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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi4g1v0137700 |
| Transcript ID | LotjaGi4g1v0137700.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | DUF241 domain protein; TAIR: AT4G35690.1 hypothetical protein (DUF241); Swiss-Prot: sp|Q5UPB0|YR034_MIMIV Uncharacterized protein R34; TrEMBL-Plants: tr|G7LA83|G7LA83_MEDTR DUF241 domain protein; Found in the gene: LotjaGi4g1v0137700 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr4:20377316..20385174) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GTCTAATTAAGGTGTGGGATTCTAGCTAGTGTTGCACAATGCTGAAAACGATAGGTTAGCCACCTTGATAACATGTATCT AACTATCTATCTTGAGCTTACTAATATCAAACCTGGAGTCAATTCAAGATAGCTGACCCTATTTGGACTAGCACATATAT TCGGGTTGGGTTGGAACAAATCTACTACACTTTAAAAGAGACTCAAGAAATCACTATTTCTAAAAGAACTTTCAATCTCA GCCGTCCAATTGACCCTCTCTCCATTGTCACTCTTTAATCTTGGCCCCTCACTTGTGAGACTTTTTTCCGCCTCTATTCT ACTCTACTCGAGCGTATGGGATGAAGGTGAGGAGTGTTTCCCTGTTAAGCGTTCGTGAGTTATCGTCATGCCTGCACGCC CTGTCCCTGTCGTGTAACTGTAGTTGGATTGCAAGAGTGAATAGCTGTGGAAGTTGCCAGGACCAGGAAGGGGATGAGGT CACTGATTGCGTTGAAGGGGTTCTGGCACATCACCTTTTCCATTCAAAATATCTCTCTCACGCACTCTCCCACCCTTTTT CTCTCATTTTAGGTTTTCCTGTTGACCAGGATTTGGTGTTTGATTTGTTCAGAATGTGTTGTCCGAAGGAGGAGAATAGA TGTGTATCAGAAGCCATGTCAGGTTAGTACCAGAGGTTTGGTATGTATAGTTGTCAAGCAGGTTTGCTTTTGATTCTGAA ACTCAACTCAATTCAATTTAACTAGATTTAATTAAATTTTTGAAATGCTCAAATGTTTCTCACTTTCACTTGTCTATAAA TACTGCTATCTTCTGTTCTTCTTGGTGTTCTTGCTCTGGGCAATTTTCTTTTTCTTATCTCCCCTTTTGTACAGAGAATT GTTGATTTGCTTATCTCCCCTTTCGTATAGAGAATTGTTGATTGTTGTTACTTATGGCTTATACTGCTGGTCCTTTCCAT 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AAAACAAGAGCCTCCCTTTTGAACATAATCTCCTCCCAATAGAGTATTTTTTAGCTGCAATTTTTCTCCAAATACATCCG AATTTTAGGGATCTATTGAGGAATGTAAATTATTGCCTGGATGATTTTTACAAGTGTATATTGATACATTGAAAATGCAA AGAATATTTTTATGATCTA
CDS sequence (LotjaGi4g1v0137700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCAAGCAAGTACCATGTTCGCTCAATTAGTCTTCCTTCTAGATCTCATCCCAGCACAATTAGAGTGGAAGAGGAGCT GAGCAAGCTCAAGAATTGGGAAGGAGCAACAACAACATCCACATCCACATCAGAATCTATTCACACTGGCTTGTCCATGC TTGAAGATTTGTACATTTCCTTGGATGATCTTCTCAACATGGCATCAACCCAGCAAGTGATTTCTCACCACCGCGGTGAG AAATGCGTGGAAGAGGTGTTGGATGGTTCAATGAGGATCTTAGATATCTGCGGCGTCATGAGGGACACCATGTCGCAAAT CAAGGAAAATGTTCAAGCCCTTCATTCATCTCTTAGGAGAAGGAAAGGAGATTCAAGTGTTGAGAAAAGTGTAGCAGAAT ACAAATTCTTCACAAAGAAGATGAGGAAGGATGTGAACAAATTGATCACATCTTTGAAGCAAATGGATAGCAAATTTGGG GTTTCCCCACTCTTAGATCTTGATCACCACCTTGGTGCTGTGATTAGAGTGCTAAGGGAAGTGATTCTAATGAACTTGTG TGTCTTCCAATTCCTCTTGTCATTTTTGTCTTCATCAAAATCAAAGGCAACAAAATGGTTTTTGGTGGCAAAATTGATGC ACAAAGGGGCCATAACATGTGAAGATAACTCAGAGAAAATCAATGAGTTGCAGAGTGTGGATGCTTCCTTAAGCACAATT CTTAATGAAGGTGCTAATGGTGAGACATTGAAGGCTGCACATGAAACATTGGAGCCTTTGGAACATGTCATTGAAAGTGT TGAGAATGGTTTGGAGAGTGTGTTTAGGCGATTGATTAAAACAAGAGCCTCCCTTTTGAACATAATCTCCTCCCAATAG
Protein sequence (LotjaGi4g1v0137700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MASKYHVRSISLPSRSHPSTIRVEEELSKLKNWEGATTTSTSTSESIHTGLSMLEDLYISLDDLLNMASTQQVISHHRGE KCVEEVLDGSMRILDICGVMRDTMSQIKENVQALHSSLRRRKGDSSVEKSVAEYKFFTKKMRKDVNKLITSLKQMDSKFG VSPLLDLDHHLGAVIRVLREVILMNLCVFQFLLSFLSSSKSKATKWFLVAKLMHKGAITCEDNSEKINELQSVDASLSTI LNEGANGETLKAAHETLEPLEHVIESVENGLESVFRRLIKTRASLLNIISSQ
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 3 | 290 | 288 | 1.5E-109 | – | |
| PANTHER | 3 | 290 | 288 | 1.5E-109 | – | |
| Pfam | 50 | 288 | 239 | 4.7E-79 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi4g1v0137700.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…