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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi4g1v0144000 |
| Transcript ID | LotjaGi4g1v0144000.1 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Pectin acetylesterase; TAIR: AT4G19420.1 Pectinacetylesterase family protein; Swiss-Prot: sp|Q6DBP4|PAE8_ARATH Pectin acetylesterase 8; TrEMBL-Plants: tr|I3SY05|I3SY05_LOTJA Pectin acetylesterase; Found in the gene: LotjaGi4g1v0144000 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr4:22901745..22912629) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TTATTATTTTTTATGTAGATCTCTATTTTTCCCCTTTGGTAATAAGATGCAGACATGTCCCACTTACACGTTAACATCAC TCTTGGAAATAAGACAGTTAGATTGTGTTATTCCTGCAGCTTCCAAGTACATTCACTGGTTCCTTCTCTGTGGGCGAGTG TCGGTATTTGACGCATTTAATATATAAAGCCACCTCTCTGGACTGGGTTTCACTCATCATTATTCCCAAGTGCATCAACC CATTTTCTGTTCAAGGTTCAGCTTCTGAGCTTCATTATCATATATTTTGTAGTTAATGTCTTTGTTTTGATTTTTCTTTC TGCAACTTTTATTTTTATCATTCATCATCAGTTTGTGGATTGCAATTGCATGTTTCTGATTTTTTGGATCTAGAAGTAGG CATAGTTGTTGACTGTGCTCTGCAGTGAACATGTGTTGATCTAGGAAGTGTTGAAATTGGACCAATGTGATCTGTTTTTA AGCTAAGTTTTTGGAGTTTCTTTTGTGTTATTATGATTTGATATTTAAACGCTATTGTTAAGGTATTTTCTGGGTTAGTT AATTTAACAAGAATGGGTTTATGTTATTTACTTATTTATTATACACCCTATTGATCCTTCTAAATAAGGTACTCTGTATT TTACTAGTTGGATCCGTGGAGAATGGAGTGTCCAAGAATGGGCCAATGGTTAAGCCTTCTATTATGTTTACTGCTATTAC TAAAGGCAGAAGGAGTTGCTGTTCCAATCACTTTTGTTCAAAGTGCGGTCGCGAAAGGAGCTGGTGAGAAATTTCTGCTG TGTCTGATGATTAGGAATATGAATATTTGTGTTCTTCATATCATGTTCACTATTTTAAGTGCTTTTTTATATTGGTTTCC AAATTGATTTCAATTTTCAACATATATATTGTGCAGTTTGTTTAGATGGGAGTCCACCAGCTTACCATTTTCATAAGGGA 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AAGAAAAAAAAAATAGAAGAGAAAAGAAAGTCCTGTGTAATTACTTATTACCCAGTGAGAGAAATTACTTATAGGAATAA GGGAATGGGTATTTTTGTCCAAAAAGAAAAGGTGTTACTTGCTATGCTACTCCTTCTTAAAATATGATAGGTGTATCGTA GCATTCCTTATATATATATATATATATATATCTATAAAGGGAAGTTTTTGCAACTTTAGTGGTAGTTTTGTCATTCAACA ATTCATTGCACATCAAATTAATTTTTAACATGGATATTTTAGTAAAGATGGACATTATTCTCCAAAGATGGAATCTTGGC CGTTCATAACTTTGTTCCAATGCTTCACATTTGCTGTCATCTTTCTTTCACCTTTTGCTCTTCTGGGTTTCTCATTTTGC AACGCTTCAGGTTTGGTGCTTTTCTTTCTTCTACCGTTTCACTCTTTTCAGTTTCTTATTTTCCAAAGTGTGGCGAGGCT TAAAAATCAAATGGATGCGTTACCTCTTCCTTTCCTCTTAACCTAGCAGAGTCGCTGTCAAATGCGTTACCTCTTCGGTC TGGGGCGGTGACCCATTCCTGACCTGAGGCAAAGCGATTTAAACCACATAGGAATGGAAGTCTGGAACACAGATTCTTGG GAGCTCTGATCTTTAATCCAGTAAGAACAATCTTCTCCTCCGTTCTCCTTACTTTTTTTCCCACCTTCTCTCTTCAACAG TTTCACCACCATGTCTTTCCATCTGCCACTACAAGGTAAGTTCTTTCACAATCTTCCACTCTCCATTCACATATTGTTCT TCCCTCTTGAAATCTTACTATTTTTATTGGATTTCTTTTCGATATGAATCAGTTCCAACGCAAAGTTGTTCATCAGAAGG TAAGAGCTTTCACCTCCTTCCAATTTCTTTTCTTTTTTCAAGATGAGGATCAATATGTTGGGTTGTTGGTGCTACGATGT GGTTTTGCACAGTGATGACAATAATCAATTTAGATGTGTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTGACCAATTATGTTATCCAGATT TTAAGAAATGTGAATTTGAGATTATTAAATGGTTTTGGTTTTCTTCATATGTGTGTATGTTTGTGGAATTCGGACAATTG TATCAAAATATATGAACGGTTACTCCTTTTATTCTTGACTTTCACAATTTTACTTGAAATCTTTAATGATACTTTTTCTG CAGCAGTATCTTTACCTCACTTTTTTTTTCACCCAGGGAATTTGCTTTAGCATATATCCAAAGAGGCTTGGCTTAGAAGG TGTATCTGTTGTCATCTCTTCTCAGCTTCTGGCAAACAGGTTCAATCTTCACTTTCAATGTATTTTCTAACGGATATTGA AGATGGGTTCTGAATGCTATTCTTACTTTTGAGGCAAAGTCTTCATTTCTATTTGGGCGAAATTCAGAAATCCGGTTTTT GTTCCAATAAATTTAATGGATTTCGTTCATCTTTGCCTGGAAAAAAAGAACGAGAGAAATTGATAAGAGGAAGTGCTAAT TGCTAAATTATATGATTGGTTGTGTTCATACAAATGATTGTCTTTACAAAGTCCACATGCACTAATAAAATGAGAGTGAT ACTTTTCCACTTTGGATTGAATTAAGTAGCAAAATGTTGATGTGCATGGCTGCTGAAAAACTCTGTGCTCGGGATAAAGG AATTCAAGTGTTGGTGGATGTTTGGCATGTTTTAATTACTCAACAAAGGAAGAGTTTGATTAAAAAAACTGTTTTTGTGA AATTTTCTTTAGATAAAGTAGGCTGAAAATTTTGATTTCTGTCTGTTTCTTTTATTCAATCTTTTGATTCTAGGTTTCTT TTATTCAACTTACTTCACTTCTTCTTATGGTTTCCACTTTTATTTTAATTTGCATTTCTCTTTTGATTTTGGACTAGAAG GTGGGAGATTAGGAAAGAGAATAGAGTGTTTGTTGAGAGCGTCCATCGCAGTCATCATCTTCAACAGTGGTATAAACTCC TTTTATTTTGCTTCTTAATGACTTTTTCTGATCCTTTTCTGTTTGTGTGCAAACTTCAAACTCAACACTTAAGCTTAAGC CATTCCCTGATGTTGTGTTTTTGTTGCTGTGATTTTGTTCATTGCGTTTTGGTGTTGAGCTATTCTTTGGTTATTAACTT TCATGAAAAACCTTGATTGATCCATGTTCTATGATGGTTATATTTTACTATGTAGGTTCTGATATTTAATCTTTTCAAAG GAACATCAACATGGCTTTTGAAAGCCCTGCAGTTTTTCTCATTTCTAAAGTTATTAAATGCCTTGAGCTTTGAATTATCT AATTGTATATCTATTGAATTCTGAATTAGAACTACGCTTTTGTCGGTTCAAGATATCTGAGAGGGGAAGGAGTTACGGCA CACAGAGGGGACCACAATCACAACAATCTGTACAATATCGTCTTGATCAGGTATGACAAGTATGTCTTATCCTTTTTTAC CCTCTTAAATGAAAATGCATTCATTCTTTTTTGGTGTTTCCTAATTTTTATTGAATTTGTGTGTATATATTTGTTTTCCT TTCCAGTTTACAAATTTTATATTTTTTAACTGTATTCTTAAGTGTCGTTAGTTGAATGTAAGTTTTGAAAAGTGGGTTAT TGTGTTAGAGATTTTGAGAAAAAACAAAAAGATGCTAGACAAGTCCATTATAGAAATACAAAGGGAAAGACAATAAATTA AGAATGCCAAACAAGGACAGATGGTATCATATCTTTTGTTCATTTTTTTATTAGTTTTCATCACTATTTTGCATTTTTGA TTAGTTCACATCTGAAGTTAATTTTGTGCTTATAAGGATTGTGGTCTTATATAGTGGGGTGATGTTATTAATAGTGGTTC 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TTAGTCAGAGATAAGAATCCAAAGAGATAGTAGATGAAGGCTTACAGCAGTAGTATATGAGAACTATGAGAAGGTACTAA GGTGCACCCGAATATATTGATTAATATTCATCTCAAGTCTCAATCCTTTAAAGTTAAAGCTGGGGGTTTTAGCAATAAAT TTGTAATCAGTGCCAAAAAAAAATTTTCCACTGATCCTTTTCCCTACAATTATTTGCCTTACATAGAAATTGAACATTTA AATGACAATTTATGTTCTAATCTGAGCATTAATGAGTTTGTTTAAAGACTTTTAGACTTTAGTGGTTAGTTATTAGGATT CTATATCCGGAACTCTTTATTAGTTGTAGTATTTATTTAGGGAATTCCATAGGACCTGACTGATTAGTGATTATTTTGGA TTTATAGAAATATTAAGTAAAATTAATTTTAATCATTAAAAATTAAAGCTGGAGGTTTTAGCATAAACTTTGATATCAAT GCCAAAAAAATTCTCCACTAACACTTTTCTCTATAACTATTTGCCTTAGATGTGTGTATATAAATTAGTAATAGTGCTCT TTGAGAAGTTTGCACTTCAATTTATCTGATTTTCAAATGTACATTACTTCACATAATCTAATTTTCAACATTGTGCATTG CATTTTGCAGGTATAAAAAAATGTACGCAAGTCAAAGTGGACACGTGTATAGTTTCATAATTTTTTGGTTCTTTATTAGT GTTTAATCGATGTCTCCGAGTGATAGCTCAAGTGGTAAGAGTTATAGAGCATATAGATTAGATGAAGGGGGTCTAAGGAT CAATCATTTGATGATGCAATTTGGTTTTTCAATGTACCTAAAAAAGTTTTTTTTTAAAAGGAAAAAAGTGTTTAATCGAT ATAAACTTTGGATTGCTTTACACCTCTTTTGCATGAGTGAATGATTAATTGATAAATGAAAATGAAGTCTATCTTATAAT GTGTAAGCACAACACACTCCATTTAAACTAATATTTAAATCATAATTTTATTCTATATAGTAAGTAGAATTCCATTTGGT TATATATATAATAGTCGTATCTAATATTCATATATCTTCATCAAAAAAAATCTTATATTCATAATATCACTTCAAAATGA ATATTTGATATATTAAACAATGTCAATACGTATATGTTTACATATTCATTTTCGTTAACATAAAACAAGCTTTCTTTTTG GTGCAAACCATGCTTTGATCCATGTTGTGTGAAAATTGAAGTCATTAAATTCATATATTAAGAATTAAAAAATGTGTTTT CAGCAAAAAGTAAAAATTCAAAATCTATTCTCGATCTCCCCTTATTTACAGTCGAATGAGATTTTAGAAAAAAATTAGTA GTTTAAATAGTGAAGACTGACCATGACTAAACTCATAATCATAAAAAATTTGAATATAATATATATAATGTACTGTATTT AATTATATAACAGCATAAAAATAGAGATATAAAGTGAAATTAAATTCAAAATTTATTGAAAGGGTTTTTTTTAGAAAGGA GAAGCATTCATAAATATTTATTTATTTAGAGGGTTATGCAACATGGGCGGATCCAGACATTATATATCGGTGTGGCTAAA CATAAAAGAAATTATATACTAAAATACAAAATAGAAATTATATTAGGTAGCAAGCAAGAAGTAACTATAATCTCACATGA AAAGCAGAAAAGTTTATTCAACCATGAAAAGTTAAGACTAATATAATTTGTGCAGTAAAAAGGACAAATTTTGTTTTTTT GGGAGAAAACATTACAATGTTGCTAATTTAACATTCCAAAATTTGCAGGCACGAAATTCTGTTCTGGATATAACAAGCAG TGTTGATTGCTTCTGCGCAGAAATGTTTGGCCATACTTGATTCTTGCATCATGGTGCGAGCCATCTCCTGAAGAGTTATG TTCTTTCTTTCAACAACTCCATTTTGTTGGGGAGTGCGAGGACAAGAGAAGTTGTGAGAGATTCCTTGGGAGTTGAACAA TTCTTCAAAAGCTTTGTTCTCAAATTCTCCACCATGATCACTTCTGACAGTAATCACTGAAGTTTGGAACTCCTTCTGAA CTTGAGTGATGAAGTTGGTAAACATAGTGTGTGTTTCATCTTTATGTAAGATCAAGTTTTGATCTAGTAGTACAACTCTA TGTTTTGATGATTACAAGTTAACCTTTTTGAAGGTGTGAAAAACGACTAGAAGGGGGGGTTGAATAGCGTTTTCAAAATA AAAAC
CDS sequence (LotjaGi4g1v0144000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGAGTGTCCAAGAATGGGCCAATGGTTAAGCCTTCTATTATGTTTACTGCTATTACTAAAGGCAGAAGGAGTTGCTGT TCCAATCACTTTTGTTCAAAGTGCGGTCGCGAAAGGAGCTGTTTGTTTAGATGGGAGTCCACCAGCTTACCATTTTCATA AGGGATTTGGAGCAGGAATTAACAACTGGATTGTTCACTTTGAGGGAGGAGCATGGTGCAACAATGTCACTACTTGCCTA GCTCGTAGGGACACTCGTTTAGGTTCATCTAAGAAAATGTCGCAGACCCTTTCCTTTTCTGGGTTTTTCAGTAATGGGCA AAAGTTTAATCCAGATTTCTACAATTGGAACAGAATCAAGGTTAGGTATTGTGATGGGTCATCATTTACTGGTGATGTTG AAGCTGTTGATCCAAAAACCAATTTGCACTTCAGAGGAGGAAGGATTTTTGTTGCTGTCGTTGAGGATTTACTAGCAAAT GGAATGAAAAATGCTCAAAATGCAATTCTCTCTGGATGTTCCGCTGGAGGATTGACCTCTATTTTACAGTGCGATCGCTT CAGATCTCTTATTCCTGCAGCAGCCAAAGTGAAATGCCTTTCAGATGCTGGTTATTTTATTAATCTAAAGGATGTGTCTG GAGCCGCACACATAGAACAGCTTTATAGTCAAGTTGTTGAAACCCATGGCTCTGCAAAGAATTTGCCTGCATCCTGCACC TCAAGACTCAGACCGGGGCTGTGCTTTTTTCCCCAAAATGTGGCAGGGCAAATCAAAACACCAATCTTCTTTGTCAATGC AGCGTATGACTCATATCAGGTTAAGAACATTTTGGCTCCAGGTGTTGCTGATCCCCATGGCACTTGGCGTGACTGCAAGC TTGATATAAAAAAGTGCTCTTCTAATCAATTAACTGTAATGCAAGGTTTCAGGACAGAATTCTTAAAGGCTATAAGTGTG GTTGAGAACTCTCCATCTAAAGGAATGTTCATAGACGGTTGCTATTCCCATTGCCAAACTGGAATGCAGGAGACATGGAT GAGAAGTGACTCTCCAGTGCTGGCCAATACAACAATTGCAAAGGCAGTGGGAGATTGGTTTTATGAACGAAGGTCTTTCA GTCAGATAGATTGCTCTTACCCTTGCAACCCTACTTGTCACAACCGTGTTTTTGATGATAATTAA
Protein sequence (LotjaGi4g1v0144000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MECPRMGQWLSLLLCLLLLLKAEGVAVPITFVQSAVAKGAVCLDGSPPAYHFHKGFGAGINNWIVHFEGGAWCNNVTTCL ARRDTRLGSSKKMSQTLSFSGFFSNGQKFNPDFYNWNRIKVRYCDGSSFTGDVEAVDPKTNLHFRGGRIFVAVVEDLLAN GMKNAQNAILSGCSAGGLTSILQCDRFRSLIPAAAKVKCLSDAGYFINLKDVSGAAHIEQLYSQVVETHGSAKNLPASCT SRLRPGLCFFPQNVAGQIKTPIFFVNAAYDSYQVKNILAPGVADPHGTWRDCKLDIKKCSSNQLTVMQGFRTEFLKAISV VENSPSKGMFIDGCYSHCQTGMQETWMRSDSPVLANTTIAKAVGDWFYERRSFSQIDCSYPCNPTCHNRVFDDN
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 9 | 9 | - | – | |
| Phobius | 1 | 24 | 24 | - | – | |
| PANTHER | 1 | 393 | 393 | 5.1E-227 | – | |
| SignalP_EUK | 1 | 24 | 24 | - | – | |
| PANTHER | 1 | 393 | 393 | 5.1E-227 | ||
| Phobius | 10 | 20 | 11 | - | – | |
| Phobius | 21 | 24 | 4 | - | – | |
| Pfam | 21 | 371 | 351 | 6.0E-165 | ||
| Phobius | 25 | 394 | 370 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Hydrolase activity | Catalysis of the hydrolysis of various bonds, e.g. C-O, C-N, C-C, phosphoric anhydride bonds, etc. Hydrolase is the systematic name for any enzyme of EC class 3. |
Expression pattern of LotjaGi4g1v0144000.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…