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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0123100 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0123100.3 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Telomerase reverse transcriptase; TAIR: AT5G16850.1 telomerase reverse transcriptase; Swiss-Prot: sp|Q9SPU7|TERT_ARATH Telomerase reverse transcriptase; TrEMBL-Plants: tr|V7BV12|V7BV12_PHAVU Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0123100 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:15068161..15080333) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GGTTCATCCATAAAACAAAAACTGTCCACTTTGAAGACTCCACTCCACTCTAGTTTGAAAAAAATCCCCTCTTCTTCTTC TTCCTCTACCTTTCCCGGGGGAAAAAATGCATCATCGGAAACGCAAATCTCAAGCTCCCGCCGTGCTCCACCGCTTGTTC CGGGATCGAGCACGAACCCTCTTCGACACCATCATTTCCCTGCTCCCTTCTCCTCGTCCTTCGCCGGAGCTTTGCTTCTG CAACCGCCGTCGCTGCCTTGGCTGCGCCGCCGATGCCAGAGCCTTCCTTATCAGACCTGATGATCCCGCCGATTACCGCA AACTGCTCACCAAGTGCTACGTCGTCGTTTCGGAAAATGCTCCTCCTGTTCGGTTTTTCATTGCTCAGTTTCTTTGCCCC CAAATTGAGGTATTGTTTGGAAAAAAAAGTACCTTTTTCCCCTTTTTTGATTCCCATTTCGCATTTTAAGAGATGTGTTT ATAATGTGTTTTGAAACTTGCACGTTTTCACGTTATGGAAAAAAGTGATTTTTTTTTGGAAAAAAAGATTCTGGAATGAA CTATTTGGAATGAAGTATTTTTGGAGGTTTGTTTATCACACCTGCTATCAAATACTAGGAGAGTGTGTGTTTGACATACC AACAAGGTTTCGGCTCCTTAAGCATCTAGTCCAGAGTTTGATCCCTGGGCGGTGTGTATAAAGCGAGAGAGGCGTACCCG TGATCTCCTAACCTTGAGGAGATTAGTCTCATGAAGGATGTGGATACATTAGAAACTAAAAGAAAAGAGTGTGTGTGACA AAGCTTTTAAATAAATTTATCTCCCTAGAATAGAATAATCTTTTTTGTTTATACAAGGAGCTTGTAGAAGATGAAAGAGC CTTTTAACAATTTGACCATTTACCTTTATTCAATTTTTTTGTTTTTTATATTTTTTAATTTATTAGAAAGATGAAACACT 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AATGAACCGGGTTTATGCGGGCAAAGATGGCGCTACTTCATTTGTTCGATGGAGTGGCCTTCTCATCAATTGCTCCACTT TGGAAATTCTGGCTGACTACACAAGGTTAATCTTGATTTAATTTTTTATTTATTTATCCTATTAGAATATAATGTGTTTA ACTGTTATGAGCATGTTCAGAAGACACATTTCTCCTGTATTTGTTGATTGTTGTCTGTGGAGTTTGACGATATTTTCAGG ATTTTGTTATGAAAATGTATAAACAGGTTCAATGTAGTGATAAATGGAACTTAACATTTAATGTTGTCATGTCATCTCAA TCTGATTTACTACTCTGAAGGCTATTTTAGAGTTAAGTATTATGCACCATGTGAATCTGTTTTTGTTCTCTAATGATTAG TTAACTATGCTGAACAGGTACTTGAATAACCATTTAAGCTCAACGCTTACTGTTTGCTGGCAAGGTAAACCAGGCATTCA TCTGAAGGAGAAGCTGCGACTCTTTCTAAGACCCAAGTGCCATCCAATATTCTTCGATTCGAATATCAATTCAGATGCTG TTGTTAGACTGAACATTTATCAAATTTTTTTGATATCTGCAATGAAGTTTCATTGTTACATTTGTGACCTATCATTCGTC TGCAAATTTGACAAAAGATTTTGTTCAGAAATTATTCAGAGTTCTCTGAGGTACGGATACAAGATTCATGCAGTTGAATC AGTTCTAGTATATTGTTGATTTGATTGACTTTTCTCAATGAACCAATGCTATATGTATCAAATGATTATGTGTTTCTTTC TGATTACTAAGAGTCTGTTTGATTTACTGCTAGAAAGTATGAAAAAATGGGAAAATAACACATCCCAAGTGCCTCGACAT GTGCTATTTTCCCATTTTCATACTTTCCAATAATAAATTAACGGGCTCTAAGACTCTGGGCATTACAACCATTAGTCAAA 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CDS sequence (LotjaGi3g1v0123100.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGCATCATCGGAAACGCAAATCTCAAGCTCCCGCCGTGCTCCACCGCTTGTTCCGGGATCGAGCACGAACCCTCTTCGA CACCATCATTTCCCTGCTCCCTTCTCCTCGTCCTTCGCCGGAGCTTTGCTTCTGCAACCGCCGTCGCTGCCTTGGCTGCG CCGCCGATGCCAGAGCCTTCCTTATCAGACCTGATGATCCCGCCGATTACCGCAAACTGCTCACCAAGTGCTACGTCGTC GTTTCGGAAAATGCTCCTCCTGTTCGGTTTTTCATTGCTCAGTTTCTTTGCCCCCAAATTGAGGTTGTAAAGAGCACCAT TGAAATGTTGTATCAAAAAGGTGCAGCCAAGTCTAATGTGTTGTGCGCTGGTTATTATGATAATAGTAAATGTTCAAGCC CTATTGTGGAGCTTTTATCCAGTGCATCTTGGTGCCTTCTGTTAAGTAGGGTTGGAGATGATTTTATGGTTTACCTACTG AAGAATACGTCAATATTCTTGCCAGCTCCCCAAAGGAAACACCACCAGGTTGGAGGTCCTCCGATCAATCGTCGATGCTT TGATATGCTCAAGAGTTCATCAGAGTTTGACTGTCAGCATCGTTCGCTTCATGACCGCGGTGTGCAAAAGAGAAAAAGAA CTCATGTTGATGATGCAACAGTGAAAAAACAAAAGTGCCATGTTTCTTATAGTACCAATGCTCCTGTTGTTGGCCTTACA AGTAATCTTGGATTTAGAGGCAAGCCTTCAATGCAACTGAACATGCATCAAGAGAGCAGTTGTTATGATGTCAGTGTCTC TGAAGCTCCTACGTCAACACAAAATGGAAAGCCAGACTTGAATTGTGTTACCAGGCTCGGAAAGCATTCTAGGCCATTTT GTTGGCAGAGGCTTAGACGCAAAAAGAAGAAGCAGATAACCTCTGAGGAAAACAGTGCCAATACACATTGCAATTTGCTT CCTACAAATACAGATTGCTTGCATGCTTGTTTAAAGCATCACAACACCAGCTTAAGCTATCATGAAAAGTTGCAGAAGTT GGGGCAATGCTCTTGCTGTTCAATCTTGCAATCTCCCTCAGCTGTTCCTAGGAGGACTGATATCAAAAGGCAATCCATCT TTTATAACTTGGAGTCTTCACTCTCAGTGCTTCCAAAGAAACATATTTTATATTCCTTAAGGCCAAATTTGGCTTGCTCG AAGAATCTCATTAGCCATATTTTTGGCTTCTCAGATGTAAATGCTATTACTCAGTCAGTGCCATGTTCCCACAACTGTGG TTCATGTCTAATTGACTCTGCATGCTTGTAA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0123100.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MHHRKRKSQAPAVLHRLFRDRARTLFDTIISLLPSPRPSPELCFCNRRRCLGCAADARAFLIRPDDPADYRKLLTKCYVV VSENAPPVRFFIAQFLCPQIEVVKSTIEMLYQKGAAKSNVLCAGYYDNSKCSSPIVELLSSASWCLLLSRVGDDFMVYLL KNTSIFLPAPQRKHHQVGGPPINRRCFDMLKSSSEFDCQHRSLHDRGVQKRKRTHVDDATVKKQKCHVSYSTNAPVVGLT SNLGFRGKPSMQLNMHQESSCYDVSVSEAPTSTQNGKPDLNCVTRLGKHSRPFCWQRLRRKKKKQITSEENSANTHCNLL PTNTDCLHACLKHHNTSLSYHEKLQKLGQCSCCSILQSPSAVPRRTDIKRQSIFYNLESSLSVLPKKHILYSLRPNLACS KNLISHIFGFSDVNAITQSVPCSHNCGSCLIDSACL
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 40 | 429 | 390 | 3.4E-46 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | DNA binding | Any molecular function by which a gene product interacts selectively and non-covalently with DNA (deoxyribonucleic acid). | ||
| Molecular function | Telomerase RNA reverse transcriptase activity | Catalysis of the extension of the 3' end of a DNA strand by one deoxynucleotide at a time. Cannot initiate a chain de novo; uses the RNA subunit of the telomerase enzyme complex as its template. |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0123100.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…