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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0423800 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0423800.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein; TAIR: AT4G04650.1 RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein; Swiss-Prot: sp|B8GYN6|GPMA_CAUCN 2,3-bisphosphoglycerate-dependent phosphoglycerate mutase; TrEMBL-Plants: tr|V7BAQ8|V7BAQ8_PHAVU Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0423800 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:83300136..83312551) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TTTTTATATATATATATATATATATGGTGAGATCTTCTCTTCACAATGGATGAAACTCTGGCTGCGCATTCTTTCCATCA AAAGCTCAGTTATAGAGGGGAAGGAGATGGAGATCTCGATCCTAGAGCACACTTGTGCATGATATGTTGTTGCAGATAGA TTCTTAAAGCTATTACAATTTTCGTTGTGTCATCAAGAGGTACGCAATTTATACCAATTTTATTAGTGTTTCTAGTATAA ATTCATACTAGAGCAGGTTATACTAGAACTCTATAATATTAATTTATAAACTTTCTAAGATTTGGGATTTTAGGGTTTAT AAATATATATAAATAATAAATTCTTATGGTTATATCTGCAGATTGTGTTATATGAAATTGTGATCGGAATTCACCTATGT TTTGGGCGAAGAATTTGCGTCCTTAACCCAGCAATTTTTCATTTTCAGTTTGGAAGCGAGTTTCAATTCCATGACATCGT ACCCTGCAAGGTAAATGTAACCCTACATGTGTATTTTTAATGCTACCATTAATTTGTTGAATTATTTGAACTTTGAAAGA AAAAAAAAATAGTGAATTAAGTAATGTTTCCACATCCACATCCGTGAAAGAGAACGTCTGGATATCTTTATTTTTTTTTT ATCAGGTGTTGAGATTGAGATTTTTTTTAAAGGCCAATAAAAATTATATAAATATAGAGAGAAAAATACAGAGAAGGAGG TTGGCACTAGAGGTGCCAACAGCCCATACAAATACATGGTTCCATAGCCAACGAGACTAAAAGAAACCGAGAGCTAAATT AGACAGCAAAAAACTAGGAATCACAAAAATTAACCAGCATCCTACAGCCCTTGATCCCTGGAAAACAAACAACATTAGCA CCAAAGACCAGAAGAGTAGAAGCTAGGCCCTCAATAACATTCAAGCAGCATTTGCAACATTTGCAGTACCACACAGGTTC 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ACAATGAGTGGCCAAATTTAGAGTGCAAATATTAATTGAAAAAAATGCCTCCAAGAAGCTCTGCTAGGGTTCCATACCCT CTTGTAGCTAAAAGGTCAGTGGCAGCTCAATCTTGCTGTAGAGGCTCACGACGAGGAGTTGTTTCGGTGCAACCAGAGGG AGAGGCGGACGATGATGAAGATGGGGAAGCAGCTCATGGTGACGATGGGGACAGTCGAACCTACACCACAATCTTCATCA ATGGTATATCAGCGAAGATCGGATATCATCAGATCAAAAACTTATTCGCGCAACATGGAAAGCTCGTGAATGTCTTTGTT CAGTGATTGAAGAAACGAGGAAGAAGGTTTCGATTTGGATTCGTCCATTTTGTGTCGAGAAAGCAGGCCGATCGTGCGAT CGATCTCCTCAATGGTGTGAGGATGGGTGGGGCTTATTTGGTGGTAGCTTTGGCAAGGTTCCCTTTTTATGGCTCTTCAG GTTCGAGAGCTCACGATGTCGGTGGGCATTTTTCGCCCAGGAAAAAGGAAGGACACGCTGAACAGAGACAATTTCGAAAA GAGGTGTTGTCGGATCCACCATCAAAATCGTGGTGCGATGTGCTGCTCGGGAGGAAATCAGAAAGTAACTCAGCGCCGAC GGTGACCGTGACGACAAAGGATTGCATTTTCGAAGATCATTATAGTCAGGATGAACTGTGTTCTATATCCCATGACATTT ACATATTCCCAGAGCTTTCTTTAGGTGCTTGTTGGAAGGAGGATGGAAAATTGCTATTGGATAAAGATGAGGAGTTTACT GAGGTTGGGAAAAAAGGAAATCTGTCGAAGGCTTTTGTTGGGGGTGTTGCCTTAATTCCTCTCGTTTATAGGGTTGATGT TGAATTTGGGGTTAAAGCTTTTGTTTTTTGCAATGGGAATTTATTATTTAATCTGAAGCTGTCTACAATTTTGGGAGGCT GGGTTTTTGATCTTTTTGTTAGAGGTGAGATTGAAGAATTGTTCTCCATGTTCTCTCTTCATGTGCCCAGGTCGATGCGT TTGCTTATTGTTTCTAGCGCTAGTTCACTTTCTTCAACTGAAGCTTCATTTGTATCAATTGAGCCTCATACCTGTAACAA ACAGGCCGAGGTCTCTTCGCTGTCGTCAGCTATTGTTATTCCAGGCGAGAATCATGGTGTGGAGGTTGAAGGCTCTTTGG ATGGCATGTCTCGAGAGCCCAAGAAACTATGGCCGGCTTATGTGGTTGGAGGCCATGTAAACTCAGAAGAATTGGCTAGG CTGAATCTTATTCGCGTTGTGAATTCCGAGGGAGTCGAGAGTGTTAACTGTTTGGGACATAGTCTCGACGACATGGATTT CTTTTCTTCGTCCATTCCGTTCGGTTTGGATGAAACTATTCATTGCCTCATGGATCATCCTTCTTTTTCGGGTGCAAAAA ACGCTTTGGGTGAAACTCCTTTGGGTAAAGATGCTAAATCTTTTAATGGTTTGGAAACATCGGGTTCTAATCGCCTTTGT CGAGGCCGCGATGCTCCAAAGAAAATTAAGCAGCGACGAAAACCACAGGTTGCTATTGCTCTTGACCCGCAATATCAATT TGGGGTCTTGACGTGCGCTAGGAAGGCTAAATTATTAGCTCAAGGGTTGGGAGTTGTATTTTAGAATTTTAGAAGTTAAG GGGTTTTTTGATTTTGATAATAAGGGCTTTTCCTTTGTGCCTCAGTTCTATTTTTAAAGGTTGTTGGAATTTGTATTTGG CTATTGCTGGCAGCGGCGTGGAGGTGTTTCAAGGCCTTTAGATTTTCAGTCTTCGGCATTCCCTTGAGGTATCTGTTTTG GTTTTTCCCCTGTTTGGTGCGGTTTGTAAGTTGGTGCTGCTATGTCTGTTTGGATGCTAATGGAGCGTATTTTCTGCCTC TTTTATGATTACGTTTTCATGTATCTGTTTTAATTACCCATTATGTTTAAGTTTCACTTTTCTTTTTGCCTCTAGGCAAT GTTCTATTTCTTTTTATTTGAACCTTTGCTCCCTTGGAAGAGTTTGTTTCCAAGGCTTATCTTTTTATCTAATATATGTT ACTCTTTTCGAAAAAAAAATATTTATCAACATGTGAAGTTACACCTTTAAAAGGTGAACATCAGCTAAATTCATTAGAAG GGGACACATGTATTAAGAGACCATGAAATTAAATGAGAACAAAATGCATGATGGAGTGACACATCAGTAAATAGTTCTCA TAACTCTTGCTCTTTTACAAAGAAGAAAATGATATAAAAAAAGGAATATAAGCTCCAATAGCAAAAAAAAAAAATGTAGA ATAGAAAATAAAGCATATTAACTTGTTGTGGAGAATTCAATTCACTAAGATATACTTAACAGGGCAAGAACTATACACAA TGAAATTGAAGGTGAAAAAAATATGTATAAAAGATAGCATTGCCAGCATGGCACTACCTATGTTAACAATTTTAGCCATA TTTGACATAAAAATATAATGAAGCAAATTGAAAAAGCACCTTAATTGAAAGGCAATTGAGGTAAGGAGCTAATGTGCCTC AAAGAATTGTTTATCACATTAGTATCCATGATAGTTCTTAATAAACTGCATTGGCTAATTTTAGTGACAGCTAACATTCT TGATAAACTTCATTGGCTAATTTCACTTGCATATTTGGATGGAAAGTAACATCTCTTCCTTGAAAAGCCAGAAAGTATAG CATTCGAAGAACAATTCCCAAACTTCTCACATTTCTCTATGGACTAAGCTCGTATGGGGTGCAGGAGGGGGAAGATGAAC GCGACGAAGAGGTAGAAGTCAGGGGACTCGGGCTTTGAATGTGAAACGTCGGTGGCAGCGACTCGGTGGTGGGCGAGGAA 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AAATTTTCAGCCTTTCTATCATTTTAAACACATTTGATCTGACCTTTTATTGAACTATCCATGACTCCCTTCGCAACATC CTCTCATTCCCAGCTCCCCACGCCAAGGAATCCTCCTTTTCTGCGATTTTCCTTCGATCTCCTCCTCTCTTCTTCCTTGT TGGCGAAGTCATTATGGGTTTGAAGGACGTGGTTGAGTGTGACCTTGGGTGTATGGCACGGTGCTTTCACTGGCGGTTGT TTCGTAGATTTGGCAAGGTAGAGCAGTTCCAAGGAGTGGGTGGGTCATGCTAGGATGGAGGCGCTTGTGGTTTTCATTGG TATTTTTGGCGATGGTTGTTGTAGTGGCGCTCCTGCTTCTAAATTGGTGAGGCAGAGCAGATTGATGTTGGGCCTGAATT GTTGGTATTTTTGTTCGTTCGCCTCTATTTCAGTGTGCATCTTGCTGGGTCGTTCGAGCTCATGTTTACTTCACGTTCTC TTTGAAGTTGCTCCTTTGTGTTTAGGTGCTTCTCTCCAGATTTTCAGTCATTCTCTATATGTCGTCCTCTCAGCAATGGT TTGATGTTTGTTCTAGGTCCTTGGGTGGGTTAGGTTTTTGGGTTGGGTATCTGTTTTCGCAGGTTTCGTGCAACTTTTGG TAGGTATTTGTTGTCGTTGTTTTACGAATTCGAATAGAGACCTTTCTCTGTGGGGTTTGGTTCTCACTTTGGAGGTTTTT GGTGGTGCTGTTAAAGCATTTCTCTGTGCTAGTGGATTTTGTGTTTGTGGGTTTTTCCCAACTTGTTCTTTGACTTGGTC ACTTTATCTATAAGAGAGCTTGTTTCTCAACTAACTATCTATTCTATTTTCACTTAAAAAAATTATATATATGGTTAGGA TCTCATCTCCCGTGCCCGAATGATAGCTCAACAAGTAAGAGTTAGGGATCATGTGGGTTGTGTGAGGGAGATCTAGCAAT 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CDS sequence (LotjaGi3g1v0423800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGCTATATATACCTTCAAATAGTGGGTTGGAGTGCGGCTTATGTCTACATGACGTGGAAAATTGCTCTCATCTCTTCTT TGAATGTCAGGTGAGTTGGAAGGTGTGGATGCGAGTGTGTAATTGGTTTGGTGTCTTCACAGCTATGCATAAGAAACCTC AGGAGAATTTTATACAATTTTGTGCGGTTTGGGGGTCTGGCCTGAGTCTTTCCAGGTCTTTGGCCCTTATCTGGATTGCT ACTGTGTGCGCAATATGGTACCATAGGAATAATTCTGTGATCAGAGGAGCAACAGTGGAAGTGGATAGGATCTTTGAATC AATTCAGTTCAGGTCATGGCTTTGGCTAAAAGCTAAGGTGAGGGGATTTTCTGTATCACACTATGATTGGATAACTAATC CTATGTATTGCTTAAACTTGGTGGGAGAATGA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0423800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MLYIPSNSGLECGLCLHDVENCSHLFFECQVSWKVWMRVCNWFGVFTAMHKKPQENFIQFCAVWGSGLSLSRSLALIWIA TVCAIWYHRNNSVIRGATVEVDRIFESIQFRSWLWLKAKVRGFSVSHYDWITNPMYCLNLVGE
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 56 | 56 | - | – | |
| PANTHER | 10 | 138 | 129 | 3.1E-15 | – | |
| PANTHER | 10 | 138 | 129 | 3.1E-15 | – | |
| Phobius | 57 | 87 | 31 | - | – | |
| Phobius | 88 | 143 | 56 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi3g1v0423800.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…