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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi4g1v0054500 |
| Transcript ID | LotjaGi4g1v0054500.2 |
| Related isoforms 6 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16; TAIR: AT4G04920.2 sensitive to freezing 6; Swiss-Prot: sp|F4JGZ1|MED16_ARATH Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16; TrEMBL-Plants: tr|V7CM89|V7CM89_PHAVU Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi4g1v0054500 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr4:6571569..6593716) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TTGGGTATGAGTCAAATTGAAGGAGAGGGAGAGCTAGAGGCTCAGTCTATGCCCCAACAACCCCAAGAGGCTCTGAAGAA GGGTTCCGACGAGACCGAACCGGTCACGGAAGAACAAGAGGTTGTGGAGGAGGTGAAGCCACCGTTGGATGATCCAATGG AGGAAGATGATCAAATTAGCTCCGCCACTGTTTTCACCATCAGGCTAAGACAGTCTAGCTCCAATTTGCAGCACAAGATG AGTGTCCCGGAACTCTGTCGCAATTTCAGGTCTGTTCCCTGCATTCATTGGTTTTAATTTATGGAAATTGGTACAATTAT TGAAGAATCCTTATTGTTATTTAGTGATGGATTCTAACCTTTTTTATCAATTGCCTCACTTTCACTTGATTCCAATATTT AGTATGAATAATGCTTCTGTGTTTTAACAATTCACTCATTGAGGGCTTAGTTTTCTGATCAAAATTGAGCATATGGCACC AAGTTTGTTAATAACAGCAAATATGATAACATCATAAGTTGTAAACTACAAACTACATCTAGTTCCACCTATCTTGGCAG TGAATTACTGATTGTCATGTTTTTATAAAATTTATATGCTGACGTTCTATGTTTGGTCTTCTGATGAGTTTCTGTAAAAC GAATTAGTTTACGTACTATTTTAAGCCCTATATGGTAGTATTATATGATAAACTCTGGTACCATCAATTTTTTCAATTAT TTAGGTCTTGTTTGTTATTTCTGCAGTGCTGTTTCTTGGTGTGGAAAACTGAATGCTATAGCTTGTGCAGCTGAAACATG TGCCAGAATACCAAGGTTTGTGTTTTTTATCCATTTGGACATGTTTCCTGCCTGAATTTCATTGTGAACAAGACTTTCTG TTTATGTAAATGGTAATTGAAGGAAACTTTCTGAGAAGAAAAGCTGATAAAAGTAAGAAAATTGTATTGCAGGCCATGAT 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CCTTGTAAATTTGGAACTTTTTAAAAAGTGTGTTGATTACTTGATTAAAAGTTTGAACAATCCTAAAGTGTGTTAATGAG TGTGCTTCTAGCATTTCTGCACTATATGTATTGATTGTCCTCGCTGAATAGCCTGTGGATTCCAAAGAGCTTAATTTGAT CTTGAACTGTTCATAGTTGATATTTGAATTGAGGTCTGTTCGATACTATAAATCTTCATATGGTTTTCAGTTGTTTAAAC GTCCATGTGAAATTCAGTCTGAAATCTGAATCTTATTTTTAAACTTCTAAAAAGTCTGCAAAGGTCCAATTTATAACCTA ACTTGCAGTCTTGCACCGTCCTTATACGGTGTCTTTTCAGATGAGAGGATTCCTGTTATAATTTAAACAATATTGAGATG CTTCTTTCAGTTTCTTTTGTTTACTTTAGTATTTTCAGTCAGGCATGTGGTTGTGTGTGTTAGTGCTTTATAAGCTAAAT GAACCTAGTTTCTCTATGATTGCAGAGTCTAGACAGGATAAAGTGTAGGCTACTGGAAGGATCAAATGCCCAAGAGGTCA GGGCGATGGTTTTGGATATGCAAGCCAGGTTGTTGTTGGATATGCTTGGGAGAGGAATTGAGTCTGCGTTGATAAATTCT TCTGCTTTAGTGCCTGATCTGTGGCAAGCGTCTGGTGAAACATTATCCGGCATTGACCCTGAATCAATGGCTGTTGAACC TGCACTAATTCCTAGTATTCAGGTTTGCTTTGATTACAGTTTGAAAACATCTGTTCCTTATTTTGGCTAATCATAAAATA TAAAATGCAAATGTGTTGTGGTTCGCTATTGGTCTTTCGATATGATCATTTGTCCTCAGTCTTGTCATAATATAGTTGTC AATCCTTGATAGCAACCACAACCACAACCACTATTGGATAACACAGGTTATAATGCACTGATACAGCCTTATCATAGTTC TAACTGTCAGTTGATAGTTAGTTAGGCTATGTTAATTTGACTGTTGAAAGAGTTTGTTATTTTGTTAAGTTCGGTTATCT AGCCTAGTAGTAGTAAATATTTTGCAACATTTCACTTTGAATTCAATAACAACATTTTCTTCAGATTCTCTCTTTCTCTC CTTGTTCATTCTCTCTTACTATAATATGGTATCACAACTAATCCTAGATCTGTGATTAGACCACCCATAATGGTCCACCT GCTAAAGTTTAAAGTTCAATAATTAACTTGGTCCGCGGTTGTTCTAGGTAAAATTAATGAAATCAATATGACCCTGTAGA TACTCCATGATGAGCATGAGGATATTCTGTTCAGACAGTTGTTCAAATTTTATTATCTATTTAATTGTCTGGGCTTCCTG TTTCTGAATTATTTCATTCTGTTCAGGCTTATGTTGATACAGTTCTTGATCTGGCTTCACATTTTATTACACGTTTGCGA CGTTATGCAAGTTTTTGTCGCACATTGGCAAGTCACGCTGTGACTGCAGGCAGTGGAAGCAATCGCAATGTGGTTACCAG TCCTTCCCAAAGTTCAGCAACTCCGGCAACGAGTCAGGGTTAGTGTGCTCTTTATTAATAATCGGTTGCTATGATAAAAA CTACGAGTGGACTCTTCTAGATTGAGAAGCTTTCTCAATTGATTCCTTGAATCCAGTCTTCAATTTGAAGTGTTTTTGCA ACTGAAACTAGAGACCAATTGATAGATTTTCAATCGAAAGGACCTATTGAGAAATTCACAAAGAAAAGGATCAACAAATA ATTAACCTTTTTTAAAGTAAATATTCATTATACAGTTTGCTTTATCAAATAACATGCCTCTATATGGATATCCTTAGGCA CCCATGGGATAGTTAATTAACCTCCTTATATGGCATTAGAAAACAATCAATGGATGTAATCCGCTGGTTGGGCTTTTACT GCTCCTCTGGGATCTTGGCATGCCCATAACACTAACATTGGTAGTATTAGTGCAGCCTATCCTTGCTGCAGTTCTAAGTT CTAACCATTGAAAAATCAAGTATAGATCCACACTTTTAAATTGCAAATTTGTTTGCTTCTTCTCTTCTAATACTCATGCT CAATTATCCTACCCTGAATTAGTGTGATCGTTATTTACAGACATAACTGAAATGATTGAAACATTTTTCCAGGTCAAAAT GGGACCACTAGCTCCATGGGAAGCACACAGTTGCAAACTTGGGTACAAGGGGCTATTGCCAAGATTAGTAGCACTACTGA TGGAGGGTCCAATTCAGCTCCTAACCCCATCAGTGGTCCTTCAACATTTATGCCTATTAGCATTAATACAGGAACGTTTC CAGGAACACCGGCAGTTAGACTTATTGGGGACTGCCATTTCCTTCACAGACTATGCCAACTTTTGCTCTTCTGCTTTTTC TTTCGGCGTACACAGCTTCCTCGATATATGGGGGTTGCAAATAGAACTGCTGATACAAAGCCTCAATCTAATGCATCTGC TCCTGGGAAGGTGGAGGAGATTACAAAGCCTGTTTCAGCTGTGACCAAGTCAGATGATGGCCTGACAGGTCGAGCTGGTC AGCTTGTGCCTGGGGCAAAAGGAGGTGAAGAAGCACCTTCTGGACGTTCCAGAGTAGGTAGTGGGAATGCTGGCCAAGGA TATACATTCGAAGAGGTATATTTCTGTTGTGTCTTACATAGATGTGTTTTCAAATATGTACTAATTCTTAAGTTTACTTA ATACTTTAAAAAATTATGAAGTAGACTATGATTTTACTTTTCTCTGTGCACTAATAATGCAGGTCAAGGTGCTTTTTATG ATGCTCATGGAACTATGTCGCCGGACAGCTGGCCTGCAACACCCATTGCCAATCTCTCAGGTAGGGAGCAGCAACATTCA GGTTCGGCTGCATTATATTGATGGAAACTATACTGTGCTTCCAGAGGTTGTGGAGGCATCCCTTGGTCCACATATGCCGG TAACTTTATGTTTTTCCACTTATTTAAATTAGTTATTTCTAGGACACAAATTAAACTAGTTCGAATTGGTATTTCATGAT ATTGTTGCCTTGAGTTTTCACTATTTAATTGATTATTTGCTTCGCTGATATGTACGGAGGGATGGAAAGTGGCTAAATTA CCTTTCTTTACACATTGATTCCTTTTTACAGTAAAAACTCATTTCCGGTTCAGTGATACATTACAATTTGTTAGATTATG TAGGTGCTATTGATGGTTTAAACTCTCGATACCCTCTTGTTTTTGTTTGACCCTCTAATTGGTCTTCCTTTTTCTTTTTA ACCTTTCTCTGACTGCTCTCGGCTGAAACAAAAACACTATGCAGAATATGCCCCGTCCTAGAGGTGCTGATGCTGCTGGT CTTCTACTACGGGAGCTGGAACTCCACCCTCCAGCAGAAGAATGGCATCGGCGGAATATGTTTGGCGGACCTTGGTCTGA TCCGGAGGATGTGGATTGTGCAAATGATAAAGCTAAACTTGTTTATTCTGACCCACTTGATTTCTGCTCATCGGAGCATG ATGATGTATACTCCGGAACCCATCGCTTATGGCCAAGGAAGCGGAGAATGTCTGAAAGAGATGCAGCTTTTGGGTTGAAC ACTTCTGTGGGCTTGGGAGCTTATCTTGGTATAATGGGATCTCGAAGAGACGTCGTTACTGCAACATGGAAGACTGGCCT TGAAGGGGTCTGGTACAAGGTTAGAAAAGTAATCTTGTTTGTTTATTTATATTGTTTTTTCTGTTCATATGTACATGTAA GGATTGCATTACCTGGAAATGCTTTTATTTTATTTGTTTTTGTTGTTGGAAACTGTCTTTTTCTCAAGGCTTAACACCAA ATATTTTGCTTCTTTGGTTGGTAACACTTTGAATGGACATATGGGGTAAATAAAGATATATGTTTTTTCTACAACGTGCT TGTGTAAATCAAGTCACTTGACAGAAGAAAAGCCTCACATGCTGGAGTTTAGATGGGCATCCTTCCTGTTAAATGTTCAA TATATATAATCAGTGGGCATCCTTCCTCTTAAATGTTCAACTTTATCTAACATTCAATCTTGGGGATTGTGGGAGTTTGC ATTTGACTCTATTACTTTCTCAGATAGACTTTGTTAACATGTTAGCTAATAACCTAGACTTTCTTAGGACTCTAACTGAG CCCTTAATGTGAAAGGAAACTCTGGTTGAAATGTGGATCAACAGTTTCATTTACCGAAAACCAAAGTAACTTTCTGGTGA CTTGGGTCATATTCAATGAGGATAGAGTCTTAATCATTTGTTTACTGAGTTTCTGACACCTTATGAAAACCACTTGATTA TTTGTCATTTTGACTTTTTGAACTACATTTTGTTTGGTTCAAGAATGTGCAATATCTGTAACATGATTTTTATCCCAAAA AAAAAAAGAAATCTTAATGTAGTCTATACCTGGTCTTCTAACTTTTTGACATTGTGTACATTTTTCTCTGTATATCCTTT CTTTCTATGTATAGAAGAAATATTTTTATGAGTAGAACTGGATGTAAATGTAGATAGTGACTTGGGAACTTTAGAATAAT CATTAGTGTCAGACTTGCTATTGTGATGAGTCCTAACTTTTGGAAACTTAGTCATTCCCTTGATGATTTTTTCAAGTTAT TTAAAGACATTTGTTTATTCTTCCTGATATTTTAATTATTCAACTTTCTATTTTGTCTTCTTGTTTACTTCCATGGTGCA GTGCATAAGATGTCAGCGGCAGACTTCGGCTTTTGCTTCACCAGATTCTACTACCTCTTCTAATCAGAATGACCGGGAGA CGTGGTGGATCAGCCGCTGGGCATATGGCTGCCCAATGTGTGGTGGAACATGGGTTCGGGTTGTCTAG
CDS sequence (LotjaGi4g1v0054500.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGAGTCAAATTGAAGGAGAGGGAGAGCTAGAGGCTCAGTCTATGCCCCAACAACCCCAAGAGGCTCTGAAGAAGGGTTC CGACGAGACCGAACCGGTCACGGAAGAACAAGAGGTTGTGGAGGAGGTGAAGCCACCGTTGGATGATCCAATGGAGGAAG ATGATCAAATTAGCTCCGCCACTGTTTTCACCATCAGGCTAAGACAGTCTAGCTCCAATTTGCAGCACAAGATGAGTGTC CCGGAACTCTGTCGCAATTTCAGTGCTGTTTCTTGGTGTGGAAAACTGAATGCTATAGCTTGTGCAGCTGAAACATGTGC CAGAATACCAAGTTCAAATGCTAATCCACCATTTTGGATCCCTATACATATTGTGATCCCAGAGAGGCCGACTGAATGTG CAGTGTTCAATGTCATAGCAGATTCTCCTCGTGATTCTGTCCAGTTTATAGAATGGTCCCCGACCTCTGGTCCCTGTGCC CTATTGATTGCAAATTTCCATGGGAGGGTGACTATTTGGACTCAACCTTCTCAAGGGCCACCTAATCTTGTTCGTGATGC TAGCTGTTGGCAGCGTGAGCATGAGTGGCGGCAAGATATTGCAGTTGTTACAAAGTGGCTATCAGGAGTGTCTCCGTATA GGTGGCTCTCATCCAAATCTAGTGCTGCTGCCAATTCAAAGTTGACATTTGAGGAAAAGTTTCTTTCACAGCAATCTCAA ACTTCAGCTAGATGGCCCAATTTTCTTTGCGTCTGTTCTGTGTTCTCATCAGGCTCAGTTCAACTTCGCTGGTCCCAGTG GCCTCCTAGTCAGAATGGCGCCTCACCTAAGTGGTTCTGCACTAGTAAAGGACTTTTGGGTTGCGGGCCCAGTGGCATTA TGGCTGGTGATGCTATCATAACAGACAGTGGTGCCATGCATGTGGCAGGGGTACCGATTGTTAACCCATCCACCATTGTC GTTTGGGAGGTCACACCTGGGCCTGGAAATGGTTTCCAAGTGACTCCGAAAACAAGTACAACATCTGGTGTCCCACCTCT GAGCCCACCCAACTGGGTTGGTTTTGCGCCTTTAGCAGCATATTTATTTAGTTGGCAAGAATATCTATTATCTGAAGAAA AGCAAGGGAAAAAGCTGACTGACCAAAATCTAGTTGATGCTGTACCTCTATACTGCTCACCAGTTTCAAATTTTTCAGCA TATGTGAGCCCTGAAGCTGCAGCTCAATCTGCCGCGACCACTACATGGGGTTCTGGTGTAACAGCTGTGGCCTTCGATCC AACTTGTGCCGGTTCTGTTATAGCTGTTGTTATAGTTGAGGGACAGTACATGTCCCCTTATGATCCGGATGAAGGCCCAT CAATTACGGGGTGGAGGGTGCAACGCTGGGAATCATCTTTGCAGCATGTTGTTCTCCATCCGATATTTGGGAACCCTACT TCTAATATGGGTGGACAACCTCCTATGCAAACTGTTTGGCAGTCCAAAGTGGACCTGAGCATACCCCCAACCAATGATTT TAAGAACCATCAATTATCTGCAAGTGGGATGGCTATTGATGTGCAAAAGTCATCTGAGCCTGTTTCTGACAAGTCAAAGA GGGTCAATTTCGATCCATTTGATCTTCCAAGTGATGTTAGAACACTTGCAAGAGTTGTTTACTCTGCTCATGGTGGTGAA ATTGCCATTGCTTTCCTTCGGGGTGGTGTCCATGTCTTTTCTGGTCCAAATTTCACACCTGTAGACAACTATCAGATTAA TGTTGGATCTGCCATTGCTGCTCCTGCTTTTTCTTCAACAAGTTGCTGTTCAGCTTCAGTTTGGCATTACACTCTTAAGA ACTGTACAGTACTGAAAATAGTTCGGGTTCTTCCTCCTTCTGTTCCTATTAGTCAAGCAAAGGCTGATTCATCAATTTGG GAGCGTGCAATAGCTGAAAGGTTTTGGTGGAGCCTTTTGGTTGGAGTTGATTGGTGGGATGCTGTGGGCTGCGCACAAAG CGCTGCGGAGGATGGTATTGTTTCGCTCAACAGTGTTATTGCAGTTTTGGATGCGGATTTCCATTCTCTTCCTTCTGTTC AACACCGGCAACTTTACGGTCCCAGTCTAGACAGGATAAAGTGTAGGCTACTGGAAGGATCAAATGCCCAAGAGGTCAGG GCGATGGTTTTGGATATGCAAGCCAGGTTGTTGTTGGATATGCTTGGGAGAGGAATTGAGTCTGCGTTGATAAATTCTTC TGCTTTAGTGCCTGATCTGTGGCAAGCGTCTGGTGAAACATTATCCGGCATTGACCCTGAATCAATGGCTGTTGAACCTG CACTAATTCCTAGTATTCAGGCTTATGTTGATACAGTTCTTGATCTGGCTTCACATTTTATTACACGTTTGCGACGTTAT GCAAGTTTTTGTCGCACATTGGCAAGTCACGCTGTGACTGCAGGCAGTGGAAGCAATCGCAATGTGGTTACCAGTCCTTC CCAAAGTTCAGCAACTCCGGCAACGAGTCAGGGTCAAAATGGGACCACTAGCTCCATGGGAAGCACACAGTTGCAAACTT GGGTACAAGGGGCTATTGCCAAGATTAGTAGCACTACTGATGGAGGGTCCAATTCAGCTCCTAACCCCATCAGTGGTCCT TCAACATTTATGCCTATTAGCATTAATACAGGAACGTTTCCAGGAACACCGGCAGTTAGACTTATTGGGGACTGCCATTT CCTTCACAGACTATGCCAACTTTTGCTCTTCTGCTTTTTCTTTCGGCGTACACAGCTTCCTCGATATATGGGGGTTGCAA ATAGAACTGCTGATACAAAGCCTCAATCTAATGCATCTGCTCCTGGGAAGGTGGAGGAGATTACAAAGCCTGTTTCAGCT GTGACCAAGTCAGATGATGGCCTGACAGGTCGAGCTGGTCAGCTTGTGCCTGGGGCAAAAGGAGGTGAAGAAGCACCTTC TGGACGTTCCAGAGTAGGTAGTGGGAATGCTGGCCAAGGATATACATTCGAAGAGGTCAAGGTGCTTTTTATGATGCTCA TGGAACTATGTCGCCGGACAGCTGGCCTGCAACACCCATTGCCAATCTCTCAGGTAGGGAGCAGCAACATTCAGGTTCGG CTGCATTATATTGATGGAAACTATACTGTGCTTCCAGAGGTTGTGGAGGCATCCCTTGGTCCACATATGCCGAATATGCC CCGTCCTAGAGGTGCTGATGCTGCTGGTCTTCTACTACGGGAGCTGGAACTCCACCCTCCAGCAGAAGAATGGCATCGGC GGAATATGTTTGGCGGACCTTGGTCTGATCCGGAGGATGTGGATTGTGCAAATGATAAAGCTAAACTTGTTTATTCTGAC CCACTTGATTTCTGCTCATCGGAGCATGATGATGTATACTCCGGAACCCATCGCTTATGGCCAAGGAAGCGGAGAATGTC TGAAAGAGATGCAGCTTTTGGGTTGAACACTTCTGTGGGCTTGGGAGCTTATCTTGGTATAATGGGATCTCGAAGAGACG TCGTTACTGCAACATGGAAGACTGGCCTTGAAGGGGTCTGGTACAAGTGCATAAGATGTCAGCGGCAGACTTCGGCTTTT GCTTCACCAGATTCTACTACCTCTTCTAATCAGAATGACCGGGAGACGTGGTGGATCAGCCGCTGGGCATATGGCTGCCC AATGTGTGGTGGAACATGGGTTCGGGTTGTCTAG
Protein sequence (LotjaGi4g1v0054500.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MSQIEGEGELEAQSMPQQPQEALKKGSDETEPVTEEQEVVEEVKPPLDDPMEEDDQISSATVFTIRLRQSSSNLQHKMSV PELCRNFSAVSWCGKLNAIACAAETCARIPSSNANPPFWIPIHIVIPERPTECAVFNVIADSPRDSVQFIEWSPTSGPCA LLIANFHGRVTIWTQPSQGPPNLVRDASCWQREHEWRQDIAVVTKWLSGVSPYRWLSSKSSAAANSKLTFEEKFLSQQSQ TSARWPNFLCVCSVFSSGSVQLRWSQWPPSQNGASPKWFCTSKGLLGCGPSGIMAGDAIITDSGAMHVAGVPIVNPSTIV VWEVTPGPGNGFQVTPKTSTTSGVPPLSPPNWVGFAPLAAYLFSWQEYLLSEEKQGKKLTDQNLVDAVPLYCSPVSNFSA YVSPEAAAQSAATTTWGSGVTAVAFDPTCAGSVIAVVIVEGQYMSPYDPDEGPSITGWRVQRWESSLQHVVLHPIFGNPT SNMGGQPPMQTVWQSKVDLSIPPTNDFKNHQLSASGMAIDVQKSSEPVSDKSKRVNFDPFDLPSDVRTLARVVYSAHGGE IAIAFLRGGVHVFSGPNFTPVDNYQINVGSAIAAPAFSSTSCCSASVWHYTLKNCTVLKIVRVLPPSVPISQAKADSSIW ERAIAERFWWSLLVGVDWWDAVGCAQSAAEDGIVSLNSVIAVLDADFHSLPSVQHRQLYGPSLDRIKCRLLEGSNAQEVR AMVLDMQARLLLDMLGRGIESALINSSALVPDLWQASGETLSGIDPESMAVEPALIPSIQAYVDTVLDLASHFITRLRRY ASFCRTLASHAVTAGSGSNRNVVTSPSQSSATPATSQGQNGTTSSMGSTQLQTWVQGAIAKISSTTDGGSNSAPNPISGP STFMPISINTGTFPGTPAVRLIGDCHFLHRLCQLLLFCFFFRRTQLPRYMGVANRTADTKPQSNASAPGKVEEITKPVSA VTKSDDGLTGRAGQLVPGAKGGEEAPSGRSRVGSGNAGQGYTFEEVKVLFMMLMELCRRTAGLQHPLPISQVGSSNIQVR LHYIDGNYTVLPEVVEASLGPHMPNMPRPRGADAAGLLLRELELHPPAEEWHRRNMFGGPWSDPEDVDCANDKAKLVYSD PLDFCSSEHDDVYSGTHRLWPRKRRMSERDAAFGLNTSVGLGAYLGIMGSRRDVVTATWKTGLEGVWYKCIRCQRQTSAF ASPDSTTSSNQNDRETWWISRWAYGCPMCGGTWVRVV
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| MobiDBLite | 1 | 54 | 54 | - | – | |
| MobiDBLite | 24 | 46 | 23 | - | – | |
| PANTHER | 51 | 1237 | 1187 | 0.0 | ||
| MobiDBLite | 815 | 848 | 34 | - | – | |
| MobiDBLite | 961 | 996 | 36 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Biological process | Regulation of transcription, DNA-templated | Any process that modulates the frequency, rate or extent of cellular DNA-templated transcription. | ||
| Cellular component | Mediator complex | A protein complex that interacts with the carboxy-terminal domain of the largest subunit of RNA polymerase II and plays an active role in transducing the signal from a transcription factor to the transcriptional machinery. The mediator complex is required for activation of transcription of most protein-coding genes, but can also act as a transcriptional corepressor. The Saccharomyces complex contains several identifiable subcomplexes: a head domain comprising Srb2, -4, and -5, Med6, -8, and -11, and Rox3 proteins; a middle domain comprising Med1, -4, and -7, Nut1 and -2, Cse2, Rgr1, Soh1, and Srb7 proteins; a tail consisting of Gal11p, Med2p, Pgd1p, and Sin4p; and a regulatory subcomplex comprising Ssn2, -3, and -8, and Srb8 proteins. Metazoan mediator complexes have similar modular structures and include homologs of yeast Srb and Med proteins. |
Expression pattern of LotjaGi4g1v0054500.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…