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LotjaGi4g1v0144000.3

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi4g1v0144000
Transcript ID LotjaGi4g1v0144000.3
Related isoforms 2
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Pectin acetylesterase; TAIR: AT4G19420.1 Pectinacetylesterase family protein; Swiss-Prot: sp|Q6DBP4|PAE8_ARATH Pectin acetylesterase 8; TrEMBL-Plants: tr|I3SY05|I3SY05_LOTJA Pectin acetylesterase; Found in the gene: LotjaGi4g1v0144000
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr4:22902524..22912580) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

CAGACATGTCCCACTTACACGTTAACATCACTCTTGGAAATAAGACAGTTAGATTGTGTTATTCCTGCAGCTTCCAAGTA CATTCACTGGTTCCTTCTCTGTGGGCGAGTGTCGGTATTTGACGCATTTAATATATAAAGCCACCTCTCTGGACTGGGTT TCACTCATCATTATTCCCAAGTGCATCAACCCATTTTCTGTTCAAGGTTCAGCTTCTGAGCTTCATTATCATATATTTTG TAGTTAATGTCTTTGTTTTGATTTTTCTTTCTGCAACTTTTATTTTTATCATTCATCATCAGTTTGTGGATTGCAATTGC ATGTTTCTGATTTTTTGGATCTAGAAGTAGGCATAGTTGTTGACTGTGCTCTGCAGTGAACATGTGTTGATCTAGGAAGT GTTGAAATTGGACCAATGTGATCTGTTTTTAAGCTAAGTTTTTGGAGTTTCTTTTGTGTTATTATGATTTGATATTTAAA CGCTATTGTTAAGGTATTTTCTGGGTTAGTTAATTTAACAAGAATGGGTTTATGTTATTTACTTATTTATTATACACCCT ATTGATCCTTCTAAATAAGGTACTCTGTATTTTACTAGTTGGATCCGTGGAGAATGGAGTGTCCAAGAATGGGCCAATGG TTAAGCCTTCTATTATGTTTACTGCTATTACTAAAGGCAGAAGGAGTTGCTGTTCCAATCACTTTTGTTCAAAGTGCGGT CGCGAAAGGAGCTGGTGAGAAATTTCTGCTGTGTCTGATGATTAGGAATATGAATATTTGTGTTCTTCATATCATGTTCA CTATTTTAAGTGCTTTTTTATATTGGTTTCCAAATTGATTTCAATTTTCAACATATATATTGTGCAGTTTGTTTAGATGG GAGTCCACCAGCTTACCATTTTCATAAGGGATTTGGAGCAGGAATTAACAACTGGATTGTTCACTTTGAGGTATGTTTCT TCCTGCAAAATTGCATCAATGAGTCTTTACCAATTCAAGAAATTAAACATTCATTTCACTTTTTATTCTACTTATATGTT CTTTTTAAGTTCATGAGTTCATGTTCAAAGATTGCTTTGTTCAATTGCCAAGTGGATGAGGGGATGAATTTCTAATTTTT TAATTTAAAAACCTAATCAAAAGTAAGCTAATCATGAAAATTTATAAAATGTGGAAACCAATTCTAAGAGATCTCTAAAA TATCCTATGTTTTACAAAAATAGTATTATGTGACATTTTCTAGATAGGCTAATTTGTGTCATTTAGCTTGTCTCAGTTCG GTACAGATGATGAAAGTTCTCTTTTCTTGTTGATGATCTTCTTCTATACAATTTCTTTCAGGGAGGAGCATGGTGCAACA ATGTCACTACTTGCCTAGCTCGTAGGGACACTCGTTTAGGTTCATCTAAGAAAATGTCGCAGACCCTTTCCTTTTCTGGG TTTTTCAGTAATGGGCAAAAGTTTAATCCAGGTATTGTCTGCTGATCAATACATATTGCTTGTCCTTATGAAGTCAATTT TTAACGAGTTTGTAAATTTCAGATTTCTACAATTGGAACAGAATCAAGGTTAGGTATTGTGATGGGTCATCATTTACTGG TGATGTTGAAGCTGTTGATCCAGTAAGTACTTAAATTTCAAGGAAAATACTAATATTTCAACAATTGTATATGCTTGTTT TCTTTGTGCTGATATTTTGTAATTTGATTTGTAAACCAGAAAACCAATTTGCACTTCAGAGGAGGAAGGATTTTTGTTGC TGTCGTTGAGGATTTACTAGCAAATGGAATGAAAAATGCTCAAAATGTACGAGATATTGATGATTTACCACTTTTCTTCT TCTACCTGAATTAATTTCAGTCACTCACTGAAACTTGTAACTGCAGGCAATTCTCTCTGGATGTTCCGCTGGAGGATTGA 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ACCCAGTGAGAGAAATTACTTATAGGAATAAGGGAATGGGTATTTTTGTCCAAAAAGAAAAGGTGTTACTTGCTATGCTA CTCCTTCTTAAAATATGATAGGTGTATCGTAGCATTCCTTATATATATATATATATATATATCTATAAAGGGAAGTTTTT GCAACTTTAGTGGTAGTTTTGTCATTCAACAATTCATTGCACATCAAATTAATTTTTAACATGGATATTTTAGTAAAGAT GGACATTATTCTCCAAAGATGGAATCTTGGCCGTTCATAACTTTGTTCCAATGCTTCACATTTGCTGTCATCTTTCTTTC ACCTTTTGCTCTTCTGGGTTTCTCATTTTGCAACGCTTCAGGTTTGGTGCTTTTCTTTCTTCTACCGTTTCACTCTTTTC AGTTTCTTATTTTCCAAAGTGTGGCGAGGCTTAAAAATCAAATGGATGCGTTACCTCTTCCTTTCCTCTTAACCTAGCAG AGTCGCTGTCAAATGCGTTACCTCTTCGGTCTGGGGCGGTGACCCATTCCTGACCTGAGGCAAAGCGATTTAAACCACAT AGGAATGGAAGTCTGGAACACAGATTCTTGGGAGCTCTGATCTTTAATCCAGTAAGAACAATCTTCTCCTCCGTTCTCCT TACTTTTTTTCCCACCTTCTCTCTTCAACAGTTTCACCACCATGTCTTTCCATCTGCCACTACAAGGTAAGTTCTTTCAC AATCTTCCACTCTCCATTCACATATTGTTCTTCCCTCTTGAAATCTTACTATTTTTATTGGATTTCTTTTCGATATGAAT CAGTTCCAACGCAAAGTTGTTCATCAGAAGGTAAGAGCTTTCACCTCCTTCCAATTTCTTTTCTTTTTTCAAGATGAGGA TCAATATGTTGGGTTGTTGGTGCTACGATGTGGTTTTGCACAGTGATGACAATAATCAATTTAGATGTGTTTTTTTTTGT TTTTTTTTTGACCAATTATGTTATCCAGATTTTAAGAAATGTGAATTTGAGATTATTAAATGGTTTTGGTTTTCTTCATA TGTGTGTATGTTTGTGGAATTCGGACAATTGTATCAAAATATATGAACGGTTACTCCTTTTATTCTTGACTTTCACAATT TTACTTGAAATCTTTAATGATACTTTTTCTGCAGCAGTATCTTTACCTCACTTTTTTTTTCACCCAGGGAATTTGCTTTA GCATATATCCAAAGAGGCTTGGCTTAGAAGGTGTATCTGTTGTCATCTCTTCTCAGCTTCTGGCAAACAGGTTCAATCTT CACTTTCAATGTATTTTCTAACGGATATTGAAGATGGGTTCTGAATGCTATTCTTACTTTTGAGGCAAAGTCTTCATTTC TATTTGGGCGAAATTCAGAAATCCGGTTTTTGTTCCAATAAATTTAATGGATTTCGTTCATCTTTGCCTGGAAAAAAAGA ACGAGAGAAATTGATAAGAGGAAGTGCTAATTGCTAAATTATATGATTGGTTGTGTTCATACAAATGATTGTCTTTACAA AGTCCACATGCACTAATAAAATGAGAGTGATACTTTTCCACTTTGGATTGAATTAAGTAGCAAAATGTTGATGTGCATGG CTGCTGAAAAACTCTGTGCTCGGGATAAAGGAATTCAAGTGTTGGTGGATGTTTGGCATGTTTTAATTACTCAACAAAGG AAGAGTTTGATTAAAAAAACTGTTTTTGTGAAATTTTCTTTAGATAAAGTAGGCTGAAAATTTTGATTTCTGTCTGTTTC TTTTATTCAATCTTTTGATTCTAGGTTTCTTTTATTCAACTTACTTCACTTCTTCTTATGGTTTCCACTTTTATTTTAAT TTGCATTTCTCTTTTGATTTTGGACTAGAAGGTGGGAGATTAGGAAAGAGAATAGAGTGTTTGTTGAGAGCGTCCATCGC AGTCATCATCTTCAACAGTGGTATAAACTCCTTTTATTTTGCTTCTTAATGACTTTTTCTGATCCTTTTCTGTTTGTGTG CAAACTTCAAACTCAACACTTAAGCTTAAGCCATTCCCTGATGTTGTGTTTTTGTTGCTGTGATTTTGTTCATTGCGTTT TGGTGTTGAGCTATTCTTTGGTTATTAACTTTCATGAAAAACCTTGATTGATCCATGTTCTATGATGGTTATATTTTACT ATGTAGGTTCTGATATTTAATCTTTTCAAAGGAACATCAACATGGCTTTTGAAAGCCCTGCAGTTTTTCTCATTTCTAAA GTTATTAAATGCCTTGAGCTTTGAATTATCTAATTGTATATCTATTGAATTCTGAATTAGAACTACGCTTTTGTCGGTTC AAGATATCTGAGAGGGGAAGGAGTTACGGCACACAGAGGGGACCACAATCACAACAATCTGTACAATATCGTCTTGATCA GGTATGACAAGTATGTCTTATCCTTTTTTACCCTCTTAAATGAAAATGCATTCATTCTTTTTTGGTGTTTCCTAATTTTT ATTGAATTTGTGTGTATATATTTGTTTTCCTTTCCAGTTTACAAATTTTATATTTTTTAACTGTATTCTTAAGTGTCGTT AGTTGAATGTAAGTTTTGAAAAGTGGGTTATTGTGTTAGAGATTTTGAGAAAAAACAAAAAGATGCTAGACAAGTCCATT ATAGAAATACAAAGGGAAAGACAATAAATTAAGAATGCCAAACAAGGACAGATGGTATCATATCTTTTGTTCATTTTTTT ATTAGTTTTCATCACTATTTTGCATTTTTGATTAGTTCACATCTGAAGTTAATTTTGTGCTTATAAGGATTGTGGTCTTA TATAGTGGGGTGATGTTATTAATAGTGGTTCTCATTACTAGCTTAAATCTGAACTTTATGGTGTTGATTTGAGAATTCAA CTTTCTTTTGAGAAACCTCTTTATGCTATGTTTTCCAATATATATTATTTTTGTGGCAATTCCTTTACCTGGCCCAAATT GCTTTGAAAATGAATAAGCAATACTGAGAGCATCCAGAGGGAACTGGCTGATGGACTGAGTGCTCAGTTAAGATCAACCT ACATGAGAGTTAAAGAAAGATTGTTTCCCCTTATTTCTGAAGTTTTTTGTTTTTGGTTTATGGTTGTTATAACTCCATTA TCATATTTTTTCTATCAGCAAATTGAATATGTATAATAAATAGGAGCACAAGGGGTGCCCCAACCCTTGTGCAAGGAGAA AAAGGAAAACAAAAAATGGCAAAGCAAAACCCAACAGAACATACAGGGAAAAGCCAAGCATAAAGGAAAAATCCGGCCAA CAAATAAACCAGAGGCAGCAGCAGGTAAGCCTTTTCAAGATAGTAAGACAATCTTTCAGATTAGTCACCTAAATCGAATC TCATCAGCAAAAGGCATCAGTTTTGATGGTAAAATTGGTTTTTATGTCTCATATTTAATTCCTGAAAATGATTTGTTCAT TTCCTATCACCAATTGAATTTCCAAAACTGAAAGTTTTAATAAAAAAATCAATCTCATTATTTTGAAATATTACATTTGA GTTGGTGAGATTATTATGTTTTGAAGGAAGATTTACAAACAAAATGAAGAGTGAGTAGAGCTCAGATTCAATGCAGTTCC TGAGACAAAGCCAAAGCATGACTAAATCCTTCATAATGCATACTAACTACTAGCAAATGTTGCAGGGGAGTTTTGGATCC AATTTAACCAGTTTCACATTTTATAGCTGATTTACATGATATAGCTTATCCAAAATAGCAAAATCTTATTGGATGAAAAA GGTATTTATGATTTTTTAGATGTATAATATGTTAGTCAGAGATAAGAATCCAAAGAGATAGTAGATGAAGGCTTACAGCA GTAGTATATGAGAACTATGAGAAGGTACTAAGGTGCACCCGAATATATTGATTAATATTCATCTCAAGTCTCAATCCTTT AAAGTTAAAGCTGGGGGTTTTAGCAATAAATTTGTAATCAGTGCCAAAAAAAAATTTTCCACTGATCCTTTTCCCTACAA TTATTTGCCTTACATAGAAATTGAACATTTAAATGACAATTTATGTTCTAATCTGAGCATTAATGAGTTTGTTTAAAGAC TTTTAGACTTTAGTGGTTAGTTATTAGGATTCTATATCCGGAACTCTTTATTAGTTGTAGTATTTATTTAGGGAATTCCA TAGGACCTGACTGATTAGTGATTATTTTGGATTTATAGAAATATTAAGTAAAATTAATTTTAATCATTAAAAATTAAAGC TGGAGGTTTTAGCATAAACTTTGATATCAATGCCAAAAAAATTCTCCACTAACACTTTTCTCTATAACTATTTGCCTTAG ATGTGTGTATATAAATTAGTAATAGTGCTCTTTGAGAAGTTTGCACTTCAATTTATCTGATTTTCAAATGTACATTACTT CACATAATCTAATTTTCAACATTGTGCATTGCATTTTGCAGGTATAAAAAAATGTACGCAAGTCAAAGTGGACACGTGTA TAGTTTCATAATTTTTTGGTTCTTTATTAGTGTTTAATCGATGTCTCCGAGTGATAGCTCAAGTGGTAAGAGTTATAGAG CATATAGATTAGATGAAGGGGGTCTAAGGATCAATCATTTGATGATGCAATTTGGTTTTTCAATGTACCTAAAAAAGTTT TTTTTTAAAAGGAAAAAAGTGTTTAATCGATATAAACTTTGGATTGCTTTACACCTCTTTTGCATGAGTGAATGATTAAT TGATAAATGAAAATGAAGTCTATCTTATAATGTGTAAGCACAACACACTCCATTTAAACTAATATTTAAATCATAATTTT ATTCTATATAGTAAGTAGAATTCCATTTGGTTATATATATAATAGTCGTATCTAATATTCATATATCTTCATCAAAAAAA ATCTTATATTCATAATATCACTTCAAAATGAATATTTGATATATTAAACAATGTCAATACGTATATGTTTACATATTCAT TTTCGTTAACATAAAACAAGCTTTCTTTTTGGTGCAAACCATGCTTTGATCCATGTTGTGTGAAAATTGAAGTCATTAAA TTCATATATTAAGAATTAAAAAATGTGTTTTCAGCAAAAAGTAAAAATTCAAAATCTATTCTCGATCTCCCCTTATTTAC AGTCGAATGAGATTTTAGAAAAAAATTAGTAGTTTAAATAGTGAAGACTGACCATGACTAAACTCATAATCATAAAAAAT TTGAATATAATATATATAATGTACTGTATTTAATTATATAACAGCATAAAAATAGAG 

CDS sequence (LotjaGi4g1v0144000.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGAGTGTCCAAGAATGGGCCAATGGTTAAGCCTTCTATTATGTTTACTGCTATTACTAAAGGCAGAAGGAGTTGCTGT TCCAATCACTTTTGTTCAAAGTGCGGTCGCGAAAGGAGCTGTTTGTTTAGATGGGAGTCCACCAGCTTACCATTTTCATA AGGGATTTGGAGCAGGAATTAACAACTGGATTGTTCACTTTGAGGGAGGAGCATGGTGCAACAATGTCACTACTTGCCTA GCTCGTAGGGACACTCGTTTAGGTTCATCTAAGAAAATGTCGCAGACCCTTTCCTTTTCTGGGTTTTTCAGTAATGGGCA AAAGTTTAATCCAGATTTCTACAATTGGAACAGAATCAAGGTTAGGTATTGTGATGGGTCATCATTTACTGGTGATGTTG AAGCTGTTGATCCAAAAACCAATTTGCACTTCAGAGGAGGAAGGATTTTTGTTGCTGTCGTTGAGGATTTACTAGCAAAT GGAATGAAAAATGCTCAAAATGCAATTCTCTCTGGATGTTCCGCTGGAGGATTGACCTCTATTTTACAGTGCGATCGCTT CAGATCTCTTATTCCTGCAGCAGCCAAAGTGAAATGCCTTTCAGATGCTGGTTATTTTATTAATCTAAAGGATGTGTCTG GAGCCGCACACATAGAACAGCTTTATAGTCAAGTTGTTGAAACCCATGGCTCTGCAAAGAATTTGCCTGCATCCTGCACC TCAAGACTCAGACCGGGGCTGTGCTTTTTTCCCCAAAATGTGGCAGGGCAAATCAAAACACCAATCTTCTTTGTCAATGC AGCGTATGACTCATATCAGGTTAAGAACATTTTGGCTCCAGGTGTTGCTGATCCCCATGGCACTTGGCGTGACTGCAAGC TTGATATAAAAAAGTGCTCTTCTAATCAATTAACTGTAATGCAAGGTTTCAGGACAGAATTCTTAAAGGCTATAAGTGTG GTTGAGAACTCTCCATCTAAAGGAATGTTCATAGACGGTTGCTATTCCCATTGCCAAACTGGAATGCAGGAGACATGGAT GAGAAGTGACTCTCCAGTGCTGGCCAATACAACAATTGCAAAGGCAGTGGGAGATTGGTTTTATGAACGAAGGTCTTTCA GTCAGATAGATTGCTCTTACCCTTGCAACCCTACTTGTCACAACCGTGTTTTTGATGATAATTAA 

Protein sequence (LotjaGi4g1v0144000.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MECPRMGQWLSLLLCLLLLLKAEGVAVPITFVQSAVAKGAVCLDGSPPAYHFHKGFGAGINNWIVHFEGGAWCNNVTTCL ARRDTRLGSSKKMSQTLSFSGFFSNGQKFNPDFYNWNRIKVRYCDGSSFTGDVEAVDPKTNLHFRGGRIFVAVVEDLLAN GMKNAQNAILSGCSAGGLTSILQCDRFRSLIPAAAKVKCLSDAGYFINLKDVSGAAHIEQLYSQVVETHGSAKNLPASCT SRLRPGLCFFPQNVAGQIKTPIFFVNAAYDSYQVKNILAPGVADPHGTWRDCKLDIKKCSSNQLTVMQGFRTEFLKAISV VENSPSKGMFIDGCYSHCQTGMQETWMRSDSPVLANTTIAKAVGDWFYERRSFSQIDCSYPCNPTCHNRVFDDN 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Phobius 1 9 9 -
Phobius 1 24 24 -
PANTHER 1 393 393 5.1E-227
SignalP_EUK 1 24 24 -
PANTHER 1 393 393 5.1E-227
Phobius 10 20 11 -
Phobius 21 24 4 -
Pfam 21 371 351 6.0E-165
Phobius 25 394 370 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Hydrolase activity Catalysis of the hydrolysis of various bonds, e.g. C-O, C-N, C-C, phosphoric anhydride bonds, etc. Hydrolase is the systematic name for any enzyme of EC class 3.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi4g1v0144000.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…