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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0074200 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0074200.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | DNA replication and repair recF; TAIR: AT1G04850.1 ubiquitin-associated (UBA)/TS-N domain-containing protein; Swiss-Prot: sp|P02977|M5_STRP5 M protein, serotype 5; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2NU08|A0A0B2NU08_GLYSO Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0074200 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:8154302..8178037) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AGAAAGTGGAAGGGTGTTACTAGTTCACACTGCAGCATATAAAACCAGAACTTGAACCCAAGTGTTTCAGTTTCAGTGTT AATCGAAGAAAGAAAAATGGAGGTGGAGTTGGAGCCTCGCGTGAAGGCTCTTCCGTTCAAGGTCAAAGCCATGTCCAGGG AATCGCCGTCGCAGAAAGCCCTCCATGTCCTCGACACCGACCTCCGTTCTCACTGGTCCACCGCCACCAACACCAAGGAA TGGATACTCCTCGAACTCAACGTGCGTGCGTCCTTCTCTTCCTAAACCCTATCTCCTTCCTTCATTTTCACTTGTTGCTG TTTCTCTTGATTCATCAATGTCTGAACTCTCAAACACTGTAACTAGTCAATCTGTGTGTTCATGCTGAAAATCAATAATC AATTTTATGTAAATGGAAGGAGTTTCTGGATTTTATTGCAAAGGAAGAGTTTATTGTAATGTAACTAGTTCACAAGTTAT TGGGGACTTGAATTGAACTTGCATTTGGGTACTTTTTTGTGTTATTAAGTAGGTTTTGTTGTGTATTTGTTTTTTCAGGA GCCGTGTCTATTGTCGCATATTCGGATTCATAACAAGTCTGTGCTTGAGTGGGAGATTGCAGTTGGTTTACGGTACAAGG TTAGGCGCTTGAAATGTGTCTAGCAAAGGGATCATGGAAATTGATATTATTCTTTTTTATAATGTATAGTTTATTGATTT ATAAAGCTTATTATGTGTCTACTGTAAAATTTTATTTAGGCTAGTCGATGCTTTATAAAGATTAGAGGGGAATTTTGTGG TATGCCAATGTGAGGATCGTTGGAAGTATTCTATTTGGCTTGGTTATTATTTAATGAATGTCATTAGTATATAATCCAAT GATCATATGCAGGAGGTTCCATGATAAATGGTACCAGTGTGTAATGTAACGCCTATTACGCATTACATTGAGTATTTATT 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GGGTTCTATCCTACAACTTTCATTAGCACTTATTGCTTATGCATGCCTGTACTCATCACCTGAAGATATTTCTTTGATTC CCGAAAATGTATGGGGAAATGTTGAAACATTAGGGTCATCAAAACATGGTATTAGATCTTTATCCCTGCCATATCTGTAT GAAATGTCATATCATAGTTTTGAATGTTATGTGTACTTTTAACTTCTTAATTTGTTTTCTATCACTTTTATAGATGGCAA GCTTGGAGACCTTGAAAAGAAGACTTGTCAAGTCCTCTGTAGATTGAGGGATGGAGATGAGGCGAAAGAGGTATATCTTT TATAGTGAGACTAGCCATTCATACCAATTTAGATAAAGCACATGAAATTATTTTTCTGTTCAAAGCATATTTTAGTATTT TAGGCTTGTTCTTGTCCCATAATGAAATGAATTTCGAATTATGTTTTTTATGTAAGGCACTGAAAGAAGTACTTTCTTCA AATTCTTCAAAGCAGCATGATCCAGACTTTGCTAGTATGCGTGAATCTATTCTCCAGGTAAAATACTTAAAACAACGACG TCTTCTTTTCAGTTTTCATGAAAATCAAAATTTTGTTTACAACTTTGCATCGAAGTTAGTCATTTTAAATATAAAACATA TGTTTGACTGTATGGTTCTATTTCTTGTCTGATACTACTAGAGTAACATAATTTATCATGTGCATTTATTCTAACTTACA GTTGTGTGAAACCCACTCATAAGTGAATCTGCACCTTTATATATATCATTTACAAATATAGGCATTAAATGTTCTCTGCA GGATTCATATCAAATACAGTTACTAGCAGCTCCAAATGCTGCTATTGAGTATTGACTACTCTGTTCCTCTTTTAGGACTC CTAATAAAAGAACAAATTTGTTCAAGTGAGCAAAAGAAAATTAAACAGCATAACTCCATTTTAAGGTTGTTAATGGCGGA TGGCAGGCCAAAAACCCGCCATATATGACATACTGGCGGCCTACGGCGGATTATGGCGGGATATCGGCCATGGTGGTGAG CCTAAAAGCCAGCCATGAGAACCGGCGATTTTATCAATGATCCATTTTACAAAATGACTGGGAAGTGGGAAATTGAGGGA GATGTTAACTTTAGGATTTAAGCAGATTGAGTCAAATGGAGGAATGTTTCGTGTATAATTTTTCATAGAAAAGTACCATT CAAACTCAAGGGAAGATTTTTGAACTTTAAAGTACAATTGTTAGACTTGCAAGTTTGTAAGGAATTGAATATTGGATGGT AAGTCCCTAAGAGATGAGAAGGATAGGATAGATGGGTGAACGCACTAGAGAATATGGTATTAGAAATGAGAACATTAGAG AGAAAGTAGCACTTATATCTATATAAAGATTGTAGAGTTTTCTTTAGGTGATCTGGGCATGTATAAAGAAGACCTACAAA AGCCCAGTAATGAAAGTAGATCAAACAGAGGATATTTCAAAAGCTAGAGAGAGGGAGAAACTAAGAAAAACTACAAGCTA AATCATTAGGAGGAAAAAAGGGGTTCGGAAAGGGCAGAACACCCTTCCTCCCTCTCATCTTAGTCTGTTATCTGCCAAAT TTCTCTGCTATTGCGGCGACTGTCCAGCAACGTTATGATCACACCCTTGAAATGTTGCTAGATTTGACTTGTCATACTTT TTTTTACATAATTGCGAATAGCCAAATTTTAACTTTTATATAATGGTTTTCAAACATTCTTGATTTTCAACAGGTCCTTG GCGACTTAACAGCAGTTCACTCATATTTTGATGTATTCTCAGAGAAAATTAACCAAGAAGCTATGGTATGAGTTCTCATT AACCAATTTATTATTTTACAACCTATCTGATTAGTTACATGTAGTTGAATATTTTTCTAGGAGGTAGAGGAGGCTGAGAT GGAACTAGACATTATACAAAAGGAACATGCATTACCAGGACGAATGGAGGATTCCAAAGGTTGGAATCAGACACCAACTC TACCCTGTAAGTTTTCATAGAGTACTTGTTTTCATTTTGTTTGGTTATTTAGAAACATTTTACAGTTAGTTCCTGAATGG CCCCCAGCCCTCCTCGACTCTGTATCTTTTAATAATTTGAACTTTACAGCCTATGGGAAGGATCTTTCAAGGCTTCAACA AATCAGAGAGTGCATTCGTTCCCTGTAAGTGATTTTAATTTTGACTGATAGCCAAATTTGACTGGCTAGCTTGCTCTCTA TGGTATTTCTTGCTTACCTCATTTGTTTTTGTTCACGAGGCCATCCTCATCTTCAGTTTGATTACTTTCTTCTCTTAAGT TAAACTATCTTGTTATTGCTAACCTTCCCAACCAAAAGTTGAAAATAGGAAAAAAGAATAAAAGACAGAAAGGCAGTGCA AAGTACCCATTATCATGTGAATTCTTATTCCAAGTTTCCGATAGCACAAGAGCAACTGGCCCGATAATAGAAGATGAATT GGGCGTGGACTAGGAGAGAAGTGTATAAAAGGAAGCTAGACTTCTAGCAAGATAGGGACTGGATGTGAATTCTGGAAAGG GAAAAATTTAGCATGTTTGTTGCAGGGCATTGAGTCTGTCAGAAATTGGTGTGAAGGCTTAGTCCAGGAGAGGAGAGTCA TCTCTGGAGGAGCTGTTGCTCTGGTGTTACTTTGCTAGAATATTAGAAACCAGAGAGAAAAACTGAGAGACAATTGGTGT AATAGTTCTGAATTCACAACACTGAATGTGAAGTACAAGAGAGATCATACATATATTATGTTAAGCCGAGTTGCATGAAG CTTACAACAGAAGCTACTGACTACACTGAGTACTAACTACTAACTGAATCTGAACTAGCATGAACATAATCTAACAGACT TGTACCTGCAAGGCTGCAACAGGTTACTGGTAACAGTGTAACAGGAGCTCTTCTAAACTACACAATACACTAAAATACTT TTTCTTGGCGTTACTTTTCCATTCAATAAAGTCACATATTCAGTAGTGTTCGTACGTGTTCTAACTTTTTCTTATGTATT CAAACATATAACTAGTTGCTAGCTTGGTTAGGTTTACTGTAACTTCCTTGTTTTTGGTATTGCGTAACAGATGCCTCTTA TGATTACTTTTTATCGTCTACTTTGAAACCTTGATCATCTATGCTGCTGAGATTTGTGACTCAGTGAAAACTTGTTCCTT TTGTATTGTTATCAGGGAGAAGACCAAACTTAAAGAAGATATTCTAGGCCGTAGGCAAAAGAAAATACTACTGAGACACA CCCATCAAAAACATTTGGAAGAAGCAGCTTTACGGGAAGCAGAACTTGTACAAGAACTTGATAGGTTCTAGATCTATATT CAGGACTTTGTTGCTTGTTTTATTTATGTTATGATTTTTGAACTGGAAGCTGAGCCCTTTCCAACTATTCAATAGGGAGA GAGTGGCTGAAATTGAAAAGGAGCTGGAAAGACAAAGATTACTAGAATTAGAGCGTGCTAAAACAAGGGAATTGCGTCAC AATCTTGATATGGAGAAGGAGAGACAAACGCAGGTAATCACTCTTGAAAACAGGAATCATTATTCTGAATTGTGTTATAA TACTGATTTCCAACAACTGTTCAAACTATTAATTTAGTTCAAGTAGTACAAGCCCACCCCATTATGACTTACTAAACTTA CATTTAAATGCAATCACTGAAGCTGGCATGTAGTTAGTAGTTACATACATAATTGAGTCCAGGACCTCTTAGCAAACATG TGTCATATCGATTTATTCATAAATCTCTATATATCCCCCGTAAAACTGCATCCAAGTAAGATATCCATGGAAAGTCATGG ATACTTTCATTCAATCTTCCCCTTGTACTACTGGGGTCCTGTTAGCAACGTGACTTTGGGAGACAAAAGTGCTAAATGTT TTTTTTGCGCGCCTAAAGTGGAGATGTTTTCCTGAATAGGAGATACTTTCCAACAATGCCAGTCCTCCCCTATGGTATAA ATTCAACGAGAGTCCTCAGTCTGGAATGTGAGGTACTCAGTACTCACACTAATATTACTTTACAAGCACCGTGTGGCCTT TTAAAAAGTTCCGCATGGTATCTCTTATTTTTCATTCTTCTCAAATTTCAAAATGAAATGTCAACAAGGGTTTAGCCTAG TTTTCTTTTCCTATTTATCCCCTTGTATCCGCATATCAAGTTTAAACAAGTTAAGTCCTAGTGTTAGCATATCAAATTCA AATCCAAACTTATTATTCCAGACTAATTATGTTTTTTCTCTCTTCAAGGCTATGAAAAATAGTTGTTTACTTTTCTTCTT TCTGGCTATTAAGATAATGTTACCTTTCATTTTTATGCAGAAAGAACTTCAGCGTGAAATAGAGCAAGCAGAATCAGGAC TCCGACCATCTCGGCGTGATTTTCCTTCCTCCACCCACACTAAGTAAGTTAAACATTATCTTTGCAGTGAATGCTCGGGT TATAAGTAAATTTCTCTCTGTTCTGTTGGAACTTTTCCTTGGCTTTAACTTTCCTTTACCTGGTTTTTTGGGTTTCTCAT TGTAGTCGTCCTAGGGATAGATTTCGTGACAGAGAAAATGGGAGATCCGTAAATGATGGGAGCGCTAGAGCTGGTACTGG AAGCTTACAGCCTGAAATTCCTTCAATTAGTTCATCAACTACAGCATCACCGACTATAGTTCTTTCTGGCTCCCGGACAT TTTCAGGCCAGGTGCCTACCATCTTACAGTCACGCGACCGACAGGACGACAGTGGCAGCATGTATGAAGAAAATGTTGAT GGAAGCAAGGATTCAGGTGATGCCAGCAGCATTGGAGATCCAGAATTGGCATCAGCATTTGATGGCCAGTCTAGTGGATA TGGATCCCAAAGGCAGAGTTCAAGGGGAAGCAAGTCAAGGCAACTCGGGGAACGCAGAGACAGAGACAGAGACATCAGGC GCGAAGGGAAGTGGGAAAGGAAGCATTGATAGCTAGTGAACAGGGTTCTTGTGCACTTAGTAGGTCGTATTCATTGTATT ATCCATGCAAGAAGAGCAGTAGCTGTACTGCCTCAACAGAACAAAACTTTTGCAAAGGATATTTGTTGTATGTATTTTTG GAAAATCTATGCAGAACCATGAGGAACATGTTACATGTCACCCTGGGTCTGTAGCTGGTTCAGCAGTGTTGTATAATCCT ATGGATGGTTAAACTTTATGCAGGTCCATATTTTAGGCAACTGTATCAATTTCTGTACAATAGTGTGGATAATTGTGTCT AAGATTATTCACAAGGTTGTATACAAGATAAAACAGGTAGTTGAAGTTATTTTATTTTCTTAGAATTGCTAATCTTTTCT TAAATCCGTGTCATCAATTGAAATTTGAGCTGCTTGACTGTGCAAGTTTATCGTGTGACGTGTCACCAAACTAATTTGTG TTTGGCTTTTGTTTAGTATCAAATTCAATTGCAAAACTATTGTTTGAAATTTACTT
CDS sequence (LotjaGi3g1v0074200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGAGGTGGAGTTGGAGCCTCGCGTGAAGGCTCTTCCGTTCAAGGTCAAAGCCATGTCCAGGGAATCGCCGTCGCAGAA AGCCCTCCATGTCCTCGACACCGACCTCCGTTCTCACTGGTCCACCGCCACCAACACCAAGGAATGGATACTCCTCGAAC TCAACGAGCCGTGTCTATTGTCGCATATTCGGATTCATAACAAGTCTGTGCTTGAGTGGGAGATTGCAGTTGGTTTACGG TACAAGCCAGAGACATTCCAAAAAGTTCGCCCACGTTGTGAAGCGCCTAGACGTGATATGATCTACCCTATAAATTACAC TCCATGTAGATATGTGAGGATATCTTGTTTGCGTGGAAACCCTATTGCTATATTCTTTGTTCAGCTAATTGGAGTTTCTG TGGCTGGTCTTGAACCTGAATTTCAACCGGTTGTTAATTACTTGCTGCCACATATTCTATCTCACAAACAAGATTCTAAT GATATGCATCTTCAGTTACTGCAAGACATGACAAACCGGTTGCATGTATTTCTTCCACAACTAGAGACAGACCTTGCCAG CTTTCCAGATAATCCTGAATCTAATCTGCGATTTCTTGCCATGCTTGCTGGTCCTTTTTATCCTATTCTTCATGTGGTGA ATGAAAGAACATCTTCAAGGACTCCAGGCAATACAACTGACCTTGATGTCTCCAAAAGTAGTCAACTCTCACCGGCTCTA ACTGTTTCCTCTAACTTTGAGCCCAGGAGATCACGGAGTTCGTCCCCTTTCATTTCGTCTGCATATCGTGCCATAGTTTT TCGGCCAGATGCAATTTTTGTGCTGCTGAGAAAGGCATATAAAGATTCTGATCTGGGCTCTGTTTGTAGGATGGCATCTA CAATTATGCAGAAGCTCATAAATCCTGATACTGAGCAAGATGTATCAAACCCTCAGAATGAATTTATTTTTCTTTCGGAA GACAAATCAAAGTCAGAACTGTCTAGTCCTTTATCTTTAGTTGATTATTCAAACCTGTTTGGTGAGGATTTCCGAATCCC AGATGAGCAATGGGATTGCAGTTATCTTAATATAGTAGATACTGGGGCAGTGGAAGAAGGGATCTTACATGTTGTTTATT CTTGTGCATCCCAGCCTGTTCATTGCAGCAGGATGGCTGAGAGAACTTCAGACTTTTGGGCTGCACTGCCTCTTGTACAA GCTCTACTGCCAGCTCTACGCCCATGGGTGAGCAATTCTTTTGATGTTGTGGATGAAACTTTTTCTCAGTGGAATCAGCC TATTGTACAACAAGCCTTCTCCCAGATTGTTACTACAGCAACATCAGCTACCTATCGCTCACTTCTTTATTCTTGTGCTG GTTATCTGTCTTCATATTCTCCATCTCATGCTAGGGCTGCTTGTGTGCTGATTGATCTGTGCTCTGGTGTTCTAGCACCT TGGATTACTCAGGTGATAGCAAAGGTTGATCTTGCTCTGGAGCTTGTGGAGGATCTTTTGGGCCTAATCCAGGATGCTCA CAATTCACTTGTTCGTGCTCGTGCTGCCTTGAAGTATATTGTGCTAGCTCTATCCGGGCATATGGATGACATATTAGGGA AATATAAGGAAGTTAAACACAGAATCCTCTTTCTTGTGGAGATGCTTGAGCCTTTTCTTGATCCTGCCATTGCTGTATCG AAAAGCAAAATAGCTTTTGGTGATCTATCTTCTTCGTTTCCAGAAAAGCAGGAGCAGAATTGCGTGATTGCTCTTAATAT CATCCGTACTGCAGTGCGAAAGCCAGCTGTGCTACCCTCTCTGGAATCAGAATGGCGACATGGATCTGTGGCTCCTAGTG TGCTTCTCTCTATATTGGAACCACACATGTTAATGCCGCCAGATGTTGACCTTTGCAAGTCTGTTTCAAGACTAACTGAA CATGAAACTGCATCTGTTTTGCCTCTTTACTCTGACACCAATGCTGGAGGTGCCATTTCCAAGTCTAATAGTCAAGATGA TCCTGATGGAAAAGCAGATGTATCAGAAACACTAGGAAGATCTGATTCTATTGATGATCGTAATCTACTTTTTGCCCCAT CTGAATTGCAGAATATTACATTGACAAACTATTCTAATGCACCTAACCAAAATAGCTCTGTTTCTAACATTAGGGATATG AAATTGGAATCCAAACGTGTTGTTGATGAAAATTCCAGCCATCATTTTCCTACTAATGTTGTCATAGATTCTGGCCTTGG TTTTGAATACTTCCACCTGCAGGCAGATTATTTTCAACTTCTAAACCACCATGATTGTGAGCTTCGTGCTTCTGAGTTTA AACGCTTGGCTTTAGATTTGCATTCTCAGAGTAACATCACTATTGAAAGCCATGATGCTGCGATTGATGCTTTACTGTTG GCAGCAGAATGCCATGTAAATCCATATTTTATGTCATCTATAGGAACCACTTCAAAACTTTCAGACCTTTTGAACATCAA TGAATGTAAATTCGGGCAGACTCATGATAATCTGGAGCTGAACACGGCTTCTGGAAGGAATATACATAATTTACAGACAA TAGCCCATATAGAAAGACAGAGAGATAAACTTGTTTTTCACATACTTCTTGAGGCTGCAGAATTGGATAGGAAATATCAT TTAACAGTATCTGATGGAGAAGATGGCCCTTATTCCGCTGCAGGTTTTGATGAACAGGTTATCAAGCTGTCCCCCCTTGA TGTACAATATGCAGATGCTCTTACCTTGGTTCGACAAAACCAAGCTCTACTGTGTAAATTTTTGATCCATCGGTTGCAAA GAGACCAAATCTCAATGCATGAAATTCTCCTGCAATGTCTTGTGTATTTTTTGCATACGGGCACCAAATTATTTTGCCCT CCAGAACATGTGATTGATATCATTTTAAAATATGCTGAAGACTTGAACAGGATGCTGGCATCTTTTCATCCTCAGCTGAA GGTTGGTAGTTTGCATTTGGCACAAGAAAGAGCACGTGGGATAGAGCGGCGTTGGTTACTGTTACAAAGATTGGTAATGG CCTCAAGCAGTGGAGGTGAAGAGGAAAAATTTGGAACTCATATCCAAAATAATTACCTCTCTGGAAATTTAATTCCCTCT TCAGCATGGATGCATAGAATTTCTCATTTTTCTGGTTCTGTGTACCCTTTGGTTCGATTTCTTGGTTGGATGGCAGTATC TCGTAATGCAAAACAGTATATGAAGGACCGGATTTTCCTTGCATCTGATCTGTCTCAGCTGACATATTTACTTTCTATTT TTGCTGATGATCTTGCTGTTGTTGATAATGTTGTCAATAAAAAGTATGAAGAGGTTAAAATTGAAGATTCACGGGTTGAA CTTGGTTCCTCTGTTAGAAGAGAAGTTGAACGAAGTAACCAATATAATGAGGAACAATCTTTTTCTGCAATCTACCCTGA ACTCTGGAGATTCTTTCCTAATATGAAAAGGCAATTTGAATCTTTTGGAGAAGCCATTTTAGAGGCAGTTGGTTTGCAGC TGAGATCTGTTTCTTCTACTCTTGTGCCTGATGTTTTGTGTTGGTTTTCTGAGTTGTGTTCATGGCCATTTTCCGTTGCT TCTTCAATCAGTAATGACAATTTGAAAGGTTATAATGCAAAGAATGCTAGAGCAATAATTCTTTATGTGCTTGAAGCTAT TATTGTTGAGCACATGGAAGCTATGGTTCCTGAGACACCTAAATTGGTGCAAGTGCTTGTGTCACTTTCAAGTTCTACTT ACTGTGATGTATCATTTCTCGACTCTGCATTGCGTTTGTTAAAGCCTATTATTTCTTGTTCTTTGTCCAAGGTCTCTCAT GATGAAAAGTTATTGGATGGTGATTCCTGTTTTAACTTTGAGGAATTATGCTTTAATGTTCTTTTCAGTAGAATTAAACA GAAGAATGAGATCAAACCTAGTTCTGAAGATAAAGGATACAATGTGGCACTGGCTATTTTTATTTTGGCTTCAATTTTTC CTGACTTATCTGTTCGATATAGAAGGGAATTTCTGCAGTCTCTATTAAATTTTGCAAACTTTGCTGCTTTTGAGCCGACA ACTTCTTTCCATGATTATCTTAGTGCATTTCAGTGTGTTATGGATAACTGCAAATTACTGCTAGTGAATGCATTAACAGC ATTTGGTGTTATTCCTATTCAGCTGCCGCCTTTTCCTCATGTGACTGATGGTCGGCTTTCTGATGATAACTTACCAAATC CTTGGTTTCTCAGTGATATCTGTCACACTTCTCGTGAGAATGATGTTCTTAACGTAGAAAGTAACTGTTCTGTTGCTGAT GTTGATCATTGTCATTTATCTTCTGATGATTTAGAAGGCTTATCTAAAGACATGGTGGATCTCATTTCTGAGCTTAATCC AGCTATTGAGCGCTGTTGGAATCTTCATCATCAGATTACCAGAAAGTTGACGATAACGGCATCAGAGTGTTTTGTCTTCT CAAAATGTTTGACATCAGTTTCTAAAAAATTTAAGAATGTTGAAGATGGTGATGATAGAAATTCTTCACTGGCTGAATCA TCTGACCTGTTCACATTTCATTGGAGAGTTGGTCTTGAAGGTCTCTCTGAATTGATCATTACCCTTCAAGAATGCAGTTG CTGGGAAGTTTCTAGTTTGATTCTTGATTGTCTGCTTGGAGTACCCTGTAGCTTCTGCCTGGATAATGTGGTAGGCTTGA TATGTTCTGCAATAAAGAAAGTTTCTTTCAGTGCACCTAAAATCTCTTGGCGTTTGCAGAGCGATAAGTGGCTGTCTTCA TTAATCGCCAGAGGTATCTACAACATTCGAGAAAGTGAGGTTCCTCTCACTGATCTGTTTTGTACATTGCTGGGCCATGC AGAACCTGAACAACGTATGATAGCAATAAAACATTTGGGAAAACTTGTTGGCCAATGTACAAATGGAGAAAGTGCAGTGT TAAATTCAAAAATTTGCACTGACTTTGTTCTGAATAAGTTAGCTCTACATGTTCCTGATCATGTCTTATCTCATTTGGTT TCAAGTACTTGGGATGAGATTGTTGTGCTGGCATCATCTGATACATCATTTCAAATAAGGGTTTATGCAATGGCACTTCT TTCAAATTACATTCCATTTGCTGAGCGCCATCACTTGCAATCTCTTCTTGTGGCAGCTGATAGGATTTGTTGTTTCCACT ATGCACAACCATCACATGAGGGTTCTATCCTACAACTTTCATTAGCACTTATTGCTTATGCATGCCTGTACTCATCACCT GAAGATATTTCTTTGATTCCCGAAAATGTATGGGGAAATGTTGAAACATTAGGGTCATCAAAACATGATGGCAAGCTTGG AGACCTTGAAAAGAAGACTTGTCAAGTCCTCTGTAGATTGAGGGATGGAGATGAGGCGAAAGAGGCACTGAAAGAAGTAC TTTCTTCAAATTCTTCAAAGCAGCATGATCCAGACTTTGCTAGTATGCGTGAATCTATTCTCCAGGTCCTTGGCGACTTA ACAGCAGTTCACTCATATTTTGATGTATTCTCAGAGAAAATTAACCAAGAAGCTATGGAGGTAGAGGAGGCTGAGATGGA ACTAGACATTATACAAAAGGAACATGCATTACCAGGACGAATGGAGGATTCCAAAGGTTGGAATCAGACACCAACTCTAC CCTCCTATGGGAAGGATCTTTCAAGGCTTCAACAAATCAGAGAGTGCATTCGTTCCCTGGAGAAGACCAAACTTAAAGAA GATATTCTAGGCCGTAGGCAAAAGAAAATACTACTGAGACACACCCATCAAAAACATTTGGAAGAAGCAGCTTTACGGGA AGCAGAACTTGTACAAGAACTTGATAGGGAGAGAGTGGCTGAAATTGAAAAGGAGCTGGAAAGACAAAGATTACTAGAAT TAGAGCGTGCTAAAACAAGGGAATTGCGTCACAATCTTGATATGGAGAAGGAGAGACAAACGCAGAAAGAACTTCAGCGT GAAATAGAGCAAGCAGAATCAGGACTCCGACCATCTCGGCGTGATTTTCCTTCCTCCACCCACACTAATCGTCCTAGGGA TAGATTTCGTGACAGAGAAAATGGGAGATCCGTAAATGATGGGAGCGCTAGAGCTGGTACTGGAAGCTTACAGCCTGAAA TTCCTTCAATTAGTTCATCAACTACAGCATCACCGACTATAGTTCTTTCTGGCTCCCGGACATTTTCAGGCCAGGTGCCT ACCATCTTACAGTCACGCGACCGACAGGACGACAGTGGCAGCATGTATGAAGAAAATGTTGATGGAAGCAAGGATTCAGG TGATGCCAGCAGCATTGGAGATCCAGAATTGGCATCAGCATTTGATGGCCAGTCTAGTGGATATGGATCCCAAAGGCAGA GTTCAAGGGGAAGCAAGTCAAGGCAACTCGGGGAACGCAGAGACAGAGACAGAGACATCAGGCGCGAAGGGAAGTGGGAA AGGAAGCATTGA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0074200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MEVELEPRVKALPFKVKAMSRESPSQKALHVLDTDLRSHWSTATNTKEWILLELNEPCLLSHIRIHNKSVLEWEIAVGLR YKPETFQKVRPRCEAPRRDMIYPINYTPCRYVRISCLRGNPIAIFFVQLIGVSVAGLEPEFQPVVNYLLPHILSHKQDSN DMHLQLLQDMTNRLHVFLPQLETDLASFPDNPESNLRFLAMLAGPFYPILHVVNERTSSRTPGNTTDLDVSKSSQLSPAL TVSSNFEPRRSRSSSPFISSAYRAIVFRPDAIFVLLRKAYKDSDLGSVCRMASTIMQKLINPDTEQDVSNPQNEFIFLSE DKSKSELSSPLSLVDYSNLFGEDFRIPDEQWDCSYLNIVDTGAVEEGILHVVYSCASQPVHCSRMAERTSDFWAALPLVQ ALLPALRPWVSNSFDVVDETFSQWNQPIVQQAFSQIVTTATSATYRSLLYSCAGYLSSYSPSHARAACVLIDLCSGVLAP WITQVIAKVDLALELVEDLLGLIQDAHNSLVRARAALKYIVLALSGHMDDILGKYKEVKHRILFLVEMLEPFLDPAIAVS KSKIAFGDLSSSFPEKQEQNCVIALNIIRTAVRKPAVLPSLESEWRHGSVAPSVLLSILEPHMLMPPDVDLCKSVSRLTE HETASVLPLYSDTNAGGAISKSNSQDDPDGKADVSETLGRSDSIDDRNLLFAPSELQNITLTNYSNAPNQNSSVSNIRDM KLESKRVVDENSSHHFPTNVVIDSGLGFEYFHLQADYFQLLNHHDCELRASEFKRLALDLHSQSNITIESHDAAIDALLL AAECHVNPYFMSSIGTTSKLSDLLNINECKFGQTHDNLELNTASGRNIHNLQTIAHIERQRDKLVFHILLEAAELDRKYH LTVSDGEDGPYSAAGFDEQVIKLSPLDVQYADALTLVRQNQALLCKFLIHRLQRDQISMHEILLQCLVYFLHTGTKLFCP PEHVIDIILKYAEDLNRMLASFHPQLKVGSLHLAQERARGIERRWLLLQRLVMASSSGGEEEKFGTHIQNNYLSGNLIPS SAWMHRISHFSGSVYPLVRFLGWMAVSRNAKQYMKDRIFLASDLSQLTYLLSIFADDLAVVDNVVNKKYEEVKIEDSRVE LGSSVRREVERSNQYNEEQSFSAIYPELWRFFPNMKRQFESFGEAILEAVGLQLRSVSSTLVPDVLCWFSELCSWPFSVA SSISNDNLKGYNAKNARAIILYVLEAIIVEHMEAMVPETPKLVQVLVSLSSSTYCDVSFLDSALRLLKPIISCSLSKVSH DEKLLDGDSCFNFEELCFNVLFSRIKQKNEIKPSSEDKGYNVALAIFILASIFPDLSVRYRREFLQSLLNFANFAAFEPT TSFHDYLSAFQCVMDNCKLLLVNALTAFGVIPIQLPPFPHVTDGRLSDDNLPNPWFLSDICHTSRENDVLNVESNCSVAD VDHCHLSSDDLEGLSKDMVDLISELNPAIERCWNLHHQITRKLTITASECFVFSKCLTSVSKKFKNVEDGDDRNSSLAES SDLFTFHWRVGLEGLSELIITLQECSCWEVSSLILDCLLGVPCSFCLDNVVGLICSAIKKVSFSAPKISWRLQSDKWLSS LIARGIYNIRESEVPLTDLFCTLLGHAEPEQRMIAIKHLGKLVGQCTNGESAVLNSKICTDFVLNKLALHVPDHVLSHLV SSTWDEIVVLASSDTSFQIRVYAMALLSNYIPFAERHHLQSLLVAADRICCFHYAQPSHEGSILQLSLALIAYACLYSSP EDISLIPENVWGNVETLGSSKHDGKLGDLEKKTCQVLCRLRDGDEAKEALKEVLSSNSSKQHDPDFASMRESILQVLGDL TAVHSYFDVFSEKINQEAMEVEEAEMELDIIQKEHALPGRMEDSKGWNQTPTLPSYGKDLSRLQQIRECIRSLEKTKLKE DILGRRQKKILLRHTHQKHLEEAALREAELVQELDRERVAEIEKELERQRLLELERAKTRELRHNLDMEKERQTQKELQR EIEQAESGLRPSRRDFPSSTHTNRPRDRFRDRENGRSVNDGSARAGTGSLQPEIPSISSSTTASPTIVLSGSRTFSGQVP TILQSRDRQDDSGSMYEENVDGSKDSGDASSIGDPELASAFDGQSSGYGSQRQSSRGSKSRQLGERRDRDRDIRREGKWE RKH
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 1318 | 1318 | - | – | |
| PANTHER | 4 | 2163 | 2160 | 0.0 | – | |
| Gene3D | 8 | 138 | 131 | 7.7E-11 | ||
| SUPERFAMILY | 13 | 134 | 122 | 1.91E-7 | ||
| SUPERFAMILY | 127 | 1353 | 1227 | 9.87E-7 | ||
| MobiDBLite | 217 | 236 | 20 | - | – | |
| MobiDBLite | 657 | 679 | 23 | - | – | |
| SUPERFAMILY | 1180 | 1850 | 671 | 8.25E-5 | ||
| Phobius | 1319 | 1338 | 20 | - | – | |
| Phobius | 1339 | 2163 | 825 | - | – | |
| Coils | 1854 | 1874 | 21 | - | – | |
| CDD | 1921 | 2010 | 90 | 1.57051E-4 | – | |
| Coils | 1945 | 1965 | 21 | - | – | |
| MobiDBLite | 1984 | 2064 | 81 | - | – | |
| MobiDBLite | 1984 | 2010 | 27 | - | – | |
| Coils | 1988 | 2008 | 21 | - | – | |
| MobiDBLite | 2017 | 2038 | 22 | - | – | |
| MobiDBLite | 2040 | 2064 | 25 | - | – | |
| MobiDBLite | 2078 | 2163 | 86 | - | – | |
| MobiDBLite | 2090 | 2104 | 15 | - | – | |
| MobiDBLite | 2123 | 2138 | 16 | - | – | |
| MobiDBLite | 2139 | 2163 | 25 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi3g1v0074200.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…