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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0187400 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0187400.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | B-cell receptor-associated 31-like protein; TAIR: AT5G42570.1 B-cell receptor-associated 31-like protein; Swiss-Prot: sp|Q54K74|YETL_DICDI Endoplasmic reticulum transmembrane protein YET-like; TrEMBL-Plants: tr|I1LU43|I1LU43_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0187400 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:26344375..26359983) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AACTTACCCCATCTACCCATCCATATTCCATTCAATTAGATCTAACACCATCCATATTCTCAAACTCCAACTACCCAAAA TCAAAAGCCTCCAGAACTTTCATCTAAGGTTCCAAGCTCCGCCGTTCCAAACCCACAACTACCCATCGTGTCAAATCTTG TTCCAAACCCACATCCCCATCCAGAACGTTCATCTAGGGTTCCAAGCCTGCATTGTTCGAAACCCACAACCCCCATTGTT CCAAATCTCGTTCGAAACCCACATCCCCCGTCGTTCGAAACCCACACCCAGATATTTATTGAAACCCTCCATCCTTCCCA TCGGCTCTATTCGATCGAGGGTCTGTGTTTTTTTTTTGTTGTCGTCGCCTATGTCCAAACACATGCCTCAGTCGAAACCC AAATTTGTTCTTGTGTTTTCCTCTATAGTCACTTCTGCCATGGCCATCGTGAAAGGCATTTTTTCGCTCCTTTATTCATG TCTACCGATTCGCGTTTGGGATGTTTAACTGATTCGCGTTTGGGATGTTTAGGGTAATCTGGGTTAAATTGATTTGGTGG TTTGGGATGTTTAACCAAATTAGGGTATTTCGGGTTCGAAAATTGGGGATTTTGGTTAAGTTGATTTGGGATTTTTTCTA AATTTGGCTATTTCGTCGTGCCTGGAATTGAATTAGTGGTGGAATTGGTTGTAATTGAATCATTTTCTGGGTAATTTTCG ATTTGGGGATTTTGACTCATCTATGTTTATAATTTATTTGATCTGATTGAAATGCATATAAACATGTTTTCTTGTAAGGG TTATTGTAATTGAATGCATATTAACAATTGTTCTTTGTGTTAAAATTAGGGATTTATGGGCTAATCATCTCAAAATCAAA TGAGAAGGAAGTTGAAGAAGTGAATCCCAGGTGAATCTGGGAGTGCTTGACGGAGCTGTTCAGCATGGTTGAACCCAGTC GTTTGAGAGGGCTAGTGATTATTTTTGGTCCGGTAAGGTTAGTGGGCCGATCTAACCTTTTATTTTGGGCTCATCCTTGA TATTAAAGTTTTTATTCGTGCCTCCTTTTTTTTTGCCTCATTTTTTTTGTCCTCCTACTCCTTTTGGGCCTAATACAAAT GGGTATAAGTCCTTCCACCCCGCCACCGTTGAAATTTAATATTTAATATTAAATACATAGTATATAAAATTTAAAATGGA ATATTTAATGAGAAAAAGGATGATGCACCGACGGTGTAAAGTTTTTTTACACAGTCAACCAATCAGATTTTAAGGATGTG AGAAAATCTCTCTTTTTATTCAATTTCATTAATTCATTAATTGACGTGGCACATCCTTAAAATCTGATTGGTTGACGGTG TAAAAAAACTTTACACCGTCGGTGCATCATCCTTTTTGTCATATTTAATTTTGGGTAATCAATAGTTATTATTTATTTAT ATTTAATTACTAATTTTTATAGGTAATTGTTAATTAATTTTATAATTCATAATTATTAATTAACAATTAAATATATTTTT AACATCAGTTCTTCTCTTCCACAAATTAATTTTTTAACATCATTTCTTGCCTTCAACAACTAAGTTTTTAACATCAGTTC TTCTCTACCAGAAATAACATTTTTAACATCATTTGTTGCCTTCAACAACTATCTTTTTAATATCAGTTCTTCTCTTGCAC AAATTTTCAGCTTTGATACGATGACAGACATTGGACGTGATGAGGCTAGGGTGGTGGAGCCTTTTGATCCAACATCACTC TGCAGTGATGTTAACCAGATTAACGCTACTGCTATGGGTCTTGCTGGGTCGGTGAATGCCGCCTTGATGAAGTTCCAACA TGTAGACACTCATCTAGAGGAACTTCACAACATTCAGTAGGGGTGCACATGGGTTGGGTTGGATGGATTTTTAGGCTAAT 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GGAACCCTAGATGAACGTTCTGGATGGGGGTTGTGGGTTTGGAACAAGATTCGGCACGATGGGGAGTTGTGGGTTTGGAA CGACAGAGCCTTGGAACCCTAGATGAAAGTTCTGGAGGCTTTTGATTTCGGGTAGTTGGAGTTGGAGAATATGGATGGTT TTAGATGTAATTGAATTGAATGGAATATGGATAGGTAGATGAGGTAAGTTGGTGTAAAATTAATAGTTAACTGATGTTTT AACTTCTTTAATTTTTTTTTAAATTTGTTAACTTCTCAAATTTACCTTACTTATTTACCACTTGGGTTAATCTTAAATGA ATTGTCATAATATTTGTATAATATATTAACTATTTTAATTTTCGCAAAATATAAAAAATACAAAAATCTGAAGTAGTAGG ACAAAAGAGAGAGGTGCAACTATGCACAAGTTTTTCCTTGTGCATAGTAAATATTTCCCATATTTAGTAATGCAATTAAT ATTGTTAACTTTTTAAATATATTAGTATTTGTTTTCCTAGTTTACCCGTTAAAGTCTATTATTATATCTCTTCATTTATT GTTCACGTAGGAGTATTATATGGAGAAACATCGATAAATGCTCTCTTGAAATTCTAAATGGACAATTATATAAATAAATA TTTTTTCTCTATGTAGACAGTTATTTTGAAACGGATGGAGTATTAAATAAATCATATACATATTGAATATAAATAATTCA ATGTATGAAGTCATAATATAATCCATATTAGAAAAATTCTCCGAATTCATACGAAAAAATGCATAGTTCGATAATTTACA ATAAGTTTATGCCTTAATTTATAATGCAATACATATATCTTAATTCATATAAATATTTTACTTAAATATTTTGTAATTTT TTATTCAAATACATTTTTTTATGAGTAAGCTTAAATTATATGATAATTTTATAAATATGCAAAGGACTAGGATGATAATT 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GGGCTGGTCCATCCTAATCCCTTTCAAAAACCCATAATGGTCCAACATGCATTAAAACCAATAATCAATTTAAGAACCGT GACTCATGGATAAATGGGCCAGCATGAGACTTTACTCTTGAGTCTTGACCCATAAACTCAGCTGAAATGATTCATACTTT GTCGGCTAAAACAAACCAAAAAAAGAAGGTTGTAGAAAGAATGAATTGAGCAAAAGCAGGAAGAAGCAGGTGGAAGAGAT GGGAAGAAGCGCGTTGAGCGTTCGGCATTAAAAAGCAATGAAGAAGAAAGATCATGATCATCAAACCTGCATTCGCGTTT TATGTCGACTCGCAATTAACACGCACACTCATCCCACGCGCTCAAATCAATCAATATTAACACACACTCACACATTGCTA TAACAATTTCTAGGGTTTCCATTCCCAAATCCCAATCGAATTCGAATCGAACAATGTTGCAGCTTCTGTACGGTGCGATT TTCGGTGAAATCTTCATGATTCTGAGCTTCCTATTCAAGACTCCGTTCAGGAAGCTGGTTATCATCACGTTGGATCGGGT CAAGCGAGGTCGCGGTCCTGCTGTAGTCAAAACCGTCGCCGCCACTTTGCTGCTGCTCCTCGCTTCGTCACTCCACAGCG TCTACAAGATCCGCCGTCGCAGTTTCGAAGCTGGTGGCGGTGGCGGTGGCGGTGTCGTTAACCCTACCGATCAAGTGCTT ATGTCGAATCACGTTCTCGAAGCTTCTCTTTTAGGTAAATTGAAACTTTTGGTTTCGTTTCATTGTCAATTTTGATGGTC CCCTACACTCTGCAATGTGCTATGCTTTCAATTTATTTGCCTAACTTGAATTAGCGAAGTTTCTAAATTAAGCTCTTATG GGATTTGATTACACGTGTTGAGCAATACGCCATTTTCATAGTTTAGTTCTCGAAAGTTTTTATTTTTTTATTTATCAAAA CAGGCATGAAAAGGGTCATTTTTCTACCAATTTGGTTACTGGATAACATAAATTATATATATGAAATAATCTATTATACT AGTCTATGGAAATATAAATTTAAATTCATAAGTATTTCAAAGCAGTTCCTAAATTTAGACCCTTTTTTTGAAAGAGTAGG TTATTTTATAGAATAAACATTTATGCAAGAGTTAGAGATAGTTTATGTAAATAGCTTACGGCATTTTTTACCTTATTTTC ATAAGATGTTCATATGCTTATGAATAAGACATTATGCTTATCTGGAACTTATTTTCATTGTATTTCGATAAGTTTATCAA ATTAGCTTATGCATAGGTGCTTATGGTGCTAAGCGCTTAATTAAGTTAATTTATCCAATCGCACAATTAAATACATGGAT GAAATTGCCAAATAAATTGTATTTTTATAGACTTTTTTACTAGAATGACTAATCGGAATACAGACTAAAATGATGTTTTA CTCAGCTTCTGAAAATGTTAAGCCTTAGAAGTGATTTCAGAAGCTATTATTTAGAAAATTCACAGTTATTGTAACATCAT TTCATTTTTTAAAGCAAGTTTTCATTGAGAGGTTATCCAAACTGGTTTTGTATATGGAATTCATGTTTTTGCTTTGTTTC TGTAATTTGTATTTCTTCTAATGGTTTTTCTAGTGTATTAGTTGTTGAATTTGTTTTTTCACGTTTGTGCAGGTTTTGTT CTGTTCCTTTCTCTGATGATAGATAGATTGCACCATTACATTAGAGAGCTTCGGTTGCTGAGGAGGGCTGTGGAGTCTGC GAAGAAACAAAGCCGAAGCTTCGGTAACGGTATAAATGGCATTGCAACAGAGCAAAACAAGGCCTTGATGGAAGAAATTG CCACATTGAGGTCCAAAGTTAAGGAACTTGAGTCTGAATGTGAGGTGAAAGGAAGCAGGGCTAAGGGCTTGGAAGCTGAG 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GGGTTGGAAAAACATGAAAATTTGGAATTGATTTCGGTTCTTTGATAATAAAAATAGAGAGAATTTAGTTTGGAACTACT GTCATAGTTACAATATTGTTGAATGGCCTTCATCCATAAACCATCGTTTCTTTATCCCAGTCTCTTTTTCTTGACGAATT ATTCCAGTCTCAATCTCTCCTCTTGTATATCTCCACTAGTGGGCCGAATTTCCTCATCTAGGTATGTTCTTTTTTGTTGA CAAAAAACT
CDS sequence (LotjaGi3g1v0187400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTTGCAGCTTCTGTACGGTGCGATTTTCGGTGAAATCTTCATGATTCTGAGCTTCCTATTCAAGACTCCGTTCAGGAA GCTGGTTATCATCACGTTGGATCGGGTCAAGCGAGGTCGCGGTCCTGCTGTAGTCAAAACCGTCGCCGCCACTTTGCTGC TGCTCCTCGCTTCGTCACTCCACAGCGTCTACAAGATCCGCCGTCGCAGTTTCGAAGCTGGTGGCGGTGGCGGTGGCGGT GTCGTTAACCCTACCGATCAAGTGCTTATGTCGAATCACGTTCTCGAAGCTTCTCTTTTAGGTTTTGTTCTGTTCCTTTC TCTGATGATAGATAGATTGCACCATTACATTAGAGAGCTTCGGTTGCTGAGGAGGGCTGTGGAGTCTGCGAAGAAACAAA GCCGAAGCTTCGGTAACGGTATAAATGGCATTGCAACAGAGCAAAACAAGGCCTTGATGGAAGAAATTGCCACATTGAGG TCCAAAGTTAAGGAACTTGAGTCTGAATGTGAGGTGAAAGGAAGCAGGGCTAAGGGCTTGGAAGCTGAGGTTGAGACTCT TAAGAAACAATCTGAAGGGTTCCTTATGGAATATGATCGCCTCTTAGCGGAAAATCAGAATCTTCAGAGTCAATTGTAG
Protein sequence (LotjaGi3g1v0187400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MLQLLYGAIFGEIFMILSFLFKTPFRKLVIITLDRVKRGRGPAVVKTVAATLLLLLASSLHSVYKIRRRSFEAGGGGGGG VVNPTDQVLMSNHVLEASLLGFVLFLSLMIDRLHHYIRELRLLRRAVESAKKQSRSFGNGINGIATEQNKALMEEIATLR SKVKELESECEVKGSRAKGLEAEVETLKKQSEGFLMEYDRLLAENQNLQSQL
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 211 | 211 | 6.8E-106 | ||
| PANTHER | 1 | 211 | 211 | 6.8E-106 | – | |
| Phobius | 1 | 5 | 5 | - | – | |
| TMHMM | 4 | 21 | 18 | - | – | |
| Phobius | 6 | 22 | 17 | - | – | |
| Phobius | 23 | 42 | 20 | - | – | |
| TMHMM | 42 | 64 | 23 | - | – | |
| Phobius | 43 | 64 | 22 | - | – | |
| Phobius | 65 | 93 | 29 | - | – | |
| Phobius | 94 | 114 | 21 | - | – | |
| Coils | 113 | 133 | 21 | - | – | |
| Phobius | 115 | 212 | 98 | - | – | |
| Gene3D | 142 | 208 | 67 | 8.8E-6 | – | |
| Coils | 149 | 197 | 49 | - | – | |
| Pfam | 155 | 208 | 54 | 1.9E-7 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Cellular component | Endoplasmic reticulum | The irregular network of unit membranes, visible only by electron microscopy, that occurs in the cytoplasm of many eukaryotic cells. The membranes form a complex meshwork of tubular channels, which are often expanded into slitlike cavities called cisternae. The ER takes two forms, rough (or granular), with ribosomes adhering to the outer surface, and smooth (with no ribosomes attached). | ||
| Biological process | Intracellular protein transport | The directed movement of proteins in a cell, including the movement of proteins between specific compartments or structures within a cell, such as organelles of a eukaryotic cell. | ||
| Cellular component | Integral component of membrane | The component of a membrane consisting of the gene products and protein complexes having at least some part of their peptide sequence embedded in the hydrophobic region of the membrane. |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0187400.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…