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LotjaGi4g1v0156400.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi4g1v0156400
Transcript ID LotjaGi4g1v0156400.1
Related isoforms 1
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Alpha-glucan water dikinase; TAIR: AT1G10760.1 Pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate binding domain-containing protein; Swiss-Prot: sp|Q8LPT9|GWD1_CITRE Alpha-glucan water dikinase, chloroplastic; TrEMBL-Plants: tr|A0A151RQ57|A0A151RQ57_CAJCA Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi4g1v0156400
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr4:27196674..27234816) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

AAAGAAAGCATCGTCTCTCACGGACCCCACGGCTCGTCTCACACTCTCACCTAGCCTTGTTTGTTTCCATGCCATAACGC ACGTGATAACCTCTTACACACGATCCCACTCCAATCCCAACGCGCCACGTGTCCTTCACCGTTGATATTATGATGAGTGA CGAGTGAAACACCCGCTATCAGACACACACTTCGAAGAACCTCGCTCTCTCCTTCATCATCAACGTAGATTTTTCCATTT TTCCATTTTTCCATTTTCCATTCCCATCCTCGCAACGATTCACGAAGGTTCATTTCATTCCCTCGTTTTCAATCGAATTT CATTCATCAATTTTGCAAATCGTGAATTCGATTCAACACATTCACTGTTTGAATTTCAAGATGCAGTGAATCTTACGATT GTTAACGATTCCAAGCTTTTCTGAATCTTGCAGAGCAAGAAGTGGTGGTGGATCCACGAAGATGAGTCACAGCATCTTCC ACCAGACTCTGCTTTGTCAAACGCAGACGGTTGCGGAGCACCAAAGCAAGGTGAGTTCTCGCGGAAGCACTTTATTCCCA GCGCTGAGTGTCAGCAAAGGCAAGAAGCTTGTACTCTCTACAAATCTCCGCGGGAACAGGTTGTGCTTGAGGAAACGGAG ATTCGCCATGGGAAGAAACCGCAACACTGTGGCTATTCCGCGTGCTGTGTTAACCTCGAATGCTGCTTCTGAGGTGTGTG CCTGTGAAATATTTTGATTGTGATTGCATCATTACTATTCTTTTTTTGATTGGATTCTGTTTGTTCTTAATTTCAGTCTA ATGATTGATCAAATGTTAATAAAATTATTAGTATTATAATTTCTTAATTATTTGTTAGAAAGCTCAGTGTTTAGTATTGA AAACTTCAAGTTTTTGAAAAAGTACTTGCTTTATTAAATACTTACTATTTTTGGAATCCAATCAAGTTGTTGGGTTTCTT 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CAACGAATTTAAAATGTAGGCTTAATTGCACTTTTGGTCCCCCAACTTTGACCTTCCTGCGAAAATCGTCCCCAAACTTT AAAATTAGCAAAAATCATCCCTAACGTTTACACCCGGTTGCAAAATTGGTTTTCCGTCCAATTTCATCCACTATTTAACG AATTATGGGATAAGAATTAATAAAAAATAAGAAAATAAATCAAAAACTTAAAATTCATCATTTTTCTATCCTTTTACTGG AAATCTTTTTTTTTTTCTGGGTTCATTGTTGGAGAGAGAGGTTGAAGAAAAAGAACCCAGATCACACCAATAACAATTGC AACTCTGTCACCCAAGCTAGGACCAGTTACTACATCAATTTCCCACCCACCCCTTCATCAACACGATCCAACATCTCACC ACTACCTACACTTCTTGCCTGATCCATCTCACCAATAACAATTTCTTCCACTCAATATGTCCAAACCTGAAAAGAAATTC CTAAAGTATACACATCCCACAGTGACAAACCCAGCAAACAGAAGGAAAAAAAAATTAATTATTTACAGTGGATGAACAAT GTGATCAAATGGAAGGTACAAAATCCAAATCTCTCAACGACCCATTTCATGGTTTGAGATAAAACATTCAGACAATGTAA CTAACACATTTCCCTATCTCCCAACCACCAACACCACAGCCACTACCTAAAAACCACTGCCTCCTCCTCCGCCAGCAGAG TCAGAGACGATATAAAACTAGAGGATGATGGTGATGGCGGTGAACAGAGCGGCTACGCGAAAACGTGGTGGTGTGCAGAG GTTTAGATCTGAGATAGGTGATGAACGAGTGGTGGTGATGGGAAGATCGAGAAAGGGTGAGCGACGGTGGAGCTAAAACC AGCAAGGAGAGGTTCAGATCGGGAAAGGGCAGATCTGAGGAGAAGCGACTGCAGGAAAACGTGGCGGTGTGTAGAGGTTC AGATCGGAGAGCGCGAACGAGTGGTGGTGATGATGTGATTTGGGGAAGTGAGATGAGTGATCCATGGTATGGTGGTGGTG GCTTGCAGTTGAAGTGCAGAGGTTATGGTGGAAAGGTGAAAAGGAAAAGGGTGTTAATTAAGATGATGAAGATGAAGGAA AAATGGGATGACGATGATGAATTTTTGGGTTTTTAATCTGAAGATGATGAATGTTTCAGAGACTCAATTTTTTAATGAAT TTTTTGAGGAATATTCCGTTAGTTTTTGGATGGAATTAGACGGAAAACCAATTTTGCAACCGGGTGTAAACTTCAGGGAC GTTTTTTGCTAATTTTTAAGTTTGAGGACGATTTTCGCAAGAAGGCCATAATTGGGGGACCAAAAGTGCAATTAAGCCTA AAATGTAATGAAATGCATCAATTGATAGAACCTCACACATTTTGTGACATTACATTACTTCTTTCATTATAAAAGTGGGT GTTGTTTTAACTTTTTCACATATTTTCTAAAATGAATGTTGTGTTAGAAGTTCAAGACTATTTGTAATATCTTTTTACAC ATATACTCTCATTTAATAATATATCTCATACCCTATAAAGCACGGACTCGGACACGACACGACATGACACCAGTACCGGG ACACGGCTAAAATCTAAAAAATAAGACACGGGGACACACACACACACACACATATATATAGACACACCTCATATATTTTT ATGAAGCTCTTGTCATAAAGCTTAGGAAATTGTTTTGATGTTTTCTTTGTAAAAGGAGTAACTTGTTTATAAAAAGAGCT AATCTATCTGGTTTTCACTCCCTTATTGATTATCATCATTGAAAATGTCTTTGACTTTGATTCTTCAAGTGATAAGTTAA CACTTTCTTTCATGCTTCCCTCTTAAAAATTATATGATTTTTTAAAAATACAAGTTTCCTAGAGGTGTCCAGCCAAGAAG AGGTGTCGGCTCAAATGTCCTAACCGCAAAAAAATATTTTTTTAATCGGACACCGCAAAGAAGTGTCTGACACATGTCGG ACAGGTGTCGTACGAGTGCCGGTGTCGTGTCGGTGTCCGACACCGGGACACTCCGTATGTTATAGCCTTATAGGTGTCTG TGATTCATAGCACATACCACTTCTTATTTTATCATAATTTTCATCAATCACTTAATCAATATACTTCAAATTTAAATGAG TGTTTTAATAAATGAGCTCTTAAATTATGTGTATTATTTTAAATAACAACAATTTTGGAATAAAGGGAGTAGTTAATTTG AGTTCTGAACTTCATACTTTAATCAATACCATTTTGGAATAATGCATTAGTAGTGACAAGTCATGGCATGGTTGAGGGGA AAAGTAGATAGATTTTGATTTTCAGCATTATAGTTGAGGAAGAGGTACTGTTCTCATACATCATACAAGAAATATAAAAA AACCTGTGAAATCCGGTTTTGGTGGATTGTTCGAAGGAAGTTCCTGAAACAGGAGCAGACATCCATAAAGATTCATCGTA GAGTCTGATCTGAAAATTTGATTCTGAAAATATCACTGTATATTTTGGGGATTCAATAGCGTGCACTATTTTGCCACAGC AGCAACATATGGTCATGTACAAATAATAAAGAAAACACAAGAGTTTCGTTTCCATCTTCAGCT
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CDS sequence (LotjaGi4g1v0156400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGAGTCACAGCATCTTCCACCAGACTCTGCTTTGTCAAACGCAGACGGTTGCGGAGCACCAAAGCAAGGTGAGTTCTCG CGGAAGCACTTTATTCCCAGCGCTGAGTGTCAGCAAAGGCAAGAAGCTTGTACTCTCTACAAATCTCCGCGGGAACAGGT TGTGCTTGAGGAAACGGAGATTCGCCATGGGAAGAAACCGCAACACTGTGGCTATTCCGCGTGCTGTGTTAACCTCGAAT GCTGCTTCTGAGCTTTCAGGGAAGTTCAACCTTGATGGAAACATTGAATTACAGGTTGGTGTTAGTTCTTCAGGACCAGG AGGTGCAACACAAGTAGATATTCAAGTTTCAAATAAAAGTGGTTCTTTGATTTTACATTGGGGAGTTTTACATGAAAGTC AAGGGAAGTGGGTACTTCCTTCTCGCCACCCAGATGGAACTCAAGTTTATAAGAACAGAGCTCTTAGAACTCCTTTTGTG AAATCTGGCTCTGGATCCTTCCTTAAAATAGAAATTGATGATCCTGCTGCACAAGCCATAGAGTTCCTTATACTTGATGA ATCTCAGAATAAGTGGTTTAAAAACAATGGTGAGAACTTTCACATCAAGTTACCAGGAAAAGATGAGGGAGTTCAACAAG GCTCAGTTCCTGAAGACCTTGTACAAGTTCAAGCATATCTTAGGTGGGAGCGAAATGGTAAGCAGATGTACACTCCAGAG AAAGAGAAGGAGGAATATGAAGCAGCTCGACAAGACCTATTGAAAGAAGTAGCTAGAGGTATTTCTGTGCAAGACCTCCG CGCAAGGTTGACTAACAAAGCCAACACTGCTGAAGTAAAGCAGCCTTCGGTTTCTGGAACCAAGAACATCCCTGATGAAC TTGCACAGGTTCAAGCTTATATACGCTGGGAAAAAGCTGGGAAGCCTAACTACTCTCCGGAACAACAACTTATCGAATTT GAAGAAGCAAGAAAAGAATTGCTAGGTGAGCTTGAGAAAGGTGCTTCTCTAGATGAAATACGGAAGAAAATTGTCAAAGG GGAGGTACAAACTAAAGTTGCCAAGCAGTTGAAAACCAAAAAATACTTCCATGTTGAAAGAATACAAAGGAAAAAGAGAG ATTGGACGGAGCTTATCAACAGAAATGTTGGGGAAAATATAGTTGAACAATTTGTAGATGTTCCAAAGACAATGACAGTG ATTCAACGCTATGCCAAGGAAAAGGAAGAATATGATAAAGGTCTTATTTTGAATAGGGCAATTTACAAGCTTGCTGATAA TGATCTTCTGGTCCTCGTTACCAAAGATGCTGGTAACATTAAGGTTCACCTGGCTACAGACTCCAAATCACCTGTTACAC TTCACTGGGCCTTATCAAGATCAACACCTGGAGAGTGGTTGGTGCCACCTGCAAGTGCTCTGCCCCCTGGATCTGTTATT ATGGATAAGGCTGCTGAAACACCTTTTAATCCTGGTTCCCCGTCTCATCCTTCCTTTGAGGTCCAGTCCTTAGATATAGA GGTCGATGGCGATACTTTTAAAGGAATAACTTTTGTCACTCTGTCAGATGGAAAATGGATAAAGAACAATGGATCAGATT TTTATGTTGAATTTAGTGAGAAGAAGAAGATACAAAAGGCTTCTGGTGATGGCAAAGGTACAGCCAAGTTCTTGTTGGAT AGAATAGCTGAAATGGAAAGTGAGGCACAAAAGTCCTTTATGCATCGATTTAACATTGCATCGGAATTGATGGATCAAGC CAAAAATGCTGGTCAATTGGGTCTTGCGGGCATTTTGGTTTGGATGAGATTTATGGCTACAAGGCAGCTTATATGGAACA AAAATTATAATGTGAAGCCACGTGAGATAAGTCAAGCACAGGATAGGCTTACAGACTTGCTCCAGGATGCCTATACGAGT TATCCACAGTATAGAGAGCTTGTGAGGATGATCCTTTCTACTGTTGGTCGTGGAGGTGAAGGTGATGTGGGACAGCGGAT TCGAGATGAAATCCTTGTTATCCAGAGAAAGAATGAATGCAAGGGAGGAATGATGGAGGAATGGCACCAGAAGTTACACA ATAATACTAGTCCTGATGATGTTGTAATTTGTCAGGCACTGATTGATTATATAAATAATGACTTTGATATTGGAGTTTAC TGGAAAACATTGAATGACAATGGAATAACAAAAGAACGTCTTTTGAGCTATGACCGTGCCATCCACTCTGAACCAAATTT TAGGAGGGATCAGAAGGAAGGTCTTTTGCGAGATCTGGGAAACTACATGAGGACACTGAAGGCAGTTCATTCAGGTGCAG ATCTTGAATCTGCAATTACAAATTGTTTAGGCTACAAATCTGAGGGTCAGGGCTTCATGGTGGGGGTGCAGATAAATCCA GTGTCTGGTTTGCCATCTGGTTTTCCTCAATTAGTTCAGTTTGTGATGGAACACGTTGAAGTTAAATATGTTGAACCACT TCTTGAGGGTTTGCTAGAGGCTCGTCAGGAACTCCGACCATCACTCAATAAGTCTCAAAGTCGTCTGAAAGATCTTTTAT TTTTGGATGTTGCTCTGGATTCCACAGTTAGAACAGCAGTGGAAAGGGGATATGAAGAATTAAACAATGCAGGGCCTGAG AAAATAATGTACTTTATCTTCTTGGTTCTTGAAAATCTTGCACTTTCATCGGACAATAATGAAGATCTTATCTACTGTTT GAAGGGATGGGAAATTGCCTTAAGCATGTGCAAGAGTAAAGACACTCATTGGGCATTGTATGCAAAATCAGTCCTTGACA GAACACGCCTTGCACTCGCAACCAAGTCAGAGGAATACCATAATATTCTGCAACCATCAGCAGAATACCTTGGATCACTA CTTGGTGTGGAAACATGGGCTGTGGAAATATTTACGGAAGAAATTATCCGTGCTGGATCTGCTGCTTCTTTGTCTGCACT TCTAAATCGACTTGATCCTGTACTCCGAAAGACAGCTAATCTTGGAAGCTGGCAGGTTATTAGCCCTGTTGAAACGATTG GATATGTTGTGGTTGTGGATGAGTTGCTTTCTGTTCAAAACAAATCATATGAGAGGCCTACAATTTTGATAGCCAAGAGT GTGAGAGGAGAGGAAGAAATTCCAGATGGTGCAGTTGCTGTCCTGACACCAGATATGCCAGATGTCCTATCTCATGTTTC TGTTCGAGCAAGAAATAGCAAGGTGTGTTTTGCCACATGCTTTGACCCCAGTATCCTTGCTGACCTTGAATCAAAGAAGG GAAAGCTCTTGAGCTTGAAGCCTACATCTGCAGAAGTAGTTTATAGTGAGGTCAACGAGGGTGAGCTTATTGATGAAAAA TCAAGTCACCTGAACGAAGTTGGTTCTGTGCCATCCATATCTTTGGTCAAAAAGCAGTTTAGTGGAAGATATGCTGTCTC ATCTGAAGAATTCACTGGGGAAATGGTTGGTGCTAAATCTCGTAATATCTCTTATTTAAAAGGAAAAGTACCTTCTTGGA TTGGAATTCCTACCTCAGTTGCCCTACCATTTGGAGTTTTTGAGCATGTCCTTTCTGACAAATCAAATCAGGTAGTGGCT GAGAAGGTTAATGTTTTGAAACGGAAGTTAACTGAGGGAGACTTCAGTGCCCTCAAGGATATTCGTGAAACAGTTTTACA GTTGAATGCGCCACCCCAGCTGGTAGAGGAGTTGAAAACTAAGATGAAGAGTTCTGGAATGCCTTGGCCGGGTGATGAAG GCGAACAACGCTGGGAACAAGCATGGAAAGCTATAAAAAAGGTATGGGGCTCAAAGTGGAATGAAAGAGCATACTTCAGC ACGAGAAAAGTTAAGCTTGATCATGATTATCTTTCCATGGCTGTCCTTGTGCAAGAAGTGGTAAATGCTGACTATGCTTT TGTAATCCACACAACTAATCCATCTTCCGGAGACTCCTCAGAAATATATACGGAGGTGGTAAAGGGACTTGGAGAAACAC TAGTTGGAGCTTATCCTGGTCGTGCTTTGAGTTTTATCTGCAAAAAACATGATTTGGACTCCCCTCAGGTCTTGGGTTAT CCTAGCAAACCTATCGGTCTGTATATTAGAAGGTCAATTATTTTTCGGTCGGATTCCAACGGTGAAGATCTAGAAGGTTA TGCTGGTGCTGGCCTCTATGACAGTGTGCCTATGGATGAAGAGGAGAAAGTTGTACTTGATTACTCATCAGATCCGCTGA TTGTTGATGGTAGTTTTCGCAAGTCAATCTTGTCAAGCATTGCCCGAGCAGGAAATGCAATTGAAGAGTTGTATGGCTCT CCTCAGGACATTGAAGGTGTCATCAGGGATGGAAAAGTCTATGTTGTGCAGACCAGACCACAAATGTAG
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Protein sequence (LotjaGi4g1v0156400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MSHSIFHQTLLCQTQTVAEHQSKVSSRGSTLFPALSVSKGKKLVLSTNLRGNRLCLRKRRFAMGRNRNTVAIPRAVLTSN AASELSGKFNLDGNIELQVGVSSSGPGGATQVDIQVSNKSGSLILHWGVLHESQGKWVLPSRHPDGTQVYKNRALRTPFV KSGSGSFLKIEIDDPAAQAIEFLILDESQNKWFKNNGENFHIKLPGKDEGVQQGSVPEDLVQVQAYLRWERNGKQMYTPE KEKEEYEAARQDLLKEVARGISVQDLRARLTNKANTAEVKQPSVSGTKNIPDELAQVQAYIRWEKAGKPNYSPEQQLIEF EEARKELLGELEKGASLDEIRKKIVKGEVQTKVAKQLKTKKYFHVERIQRKKRDWTELINRNVGENIVEQFVDVPKTMTV IQRYAKEKEEYDKGLILNRAIYKLADNDLLVLVTKDAGNIKVHLATDSKSPVTLHWALSRSTPGEWLVPPASALPPGSVI MDKAAETPFNPGSPSHPSFEVQSLDIEVDGDTFKGITFVTLSDGKWIKNNGSDFYVEFSEKKKIQKASGDGKGTAKFLLD RIAEMESEAQKSFMHRFNIASELMDQAKNAGQLGLAGILVWMRFMATRQLIWNKNYNVKPREISQAQDRLTDLLQDAYTS YPQYRELVRMILSTVGRGGEGDVGQRIRDEILVIQRKNECKGGMMEEWHQKLHNNTSPDDVVICQALIDYINNDFDIGVY WKTLNDNGITKERLLSYDRAIHSEPNFRRDQKEGLLRDLGNYMRTLKAVHSGADLESAITNCLGYKSEGQGFMVGVQINP VSGLPSGFPQLVQFVMEHVEVKYVEPLLEGLLEARQELRPSLNKSQSRLKDLLFLDVALDSTVRTAVERGYEELNNAGPE KIMYFIFLVLENLALSSDNNEDLIYCLKGWEIALSMCKSKDTHWALYAKSVLDRTRLALATKSEEYHNILQPSAEYLGSL LGVETWAVEIFTEEIIRAGSAASLSALLNRLDPVLRKTANLGSWQVISPVETIGYVVVVDELLSVQNKSYERPTILIAKS VRGEEEIPDGAVAVLTPDMPDVLSHVSVRARNSKVCFATCFDPSILADLESKKGKLLSLKPTSAEVVYSEVNEGELIDEK SSHLNEVGSVPSISLVKKQFSGRYAVSSEEFTGEMVGAKSRNISYLKGKVPSWIGIPTSVALPFGVFEHVLSDKSNQVVA EKVNVLKRKLTEGDFSALKDIRETVLQLNAPPQLVEELKTKMKSSGMPWPGDEGEQRWEQAWKAIKKVWGSKWNERAYFS TRKVKLDHDYLSMAVLVQEVVNADYAFVIHTTNPSSGDSSEIYTEVVKGLGETLVGAYPGRALSFICKKHDLDSPQVLGY PSKPIGLYIRRSIIFRSDSNGEDLEGYAGAGLYDSVPMDEEEKVVLDYSSDPLIVDGSFRKSILSSIARAGNAIEELYGS PQDIEGVIRDGKVYVVQTRPQM
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Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER
PTHR46999
80 271 192 0.0 –
PANTHER
PTHR46999
270 1462 1193 0.0 –
SUPERFAMILY
SSF56059
1154 1461 308 5.65E-40 –
Gene3D
G3DSA:3.30.1490.20
1253 1300 48 9.5E-6
IPR013815
Pfam
PF01326
1259 1461 203 2.3E-19
IPR002192
Coils
Coil
1462 1462 1 - –

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
GO:0005524
Molecular function ATP binding Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator.
Subterm of
GO:0016301
Molecular function Kinase activity Catalysis of the transfer of a phosphate group, usually from ATP, to a substrate molecule.
Subterm of
GO:0016310
Biological process Phosphorylation The process of introducing a phosphate group into a molecule, usually with the formation of a phosphoric ester, a phosphoric anhydride or a phosphoric amide.
Subterm of

Genome browser

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi4g1v0156400.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…