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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0141300 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0141300.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | NAC domain-containing protein; TAIR: AT1G56010.2 NAC domain containing protein 1; Swiss-Prot: sp|Q84TE6|NAC22_ARATH NAC domain-containing protein 21/22; TrEMBL-Plants: tr|A0A0S3SKK9|A0A0S3SKK9_PHAAN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0141300 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:18705049..18730514) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CCTCTTTCCTCTCTAATCTAACTCTCAAAATTTCTCACCTGGGAGTTGGGAGCTTCAACTAATTCTCTCTCCATTATTCT CTTCCTCTTAATTCTCATTTACACAAAATCTCTCAAGATGAGCAACATAAGCATGGTAGAGGCAAAACTCCCACCTGGAT TCAGGTTCCATCCCAGAGATGAAGAGCTTGTGTGTGATTACTTGATGAAGAAGGTGACACACAGTGATTCCCTTCTCATG ATTGATGTTGACCTTAACAAGTGTGAGCCATGGGATATTCCTGGTGAGTTTCATGTTAATCTCCCCTTCTTAATTTATCC TGCATTTTCTACTTCATAATTTCCTCCTCTGCATATTCATATGAGTAATTAAGTTGACTGTGATCAGCTCTTATGTTCTA TCTTAAATTTCATATGAGTAATTAAATTGACTGTGTGGATGAGGTGATGATATCCAATGGCTATAATAGATCCCCATTCA ATGTATGCACTTGCGTGTGCTTTGATAGGGAAATGATGATATATACCTCTCAACTCTGATGGATGATACATCATAAAATA TCTTAAAACTTTCATGTTGAAATTAATTCATCAGAAAACTACTTGTGAGTTAAATTAATTGGTAGGCCAGAAAACCTAAA ACTGATTAATAATGTCTTAGAAATATTATGTCATGTAGATCACTCCATGAAGGTTTTTGATGATTTTTTTGGTACATCAG AAATAAAGTTTTTTTTTATGATTTGATCTTGAACCCAAAGGTTAATTGCTAGCTATGATTCTGCTGTATATATGCCAATT AATGTAAAAACAAGATGGAGAACTGATTTGTTAATTCTTGCATCAAATGTTAATTTGAATATTTTTTTTTCCCTTGTGGA GTAATTAGAGAGCATATATCATTATTTCCAATCTGCATTTTCATGTGGGTCATAAGTTGACATAAGCCTATTTTCATGTG 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TCGTGCACAATAGGGGCACTTACCAACTGGGGGCACAATAGGGGGCACTTGCCAATAGGGGGCACAACATCAATGGGGGC ACTTGCCAACTGGTGCACAATAGGGGGCACTTGCCAACTGATTCTTCATTCCGATGGGCAATTCTCAATGTTTCTTCTGT TGTTGCTACCTCTCTTTCATGCTTCTTCCGCAGTCGCAGCAAGGTAATTTCAGTTCATACTTCTTTTTGCCTAGAATTTC CCAATTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTAGTTCATTCTTTCTCTTTCTTTGACATATATGATGTTGTG ATCCAGCCTACCCTGCCTCTGCTACCTAGATTCCCTCCACCCCTTCCTGCAGATCATCTCCGCGGTTATACACTTGTTAC GGGTCATACTGTCCATTTTTCAGATCCACTACCCCGCCTAAACTCAATCGACCCAAACATGACCTGTCTAAACAACGTCG ACCTAAACGGGACCGGGTCATAGAGCTGGAGAAGCCCAATGATGACCATCAGGTTCATCCTGATTGCACTGATCCTAGAT CGTGCATTATGTATTATTATGGGATGCTTCTCTCCTTCTCCACCACCACCTCCACCACCACCACCGTCGTTGTCGCATCT TGTGCATGTTGCGGAGCGACCACCACCAGAGAGTACACTTACCTCATTAGTAATTATTCAGATGATACCACCACCGATGC ACCTACCACACATGTCTGCTATAGAGCGGCCACCACCTACAATGTCGCTTGTGCCAGAAGGTTGCACTGAACAGTGGGTT GTAGCAGCTTGACTTTAGACCCGGTTCCCATAATCTATATTTGTATTTTGTAAAGAAAATTTATATTTAATAGATAAATT TCTTGAGTCTTTCAAAGCAGAAAAAAATAAAGATGCTAAAGAAGAAGAATATGATATTAAGTGTGAGGGCATGTCGTAGG 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AATTATTCTTGCAGTATTGGTTGGGGTTTCACTTATTTTAAACATCGCCACATTATATGCCACATTATATGCGTATACTA AGAAGAAAAAGAAGAGTAATGAGGTTCTTCCATGAAAATAGCGGATCTAGGGTCATAAAGGTTCAAGAAAATAAACTTGC AATTCTCTATGCATCATCTAATGTTTCTATTCAATAATTAATTATTTTAGAGTGTGTTGGATGAAGAATTCTAGAATTTT TGAGGATTTGAAATGATAAAGAATTCAATTGAATTTCTTTAATTTATTTGTAATATCACTTGTTTGGGTGAAATGCTTGA ATTTCTTTTAATTTCAAATTTCTTGTTTGTTTGAATTTTTTACATTTCCTTTATTAATACCATTTTTCTTTAGAAAAAAA ATTAAATTTAAAATGTAGAGCTTATTTTTTTTTACTTCATTAATATCATTTTATTTTAATAATATTTAAAAAAAAATTAT ATTGATGTATTGAGAAGAATACACAAGCAATGTCCCAAAGAGGCAAGACCATGTAAAAAGGAGGACAGCCCACAAACAAA CGACCTAGGCAAATACCAATAAAATGATTTAATAGAAACAAACTCTAAGCTACATCATACAACCACAACGTAAAACCTAC AACACCCACAAACTGACATAACCCAAGACCCAAGAAGAAGCCAAAAAGAACAACACCATAAAAGTGCAACATCCCCAAAA ACCCAAAAATCACCAACAAGACAGGTTTCATCTTTAGTCTCTACTACTCAACTCTCACTCAATCTTTGAAAACTAATCTC AACTACTAGACCTTGAAGGTCAATCTCATCCCCATGAAAAGAGCACGCCAATGTAAGTTTTGATGCTAGCAAAACTTCCT TTTGGAGGAAAGGAAAATGAAGACCTTATTTTTTACTTTTATATTAAAAATATATAATATTAGGATGATAGATAAATTGT TAGTGTATTATACTTATAATAAAGAGGGATGAGACTAAGCTCAAGAATAGGAGAGTAGAGATAACAAAAACAAAAACAAA ATATAAGCTCTAATCCGCAAGAATGCACAAGCTCTAATCCACAAAAAATTATGAACTTAACGGTGTCTTTTTTAAACTAT TTAGTTAAGTGCTTATGGTAATAAGCTTTGTTATATAAGTTCTTATTCATAAGTGAATTTGAGAATCTTATTGAAATAAG TTGAAATTATGTTATGGATCAGGATAAGAAAAAATGGAGAGACCTCCTACTTCGCCTACCCCGAAGTTAAAGTGTAACAC CCCAAAATTAAACACGTCGTTGATCAACTTTCGAAACATAAAGAAGCAGATATATTATTTTTTTTAGACATCTTTCTTTC GTTTCCACCCAATAATAAATAACCTCACCTCCATAAATATATGTACAACCAGAGACTCCAGAAAGAAATATCAAAAGACC ACCTACGTTGGACAAACTCCTTGTAATCTCCACGTTGGGTAGACCACGCATCAGCTAGACACCGGAGCCTACCCTTAAGT GAAACAGACTCATAAGATCACTCTGCATGCTTCAACCAACAACGGTAAGTTTCCTACCCCAAAGGTTCTAGCCTTACACA AGACTTTACTCCTCCTCCGAAGATCTCTTCTCGTCGGTCAAAACGTCGTTCTCTGATAACTCTCGCAACAGGTCTCTGAA AACAGCGCGGTCTCACGAACAGCCAATACTTACTTCAAGGTGGTAGATGAAGTAACCAGCCTTTTACAAGTAGTTTTCGG GGGAAAGTTCCAACGTAGCATCTCTTGGTCGGGCATGCAATCAATCCATTTCCCCAGCAACGTCTTCTCGTAATCCGATC GTCTGAAACTTATACCTCAAACACCGTCCACAACGATCTATCAACCACATTAATGGATCCTCCTCGTCGGGCATGCAAGG GTAAACTTCTAAAATATAGGTGTATAGGTAGTATATATTATACTTACACACTTGTGATTATATAGACAACACAAACACAT ATATTGTACGATAAGGTATATTCGCAAGTTCGTCCTACTCACACTTACTCACGTCAGTCCATCGATCACGTGGCTTATGT CACAGCACGAGAGTTGCTCATGACAACCTCCCAACCACACATAACAATCAAACCAATCCACACAAGACAAAGCCTCAATC TCATAATACACAAGGAATCAAGTCACATGAACATATATCATAGGTTACCCGTTCACAACTTAAGAGCATATAATTATCAT ATATCTCATTAACCGTAGGCATGCAATCATCATCAAACATCAAGTCATTCATAACTTGGTTACTTATCTCCACCACTAAG AGTCTTATCTATTGAGACCTTCTACTCCACCTACTCCACGTTGAAAGATCCTAAACTACTACCAATGCTTTGCCCGCTTT TCATAAAGGTTTAAGTAATATTTTAACGGAAGTCTTGACTCTTGAGTGACCACGGTTAAGTATAAATTTTTCCTTTTATT TTCAAAAAAAATTAAATATGATACCATGCATTGATTTGAAACCCTCTGAAAACTTTCGTAAATAAGTCACATCTTTTCGT TTACTTTTCTTTTTTGAAAACTCCAATAAGGTTTACCAAAATGTTTACGACATAAAACTATCGGAGTACAAAACTACTAA ATATCACGCGCAAAACATATATATACATATTTATCAACAAAAGATCAAGTCACAGACAGATAATGTTCTCCCGTATGTTT GTAGAGTGTCAAAGTCATAGAATAAGTATCCATTGTGTTAAGTTCAAACGTATATCCATATTGTTTTCCTTTATTTTGAA TGATAATAATTTTAAGGTGCCGCAACCAGGATTGCGGCGGGACGACGATAAAATATTTTGAGATTCAGAAGAGTCGCCAC CAATGTTTTAAAATGGGAAAACATTAGAAAACCCATGAACTTTTGATCTTCACAATCAGAGCTGGATCCGGGAGTCAATT ACGCGTAGGGAAGGTACTAGCACCCTACGACATCTGTTTACCTCTAATTAATTGTGTACAATTTATTAGCTTTTAAAATA TTTATCTCACCCTAAGAGAATTATGTATATTTATTATGAAATTTAATTAAGAAAAGAAAAATGGGTTATTTACATATTTG GCCTGACAAGCCTTTGAGGCTTGCGCCTACGCATCCCCCCTTGTGCAATGGGGTCTTCAAGGCCACGTAGTTCTTAGGGT TTAAATAGATTTTTAATTTGGGGTGTTTGACGGGAATCGCTTCCCGGCCTACGTATTCTCTTTAGAGAGAGATTAAGGCA ACGTAATTTTGAGGGAAAAGCTTGAAAAAGTTTGGTTTGAAGTAATTGGAGAAAGCTTGAAGAAACTTGATTTTGAAAGG CTTAAAAAAGCCAGGATTAGGAAATAATTTGAAAGTTCTGAAAAGTTAATATGAGTTACTGGAAGAGATCTTTATGATAT TTTAGGTTCTTAATAATATGAAGGAATCTTGATATTCGTTTATTATTGTTTAAGTATTTTGATACTAATGTTTTTATGAA TTTATGCGTTTTATACACTTCTGAAATTTCACCATTTAGTAATTTTGGGTAAGTAACAAATTAATTAATAAAATATTTGA CCCAGTTACCTTTCTTATATTGTTTCAAGTAAATAACTAATTAATTGAATGATTCAAAAGGATTGAATAAAAAAGGAAAA AAAAAACCTAGTCTAGATGGAAGAGGGCAGCGCCGCTGCAAATCTTCATTTTCAATTAACTCTTATTTTAATATTATTAT TTAATCCAATAAATTAGTTAATGCCTAACGACAAAACCTAGTCTGCAATGCAATAGCAAGAGCAGTGCTTCCATTCCAAT CAGTTGACAAATTAAAGGATGGATGGAAAATATGATGAAGCTAATAGGTGTGTGTACTGCAATGTGATTCTGCGTTATAA AGTTTTGAGAATGTTGTTAACAATTATGGTATAAAATTGATACTGAAATTGTGCAGCATGATGTAGCTTTATTTTATTGA TTTAAAAGCCATTTGTTAAACTTATAATTGATTTACTTGCATAATATTCAAACCCACTGGCAGTTAAATAAAAGAGGGAC CGTCCAGTATTTGCACGCGATTACATAAACTAGAGAAAGGGAGAAGGTTACCTTGTTGGAGCACCGTACAGGTCCTTCCC TTCGACAATCTTTTGGGTTGTGCTTGGTGGTTCCTTTGTTACATTCCTCTATTGGTATTTTGATTGTCCCTCTTCTTCTT GCCACTCTCACATTTTATGAATTACTTTTAGAACTATGGCTCAAAGATGGAACCACAGTTCACAAAAATCACTCAATTGT TTTTTTTTTCTCTCTCTCTGCCTCTC
CDS sequence (LotjaGi3g1v0141300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGAGCAACATAAGCATGGTAGAGGCAAAACTCCCACCTGGATTCAGGTTCCATCCCAGAGATGAAGAGCTTGTGTGTGA TTACTTGATGAAGAAGGTGACACACAGTGATTCCCTTCTCATGATTGATGTTGACCTTAACAAGTGTGAGCCATGGGATA TTCCTGCAACAGCGTGTGTGGGAGGGAAGGAGTGGTATTTCTACACACAGAGAGATCGCAAGTATGCAACAGGGCTTCGA ACAAATCGTGCCACTAGTTCAGGGTATTGGAAGGCCACTGGGAAAGACAGGGCAATACATCGCAGGGGCACTCTTGTTGG GATGAGGAAGACTTTGGTGTTCTATCAAGGAAGGGCACCCAAAGGAAGAAAAACAGAGTGGGTCATGCATGAGTTTCGCA TTGAAGGACCCCATGGCCCTCCTAAAATTCCTTCTTCCAAGGAAGACTGGGTTTTATGTAGGGTGTTCTACAAAAGCAGA GAGGTAGCAACCAAACCTAGCATGGGTAGCTGCTATGAAGACACAGGATCTTCATCTCTTCCTGCACTAATGGACTCTTA CATCAGTTTTGACCAAGCTCCGATCCACACAGATGAACATGATGAGCAAGTGCCCTGCTTCTCCATTTTTTCTCAAAACC AAACCAACCCCATTTTCAACCACATAACCAACAACATGGACCTAAAATTACCAGCTGCCAACAACAACACAACTACTACA TATGGAGGAGGAGCACCCAATTTGGGTTATAGCTTAGACCCTTTGTCCTGTGAGAGTAAAGTGTTAAAAGCTGTTTTAAG TGAGCTCACAAAGATGGAAAGAAACCCACTTAACCCAAGTCTTGGCTCACCAAGTTTAGGAGAAGGAAGTTCAGAGAGTT ACTTATCTGAAGTGGGCATGCCCCACTTGTGGAATAATTATTAA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0141300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MSNISMVEAKLPPGFRFHPRDEELVCDYLMKKVTHSDSLLMIDVDLNKCEPWDIPATACVGGKEWYFYTQRDRKYATGLR TNRATSSGYWKATGKDRAIHRRGTLVGMRKTLVFYQGRAPKGRKTEWVMHEFRIEGPHGPPKIPSSKEDWVLCRVFYKSR EVATKPSMGSCYEDTGSSSLPALMDSYISFDQAPIHTDEHDEQVPCFSIFSQNQTNPIFNHITNNMDLKLPAANNNTTTT YGGGAPNLGYSLDPLSCESKVLKAVLSELTKMERNPLNPSLGSPSLGEGSSESYLSEVGMPHLWNNY
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 305 | 305 | 9.8E-133 | – | |
| PANTHER | 1 | 305 | 305 | 9.8E-133 | – | |
| SUPERFAMILY | 2 | 158 | 157 | 4.18E-60 | ||
| ProSiteProfiles | 11 | 158 | 148 | 56.02 | ||
| Pfam | 12 | 134 | 123 | 1.6E-36 | ||
| Gene3D | 20 | 164 | 145 | 1.0E-53 | ||
| MobiDBLite | 274 | 292 | 19 | - | – | |
| MobiDBLite | 274 | 293 | 20 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | DNA binding | Any molecular function by which a gene product interacts selectively and non-covalently with DNA (deoxyribonucleic acid). | ||
| Biological process | Regulation of transcription, DNA-templated | Any process that modulates the frequency, rate or extent of cellular DNA-templated transcription. |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0141300.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…