACTCAGTTCAGAAGGGA ACTATACTGAAGAAGAGCTTGAAGAATACATGCAATCTCACAAGAAATTAATGATTGACTCTCTGTGGAAACTTAATGTG GCTGACATTGAGGCCACTCTTTCTCGTGTGTGTCAAATGGTTGTTTTTGCCACTCCAATGTTAACTTCTTTATATGGCAT AAAGTATATTTGAGGGCTAGGTGTGATTTAATTTAGTTCATGTGTGCTTCACTTTAGGTTCTTCAAGACAACAGTGCCAA GAAAGAAGAGCTCCGTGCACGTGCAAAAGGGTTGAAAACTCTCGGTAAAATCTTCCAGGTTGTATCTCTTTCCCTACACT ACACAGAATTGTTTGCAATATTGTATAGTGATGATGAAATGATGTTTAACTCACGATTTGAATGTAGAGGGTTAAGCCAG CTAATGGGAACGATAATGAAAGTGTTCAAAACAAAGCAGTGCATAAGTTGAATGGAAATGAAACTAGCAATGATGCTTGT TCTCCTAGTGCATCACCTAATGCTTCTAGTCCTGATTCAACACATGCTATGTATGCATCGCAGGTGCAATTTCCCCCCTG ATACGCGCTTGTTTTTCCCTTCCTTTTTCAGCATCTGCTCCCCATGTTTATATTTATAAGTCACATTCTAGAAGCTTTTC ATGTCCCTCGGTATAAGTCATTTTAAAATATAAATGAAGCATTAATTTTTTTTCTTCAAGTTTACCTTTTAACATTTAAT GCTTTATATTCTATTATCTAACATTTAGCAAATAATTCTTTTAGTTTTCCAATAAGGGGTATTTTAGGAAAATAAACATG CTTTTTTATACATTTGAGATTAATATCTAATCTTAACTAATTTTTTTTTTTAATTTGTGTAAATTGGTTGGAAGAGGCTT ATAAGTAGGAATAAATGGAGTATCCTTTTAAATTATCATTTTTATTTTTTATACAATTTAATTTATACGTTTTCTTGCTT TCTTTGATACAAATGGATGTAGAGCCCCTATGTGGAGGCCCCACACTTTGCAGGCATGCAATTCGACTACAACTTCCCTA GGCCAACAGCTCCCCCTGGTGCCCAGAGACCTGCTCCAACCAGCAAGGATTGATGAGGGAGTTTAATACCTCTGTGTGTG CGTGTGTTTGTGTTGTGGGTATACCACCTATTGTATGTATCGATCTTATGGTATCGTGTCGAATGTGCCTTTGCAAATTG ATCTGCTGGAGATCGCACCTTGTCTGTGGGGACCTGATTGTGCATTGTGGCTATTCATGTCTGATTATTTTATACATAGA TGGGGAAAGATAATTTAAAGGTAGCCCGTGTTGTTGCTAATTGGCTACCATGTAATTCGAGCTGTGTATTTTATTGGGGT TTATGCACTTGGGTTCATTTTCTCATTTCTTGTGTTTTTTTAGGGATAGTAGGATTTCAATTTTAGGGATCAAGTCTCTG ACCTTGGTTAACATAATGCTAAAATTTTGTACCATATATGAAATAGTAAACATGCGTGAATTCTTTTGCAAGATAAGTAG CTTCTGAATTTGCATGGACGCCAAGTTTGTTCCAAATGCCGAATAATTACAACTTTGTATATTTTTTTACAACGTCTCAT TGAAGGTACACCTGTTGGGATGGCAGTAGGATCAGCAGGAAAGATTATCCACTCTATGTGTATAAGTGGTGATCTTTTTG CGCATTCAAGTTCGTTAAAATATTGAATCTGAATATTTTTTTTATGTAAATGTTAGTTGTTAGTAAATTAGTTTCTCCTC AGGATTCGAACCCTAGACTCTTCACCATTCAACCCACCCAACCCTTATGTCCCTTAACTCTAACAACTTTTTTACATGTT ACTAGAAAGATTGTGCTTGGAAG 

CDS sequence (LotjaGi2g1v0462400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGTTTTTATACTCTGGTTTCAGGTTTTAGGTGAGGCTTACCAAGTTCTGAGTGACCCAGGTCAAAGGCAAGCTTATGA TGTTCATGGGAAATCAGGAATCTCTACTGATGCAATTATTGACCCTGCAGCAATCTTTGCCATGCTTTTCGGTAGTGAAC TTTTTGAGGAATATATAGGCCAGCTAGCCATGGCCTCAATGGCTTCAATGGACATTTTTACTGAAGGGGAACAATTTGAT ACTAAAAAGTTGCAAGAGAAAATGAGGGTGGTTCAGAAGGAAAGAGAAGAAAAACTTGCAGACATACTTAAAAATAGACT CAACCAATATGTCCAAGGAAACAAAGAGGACTTTGTAAATCAAGCAGAAGCTGAAGTAGCTCGGCTCTCCAGTGCAGCTT ATGGGGTTGATATGCTGAATACAATTGGCTACATATACGCTAGGCAGGCAGCAAAAGAGCTAGGAAAGAAAGCAATTTAC TTGGGTGTACCTTTTATTGCTGAGTGGTTTAGAAACAAAGGGCACTTCATCAAATCCCAAGTTACAGCAGCAACAGGGGC AATTGCTTTGATCCAACTGCAGGAGGATATGAAAAAGCAACTCAGTTCAGAAGGGAACTATACTGAAGAAGAGCTTGAAG AATACATGCAATCTCACAAGAAATTAATGATTGACTCTCTGTGGAAACTTAATGTGGCTGACATTGAGGCCACTCTTTCT CGTGTGTGTCAAATGGTTCTTCAAGACAACAGTGCCAAGAAAGAAGAGCTCCGTGCACGTGCAAAAGGGTTGAAAACTCT CGGTAAAATCTTCCAGAGGGTTAAGCCAGCTAATGGGAACGATAATGAAAGTGTTCAAAACAAAGCAGTGCATAAGTTGA ATGGAAATGAAACTAGCAATGATGCTTGTTCTCCTAGTGCATCACCTAATGCTTCTAGTCCTGATTCAACACATGCTATG TATGCATCGCAGAGCCCCTATGTGGAGGCCCCACACTTTGCAGGCATGCAATTCGACTACAACTTCCCTAGGCCAACAGC TCCCCCTGGTGCCCAGAGACCTGCTCCAACCAGCAAGGATTGA 

Protein sequence (LotjaGi2g1v0462400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MVFILWFQVLGEAYQVLSDPGQRQAYDVHGKSGISTDAIIDPAAIFAMLFGSELFEEYIGQLAMASMASMDIFTEGEQFD TKKLQEKMRVVQKEREEKLADILKNRLNQYVQGNKEDFVNQAEAEVARLSSAAYGVDMLNTIGYIYARQAAKELGKKAIY LGVPFIAEWFRNKGHFIKSQVTAATGAIALIQLQEDMKKQLSSEGNYTEEELEEYMQSHKKLMIDSLWKLNVADIEATLS RVCQMVLQDNSAKKEELRARAKGLKTLGKIFQRVKPANGNDNESVQNKAVHKLNGNETSNDACSPSASPNASSPDSTHAM YASQSPYVEAPHFAGMQFDYNFPRPTAPPGAQRPAPTSKD 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
SignalP_EUK 1 18 18 -
Phobius 1 18 18 -
Phobius 1 1 1 -
Phobius 2 10 9 -
Gene3D 6 64 59 3.8E-5
ProSitePatterns 7 26 20 -
SUPERFAMILY 7 60 54 6.02E-8
PANTHER 7 353 347 1.2E-171
PANTHER 7 353 347 1.2E-171
Phobius 11 18 8 -
Phobius 19 360 342 -
Coils 81 101 21 -
Pfam 92 283 192 5.9E-50
MobiDBLite 294 323 30 -
MobiDBLite 338 360 23 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

Unable to find any GO terms for the transcript with the identifier.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi2g1v0462400.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…