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LotjaGi4g1v0156400.2

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi4g1v0156400
Transcript ID LotjaGi4g1v0156400.2
Related isoforms 1
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Alpha-glucan water dikinase; TAIR: AT1G10760.1 Pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate binding domain-containing protein; Swiss-Prot: sp|Q8LPT9|GWD1_CITRE Alpha-glucan water dikinase, chloroplastic; TrEMBL-Plants: tr|A0A151RQ57|A0A151RQ57_CAJCA Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi4g1v0156400
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr4:27197135..27226565) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

ATGAGTCACAGCATCTTCCACCAGACTCTGCTTTGTCAAACGCAGACGGTTGCGGAGCACCAAAGCAAGGTGAGTTCTCG CGGAAGCACTTTATTCCCAGCGCTGAGTGTCAGCAAAGGCAAGAAGCTTGTACTCTCTACAAATCTCCGCGGGAACAGGT TGTGCTTGAGGAAACGGAGATTCGCCATGGGAAGAAACCGCAACACTGTGGCTATTCCGCGTGCTGTGTTAACCTCGAAT GCTGCTTCTGAGGTGTGTGCCTGTGAAATATTTTGATTGTGATTGCATCATTACTATTCTTTTTTTGATTGGATTCTGTT TGTTCTTAATTTCAGTCTAATGATTGATCAAATGTTAATAAAATTATTAGTATTATAATTTCTTAATTATTTGTTAGAAA GCTCAGTGTTTAGTATTGAAAACTTCAAGTTTTTGAAAAAGTACTTGCTTTATTAAATACTTACTATTTTTGGAATCCAA TCAAGTTGTTGGGTTTCTTGGAATGGAATCTTTCCTTTTTTTCTCTTTTTTTTGAGCTAACTTTGAATGAGCACTTTGCA ACAATGTCATAAGAAACAGTGGAATTTTTTTTTTTTTTTAAATTTTTAATTTTTTATATCTCCTAAAATTGGAATGTAAA TGATGAAGCATTTTCAATTGTTTGATCTTGGCAATGTTTCAAGCTTGACATTTGACATTTAAAGGTAACAATGGTTGAAT TTTAAAAATAACAATACCCCAGTTGAGGCATTTACTATACTTATTGAGACAGTTGCTTGTAAGTCTAGCAGTTAATTTGG ACACATGTTAACTTGTGACGATGGTTTTTTCAATGGCTTCTCAAATCACAACTTAAGATAAGATACATAGATACATGTGT GTGTACTAAGCATGGAGAATTTCATTCGATGATTATCGAAGTGTTTCTTTTTTTTTTTGTTTTGTTTTTCTAACTTGGAA 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GCTCTCAGTTATATTTCTCTCAATTCATTACTGTTATTTCCATTGTCCATTGATCTGGGTCCTAACAGTATTCCTGGCAA CTATAAAGAGTGGGCCAACGTTGACAGCAGCTGAAGCCCTAAAATTAGATAGCCCCGGTGATGATGTATAGTGGGGTCAG TGCTAACTAATAGCGGCTGAAACCCAAAAGACAAACAAAAACAACTTAACAAAGGTTGATCGAGTTGCTTTTCGGGGGAA AGAATGACATTATTATAACTTAATTTCAAACTTTTGGGGACTCAATTACGGAGGATGATACCTATCTGATACCATCCTAA AACTAGAAGTAGTCTGGATAATGAATTTATATTAACATGATCAAAAGTACGATATCGATACACAAATTTTCCTAGTTCTA GTCAAACTAAATACTAACAAACTATGATGAAAAGGTAACTAGGAAAAAATATAGAATAAAATCTAATCACAACAAAATTA TTCATAACTAAATCATCTCACCAAACTAAATTCTAAAAGATATCTCAACGAGAGCAAAAGTGGGAGATGATAAAGAGTGA AATAGTGATGGATCATGGACGAACAGAGGAAGGCATGGTATGTTTGATAAATATCTGATTTTCTTTCTTTTTCTATTCCT GGTTCTGAACTTATTTGTACGCCTAGCTTCAGTGAAGTGCTACATGAGTTTAAGAGAGATGTTTTTTCGTAGTAAAATTT GCAAATCCATGTTGTTATTTTCTATTGTGCTTGAGTGAAGAGCTCAAATATGTTTGCTGGCATGGCTAATTGAAAAATGA CATTTCTAGTCTTTTCCTTTTTAGTGACAAAACTAGATATAAACTCGTGTGATTTGTGGATATCATGATAAATATTTTCA ATTTTCTTTTGTGAGGAAACATATTTGAATTTTAATATAATTCTACATTAAATGAAAATATATATTAGTATTCTGCAAAT 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CDS sequence (LotjaGi4g1v0156400.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGAGTCACAGCATCTTCCACCAGACTCTGCTTTGTCAAACGCAGACGGTTGCGGAGCACCAAAGCAAGGTGAGTTCTCG CGGAAGCACTTTATTCCCAGCGCTGAGTGTCAGCAAAGGCAAGAAGCTTGTACTCTCTACAAATCTCCGCGGGAACAGGT TGTGCTTGAGGAAACGGAGATTCGCCATGGGAAGAAACCGCAACACTGTGGCTATTCCGCGTGCTGTGTTAACCTCGAAT GCTGCTTCTGAGGTTGGTGTTAGTTCTTCAGGACCAGGAGGTGCAACACAAGTAGATATTCAAGTTTCAAATAAAAGTGG TTCTTTGATTTTACATTGGGGAGTTTTACATGAAAGTCAAGGGAAGTGGGTACTTCCTTCTCGCCACCCAGATGGAACTC AAGTTTATAAGAACAGAGCTCTTAGAACTCCTTTTGTGAAATCTGGCTCTGGATCCTTCCTTAAAATAGAAATTGATGAT CCTGCTGCACAAGCCATAGAGTTCCTTATACTTGATGAATCTCAGAATAAGTTTAAAAACAATGGTGAGAACTTTCACAT CAAGTTACCAGGAAAAGATGAGGGAGTTCAACAAGGCTCAGTTCCTGAAGACCTTGTACAAGTTCAAGCATATCTTAGGT GGGAGCGAAATGGTAAGCAGATGTACACTCCAGAGAAAGAGAAGGAGGAATATGAAGCAGCTCGACAAGACCTATTGAAA GAAGTAGCTAGAGGTATTTCTGTGCAAGACCTCCGCGCAAGGTTGACTAACAAAGCCAACACTGCTGAAGTAAAGCAGCC TTCGGTTTCTGGAACCAAGAACATCCCTGATGAACTTGCACAGGTTCAAGCTTATATACGCTGGGAAAAAGCTGGGAAGC CTAACTACTCTCCGGAACAACAACTTATCGAATTTGAAGAAGCAAGAAAAGAATTGCTAGGTGAGCTTGAGAAAGGTGCT TCTCTAGATGAAATACGGAAGAAAATTGTCAAAGGGGAGGTACAAACTAAAGTTGCCAAGCAGTTGAAAACCAAAAAATA CTTCCATGTTGAAAGAATACAAAGGAAAAAGAGAGATTGGACGGAGCTTATCAACAGAAATGTTGGGGAAAATATAGTTG AACAATTTGTAGATGTTCCAAAGACAATGACAGTGATTCAACGCTATGCCAAGGAAAAGGAAGAATATGATAAAGGTCTT ATTTTGAATAGGGCAATTTACAAGCTTGCTGATAATGATCTTCTGGTCCTCGTTACCAAAGATGCTGGTAACATTAAGGT TCACCTGGCTACAGACTCCAAATCACCTGTTACACTTCACTGGGCCTTATCAAGATCAACACCTGGAGAGTGGTTGGTGC CACCTGCAAGTGCTCTGCCCCCTGGATCTGTTATTATGGATAAGGCTGCTGAAACACCTTTTAATCCTGGTTCCCCGTCT CATCCTTCCTTTGAGGTCCAGTCCTTAGATATAGAGGTCGATGGCGATACTTTTAAAGGAATAACTTTTGTCACTCTGTC AGATGGAAAATGGATAAAGAACAATGGATCAGATTTTTATGTTGAATTTAGTGAGAAGAAGAAGATACAAAAGGCTTCTG GTGATGGCAAAGGTACAGCCAAGTTCTTGTTGGATAGAATAGCTGAAATGGAAAGTGAGGCACAAAAGTCCTTTATGCAT CGATTTAACATTGCATCGGAATTGATGGATCAAGCCAAAAATGCTGGTCAATTGGGTCTTGCGGGCATTTTGGTTTGGAT GAGATTTATGGCTACAAGGCAGCTTATATGGAACAAAAATTATAATGTGAAGCCACGTGAGATAAGTCAAGCACAGGATA GGCTTACAGACTTGCTCCAGGATGCCTATACGAGTTATCCACAGTATAGAGAGCTTGTGAGGATGATCCTTTCTACTGTT GGTCGTGGAGGTGAAGGTGATGTGGGACAGCGGATTCGAGATGAAATCCTTGTTATCCAGAGAAAGAATGAATGCAAGGG AGGAATGATGGAGGAATGGCACCAGAAGTTACACAATAATACTAGTCCTGATGATGTTGTAATTTGTCAGGCACTGATTG ATTATATAAATAATGACTTTGATATTGGAGTTTACTGGAAAACATTGAATGACAATGGAATAACAAAAGAACGTCTTTTG AGCTATGACCGTGCCATCCACTCTGAACCAAATTTTAGGAGGGATCAGAAGGAAGGTCTTTTGCGAGATCTGGGAAACTA CATGAGGACACTGAAGGCAGTTCATTCAGGTGCAGATCTTGAATCTGCAATTACAAATTGTTTAGGCTACAAATCTGAGG GTCAGGGCTTCATGGTGGGGGTGCAGATAAATCCAGTGTCTGGTTTGCCATCTGGTTTTCCTCAATTAGTTCAGTTTGTG ATGGAACACGTTGAAGTTAAATATGTTGAACCACTTCTTGAGGGTTTGCTAGAGGCTCGTCAGGAACTCCGACCATCACT CAATAAGTCTCAAAGTCGTCTGAAAGATCTTTTATTTTTGGATGTTGCTCTGGATTCCACAGTTAGAACAGCAGTGGAAA GGGGATATGAAGAATTAAACAATGCAGGGCCTGAGAAAATAATGTACTTTATCTTCTTGGTTCTTGAAAATCTTGCACTT TCATCGGACAATAATGAAGATCTTATCTACTGTTTGAAGGGATGGGAAATTGCCTTAAGCATGTGCAAGAGTAAAGACAC TCATTGGGCATTGTATGCAAAATCAGTCCTTGACAGAACACGCCTTGCACTCGCAACCAAGTCAGAGGAATACCATAATA TTCTGCAACCATCAGCAGAATACCTTGGATCACTACTTGGTGTGGAAACATGGGCTGTGGAAATATTTACGGAAGAAATT ATCCGTGCTGGATCTGCTGCTTCTTTGTCTGCACTTCTAAATCGACTTGATCCTGTACTCCGAAAGACAGCTAATCTTGG AAGCTGGCAGGTTATTAGCCCTGTTGAAACGATTGGATATGTTGTGGTTGTGGATGAGTTGCTTTCTGTTCAAAACAAAT CATATGAGAGGCCTACAATTTTGATAGCCAAGAGTGTGAGAGGAGAGGAAGAAATTCCAGATGGTGCAGTTGCTGTCCTG ACACCAGATATGCCAGATGTCCTATCTCATGTTTCTGTTCGAGCAAGAAATAGCAAGGTGTGTTTTGCCACATGCTTTGA CCCCAGTATCCTTGCTGACCTTGAATCAAAGAAGGGAAAGCTCTTGAGCTTGAAGCCTACATCTGCAGAAGTAGTTTATA GTGAGGTCAACGAGGGTGAGCTTATTGATGAAAAATCAAGTCACCTGAACGAAGTTGGTTCTGTGCCATCCATATCTTTG GTCAAAAAGCAGTTTAGTGGAAGATATGCTGTCTCATCTGAAGAATTCACTGGGGAAATGGTTGGTGCTAAATCTCGTAA TATCTCTTATTTAAAAGGAAAAGTACCTTCTTGGATTGGAATTCCTACCTCAGTTGCCCTACCATTTGGAGTTTTTGAGC ATGTCCTTTCTGACAAATCAAATCAGGTAGTGGCTGAGAAGGTTAATGTTTTGAAACGGAAGTTAACTGAGGGAGACTTC AGTGCCCTCAAGGATATTCGTGAAACAGTTTTACAGTTGAATGCGCCACCCCAGCTGGTAGAGGAGTTGAAAACTAAGAT GAAGAGTTCTGGAATGCCTTGGCCGGGTGATGAAGGCGAACAACGCTGGGAACAAGCATGGAAAGCTATAAAAAAGGTAT GGGGCTCAAAGTGGAATGAAAGAGCATACTTCAGCACGAGAAAAGTTAAGCTTGATCATGATTATCTTTCCATGGCTGTC CTTGTGCAAGAAGTGGTAAATGCTGACTATGCTTTTGTAATCCACACAACTAATCCATCTTCCGGAGACTCCTCAGAAAT ATATACGGAGGTGGTAAAGGGACTTGGAGAAACACTAGTTGGAGCTTATCCTGGTCGTGCTTTGAGTTTTATCTGCAAAA AACATGATTTGGACTCCCCTCAGGTCTTGGGTTATCCTAGCAAACCTATCGGTCTGTATATTAGAAGGTCAATTATTTTT CGGTCGGATTCCAACGGTGAAGATCTAGAAGGTTATGCTGGTGCTGGCCTCTATGACAGTGTGCCTATGGATGAAGAGGA GAAAGTTGTACTTGATTACTCATCAGATCCGCTGATTGTTGATGGTAGTTTTCGCAAGTCAATCTTGTCAAGCATTGCCC GAGCAGGAAATGCAATTGAAGAGTTGTATGGCTCTCCTCAGGACATTGAAGGTGTCATCAGGGATGGAAAAGTCTATGTT GTGCAGACCAGACCACAAATGTAG 

Protein sequence (LotjaGi4g1v0156400.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MSHSIFHQTLLCQTQTVAEHQSKVSSRGSTLFPALSVSKGKKLVLSTNLRGNRLCLRKRRFAMGRNRNTVAIPRAVLTSN AASEVGVSSSGPGGATQVDIQVSNKSGSLILHWGVLHESQGKWVLPSRHPDGTQVYKNRALRTPFVKSGSGSFLKIEIDD PAAQAIEFLILDESQNKFKNNGENFHIKLPGKDEGVQQGSVPEDLVQVQAYLRWERNGKQMYTPEKEKEEYEAARQDLLK EVARGISVQDLRARLTNKANTAEVKQPSVSGTKNIPDELAQVQAYIRWEKAGKPNYSPEQQLIEFEEARKELLGELEKGA SLDEIRKKIVKGEVQTKVAKQLKTKKYFHVERIQRKKRDWTELINRNVGENIVEQFVDVPKTMTVIQRYAKEKEEYDKGL ILNRAIYKLADNDLLVLVTKDAGNIKVHLATDSKSPVTLHWALSRSTPGEWLVPPASALPPGSVIMDKAAETPFNPGSPS HPSFEVQSLDIEVDGDTFKGITFVTLSDGKWIKNNGSDFYVEFSEKKKIQKASGDGKGTAKFLLDRIAEMESEAQKSFMH RFNIASELMDQAKNAGQLGLAGILVWMRFMATRQLIWNKNYNVKPREISQAQDRLTDLLQDAYTSYPQYRELVRMILSTV GRGGEGDVGQRIRDEILVIQRKNECKGGMMEEWHQKLHNNTSPDDVVICQALIDYINNDFDIGVYWKTLNDNGITKERLL SYDRAIHSEPNFRRDQKEGLLRDLGNYMRTLKAVHSGADLESAITNCLGYKSEGQGFMVGVQINPVSGLPSGFPQLVQFV MEHVEVKYVEPLLEGLLEARQELRPSLNKSQSRLKDLLFLDVALDSTVRTAVERGYEELNNAGPEKIMYFIFLVLENLAL SSDNNEDLIYCLKGWEIALSMCKSKDTHWALYAKSVLDRTRLALATKSEEYHNILQPSAEYLGSLLGVETWAVEIFTEEI IRAGSAASLSALLNRLDPVLRKTANLGSWQVISPVETIGYVVVVDELLSVQNKSYERPTILIAKSVRGEEEIPDGAVAVL TPDMPDVLSHVSVRARNSKVCFATCFDPSILADLESKKGKLLSLKPTSAEVVYSEVNEGELIDEKSSHLNEVGSVPSISL VKKQFSGRYAVSSEEFTGEMVGAKSRNISYLKGKVPSWIGIPTSVALPFGVFEHVLSDKSNQVVAEKVNVLKRKLTEGDF SALKDIRETVLQLNAPPQLVEELKTKMKSSGMPWPGDEGEQRWEQAWKAIKKVWGSKWNERAYFSTRKVKLDHDYLSMAV LVQEVVNADYAFVIHTTNPSSGDSSEIYTEVVKGLGETLVGAYPGRALSFICKKHDLDSPQVLGYPSKPIGLYIRRSIIF RSDSNGEDLEGYAGAGLYDSVPMDEEEKVVLDYSSDPLIVDGSFRKSILSSIARAGNAIEELYGSPQDIEGVIRDGKVYV VQTRPQM 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 74 257 184 0.0
PANTHER 254 1447 1194 0.0
SUPERFAMILY 1139 1446 308 5.65E-40
Gene3D 1238 1285 48 9.4E-6
Pfam 1244 1446 203 2.3E-19

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function ATP binding Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator.
Molecular function Kinase activity Catalysis of the transfer of a phosphate group, usually from ATP, to a substrate molecule.
Biological process Phosphorylation The process of introducing a phosphate group into a molecule, usually with the formation of a phosphoric ester, a phosphoric anhydride or a phosphoric amide.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi4g1v0156400.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…