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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi4g1v0141800 |
| Transcript ID | LotjaGi4g1v0141800.2 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Glycosyltransferase; TAIR: AT2G35610.1 xyloglucanase 113; Swiss-Prot: sp|Q8VXZ5|XG113_ARATH Arabinosyltransferase XEG113; TrEMBL-Plants: tr|A0A151QVV6|A0A151QVV6_CAJCA Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi4g1v0141800 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr4:21723880..21734898) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CAGCCAGCACACTAGTTGACCAGACAAGAGCACAGCTAGGCCTTTCAGAACCTCAGGAAATCACAATCTGAACCACTTTC CTTCCTCTTTCAAAAGTCAAATCTCTCTGTGTTTGGGTTTTCACTCATTTCATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTT CCTTCCTCTGAGAAACGACGAAGATGGCAGTGATATTGTCGATGCATCGTTTGTGGCTTGTTCTTTGGTGATTCGGTATT ACTGTTGATTCGTAAACATGGTTTGGAGAAATGGGTGCGAGGAAGTGGCTCATTCCAAACCCCTGTTTCTCACGATCTAC ACTGTTGTCATCATTGGCATCGTGGTTTCCTTCTTCTACGTCTTCTCTGCCATATATTCAACCAACACTCCTGCTTCTCA ACCTTCTCAATGGCTCTCTTCTTCCATCTCGCTGCGTACACTCTCTTTTGCTATGCACTTGTTGTTGTTATTATAGCTAA ATTTTGACATGCCAATTTGAATTTGAGGACTTTGCCATGGTTCTCATTCATAATCTTGTTATAGAAGATTAAGTTTGAAA TGCCCTTTTGTTATTATAGCTTAATCTTGTTATTTTGAAATGTTCAAAGATGTTGTTGAGTTCTGGACTATGGAGTATTA GTTAAATCCTTGAACTGTGCTTCTAGTTCTAGGTCTGTTGGTTATCTAGTTCATCTGGTAGTGCTTGCTCAATTCTTGTT AGAAAAGGAAAGTTGGATTTTTTTTTCCTTATAACTATGTTAACTGTCTAATGGTACCTGCTCAAAACAGTTCATATTGC GGGGTTTCTATCTGTATCGGTATAAAAAAAAGAGTATACATGTTACAAAATACAATTAGCTAGGAATATCTGAGTGTCCT GAAATTCGGGCACATGTACACATCCAAAACTGGCTCGGCTACTGTTCTGGCTCATTCATAATCTTGTTATTGTTCATTAT 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GTTGGCGGATTGTTCCTCTGAAACTTTCCCAAAGCACAAAATTCATCCTGATTATGGTTCCCAAGGTTCGCTTGCTGACC TTGCCCAATGGCGCTAGCCATCATTGCCAATGCCTCAGCGATAGCTTCATCATTCCTTCCGGCAACCATTTTCCTGAATC TCCAAACAACCAACAACTCTTATCAAACAACAGCTCGATAATGCTACTTACACATATCGAGTATCAGTAAGTATTAGAAT ATATATTATACTAAAAACTTGGTCACTGACCAACCATTGCTCTGATACCACTTATGTAACACCCCAATTCTAAACGGCAT ATGTATTGCAAATATCAGAGTGATAAAAATTTTAACACTCATGAGGCATTACATAATCACATAAAACATTAACATAATGC TCTTGTAACAGATACATAGCACATAAACTTTGAGATGAACTCATAAATAAACTTAAATGCTCTTGTGACAGTTAATTAGT CTTTGAACTAGTTCACTTTGACAAATAGTTATGCAGCGAATCCAATGTCTTTAAAACTTAAAGAAAACATAGTATCTTGC CCACAACTTAAAACAGAAACAACTTCTCAAATAACAACTTAATTCAAATTATAACAGAAGGAAAACAAGCGTCCATTTCC CCCCCGAGTGCTACGTATCAGAGCAAAGACTCCAACTCGAAATAAAGGCTATAGACTACTCCTCCTGATTACCTTTGGAT TGAGTGCAGCTCCCCGTTCCCGATCGAATTCTCCGAAGCCGATCCCCTCTCCCTCTCTTCCTGCTATTTCACGCACAGCC TTCTTCTTCTTTTTTTCTCCTTCTTTCACGCGTCCTCTTCTTTCTTATTTTTTTTTCTTTAGCTGCTTCCCCATCCTTAT TAAACCATCTAAACCTAATTCCTCAAGGGCTAAACTAAAAATCCTAAAATCTCTCCTAGTCCTTGTCTCTATTTTTAATC CTAACTTTCACCCCTAGCTCTCTTCCATTTCATAAAACACACCCAGCATCACAAAAAAAATATTTTATTTCATTAAAGTA TTATTATATCACCTATTAAACCACCATACAATAGAATCTTAATTAAATTAAAATACCAACATTATTTTAATTAAAAACGG GGTGTTACACAAGGCCTTATAAACCCCACATTAGAATCCCATACTTCCATTGTGGGACTCAAGTCCCATACCTTGCAATG GGGTCCTAACCAGGGTTGTTAATGGCGGATAGCGTAGTGTAGCGGCAAGCCCAAAAAACGCTATTTCGAGCGCTATTGCG GCGCTATAGCGGAAAATAGCGCAAATAGCGGTGAATAGTGGAGTAGCGGTGAACCCCCAGGCCGCTACGCTATAGGCTAT TGCGCCGCTATAGCGCGCTATTAACAAGCCTGGTCCTAACACTCAACTACACAACATAATGTATCATATATAATAGGTAC AATAAATACTTATTGTCATGGTTTTCCTATTTACAATGATTACGTTACCTAATTATATTTGATGCAAGATATCCTACCTA TTTACAATATCTAACACTCCTCATCAAGCAGAATCATATATGTCATATGCACCAAGCTTGTTAGAAATGTAATTAACTTG AGAACCTCTCATAGAATAGTAAAAACATCAGCCATCTGATCATTTGGATTGATGAATCTAGTGCGAATATCTTTAGATAA AATCTTCTCTCTAATAAAATGGTTATAGTTCTCAATTTGCTTGGTCCTCTCATGTAAACATTGAATTTGAGGCAATGTGT AAGGCTCCATGATTGTCACAAATAAGTGTCATCTATGAAACATCCCCAAATCACTAGTCTTGAAGCAACTGTTTGAGCCA ATTCAGCTTCTTCACTTGATCTTGCCACTACACTTTATTTCGTACTCTTCCAGGAGATTAAGTTATCACCAAGGAAACAC AATACCCAAAGGTGGATTTCCTATCAGAGGGAGAACCTGCCCAATCTGCATTTGAGTATCCTACAACTCGTGTGTGGCCC TTATCTTCTAATAATAAACCTTTTCCTGGAGTTTCTTTAGTATAGTTTAGTATGTGAATCACAACATAATGCCTTTCACA AGAAGAGTTGATGAATTGACTTACCGCACTAATAGAAAATGAAATATATGGGTGGGTGACCGTAAGGTACTAGTCTCCTA TATTCAACAGGCTTGAAATGTGTTGATTTAATATGGTTGTTTATACATGTATTTGCAGTTCATGAAAGTATTCTCATCAT TCAAGGATGTAAAAGTCATTAAGTTCTCTTCAGTGCTAGATGCTTTCACAGGTTTCGCTGACAAGGCAAGGCCATTTTGC TTTCTCCATTCGAAGTTTTACTTTTCGAAATTCGTATCAAATATACAAAGCAATTAATGTTCATTATCATGTGTTGATGC CTTGCAATTTTTATTTTTATCTTTTCTAAAGGAAAGGGAAGAGAGATTCAGAAATCGTGTTAAGCGGTATGTGGGCATAT GGTGCTGTGTGCCAGATCAAGATCCTGGCCACATTTATTATGATATGTACTGGGATGAGAAACCTGGATGGAAAGCAATT CCGCCTCAATCTCCCGAGGAAGATCGTCCACCTTGGTGAGATCAAGCTCAGGTTTTTGTTTAAACACTAATAGCATGTTT GGATAAGCTTCTCTTTCCTCATAAATCAATTTTGAAAATCCAGAACCTATTTACAAAAACTTCTTCCCAAATTAATTATG GCTTTAGAATATTTCCAAACATGCACTAAGATGGATAGGGGAATAAGAGAGAAACCCAAAGGTGGATGAGTTTCCAACTC ATTGTCAAGACCAAGATTGTATACTCACAGAAATGAAGAATCTGTATCCATATTGAGGATGTAAGATATTTATAGAGATG AGACAATTGATTATTGTGAAGCAATTAAGAAAAAAATTGTGTATTTTTTGTCCACTTTGTATTTGAAGTTACCAATATTG CAAACTAGAGAAATGAAAGTCCACAATTTCTTAGAGGAGGGGGCACTTTTTGGTCTTTTTGATATTTTAGTTGATTTTGG ATCGCCTGAAATAACAATACTAGAAACATTCAATTGTATCACTCTTCCATAGTGATGTTTGCTATTCTAATATGGTTCAA GTTATCTAATTGGCTGCTGGAAATATAGCCTATGAAGCAGTTAGTACTTTTTTTCTTATCACCAGTTATTTATATTTTAT TATTAATTTGTACTCTTCTAGTCAAGTTGTCATTAACTTCTTATTAAAGAAAACAGAGCAGAATATTTGAATCCACTATT GTCCGGGATTCAAGTTAACATTTAGCTACTACATATTTTTAAGATTCAAATACATTGAC
CDS sequence (LotjaGi4g1v0141800.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGTTTGGAGAAATGGGTGCGAGGAAGTGGCTCATTCCAAACCCCTGTTTCTCACGATCTACACTGTTGTCATCATTGG CATCGTGGTTTCCTTCTTCTACGTCTTCTCTGCCATATATTCAACCAACACTCCTGCTTCTCAACCTTCTCAATGGCTCT CTTCTTCCATCTCGCTGCATGAGGATCCTCAGATTACAAATCAAACACTCAACATTTCTCAGTCAGTAACGGTGCCCAAT CCTTCTCCAGGTCAGCAAAATGTAGGGGGGCCAAGTCCTATTTGGGATGTTCCACCATCCAATAAACAAATGCCACCCCT GAAGACTTTCCAACTTACCAAGGAACTGGTTCAGCAAAGGGTGAAAGATAACGTTGTAATAGTGACCTTTGGCAACTTTG CATTCATGGATTTTATTCTGAATTGGGTTAAACAATTAACAGATCTGGGAATGTCTAATCTTCTTGTTGGAGCAATGGAC ACCAAATTATTGGAGGCATTGTATTGGAAAGGGGTGCCAGTTTTTGACATGGGTAGCCATATGAGTGCGGTAGATGTTGG CTGGGGGTCTCCAACATTTCATAAAATGGGGAGAGAAAAAGTTATTCTGATAGATTCAATACTTCCTTTTGGATACGAGC TGTTGATGTGTGATACTGACATGGTTTGGTTGAAGAACCCACTTCCATATCTTGCTCGTTATCCAGGAGCAGATATTTTA ACTTCAAGTGATCAGGTTATACCAACAGTTGTCGATGATAGTTTGGAAATTTGGCAAGAAGTTAGTGGTGCCCTCAACAT TGGAATTTTCCATTGGAGACCTACAGAGGCTGCAAAAAAGTTGGCAAAGCAATGGAAAGAAATGCTTCTAGCTGATGATA AGATATGGGATCAGAATGGGTTTAATGATATTGTTCACAGACAGTTAGGACCATCTGTTGATGATGACCGTGGACTTGTT TTTGCTTTTGATGGAAATCTGAAGATGGGAATTTTGCCTGCAAGTATCTTCTGTAGTGGACATACATATTTTGTCCAGGC TATGTACCAGCAGCTAAGGTTGGAGCCATATGCAGTGCACACAACATTCCAATATGGAGGTACTGAAGGAAAGCGCCACC GACTACGAGAAGCCATACTCTTCCATGATCCACCAGAATACTATAATCCTCCTGGGGGTTTCTTGTCATTTAAGCCATAT ATTCCAAAAAGCTTGATGTTAAATGGGGAGCATTCAGTTGAATCACATTTTACTCTTGTTAATCACCAAATTAAACAGAT TAGGACAGCACTTGCAATTGCTTCCCTCCTGAACAGAACTCTGGTCATGCCTCCACTATGGTGCAGAATTGACCGGCTGT GGTACGGCCATCCTGGTATTTTGGAAGGGTCTATGACTAGACAACCTTTTCTCTGTCCTTTGGACCATGTATTTGAGGTG AATGTCATGTTGAAAAAACTCCCAGAAGAAGATTTTGGCCCTGAAATAGATATTAGAGAGTACTCAATACTTGATAATCC CTCTGTGCCGTCAGAGGTGAAAAAGTCATGGCTTAATGTTCAGCTCTGCAAAGAAGGAACTCAAGATTGTGATGCATCAA ATGATACAACTTTGGGGGGATTACTTAAATTTCCAAAGCATAGCAATGAAGAAACGTTCATGAAAGTATTCTCATCATTC AAGGATGTAAAAGTCATTAAGTTCTCTTCAGTGCTAGATGCTTTCACAGGTTTCGCTGACAAGGAAAGGGAAGAGAGATT CAGAAATCGTGTTAAGCGGTATGTGGGCATATGGTGCTGTGTGCCAGATCAAGATCCTGGCCACATTTATTATGATATGT ACTGGGATGAGAAACCTGGATGGAAAGCAATTCCGCCTCAATCTCCCGAGGAAGATCGTCCACCTTGGTGA
Protein sequence (LotjaGi4g1v0141800.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MVWRNGCEEVAHSKPLFLTIYTVVIIGIVVSFFYVFSAIYSTNTPASQPSQWLSSSISLHEDPQITNQTLNISQSVTVPN PSPGQQNVGGPSPIWDVPPSNKQMPPLKTFQLTKELVQQRVKDNVVIVTFGNFAFMDFILNWVKQLTDLGMSNLLVGAMD TKLLEALYWKGVPVFDMGSHMSAVDVGWGSPTFHKMGREKVILIDSILPFGYELLMCDTDMVWLKNPLPYLARYPGADIL TSSDQVIPTVVDDSLEIWQEVSGALNIGIFHWRPTEAAKKLAKQWKEMLLADDKIWDQNGFNDIVHRQLGPSVDDDRGLV FAFDGNLKMGILPASIFCSGHTYFVQAMYQQLRLEPYAVHTTFQYGGTEGKRHRLREAILFHDPPEYYNPPGGFLSFKPY IPKSLMLNGEHSVESHFTLVNHQIKQIRTALAIASLLNRTLVMPPLWCRIDRLWYGHPGILEGSMTRQPFLCPLDHVFEV NVMLKKLPEEDFGPEIDIREYSILDNPSVPSEVKKSWLNVQLCKEGTQDCDASNDTTLGGLLKFPKHSNEETFMKVFSSF KDVKVIKFSSVLDAFTGFADKEREERFRNRVKRYVGIWCCVPDQDPGHIYYDMYWDEKPGWKAIPPQSPEEDRPPW
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 15 | 15 | - | – | |
| PANTHER | 6 | 636 | 631 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 6 | 636 | 631 | 0.0 | – | |
| TMHMM | 15 | 37 | 23 | - | – | |
| Phobius | 16 | 40 | 25 | - | – | |
| Phobius | 41 | 636 | 596 | - | – | |
| TMHMM | 124 | 143 | 20 | - | – | |
| Pfam | 150 | 375 | 226 | 4.6E-59 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi4g1v0141800.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…