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Field | Value |
---|---|
Gene ID | LotjaGi2g1v0462400 |
Transcript ID | LotjaGi2g1v0462400.5 |
Related isoforms 4 | |
Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
Description | Chaperone protein dnaJ 10; TAIR: AT1G21080.1 DNAJ heat shock N-terminal domain-containing protein; Swiss-Prot: sp|Q8GYX8|DNJ10_ARATH Chaperone protein dnaJ 10; TrEMBL-Plants: tr|A0A0L9T7V2|A0A0L9T7V2_PHAAN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0462400 |
Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:95586884..95596924) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATAGTAATATATTAGTGCATGATCATTTTGCTTTTGCTGATTTTTATGTCTTTCATTCCTTTCAGTGATGCAATTATTGA CCCTGCAGCAATCTTTGCCATGCTTTTCGGTAGTGAACTTTTTGAGGAATATATAGGCCAGCTAGCCATGGCCTCAATGG CTTCAATGGACATTTTTACTGAAGGGGAACAATTTGATACTAAAAAGTTGCAAGAGAAAATGAGGGTATAATTTTATAAT CTTTCTTAAAACTGCAATCTCTTATGCTTAATTTGATTGCCATGTCTTGTAAACTTTCTTTTTTTGCTTTTGTATTTTTT TTTCTCGGGTTGCAGCTTTCGATAATTAATCATAATAGGGTTCTATTGTGACTACATCATGTTACTAACATCATGCATAC TTATATTTAATCTAGCCAGAAGATTGCCTAGTTTCAGTTTTTTAGACATAGCTGAGACATTAGCATGTGTTTGGTTAAAC CTATGAATATAACTTATGATTTACTTATAAGCTGTTTTGAGCTTATTCTGATAAGCTTATAGCGCTTATAAGTATCTATA AGTTCTTTTGAGCTTATTTCAATAACCTTTTCGAATAAGCCCTTATGTGATAAGTGCTTATTGACATAAGCACTTAATCA AGCTGTTGAGCCAAACACAAACTAAATAGGGAAACAAATCATGATATATAAGGAAATAAGGAAACCAATCCAAATAGATA TTAGATAAGTTAAGTTGCCCTAAATTATTCTAAGATACAAGTCAAATACTATAACATATTCTTCACGTATCCTAATTCTC CCCCTCAAGCTAAATTTTAGAGAACTGTTTGTTACATATGTATAAGTTTTGTTTGGGGAGCTACTGAGGGCATTGGAAAC ATCATCCTATTGCTTGGAATCAGTTTTGTTCCTCTAACAACTCGAAAGGAATGGATTAAAATATTTTACATGCTTTTAAT GAAGCTCTTATCGTGGAGCTTGGGTCGTAGGGGCTTATCCGTAAGCCTCGGGCGTTATATGTCAAAGTTCATAGATGGAA GTGTGGGTGTGGTATTGATGTACTTCTTAACATGTAGAGGAAAGGCAAGATGTCGAGTACTTGGCATGACATTTGTTGTG TTTGGAGCACATTCAAAGTGGTACTTGTTGAGTAATAGAATAAACATGGCTAGAAAGGCAGCTGAAGGATGTCAGAGATG TTAGAGAGATGAGCATTGCTGTAAAGATAACTTAGTACAATGGCTGAAATGATCATCAAATTGAAAAGTTGGTCAGAATT AAAGTTATTAATCACACAGTACAAGGACACAATAGTGTTTTCACAATGCGCTTAGCCCCTTAAAAATTTAGGTCAGAAAC GTAGAGTGTTTTGACCTTGCACTTGTCGCCCGTGATTTGCGGCCAAATTGCTTCCATCAGCTCACTCCACTATTGGGTCA TGGAGGGTAAAGCTATTGGTGTAAAAATGGGATAGTCTCAAATAACCCGATTAAAATTATGGTCCGGGCTACCAAAATTC AGCTTGATCTAAATTTGGTTCAGCCTGTCCTGGCCTAAAAATTGACCAACCCACCATGGGCTGGGCCAGCTCGTTGGCCT TTTTTTTGTTTTTTATTTATTTAATGTTTATTAATTATAAACATGTTAAACTTAAAAATAATTAAGATTAATAAGACAAT GTTTATTACTTTTTTCTATTTGTATGTGTTCTATTTTTCATGTAATGATTTTCTTACCTTAAGTTGTTTTAATATTTAGA AAGCAATTATTCATGGGCTAGCCATTTGGCCCGCAACCCGTGAAGGGCTAGGCTGGCCTGCTAAATTAGTAGCCCATATC AATTTTGTTCAAACCCAACCCGGCTGAAAATGTGTTGGCCCGTTGCGGGCCGGCCCAAATTGGACACCCCTAGGTAAAGC 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TAATAACTTTGTTACAATAGAGTTCTAGATTTGAGGGAACTTACAAGAAACCCCACAGAAGATGGTAGGTGCTACTTTTT TTTTGGTACACCGGAAAGATAAACTACACCCTCCAGGTAAGTACTGCTATCCTTCGGAGATATTCATATGGGATCTTCCC CTCCCAAACCATATGTCCCCCGACTTTCACCACTTGAGCTATCCTTCGGGGACATGTAAGTACTGCTTTGATATCATATT CAAGATATTAGGAATAATTATGTCAAAAAATTAGGAATAAAATATATTGATATTGGTGAGAATGATGTATTGGGTGTTAT TAGATAAGATAAAGCACTAATTGCTAATTATACTATGCTACATTTGTAACCCTAATTAATAAGAAACAAATCTTGATATA TAAGGTAACATTGAAACCAATCATAAGAGACAATTAAAGTTACCCTTAAGGCCTTAACAATTCAATTTATTTATCATACA TTCTAATATAGATGATAATCAGTCTTACGGTGATGAAAATATTGTTCATTCTATTTTTGTGTAGTGCTTTGGTGAAGATG TATGCAAGTTTGTTTCTGTTTCACAAACCACACATATCCAGTAAGATGAAGTGCCTAGGAAATCTGCTTATATTGAATCT TTTCATGATTAAAATGACAGTCAGCCTCCATATGCTTTGTTCATTTGTTAGAATTAGGATGAGAGGCAATATAAATTGTG GTTTGGTTGTCAAGCTACTACTTTATAGGCATTTCACTCCAATTCACATCTAGTGCCAGTCTAGTATTCTAATTTGGTAT CTGACAACACTGGCTAGAAATAGATCTATAAACCAAGGATTCATCCCAATCACCCCTAGATACCTTCCATCGTCCATGAT TCTATGCCAGAAGGCACCATAACTTGAAGCACCTTTCAGATATCTCCGCATTAGAACAGTTTCCGAACGGGTGGTCCAAG GAGATGGCAAGGAGATGACATGAGTTAACTAACCACACTATCAGAGAAGGCAATATGTGTCAGATATAAAACCACTCAGA AGCTTAAGTAATTAGGCACAGTGACAAGGGAAATCGCTGATCAGTGGTGGAGTCAATGCAGGGGCCAATAGTGGCCATGG CACCACCCTAAATTTTAGGATTTCAATCTAATACTAGTAATGTATATTATGTGGAAATCATCTTGTGACTTTTTTCCAGC ACCTTATCCATGTCATTATGTTACAAAGTCAGGAAAAAAAATAAATAAATTAGGCTATCAGTGGATGTTATAATTACATA TAGCTTTAACTAACACAAAAGCAAAAAGAATATTAGAATGCCATGTTTTTTGCCCTGTTTAATGAAACCTTTGAAGTAGA TCTTGGACCTTTTATTTTAGGGTGAGTGGGTCTTTTAAGCATGATAGTTCTCTTGCTTTTTTGTAACGTCCCTTGCTTAT CCAATTAGTTTGTTTGTTATTTGACCTAAAAGAAAAATAGGTTTGTATGGTAAAAGTCTCTAGTTTTGGTCCCCTCAATC TGAATTTCTGGTTCTGCCACCTCCGCATGTCAGTGTTGGGGGAGCCATGGTCCCCCTTAAAAGTTCTTATCTTTTTTCTG TAAAAAAGGAGAAAGATTGAAATTGTCTTATATTGTCCTGTCTTAGATGTGAACTTGTATTTCGTTGTTTCAACAGATTT ATTCTTCTTTCAGGTGGTTCAGAAGGAAAGAGAAGAAAAACTTGCAGACATACTTAAAAATAGACTCAACCAATATGTCC AAGGAAACAAAGAGGACTTTGTAAATCAAGCAGAAGCTGAAGTAGCTCGGCTCTCCAGTGCAGGTACAATGTCCTAAGAA TAATATAATTCTAGACATGCAGGGAATAGGACTGGTGAAAACAATTTATTCATACAAATTTAAATGACCAGAGTTCATTG TTACAGCTCATTTGGATGCTTTTTTCATCCTAAATATCAATCCATGGTTGGAAAAAGTTCTTTGAATCAGTAATTCTTTT GTTTAAAAAATCTTGATATGATCAAAAGAATGACTACATGACATGGAAAAAACCTTTTACTTGATCCCAAGTATTTGACT TGCTGTATTGAACAGTAGTAGCCTAACTTTCCGTAGCAGTATTATCACTCATGTGCTTTTGCTGAGTAAATTAGTTGTCA TTATACAGCTTATGGGGTTGATATGCTGAATACAATTGGCTACATATACGCTAGGCAGGCAGCAAAAGAGCTAGGAAAGA AAGCAATTTACTTGGGTGTACCTTTTATTGCTGAGTGGTTTAGAAACAAAGGGCACTTCATCAAATCCCAAGTTACAGCA GCAACAGGTGAGCAAACTTTAGTTATACAACTTTTCTTGGCTGTGTTGTGGTTTCTTGATTTCAATCTTAATCTCGTATT ATTTTCTACGTTGCATATTTCCTGAGACTTTGGTGCATCAGATTGACCTTGGCCCATTAAGGCTTTGGTTTAAGTGCAGT GCATTTTTTAGTGCCTCTTTCATCAACATGCTATGGGATGGAATTATGTTTGTTGAAGTTATTAAGGAGTGAAGAGGAAG ATAAAGACTAATTTCAACATCAACATATCTAACTAAAGTCAAACAAATCTTGGTTCAAAAAGTCAAACAAATCTAACTAA AGTAAGATATTCAACAATATACATAGGTTATATCTAATCCAACCTAATTAAGGAATTACAAAGAAATAATTATCTAATAA AATCTGTACAAATCAAATCTACCCTAATTACAGGAAATTACGAAACAAGAAAATGTGAGAATAAAGAGTCAGATCCTGCT AATTATGGTAACTATGTCGTACAACAGGATTGGACGTTGGGCGCTTAAGAAGAGCCAACAAGAAAAGAAGATCAGGGTTG CAAGATGAGAATTTTATGCTGGATGAGTGGTTACACAAGACAAGATAGGATTAGAAATACAATCATTAGAGAGTCGGGGG GGGGGGAGCTTCTATTGTAGAAAAGATGGAAAAAATGATCCATATTGCTCAACCTCACATAGTGGGAAAAGGCTTTGTTG TTGTTGGTGGTGGCGGTGATGGTGATGCTTACTTAGTTACTTGTCATTGTCAACACTGATGGAGTTCGAGACTCTAAAAA ATGGGACCTAGTTGGACTTCATTTTTTGTTTTGTTTTCCATTCTTTTCACCTTGAGGACTGTTGAATATCTGTTTAGATT TAGTTTACTATTAGTATTATCTCATTGAGATATAGTTTAGATTTGTTTCTCTATTTTAGATTAGTATCTATTTAAATAGA GATAATATCTATTTAAATAGAGATAATATCTATTTAAATAGAGATAGGTTTAGATAGATTTAGTTTCTTTTTATCTCTTT GTTAGTCTATATATATTGTAGTTTTCAGTCAAGTATTAATCAATGAAATACACAATAATTATTTTATCAAATTCAAGTTG GTATCAGAGCGAGTTTCGATCCTACCGCTGTGAGGGGGCTCCTCCCCCGTGAGCCCCCTCATGGTGACCTTCCAAATCTC TTTGGATTATTTTCACTCGTCCTGTGCTTCCGCGCTTGTTCGTTCTAGCCTTTTCTTACGGCCTCGTTTCTTTCTGATTA TGGTCCCCTTTGTCTTGGAACCCTATTGACCCTTGTTTCTTAATACTTAAAACAACCGCGCCTTCTTCTTCGGCGCGTGA AGGTAACGCACAAACCTGAACTCGACGCGACGACCACATACATGTTCGTCCGTTGTAGTATAGTTGGTCAGGATATTTGG CTCTCCCTCCTGGTTCTGTTCCAGATGTTGTTTTCTCCAGATTTTCCTTCCTTTAATGCAGTTGCGTGATTGGAAGAAAT TGTGGGAATTGATTCAACAATTGTTTACTCAAGAATTCTTGATTGGAATGACATAATAATTCTTCACTGCCAGCGAGAGT ATTGGTTACATGAAGTGGAAATATGGAATGCCAATGCGTTGGGATGGTGATATTGGAAGTTTCTGATGATGCCAGAATGA AGCAGTACCATGTGGCTCTTTGGTCCAATCCAGTTCTCAATTAGTGTGTTGGGTTGTTCTAGTTTCTTGTTTTTGGTTTC TTGGTTTTGGTTGGCACAGTGTGGTTTTGGAGTTGGAAAAGATTTTTGCTCTCTATTAAAGTGGAGAATTGGTTTTGCAT TGTGTGGTTTGTTGGTGTATAAATTTTGGACTATTTTTGGGAATATCTCTCTCCGGCAGCAGCTGCTTCTCAAGTTAATT ATATTTGTTAAAAGCTATGCATATGACATATATGCGCTAGCTTGAGGGGAAGATCTGAATATTGTTAAATCTTAATTATA TTTGTTACAAGCTATGCATATGACATATATGCTATAGTTTGAAGGGAAGTGTTGGATATTGCTAAATATCCTAATAGAGA CCACAGTCAACCACCGCCGACAATCGTTATCCTTGTTGCTGGTTTGGTGGAGGGTGTATTCAAGAAGTGTTTGGTTGGAT CTAATTGTATTGCGCTGCATTGTTCTCGCTGGTCCTATTTGTGTTTCGGCCAGGTTTGGTTTTTAAGGTCCTCTATTTGA CGTGTGTTGTGGCGCCACCGTTAATGGTCGTCTGGTCTTCCTCTTCCAGTTTGGTTTGTGGGTCTGCTGTGTTTTCTCAT CTGCGATGTTTCTTGCTGTTTGAGTTCTTAGTTTGCGTCTCATGGTTCGTGATGCTCTTATTATATTGATCTTGGCTGAC TTTATGCAATTTGGTTTTGTTTGGTTTTGAAGGTGACAGTTCGTTTGTTTTGTCTCGATTGTTTGGTTTTCTGGTTTTAG GGCTTCAGCTGCAAGTTGCGCTGGCCCACTCTCTAGTTGAGAGTTATTGGTTTTGGTTTTAGGGCTCTAGCTGCGAGTTG CGCTGGCCCGCTCTCTAATGTTTGAGAGTTGTCTGTGTCAAAGTTGACACCATTGTTTGTTTTAGAAGCCATCAATCGAT CGACCTCAAGTATGTTTTATTTCTGTGTGGTTGTTGTTGGTGAGTTGTTGCTTCAGCCTTGTTTTGTTTTCGGGCGTATT GTTGCTGGTTTTTCGCCCTTGTTTGCTGACTCAGCTACCCTACGACACTCCAGAAGAATTGGTTTTTGTCTTGCATCAAT TTCAGCCAGATCAAGTATGAGAAGTTGTCTTTTGCCTGCCCATGGATTTAGCAGAAGTTCGAAAGATTATTCAATTTGAA GTATGAGAAGTTGGCTTTTATTGCCATGGATTTACTAGAAGTTTGAAAGGTTATTCAATTCAGAAATTCGCCAAGACTGT CATTATTAAGGGATATCTATTAAGATAATTTTTTTCTTGGGTTCGATTTGTTACAAGCTTAAAGCTAAGTAAGCTTTAGC TTGAGGGGGAGTGTTGAATATCTGTTTAGATTTAGTTTACTATTAGTATTATCTCATTGAGATATAGTTTAGATTTGTTT CTCTATTTTAGATTAGTATCTATTTAAATAGAGATAATATCTATTTAAATAGAGATAGGTTTAGATAGATTTAGTTTCTT TTTATCTCTTTGTTAGTCTATATATATTGTAGTTTTCAGTCAAGTATTAATCAATGAAATACACAATAATTATTTTATCA AATTCAAGTAGGACAAAGTAAAACACTGGGAGGGATTGGCAAAATATCAGCTTAGTGGTATAGGCATGCGTGGACAAGAC CCATATGATAGGTAACTATGTCGTTGCATGATCAAAATAGCTCAACCCCACATAGTGGGAAGAAGCTTTGTTGTCGGTGG TGGCGATGATGGTGATGGCTACTTGTCAACACCGATGGAGTTGGATACTCTAAACAATGGGACCTAGTTGGACTTTTTTT AGCACCCCCTGTTAGGTTAAGGCTTTTATTTGAACTGATAGATAGAAGTTCACACTTGAAACTAACTATCTATTCACTTT GACTCTCTAGCTTGCAGACATGAATTGCTATACTTTAAAACGTTTGAGTAGGAGACTGACAAATGGTTTTTCTTTGTGTT GATTCTAGGGGCAATTGCTTTGATCCAACTGCAGGAGGATATGAAAAAGCAACTCAGTTCAGAAGGGAACTATACTGAAG AAGAGCTTGAAGAATACATGCAATCTCACAAGAAATTAATGATTGACTCTCTGTGGAAACTTAATGTGGCTGACATTGAG GCCACTCTTTCTCGTGTGTGTCAAATGGTTGTTTTTGCCACTCCAATGTTAACTTCTTTATATGGCATAAAGTATATTTG AGGGCTAGGTGTGATTTAATTTAGTTCATGTGTGCTTCACTTTAGGTTCTTCAAGACAACAGTGCCAAGAAAGAAGAGCT CCGTGCACGTGCAAAAGGGTTGAAAACTCTCGGTAAAATCTTCCAGGTTGTATCTCTTTCCCTACACTACACAGAATTGT TTGCAATATTGTATAGTGATGATGAAATGATGTTTAACTCACGATTTGAATGTAGAGGGTTAAGCCAGCTAATGGGAACG ATAATGAAAGTGTTCAAAACAAAGCAGTGCATAAGTTGAATGGAAATGAAACTAGCAATGATGCTTGTTCTCCTAGTGCA TCACCTAATGCTTCTAGTCCTGATTCAACACATGCTATGTATGCATCGCAGGTGCAATTTCCCCCCTGATACGCGCTTGT TTTTCCCTTCCTTTTTCAGCATCTGCTCCCCATGTTTATATTTATAAGTCACATTCTAGAAGCTTTTCATGTCCCTCGGT ATAAGTCATTTTAAAATATAAATGAAGCATTAATTTTTTTTCTTCAAGTTTACCTTTTAACATTTAATGCTTTATATTCT ATTATCTAACATTTAGCAAATAATTCTTTTAGTTTTCCAATAAGGGGTATTTTAGGAAAATAAACATGCTTTTTTATACA TTTGAGATTAATATCTAATCTTAACTAATTTTTTTTTTTAATTTGTGTAAATTGGTTGGAAGAGGCTTATAAGTAGGAAT AAATGGAGTATCCTTTTAAATTATCATTTTTATTTTTTATACAATTTAATTTATACGTTTTCTTGCTTTCTTTGATACAA ATGGATGTAGAGCCCCTATGTGGAGGCCCCACACTTTGCAGGCATGCAATTCGACTACAACTTCCCTAGGCCAACAGCTC CCCCTGGTGCCCAGAGACCTGCTCCAACCAGCAAGGATTGA
CDS sequence (LotjaGi2g1v0462400.5) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGATCATTTTGCTTTTGCTGATTTTTATGTCTTTCATTCCTTTCAGTGATGCAATTATTGACCCTGCAGCAATCTTTGC CATGCTTTTCGGTAGTGAACTTTTTGAGGAATATATAGGCCAGCTAGCCATGGCCTCAATGGCTTCAATGGACATTTTTA CTGAAGGGGAACAATTTGATACTAAAAAGTTGCAAGAGAAAATGAGGGTGGTTCAGAAGGAAAGAGAAGAAAAACTTGCA GACATACTTAAAAATAGACTCAACCAATATGTCCAAGGAAACAAAGAGGACTTTGTAAATCAAGCAGAAGCTGAAGTAGC TCGGCTCTCCAGTGCAGCTTATGGGGTTGATATGCTGAATACAATTGGCTACATATACGCTAGGCAGGCAGCAAAAGAGC TAGGAAAGAAAGCAATTTACTTGGGTGTACCTTTTATTGCTGAGTGGTTTAGAAACAAAGGGCACTTCATCAAATCCCAA GTTACAGCAGCAACAGGGGCAATTGCTTTGATCCAACTGCAGGAGGATATGAAAAAGCAACTCAGTTCAGAAGGGAACTA TACTGAAGAAGAGCTTGAAGAATACATGCAATCTCACAAGAAATTAATGATTGACTCTCTGTGGAAACTTAATGTGGCTG ACATTGAGGCCACTCTTTCTCGTGTGTGTCAAATGGTTCTTCAAGACAACAGTGCCAAGAAAGAAGAGCTCCGTGCACGT GCAAAAGGGTTGAAAACTCTCGGTAAAATCTTCCAGAGGGTTAAGCCAGCTAATGGGAACGATAATGAAAGTGTTCAAAA CAAAGCAGTGCATAAGTTGAATGGAAATGAAACTAGCAATGATGCTTGTTCTCCTAGTGCATCACCTAATGCTTCTAGTC CTGATTCAACACATAGCCCCTATGTGGAGGCCCCACACTTTGCAGGCATGCAATTCGACTACAACTTCCCTAGGCCAACA GCTCCCCCTGGTGCCCAGAGACCTGCTCCAACCAGCAAGGATTGA
Protein sequence (LotjaGi2g1v0462400.5) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MIILLLLIFMSFIPFSDAIIDPAAIFAMLFGSELFEEYIGQLAMASMASMDIFTEGEQFDTKKLQEKMRVVQKEREEKLA DILKNRLNQYVQGNKEDFVNQAEAEVARLSSAAYGVDMLNTIGYIYARQAAKELGKKAIYLGVPFIAEWFRNKGHFIKSQ VTAATGAIALIQLQEDMKKQLSSEGNYTEEELEEYMQSHKKLMIDSLWKLNVADIEATLSRVCQMVLQDNSAKKEELRAR AKGLKTLGKIFQRVKPANGNDNESVQNKAVHKLNGNETSNDACSPSASPNASSPDSTHSPYVEAPHFAGMQFDYNFPRPT APPGAQRPAPTSKD
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
---|---|---|---|---|---|---|
Phobius | 1 | 1 | 1 | - | – | |
SignalP_EUK | 1 | 18 | 18 | - | – | |
Phobius | 1 | 18 | 18 | - | – | |
Phobius | 2 | 13 | 12 | - | – | |
Phobius | 14 | 18 | 5 | - | – | |
PANTHER | 16 | 327 | 312 | 9.8E-152 | – | |
PANTHER | 16 | 327 | 312 | 9.8E-152 | – | |
Phobius | 19 | 334 | 316 | - | – | |
Coils | 61 | 81 | 21 | - | – | |
Pfam | 72 | 263 | 192 | 4.8E-50 | ||
MobiDBLite | 274 | 299 | 26 | - | – | |
MobiDBLite | 274 | 334 | 61 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi2g1v0462400.5, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…