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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi4g1v0216300 |
| Transcript ID | LotjaGi4g1v0216300.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | gamma-irradiation and mitomycin c induced 1; TAIR: AT5G24280.2 gamma-irradiation and mitomycin c induced 1; Swiss-Prot: sp|Q94A79|DMS3_ARATH Protein DEFECTIVE IN MERISTEM SILENCING 3; TrEMBL-Plants: tr|G7I3I1|G7I3I1_MEDTR Gamma-irradiation and mitomycin C induced protein, putative; Found in the gene: LotjaGi4g1v0216300 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr4:50878064..50907122) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GTTTTATTTTCCCTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTCTCTCACTCACTCTTCCTTCTCTCTTCCCAATTTTAGCAAATTCTCC CTCACAAACCCTCGTTTCACCTCCGCCATATGTATTGGAAACAGACATGGATGGCAATGCAAAGAGGAAACTGGTGCTGA GGAAGGACGATGATGATACTGGAAAGGCATATAGGTTCAAAATCTTGTTACCTAACGGGACTAGTGTGGAACTCACATTG CGGGATCCTCAACCTCAAATGCCGTTGCCGGATTTTTTACAATTGGTGGAAGATGCTTACAATGGAGCTCGAGAGCACAA TCAATCAATGAAAAGGAAAAAGGACATTAACTGGATTGGTGCTCCTCTGTTTCTGCACGATTCCACTGACGCTAAGATTA AGAACGTTATTGATTTCCACAACTATAAGCCTCACAAATGTCACATTTTACAGCTTCATGTTAGTTATTTCTTTAATTTT GAGTTAGGTTTTTTTCCTCTGCTCAGTTTTTTATACTCTTGTTTCTTCTGAATCAGGATGGGAGAACTGAAATTGCCAAA TCTTTTGAGGTTAGGATTTCCTATCGTAGTTTCTTTGTCCTTGCTACTAGCCTACTATTCTTTTGTTTTTTAGGGATATT TTGATTCTGTTTGAAATGCAATGCAGAATATGTGGGATTTGACGCCAGATATTGATCTGCTTCTGGAGCTTCCTGAGGAA TATTCTTTCCAAACAGCCCTTGCAGACTTGATTGTGAGAACATTAACAAAACAGAACAGAGACTATAATCTCATAATTAT AAATATTTTTCTCATTCAGACACTAAAACTGCTGATCATTTACAGGATAATTCCTTGCAAGCTGTGTGGTCTAATGGGGG AAATAGTAGAAAGCTAATTAGGTATGACCGTTCAGTTCAGTTCGTTTAGGATCTCAACTTTCCTTTTAGTATTAAAAGTA 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Protein sequence (LotjaGi4g1v0216300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
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Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
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|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 27 | 718 | 692 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 27 | 718 | 692 | 0.0 | – | |
| Gene3D | 133 | 306 | 174 | 2.3E-6 | ||
| Pfam | 141 | 263 | 123 | 1.1E-10 | – | |
| SUPERFAMILY | 142 | 257 | 116 | 1.96E-7 | ||
| CDD | 146 | 258 | 113 | 0.00121835 | – | |
| PANTHER | 769 | 1498 | 730 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 769 | 1498 | 730 | 0.0 | – | |
| Coils | 1165 | 1185 | 21 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi4g1v0216300.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
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