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LotjaGi4g1v0054500.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi4g1v0054500
Transcript ID LotjaGi4g1v0054500.1
Related isoforms 6
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16; TAIR: AT4G04920.2 sensitive to freezing 6; Swiss-Prot: sp|F4JGZ1|MED16_ARATH Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16; TrEMBL-Plants: tr|V7CM89|V7CM89_PHAVU Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi4g1v0054500
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr4:6571115..6596154) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

TAACCCATCACCTAACCCTTTCTGGAATTTTCTGTGCTTTGCTATCATATCCACTCACACAGACACAGTGCCACAGCACA ACACAAACAAGTGAACAACCTCAACAAACAAAAAGTGCTCATACGTCACCTTTGAAAAACAAAATCCCAATTCCGACCCA ACAAAAACACTAACCTGCTTCCTTTGTCCACCACCACCACCCAACACAAAACCCTAAACCTCAGATCCTATCAAAATCTT TCCTTTACATTAAACAAATCAAATAAAAACCTCAATTTCCTCAAATCCCCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT CTCTCTCTCACTCACATTCTCCCCACTCTCTCTCTACAGTGGAATCTGTCACCTTCAATTGCAACTTTCCACCACTAACC CCATTCCCATTCTCTCTCTGGCTTTTTGGTTTGGTATATAAAAGATTTGAGCATTTGGGTATGAGTCAAATTGAAGGAGA GGGAGAGCTAGAGGCTCAGTCTATGCCCCAACAACCCCAAGAGGCTCTGAAGAAGGGTTCCGACGAGACCGAACCGGTCA CGGAAGAACAAGAGGTTGTGGAGGAGGTGAAGCCACCGTTGGATGATCCAATGGAGGAAGATGATCAAATTAGCTCCGCC ACTGTTTTCACCATCAGGCTAAGACAGTCTAGCTCCAATTTGCAGCACAAGATGAGTGTCCCGGAACTCTGTCGCAATTT CAGGTCTGTTCCCTGCATTCATTGGTTTTAATTTATGGAAATTGGTACAATTATTGAAGAATCCTTATTGTTATTTAGTG ATGGATTCTAACCTTTTTTATCAATTGCCTCACTTTCACTTGATTCCAATATTTAGTATGAATAATGCTTCTGTGTTTTA ACAATTCACTCATTGAGGGCTTAGTTTTCTGATCAAAATTGAGCATATGGCACCAAGTTTGTTAATAACAGCAAATATGA 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GTCTAGACAGGATAAAGTGTAGGCTACTGGAAGGATCAAATGCCCAAGAGGTCAGGGCGATGGTTTTGGATATGCAAGCC AGGTTGTTGTTGGATATGCTTGGGAGAGGAATTGAGTCTGCGTTGATAAATTCTTCTGCTTTAGTGCCTGATCTGTGGCA AGCGTCTGGTGAAACATTATCCGGCATTGACCCTGAATCAATGGCTGTTGAACCTGCACTAATTCCTAGTATTCAGGTTT GCTTTGATTACAGTTTGAAAACATCTGTTCCTTATTTTGGCTAATCATAAAATATAAAATGCAAATGTGTTGTGGTTCGC TATTGGTCTTTCGATATGATCATTTGTCCTCAGTCTTGTCATAATATAGTTGTCAATCCTTGATAGCAACCACAACCACA ACCACTATTGGATAACACAGGTTATAATGCACTGATACAGCCTTATCATAGTTCTAACTGTCAGTTGATAGTTAGTTAGG CTATGTTAATTTGACTGTTGAAAGAGTTTGTTATTTTGTTAAGTTCGGTTATCTAGCCTAGTAGTAGTAAATATTTTGCA ACATTTCACTTTGAATTCAATAACAACATTTTCTTCAGATTCTCTCTTTCTCTCCTTGTTCATTCTCTCTTACTATAATA TGGTATCACAACTAATCCTAGATCTGTGATTAGACCACCCATAATGGTCCACCTGCTAAAGTTTAAAGTTCAATAATTAA CTTGGTCCGCGGTTGTTCTAGGTAAAATTAATGAAATCAATATGACCCTGTAGATACTCCATGATGAGCATGAGGATATT CTGTTCAGACAGTTGTTCAAATTTTATTATCTATTTAATTGTCTGGGCTTCCTGTTTCTGAATTATTTCATTCTGTTCAG GCTTATGTTGATACAGTTCTTGATCTGGCTTCACATTTTATTACACGTTTGCGACGTTATGCAAGTTTTTGTCGCACATT GGCAAGTCACGCTGTGACTGCAGGCAGTGGAAGCAATCGCAATGTGGTTACCAGTCCTTCCCAAAGTTCAGCAACTCCGG CAACGAGTCAGGGTTAGTGTGCTCTTTATTAATAATCGGTTGCTATGATAAAAACTACGAGTGGACTCTTCTAGATTGAG AAGCTTTCTCAATTGATTCCTTGAATCCAGTCTTCAATTTGAAGTGTTTTTGCAACTGAAACTAGAGACCAATTGATAGA TTTTCAATCGAAAGGACCTATTGAGAAATTCACAAAGAAAAGGATCAACAAATAATTAACCTTTTTTAAAGTAAATATTC ATTATACAGTTTGCTTTATCAAATAACATGCCTCTATATGGATATCCTTAGGCACCCATGGGATAGTTAATTAACCTCCT TATATGGCATTAGAAAACAATCAATGGATGTAATCCGCTGGTTGGGCTTTTACTGCTCCTCTGGGATCTTGGCATGCCCA TAACACTAACATTGGTAGTATTAGTGCAGCCTATCCTTGCTGCAGTTCTAAGTTCTAACCATTGAAAAATCAAGTATAGA TCCACACTTTTAAATTGCAAATTTGTTTGCTTCTTCTCTTCTAATACTCATGCTCAATTATCCTACCCTGAATTAGTGTG ATCGTTATTTACAGACATAACTGAAATGATTGAAACATTTTTCCAGGTCAAAATGGGACCACTAGCTCCATGGGAAGCAC ACAGTTGCAAACTTGGGTACAAGGGGCTATTGCCAAGATTAGTAGCACTACTGATGGAGGGTCCAATTCAGCTCCTAACC CCATCAGTGGTCCTTCAACATTTATGCCTATTAGCATTAATACAGGAACGTTTCCAGGAACACCGGCAGTTAGACTTATT GGGGACTGCCATTTCCTTCACAGACTATGCCAACTTTTGCTCTTCTGCTTTTTCTTTCGGCGTACACAGCTTCCTCGATA TATGGGGGTTGCAAATAGAACTGCTGATACAAAGCCTCAATCTAATGCATCTGCTCCTGGGAAGGTGGAGGAGATTACAA AGCCTGTTTCAGCTGTGACCAAGTCAGATGATGGCCTGACAGGTCGAGCTGGTCAGCTTGTGCCTGGGGCAAAAGGAGGT GAAGAAGCACCTTCTGGACGTTCCAGAGTAGGTAGTGGGAATGCTGGCCAAGGATATACATTCGAAGAGGTATATTTCTG TTGTGTCTTACATAGATGTGTTTTCAAATATGTACTAATTCTTAAGTTTACTTAATACTTTAAAAAATTATGAAGTAGAC TATGATTTTACTTTTCTCTGTGCACTAATAATGCAGGTCAAGGTGCTTTTTATGATGCTCATGGAACTATGTCGCCGGAC AGCTGGCCTGCAACACCCATTGCCAATCTCTCAGGTAGGGAGCAGCAACATTCAGGTTCGGCTGCATTATATTGATGGAA ACTATACTGTGCTTCCAGAGGTTGTGGAGGCATCCCTTGGTCCACATATGCCGGTAACTTTATGTTTTTCCACTTATTTA AATTAGTTATTTCTAGGACACAAATTAAACTAGTTCGAATTGGTATTTCATGATATTGTTGCCTTGAGTTTTCACTATTT AATTGATTATTTGCTTCGCTGATATGTACGGAGGGATGGAAAGTGGCTAAATTACCTTTCTTTACACATTGATTCCTTTT TACAGTAAAAACTCATTTCCGGTTCAGTGATACATTACAATTTGTTAGATTATGTAGGTGCTATTGATGGTTTAAACTCT CGATACCCTCTTGTTTTTGTTTGACCCTCTAATTGGTCTTCCTTTTTCTTTTTAACCTTTCTCTGACTGCTCTCGGCTGA AACAAAAACACTATGCAGAATATGCCCCGTCCTAGAGGTGCTGATGCTGCTGGTCTTCTACTACGGGAGCTGGAACTCCA CCCTCCAGCAGAAGAATGGCATCGGCGGAATATGTTTGGCGGACCTTGGTCTGATCCGGAGGATGTGGATTGTGCAAATG ATAAAGCTAAACTTGTTTATTCTGACCCACTTGATTTCTGCTCATCGGAGCATGATGATGTATACTCCGGAACCCATCGC TTATGGCCAAGGAAGCGGAGAATGTCTGAAAGAGATGCAGCTTTTGGGTTGAACACTTCTGTGGGCTTGGGAGCTTATCT TGGTATAATGGGATCTCGAAGAGACGTCGTTACTGCAACATGGAAGACTGGCCTTGAAGGGGTCTGGTACAAGGTTAGAA AAGTAATCTTGTTTGTTTATTTATATTGTTTTTTCTGTTCATATGTACATGTAAGGATTGCATTACCTGGAAATGCTTTT ATTTTATTTGTTTTTGTTGTTGGAAACTGTCTTTTTCTCAAGGCTTAACACCAAATATTTTGCTTCTTTGGTTGGTAACA CTTTGAATGGACATATGGGGTAAATAAAGATATATGTTTTTTCTACAACGTGCTTGTGTAAATCAAGTCACTTGACAGAA GAAAAGCCTCACATGCTGGAGTTTAGATGGGCATCCTTCCTGTTAAATGTTCAATATATATAATCAGTGGGCATCCTTCC TCTTAAATGTTCAACTTTATCTAACATTCAATCTTGGGGATTGTGGGAGTTTGCATTTGACTCTATTACTTTCTCAGATA GACTTTGTTAACATGTTAGCTAATAACCTAGACTTTCTTAGGACTCTAACTGAGCCCTTAATGTGAAAGGAAACTCTGGT TGAAATGTGGATCAACAGTTTCATTTACCGAAAACCAAAGTAACTTTCTGGTGACTTGGGTCATATTCAATGAGGATAGA GTCTTAATCATTTGTTTACTGAGTTTCTGACACCTTATGAAAACCACTTGATTATTTGTCATTTTGACTTTTTGAACTAC ATTTTGTTTGGTTCAAGAATGTGCAATATCTGTAACATGATTTTTATCCCAAAAAAAAAAAGAAATCTTAATGTAGTCTA TACCTGGTCTTCTAACTTTTTGACATTGTGTACATTTTTCTCTGTATATCCTTTCTTTCTATGTATAGAAGAAATATTTT TATGAGTAGAACTGGATGTAAATGTAGATAGTGACTTGGGAACTTTAGAATAATCATTAGTGTCAGACTTGCTATTGTGA TGAGTCCTAACTTTTGGAAACTTAGTCATTCCCTTGATGATTTTTTCAAGTTATTTAAAGACATTTGTTTATTCTTCCTG ATATTTTAATTATTCAACTTTCTATTTTGTCTTCTTGTTTACTTCCATGGTGCAGTGCATAAGATGTCAGCGGCAGACTT CGGCTTTTGCTTCACCAGATTCTACTACCTCTTCTAATCAGAATGACCGGGAGACGTGGTGGATCAGCCGCTGGGCATAT GGCTGCCCAATGTGTGGTGGAACATGGGTTCGGGTTGTCTAGATGGCTGACTAGGAAACTGAAGTTAACATGCAGATGGA GTGCTGACTGGATTTGTACAGAAGACGTGTAGATTTTCCTGACAAGTTGGTTATCAGTATCTTTGTTTTTGTTGGTGGCT GTGTTATCTTGGGATTCCTACTGGTCACTCCGCGGGGTTTTAAATTATTCAAAAATTCAATTCATTCAGATCTGAATTTG TTTTGAGAATTATGGTCAAGTTACTCCACCAACAGTAGGTGTTAACATATGCTTGGAGTTTTTGTAGTTTACTCCTTCTT GCAGGTATGTAATATCTCATCTAGTACTCTATACTTCTAAATTCAGTAAATGCATCCCATTATGTATGGCCTATGTAGAA GTTTACATTTTTGTTCGAAGAAAAAAAAAATTCTCCTGAAGGCAGATTTTTCAAGAAATGAAATTCTAACTGTTAGAAGT CCCACTAATCTTTATAAGGGTAGTGCAAACCTCAACTCTTGAGCTAGCTTTTGTGGTTGAGTATAGGCCTACCAATTTCT AATACTAACATTACATTTCAAATTTTCACATTCAAACTTGTCAAAGCCACCCTTGTTTTTGGTAAATTTCTCAAATTTCT TGGAGATAATCTTTCTGTTTGTTTATGACGCTTGGGAGACAGTGATGAAATTTGTGTTACATTCATACTTACTATATATT ATATACAAATAATTTGTGATGTGAACTTGGTCATTATTCTTTAGTTTCAATTTACTGCTCAGGCAGTGTACTTGTACACC TTAACGCAAAATAGGCGAAGAAATATTGGATTTACTTGTGAACCTTCTAAATAAGATCATGAACTGTTAATGCTAAAACG GTGGAATGATTTTTCTTTTGTGAATCCCCATTGGTTGTTTAAGGTTCCTACCTATTTTCAGATGTATTCATATTTCGTTG AGGGGCGTGATCATAATAAACCATTTGCAAAAACACACTGTTGCACTAGAATGCAAGTTTGGGAAGATACTATTTAAGTT CTTAGATTTTTACTGTCACTATTCCACAGTGGATCATGTCCATCCAAGAGGTTTTTCTTCTTTGTAGTCCTTTCCAGTTT GCAAAGCTTGCTCTACATCTTCCTTAGATTTTGTCTTGCAGGCTCCTTACGTAACATCAACGGCTTTTAATAAACTTTTC GTTCCGTAATGCAGGTTGTAAACCCTCTGCCTGGTGTTTCATGCATTGCTGATATGGGAGTGGATATACAGATAGGATTA TTAAGAGGCTGCTGCTGGTGAATTGGAGATCATTAACCTATATTAATGTATAACTGTCATGACTCGTATTATAATGTATA AGATTATACTCTCCATCACATCTACACATTCTCGATTTTGTGTGGAGCTGGCAAGTAGACTCTTGTGCTAAAGTAGTTTG GACAAAGTCCATGTAATTAGTAGCTTAGCTTAGCATTTTACTATCTCCATGAGAACCCTGTAACTTGATGAAATGTTTTT TAAAGTTTTGTTGGGGGGCAATAGTGGTGCATTAAAATGAGTAATATGTAATTTTCTTAAACTGACTATGCAGCATTGGA GCTGGTTGGTTGGTGGTTTGACATCAGCAGTTTTAGTCGACCCAAATGGTTTCGTCTCCCTTGTCTTGTGCGGTCTAAGC TTTTGGTCCCTGCGTAATAGGAAACGTTTAAAAATGGTCCCTCATTGGAGTAAAGTTTGGCTTAGTCCCTAATTTTTTGG AGACTATCTAGTTTTGGTCCCTGTCAGGGATGGCAATCTGGTGGCCTTGCCACATTGTTTCACCGGTCCTACGTGTTAAA CGTGGTTGATTTTTTTTTCTTTATTTTAGTTCATTACCACATCATTCCACTATTCACTAATACTAAGCACAAATTAAACC TAATTAACCTCATTTTTGCCAATCTTAACACTAAATTAACCTCAAACTAAATTAAAGAGACAATTTCGGAAACCCATCCC TAATTCATTTGACCTTGAACCCCCAAATTTACTGTTCATCATTCAATGTGCAAACATCATTTTCTTCTTCTTCTCTTCTT TTCTTCATCATCTTCATTGTTTGTTTTTAATCAATTTTTTTCTTTTCTAGTTTTCTTCTTCCTCATCTTCTCCGAGCCTC CCCCAGCCTTTCAACCACAACAAAACCCTTTTACACAGGACTTCTCTGCACAAGCATTCTACATGACTTCTCCTCACAAG TAATCTACAAGACTTCTCCTCAACAAGTATTATCCAGGACTACTCATAAATTCGAAAGATGATTTTTCTTCTACTTAGAT CTCTTCACAAAGAGGGGTATAGAAAGTTTAAAGATCAAGCTACTCTTCTTCAAGTGTGTATACATGATTTGACATTAAAG TATATCAAGAGTGTTTTAGAGAGATTAAACGCGTATGTGCAATGATGATGTTGATATGAGATTTCTTAAGACTTTTCACT 

CDS sequence (LotjaGi4g1v0054500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGAGTCAAATTGAAGGAGAGGGAGAGCTAGAGGCTCAGTCTATGCCCCAACAACCCCAAGAGGCTCTGAAGAAGGGTTC CGACGAGACCGAACCGGTCACGGAAGAACAAGAGGTTGTGGAGGAGGTGAAGCCACCGTTGGATGATCCAATGGAGGAAG ATGATCAAATTAGCTCCGCCACTGTTTTCACCATCAGGCTAAGACAGTCTAGCTCCAATTTGCAGCACAAGATGAGTGTC CCGGAACTCTGTCGCAATTTCAGTGCTGTTTCTTGGTGTGGAAAACTGAATGCTATAGCTTGTGCAGCTGAAACATGTGC CAGAATACCAAGTTCAAATGCTAATCCACCATTTTGGATCCCTATACATATTGTGATCCCAGAGAGGCCGACTGAATGTG CAGTGTTCAATGTCATAGCAGATTCTCCTCGTGATTCTGTCCAGTTTATAGAATGGTCCCCGACCTCTGGTCCCTGTGCC CTATTGATTGCAAATTTCCATGGGAGGGTGACTATTTGGACTCAACCTTCTCAAGGGCCACCTAATCTTGTTCGTGATGC TAGCTGTTGGCAGCGTGAGCATGAGTGGCGGCAAGATATTGCAGTTGTTACAAAGTGGCTATCAGGAGTGTCTCCGTATA GGTGGCTCTCATCCAAATCTAGTGCTGCTGCCAATTCAAAGTTGACATTTGAGGAAAAGTTTCTTTCACAGCAATCTCAA ACTTCAGCTAGATGGCCCAATTTTCTTTGCGTCTGTTCTGTGTTCTCATCAGGCTCAGTTCAACTTCGCTGGTCCCAGTG GCCTCCTAGTCAGAATGGCGCCTCACCTAAGTGGTTCTGCACTAGTAAAGGACTTTTGGGTTGCGGGCCCAGTGGCATTA TGGCTGGTGATGCTATCATAACAGACAGTGGTGCCATGCATGTGGCAGGGGTACCGATTGTTAACCCATCCACCATTGTC GTTTGGGAGGTCACACCTGGGCCTGGAAATGGTTTCCAAGTGACTCCGAAAACAAGTACAACATCTGGTGTCCCACCTCT GAGCCCACCCAACTGGGTTGGTTTTGCGCCTTTAGCAGCATATTTATTTAGTTGGCAAGAATATCTATTATCTGAAGAAA AGCAAGGGAAAAAGCTGACTGACCAAAATCTAGTTGATGCTGTACCTCTATACTGCTCACCAGTTTCAAATTTTTCAGCA TATGTGAGCCCTGAAGCTGCAGCTCAATCTGCCGCGACCACTACATGGGGTTCTGGTGTAACAGCTGTGGCCTTCGATCC AACTTGTGCCGGTTCTGTTATAGCTGTTGTTATAGTTGAGGGACAGTACATGTCCCCTTATGATCCGGATGAAGGCCCAT CAATTACGGGGTGGAGGGTGCAACGCTGGGAATCATCTTTGCAGCATGTTGTTCTCCATCCGATATTTGGGAACCCTACT TCTAATATGGGTGGACAACCTCCTATGCAAACTGTTTGGCAGTCCAAAGTGGACCTGAGCATACCCCCAACCAATGATTT TAAGAACCATCAATTATCTGCAAGTGGGATGGCTATTGATGTGCAAAAGTCATCTGAGCCTGTTTCTGACAAGTCAAAGA GGGTCAATTTCGATCCATTTGATCTTCCAAGTGATGTTAGAACACTTGCAAGAGTTGTTTACTCTGCTCATGGTGGTGAA ATTGCCATTGCTTTCCTTCGGGGTGGTGTCCATGTCTTTTCTGGTCCAAATTTCACACCTGTAGACAACTATCAGATTAA TGTTGGATCTGCCATTGCTGCTCCTGCTTTTTCTTCAACAAGTTGCTGTTCAGCTTCAGTTTGGCATTACACTCTTAAGA ACTGTACAGTACTGAAAATAGTTCGGGTTCTTCCTCCTTCTGTTCCTATTAGTCAAGCAAAGGCTGATTCATCAATTTGG GAGCGTGCAATAGCTGAAAGGTTTTGGTGGAGCCTTTTGGTTGGAGTTGATTGGTGGGATGCTGTGGGCTGCGCACAAAG CGCTGCGGAGGATGGTATTGTTTCGCTCAACAGTGTTATTGCAGTTTTGGATGCGGATTTCCATTCTCTTCCTTCTGTTC AACACCGGCAACTTTACGGTCCCAGTCTAGACAGGATAAAGTGTAGGCTACTGGAAGGATCAAATGCCCAAGAGGTCAGG GCGATGGTTTTGGATATGCAAGCCAGGTTGTTGTTGGATATGCTTGGGAGAGGAATTGAGTCTGCGTTGATAAATTCTTC TGCTTTAGTGCCTGATCTGTGGCAAGCGTCTGGTGAAACATTATCCGGCATTGACCCTGAATCAATGGCTGTTGAACCTG CACTAATTCCTAGTATTCAGGCTTATGTTGATACAGTTCTTGATCTGGCTTCACATTTTATTACACGTTTGCGACGTTAT GCAAGTTTTTGTCGCACATTGGCAAGTCACGCTGTGACTGCAGGCAGTGGAAGCAATCGCAATGTGGTTACCAGTCCTTC CCAAAGTTCAGCAACTCCGGCAACGAGTCAGGGTCAAAATGGGACCACTAGCTCCATGGGAAGCACACAGTTGCAAACTT GGGTACAAGGGGCTATTGCCAAGATTAGTAGCACTACTGATGGAGGGTCCAATTCAGCTCCTAACCCCATCAGTGGTCCT TCAACATTTATGCCTATTAGCATTAATACAGGAACGTTTCCAGGAACACCGGCAGTTAGACTTATTGGGGACTGCCATTT CCTTCACAGACTATGCCAACTTTTGCTCTTCTGCTTTTTCTTTCGGCGTACACAGCTTCCTCGATATATGGGGGTTGCAA ATAGAACTGCTGATACAAAGCCTCAATCTAATGCATCTGCTCCTGGGAAGGTGGAGGAGATTACAAAGCCTGTTTCAGCT GTGACCAAGTCAGATGATGGCCTGACAGGTCGAGCTGGTCAGCTTGTGCCTGGGGCAAAAGGAGGTGAAGAAGCACCTTC TGGACGTTCCAGAGTAGGTAGTGGGAATGCTGGCCAAGGATATACATTCGAAGAGGTCAAGGTGCTTTTTATGATGCTCA TGGAACTATGTCGCCGGACAGCTGGCCTGCAACACCCATTGCCAATCTCTCAGGTAGGGAGCAGCAACATTCAGGTTCGG CTGCATTATATTGATGGAAACTATACTGTGCTTCCAGAGGTTGTGGAGGCATCCCTTGGTCCACATATGCCGAATATGCC CCGTCCTAGAGGTGCTGATGCTGCTGGTCTTCTACTACGGGAGCTGGAACTCCACCCTCCAGCAGAAGAATGGCATCGGC GGAATATGTTTGGCGGACCTTGGTCTGATCCGGAGGATGTGGATTGTGCAAATGATAAAGCTAAACTTGTTTATTCTGAC CCACTTGATTTCTGCTCATCGGAGCATGATGATGTATACTCCGGAACCCATCGCTTATGGCCAAGGAAGCGGAGAATGTC TGAAAGAGATGCAGCTTTTGGGTTGAACACTTCTGTGGGCTTGGGAGCTTATCTTGGTATAATGGGATCTCGAAGAGACG TCGTTACTGCAACATGGAAGACTGGCCTTGAAGGGGTCTGGTACAAGTGCATAAGATGTCAGCGGCAGACTTCGGCTTTT GCTTCACCAGATTCTACTACCTCTTCTAATCAGAATGACCGGGAGACGTGGTGGATCAGCCGCTGGGCATATGGCTGCCC AATGTGTGGTGGAACATGGGTTCGGGTTGTCTAG 

Protein sequence (LotjaGi4g1v0054500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MSQIEGEGELEAQSMPQQPQEALKKGSDETEPVTEEQEVVEEVKPPLDDPMEEDDQISSATVFTIRLRQSSSNLQHKMSV PELCRNFSAVSWCGKLNAIACAAETCARIPSSNANPPFWIPIHIVIPERPTECAVFNVIADSPRDSVQFIEWSPTSGPCA LLIANFHGRVTIWTQPSQGPPNLVRDASCWQREHEWRQDIAVVTKWLSGVSPYRWLSSKSSAAANSKLTFEEKFLSQQSQ TSARWPNFLCVCSVFSSGSVQLRWSQWPPSQNGASPKWFCTSKGLLGCGPSGIMAGDAIITDSGAMHVAGVPIVNPSTIV VWEVTPGPGNGFQVTPKTSTTSGVPPLSPPNWVGFAPLAAYLFSWQEYLLSEEKQGKKLTDQNLVDAVPLYCSPVSNFSA YVSPEAAAQSAATTTWGSGVTAVAFDPTCAGSVIAVVIVEGQYMSPYDPDEGPSITGWRVQRWESSLQHVVLHPIFGNPT SNMGGQPPMQTVWQSKVDLSIPPTNDFKNHQLSASGMAIDVQKSSEPVSDKSKRVNFDPFDLPSDVRTLARVVYSAHGGE IAIAFLRGGVHVFSGPNFTPVDNYQINVGSAIAAPAFSSTSCCSASVWHYTLKNCTVLKIVRVLPPSVPISQAKADSSIW ERAIAERFWWSLLVGVDWWDAVGCAQSAAEDGIVSLNSVIAVLDADFHSLPSVQHRQLYGPSLDRIKCRLLEGSNAQEVR AMVLDMQARLLLDMLGRGIESALINSSALVPDLWQASGETLSGIDPESMAVEPALIPSIQAYVDTVLDLASHFITRLRRY ASFCRTLASHAVTAGSGSNRNVVTSPSQSSATPATSQGQNGTTSSMGSTQLQTWVQGAIAKISSTTDGGSNSAPNPISGP STFMPISINTGTFPGTPAVRLIGDCHFLHRLCQLLLFCFFFRRTQLPRYMGVANRTADTKPQSNASAPGKVEEITKPVSA VTKSDDGLTGRAGQLVPGAKGGEEAPSGRSRVGSGNAGQGYTFEEVKVLFMMLMELCRRTAGLQHPLPISQVGSSNIQVR LHYIDGNYTVLPEVVEASLGPHMPNMPRPRGADAAGLLLRELELHPPAEEWHRRNMFGGPWSDPEDVDCANDKAKLVYSD PLDFCSSEHDDVYSGTHRLWPRKRRMSERDAAFGLNTSVGLGAYLGIMGSRRDVVTATWKTGLEGVWYKCIRCQRQTSAF ASPDSTTSSNQNDRETWWISRWAYGCPMCGGTWVRVV 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
MobiDBLite 1 54 54 -
MobiDBLite 24 46 23 -
PANTHER 51 1237 1187 0.0
MobiDBLite 815 848 34 -
MobiDBLite 961 996 36 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Biological process Regulation of transcription, DNA-templated Any process that modulates the frequency, rate or extent of cellular DNA-templated transcription.
Cellular component Mediator complex A protein complex that interacts with the carboxy-terminal domain of the largest subunit of RNA polymerase II and plays an active role in transducing the signal from a transcription factor to the transcriptional machinery. The mediator complex is required for activation of transcription of most protein-coding genes, but can also act as a transcriptional corepressor. The Saccharomyces complex contains several identifiable subcomplexes: a head domain comprising Srb2, -4, and -5, Med6, -8, and -11, and Rox3 proteins; a middle domain comprising Med1, -4, and -7, Nut1 and -2, Cse2, Rgr1, Soh1, and Srb7 proteins; a tail consisting of Gal11p, Med2p, Pgd1p, and Sin4p; and a regulatory subcomplex comprising Ssn2, -3, and -8, and Srb8 proteins. Metazoan mediator complexes have similar modular structures and include homologs of yeast Srb and Med proteins.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi4g1v0054500.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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