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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0261000 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0261000.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase-like protein; TAIR: AT5G65940.1 beta-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase 1; Swiss-Prot: sp|Q9LKJ1|HIBC1_ARATH 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase 1; TrEMBL-Plants: tr|I1MM40|I1MM40_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0261000 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:47666755..47681632) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AAAAAAATCTCTATCATTTTGATTCATTTCAGTTCACTCACTGTTCTCTCCCTCATCGATCAGAACACCGGCCCCAACGA TCCAACCGATAATGGCTTCTCACACCAACCTCGACGACGATCAGGTCTCTCTACTCTTCATCTCGCCAACTCTCCTTCTA TTTTTCCTTCAATATTTTAGTTTTCTCTGCTTATTCTCACCGAACTCTTGCAAATTCTGAATTGTAATCATCACTTAGCT TCTGTTGCTTGCTTCAATAAAGCATCATCACTCTCCATGTCACCTTCTGATTCCATTGTTTTCCTGTTTTAAGCTTTTCA TTTGTTAGTAAACTGATATGATATCTTCTCATTTTTCATAATTATGTTTGTAATTTTCGTTCTGTTTGACAGCTTCTGGT GGAGCGTAAATTATCTGCTAGGGTTTTGACACTCAACAGGCCAAAGCAGTTGAATGCCCTCTCTTATTATATGGTATTCA CAGTACATCATTATCACTTTATTTGTTGAATTGTTTTCACTTTGGAGCAACATTTGATAGGAATTACTGAATTAGGAAAG AGCAACATTTAAGGATATGAAAACTATCACAGCTTCTCAGTGATTTGTGGAAGTTCTTTTGGCATTTCCATTACAGATCG TTTGAAATAGGAAGCACAAAAGTGAAAAAAAAAAGACATTTACAGAAGCTAAAGACATCCTAGGTTTTCCATTAATATAT ATCTAAACGTAAAAAAATGTTCTTCTATTTGCGAAGTTCCAATTCCATTTGCTATTTTCTTACTTTCGTTGTCTGTGTTC TTCTTCTGTCTTCTTATTATAGGTATCTCGGCTACTTGAAAGTTTTCAAGGCGATGAGGGGAATTCTGATATTAAATTGA TTGTTGTGAAGGTAATTTCCATTTACTGAGCACAATAAATTATAATTTTTGATTTTTTTTTATTGAGTCTGTCTAAGAGA 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TGCTTAAACTTGATTGAATTTCCATACTCTCATAAACTTTCAACATTAATTAAAGCATAAAATAAATGTGATCTGTGATG TCTGAGAGCGCTGCCTTATGAGAAAATACCTCTAACACTCCCAATCATGTTCAAGTTTGTAAACAATTTTGCTCAGCATT TAGTAGTTGTTTCTGTGTTAGACGATACTATGAACCCGTTTATTTCATTATTTTGGGGAAATTAGCTTGGGTTGAAGTCA TATTAGAAAGAGTCTCTAAATTAGGAGTGTTTGGTTGTTTATTGCATATGGTTTGGGTAGGAAGAGGTCCAGGAATCGAT TCCTGCAAGTGTAATTTATCTTTCCGATGTATCAAAATAAAATACTATTCATATTTATATAGTTCACTATCTTTTTTTTT ATATAAATAACTTTAAAAAAAAAAAGCTTAAATAACCTTAAAAACTGAATTGTGTTAAGTGTCAACACAATCTTTCAC
CDS sequence (LotjaGi3g1v0261000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCTTCTCACACCAACCTCGACGACGATCAGCTTCTGGTGGAGCGTAAATTATCTGCTAGGGTTTTGACACTCAACAG GCCAAAGCAGTTGAATGCCCTCTCTTATTATATGGTATCTCGGCTACTTGAAAGTTTTCAAGGCGATGAGGGGAATTCTG ATATTAAATTGATTGTTGTGAAGGGAAATGGAAGGGCATTTTGTGCTGGTGGTGATGTTGCAGCGGTTGTTCGTGCTGCG AGAGATGGTGATTGGAGGTATGGTGCAAAATTTTTTGGTAATGAATATAAAATGAATTACTTGATGGCAACATATAGTAA ACCTCAGGTTTCAATTCTCAATGGAATTGTCATGGGAGGTGGTGCTGGTGTTTCTATACATGGAAGATTTCGAGTTGTTA CAGAGAATACAGTCTTTGCTATGCCAGAAACAGCTTTGGGTTTATTTCCTGATGTAGGTGCTGCATATTTCTTGTCTAGA CTGGCTGGATTTTTTGGTGAATATGTTGGTCTTACAGGAGCTAGGTTGGATGGTGCTGAAATGCTTGCTTGTGGTCTTGC AACACATTTTGTCCCTTCACCGAAATTGTCTCTATTAGAAGAATCATTATGTAAGGTGGGAACTAGCGATCCAACTGCAG TATCGGCAATTATCAATACGTACTCGGAGCAGCCATTCTTGAAAGAGGATAGTGTTTTTAACAGGATGAATGCCATCAAT AAGTTTTTCTCAAGAAAAACAGTCGAGGAAATATTATCTTCTCTTGAGATGGAAGCTGAGAGTAAGACTGACAATTGGAT TTCTGCAACACTTCAAACCTTAAAGAAAGCATCACCAACAAGCCTTAAAATCTTTCTTAGATTGATTAGAGAATGCAGAC TCCTAGGAGTTGGTCAATGTCTTGTTTATGAGTATAGAATTGTTTGTCATATTCTAAAAGGACACTACAGCAAGGATTTC TTTGAGGGTTGTAGAGCTATACTGATAGATAAGGACAGGAACCCAAAGTGGGAGCCTTCCAAATTGGAGCTTGTAAGTGA TCGTGATGTTGATCGTTACTTCTCTAAGCTTGATGTTAAAGGATGGGAAGATTTGGAGCTTCCTAAAAGGTTCAACAATC TTCCTGCCTATGCTATTTCAAAGCTTTAA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0261000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MASHTNLDDDQLLVERKLSARVLTLNRPKQLNALSYYMVSRLLESFQGDEGNSDIKLIVVKGNGRAFCAGGDVAAVVRAA RDGDWRYGAKFFGNEYKMNYLMATYSKPQVSILNGIVMGGGAGVSIHGRFRVVTENTVFAMPETALGLFPDVGAAYFLSR LAGFFGEYVGLTGARLDGAEMLACGLATHFVPSPKLSLLEESLCKVGTSDPTAVSAIINTYSEQPFLKEDSVFNRMNAIN KFFSRKTVEEILSSLEMEAESKTDNWISATLQTLKKASPTSLKIFLRLIRECRLLGVGQCLVYEYRIVCHILKGHYSKDF FEGCRAILIDKDRNPKWEPSKLELVSDRDVDRYFSKLDVKGWEDLELPKRFNNLPAYAISKL
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Gene3D | 7 | 369 | 363 | 2.2E-121 | – | |
| SUPERFAMILY | 10 | 340 | 331 | 2.11E-60 | ||
| CDD | 12 | 196 | 185 | 4.23981E-54 | – | |
| PANTHER | 12 | 369 | 358 | 4.2E-149 | – | |
| Pfam | 21 | 354 | 334 | 1.5E-124 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase activity | Catalysis of the reaction: 3-hydroxy-2-methylpropanoyl-CoA + H2O = CoA + 3-hydroxy-2-methylpropanoate. |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0261000.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…