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LotjaGi2g1v0462400.2

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi2g1v0462400
Transcript ID LotjaGi2g1v0462400.2
Related isoforms 4
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Chaperone protein dnaJ, putative; TAIR: AT1G21080.1 DNAJ heat shock N-terminal domain-containing protein; Swiss-Prot: sp|Q8GYX8|DNJ10_ARATH Chaperone protein dnaJ 10; TrEMBL-Plants: tr|A0A0L9T7V2|A0A0L9T7V2_PHAAN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0462400
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr2:95584742..95597394) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

ATTTTGTTTTCTTAAATACTGGTGAAAGGCAAAAAGTCGGAACCACCGCGGTTCGGAGAGGAAACATTTCACGGCAGTCA ACTCCCCGGAGTCCGAAGTCCATTCCAATCAGAGGAGGCGGATTACGCCTGAGCGAGGAGAATAACGCCATTTGATTTTG CGTGAGGATAATACTTAAGATTTTCCCTGCTATTGTTTTTATCGCTTTCGTGTTTTTTCTCTTCATACCCTCTTAGGTTA GTAAAAATCTAATAATTCCAGGCGTTTGCTCATTGGAAAGCTCAATCAAGTGCTCATTGAGATGGTAAAGGAGACCGAAT ACTATGACGTGCTGGGTGTCAGTCCTTCGGCATCCGAAGCTGAGATTAAGAAAGCTTATTACATGAAGGTCCTGGTCTAA TCTATCGATCCCTTGCTTGTCCGCCTCATTTGTTTTCTTGTCATGCGCAAAGGGGCTTAATTAATTGATTATTTGGCCTG AAGAGTTGGTATTACGTAGAGCTACACAATTATTTTGCTTTGCAACCTGTAGCGGACCTCAATGGATCCGTCTAATCCAA TATACCGTTTGAATAGACACAATATAGCAGATGCCTATGTCCTATGGCTCGATCTGTCAATTCTGTTAGGTTTTGAAAGA GATGTATACTTGCGTCGAGTGCTTTCTCTTTGCAATACAAGACAAGCTAGCTAGCTTTTACACAATGAATTTCAAATGTT AGCGTTTAGCTTTGAAAAATTGAATTAAAATTTCCTTGTGCCTTGTGTTGTACTTGATTTACATTTTCCATAGTTATCAA TTTTTTATCATTTTGTACCAAATTGTTAAATATGATCAAGTGGTTTAATCACATTATTAATTCCTCTTCTCCTGTCATAT ATGTGCAGGCACGGCAAGTGCATCCAGATAAAAACCCAAATGACCCTCTTGCTGCACAAAATTTTCAGGCAAGAATATTA 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TGGGATAACTATGGTCAAACTTCATCCAGGATAGTCAGGGATAATATACATTTAGGATGGCCATAGGCTTCAAAAGGAGG ATATGACACTGGGGTGAGTTCACCTGCAGCTTTTGAGGTAGGTTGTAGAAACGTAAAAACCACTATAGAAAGAGAAAACC TAAGAGAAAAAGGGCTGGCTGGAATTTGTGCACGATCCATGGGAATAAAATTATCATGGAGATAATAACTTTGTTACAAT AGAGTTCTAGATTTGAGGGAACTTACAAGAAACCCCACAGAAGATGGTAGGTGCTACTTTTTTTTTGGTACACCGGAAAG ATAAACTACACCCTCCAGGTAAGTACTGCTATCCTTCGGAGATATTCATATGGGATCTTCCCCTCCCAAACCATATGTCC CCCGACTTTCACCACTTGAGCTATCCTTCGGGGACATGTAAGTACTGCTTTGATATCATATTCAAGATATTAGGAATAAT TATGTCAAAAAATTAGGAATAAAATATATTGATATTGGTGAGAATGATGTATTGGGTGTTATTAGATAAGATAAAGCACT AATTGCTAATTATACTATGCTACATTTGTAACCCTAATTAATAAGAAACAAATCTTGATATATAAGGTAACATTGAAACC AATCATAAGAGACAATTAAAGTTACCCTTAAGGCCTTAACAATTCAATTTATTTATCATACATTCTAATATAGATGATAA TCAGTCTTACGGTGATGAAAATATTGTTCATTCTATTTTTGTGTAGTGCTTTGGTGAAGATGTATGCAAGTTTGTTTCTG TTTCACAAACCACACATATCCAGTAAGATGAAGTGCCTAGGAAATCTGCTTATATTGAATCTTTTCATGATTAAAATGAC AGTCAGCCTCCATATGCTTTGTTCATTTGTTAGAATTAGGATGAGAGGCAATATAAATTGTGGTTTGGTTGTCAAGCTAC 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TCAGAAGGAAAGAGAAGAAAAACTTGCAGACATACTTAAAAATAGACTCAACCAATATGTCCAAGGAAACAAAGAGGACT TTGTAAATCAAGCAGAAGCTGAAGTAGCTCGGCTCTCCAGTGCAGGTACAATGTCCTAAGAATAATATAATTCTAGACAT GCAGGGAATAGGACTGGTGAAAACAATTTATTCATACAAATTTAAATGACCAGAGTTCATTGTTACAGCTCATTTGGATG CTTTTTTCATCCTAAATATCAATCCATGGTTGGAAAAAGTTCTTTGAATCAGTAATTCTTTTGTTTAAAAAATCTTGATA TGATCAAAAGAATGACTACATGACATGGAAAAAACCTTTTACTTGATCCCAAGTATTTGACTTGCTGTATTGAACAGTAG TAGCCTAACTTTCCGTAGCAGTATTATCACTCATGTGCTTTTGCTGAGTAAATTAGTTGTCATTATACAGCTTATGGGGT TGATATGCTGAATACAATTGGCTACATATACGCTAGGCAGGCAGCAAAAGAGCTAGGAAAGAAAGCAATTTACTTGGGTG TACCTTTTATTGCTGAGTGGTTTAGAAACAAAGGGCACTTCATCAAATCCCAAGTTACAGCAGCAACAGGTGAGCAAACT TTAGTTATACAACTTTTCTTGGCTGTGTTGTGGTTTCTTGATTTCAATCTTAATCTCGTATTATTTTCTACGTTGCATAT TTCCTGAGACTTTGGTGCATCAGATTGACCTTGGCCCATTAAGGCTTTGGTTTAAGTGCAGTGCATTTTTTAGTGCCTCT TTCATCAACATGCTATGGGATGGAATTATGTTTGTTGAAGTTATTAAGGAGTGAAGAGGAAGATAAAGACTAATTTCAAC ATCAACATATCTAACTAAAGTCAAACAAATCTTGGTTCAAAAAGTCAAACAAATCTAACTAAAGTAAGATATTCAACAAT ATACATAGGTTATATCTAATCCAACCTAATTAAGGAATTACAAAGAAATAATTATCTAATAAAATCTGTACAAATCAAAT CTACCCTAATTACAGGAAATTACGAAACAAGAAAATGTGAGAATAAAGAGTCAGATCCTGCTAATTATGGTAACTATGTC GTACAACAGGATTGGACGTTGGGCGCTTAAGAAGAGCCAACAAGAAAAGAAGATCAGGGTTGCAAGATGAGAATTTTATG CTGGATGAGTGGTTACACAAGACAAGATAGGATTAGAAATACAATCATTAGAGAGTCGGGGGGGGGGGAGCTTCTATTGT AGAAAAGATGGAAAAAATGATCCATATTGCTCAACCTCACATAGTGGGAAAAGGCTTTGTTGTTGTTGGTGGTGGCGGTG ATGGTGATGCTTACTTAGTTACTTGTCATTGTCAACACTGATGGAGTTCGAGACTCTAAAAAATGGGACCTAGTTGGACT TCATTTTTTGTTTTGTTTTCCATTCTTTTCACCTTGAGGACTGTTGAATATCTGTTTAGATTTAGTTTACTATTAGTATT ATCTCATTGAGATATAGTTTAGATTTGTTTCTCTATTTTAGATTAGTATCTATTTAAATAGAGATAATATCTATTTAAAT AGAGATAATATCTATTTAAATAGAGATAGGTTTAGATAGATTTAGTTTCTTTTTATCTCTTTGTTAGTCTATATATATTG TAGTTTTCAGTCAAGTATTAATCAATGAAATACACAATAATTATTTTATCAAATTCAAGTTGGTATCAGAGCGAGTTTCG ATCCTACCGCTGTGAGGGGGCTCCTCCCCCGTGAGCCCCCTCATGGTGACCTTCCAAATCTCTTTGGATTATTTTCACTC GTCCTGTGCTTCCGCGCTTGTTCGTTCTAGCCTTTTCTTACGGCCTCGTTTCTTTCTGATTATGGTCCCCTTTGTCTTGG AACCCTATTGACCCTTGTTTCTTAATACTTAAAACAACCGCGCCTTCTTCTTCGGCGCGTGAAGGTAACGCACAAACCTG AACTCGACGCGACGACCACATACATGTTCGTCCGTTGTAGTATAGTTGGTCAGGATATTTGGCTCTCCCTCCTGGTTCTG TTCCAGATGTTGTTTTCTCCAGATTTTCCTTCCTTTAATGCAGTTGCGTGATTGGAAGAAATTGTGGGAATTGATTCAAC AATTGTTTACTCAAGAATTCTTGATTGGAATGACATAATAATTCTTCACTGCCAGCGAGAGTATTGGTTACATGAAGTGG AAATATGGAATGCCAATGCGTTGGGATGGTGATATTGGAAGTTTCTGATGATGCCAGAATGAAGCAGTACCATGTGGCTC TTTGGTCCAATCCAGTTCTCAATTAGTGTGTTGGGTTGTTCTAGTTTCTTGTTTTTGGTTTCTTGGTTTTGGTTGGCACA GTGTGGTTTTGGAGTTGGAAAAGATTTTTGCTCTCTATTAAAGTGGAGAATTGGTTTTGCATTGTGTGGTTTGTTGGTGT ATAAATTTTGGACTATTTTTGGGAATATCTCTCTCCGGCAGCAGCTGCTTCTCAAGTTAATTATATTTGTTAAAAGCTAT GCATATGACATATATGCGCTAGCTTGAGGGGAAGATCTGAATATTGTTAAATCTTAATTATATTTGTTACAAGCTATGCA TATGACATATATGCTATAGTTTGAAGGGAAGTGTTGGATATTGCTAAATATCCTAATAGAGACCACAGTCAACCACCGCC GACAATCGTTATCCTTGTTGCTGGTTTGGTGGAGGGTGTATTCAAGAAGTGTTTGGTTGGATCTAATTGTATTGCGCTGC ATTGTTCTCGCTGGTCCTATTTGTGTTTCGGCCAGGTTTGGTTTTTAAGGTCCTCTATTTGACGTGTGTTGTGGCGCCAC CGTTAATGGTCGTCTGGTCTTCCTCTTCCAGTTTGGTTTGTGGGTCTGCTGTGTTTTCTCATCTGCGATGTTTCTTGCTG TTTGAGTTCTTAGTTTGCGTCTCATGGTTCGTGATGCTCTTATTATATTGATCTTGGCTGACTTTATGCAATTTGGTTTT GTTTGGTTTTGAAGGTGACAGTTCGTTTGTTTTGTCTCGATTGTTTGGTTTTCTGGTTTTAGGGCTTCAGCTGCAAGTTG CGCTGGCCCACTCTCTAGTTGAGAGTTATTGGTTTTGGTTTTAGGGCTCTAGCTGCGAGTTGCGCTGGCCCGCTCTCTAA TGTTTGAGAGTTGTCTGTGTCAAAGTTGACACCATTGTTTGTTTTAGAAGCCATCAATCGATCGACCTCAAGTATGTTTT ATTTCTGTGTGGTTGTTGTTGGTGAGTTGTTGCTTCAGCCTTGTTTTGTTTTCGGGCGTATTGTTGCTGGTTTTTCGCCC TTGTTTGCTGACTCAGCTACCCTACGACACTCCAGAAGAATTGGTTTTTGTCTTGCATCAATTTCAGCCAGATCAAGTAT GAGAAGTTGTCTTTTGCCTGCCCATGGATTTAGCAGAAGTTCGAAAGATTATTCAATTTGAAGTATGAGAAGTTGGCTTT TATTGCCATGGATTTACTAGAAGTTTGAAAGGTTATTCAATTCAGAAATTCGCCAAGACTGTCATTATTAAGGGATATCT ATTAAGATAATTTTTTTCTTGGGTTCGATTTGTTACAAGCTTAAAGCTAAGTAAGCTTTAGCTTGAGGGGGAGTGTTGAA TATCTGTTTAGATTTAGTTTACTATTAGTATTATCTCATTGAGATATAGTTTAGATTTGTTTCTCTATTTTAGATTAGTA TCTATTTAAATAGAGATAATATCTATTTAAATAGAGATAGGTTTAGATAGATTTAGTTTCTTTTTATCTCTTTGTTAGTC TATATATATTGTAGTTTTCAGTCAAGTATTAATCAATGAAATACACAATAATTATTTTATCAAATTCAAGTAGGACAAAG TAAAACACTGGGAGGGATTGGCAAAATATCAGCTTAGTGGTATAGGCATGCGTGGACAAGACCCATATGATAGGTAACTA TGTCGTTGCATGATCAAAATAGCTCAACCCCACATAGTGGGAAGAAGCTTTGTTGTCGGTGGTGGCGATGATGGTGATGG CTACTTGTCAACACCGATGGAGTTGGATACTCTAAACAATGGGACCTAGTTGGACTTTTTTTAGCACCCCCTGTTAGGTT AAGGCTTTTATTTGAACTGATAGATAGAAGTTCACACTTGAAACTAACTATCTATTCACTTTGACTCTCTAGCTTGCAGA CATGAATTGCTATACTTTAAAACGTTTGAGTAGGAGACTGACAAATGGTTTTTCTTTGTGTTGATTCTAGGGGCAATTGC TTTGATCCAACTGCAGGAGGATATGAAAAAGCAACTCAGTTCAGAAGGGAACTATACTGAAGAAGAGCTTGAAGAATACA TGCAATCTCACAAGAAATTAATGATTGACTCTCTGTGGAAACTTAATGTGGCTGACATTGAGGCCACTCTTTCTCGTGTG TGTCAAATGGTTGTTTTTGCCACTCCAATGTTAACTTCTTTATATGGCATAAAGTATATTTGAGGGCTAGGTGTGATTTA ATTTAGTTCATGTGTGCTTCACTTTAGGTTCTTCAAGACAACAGTGCCAAGAAAGAAGAGCTCCGTGCACGTGCAAAAGG GTTGAAAACTCTCGGTAAAATCTTCCAGGTTGTATCTCTTTCCCTACACTACACAGAATTGTTTGCAATATTGTATAGTG ATGATGAAATGATGTTTAACTCACGATTTGAATGTAGAGGGTTAAGCCAGCTAATGGGAACGATAATGAAAGTGTTCAAA ACAAAGCAGTGCATAAGTTGAATGGAAATGAAACTAGCAATGATGCTTGTTCTCCTAGTGCATCACCTAATGCTTCTAGT CCTGATTCAACACATGCTATGTATGCATCGCAGGTGCAATTTCCCCCCTGATACGCGCTTGTTTTTCCCTTCCTTTTTCA GCATCTGCTCCCCATGTTTATATTTATAAGTCACATTCTAGAAGCTTTTCATGTCCCTCGGTATAAGTCATTTTAAAATA TAAATGAAGCATTAATTTTTTTTCTTCAAGTTTACCTTTTAACATTTAATGCTTTATATTCTATTATCTAACATTTAGCA AATAATTCTTTTAGTTTTCCAATAAGGGGTATTTTAGGAAAATAAACATGCTTTTTTATACATTTGAGATTAATATCTAA TCTTAACTAATTTTTTTTTTTAATTTGTGTAAATTGGTTGGAAGAGGCTTATAAGTAGGAATAAATGGAGTATCCTTTTA AATTATCATTTTTATTTTTTATACAATTTAATTTATACGTTTTCTTGCTTTCTTTGATACAAATGGATGTAGAGCCCCTA TGTGGAGGCCCCACACTTTGCAGGCATGCAATTCGACTACAACTTCCCTAGGCCAACAGCTCCCCCTGGTGCCCAGAGAC CTGCTCCAACCAGCAAGGATTGATGAGGGAGTTTAATACCTCTGTGTGTGCGTGTGTTTGTGTTGTGGGTATACCACCTA TTGTATGTATCGATCTTATGGTATCGTGTCGAATGTGCCTTTGCAAATTGATCTGCTGGAGATCGCACCTTGTCTGTGGG GACCTGATTGTGCATTGTGGCTATTCATGTCTGATTATTTTATACATAGATGGGGAAAGATAATTTAAAGGTAGCCCGTG TTGTTGCTAATTGGCTACCATGTAATTCGAGCTGTGTATTTTATTGGGGTTTATGCACTTGGGTTCATTTTCTCATTTCT TGTGTTTTTTTAGGGATAGTAGGATTTCAATTTTAGGGATCAAGTCTCTGACCTTGGTTAACATAATGCTAAAATTTTGT ACCATATATGAAATAGTAAACATGCGTGAATTCTTTTGCAAGATAAGTAGCTTCTGAATTTGCATGGACGCCAAGTTTGT TCCAAATGCCGAA 

CDS sequence (LotjaGi2g1v0462400.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGTAAAGGAGACCGAATACTATGACGTGCTGGGTGTCAGTCCTTCGGCATCCGAAGCTGAGATTAAGAAAGCTTATTA CATGAAGGCACGGCAAGTGCATCCAGATAAAAACCCAAATGACCCTCTTGCTGCACAAAATTTTCAGGTTTTAGGTGAGG CTTACCAAGTTCTGAGTGACCCAGGTCAAAGGCAAGCTTATGATGTTCATGGGAAATCAGGAATCTCTACTGATGCAATT ATTGACCCTGCAGCAATCTTTGCCATGCTTTTCGGTAGTGAACTTTTTGAGGAATATATAGGCCAGCTAGCCATGGCCTC AATGGCTTCAATGGACATTTTTACTGAAGGGGAACAATTTGATACTAAAAAGTTGCAAGAGAAAATGAGGGTGGTTCAGA AGGAAAGAGAAGAAAAACTTGCAGACATACTTAAAAATAGACTCAACCAATATGTCCAAGGAAACAAAGAGGACTTTGTA AATCAAGCAGAAGCTGAAGTAGCTCGGCTCTCCAGTGCAGCTTATGGGGTTGATATGCTGAATACAATTGGCTACATATA CGCTAGGCAGGCAGCAAAAGAGCTAGGAAAGAAAGCAATTTACTTGGGTGTACCTTTTATTGCTGAGTGGTTTAGAAACA AAGGGCACTTCATCAAATCCCAAGTTACAGCAGCAACAGGGGCAATTGCTTTGATCCAACTGCAGGAGGATATGAAAAAG CAACTCAGTTCAGAAGGGAACTATACTGAAGAAGAGCTTGAAGAATACATGCAATCTCACAAGAAATTAATGATTGACTC TCTGTGGAAACTTAATGTGGCTGACATTGAGGCCACTCTTTCTCGTGTGTGTCAAATGGTTCTTCAAGACAACAGTGCCA AGAAAGAAGAGCTCCGTGCACGTGCAAAAGGGTTGAAAACTCTCGGTAAAATCTTCCAGAGGGTTAAGCCAGCTAATGGG AACGATAATGAAAGTGTTCAAAACAAAGCAGTGCATAAGTTGAATGGAAATGAAACTAGCAATGATGCTTGTTCTCCTAG TGCATCACCTAATGCTTCTAGTCCTGATTCAACACATGCTATGTATGCATCGCAGAGCCCCTATGTGGAGGCCCCACACT TTGCAGGCATGCAATTCGACTACAACTTCCCTAGGCCAACAGCTCCCCCTGGTGCCCAGAGACCTGCTCCAACCAGCAAG GATTGA 

Protein sequence (LotjaGi2g1v0462400.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MVKETEYYDVLGVSPSASEAEIKKAYYMKARQVHPDKNPNDPLAAQNFQVLGEAYQVLSDPGQRQAYDVHGKSGISTDAI IDPAAIFAMLFGSELFEEYIGQLAMASMASMDIFTEGEQFDTKKLQEKMRVVQKEREEKLADILKNRLNQYVQGNKEDFV NQAEAEVARLSSAAYGVDMLNTIGYIYARQAAKELGKKAIYLGVPFIAEWFRNKGHFIKSQVTAATGAIALIQLQEDMKK QLSSEGNYTEEELEEYMQSHKKLMIDSLWKLNVADIEATLSRVCQMVLQDNSAKKEELRARAKGLKTLGKIFQRVKPANG NDNESVQNKAVHKLNGNETSNDACSPSASPNASSPDSTHAMYASQSPYVEAPHFAGMQFDYNFPRPTAPPGAQRPAPTSK D 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 1 394 394 4.4E-202
Gene3D 1 82 82 5.4E-27
PANTHER 1 394 394 4.4E-202
SUPERFAMILY 2 101 100 9.68E-29
SMART 5 63 59 1.1E-26
ProSiteProfiles 6 71 66 20.707
Pfam 6 68 63 2.5E-24
CDD 6 60 55 4.02314E-23
PRINTS 8 26 19 1.9E-18
PRINTS 26 41 16 1.9E-18
PRINTS 43 63 21 1.9E-18
ProSitePatterns 48 67 20 -
PRINTS 63 82 20 1.9E-18
Coils 122 142 21 -
Pfam 133 324 192 7.8E-50
MobiDBLite 335 364 30 -
MobiDBLite 379 401 23 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

Unable to find any GO terms for the transcript with the identifier.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi2g1v0462400.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…