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LotjaGi2g1v0462400.5

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi2g1v0462400
Transcript ID LotjaGi2g1v0462400.5
Related isoforms 4
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Chaperone protein dnaJ 10; TAIR: AT1G21080.1 DNAJ heat shock N-terminal domain-containing protein; Swiss-Prot: sp|Q8GYX8|DNJ10_ARATH Chaperone protein dnaJ 10; TrEMBL-Plants: tr|A0A0L9T7V2|A0A0L9T7V2_PHAAN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0462400
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr2:95586884..95596924) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

ATAGTAATATATTAGTGCATGATCATTTTGCTTTTGCTGATTTTTATGTCTTTCATTCCTTTCAGTGATGCAATTATTGA CCCTGCAGCAATCTTTGCCATGCTTTTCGGTAGTGAACTTTTTGAGGAATATATAGGCCAGCTAGCCATGGCCTCAATGG CTTCAATGGACATTTTTACTGAAGGGGAACAATTTGATACTAAAAAGTTGCAAGAGAAAATGAGGGTATAATTTTATAAT CTTTCTTAAAACTGCAATCTCTTATGCTTAATTTGATTGCCATGTCTTGTAAACTTTCTTTTTTTGCTTTTGTATTTTTT TTTCTCGGGTTGCAGCTTTCGATAATTAATCATAATAGGGTTCTATTGTGACTACATCATGTTACTAACATCATGCATAC TTATATTTAATCTAGCCAGAAGATTGCCTAGTTTCAGTTTTTTAGACATAGCTGAGACATTAGCATGTGTTTGGTTAAAC CTATGAATATAACTTATGATTTACTTATAAGCTGTTTTGAGCTTATTCTGATAAGCTTATAGCGCTTATAAGTATCTATA AGTTCTTTTGAGCTTATTTCAATAACCTTTTCGAATAAGCCCTTATGTGATAAGTGCTTATTGACATAAGCACTTAATCA AGCTGTTGAGCCAAACACAAACTAAATAGGGAAACAAATCATGATATATAAGGAAATAAGGAAACCAATCCAAATAGATA TTAGATAAGTTAAGTTGCCCTAAATTATTCTAAGATACAAGTCAAATACTATAACATATTCTTCACGTATCCTAATTCTC CCCCTCAAGCTAAATTTTAGAGAACTGTTTGTTACATATGTATAAGTTTTGTTTGGGGAGCTACTGAGGGCATTGGAAAC ATCATCCTATTGCTTGGAATCAGTTTTGTTCCTCTAACAACTCGAAAGGAATGGATTAAAATATTTTACATGCTTTTAAT GAAGCTCTTATCGTGGAGCTTGGGTCGTAGGGGCTTATCCGTAAGCCTCGGGCGTTATATGTCAAAGTTCATAGATGGAA GTGTGGGTGTGGTATTGATGTACTTCTTAACATGTAGAGGAAAGGCAAGATGTCGAGTACTTGGCATGACATTTGTTGTG TTTGGAGCACATTCAAAGTGGTACTTGTTGAGTAATAGAATAAACATGGCTAGAAAGGCAGCTGAAGGATGTCAGAGATG TTAGAGAGATGAGCATTGCTGTAAAGATAACTTAGTACAATGGCTGAAATGATCATCAAATTGAAAAGTTGGTCAGAATT AAAGTTATTAATCACACAGTACAAGGACACAATAGTGTTTTCACAATGCGCTTAGCCCCTTAAAAATTTAGGTCAGAAAC GTAGAGTGTTTTGACCTTGCACTTGTCGCCCGTGATTTGCGGCCAAATTGCTTCCATCAGCTCACTCCACTATTGGGTCA TGGAGGGTAAAGCTATTGGTGTAAAAATGGGATAGTCTCAAATAACCCGATTAAAATTATGGTCCGGGCTACCAAAATTC AGCTTGATCTAAATTTGGTTCAGCCTGTCCTGGCCTAAAAATTGACCAACCCACCATGGGCTGGGCCAGCTCGTTGGCCT TTTTTTTGTTTTTTATTTATTTAATGTTTATTAATTATAAACATGTTAAACTTAAAAATAATTAAGATTAATAAGACAAT GTTTATTACTTTTTTCTATTTGTATGTGTTCTATTTTTCATGTAATGATTTTCTTACCTTAAGTTGTTTTAATATTTAGA AAGCAATTATTCATGGGCTAGCCATTTGGCCCGCAACCCGTGAAGGGCTAGGCTGGCCTGCTAAATTAGTAGCCCATATC AATTTTGTTCAAACCCAACCCGGCTGAAAATGTGTTGGCCCGTTGCGGGCCGGCCCAAATTGGACACCCCTAGGTAAAGC CCCATATTATCCTTTACCTCCCAATGACGTTACAACCCCTAATGTTTTCATATTTTTGTAATTTCCTTGACATATTTTTC ATTAGAAAATTGGGGACTGTCCCTCACCCATCGTTTGCTGTCATTCACATATGAAGAAAGCCTATTTTATTCTTCTACAC CCTCACGAACTCAAGCCCACTTTTCACCCGCAATATTTTCAGCCATTCCCATCACTTTGACACCCACACTAGTCATTAGC ATCCCTCTATTCATGCTCCCCTGTTAATGTCATAGCTTCCAGCTCTATTAATTTTTTTCACCCTCTATTCTACTACTGCT AAAATGATCATCATTAAAACATTCCTAGCAATCAAATTATAAGCAGCAATGTTAGAATGTGTTACTTTAGTTTGTGTATT AGTTTGTTATATTCTGTTTCAACAAATTACCTTTGATTGTCGCTCGTTTGTTAAGAAGTTAGTTTCTGTTAGTGACACCC TGCTGAGAGAAGTTTGCATAAATACATATCTCTTTGTAATCATGATTCATCGTAATGAATATTAAGAAATGTTCATCAGG AACGTGCAGAAGTTTCAAATAACGAGAACTTAAATAACAACAAATAATAGCATGACTAAGACCTGATTGTTTGAGGATAA AGAAGAGCAGGGTCCAATCTAGGACATATGGTGCCAAACTTCACCGTTGATCGTAGACTAGGTCAAACAACATCTGGTAC AACGGAGGTCACTGTATCTGGGATAACTATGGTCAAACTTCATCCAGGATAGTCAGGGATAATATACATTTAGGATGGCC ATAGGCTTCAAAAGGAGGATATGACACTGGGGTGAGTTCACCTGCAGCTTTTGAGGTAGGTTGTAGAAACGTAAAAACCA CTATAGAAAGAGAAAACCTAAGAGAAAAAGGGCTGGCTGGAATTTGTGCACGATCCATGGGAATAAAATTATCATGGAGA 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GAGATGGCAAGGAGATGACATGAGTTAACTAACCACACTATCAGAGAAGGCAATATGTGTCAGATATAAAACCACTCAGA AGCTTAAGTAATTAGGCACAGTGACAAGGGAAATCGCTGATCAGTGGTGGAGTCAATGCAGGGGCCAATAGTGGCCATGG CACCACCCTAAATTTTAGGATTTCAATCTAATACTAGTAATGTATATTATGTGGAAATCATCTTGTGACTTTTTTCCAGC ACCTTATCCATGTCATTATGTTACAAAGTCAGGAAAAAAAATAAATAAATTAGGCTATCAGTGGATGTTATAATTACATA TAGCTTTAACTAACACAAAAGCAAAAAGAATATTAGAATGCCATGTTTTTTGCCCTGTTTAATGAAACCTTTGAAGTAGA TCTTGGACCTTTTATTTTAGGGTGAGTGGGTCTTTTAAGCATGATAGTTCTCTTGCTTTTTTGTAACGTCCCTTGCTTAT CCAATTAGTTTGTTTGTTATTTGACCTAAAAGAAAAATAGGTTTGTATGGTAAAAGTCTCTAGTTTTGGTCCCCTCAATC TGAATTTCTGGTTCTGCCACCTCCGCATGTCAGTGTTGGGGGAGCCATGGTCCCCCTTAAAAGTTCTTATCTTTTTTCTG TAAAAAAGGAGAAAGATTGAAATTGTCTTATATTGTCCTGTCTTAGATGTGAACTTGTATTTCGTTGTTTCAACAGATTT ATTCTTCTTTCAGGTGGTTCAGAAGGAAAGAGAAGAAAAACTTGCAGACATACTTAAAAATAGACTCAACCAATATGTCC AAGGAAACAAAGAGGACTTTGTAAATCAAGCAGAAGCTGAAGTAGCTCGGCTCTCCAGTGCAGGTACAATGTCCTAAGAA TAATATAATTCTAGACATGCAGGGAATAGGACTGGTGAAAACAATTTATTCATACAAATTTAAATGACCAGAGTTCATTG 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CAAGATGAGAATTTTATGCTGGATGAGTGGTTACACAAGACAAGATAGGATTAGAAATACAATCATTAGAGAGTCGGGGG GGGGGGAGCTTCTATTGTAGAAAAGATGGAAAAAATGATCCATATTGCTCAACCTCACATAGTGGGAAAAGGCTTTGTTG TTGTTGGTGGTGGCGGTGATGGTGATGCTTACTTAGTTACTTGTCATTGTCAACACTGATGGAGTTCGAGACTCTAAAAA ATGGGACCTAGTTGGACTTCATTTTTTGTTTTGTTTTCCATTCTTTTCACCTTGAGGACTGTTGAATATCTGTTTAGATT TAGTTTACTATTAGTATTATCTCATTGAGATATAGTTTAGATTTGTTTCTCTATTTTAGATTAGTATCTATTTAAATAGA GATAATATCTATTTAAATAGAGATAATATCTATTTAAATAGAGATAGGTTTAGATAGATTTAGTTTCTTTTTATCTCTTT GTTAGTCTATATATATTGTAGTTTTCAGTCAAGTATTAATCAATGAAATACACAATAATTATTTTATCAAATTCAAGTTG GTATCAGAGCGAGTTTCGATCCTACCGCTGTGAGGGGGCTCCTCCCCCGTGAGCCCCCTCATGGTGACCTTCCAAATCTC TTTGGATTATTTTCACTCGTCCTGTGCTTCCGCGCTTGTTCGTTCTAGCCTTTTCTTACGGCCTCGTTTCTTTCTGATTA TGGTCCCCTTTGTCTTGGAACCCTATTGACCCTTGTTTCTTAATACTTAAAACAACCGCGCCTTCTTCTTCGGCGCGTGA AGGTAACGCACAAACCTGAACTCGACGCGACGACCACATACATGTTCGTCCGTTGTAGTATAGTTGGTCAGGATATTTGG CTCTCCCTCCTGGTTCTGTTCCAGATGTTGTTTTCTCCAGATTTTCCTTCCTTTAATGCAGTTGCGTGATTGGAAGAAAT TGTGGGAATTGATTCAACAATTGTTTACTCAAGAATTCTTGATTGGAATGACATAATAATTCTTCACTGCCAGCGAGAGT ATTGGTTACATGAAGTGGAAATATGGAATGCCAATGCGTTGGGATGGTGATATTGGAAGTTTCTGATGATGCCAGAATGA AGCAGTACCATGTGGCTCTTTGGTCCAATCCAGTTCTCAATTAGTGTGTTGGGTTGTTCTAGTTTCTTGTTTTTGGTTTC TTGGTTTTGGTTGGCACAGTGTGGTTTTGGAGTTGGAAAAGATTTTTGCTCTCTATTAAAGTGGAGAATTGGTTTTGCAT TGTGTGGTTTGTTGGTGTATAAATTTTGGACTATTTTTGGGAATATCTCTCTCCGGCAGCAGCTGCTTCTCAAGTTAATT ATATTTGTTAAAAGCTATGCATATGACATATATGCGCTAGCTTGAGGGGAAGATCTGAATATTGTTAAATCTTAATTATA TTTGTTACAAGCTATGCATATGACATATATGCTATAGTTTGAAGGGAAGTGTTGGATATTGCTAAATATCCTAATAGAGA CCACAGTCAACCACCGCCGACAATCGTTATCCTTGTTGCTGGTTTGGTGGAGGGTGTATTCAAGAAGTGTTTGGTTGGAT CTAATTGTATTGCGCTGCATTGTTCTCGCTGGTCCTATTTGTGTTTCGGCCAGGTTTGGTTTTTAAGGTCCTCTATTTGA CGTGTGTTGTGGCGCCACCGTTAATGGTCGTCTGGTCTTCCTCTTCCAGTTTGGTTTGTGGGTCTGCTGTGTTTTCTCAT CTGCGATGTTTCTTGCTGTTTGAGTTCTTAGTTTGCGTCTCATGGTTCGTGATGCTCTTATTATATTGATCTTGGCTGAC TTTATGCAATTTGGTTTTGTTTGGTTTTGAAGGTGACAGTTCGTTTGTTTTGTCTCGATTGTTTGGTTTTCTGGTTTTAG GGCTTCAGCTGCAAGTTGCGCTGGCCCACTCTCTAGTTGAGAGTTATTGGTTTTGGTTTTAGGGCTCTAGCTGCGAGTTG CGCTGGCCCGCTCTCTAATGTTTGAGAGTTGTCTGTGTCAAAGTTGACACCATTGTTTGTTTTAGAAGCCATCAATCGAT CGACCTCAAGTATGTTTTATTTCTGTGTGGTTGTTGTTGGTGAGTTGTTGCTTCAGCCTTGTTTTGTTTTCGGGCGTATT GTTGCTGGTTTTTCGCCCTTGTTTGCTGACTCAGCTACCCTACGACACTCCAGAAGAATTGGTTTTTGTCTTGCATCAAT TTCAGCCAGATCAAGTATGAGAAGTTGTCTTTTGCCTGCCCATGGATTTAGCAGAAGTTCGAAAGATTATTCAATTTGAA GTATGAGAAGTTGGCTTTTATTGCCATGGATTTACTAGAAGTTTGAAAGGTTATTCAATTCAGAAATTCGCCAAGACTGT CATTATTAAGGGATATCTATTAAGATAATTTTTTTCTTGGGTTCGATTTGTTACAAGCTTAAAGCTAAGTAAGCTTTAGC TTGAGGGGGAGTGTTGAATATCTGTTTAGATTTAGTTTACTATTAGTATTATCTCATTGAGATATAGTTTAGATTTGTTT CTCTATTTTAGATTAGTATCTATTTAAATAGAGATAATATCTATTTAAATAGAGATAGGTTTAGATAGATTTAGTTTCTT TTTATCTCTTTGTTAGTCTATATATATTGTAGTTTTCAGTCAAGTATTAATCAATGAAATACACAATAATTATTTTATCA AATTCAAGTAGGACAAAGTAAAACACTGGGAGGGATTGGCAAAATATCAGCTTAGTGGTATAGGCATGCGTGGACAAGAC CCATATGATAGGTAACTATGTCGTTGCATGATCAAAATAGCTCAACCCCACATAGTGGGAAGAAGCTTTGTTGTCGGTGG TGGCGATGATGGTGATGGCTACTTGTCAACACCGATGGAGTTGGATACTCTAAACAATGGGACCTAGTTGGACTTTTTTT AGCACCCCCTGTTAGGTTAAGGCTTTTATTTGAACTGATAGATAGAAGTTCACACTTGAAACTAACTATCTATTCACTTT GACTCTCTAGCTTGCAGACATGAATTGCTATACTTTAAAACGTTTGAGTAGGAGACTGACAAATGGTTTTTCTTTGTGTT GATTCTAGGGGCAATTGCTTTGATCCAACTGCAGGAGGATATGAAAAAGCAACTCAGTTCAGAAGGGAACTATACTGAAG AAGAGCTTGAAGAATACATGCAATCTCACAAGAAATTAATGATTGACTCTCTGTGGAAACTTAATGTGGCTGACATTGAG GCCACTCTTTCTCGTGTGTGTCAAATGGTTGTTTTTGCCACTCCAATGTTAACTTCTTTATATGGCATAAAGTATATTTG AGGGCTAGGTGTGATTTAATTTAGTTCATGTGTGCTTCACTTTAGGTTCTTCAAGACAACAGTGCCAAGAAAGAAGAGCT CCGTGCACGTGCAAAAGGGTTGAAAACTCTCGGTAAAATCTTCCAGGTTGTATCTCTTTCCCTACACTACACAGAATTGT TTGCAATATTGTATAGTGATGATGAAATGATGTTTAACTCACGATTTGAATGTAGAGGGTTAAGCCAGCTAATGGGAACG ATAATGAAAGTGTTCAAAACAAAGCAGTGCATAAGTTGAATGGAAATGAAACTAGCAATGATGCTTGTTCTCCTAGTGCA TCACCTAATGCTTCTAGTCCTGATTCAACACATGCTATGTATGCATCGCAGGTGCAATTTCCCCCCTGATACGCGCTTGT TTTTCCCTTCCTTTTTCAGCATCTGCTCCCCATGTTTATATTTATAAGTCACATTCTAGAAGCTTTTCATGTCCCTCGGT ATAAGTCATTTTAAAATATAAATGAAGCATTAATTTTTTTTCTTCAAGTTTACCTTTTAACATTTAATGCTTTATATTCT ATTATCTAACATTTAGCAAATAATTCTTTTAGTTTTCCAATAAGGGGTATTTTAGGAAAATAAACATGCTTTTTTATACA TTTGAGATTAATATCTAATCTTAACTAATTTTTTTTTTTAATTTGTGTAAATTGGTTGGAAGAGGCTTATAAGTAGGAAT AAATGGAGTATCCTTTTAAATTATCATTTTTATTTTTTATACAATTTAATTTATACGTTTTCTTGCTTTCTTTGATACAA ATGGATGTAGAGCCCCTATGTGGAGGCCCCACACTTTGCAGGCATGCAATTCGACTACAACTTCCCTAGGCCAACAGCTC CCCCTGGTGCCCAGAGACCTGCTCCAACCAGCAAGGATTGA 

CDS sequence (LotjaGi2g1v0462400.5) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGATCATTTTGCTTTTGCTGATTTTTATGTCTTTCATTCCTTTCAGTGATGCAATTATTGACCCTGCAGCAATCTTTGC CATGCTTTTCGGTAGTGAACTTTTTGAGGAATATATAGGCCAGCTAGCCATGGCCTCAATGGCTTCAATGGACATTTTTA CTGAAGGGGAACAATTTGATACTAAAAAGTTGCAAGAGAAAATGAGGGTGGTTCAGAAGGAAAGAGAAGAAAAACTTGCA GACATACTTAAAAATAGACTCAACCAATATGTCCAAGGAAACAAAGAGGACTTTGTAAATCAAGCAGAAGCTGAAGTAGC TCGGCTCTCCAGTGCAGCTTATGGGGTTGATATGCTGAATACAATTGGCTACATATACGCTAGGCAGGCAGCAAAAGAGC TAGGAAAGAAAGCAATTTACTTGGGTGTACCTTTTATTGCTGAGTGGTTTAGAAACAAAGGGCACTTCATCAAATCCCAA GTTACAGCAGCAACAGGGGCAATTGCTTTGATCCAACTGCAGGAGGATATGAAAAAGCAACTCAGTTCAGAAGGGAACTA TACTGAAGAAGAGCTTGAAGAATACATGCAATCTCACAAGAAATTAATGATTGACTCTCTGTGGAAACTTAATGTGGCTG ACATTGAGGCCACTCTTTCTCGTGTGTGTCAAATGGTTCTTCAAGACAACAGTGCCAAGAAAGAAGAGCTCCGTGCACGT GCAAAAGGGTTGAAAACTCTCGGTAAAATCTTCCAGAGGGTTAAGCCAGCTAATGGGAACGATAATGAAAGTGTTCAAAA CAAAGCAGTGCATAAGTTGAATGGAAATGAAACTAGCAATGATGCTTGTTCTCCTAGTGCATCACCTAATGCTTCTAGTC CTGATTCAACACATAGCCCCTATGTGGAGGCCCCACACTTTGCAGGCATGCAATTCGACTACAACTTCCCTAGGCCAACA GCTCCCCCTGGTGCCCAGAGACCTGCTCCAACCAGCAAGGATTGA 

Protein sequence (LotjaGi2g1v0462400.5) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MIILLLLIFMSFIPFSDAIIDPAAIFAMLFGSELFEEYIGQLAMASMASMDIFTEGEQFDTKKLQEKMRVVQKEREEKLA DILKNRLNQYVQGNKEDFVNQAEAEVARLSSAAYGVDMLNTIGYIYARQAAKELGKKAIYLGVPFIAEWFRNKGHFIKSQ VTAATGAIALIQLQEDMKKQLSSEGNYTEEELEEYMQSHKKLMIDSLWKLNVADIEATLSRVCQMVLQDNSAKKEELRAR AKGLKTLGKIFQRVKPANGNDNESVQNKAVHKLNGNETSNDACSPSASPNASSPDSTHSPYVEAPHFAGMQFDYNFPRPT APPGAQRPAPTSKD 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Phobius 1 1 1 -
SignalP_EUK 1 18 18 -
Phobius 1 18 18 -
Phobius 2 13 12 -
Phobius 14 18 5 -
PANTHER 16 327 312 9.8E-152
PANTHER 16 327 312 9.8E-152
Phobius 19 334 316 -
Coils 61 81 21 -
Pfam 72 263 192 4.8E-50
MobiDBLite 274 299 26 -
MobiDBLite 274 334 61 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

Unable to find any GO terms for the transcript with the identifier.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi2g1v0462400.5, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…