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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0057100 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0057100.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Trafficking protein particle complex subunit 9; TAIR: AT5G11040.1 TRS120; Swiss-Prot: sp|Q9FY61|TR120_ARATH Trafficking protein particle complex II-specific subunit 120 homolog; TrEMBL-Plants: tr|I1MWX3|I1MWX3_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0057100 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:9661302..9678111) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CCGTCCACTATCCAAACAAGAAGGCGGTAAATGTGCTCCGCTCCATCATAAAATGTCCAAACAATGGCAAGTGAATTTTA TTCCGTTCCGTTCCACTCCGTTATGTTCCACTCCGTTCCGCTCCATTATATTCCATCAATCCAAACATAGCCTGACAGCA TTCGCCGAGAAAGAGCAAGAAACCAACCAACCGGCACTGTTTTTCACCATGGAACCGGAAGTAAGCATCGAGGGATCATC GGTGATCCAAGTCGCGGTGGTTCCGATCGGGACAGTACCGCCGAACATGCTGCGTGACTATTACTCGATGCTGCTCCCAC TGCACTCGATCCCGCTCTCCGCGATCAGTTCCTTCTACACGGAGCACCAGAAATCGCCGTTCGCGAATCAGCCCTGGGAC ACCGGTTCGCTCAGCTTCAAATTCGTCCTCGGCGGCGCTCCGCCGAGTCCCTGGGAGGATTTCCAGTCCTACCGGAAAAC CCTCGCTGTTGTTGGCATTGTTCACTGCCCTTCCTCGCCGGATCTCGACGCCGTTGTTGATCAGTTTGCTAGCGCCTGCA AGTCTTACCCTTCGTCTCTCGTCGATCGCTGCTTCGCCTTCTGCCCCAATGATTCTCAGGTCCTTCTCATCCCCTTCGTT TTCTCCATTTTTGGCATTTCCGCAAAGATTTTTTTCTTCTTGTCAGTGTAGCGAGAACGTGGATCAAAAAAGAAATTGTT ATAGGTTTTTTTTGGCAATTTCATGAAGAAATGGAACACAGAAGTAACGTTTTTATAGGTCATTTTAGTGAAGAGATGGA TCAAGATGTAACATTCTTATGGCAATTTAGCAAAGAAATGGATCTAGGCCCCTTTGGGAAAACAGCTTAATTAAGCCCTT ATTCATAAGCTATTTTAAAAAATTTATTGAGATAAATTGAAAATAAGCTATATATTAGCATAAGCTCTTTTACATAAGCT 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CDS sequence (LotjaGi5g1v0057100.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTCCAAACAATGGCAAGTGAATTTTATTCCGTTCCGTTCCACTCCGTTATGTTCCACTCCGTTCCGCTCCATTATATT CCATCAATCCAAACATAGCCTGACAGCATTCGCCGAGAAAGAGCAAGAAACCAACCAACCGGCACTGTTTTTCACCATGG AACCGGAAGTAAGCATCGAGGGATCATCGGTGATCCAAGTCGCGGTGGTTCCGATCGGGACAGTACCGCCGAACATGCTG CGTGACTATTACTCGATGCTGCTCCCACTGCACTCGATCCCGCTCTCCGCGATCAGTTCCTTCTACACGGAGCACCAGAA ATCGCCGTTCGCGAATCAGCCCTGGGACACCGGTTCGCTCAGCTTCAAATTCGTCCTCGGCGGCGCTCCGCCGAGTCCCT GGGAGGATTTCCAGTCCTACCGGAAAACCCTCGCTGTTGTTGGCATTGTTCACTGCCCTTCCTCGCCGGATCTCGACGCC GTTGTTGATCAGTTTGCTAGCGCCTGCAAGTCTTACCCTTCGTCTCTCGTCGATCGCTGCTTCGCCTTCTGCCCCAATGA TTCTCAGCTTGATGATGGAAGTAAGAGAGAGGGGAATTTGAGGTTGTTTCCTCCAGCGGATCGTCCGACATTGGAATTTC ACTTGAACACTATGATGCAAGAAGTAGCTGCTTCGCTGCTTATGGAGTTTGAGAAATGGGTGCTTCAGGCGGAATCTTCT GGAACAATTCTCAAGACGCCTTTGGATTCTCAAGCTAGTCTCAGCTCAGAGGAGGTAATTAAGGCCAAAAAGAGGAGACT TGGGCGTGCTCAGAAGACCATTGGTGATTACTGCTTGCTGGCAGGTTCCCCTGTTGATGCCAATGCTCATTATTCTACTG CGTTGGAACTTGCAAGATTGACTGGTGATTACTTCTGGTATGCTGGAGCATTGGAGGGTAGTGTTTGTGCCTTGCTGATT GACCGTATGGGCCAGAAAGATTCAATCTTGGAGGACGAAGTTAGATATCGTTATAATAGTGTGATCTTGAATTACAAGAA GTCGCAAGATAATGCTCAGAGAGTTTCTCCCATAACTTTTGAACTTGAAGCTACTTTGAAATTAGCAAGGTTCCTTTGCA GGAGAGAGCTGGCGAAGGAGGTGGTGGAGTTGTTGACAACTGCTGCTGATGGTGCTAAATGTTTAATTGATGCAAGTGAT AGACTCGTATTATATATTGAAATAGCTCGTTTGTATGGCAGTCTTGGATACCAGAGAAAAGCTGCTTTCTTTTCAAGGCA GGTTGCTCAGTTATATCTGCAGCAGGATAACAGGCTAGCGGCAATTAGTGCTATGCAAGTTTTAGCTATGACCACAAAAG CTTATCATGTGCAAAGTAGATCATCAATCTCCGATCATTCCATGCATAATAAGGGAATTGGATCAAATAATGCTGATAGT GGGAAAATGTATCATCAATCAGTAGTCTCACTATTTGAGTCTCAATGGAGTACCCTCCAGATGGTTGTATTAAGAGAAAT TCTGCTCTCTGCAGTTCGTGCTGGTGATCCTCTAACTGCATGGAGCGCAGCGGCGCAGCTTCTTAGATCCTACTATCCTC TAATACCTCCTGCTGGGCAACATGGCCTTGCTAATGCACTTTTAAATTCCGCTGAGAGGCTGCCACCAGGGACTCGTTGT GCTGATCCTGCTCTTCCTTTTATAAGGCTGCATTCCTTTCCTCTCCACCCAATCCAAATGGACATTGTAAAACGTAATCC AGCTAGAGAAGACTGGTGGGCAGGTTCTGCTCCTTCAGGCCCTTTCATTTATACACCATTTAGTAAAGGAGAGCCAAATA ATATGAAGAAGCAAGAGCTTATCTGGGTTGTTGGGGAGCCTGTCCAGGTCTTGGTGGAATTGGCAAACCCTTGTGGCTTT GATTTAAGGGTTGACAGCATCTATCTATCTGTCCATTCAGGAAATTTCGATGCTTTCCCTGTGAGTGTAAGCCTTTTACC AAATTCTTCAAAAGTAATAACCTTATCAGGCATTCCAACATCAGTGGGGACAGTTACAATTCCTGGATGCATTGTTCATT GTTTTGGCGTTATTACTGAACACCTGTTTAGAGAGGTTGACAATCTGCTCCTTGGGGCTGCACAAGGGCTTGTCCTTTCT GATCCCTTTCGATGCTGTGGATCTCCAAAGTTGAAGAATGTATCTGTCCCAAATATTTCTGTGGTCCAACCACTTCCATT GTTAATATCACATGTTGTTGGAGGTGATGGTGCCATCATTTTGTATGAAGGTGAAATTCGTGATGTGTGGATTAGCCTTG CTAATGCAGGCACTGTTCAAATTGAGCAGGCACATATTTCACTGTCAGGGAAAAATCAAGATTCTGTAATTTCATATTCT TCTGAGACTTTAAAATCTTGCCTCCCTCTAAAGCCTGGAGCAGAAGTGACGTTCCCTGTGACCTTGAGAGCCTGGCAGGT TGGCTCGGTGGATACTGATACTGGTGTAGGGAGGACTGTCTCAGGAAGCAATATGAGGCATTCCAAAGATGGAAGCGACC CATCACTGTTGATCCACTATGCTGGTCCACTGAAAACCTCTGAAGAACCTCTAACAAATGGATCAACTGTTCCTCCTGGA AGACGCCTTATAGTTCCCCTTCAGATTTGTGTTTTGCAGGGTTTATCTTTTGTAAAGGCTCAGCTGCTTTCAATGGAATT TCCTGCTCATGTTGGTGAAAATCTTCCTAAGTTGGATGATATGGATAATAAGTCCCCTGGAGAACATGTTAAGTCTGAAA CAAAAATGGACAGATTGGTGAAAATAGATCCTTTCAGAGGAAGTTGGGGACTGCGATTTCTTGAACTTGAGTTGTCAAAT CCAACTGATGTTGCCTTTGAAATCAATGTCTCTGTAAAACTGGAGAATTCTAGCAATGAGGACAATCATTTAGCTGATCA GGGCGCTACAGAATATGGCTATCCCAAAACAAGAATTGATAGAGATTGCTCAGCAAGGGTTCTAGTGCCTCTTGAACATT TTAAATTACCTGTTCTTGATGATTCCTTTTTCATGAAGGACACTCGTACAGATGGAACTGGTGGGGGACGAAATACATCC TTCTCTGAAAAGAGCACCAAAGCTGAACTCAATGCTTGTATCAAGAACCTGATATCTAGGATTAAGGTTCAATGGCATTC AGGACGCAATAGCTCTGGAGAGTTAAATATCCGGGATGCTATCCAGGCAGCACTGCAGACATCAGTCATGGATGTTTTGC TGCCAGATCCACTGACATTTGGCTTCAGGCTTGTTAGAGATGGTTTTGAATCAGAAAAACTTGATTCTGATAAAGAATCT GATATAATTGAATCCCCAGCTTCCAAAGATTCTGTGCTTGCGCATGAAATGACACCAATGGAAGTTGTGGTCCGTAATAA CACAAAGGATATGATCAAAATGAGTCTTAATATTACATGCAGAGATGTAGCTGGGGAAAATTGTGTGGATGGTATCAAAG CAACTGTTCTGTGGACAGGTGTTCTAAGTGATATTACTATGGAAATCCCTCCTCTGCAACAAATTAAACATTCTTTCTGC CTGCATTTTTTTGTCCCGGGAGAATATACGCTACTTGCTGCAGCAGTGATTGAGGATGCAAGTGACATCCTTAGGGCTCG TGCTAAGACCACTTCAGCTGCTGAGCCAATCTTCTGTCGTGGACCACCTTATCATGTTCGTGTCGTTGGGACTGCGTGA
Protein sequence (LotjaGi5g1v0057100.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MSKQWQVNFIPFRSTPLCSTPFRSIIFHQSKHSLTAFAEKEQETNQPALFFTMEPEVSIEGSSVIQVAVVPIGTVPPNML RDYYSMLLPLHSIPLSAISSFYTEHQKSPFANQPWDTGSLSFKFVLGGAPPSPWEDFQSYRKTLAVVGIVHCPSSPDLDA VVDQFASACKSYPSSLVDRCFAFCPNDSQLDDGSKREGNLRLFPPADRPTLEFHLNTMMQEVAASLLMEFEKWVLQAESS GTILKTPLDSQASLSSEEVIKAKKRRLGRAQKTIGDYCLLAGSPVDANAHYSTALELARLTGDYFWYAGALEGSVCALLI DRMGQKDSILEDEVRYRYNSVILNYKKSQDNAQRVSPITFELEATLKLARFLCRRELAKEVVELLTTAADGAKCLIDASD RLVLYIEIARLYGSLGYQRKAAFFSRQVAQLYLQQDNRLAAISAMQVLAMTTKAYHVQSRSSISDHSMHNKGIGSNNADS GKMYHQSVVSLFESQWSTLQMVVLREILLSAVRAGDPLTAWSAAAQLLRSYYPLIPPAGQHGLANALLNSAERLPPGTRC ADPALPFIRLHSFPLHPIQMDIVKRNPAREDWWAGSAPSGPFIYTPFSKGEPNNMKKQELIWVVGEPVQVLVELANPCGF DLRVDSIYLSVHSGNFDAFPVSVSLLPNSSKVITLSGIPTSVGTVTIPGCIVHCFGVITEHLFREVDNLLLGAAQGLVLS DPFRCCGSPKLKNVSVPNISVVQPLPLLISHVVGGDGAIILYEGEIRDVWISLANAGTVQIEQAHISLSGKNQDSVISYS SETLKSCLPLKPGAEVTFPVTLRAWQVGSVDTDTGVGRTVSGSNMRHSKDGSDPSLLIHYAGPLKTSEEPLTNGSTVPPG RRLIVPLQICVLQGLSFVKAQLLSMEFPAHVGENLPKLDDMDNKSPGEHVKSETKMDRLVKIDPFRGSWGLRFLELELSN PTDVAFEINVSVKLENSSNEDNHLADQGATEYGYPKTRIDRDCSARVLVPLEHFKLPVLDDSFFMKDTRTDGTGGGRNTS FSEKSTKAELNACIKNLISRIKVQWHSGRNSSGELNIRDAIQAALQTSVMDVLLPDPLTFGFRLVRDGFESEKLDSDKES DIIESPASKDSVLAHEMTPMEVVVRNNTKDMIKMSLNITCRDVAGENCVDGIKATVLWTGVLSDITMEIPPLQQIKHSFC LHFFVPGEYTLLAAAVIEDASDILRARAKTTSAAEPIFCRGPPYHVRVVGTA
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 54 | 1249 | 1196 | 8.2E-294 | ||
| Pfam | 62 | 242 | 181 | 4.9E-16 | ||
| Pfam | 251 | 330 | 80 | 6.2E-12 | ||
| Pfam | 380 | 794 | 415 | 4.3E-34 | ||
| Pfam | 1055 | 1198 | 144 | 1.9E-5 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi5g1v0057100.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…