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LotjaGi4g1v0234000.7

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi4g1v0234000
Transcript ID LotjaGi4g1v0234000.7
Related isoforms 6
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Pantothenate kinase, putative; TAIR: AT4G32180.1 pantothenate kinase 2; Swiss-Prot: sp|Q8L5Y9|PANK2_ARATH Pantothenate kinase 2; TrEMBL-Plants: tr|I1MTH1|I1MTH1_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi4g1v0234000
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr4:54688613..54698678) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

AGGAGGTGGTTGTTGACTTGATGAGCAACAATACGACATAGAGATTACTTGAGTCTTGAGTTGAAACTCGAAAGCAGAGG AGGGAGACCGTTACTCATGGCGCACACAGGAACAGGCACAGCCAACACTCCAATTCACAGGTCGAGTTCACGGCCACAAC TGGATCTTAGCAAAGCAGCGATTCAAGGAAATGTGGAAGACAGGGATCCCACTATTTTGTTACCTAACCAATCTCATGAT ATATCTCATTTGGCTCTTGACATTGGAGGTGCTGTATTCAGTATCCAATTTCATTGACATCACATTTATATTTATATTTC ATGTTTCTTAGTTCTTTAATTTCACTTCAATGTTATTTCAATTGGCTGGAAACTAGTTTCTTAAGATTGTTTAAATTATG TTATCAGGGTCTTTGATAAAGTTGGTGTACTTTTCAAGACATGAAGACCATTCAACTAATGATAAAAGGATGAGAAGGTT GAGAAGTTTGAAGGATAAACTGGGATTTCCCAATGGTAACAGGAGAAGCTATCCTATTCTTGGTGGGAGGCTTCATTTTG TCAAGTTTGAGACTAACAAGATCAATGAATGCTTAGATTTTATCTATTCAAAGAATCTTCACCATGGTCGTATTACTGTC TTGTTCAATTAACTTTATTTTTAGTCAGTCTTTTCTCTGCCACATTGGATAATGTTTTTTAGTTGTTTTCTTTCTATGAG ATAATTCAACTATACTTTGAGAACTAGTGAATCTAAAGTTGTGGATTTTTTTCTTTCTTATAGGTAGGGAATCATCGAAT ACCATAATTAAGGTGAGTTTGATTCTCTGACTGTTTTTTCTGTCACAATGGTGTTTCAATGCCCTAATGTGTCCACTTTG TGACATAGGCTACTGGTGGTGGAGCATTCAAATATGCTGAACTTTTTAAAGAGAAACTCGGGCTTAGCCTTGACAAAGAA 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AATTGCATATTTTTAACACACCAAATTTAGGGTTCCTGTGTAAGTGTATGTATTATATCAGTATATGCATGTTTGTATGA AAAGATGTATCCATTGTAGAATTTTTCCATAAATATCAACTGAACACTTAATTTTTGTTGTAAATGAGCTATTCATTTTA TGTTGGAAAAAAGTTCATATTAGTTCTTTAGAGTTTGTAAGTCTTTTATTTAGTAGGATTTGATAGAAAATATGCTGATT TTAAAGTTTATTCTTTTTCTGTAGAAAGATTTTCCCCAAAAAGACTTTTCATCCAACTACAACCTAAAAAAGCATGGACA AAAATCTCTAAACATGGAATATAATCTATGATCATTATTTATAGAATAATGCTTTCTGGCAATATATCAAGATTATCTTC CTTCAGTAGTTTTCATGCTCTGTTCAACTATTTGTTCCTCCAATGATTTCCTGACCAATTGTGTTGTTTCTATCTCTTCT GTGAAGATATCTTACTTGACTGCACTGCAATTTGGATTGAAGCGTATCTTTTTTGGAGGTTTTTTCACAAGGGGTCATGC CTATACCATGGATGCTATTTCTTTTGCAATACATTTCTGGTACATAATGATGACCAGAGATTTTTTTGTTTGTTTTTAAT TTAATTATTATTTTGTGTTGAGATTTATATATTTATCATTCAGGTCTAAAGGGGCTACACAAGCAATGTTCTTGCGACAT GAAGGATTTCTGGGAGCATTAGGTGCATTTATGAGCTATGAAAAGCATGGTTTAGATGACCTCATGGTGCATCAGTTAGT TGAAAGATTCCCAATGGGAGCTCCATATACAGGAGGCAAGATTCAGGGCCCACCACATAGGAATTTGAATGAGAAGGCAA GTGAGAGGAATTGGAAAACTTTGGTGTCTGCTAGTCACCGGCTTGAGATAAATGAACTAATTAAATGCACTTACTTATAT 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GCCCCTGTGCCAATGGCTCCTCCTGGAACTACTGGGCTTGGGGGTTTTGAAGTTCCTTTGTCAAAAGGAAGTGCTCTACG ACACGATGCTAGTGCTCTAAATGTTGGTGTTCTCCATCTAGTACCAACCTTAGAGGTCTTTCCTTTATTAGCAGACCCAA AAATGTATGCACGATTACTTAACACTCTGGCATTTTTTAGAGTGAAGTTATATTGGAACTCTCTTTTACTTTTAGGTTTC ATAGCATACTTTTTATAAGGTGATTTCTTGTTATCAATATTCTACTAATCTATTCTTAAAACATAAATTATGATTCTACA GATATGAGCCTAATACTATTGATCTCTCAGATCACAGCGAATTAGAGTAAGTACCATATTGTGAACTGTAAACAAATTTT AACTTCATTGTCCTTTAAGGCTTCAACTGTCTTTAGTGTGTGGCTTATGTGGCTAATGAAAATTTGTATATCTGATGTAG ATATTGGTTCAAGATTTTGTCTGATCACTTGCCAGATCTTGTGGACAAGGTAATCGTGTGTCCTAACACCCAGCCTTTCT GCATATGCTTGTATGTCTCTTCATGTATTACAAATGCAATAAAATTAGACCACAGAGACATCCTTGCATAAATATGAAAT TAAAGCATGAAAGGTAGACCTAAGTTCTGCTTATGAAAAAGTTACAATCTCTGCCAGTAACCTAGCTGATTATGAATAAG TAATAATAGCATGAAAGATAAACTCTTTTCCTGTTTGGTTTATTTTTTCTGCCTTGTTCACCTTGTTCAAAGCATAGTAT GGAGAAAAAATTGCTTGGATTCCCCCCCCCCCTAAAGTAGTATATGATTGTAAGGTTCTCAACTAAAATGTCAGGCTGTC GCAAGTGAAGGTGGGACTGATGATGCCAAAAGAAGGGGCGATGCTTTTGCTCGTGCATTTTCTGCTCACCTGGTTAGGTA 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CTCTTTTTCAGCTGATCAACTTCTACACTAATTGAATAGGTTAATGGAGGAGCCTGCTGCATACGGGAAGTTAGGCTTGG CCAACCTATTGGAAATGAGGGAAGAGTGCTTGAGAGAATTCCATTTTGTCGATGCCTACATAAGCATAAAGCAGAGGTAA TTATGTTTTATCTATATTGAGCAATATATATGAGATCTTTTACTTGGCCTATAGATGTAACTGACAGCCTTTTGAGTCAC TATGTTGCATGTGTAGATTTTTTCTTTTTTTTAGCCCTTTGGCCTCTAGATGTAACTAACAGCCTTTTGGCCTCTAGATG TTTTATCTCCATTTGAATTATTTTAATTTTAGTTCGAAAAGATTTGTTAAGGGTAATTTGTTTTTCATCTAGCCAAACCC TTATATGGTAGCCATGAAAACCTGGATAAATGTTTAAATTTTATCTAAATGAACTTGTTGAGTATTTAGTTCTTAATAGA AAAATTAGCCTTGTTTGATCCATATAGTCAATCCTAGAAAATTTTATTTGTTAATGTTGCATCATAAAAGATACAAGCTT TAGATGTACAACTTTAATCTTAAAAAAAAAAAAAAGCAGACACTTCCCGGTTGTCAATGTGAACGCAAGTTCAAATGATC TTCAGACCTGCATTCTCCTAAAAAAATCCTTATTCTTGATCTCTTAAATTCGTTATTGGTGTGTATATGCATATCACAGG GAAAATGAAGCTTCACTTGCTGTTTTACCTGATTTGTTGATGGAGCTTGATAGTTTGGATGAGGTATGCTTAACTATTAC TATAACCCTCTGAATTTAGCATGGTGGGAGGAATTAATATTGGTTCCATCTTGTGAAGTACATATGGCTGGTACATGCAA CTAATGCATCATTCCTTTTTGAGTAAATGTTTTCAATATACAAGTGAGTAGAAGTGACACTGTATGTATTTCATTTTTTA TGCCATGCTAGGTCTAAACACAGTCTTGTCACATAAGTGTAGTCTTTTTGGTTCAGTTGCGTGCCTAAGCCACCCTAGCT TTGCATACATAAATCATGTCCGCGTGTAAACTAATTCTGAAAACCTTTTGTTGCAGGAAACTAGACTACTTACTTTAATT GAAGGTGTTCTTGCTGCAAACATTTTTGACTGGGGATCTCGTGCATGTGTGGATCTCTATCATGAAGGAACTATTATTGA AATTTACAGAATGAGTCGCAATAAAATGCAGAGACCTTGGCGAGTAGGTGCATTTCATCATATCCATTGATGAGGATATT TTATTTCTAAATTTATTTATCATTGTTGATGGTTGAATACTAAGCTAATTTTTTTTTTGTCATCTAGGTGGACAATTTTG ATGCCTTTAAAGAGAGAATGTTGGGGACTGGGGACAAGAAACTTCCCCCACACAGAAGAGCTTTACTTTTTGTGGATAAT GCAGGTGCTGACATTGTTCTAGGGATGCTTCCCTTGGCACGAGAGCTCCTCCGCCGTGGAACTGAAGTGAGTTCTCTTTT TGAAGAAAATTTGAAGTTACTATACTGGACTAGATACTAAATTTCCCAACAAATTATTTGATTTAATTTTAGATTCTTCA TGATTTTAATAAATGCTGTACTGGTGTTTTGATTGAGTAAAGGTGTTCTAGAATTACCTTGTTCACTTGATAAATATGTA AACTGAATCTTAACAAGATCTTCAATAGCTGAAAATCTTATGATATATTCCCGAATTCTGACACCCCCTCCCAAAAACAA TCTTGTTATGATTTCATATGTCAAAGTAAATTTATGACTGCTATCATCAAGCAAATTAGGAGATTTTTTTTATTGTTTTG GCTGCTATGCAGTCATTTGATCCTATGCTTACTAGTTGTGTGATGTTAATATGAAAATAATGAATGAGTGCAGGTGGTTC TGGTAGCAAATTCCCTTCCTGCTTTAAATGATGTGACTGCAATGGAGCTTCCTGATATTGTTGCTGAGGCTGCCAAGGTT TGTGTATTTTGATGAACTTAATTTGTTATCTCTGGAACATTTGTGATGTTCCGAGAGCCCCTTGTAAAATTCTTCTGAAT GTCTACCATCAATCAGTTACTTCTCTTTTTGTGTCTTCCCCTTGAGGTAAAATGACATGCTTGCTAAACTTCTGGTAAAG AATCCTTGCAGATAAAATTCGGCATGCAATGATGTTATACCAAACACACTTTCTTACTGTCGTGTATTGAACGAAAACTT CTGTACCTGCATGTCTTGTCACTTTCCATATTTGTTGGAATTTCTTTTTCCTTCTTCACTTCATGACCTTCCCTTTACTT TTGTGTATCATAAATATAATCCAACCAAATAAACTTTTGCATGAATTTATGATATGTAATAGTTATGCTTTTCTTCTTGA CATCAGCTGTCAAGTATCTAGTGTGGTATCATTGATAAAAGTAAAAAAAGTATCTATTATGGTATCTGATTTAAAGTGTA CTTGCAAAGATCCTGACTTCGCGAACCTTATGTTTGATGTCAATTTGTTTATGATGTTGAATACACATTACTAATTCTTC TACATTACAGCACTGTGACATTCTTAGGCGAGCGGCTGAATCGGGAGGCTTGCTTGTGGATGCAATGACCTATACCTTAG ATAGTCCCAGACAAAATTTGCCTTCGGTTCCCTTGATGGTTGTTGAGAATGGGTGTGGTAGTCCTTGTATAGACTTAAGG CAGGTCAGCTCTGAGCTGGCTGCTGCTGCAAAAGGTGCAGATCTGGTGAGTAAACCATTCTATTTATGTTTAGAAAATCA AGGAGAAGAGCATATTCTAACTTCGTTTTATCCATTTGGTAGATAATTTTGGAAGGGATGGGTAGATCTCTTCATACAAA CCTCAATGCTCGATTTCAGTGTGATGCTTTAAAGGTATGGTCATCATCTTGGTTTAAACTTTATAAGGATTTAATTTATA TGCAACATCCAATGATATTTTGTCATTTTTTATTTATTAATGATGTGGTAAAATAGTGAATCCTGATTGAATGTATGTGA AAAACTTTTTTACACTATCAATGAATTGTTATTAAACTCTTGTGTTTTACAATCAGCTGACACTCGTCATTGTGTTCTGG TGTATAGTTACTTAGCTAATGCTACTCTAAGATTTCTTCTCCTATCTATGATGCTTGTCTTGTCTTTAAAACTTAACTGT CCCTGTAATCACTAATGGCTCCTTTGACACATTTTTCCCCTTATATATTTTGTTAGCTTGCAATGGTGAAAAACCAGAGA TTGGCTGAAAAGTTAGTTAAAGGGAATATATACGACTGTGTTTGCAAATACGAGCCTGCAAATTGA 

CDS sequence (LotjaGi4g1v0234000.7) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGCTTGTCTTGTAGCCGGAGCCAATTTCTTGCTCAAGGCAATTCGCCATGAAGCTTTTACACACATGGAGGGTCAGAA AGAGTTTGTTCAAATTGATTCTAATGAGTTGTATCCTTATCTTCTAGTTAATATTGGATCAGGTGTTAGTATGATCAAGG TTGATGGGGATGGCAAATTTGAGAGGGTTAGTGGAACAAATGTAGGTGGTGGTACTTACTGGGGCTTGGGAAGGCTGTTA ACAAAGTGCAAGAGCTTTGATGAGTTACTCGAGCTGAGTCAGAAAGGAGACAACAGAAACACAGATATGCTAGTTGGAGA CATTTATGGGGGTATGGACTATTCTAAGATTGGCCTATCGGCTTCTACAATTGCGTCAAGTTTTGGCAAGGCTACACTGG AAGGAAAGGAGCTTGAAGATTACAGACCTGAAGATATATCACTCGCTCTGCTACGGATGATTTCATACAACATTGGCCAG ATATCTTACTTGACTGCACTGCAATTTGGATTGAAGCGTATCTTTTTTGGAGGTTTTTTCACAAGGGGTCATGCCTATAC CATGGATGCTATTTCTTTTGCAATACATTTCTGGTCTAAAGGGGCTACACAAGCAATGTTCTTGCGACATGAAGGATTTC TGGGAGCATTAGGTGCATTTATGAGCTATGAAAAGCATGGTTTAGATGACCTCATGGTGCATCAGTTAGTTGAAAGATTC CCAATGGGAGCTCCATATACAGGAGGCAAGATTCAGGGCCCACCACATAGGAATTTGAATGAGAAGATTTCATGGATGGA GAAGTTTCTGCAGAAGGGGACTGAGATTACTGCCCCTGTGCCAATGGCTCCTCCTGGAACTACTGGGCTTGGGGGTTTTG AAGTTCCTTTGTCAAAAGGAAGTGCTCTACGACACGATGCTAGTGCTCTAAATGTTGGTGTTCTCCATCTAGTACCAACC TTAGAGGTCTTTCCTTTATTAGCAGACCCAAAAATATATGAGCCTAATACTATTGATCTCTCAGATCACAGCGAATTAGA ATATTGGTTCAAGATTTTGTCTGATCACTTGCCAGATCTTGTGGACAAGGCTGTCGCAAGTGAAGGTGGGACTGATGATG CCAAAAGAAGGGGCGATGCTTTTGCTCGTGCATTTTCTGCTCACCTGGTTAGGTTAATGGAGGAGCCTGCTGCATACGGG AAGTTAGGCTTGGCCAACCTATTGGAAATGAGGGAAGAGTGCTTGAGAGAATTCCATTTTGTCGATGCCTACATAAGCAT AAAGCAGAGGGAAAATGAAGCTTCACTTGCTGTTTTACCTGATTTGTTGATGGAGCTTGATAGTTTGGATGAGGAAACTA GACTACTTACTTTAATTGAAGGTGTTCTTGCTGCAAACATTTTTGACTGGGGATCTCGTGCATGTGTGGATCTCTATCAT GAAGGAACTATTATTGAAATTTACAGAATGAGTCGCAATAAAATGCAGAGACCTTGGCGAGTGGACAATTTTGATGCCTT TAAAGAGAGAATGTTGGGGACTGGGGACAAGAAACTTCCCCCACACAGAAGAGCTTTACTTTTTGTGGATAATGCAGGTG CTGACATTGTTCTAGGGATGCTTCCCTTGGCACGAGAGCTCCTCCGCCGTGGAACTGAAGTGGTTCTGGTAGCAAATTCC CTTCCTGCTTTAAATGATGTGACTGCAATGGAGCTTCCTGATATTGTTGCTGAGGCTGCCAAGCACTGTGACATTCTTAG GCGAGCGGCTGAATCGGGAGGCTTGCTTGTGGATGCAATGACCTATACCTTAGATAGTCCCAGACAAAATTTGCCTTCGG TTCCCTTGATGGTTGTTGAGAATGGGTGTGGTAGTCCTTGTATAGACTTAAGGCAGGTCAGCTCTGAGCTGGCTGCTGCT GCAAAAGGTGCAGATCTGATAATTTTGGAAGGGATGGGTAGATCTCTTCATACAAACCTCAATGCTCGATTTCAGTGTGA TGCTTTAAAGCTTGCAATGGTGAAAAACCAGAGATTGGCTGAAAAGTTAGTTAAAGGGAATATATACGACTGTGTTTGCA AATACGAGCCTGCAAATTGA 

Protein sequence (LotjaGi4g1v0234000.7) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MACLVAGANFLLKAIRHEAFTHMEGQKEFVQIDSNELYPYLLVNIGSGVSMIKVDGDGKFERVSGTNVGGGTYWGLGRLL TKCKSFDELLELSQKGDNRNTDMLVGDIYGGMDYSKIGLSASTIASSFGKATLEGKELEDYRPEDISLALLRMISYNIGQ ISYLTALQFGLKRIFFGGFFTRGHAYTMDAISFAIHFWSKGATQAMFLRHEGFLGALGAFMSYEKHGLDDLMVHQLVERF PMGAPYTGGKIQGPPHRNLNEKISWMEKFLQKGTEITAPVPMAPPGTTGLGGFEVPLSKGSALRHDASALNVGVLHLVPT LEVFPLLADPKIYEPNTIDLSDHSELEYWFKILSDHLPDLVDKAVASEGGTDDAKRRGDAFARAFSAHLVRLMEEPAAYG KLGLANLLEMREECLREFHFVDAYISIKQRENEASLAVLPDLLMELDSLDEETRLLTLIEGVLAANIFDWGSRACVDLYH EGTIIEIYRMSRNKMQRPWRVDNFDAFKERMLGTGDKKLPPHRRALLFVDNAGADIVLGMLPLARELLRRGTEVVLVANS LPALNDVTAMELPDIVAEAAKHCDILRRAAESGGLLVDAMTYTLDSPRQNLPSVPLMVVENGCGSPCIDLRQVSSELAAA AKGADLIILEGMGRSLHTNLNARFQCDALKLAMVKNQRLAEKLVKGNIYDCVCKYEPAN 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 1 250 250 9.7E-138
TIGRFAM 1 222 222 4.6E-85
Gene3D 1 221 221 1.8E-95
Pfam 1 221 221 7.6E-98
PANTHER 1 250 250 9.7E-138
SUPERFAMILY 2 223 222 7.22E-65
Gene3D 20 215 196 1.8E-95
Gene3D 100 144 45 1.8E-95
SUPERFAMILY 315 697 383 1.44E-83
Gene3D 337 421 85 6.0E-6
Pfam 407 685 279 5.9E-42

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Pantothenate kinase activity Catalysis of the reaction: ATP + pantothenate = ADP + D-4'-phosphopantothenate.
Molecular function ATP binding Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator.
Biological process Coenzyme A biosynthetic process The chemical reactions and pathways resulting in the formation of coenzyme A, 3'-phosphoadenosine-(5')diphospho(4')pantatheine, an acyl carrier in many acylation and acyl-transfer reactions in which the intermediate is a thiol ester.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi4g1v0234000.7, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…