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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0342500 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0342500.2 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Kinase; TAIR: AT1G79640.1 Protein kinase superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q551H4|FRAY2_DICDI Serine/threonine-protein kinase fray2; TrEMBL-Plants: tr|K7KYT5|K7KYT5_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0342500 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:71778456..71794782) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TGGTTGCAGGAGTAAAACGAAAGGAAAGGTGGCGGGAGAGAAGAAAAGAAACAGAACAACACTCATCTCTTGCGGCCACC CAATAAGATCGGAAGTAACTGATAAATAAAACAAAGCCCATTAGTTTTTCTTTCACGAGAAACTTGCCGAACCCTCACAA TCCCAATTACCCTTTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGTGCCCTGCGTTGCATCGCGACTCATCACATCACACTTCTCACT CTCTCATTCATCCTCTTCAATTCAATCACAACCACCATGAAGGACAAAGAAAAGGAAAAGGAAAAGGAAAAGGAAAAGGA AATGGAGAAGAAGAAGTACCCCATTGGTTCTGACCATTACACACTCTACGAAGAGATTGGCCAAGGTGTCAGCGCTTCCG TCCACCGCGCTCTCTGCGTCCCCTTCAACGAGGTCGTCGCCATCAAAATCCTCGACTTCGAACGTGACAATTGCGATCTG GTATGCATCCAATTCCAATTCCAAAACCTAATCAAATTTCAAATCCAATTCATTCCTTCATTCATTCTTCATTTCCACAG AACAACGTTTCACGTGAAGCTCAAACAATGGTTCTGGTGGACCACCCTAACGTGTTGAAATCGCACTGCTCCTTCGTCAG CGACCACAGCTTATGGGTGGTGATGCCGTTCATGGCGGGAGGATCGTGTCTTCACATATTGAAAGCCGCGCATCCTGATG GATTCGAGGAGGTTGTTATTGCAACCGTGCTTAGGGATGTGCTCAAGGGTTTGGAGTATCTTCACAACCATGGTCACATT CACAGGGATGTTAAGGCTGGCAACATTCTCATCGGTTCGCGCGGCTCGATTAAGCTCGGGGATTTTGGTGTATCTGCTTG CCTTTTTGATTCCGGTGACCGGCAGCGGTCCAGGAATACGTTCGTCGGAACGCCTTGCTGGTTGGTTGCTTTGTGATTTG 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CDS sequence (LotjaGi3g1v0342500.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGAAGGACAAAGAAAAGGAAAAGGAAAAGGAAAAGGAAAAGGAAATGGAGAAGAAGAAGTACCCCATTGGTTCTGACCA TTACACACTCTACGAAGAGATTGGCCAAGGTGTCAGCGCTTCCGTCCACCGCGCTCTCTGCGTCCCCTTCAACGAGGTCG TCGCCATCAAAATCCTCGACTTCGAACGTGACAATTGCGATCTGAACAACGTTTCACGTGAAGCTCAAACAATGGTTCTG GTGGACCACCCTAACGTGTTGAAATCGCACTGCTCCTTCGTCAGCGACCACAGCTTATGGGTGGTGATGCCGTTCATGGC GGGAGGATCGTGTCTTCACATATTGAAAGCCGCGCATCCTGATGGATTCGAGGAGGTTGTTATTGCAACCGTGCTTAGGG ATGTGCTCAAGGGTTTGGAGTATCTTCACAACCATGGTCACATTCACAGGGATGTTAAGGCTGGCAACATTCTCATCGGT TCGCGCGGCTCGATTAAGCTCGGGGATTTTGGTGTATCTGCTTGCCTTTTTGATTCCGGTGACCGGCAGCGGTCCAGGAA TACGTTCGTCGGAACGCCTTGCTGGATGGCACCCGAGGTCATGGAGCAATTGCACGGTTATAACTTCAAAGCTGACATCT GGTCATTTGGTATAACTGCATTGGAGCTTGCACATGGTCATGCTCCTTTCTCCAAGTTTCCACCATTGAAGGTATTGCTT ATGACTTTGCAAAATGCACCCCCTGGCCTTGACTATGAAAGAGATAGGAAGTTCTCTAAGTCTTTCAAGCAGATGATTGC TAGTTGCTTAGTAAAAGATCCTTCAAAGCGACCCTCTGCAAGCAAGTTGTTAAAGCATTCCTTCTTTAAGCAGGCTCGCT CCAATGATTTTATTGGACGGACACTTTTGGAGGGGCTACCTGCTTTAGGTGACCGCATGCAGCTCCTAAAGAGAAAAGAA GAAGATATGCTTGCACAAAAGAAAATGCCTGATGGGGAGATGGAGGAATTATCACAGAATGAATACAAACGAGGAATTAG TGGGTGGAACTTCAATCTTGAAGATATGAAGGCTCAGGCTTCCTTGATCCATGATTTTGACGATGCTATGTCAGACATCA ATCATGTGGGAAGTGCATCTTCTTTAGCTACACTTGATGCACAAGATAAGGAATTGCCAAGTGCAAACCATATGGAAGAA AATGAAATGCAAAATCAATCAGCTTCTGTTCCAGCAGTTGATTCTTCTGTAAATGATGCCAAGTCAAGGTTAGAAAAATC TGATGATGACTCTAGCATCACCAGTTCAAGCCATGAACCGCAAACATATTCTTCCTGTCTTGATGATCAAGTGGACAATA ATTTGGGTGAAAAATCTGAAATAGAAAATGGTGGAAGATTCTTGGAGAGCATGGCAACCCATTCTTATCATAGAAGAGGA TGTTCATCAAGCATCTTACCTGAAGTTACTCTTCCACCTATTCGAGCAGAATGTGAGAAGCCACAGAATCTGCTGCAGAA CATTTCAATTCCACAATCAGGAGAGGATGTGCTTACTGAACTTCCTTCTAGAGCCTCCAAAACTTCAGCTACTTCTGATG ACACTGATGAGAAATCTAAGATACCGGTTGTTCAACAGAGAGGACGTTTTAAGGTTACATCTGAGAATGTTGAGCCAGAA AAGGTTGCTCCTTCTCCTGTGCTGCAAAAGAGTCACAGCATGCAGGTTTTTACCCAGCATACTGCTACTCCTCTACAATC AAATTTACCTTTGTTATCAGCATCTGATGCTTCATCATCAAATCTTTCTGGCTGTTCTCTGTTCCCCATGTTGCAATCTG TGTTGCAGACAAATATTATTCAAAGGGAGAGCATTCTAAGTTTAATGAAACAAATTACTGTGGGTGACTCTACAGGTTCA ACCGCTTTCTCTGATGGCGCAAGTAACACAGCACCAGTAGCAGGGATTGAGAAATCTTTGCTTGAAGCAGCTCACGATAG GGAGAAAGAGTTACTTCATGAGATAACTGAACTGCAGTGGAGGCTCTTATGTACCCAGGATGAGCTTCAAAAATTAAAAA CAGAAAACGCCCAGGTGTGA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0342500.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MKDKEKEKEKEKEKEMEKKKYPIGSDHYTLYEEIGQGVSASVHRALCVPFNEVVAIKILDFERDNCDLNNVSREAQTMVL VDHPNVLKSHCSFVSDHSLWVVMPFMAGGSCLHILKAAHPDGFEEVVIATVLRDVLKGLEYLHNHGHIHRDVKAGNILIG SRGSIKLGDFGVSACLFDSGDRQRSRNTFVGTPCWMAPEVMEQLHGYNFKADIWSFGITALELAHGHAPFSKFPPLKVLL MTLQNAPPGLDYERDRKFSKSFKQMIASCLVKDPSKRPSASKLLKHSFFKQARSNDFIGRTLLEGLPALGDRMQLLKRKE EDMLAQKKMPDGEMEELSQNEYKRGISGWNFNLEDMKAQASLIHDFDDAMSDINHVGSASSLATLDAQDKELPSANHMEE NEMQNQSASVPAVDSSVNDAKSRLEKSDDDSSITSSSHEPQTYSSCLDDQVDNNLGEKSEIENGGRFLESMATHSYHRRG CSSSILPEVTLPPIRAECEKPQNLLQNISIPQSGEDVLTELPSRASKTSATSDDTDEKSKIPVVQQRGRFKVTSENVEPE KVAPSPVLQKSHSMQVFTQHTATPLQSNLPLLSASDASSSNLSGCSLFPMLQSVLQTNIIQRESILSLMKQITVGDSTGS TAFSDGASNTAPVAGIEKSLLEAAHDREKELLHEITELQWRLLCTQDELQKLKTENAQV
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 16 | 699 | 684 | 2.4E-236 | – | |
| Gene3D | 16 | 105 | 90 | 1.7E-28 | – | |
| PANTHER | 16 | 699 | 684 | 2.4E-236 | – | |
| SUPERFAMILY | 26 | 290 | 265 | 1.21E-79 | ||
| CDD | 26 | 289 | 264 | 2.69311E-172 | – | |
| ProSiteProfiles | 28 | 289 | 262 | 46.251 | ||
| Pfam | 28 | 289 | 262 | 2.1E-57 | ||
| SMART | 28 | 289 | 262 | 1.8E-87 | ||
| ProSitePatterns | 34 | 57 | 24 | - | ||
| Gene3D | 107 | 322 | 216 | 2.8E-60 | – | |
| MobiDBLite | 400 | 416 | 17 | - | – | |
| MobiDBLite | 400 | 451 | 52 | - | – | |
| MobiDBLite | 419 | 433 | 15 | - | – | |
| MobiDBLite | 434 | 451 | 18 | - | – | |
| MobiDBLite | 519 | 540 | 22 | - | – | |
| Coils | 675 | 695 | 21 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein kinase activity | Catalysis of the phosphorylation of an amino acid residue in a protein, usually according to the reaction: a protein + ATP = a phosphoprotein + ADP. | ||
| Molecular function | ATP binding | Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator. | ||
| Biological process | Protein phosphorylation | The process of introducing a phosphate group on to a protein. |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0342500.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…