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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0294800 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0294800.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Beta-glucosidase; TAIR: AT5G42260.1 beta glucosidase 12; Swiss-Prot: sp|B8AVF0|BGL12_ORYSI Beta-glucosidase 12; TrEMBL-Plants: tr|B2ZUU2|B2ZUU2_LOTJA Beta-glucosidase D7; Found in the gene: LotjaGi3g1v0294800 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:60708507..60725098) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CGGTGATGCATACTCTATCTTGGTCAACACTTATCTTTTCCATACTGCAGAGTTTATTTTCCATTGTTTGTATATATCTT CAGTTACTTCCATGCTGATCTGTACTTAGACTTTATCAAGTTTTTGCTTTATAAAAGGCCCATATATTATCACACAAGAA CAAGCAATACTCACTCTTCTTCATCACATTCACATGATATGGCACTCCGCACCTTATTAGTTTTCCTTCTTCCCCTCTTG AGTGTTCTTGTTTGCGCATTACCATCGGTTACTTTTGCAGAAACAGTTTCTCCCATTCTTGACGTTGCTTCACTTAATCG CAGCAGTTTTCCTAAAGGCTTCGCTTTTGGGACAGCATCCGCAGCATATCAAGTACGTGTCTTTGAATACCAGGCCGGCC GGTTGATGAATTAATAAGAAAACACATTCATGTCAATTCATAAAAAAAGTTTGGTATATATTCATTTTTTAATTTTACCT TAAAGTGACCGCTAACGCCCATTTACATGGCACCAACAAATATGCAAACATACACATCTCTTTGTACACGGTCAACAGCA CATTAACTTTGAATCTGAAGATTTGTGTTCATGGTCAGTTTAGATTAGAATAATGATTTAAACATCGACAAATATCATGT TAACAAACATCCATGTTTGAATTAGCGTTGGGTGCATAGTACAAACAAATCACCGTAATCTTATAGAAGCTATAATTATG CTCTCCCAATTAAGGAATCAAATAAACAAGATATAAAATAAATCTCTTCATGTTCATTCACAGAGCTAATATGGATATAA AATATTTTCTCTTTTGTTTATTTTAACCACTTTGTTATGTATATCCAGTATGAAGGTGCAGCAAAAGAAGGTGGTAGAGG AGCAAGTATATGGGACACCTTCACCCACGAACATCCAGGTATCCATTTCCAAAAATTCAAGTGCATGTGAGTAATAAGCA 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CDS sequence (LotjaGi3g1v0294800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCACTCCGCACCTTATTAGTTTTCCTTCTTCCCCTCTTGAGTGTTCTTGTTTGCGCATTACCATCGGTTACTTTTGC AGAAACAGTTTCTCCCATTCTTGACGTTGCTTCACTTAATCGCAGCAGTTTTCCTAAAGGCTTCGCTTTTGGGACAGCAT CCGCAGCATATCAATATGAAGGTGCAGCAAAAGAAGGTGGTAGAGGAGCAAGTATATGGGACACCTTCACCCACGAACAT CCAGATCGCATCGAGGATGGAAGCAATGGAGATGTCGCAGTAGATGAATATCACCGCTACAAGGAAGATGTTGGGATCAT GAAATCTATGAACCTGGATGCTTATAGATTTTCTATCTCTTGGTCTAGAATCCTTCCAAAAGGAAAGCTCAGCGGAGGTA TCAACCAAGAAGGAATTAAATATTATAACAATCTCATCAACGAGCTGCTATCTAATGGTCTACACCCATTTGTAACACTT TTTCATTGGGATATGCCCCAAGCTTTGGAAGATGAGTATGGTGGTTTCTTAAGTCCTCATATTGTAGATGATTTTCAAGA TTATGCCGAGCTTTGTTTCAAGGAGTTTGGAGATAGAGTGAAGCATTGGATTACCTTGAATGAACCATGGTCTTACAGTG GAAGTGGCTACGCACTTGGGTCATTTGCACCAGGTCGATGTTCTAAATGGTTTAACCCAAATTGCACCGGTGGTGATTCA GGGACAGAGCCATATTTGGTTTCACACCACCAACTTCTTGCTCATGCAGAAGCTGTTCATGCGTACAAGAAAAAATATCA GGCATCTCAAAAGGGTATCATAGGAATAACATTGGTGACTCATTGGTTCGTACCATTTTCAGATAACAAATTTGATCATG ACGCTGCTGGACGAGCACTAGACTTCATGTTCGGATGGTTTATGGAACCATTAACTAGGGGAAACTATCCACAAAGTATG CGCTCCCTAGTTGGAAGTAGAATGCCAAAATTTTCTAAGAAGCAAGCTAGGCTAGTTAATGGTTCATTTGATTTTCTTGG ACTGAATTACTACACCTCCAATTATGCTGCCAACGCACCTTCTTTAAGCAATGCTAGACCTTTTTTCTTCACAGATGCTC TTGCCAATCTTACAACTGAGCGCAACGGGATTCCCATAGGTCAAAGGGCTGCTTCAAGTTGGTTATATGTTTATCCAAAA GGAATTCAAGAATTGTTGCTCTATATCAAGAAAAAGTACAACAATCCTTTGATTTACATAACTGAAAATGGTATGAGTGA GTTCAATGATCCAACACTATCACTAGAGGAAGCTCTTTTAGACACTTTCAGAATTGACTATTATTATCGACATCTCTTTT ATCTTCAATCTGCAATAAGGGATGGGGCAAACGTAAAAGGATATTTTGCATGGTCATTGTTGGATAACTTTGAATGGGCT TCAGGTTATACATTGCGGTTTGGAATAAATTTTGTGGATTATAAAAATGGATTGAAGAGGTACCAAAAGCTATCAGCAAA ATGGTTCAAGAATTTTCTCAAAAGATATTAA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0294800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MALRTLLVFLLPLLSVLVCALPSVTFAETVSPILDVASLNRSSFPKGFAFGTASAAYQYEGAAKEGGRGASIWDTFTHEH PDRIEDGSNGDVAVDEYHRYKEDVGIMKSMNLDAYRFSISWSRILPKGKLSGGINQEGIKYYNNLINELLSNGLHPFVTL FHWDMPQALEDEYGGFLSPHIVDDFQDYAELCFKEFGDRVKHWITLNEPWSYSGSGYALGSFAPGRCSKWFNPNCTGGDS GTEPYLVSHHQLLAHAEAVHAYKKKYQASQKGIIGITLVTHWFVPFSDNKFDHDAAGRALDFMFGWFMEPLTRGNYPQSM RSLVGSRMPKFSKKQARLVNGSFDFLGLNYYTSNYAANAPSLSNARPFFFTDALANLTTERNGIPIGQRAASSWLYVYPK GIQELLLYIKKKYNNPLIYITENGMSEFNDPTLSLEEALLDTFRIDYYYRHLFYLQSAIRDGANVKGYFAWSLLDNFEWA SGYTLRFGINFVDYKNGLKRYQKLSAKWFKNFLKRY
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 5 | 5 | - | – | |
| SignalP_GRAM_POSITIVE | 1 | 27 | 27 | - | – | |
| SignalP_GRAM_NEGATIVE | 1 | 20 | 20 | - | – | |
| SignalP_EUK | 1 | 20 | 20 | - | – | |
| Phobius | 1 | 27 | 27 | - | – | |
| TMHMM | 5 | 27 | 23 | - | – | |
| Phobius | 6 | 21 | 16 | - | – | |
| PANTHER | 15 | 516 | 502 | 3.4E-299 | ||
| PANTHER | 15 | 516 | 502 | 3.4E-299 | – | |
| Phobius | 22 | 27 | 6 | - | – | |
| Phobius | 28 | 516 | 489 | - | – | |
| Gene3D | 28 | 515 | 488 | 4.9E-232 | – | |
| SUPERFAMILY | 31 | 514 | 484 | 5.09E-196 | ||
| Pfam | 42 | 514 | 473 | 3.9E-164 | ||
| ProSitePatterns | 48 | 62 | 15 | - | ||
| PRINTS | 342 | 356 | 15 | 1.1E-23 | ||
| ProSitePatterns | 418 | 426 | 9 | - | ||
| PRINTS | 418 | 426 | 9 | 1.1E-23 | ||
| PRINTS | 441 | 452 | 12 | 1.1E-23 | ||
| PRINTS | 462 | 479 | 18 | 1.1E-23 | ||
| PRINTS | 486 | 498 | 13 | 1.1E-23 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds | Catalysis of the hydrolysis of any O-glycosyl bond. | ||
| Biological process | Carbohydrate metabolic process | The chemical reactions and pathways involving carbohydrates, any of a group of organic compounds based of the general formula Cx(H2O)y. Includes the formation of carbohydrate derivatives by the addition of a carbohydrate residue to another molecule. |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0294800.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…