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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi4g1v0182200 |
| Transcript ID | LotjaGi4g1v0182200.2 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Armadillo/beta-catenin-like repeat protein; TAIR: AT1G14300.1 ARM repeat superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q76NW7|HGH1_DICDI Protein HGH1 homolog; TrEMBL-Plants: tr|I3STU3|I3STU3_LOTJA Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi4g1v0182200 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr4:38542120..38554339) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATGGCGACGGAGCTGGAAGAACTCGTGAGCTTTCTAACTTGTCCATCGCCGCAGATCACAAAGGCTGCCGTTGACATAGT TCGAGGATTAACTGGTTCTGATGACGGCTTGCACTCTCTCGCCAATCACGCTAACACCCTTATACCTGCCTTGTCTCGCC TCTTAACTGCACTCAAGGTCAACTTTTTGCTTCTTCTACGTATCTTAGGGTTTTCAACATGGAACGTCAAATTATTCCAC TAATATTTGCCACTTTGACTGTAATTTTAATTGTTTGGGGGCTAGTTTGACTGACACTATATCTACATAGATTAATTGAT TTGATTATTTACTCCCTATGGAATTGAAGAGAGACAAGCTGATTATGATGTGATACTTTGTTCAGGAGGTTTCAGAGGCT GCTGCTGAAGCCCTTGTAAACCTCTCACAAAATTTGAATCTAGCGGCGGAGATGGTTCAGATGAGATTGATTGACACAGC TATGGATGTTTTGTACAAGCCGGACTGTAGCGTTACTCCCTTGCTTGTCATGCTTCTAGTGAATCTCACTCAACTTGATG CTGGTATTGCTTCCTTGCTTCAGGTGGGCTTTCATTTATTCATTTGTAAACAATTTGGCATTTATGTTATGAGAAGTACA TGTAATGATCATGTCATGATGTCACAAGCAGCAAAAAGGGTGTAATACTGATAGGGAACGACCCATTAGATTCTCGACAA CAAGTGGCAGTGCGCATGAACAATGACAGCAGTTAGATAGCAGTTAGGAAGTTATTATTTAATTGTTATAAGTTGGGTAG TTTTAGCAGTTAGTAACTGTTATAGTTTGAATTTAAATTAGACAGCAGCAGTTATTAGATAGCAGTAGTTATATATTAGG GGTTGGGTTGAACTGAAGGATGTTCAGAAGTTGTGTTTTAAGGTGAGGGACTGGACTCTCTAATTCCAGTATTATTAGGA 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CAAAACTTCACCTTGTCCTCAAGACGAATGGAAAATGGTTACCGATTCTACAGTGACTGTGACCCTACTACCCAGCTCAT AGGTTTTGGAGAGTGGACACCCCTTACAGCTGGTAATCCTTTGCTGTTCATAGCTTTACCCTCCCCTCCCCCTCTTCTTC CACCCACGTTTCATCAATCCAGCCAAGGGTTCCAGTGTTCCACCCTATTTAATTTTAATTCAACCCTAATTTCCTCTTTC AGTCCATTCTGAAATATACTTCTTACCTATTCAGGGTTTGTAATACAATTCAAATTATTCCGTGTTACTTGTAGAAGACG TCTGCTTCAACCCTAAGACCAGTGTTATCAGACTCGGACCGGTCATTGACTCGGTCAGGGCACTGAGTCAATATGTCATT GGTTCAACCACTGGGTCACTGGTTGAACCGTTTGACTCGGTCTTTATTAAAAAATATAAAAAACTAACACTAATTAGCCA TTCACATTCTAAATTTAAAATTATTACCATCATATAAGAATTATATAAACTAAAAATAATTTACATAATAAAACCTTGCA ATTTATTACGGTCATATTACTACCTAAAGTAATAATATATAAAAATATTATGCACGTTGGGACCTTATTGCTACAAATCA GAAAAGATTTCTTTTGTCCACTAATTTAGCAAAAGGGAGTAAGGGACTGTATAGTACTCTAGCTAATTGTTGGTTTTATA TTAGGCCCATTCAAACTCTTAAATAATATGATCATGTTTTTGGGCCCAGTAAATCTAAAGTCTAATAGAAGGTTGCACTT TAGCTAGAGCCCAAGGAAACAAAACCCTAATTTCTAATATCATATATGTAACTAAAGAAAAGAAACAGTGGACAGCAGCC ACACAAATACGCAGCAGCAACAGAATACAATGAAGGTGCGGGAGCAAAGCGATGTGGGTGAAGAGAAGTTAAAATCAAGA AAGAGACAACCTCGTGACGGCCGGAAATTGATAACCCAGGGACAAGCACGGTGAGGACGGCCCCTAGCTCCATGACACAG CATTGTTGCAGATCTGTTAAAAGAGAATGGATACTAGAATGCCGTTTTTTTTTCTACTCTCCGGTTCAGTAAAAAACCGA CCGAGTCACCGGTTTTGAGGTAAACCGACCGAGTCATACCGGTTCTTACCGGTTCAATTGCATGGCCGATCCGATCCTCG ACTCAAACCGCTCAGGTGACCGATTCCCGGTCGGACCGGTTCAACCGGCCGGTCCGAGCCGAGTTTTATAACACTGCCTA AGACTAGCTCATAAGAATCTTGCATCATCGAAGGCTGAAATTTCACCATCATGGCCAACTTGAGAGCTGTCCAATTGTAT TGCAGAAATCAAAGCTGTCTAGAGTTTTTGATATACTTGGTTTCAAAATATTTCCTGTATCATTGTTATTGAGTTGAGCT TAGATTAGGAGACAACTTAAGGAAGCATTATGCTATAGGAATCTTAGGTGCCAAAAAAATTAAAGTAGATCTTTGAAAGA AACTGTATGGATTCAAGTAGGAGATCTGGTAAATGGAATGTGTACAGAACGAAGAATTGAACAAAAAGCAACCAAGGAGG CAAATAAGAGAGTGCCTCTATCTCCTAAGCCCAACGTAAATAACTGCCTACCCTCCCTTTCCCGCATTCCCTTTTTTATT CCTCCTAAACTCTCTCCAGCTCTACCCACATGGATCCCACACCACTGCCACCTCAGCACGTGGTTAATCTTCCTACAAGG ACTGATCTAGTGCATCGTACCTCTTCCACATGCTTTCGTAGAATCTCGCAATATCGCACCCTTTGCATCTTCCACAGGAG TCATGCTAGCATCTACCTTCTCGCCAGCTCTGCCACCATGGTACGTCGGTTTGGATGGGCGGTTTGGATGGTGGTCGCTC 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TACAGAATAAACTGATTATAATAAACTGACCAAAGTATTAATTATAATAAACTGATTTTGACGTTCTTTAGTTTGGAACT TTAATTAATCATTGTTTCATCAATGATAAATACAACTTGTGATAAGTGCAGAAAGAAATTGGAAATTTATTGAAATAGAA ACAAGATAGTTTTCTCTAAGTACTGACATTCAAATCTTGGATGTTCGAGAGCCAGTTCTCTCCCAACCAATTTACTTCAG AATTTCCTGATAATTAATCAATCTGACTGATCCTATTTGTGACTACCACATTCAGTTTTCTAAAACACAATTGACAAGTT AAATAACCATAAATAACTGACATAATCATAAAATAACACTCAAATAATTGACTCAACATAACTAACTCAGCGAGCTCAAC TATTCCCTGCTGCACCCCTACACTTCGTGCGGGGATAGACCTTTACATTTGGTATTGCTTCCTATCAACTTGATTGAGAT GCTTCCGGTAAATCATGTACTGCATTGTAGCAATGGTATTGTGGTGGACCACCGTGTACCTCTACCTGCCTTTTTTATGC ATCATGTTGCATTTTGGTGTTGCCGCTATAGCAGCTGAACAATACCAGAGTCATATTCTTTTAGGTCGTGGATCAGGATT TTTTCATGTGAAAACTCATGTTGAAATTTTGTGTATCTCCCTCATATTATTAAATAGGTGGGATTCTTTAAGTAGTTATG AAGAGTATTAGAATTAGGGAGGTTAAACTCAACTCAAAAAGCTAGCTCAAGAGTTGAGGATTGCTCTACCATTTATAAAC ACTTGTTTGGCCATATCTCTAGCTATTGTGAGACTTCAAACACACCCTGTCACGCCCAGGGCTAGACATTTGGAGAGTGG AATAAATATCAACGGGTGACTCAAATATGGGAGGTCCCCACAAACAAACAGATCTATGATAGGTTCTGATACCATATTAG AATTAGGGAGGTCTAACTCAACCCAAAAACTAGCTCAAGAGTTGAGGAATGGTCTACTGTTTATAAACACTTGTTTGTCT GTATCTTTAGCCAATGTAGGACTTCTAACAAAGAGAGACACACAACGTTGCACACTTGCACTTGACTTTATTATGTGATA TGAGAGGATCATAATCTTAGAAAATCCTTTGACATGCCTCATGCCGGTGTCATTCCGGCTAAATGGCAATGTTTTCCCGC CAAGTCTTTTATTTTTCGGGCCAGGCCCAGCCACCCCTGCACACATCTACTCTATTCTTCAAGTTCTCTGCTCTACTCCG TTCTTTCTTCTTCAGGTTGCCTTTCATCTATTTTATAACTTTCGCTCTGTTGCCCTTTCAATTTTTGTTTTTCTAGACTA TCTTGACCTTTGTCTTTTTTTGTGATGACTTCTTATTTGTCTCAAACTTATGTTTAGCCTATCATATGTTAAATTTCTTT CCATCATCACTGATTATGAATTTTGATTATAAGAGCTCATTTGATATTTTGTATAGTATAAAGCCTAATTGTATTAGGCC TGATAAAATTTTAATATTATACATCGTTTGGTCATACACTGCATAATTTGATAGCGATAGTGATGGTGGTGGTATTGGAA GGTGATGATGGTAGTGGTGGATAGTGGCGGCAACGATGACGGTATCAACGATGGTGGCAGAGGTGGAGTGTGGTGGTGGT GGTGGTTAATTAAATAATCCATCATTTTAATGTATAAGAGGGGATTGATGTATAAGCTTATACAATACAATGTGAGCACA AACAATGGACAAGTTCATAATGTATTGTATAAGTTTATACTATCATGTCTAATACATCATACCAAACGAGCCCTAAATAT ATATTTAATGAGTATTTTTTGCTTTTGAGTATTTATGTATGTAATACTTCCCTGTCATTTTATAGGAACCAACTAACTAT ATCACGTCCATTAAAAATGTAGTAATTTTTATTACTAGCATTGAATTTAACTTCAAATTATATTAGTTTCACGAAAATGC TCTAAACACTTCTAGTTCTCGGTAACTAGATAATTGAGACAGAAAGTATTACATTAATGTACTACATTTACTAATTGAGA GTAAGAAAATGTTTAATAGATAATTATGAGTATTTTTTCAAAAAATAATAAATGCTGTAGAGAAGCTAAGATGATTCTTA TGCTTCAATTTGGTTCTTATAAAAAAGACCGGAGATAGTATATCAATTATTTAACATATATAAATTTTGATTGAAGCCAT CATCCTGCACTCCACAATCCTGCTAAGGATTGATTACTATGATTGATGCACTATATAAATGCCTTGAGTTGTTATTGTTT TGCAGGAGGCAGGTCGAAGAGCATTTTGGTCTGTAAATGGACCTAAAATAGTACAAATCGGTTATGAAGATGAAGAAGAT CCAAAAGTCATGGAAGCATATGAACAACTGGGATCCTTGGTAAACACTAGATGTTTTATCAGTTGTTTTCTTGATCATCC TCCTCATCTTTTCCTTGTAAACTTATAATGTTATGTATCTGCATATTACTGTTTGAATCTAATATTGGCTGTCTCTACTT GTTGATCAGTTGATTCACAGTAGCAATACAGAGGAACCATCCAGTGAGACCTCAAAGTAG
CDS sequence (LotjaGi4g1v0182200.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCGACGGAGCTGGAAGAACTCGTGAGCTTTCTAACTTGTCCATCGCCGCAGATCACAAAGGCTGCCGTTGACATAGT TCGAGGATTAACTGGTTCTGATGACGGCTTGCACTCTCTCGCCAATCACGCTAACACCCTTATACCTGCCTTGTCTCGCC TCTTAACTGCACTCAAGGAGGTTTCAGAGGCTGCTGCTGAAGCCCTTGTAAACCTCTCACAAAATTTGAATCTAGCGGCG GAGATGGTTCAGATGAGATTGATTGACACAGCTATGGATGTTTTGTACAAGCCGGACTGTAGCGTTACTCCCTTGCTTGT CATGCTTCTAGTGAATCTCACTCAACTTGATGCTGGTATTGCTTCCTTGCTTCAGATTGAAGATGACAAGGTGCGGGGGT TATATGTTATGAAGCTTGTGAGATCATTTTGTAGAACCACCCATGAGAGTGATGATGATGCTTTTGAACATGTTGGTTCA ATACTTGTTAACATCTCAAAGCAGCGGGCAGGGAGAGAGCTTCTACTTGACCCAAAGCGGGGTCTTTTAAAGCAGATAAT AAGACAGTTTGATTCTAACAGTTCGCTGAGAAAGAAAGGGATCTATAGTGACGTAGACAGATCAAAAATGCCGCTTGAAC TTGGGACTGCACTCTCCATTGAGCGTGAACCAGTGAGTGATCCAGAAATTCGTACTCAAGCATTGGAAGCCATTTACTTG ATCTCCTTGCAGGAGGCAGGTCGAAGAGCATTTTGGTCTGTAAATGGACCTAAAATAGTACAAATCGGTTATGAAGATGA AGAAGATCCAAAAGTCATGGAAGCATATGAACAACTGGGATCCTTGTTGATTCACAGTAGCAATACAGAGGAACCATCCA GTGAGACCTCAAAGTAG
Protein sequence (LotjaGi4g1v0182200.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MATELEELVSFLTCPSPQITKAAVDIVRGLTGSDDGLHSLANHANTLIPALSRLLTALKEVSEAAAEALVNLSQNLNLAA EMVQMRLIDTAMDVLYKPDCSVTPLLVMLLVNLTQLDAGIASLLQIEDDKVRGLYVMKLVRSFCRTTHESDDDAFEHVGS ILVNISKQRAGRELLLDPKRGLLKQIIRQFDSNSSLRKKGIYSDVDRSKMPLELGTALSIEREPVSDPEIRTQALEAIYL ISLQEAGRRAFWSVNGPKIVQIGYEDEEDPKVMEAYEQLGSLLIHSSNTEEPSSETSK
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 202 | 202 | 9.5E-78 | ||
| SUPERFAMILY | 2 | 290 | 289 | 6.99E-17 | ||
| Pfam | 97 | 203 | 107 | 8.1E-16 | ||
| PANTHER | 202 | 293 | 92 | 9.5E-78 | ||
| Pfam | 237 | 286 | 50 | 7.1E-8 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi4g1v0182200.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…