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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0115500 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0115500.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | F-box protein; TAIR: AT3G58530.1 RNI-like superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q8LB33|FB330_ARATH F-box protein At3g58530; TrEMBL-Plants: tr|I3SB53|I3SB53_LOTJA Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0115500 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:23564438..23577038) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GCTCACTATTTGGGATCAAAACCAAGGTCCAAAACCCAAAAGCAGGAACCTCGAACTCGACCGAGATTCTCCGTTGGCAA CAACAATGGAGGAAACAACATCAACGTCAACAGAGTCAAAGGACCATGTTTGGTGCAGAGAGACAGTGCCGAAGGTTTTC AAGCTTGTTTGTTCCACTTTACCTCTCGCTCACACAGACCTCGTTTCTCTCCTCCTCGTTAGTCCCTCGCTTCATCGCAC CCTTGTCTCTTGTCAACCCCTTTGGCAGGTCACTGTTCACTTCGCTTGCTCTTCCCATTTTTCCTTATTTTCAATTTTCA ATTCTGTTACTAATCTTCTTCAATTATTATTAGTCACTGATTTTCCGCGAGGTAAATAATGCCGGGAATCGCCTTCTAGC TGCTCTTTCTCTGGTAATTTTTTTCCCTCAATCCATTTTTAAGTTTGATTACATTGCTAATAGTTGTAATTAACTGTAAT GCAGTTGTCCCCGAAAGATAGCTCAAGTGGTAAGAGCTAGGGACATAAGTGTGGGGTGGGATGAAGGGTGAAGGGTCCGG GTTCGAACCCTGAGGAGGATTAATTTACTAACATTGCTAACAACTAACATTTGCCTATAAAAAAAGCTGTAATGCATTTA GTAGTAATTTACCTTATGCAAAAAAATTGATTTTGCTATTTTGGAGGGAGATATATTGTTAATGGGAATGGCTTTGCTTT ATGATTTTGCTTGATATTTATTAATTTTTCCTAACATTTTGGTGCTTAATACTTAATAGTGTTTTGGGCTGAAATTTGAT TGCTTTTTTGTAGCCTAGATATCGCTATGTAAAGCAGATTGACCTCGAATTTGCGCGACATGTTGAAGACACACATCTCA TTCTTATTAAGGATAAGGTAACATATGTATCTTTTTAGTTTATAGCTTTTTGTGAATTTTATGTCTTAAGGCGGAGGAAC CCTTCTTGTTTAACTGAAAAATATTGTCAGATAAATTTGTTACTCCACTAGTTCTAGAGATGCCTGTGCTCTTACATTTT TAGAGTTTTCTATACAGAATATTGATGCAGAAAATTGATGTGTTTTTGCTAACCTGATGCGTCCAGCTTGATAATAAAAT GATGCATGACAGATCAAACCAATTTTTATTTGTGTAATCCATTTTTACATGTATTATTTATTATTATTGTCATTATTATC ATTGTTATTGAAATTGTAGTTATTATCAATAATATCCCTCATAATCTGGGTTTTGATCGAGCTCAATGACGTGCTGTGTT CCATATAGTCGACCTCACTTAGTGGGATAAGGCTTTGTTGTTGTATCTGGTTGTATTTTTACTACATATGTCAAATGTAA CTTATATCAATCGGATTTGTCTGCATTATAAGTTGAAAATAAAGGGAAAGAGAATAATGTGAATTTCCAGCTAAAAATAT TCCATCAATAGGGATGCAAATTGTGGATTGAAGTAGAAACAAGAATTTAAATCATACCTTAAAAAAGATAAAGATATTGG TACAACTTAATATAGTAAGCACCTAACAACTCGTTGCAGATTGACGGGCTTAATTGACCAACTTGCTTTAAAAATTTATA AGCTCTATTTGATTATGGTTATCTGTCATAACTAAATGCTTTGACAGAAGCTGGAGCAGTCTATCATAGCTTAATGAATA TTTTTGGTTGTGAAATTTCTAGAACTTTAGATAAAGAAGGCAATCCTTAGTTGACGGTTTTTGTACAAATACTTTATGAT GTTATGTAGAACTATTATTCTAACTGAATGTTTTTAAGCATTTCTAGTGTTTTGATTCTCTTCAAAGCTTGGAGTCTTTA AATCTCAATGGCTGCCAAAAAATATCGGATACAGGAATTGAAGCAATAACCAGTTGTTGCCCTCAGCTGAAAACCTTTTC 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AGTGTAGAAAATGACAAGTCTTGGAACTTACATTGATTTAGTGGATGTTGTTGAAAGCCTACCATAAAGGAATTGAAATG GAAAGTCTATAGTATCCATAGTTAGCTAGTAGTTTCGTTTGTTGAGGTAGTTTTAGTAAGTTTGAGAGAGTTTGTTAGAG TGTGAGAGAGAATGTATCAAATATGAGTGACTTAGAGAGAAATAGCATCTTTAGGTAACCACTAGGGAGGTGTGATAATA CTCTTGAATTACTCAACAACTATTGTAGTTTCTATTCTTGAATATTCAACTTTCTTTTTCTTATTAGCTGGTTCCTATCA AATGGTATCAGAGCTCTATCCAGGAGCTGTGGGCACCGTCGAGAAGGAAATGGCTGGTAAGAAAAGGAAGAATAATAAGT TGTTCACTGCCATCAAAATTGAGTTAGGAAATAATTGCTCTTCTTGGACAAGTGAAAAGAAGATCGCATACTGGAGAAGG GAAATCAATGAGAGAAGACTAAAGGAAGAAAAAGAAAGGAGGAAAACGAAGGTGATTGCAGATTGGAGAAGGGAACTCCA AGAGAGAAGACTGAAGGAGGAACAAGAAAGGTGGGAACCTGGAATTCTGGAGTGAGATGTTCAAACCAGAATCAGAAGAA GGGACCCCCCCCTCCAGAAGGAACAATTTTATTTTTGGGCGTATTGTTGCTGGTTATTCGCCTTAGATGCTGACCCTGTG ATACTCCAAACAAATTAGTTTTGACTTGCATCAATCTCAGCCAGATCAAGTTTGAGAAGTTATCTTTTGTCTGCCCATAG ATTTAGCAGAAGTTCAAAATGTTGACCTATTCAATTCAAATATTCAATTCAGATATTCGTCAAGACCCTCATTAGCTTTT CCTTTTTCTAAAGCATATATTTGTTTCACGCTTAAAGATAATAAGCTTTAGCTTGAGGGGGAGTGTTGAGACCTTGGACC TGCAGCTAGGGCATTTAGTTTATCTAATTTTTTCAACCCGAAGGGTGAAATCTAAGTTTAGCTTATCCATAGAGGAACTT ATCAGTTGATATTAAAGCTAAATGGAGTATCACTTACTTTGCCACAAAAAAATAAAATAAAAAAAAGGCTAAAAAGCACT TTTGGCCCCTGATGTTTCAAATTTGTGCAAATTCTGCCCCTACTATATTTTTGTCGATGTTTCTACCCCTCATGTTTTCA AACAGTGCACCGTCTACCCCTCCGTCAGTCAGACGTTAAAAAACTAACGGAATGAGCTGATTTGGTTTTTGTTTTTTTTT TTTTACCTGCCACGTGGAAATTACAAGTGAAATTGGAAAAATGGGGCATGGGAGATTCAAACTCAAGACCTGTAAGTAGC AAAACATGCATTTAACCAGTTCAATTACATACATAATTGATATATACATCAAACAAATTTAATTTATATCATTTCCTTGA TCATCATCAACTTCATATACTCCTCTTCATCTCTCCAATCCACTCAGGAACCTCTCCTGAGAAAGCCTGACTGAGGGAGG GGTAGACGGTGCACTGTTTGAAAACATGAGGGGTAGAAACGTCGACAAAAATAGAGTAGGGGAAGAATTTGCACAAACTT GAAACATCAGGGGCCAAAAATGCTTTTTAGCCTAAAAAAAACTAATTCTATAGAAAATTATGTTGGTGAAGTATGTTTGT GTACACTATTCTGAATTTGATTCATCTACTTATTCATCTAAAGAAAGTACTTTGATATGATAATTGCAGCAAATTACAGA TCAAGGTATACAATTTGTTGCTGAGAATTACCCAGAACTAGAGTCACTAAACTTGACAAGGTATCTCCAGTGATTTATGT TAAGAATTCATGTGTTTTGTTATGATAGATTACTGTTATGATATATTAGGATAAGTTACATTATTTTGTTATGACAGATT ATGGTTAGATCAAACTTTATTGTTTAGATTTTGTAGTTGACTAGGAAACCTAGTATATAAGTATTTCACTTCTGAATCAA TTATAAATCAACTATTCAAAATATTCCGTTTCAAGATGGTATAAGAGCTTGGTCCATACTCTGCAAGTATTCAACATAGT ATTGTGGATCATCCTCAAATGACCCAAACTCGTCAGTTCTCCACCGTCCTGCATCGGAATCATGTGGTTTGTTTGGACCC ACTTTTGGCTTGTGGATTTCACATTTCAGATTGGATTTGGTTGTTTCTGGGTTGCTGGTTTGTACTGTTTGATTGTTGTC CCTCTTGTTTGGTTGTTTTCCGTTGCGCATAATCTTTTTAAGGGACGTTTTGTTTGGTCTTGTCCTCATGGCTAAATATA AGGAGTATATTCAATTTAAAGCTGCCCAAGAAGTCTCTTCCGCAGCTACTATTCCTCATACTGGTGGTACTTCCATAGTT GGTTTTTCTCACACCAGTTGGATCTTGGATGTAGATTCTGGTGCTTCTGATAACATTGCTGGTAACCTTTCCCTCTTCTC TAAATTATCATCTCCAAAAACACCACATTACATTACTCAAGCTAATGGTTCTAAGGTACAGGCTCCTGGTATTGATGAAG CCTCTCCTATTCCATCTTTGTCTTCAAAATTTGTCTTATTTGTACCAAATTACCCCTTTAATTTAGGGGAATGCTAACTT ACTCCCACTTGATTTTGTGAGGGAGTAAGTTAGCATCCAACACCTTTTTATTTGGACTAAAAACTCCAACCTTCTCTCCT TAAAACCAAATTCAAATGAAGGTTAAATATGTAATTTTGTTATTAGTTATTTAAATTAAAAATCTCATTTTCTCTCTCAT CATTTAATTCCATCCATCTCTCTTCTTCTCCATTGGATTTTTCTCTGATTCCCAATTCATTCTTTCTCTGCTATGTAGCG TTCCATATGCATCTGGAGAAACAAAAATGGTGCATCAAATTAACCCCCCTCGAAACCCCATGGTAATGGTGCACCCCGCT TTCAATCGTTGAACCCGTCCATGAGCATCACCACACAGCCGCTGCCGCTGTCTGAGTCGCGTCGCACTGAACCACTACGT TGTGTGAACCTCGTCGGAACCATCACGGTTGTGCCACCGCTCCGGCCTCCCTTACCGCGAGCTTCCCCTCTCGATCTGAT TGTACACCTATAACCTCCAAGCTTTCACCAAGCAATGGAGTTATCTATTTTAGATTGGATTGGAGATTGAAAATGAAGAT TTAACCATTGATGGCAAGGTTTTGTGAAAGGGAAGAAAGCAGGGAACGATGAAGGGGAAAGTAGAAAAAAACAACTGCAG TTTTGAAAAAAAAAGATTGTTAAATTACTTAATAACCAATAAGTATGTTTTAAAGTTTAAGATAAGGGCTATTTTTGTCT AAACGAAAAGGTGTTGAGCGCTAACTTACTCCTTCTAAAAAACAAGTGGGAGTAAGTTAGCATTTCCCTTTAATTTAATA TAAATTAGTCAACTTACTCGTTCCCTCGATTGTTCTATAACATTTACCTTAGATTCTTTGGTTATCTAGGATATCAGAGT ACAGGGCAAGTGATTGGAGCAGGATTTGAATCATGCGGCTCTACTATCTTCAACGTTCTTCCGCTATATGTGTTGTTGTT GAGTCTCATAACCTTCTTCATCGCCGCTCTGGTCACCCAAGTTTAAACAAATTAAACCAGATGATTCCTAGCCTTCCACA ATTACAGTCTGTTGAGTATGAATCCTGTTGACTTGGAAAACATGCCAGCGTGTCATTCCCAGTTAGAATTAATAAGCAAA CTATATCTCCATTTGAATATTTGTGGTTCAAGTTGTGTTCCTCGATTCCTTCTACTTTGAGGTACAAATATTGTCACATT TATTGATGATTTCTCAAGGTGTACGTGTATATGTTGAATGAAGGATCGATCTGAATTATTTGGCATCTGTGTACCTTCTA CTTAGAAATCAAAAATCAGCTTGGGCAATTCATACGTTGCGCAGTGACAATACTGGAGAAACTTTTTCAGGAGTATTCAA CTCATATATGAAGACCTATGGCATATTCATCAGTCAAATTGTCCTTATACAACCCAAAGGAATGGTGTAGTTGAACGAAA ATGCGACAGACTGAGAAGTGCTCGTACTCTTTTGATCAACGGTGAGAGTGAGACATCTTCGAAATTTTGGCGAGATATCG TTTTTACTGTTTGGTATTTAATAAATCAAATGCCATTGTTTGTTTTGGACTATCAAATTTTTCATTTACTGCTTTATTCA AAGGATCCTTTACATGTTGAACCCCCTCATGTATCTGGTTGCACCTACTTTTTTCATAATCAATCTCAAGGTCTCGATAA GATTTCAGCTCATGCTATATTTGCCTTGGCTATTCTCATGTCCAAAAGAGTTATGGTGTTACTCTCCTGCAGTCCTGCTA CTCATCAATTCTACGCATCTGCGAAAACACATCATATTTTGCCGCCGCCTCAGATGCCTCTTCAATTAACTTAGATTCAG TCCCCAAGGTGCTGCTTACCACCAATCTTGACTTTGTTGTGCCTACTTCTACCACTCCAGAGGTATTAGATAATTCTTCT GGACCACCTAATTCTGATCCTGATCTGCGCCAGTCTGGAAAAACGAATAAGTTTCGATCACAATTTGTTCCTACCACTCC TATTGGTGAGTCCAGTGATTCTACTCGTGCTCCAGTCTCCACTCCTACTTTAGCTCCACCTACCTCTCTGCCCATTCCCA TTTGTAAAGGTGCACATTCTACTATTAACCCTGAACACATTTATTACTTCGTCTCATGTCATCATTATTCTCCCACCTAC TCTACCTTTGTCTCTATTATTTCATCTATCACTGTTGCTAAGACAGTATAGGAAGCTTATCTCATTCAGGATGACGAAAG GCAAAGATTGATCAGATGGTGACCTAGAATCTAACCATTCATGGGTGCTTGTTCCACCAATGGGAGTTCTGCTGTTGGAT GCCAATCAGTCTGTAATAATTTAGTGGGCTCTGATGAACAGGATGATCATTTAAAAGTTGTCCTTGTGGAAAAAGGATAC ATCAAAGTCTATGGTCTGGATTATAGTGCAAAGATTGTCTCAGTTCGTCTGTTCAGCCATGGCTGTCATGAAACATTGGC CCTAATTTCAGTTGGATATTAAAAATGCATTCTTACTTGATGACATAGTATTAGAGTACACTACATAAACGTGTCAAAGA TACTGTTAGTGACTGCTGACTGTGCTAACAGTTAGTTATTGAGTTAGTTATGTTTAGCTGTCAATAACAGAATTAGAATA TTTGAGTACACTACATAAACGTGTCAAAGTTACTGTTAGTAACTGCTGACTGTGCTAACAGTCAGCTATTGAGTTAGTTA TGCTTAGCTGTCAATAACAGAATTAGTTAGTGTTAGCTTGTTCAACAAGCTTTAGAGTTCTTCTATAAATACTGTAATCA TCTCTTGTATTGTTAGCTTTTGAAAATCAATGAGAATCAGTTTTTAGATTAGAGTTTTCAACACATAGACGAGGAGATTT ATATGGACAACCTTTTGGATTTGTTGCTCAAAATTGATCTGGTCTTGTTTGTAAATTGCAAGAGTTCTTATATTAGCCTC GAGCTTGATTTAGTAGATTTAGCAAGGTGTTGCTTAATAGGGAAATTGTAACGACCTCCCCTGAGGTTTATCATTGTCGC ACTGACCTCCCCTCTATTATTTAATAAGACACTAACTACCCTTACTTTATTTAGAACATTGCACTAACCTCCCTTGAGGT TTATTATCATTGCATCATCAACCTCCCATAAGATTTATCATTATAACACTCAACACCCCTCTGTCTTTCTAAATGATATA TGAATATATGAAAGAGGGGAGGTCCGTGCATTTTGCAAACTAGAGGGGGGAGGTCAGTGCAATAATGACAAACCTCGGGG GGTAATGAATGATACTGTTTTACTTTTTTGCTTTAGCAGTTTCATATTGTTTGATTGACCAGTATCTTTTGATGCCCATT ATTTGTTCTTGCGGAGGGGGGTCAACTTTTTTTTGTTTTGTTTCAAGAGCCATTGAAGATGCATTTTATGCCTAAAATAT ATTATATATCAATATTCCAAATGAAAATGAACATTTGGGTGAATCATACCTCCTGGTACTTATATCTCATAATTTGATGC TTAGGTGCATCAAGGTAACTGATGACGGGTTGAAGCCCTTATTGCACCAATGCCTATCGCTTCAGAGTCTGAATCTCTAT GCACTGTCTAGGTAGGTGTTGAAACTGAAAATATTCAAGCTGTCTTGCCCTGGAAATGGATGAACTAACAACTATACTCT TATTCAGTTTCACAGATGCAGCTTACAGGGAAATTTCCCTTCTGACACGTCTCAAGTTTTTGGATCTCTGTGGTGCCCAG GTAAAATCGTGGGTTTTGAAAGATTTCTCTGCACAACCCTATCTAATGCAAACTGCTGATTGAAAAATGTTTGGTGTGCA GAATCTTTCAGATCAAGGACTTCATTGTATTTCTAAATGCAAGGACCTTGTCTCTCTCAATTTGACCTGGTATATTAATC ATCAACCTGAATATCTGTCTTTCTCATTTATGAAAGTAATGGAGCTATATCTAATTTTATGTGATAGGTGTGTGCGTGTG ACTGATGAGGGGGTTATAGCTGTAGCACAGGGTTGCACCTCTCTTGAATTTCTAAGGTATATATCTTAATTTGAGAAATT TGTAGCACTTTTCATATATGGCACTGGATTGTGCACTATTGACTATGAAAATATTTTGTTCCCCTAGTCATGTTACAAAT ATATGTGCTTCTCAAGAATTTAAATATTTGCTTTAAGGTTTCAAGAAACAGCATATGAATGTCCCAGTCCCGTACACTGT TTATAAGTTTGCATACAATGACTAGTACATGGTTTTCATTTTCCAGAGTATTCCCATTTTATCTGTACGGCTAAGAGCAA ACCACACTAGTGAATTAGACACCACATCTTTCACCCAAAACCTTAAGCATTGAGTGTATGGGTAATTTCACTTATATATT GTCCAACACTTCTTTTTTATCTAATGTGGGGCTACTTACTCATACTGGGATTCCAAACACCTGTTTTAAAACCAGTGAAC CATCTATTATCCTGCTCAGCCGAGCACAGGATACTTGTTTAGCATACTACATTTATTGAGGGAGCTTCCTGGTGTAGACT AGATCTGGCTCAAGCTGGTTTGATGAAATTATGCTAGGTTGATGCTTGGAAGCAAAGACTTCACAACAGAGGTTTAAAGG GACATTGTGAAACAATGCATTGTCATACAAAGACACTTGCAGTTGCATGCAAATTCATATATCCTTTTTACAGTGACAGC ACAAAGTGATCTCTATATTAGAGAAAAATCTACTCATGTTTCATTACTCTTTCTGTTAAGAGGGGGAGCCTTTGTCTTGA GTACTACAGGAATACCGAAGATTTGCTCCTTTATTAGTTGTTATGAGATCTCCTCCTGATGTGTGTTTTTTACTTTGAAC AATACTTGCTGATGTGCTGAACATATTTGCAGCTTGTTCGGAATAGTTGGTGTGACTGATAAATGTCTGGAGGCACTCTC AAAGTCCTGTTCGGACAAAATTACGACCCTTGATGTGAACGGATGTATTGGCATCAAGGTAAAATCCAAATTGAAAGTAT CTATGTATTAATTCATATTGAAGATATCCACTTGTTTTATGTTATTTGCCGAAGACCTAACAACCCTCCTCCTTTACCCG GTTGGGACCAGCTATGCAGCATAGGCGGAGTTTAAAGTATCTATGTACATATGAGAAATTACAAGTATAAACTTGACTGT TTTTTTTTCTTTCTAATAGTGCGTTTTCTCCTTTGCAGAAACGAAGCCGTGAAGAGTTGCTTCAGCTGTTTCCATATTTG AAATGCTTTAAAGTGCATAGCTAATGAAAGCAGTCTTTTTAATAATAAGGCATTTGACATGTAAAATTTGCAGATCTAAT CTCAACTCAAGTAATTGTGTTTAGCTTTTCTCCCCCCTTCTCCCCCTGTTTTTTTAGTTAGTTATCAATGTTTTGTGAAA CTGTTAAACAAATTTGTGTTTCTGTGCATTAGAAACCCTTCTAACTAAGTGATTTTATTGATCTAAGTAATTATATAATT GAGTTCAACTAGAATTCTCTACTGCAGGTCTTTTGACAATTAATGTTTTTAACAATGAAGAGCTAAGTTGCACCTTGTCT CAGTTGACTTGAAATAACTATGAAATCATGATTAATGTTTTCTTTGTTAGTAAAAACTTGTCTTCGAAGTTGCGTGTTTC TAAGTACTTCCAAATTATACATCTAACTATCAACTTAATTGATACGTTGTAACGAGTCCTCCCGCTGTCCTATGCTAGGG TTTGATAACTTAGGGTTTTCAACACTCCTTTGATGGCTTGTGGACGAGCATTGGGTGCCTTGATCTATTGCGTCCGATCT TGGTATTGGCTCTAGTCTCTCTTGCTGGTGGAGCCTTTTGGTGGAAAGTGCAGATCAGAAGATGGAGGTGTGGGAAGGTA TCCACTTTACGAAAGAAGAAAGCGAGGCGGTCATTATTGAGAGCAGTAATGAGATCCCAACTTAAAGCAATCTTACAATG TTTTGAACTTGCCTCTGGACTCAAGGTAAATTTTGCTTAAAGTAGGATAGCAAGGAAAGCAGGTATAGTTGTGGTGGAAT CTCATATTCAGCGATGCGCTACCGTGCTTCATTGTAGAGCAATGACTACACCATTTACTTATTTGGGGATCCCAATAGGA TCAAACCCAAGAAGGAAGGACATATGGAGACCATTGATAGACAAGATGAGCAGGAAATTATCAAAACTGAGGCGGAAATC TCTACCTCTAGGAGGTAGAATATGTCTGATTAAAAGTGTTTTATCTTCCCTTCCTCTATTCCTACTATCTTTCTTCAAAG TTGCAACGGGAGTGATTACAAAATGCCAAAAACTTATGAAGGATTTTCTTTACGGAGGATTGGATGGCCACAACAAAATT GCTTGGGTTAAATGGAAGCAAGTGTGCAAATGGCAGGAGCTTGGAGGGTTAGGAATCAAGGATTGGGGGCTGTTTAACAA AGCTTTATTGGGAAAATGGAAGTGGAGATTACTTCATGGGCAAGATGATTTATGGTGTCGGATTCTACGAGTGAGATACC ATGGTGTTGTCCCTAATTCAGCTTCTGTATGGTGGAAGGATTTAAATATGTTATGTTCTAGCAATGAATCAAAGATGCTG GTTCGAAACTGAAATAGTGAGGAAAATTTGCGAGGGCCATGAAACTATTTTGGGAAGACAATTGGTCGAGACCAGAAGCT TTTGCATCGCAATATAGCTGTTTATGCTGCTTGTCCTTACAATGTAACATGGCCTTAAAGGAATTGAGGATTTGGATAAA TAACGAATGACATTGAAAGTTTAGCTGGCGAAGAGAGTTAAGAGGAAGGGGAAATGGTCTTTAGAATCTCTATTGCAGTA AATCCAAAGCTTTACACCAAGAGTCGGTGTGCTAGATCGATGGTGGTGGGCATATATGTAATTAACTTTATGGTCTTGTT TTGTCGACACGAATCCACCAAACACAATGCATAAAATATTATTGTCTTATTCCATTTTTTTTCCATTCAGTTCTATCCTA TTCATTTCCACTATCAAACGCTATCTTAATTTTGGTGGAGC
CDS sequence (LotjaGi5g1v0115500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGAGGAAACAACATCAACGTCAACAGAGTCAAAGGACCATGTTTGGTGCAGAGAGACAGTGCCGAAGGTTTTCAAGCT TGTTTGTTCCACTTTACCTCTCGCTCACACAGACCTCGTTTCTCTCCTCCTCGTTAGTCCCTCGCTTCATCGCACCCTTG TCTCTTGTCAACCCCTTTGGCAGTCACTGATTTTCCGCGAGGTAAATAATGCCGGGAATCGCCTTCTAGCTGCTCTTTCT CTGCCTAGATATCGCTATGTAAAGCAGATTGACCTCGAATTTGCGCGACATGTTGAAGACACACATCTCATTCTTATTAA GGATAAGTGTTTTGATTCTCTTCAAAGCTTGGAGTCTTTAAATCTCAATGGCTGCCAAAAAATATCGGATACAGGAATTG AAGCAATAACCAGTTGTTGCCCTCAGCTGAAAACCTTTTCCATCTACTGGAATGTGAGGGTAACAGATACCAGCCTACTA CATACAGTGAGGAACTGCAAACACATAGTTGATTTAAATATAAGTGGCTGTAAGCAAATTACAGATCAAGGTATACAATT TGTTGCTGAGAATTACCCAGAACTAGAGTCACTAAACTTGACAAGGTGCATCAAGGTAACTGATGACGGGTTGAAGCCCT TATTGCACCAATGCCTATCGCTTCAGAGTCTGAATCTCTATGCACTGTCTAGTTTCACAGATGCAGCTTACAGGGAAATT TCCCTTCTGACACGTCTCAAGTTTTTGGATCTCTGTGGTGCCCAGAATCTTTCAGATCAAGGACTTCATTGTATTTCTAA ATGCAAGGACCTTGTCTCTCTCAATTTGACCTGGTGTGTGCGTGTGACTGATGAGGGGGTTATAGCTGTAGCACAGGGTT GCACCTCTCTTGAATTTCTAAGCTTGTTCGGAATAGTTGGTGTGACTGATAAATGTCTGGAGGCACTCTCAAAGTCCTGT TCGGACAAAATTACGACCCTTGATGTGAACGGATGTATTGGCATCAAGAAACGAAGCCGTGAAGAGTTGCTTCAGCTGTT TCCATATTTGAAATGCTTTAAAGTGCATAGCTAA
Protein sequence (LotjaGi5g1v0115500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MEETTSTSTESKDHVWCRETVPKVFKLVCSTLPLAHTDLVSLLLVSPSLHRTLVSCQPLWQSLIFREVNNAGNRLLAALS LPRYRYVKQIDLEFARHVEDTHLILIKDKCFDSLQSLESLNLNGCQKISDTGIEAITSCCPQLKTFSIYWNVRVTDTSLL HTVRNCKHIVDLNISGCKQITDQGIQFVAENYPELESLNLTRCIKVTDDGLKPLLHQCLSLQSLNLYALSSFTDAAYREI SLLTRLKFLDLCGAQNLSDQGLHCISKCKDLVSLNLTWCVRVTDEGVIAVAQGCTSLEFLSLFGIVGVTDKCLEALSKSC SDKITTLDVNGCIGIKKRSREELLQLFPYLKCFKVHS
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 17 | 357 | 341 | 6.7E-162 | – | |
| PANTHER | 17 | 357 | 341 | 6.7E-162 | – | |
| Gene3D | 30 | 205 | 176 | 1.5E-26 | ||
| SUPERFAMILY | 80 | 347 | 268 | 3.34E-42 | – | |
| SMART | 114 | 139 | 26 | 0.029 | ||
| Pfam | 115 | 136 | 22 | 0.0016 | ||
| SMART | 140 | 165 | 26 | 0.025 | ||
| Pfam | 165 | 186 | 22 | 0.048 | ||
| SMART | 166 | 191 | 26 | 0.0015 | ||
| SMART | 192 | 217 | 26 | 11.0 | ||
| Gene3D | 206 | 357 | 152 | 5.4E-24 | ||
| SMART | 218 | 243 | 26 | 34.0 | ||
| SMART | 268 | 293 | 26 | 2.6E-6 | ||
| Pfam | 268 | 291 | 24 | 0.0089 | ||
| SMART | 294 | 319 | 26 | 21.0 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). |
Expression pattern of LotjaGi5g1v0115500.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…