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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi4g1v0283600 |
| Transcript ID | LotjaGi4g1v0283600.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Protein ENHANCED DISEASE RESISTANCE 2-like; TAIR: AT5G35180.1 ENHANCED DISEASE RESISTANCE protein (DUF1336); Swiss-Prot: sp|F4JSE7|EDR2_ARATH Protein ENHANCED DISEASE RESISTANCE 2; TrEMBL-Plants: tr|I1MTY2|I1MTY2_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi4g1v0283600 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr4:65553881..65575013) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CCAATACAAGTAAAAAGAAGAGAAAGAAAAAATAAATGTATCAATTGATATTTTTCCGAAAGTCCATATATGATATTTTA ATCAATTGATTGAAGAAAGAGATATCTAATCTAAGTATGCAACAATCACTAACAAACAAAGAAGCCGAAAATGAAAGGCA AAATGAAGCTTGATATATTAGGTGGCAACCACCAAGTGGCGAAACGTGATTGGAGCAAGTGCGATGATGCGAGCAAACGC GGCATCGACTCATAAACAGTGAAAACAGAATTGACGGTCAGGACAACCTCAACCAGCTTTGAACTTCATCACTATCCTTC CTTCCTTCCTCAAACGCGTACTGGGCCCCACCCAACCTCCCCCACCCCGCAAAATTCAAAGCAAGTAATAATAATGCCTA ATGATAAGAAAATAAGACAAACAAGATTCAATTTCAATAATAATAATTGAGACGAGTCACGAGTGTGGTGTGTGGGATCA TCACCATTCAGCACTACCAGCAGCAGCAGCGATAACGTGTGATGGACGCCGTCGCAGCCGCAGTATCAACGGCGGGAACA ACCGGCTCGGTGTTGAACAAGTCCGGTAGCGGCGGTTCCGATCGGAGTGATGATAGAGGGATATTTGAGTATTTTGGTTG GGTGTATCACCTGGGAGTGAATTCGCTTGGTCATGAGTACTGTCATCTCCGATTCTTGTTCATTAGGGGGAAGCATCTTT CTATGTATAAGCGTGATCCTCATGAATACCCTTCCCTTGTAAGCTTCTGAACTTCTTAATTACTGCTGGATCATATGTTA ATTAGTGATTACTGCTGTGTTTAGCTACCTAGCAATGGTTTAATTTGTAATTGCACTTGCTTGCTTGAGTTAATTAGTTT GCTAACCCTCATTGGAGCTCATTATTTAGTTTCATTGATTATGGATTAGTGATATTTAATTAATTGAATGAACATAGATA 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CTTAATTTAATACTTGACTCTTAAAATGTATAATATCAACTCCACTGTGTAATGTAGACTTAAGGATTCAGTCATGTGCT TCTTTCTAATTTTCCTCTTTATCAACACACTAAATTTTTAATGTAAATTTTGCTAGTCATTGAAGATTCCTAATTCAACA TTGTTGAAATTATGTGCAATGATATGCTAATTGGTAGCAGAATTGAGATTTAGTACATGTGTTACTTTGCTGCTATTTTT ATATTATCTGGTAAATAACACTTTCATGGTAATTTTCTGCAATATGCAGATTGATGTGGACATTGGATCATCCTCTGTAG CTAGGAGTGTCATTAACCTTGTTCTGGGATATGTCACAAACCTAGTTGTTGACCTTGCAATTTTGGTAGAGGTTTGTGCC TTTCTCACTATAATAATTTCTGATATACTATTCTCTTATGATTTTATCTTCCCTGGCTCCTTTGGTGTAAACTTGATATT TGGCTAGAATGAGGAAGTTATTATTGTTTGGAACTGTGCAATTTATGCAATTCCCGGGTATATTTGGTTGGGGGAGAGGG GGTGCTCTTATGTTCCAGGGTGTCTGTCTATTTTTTGCGCTTATTATGATTAGGATTGTGTTTATACCTTTATGGTTTCT ATTGGGTGCAATCCATGTGTTTGTTCAAAGGGAATTCCCATTTCCAATATGCAAAGAGGTTGAATTTCTTATCCTCCCAA TTATTTTCTCTCTACTTTCTTTGTGAAGTATATTCGTTGTCACGGCTGTGCGCGCGCGCACATTATCACATGCTTGTAGG CATGAGCGTAGCCCTTTTTCAGAAGACATATACCATTAACTATGTTAGGAAAAACTAGAAAGAAGATTACAAAACCTGAA TTTTTCTAGAAGGAAAGGTGATGAACTGATTATATTAACATTAAGTTGTAACAGAATAAGCAATTGAAGACAATCAACCA TCTTTAACCAAAACAACCACAACTTTGGAATTAGTTACCTTCCTTGGCCATCCTTCCAGTTTCGCAAGTTATCTAAGCTG AGAATAAATACACGTACCAAAAAATTCTTCTTCTGGGTTTCTTGGCTGCATTCTATTTCTTGCTTTGGTCATGTTGACAT CTATTGCATTCTAATGGAGTGTGGGCTGGATTTTTTTTTACATATCAACTGCTAATACATTCACTTCTAAAAGTTGGAAA ACTCATCAACATATTCATCTCAAGTGTTCCAGATATATACTAATGCTATATTTGCAGGCAAAAGACGAGAAGGAGCTGCC GGAGTACATTCTTGGAACTGTCCGGTTAAACCGTTTAAAACTTGAATCTGCTGTACCATTGGAGAAATGACAATCTGAGT GAACTTTTTTCAGATACCTCAGTTTCTGTTTTCTGTTTCTTTGTGCTCTCATGCCTCTCCTCATTCGAGTTTGGTTCCTA TGATAAGGTAACCATTTCCTTGACCGTCAGTAATTAAATCGTCATGTAAAAAAGAAAGGAAGTCTACAAACTGTAAAAGA TGGATGCACACTGTTTGATTTTGTAGGCACCGCACAAGAAATTGTCTGCACCATGTATTCATTACTACAAATTCATGGAG TTTGTGAGCAAATATACTAGTGTATTCTAACAATATAACCTCCTATACCTGTACCGCCATAAGGGAGTCGCAATGGAGTT TGTATTCATGGCCAGTTTATTTTTTATTTTTTTATGTTAAAGAATGTATTGATGGGACATTGGCTTGTATCAAAAGAATA AGATTTGTGATTGAGTGGAATTGTCTCTCTACTGTCAGAAGGTTAGGTTTTCTGGCTTGATGCCTTTCTCGTTATTCCAC TCTAATATATAATACAGCTGATTTACAATTCTTAATGACATATAATTGTCCTTCCTAATTTGTGCAATCTAAAATAGGAA TATAAATAACCTACAATAAACCTATTGATTTTATTCCTAAATAATACAATGTATAATAGGAAACACAATTACTAACAGAT TATATTTGCCTTAACATCCCCCCTCAAATTGATGTGGTTTGTCAAGAAGTATCAATTTGCTAAGCAGAAACTGATGACGA GGTCGAGGAACAACTTTCGTGAAGATATCAGCAAGCTGGAGTTGGGAGGTGACATGAGGAAGAGAGATAACCCGATCATC AAAAGCCTCACAAATAGAATGACAGTCCACCTCAATATGTTTAGTACGCTCATGAAAAACTGGATTGGCAGCAATTTGAA TAGCATTAGTGTTATCAGCATAAAGAGAGGTTGCATCATGCTGAGGGAAGCCAAGTTCAGCCAACAAGCCACGAAGCCAA ATGATCTCGGAACAAGCAGCAGACATAGCACGATATTCAGACTCTGTGGATGACTTGGAAACTCGTACTTACTTTTTACT CTTCCAAGAAATCAGGGCAGGACCAAGAAACATGCACCAACCGGAGACAGATCGCCGAGAGTCAGGACTACCAGCCCAAT CTGCATCACTATATGCAAGCAGTTGGAGCGATGTATGAGCAGGAAAGAACAAACCCCGACAGGAGGTTCCCCGCAAGTAA CAAATTATGCGACGGACGACAGCCATAGGAAGATGACGAGGAGCATGCGTGGACTGACTAACTTGTTGTACTGCAAAGGA AATGTCAGGACGTGTAATGGTCAAGTAATTAAGACTCCCCACTAACTGGCGATATACCAGAGGATCAGGCAGAAGATCAC CATCATCACGATGATATTTGACATTAACTTCCAAAGGAGTATCCACAGGAATTGCAGACTGAAGTCCAGCCATAGAAATT AAATCCTCAGTATACATATGCTGATGAAGAAAGATGCCTTGGGGATTTGAATGAACCTCAAGACCCAAGAAGTAGTGAAG ACAGCCAAGATCTTTCATATGAAAAGAGGCTTGAAGTTGCTGTTTAAGCTGATAAATAGATGCCTGATCAGAGCCTGTAA TAACTATGTCATCAACATAAATGAGGAGAACAATGTCAGCGGTCGTTTCATGAATGAATAAAGATGAGTCATAATGACTC TGTCTGAAGGAGAAACCAAGAAAAGTAGACCGAAATTTCTCAAACCATGCTCGGGGAGCTTGTTTGAGACCATAGAGAGA GCGCTTGAGTTTGCACACACATGTGGAGGAAGAAAACAAGCCTTGAGGAGGTGTCATATAGATGTCCTCGACCAAGTCAC CATGAGCAAAAGCATTTTTCACATCCATTTGATGGAGTGACCATGCTTTGGACGCAGCAATAGAAAGGATAATGCGAACA ATAGTCATCTTGGCCACAGGTGCAAATGTCTCATCATAGTCGACCCCATACTCTTGTTTATTTCCCAAAGCCACCAACCG GGCTTTGTAACGGTTGAAGGAACCATCAGAGTTTAGCTTCACAGAGTATACCCATTTGCAACCAATGGGTTTAGCACCCG GCGGACAAGGAACAATGTCCCAAGTGAAATTCTCCTGAAGTGCCTGCAGCTCCTCTTTCATTGCTTTCACCCAACGCATG TCCTTAGTAGCCTGTGAATAACATGTAGGAATAGATGTGCAAGATAAAGTAGCAGTAAGAGAAGTAGGCCCCCATCCATA CCTATCGGGTGCACGATGCATACGAGAGGATCTATGTATGACAACCGGTGTAGATGGATCATCATCAGGAGGTTCATCAT CAGGAGGTGATGCATCAACATCGGGAGGTGGATCAGCATCGGAAAGTGGTGGATCAGCATCAGGGGGTGGCTGAGCAGTC GGGCGTCTAACATATACTTGTCCAGGTTTAAAACGTACTATAGAGAGAGGAACATGATCAAAGCTAGGAAGATGGACAAA CCTATTAGAACCA
CDS sequence (LotjaGi4g1v0283600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGACGCCGTCGCAGCCGCAGTATCAACGGCGGGAACAACCGGCTCGGTGTTGAACAAGTCCGGTAGCGGCGGTTCCGA TCGGAGTGATGATAGAGGGATATTTGAGTATTTTGGTTGGGTGTATCACCTGGGAGTGAATTCGCTTGGTCATGAGTACT GTCATCTCCGATTCTTGTTCATTAGGGGGAAGCATCTTTCTATGTATAAGCGTGATCCTCATGAATACCCTTCCCTTAAA CCGATTAGGCAGGGAGTTGTGGGGCCCGCGCTAATGGTGGAGGAGCTAGGTCGTCGGAGGGTCAACAATGGGGATCTTTA TGTTTTGCGGTTTTACAATCGGTTAGATGAGACCAAAAAGGGAGAAATTGCTTGCGCTACAGCTGGGGAGGTTCGGGGAT GGACAGAAGCATTTGATCATGCCAAGCAACAGGTTGAGTATGAGCTGTCAAGAGGAGGCAGTGCCAGGGACAAACTAAAC ATGGAGGCCGAGATCAATCTTGAAGGACATCGGCCTAGAGTGAGGCGGGTTTCCCATGGTTTGAGGAAGCATATAAGAAT TGGCCAAGGCCCAGAAATACTGTTACGGCAATCGTCAAAGTTGGCTAGCAGGGCAGATGGGTTTCAAGGGGATAGTGGAG ATGCAGTTGAAGCCTATCAATGGAAATGTGTTCTTACTGTGTCTGGTATTAGAATTTTCGAGGATGTTTCAAGTCACAAG TATGGTAAGGGTATCCTTGCAAAGTCTGTTGGTGTTATTGATGCAACTGCAGATACTGTTTTTGAAGTGGTTTTGAATAC TGAACGACAGAGAAGATATGAGTGGGATATGTTGATGTGTGACTTAGAGCTGGTAGATTCTTATGACGGACACTATGATG TTGTTTATGGGACATATGATCCTAAGTATCTATCTCGGTGGCATTCAAAGCAGGATTTTGTCTTCTCTAGGCAATGGTTT CGTGGACAAGATGGAACATACACTATCTTGCAGTTTCCAGCTAAACATAAGAAAAAGCCTCAAAGATCTGGATATCGACG TGCAAAGATTAATACATCTACATGGGAAATTAGAAACTTGAACACACCTATGGCATCAAATAGTCCAAAGTGTCTTGTGA CCCACACTTTAGAGATACAATCTGCATCCTGGATGAGATGGAAGAACAACCGGTGCTCACAATTTGAGAGGAACATTCCT TACGCGTTATTGTGCCAAGTGGCAGGTCTGAAGGAATACATCTCAGCTAATCCAGCACTCAACCGCGAAAATGCCACCAC GGTTGTTCATTCCAAAATCTCTGATGGTTCCATTTCCAGTTCTGAATATGAGGATGAAGTGCTAGATGAGTTTTATGATG CTATTAGTGCTGAATCGTCAACATCAGATGAAGAAAGCGATGATGATGAGAAACATGATCCTAAGGAGCTAAGAGTCAAA CTGAAGAATATATCATGGGCAATCACAACCTTAGCTTTGAAGCGAACTGCAGCTCCTGATCTAGGCGAAGAACTGGATCC TACTGTAGCCCCTATCACAATCGATCAAAGTGACATTCATGGCTCTTTGCGCAAAGGAAAGGATGACAATGACACAAACT GTTGGACTTCTCCTAGTGGAAAAGGATTTATGATCAGGGGAAAGAACTATCTTAAAGATAATTCTAAGGTTGTTGGAGGA GATCCTCTTCTCAAGCTCATAGCAGTTGATTGGTTCACAGTCGATAAATCTGTAGATAGAATTGCCCTGCACCCGAGATG TATGGTTCAGTCAGAAGCAGGCAAAAAGCTTCCATTTATCCTCGTCATAAATCTCCAGGTTCCTGCTAAACCAAACTACA GTCTGGTTCTATATTATGCAGCGGACAGACCGGTGCATAAAGATTCTCTATTGGCTAAGTTTGTTGATGGAAGTGATGTG TTTCGGGACTCTAGGTTCAAACTTATTCCGAGTATAGTTGAGGGATATTGGCTGGTCAAGAGAGCCGTTGGAACCAAAGC TTGCCTCTTAGGGAAAGCTGTGACTTGTAAATACTTCAAACAGGATAATTTTTTGGAGATTGATGTGGACATTGGATCAT CCTCTGTAGCTAGGAGTGTCATTAACCTTGTTCTGGGATATGTCACAAACCTAGTTGTTGACCTTGCAATTTTGGTAGAG GCAAAAGACGAGAAGGAGCTGCCGGAGTACATTCTTGGAACTGTCCGGTTAAACCGTTTAAAACTTGAATCTGCTGTACC ATTGGAGAAATGA
Protein sequence (LotjaGi4g1v0283600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MDAVAAAVSTAGTTGSVLNKSGSGGSDRSDDRGIFEYFGWVYHLGVNSLGHEYCHLRFLFIRGKHLSMYKRDPHEYPSLK PIRQGVVGPALMVEELGRRRVNNGDLYVLRFYNRLDETKKGEIACATAGEVRGWTEAFDHAKQQVEYELSRGGSARDKLN MEAEINLEGHRPRVRRVSHGLRKHIRIGQGPEILLRQSSKLASRADGFQGDSGDAVEAYQWKCVLTVSGIRIFEDVSSHK YGKGILAKSVGVIDATADTVFEVVLNTERQRRYEWDMLMCDLELVDSYDGHYDVVYGTYDPKYLSRWHSKQDFVFSRQWF RGQDGTYTILQFPAKHKKKPQRSGYRRAKINTSTWEIRNLNTPMASNSPKCLVTHTLEIQSASWMRWKNNRCSQFERNIP YALLCQVAGLKEYISANPALNRENATTVVHSKISDGSISSSEYEDEVLDEFYDAISAESSTSDEESDDDEKHDPKELRVK LKNISWAITTLALKRTAAPDLGEELDPTVAPITIDQSDIHGSLRKGKDDNDTNCWTSPSGKGFMIRGKNYLKDNSKVVGG DPLLKLIAVDWFTVDKSVDRIALHPRCMVQSEAGKKLPFILVINLQVPAKPNYSLVLYYAADRPVHKDSLLAKFVDGSDV FRDSRFKLIPSIVEGYWLVKRAVGTKACLLGKAVTCKYFKQDNFLEIDVDIGSSSVARSVINLVLGYVTNLVVDLAILVE AKDEKELPEYILGTVRLNRLKLESAVPLEK
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 20 | 749 | 730 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 20 | 749 | 730 | 0.0 | – | |
| Gene3D | 207 | 406 | 200 | 4.6E-26 | ||
| SUPERFAMILY | 216 | 379 | 164 | 1.32E-28 | – | |
| CDD | 220 | 375 | 156 | 3.90979E-31 | – | |
| ProSiteProfiles | 221 | 416 | 196 | 17.743 | ||
| Pfam | 242 | 375 | 134 | 5.6E-8 | ||
| Pfam | 535 | 740 | 206 | 1.9E-66 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Lipid binding | Interacting selectively and non-covalently with a lipid. |
Expression pattern of LotjaGi4g1v0283600.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…