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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0132900 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0132900.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Histidine--tRNA ligase; TAIR: AT3G10250.1 histidine-tRNA ligase; Swiss-Prot: sp|P34763|NMT_AJECA Glycylpeptide N-tetradecanoyltransferase; TrEMBL-Plants: tr|A0A072VI51|A0A072VI51_MEDTR Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0132900 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:31114497..31128525) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GGCCCACACCAAATAACATTGTTTTGTTATTGTGAAAAAGCTGATCATCGGAGAACGAAGCCAACTCTACCTCCCTCCAC CTCTGTTCTTCTTACCTTTCCCGCATATCAGTCATCATCTTCATCTTCTTCCTCACGCTCTCGCTCTCTTTCTCCTCTCC AGCTGTTGAGGTATGTGAAATCGCTGACATCTTATCTTCTACTTTTTCGTGATTCAATCTCTCTGCGACTCTAATTTGTT TTCTATTCCAACTTTTCATCAAAATTGATTCGGATTTTTTAAAAGTACTTAGGGTTTCATCGCTCTTTCTTTGTTTTGCT TCTTGTTGATCCATCCATTTGAATTTCTATTGGATTGTTGAATTTATTGTTTTTGATTTTATCAATTTACTGTATATGGA GCGCCTTTGGAATTGATTGACAGAACGCGAAATGGTTTCATGAATCGTGTTAAATTGTTAATAGTTGGTTAGAATTTTGC TAAGAAAATAGCTACCGGACTTGGTTGAGCCTAGAGAATATTAATATCTAGTTAGGCAGAGGATTTTACCCATACAATTG ATTAGAGAGGAATGGATTGCATTGAAGTGGTTGTTTTGGTATGAAACAAACTGATTATTAGTTTTTCTATGTACAAACCA TTTGTTCTAATTATTAGTTAAACATTGCAGTATTTTCCCCCCCAAAATAAGTAGAGTAATGTTGCTACTTTCATTAAGTC TCTTCCAATGAGGGAAGAACATTGGACATGAAAGAGAAAGGATTTAAAAATCTGAATATTATTTCTTCTTGAATAATACT ATAGCTGTGATTTACAATATATACATTGATTCTAATAAACGCTAATCTAGGATGTACAGGACTACAGGAAACAAATCTGT TCCAATTATAGAAGTTAAGAAATAAATCTGTCAAAAATATAAAAGGAATCATGGAGTCGCACTAAGAGAGGTCTTTTGGT 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CATTCTCCTTTGGAACTTGTGTTTGCTGATTTATGGGGACCAGCTTCCATTGAGTCCTCTTGTGGATTTTCATACTTTCT TACTTGTGTTGATGCCTATTCTCGCTTTACTTGGATTTTTCCCATTAAGAAGAAGTCTGATACATGTTCTGTTTTCCTTC AGTTTCAAGCCATGGTTGAGTTAAAATTCAGTTTAAAACTTAAATCAGTTCAAACTGATAATGGAACAGAATTTAAGCCT TTAACACCCTATTTCACTAAGTTAGGGATTGTTCATAGGCTTACTTGTCCCTACACACATCATCAAAATGGTAGTGTAGA GCGCAAGCATCGCCATATAATTGAAACAGGTCTTTCCTTGCTAGCACATGCTCATTTGCCATATCAGTTTTGGGATCATG CTTTCCTTGCAGCTGTGTTTCTCATCAACAGATTGCCTACCTCAGTTTTTGGGCAATGTTAGTCCTTACTTTAAGCTCTT CAAGGTGCAACCTGATTATAAGCTTCTCAAGGTCTTTGGCTGTGCTTGTTATCCACATCTCAGACCTTATACTCACTCCA AGTTGTCTTTGAGATCCAAGCTTTGTGTGTTTATTGGATACTCTTCTACACATCAGGGTTACAAGTGCATGGACAATGAA GGCAAGATATACATCTCCAAGGATGTCATTTTTGATGAGTTTACATACCCCTATCATGCACTGTTTAATCCTAATGAGAG TGCAACTTCTGGACAAGGATTGTCTTCTGTTATTCCTCTCATACCTGCTGCTGCACACATTCAGCAACCTAATACTGCTG CTGCTATTTCTGCACCTTCTCCTGAGCACAATGCAGACAGTGTTTCTTCTGTCCAGCAGCAGCCCATGCATTCTCCCTTG CCCTCAGCTTCTTCTGGTTCAGCAGCCCAAGGACATCAGTCATCTACATCTTCTTCTGCTGGTTCTGTTCCTCAACCAGT TGGGAATGTTCACCCTATGCAGACAAGGGCCAAGTCTGGCATTGTCATGCCTAGATTGTTCCCCACCTTGCTTCTTACTC AGGCAGAACCAACAACTACCAAACAGGCTCTTAAGGATCCCAAATGGCAAACTGCAATGCAGGCAGAATATGATGCTTTG ATGGCTAATGGTACCTGGACTTTAGTCCCTCTTCCTAAGGATAGGAAGCCTATTGGATGCAAATGGGTATTTAGAATTAA AGAGAATGCAGATGGAACCATTAATAGGTATAAAGCTAGGCTTGTTGCCAAAGGATATCATCAAGTTAAAGGCTTTGACT ATTCAGAAACGTTTTCACCAGTGGTCAAACCTATTACAATCAGACTTATTCTCACTTTGGCCATCACCAAGCAGTGGCAT ATTCACCAATTAGATGTGAATAATGCCTTTCTTAATGGAGCTCTCCAAGAGGAGGTTTATATGACTCAACCTACTGGTTT TCAGAATTCAGATACTACACTTGTGTGCAAGCTACACAAAGCTCTCTATGGCCTCAAACAGGCCCCTAGAGCATGGTTTG AAAGGTTAAAGTCAGCCTTAGTTAAGTATGGGTTCACACCTAGCAAGTGTGATCCATCCTTGTTTACTTTTTACATAAAA GGTTCAGTCATATACATTCTTGTTTATGTGGATGATATCATCATTACTGGCAATTCTCTGCCTTTGGTACAGCAAGTAGT GCAGAATCTTGACTCTGAATTTTCTCTGAAGCAACTGGGTCAGCTTGATTATTTTCTTGGAGTTCAGGTTCATCACTTGA AAGATAGGTCCTTGCTTTTAACTCAAACCAAGTACATACATGATTTACTTGAAAGAGCTGAAATGGGGGAAGCAAAGGGT ATTTCTACTCCTATGATTGGTGGTGCCAAGTTGAGCAAGTATGGATCTGATTATTTTGCAGATCCAACCTTGTACAGGTC CATTGTTGGTGCCCTGCAGTATGCTACTCTCACAAGGCCAGAAATCAGTTTTGCTGTGAATAAAGTTTGCCAGTTTCTTA GCCAGCCCTTAGAAGATCATTGGAAGGCTGTCAAACGTATTTTAAGGTATCTTAAGGGTACTATTCATCATGGTCTTCAC CTCAATCCTTGTTCCTTGTCCTCTACAGTTCCTCTTGTTGCATTTTGTGATGCTGATTGGGGTTCTGACCCTGATGACAG AAGGTCCACCTCAGGATCTTGTGTGTTTTTTGGTCCTAACTTGGTGTCTTGGAGTTCCAAAAAGCAAACCTTAGTTGCTA GGTCCAGTACTGAGGCTGAATACAGGAGCCTTGCCAATACTTCTGCTGAGTTACTTTGGATACAATCTTTGTTGCAAGAG CTCAAGGTCCCCTTTTCTTCTCCTAGAGTTTTCTGTGACAACATGGGGGCTGTGGCTTTAACACACAACCCTGTTCTGCA CACCAGAACAAAGCATATGGAGCTTGATATCTTTTTTGTCAGGGAAAAGGTGCTGAATGGCTCTCTCTTTGTTCACCATA TTCCTTCTGAAGACCAGCTTGCAGATATTTTTACCAAGGCTCTTTCTCCAACCCGGTTTGAGCTTCTTCGTTCCAAACTC CATGTGGCTGAGAAAATCCTTTCCTCACCACCTTGAGTTTGAGGGGGTCTATTAGAGTACACTATGTAACGTGTAAGAGA AGCTACTGTTAGTTAGCTTGCTGACTGTGTATGCAGTCAGTTATAGGGTTAGTTAGTGTTAGCTGTCATAGTTAGTTATG CTGAGCTGTCATAACAGCTGTCATAACAGAATCAGTTAGGATTGTTAGCTTGATCAACAAGCTAAGTGCTCTTCTATAAA TACTGATGTAATCTCTTGAATCTGAAGCTTTTACAAATCAATGTTAATCAGTTTTCTCATTTACAGTTTTCAACACTCTT 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AGTGATTGAATAGATATACAGAAGTGTTGAATTTAGTTGCCTGCTTCAATTACTTGTTATTTTTATGCACTTGTGTCACT TTTGTTAACAGTATCCCAGAACCCATCGTGCTATGCTGTTGAGCAAGGCAGTGCAACTGCGAAGCCAGAAAATGTGCAAC ATGCTGTTGACTCCAGACTACATAATATGTTTAGTAATGATGTGTCATCGCTCAACACTAGTATGCATGCTGTGGTTGAG ATGTCTGCTCATGCAAACAGGATTGCCAGTCCTTCAAGCATGCGTTCAGCTCAAAGCTCAAGTATGGGTTTGATACAAGG GATTAATGGGGGGATGATCAAATCGGAACCTGGATATTCAGGTAGTCCTTCATACATTTTTGGTCCTGATAGCACTGTCC TGGATGCATGCCCAACTATTGGTGATGGAACGGTTACATCATTCACTAGTGTAAACTCAAACTCTCATTCTATGAATGGG GCCCTCCTGGATCTAGACATTTCTTCATTTGGAGTTTTGGGGCAGATTTCTAGAAATCTCAGCCTTTCAGATCTGACTGC TGATTTTTCTCAGAGCTCTGGTATGTTCTCTCTCCTGTTCATCATTGCTTTCTATATACTTGCTTGCTTGATGGTAATGT GTAAAAGGATGGTCCCTTACTCCCTTATGATTCATGATGATTGTTTGAAGTTTGTGCCTAGCTTTTTTTTTTTTGATAAG CAATGAATTATATATTTAAAATGAAGTACAAGAGGTACTTCAACCCAATACAAGTAGAAGAAAATAAAGCATAAATTTAC AGCAGCTTAAAATGTTTCTACTGCTAGTGATTTCCCTCCATCACCTTGGAGAAGAGACTTTAGAAAAAATGCCTCATTAA AAGCTTACTAGGAAAAACCCCTTGGGATCAAAACCTAGTGAAGGAAAAAGAGTACAAATTTTCCAAAAGCTACAATTAGT CTCCAAGGGGTACTAGAAACAAAATCAGAGGACTGAAAGACCATACAACCAAGGAACCATCGCCCATTCCAAATCAGCCA AGAACCCCTACTACTTGCACCCTTCAACACTAGTCTGAATTATTAATTAAGCACATTATGTTATACTTCACCACATGAAA GCACCTCTCCTTTGATAACATAGCAGCAGCAAGTCCCACGAGTCATATCATAATTTCACAAAGCTCTGCATGCTTGGGGT CTGAGATGGGGTCCGATCATTTGGTTTATTAGCGGTAATTTTTTGTTTTTTGTTTTTCAGACATAATGGAGAGCTATCCA AGGTGTCCCTACCTGGCTACTAATGAGAACTTCCTTGAAAGTTGAGAACAAGGTTAGAAAGCACTACCCCAAAACTCCCG CCCCGCACAGAGAGAGAGAAATTTTGACATTAGTATTATTATGGACTTCCACATATTAAATGCATTACTCAATGTTTAAT TATCAATAACATTGAGGTACATTCTTTCTCTTTTGTTATAAGGGATCCTGTTATCTAAACTAAAGCTAGCTGCTATAAGG CAGAAATAATAAATAAATACATAACAGATTTTATTGAAAACAAGTGCGGCTTCAAACCTCTCTATGGTTCCATTACAATT GCATACAACACATGAAATTGTTTAGGTCATACACTTAATAATAATTGTTTCTTTTTTGCATGCAGGTTGAACAGCTTACT TAGAACGAACTGCTTGTAAATAGAAGTTTAGAAAGAGATTTTCAAATTCCAGCTCTTCGGTGCACAATGTATAGGAGCTC ATTAGCCTCAAACTGTAGTGATAGGAAGTGAAATTTGGAAGGGTTTTCCTGGTCTTAATAAATAATAAATCCTCTTCGTT TATTTTCGCGCTTGTTCTCCCCCTATATTTCTGGTCTTATTTTTCTTTGTTAGATACTTTACTTGCTCTAGTGTGTTTTG ATGATTTTATATTTCTGATTCTATTGTCCTTTGTCAGATGCTTTACTTGCGTTACTGTGTTTTGATGATTTTAATTATTG GTTTAGTCTGCGTGAAACTACTTTTATGAAGATTTACCTGGTAAAACTAACAATCATTAAAGAATTCAGGGAACTCGATG AAATTATTGAACTTTTATTAAACCTTACTGGTTCCATCATTCTGTTTAGAGGTTGGTTGATGCCTGCTTCAACCTTTTTT TTTTAAATTTGGAGGGCTTCAGCCCATGCTTCAATTTTTTTTTTGTTGAAGATGTTTCTATCTCAGAGTATCTCTTTATA TGCACCATGCTTTCTATTGGTGTTTTTATTTTCAAAGTTGATATAGTTACGTTGGCATCCAAAAATTTGTAGCGGAAATT TGGCGGTCGAAAAAAAAAAAGACCGTATAGGTTTAGCCATTGGAAAAATAACAAAATCTATAATCATTGTAGTTGGTACA ATAAAGTGAATCTGCCGAGTACAGGAGCTCAAACGGACAAGAAAAAAGCTTACAGGGTCTTGCACACTAACCAAGTGGTT TTGTTACTTATTAATAGAGAATGTGGTTG
CDS sequence (LotjaGi5g1v0132900.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTCAAGTGGATCTGTGAGACGGGTTTCTCGTGAAGATATCCAGCTGGTGCAAAATCTCATAGAACGATATCTGCAATT ATACATGAACCCAAAAGAAGTTGTGGAAACGCTACTAGTGGAAGCCAAAATCGAGCCTGGTTTTACAGAACTTGTTTGGC AAAAGCTTGAAGAAGAGAATCAAGAATTCTTCAAGGCTTACTATTTAAGGTTGCTAGTGAAGGAGCAAATAACAGAGTTC AACAGGTTGCTGAAGCAACATGCCGAGCTAAGTCAGTTACAATCAGCTGCAGTTGCTTCACTACCTAACTCTAATGGTTC GCATATTCCTCCATTATCCCAGAACCCATCGTGCTATGCTGTTGAGCAAGGCAGTGCAACTGCGAAGCCAGAAAATGTGC AACATGCTGTTGACTCCAGACTACATAATATGTTTAGTAATGATGTGTCATCGCTCAACACTAGTATGCATGCTGTGGTT GAGATGTCTGCTCATGCAAACAGGATTGCCAGTCCTTCAAGCATGCGTTCAGCTCAAAGCTCAAGTATGGGTTTGATACA AGGGATTAATGGGGGGATGATCAAATCGGAACCTGGATATTCAGGTAGTCCTTCATACATTTTTGGTCCTGATAGCACTG TCCTGGATGCATGCCCAACTATTGGTGATGGAACGGTTACATCATTCACTAGTGTAAACTCAAACTCTCATTCTATGAAT GGGGCCCTCCTGGATCTAGACATTTCTTCATTTGGAGTTTTGGGGCAGATTTCTAGAAATCTCAGCCTTTCAGATCTGAC TGCTGATTTTTCTCAGAGCTCTGACATAATGGAGAGCTATCCAAGGTGTCCCTACCTGGCTACTAATGAGAACTTCCTTG AAAGTTGA
Protein sequence (LotjaGi5g1v0132900.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MSSGSVRRVSREDIQLVQNLIERYLQLYMNPKEVVETLLVEAKIEPGFTELVWQKLEEENQEFFKAYYLRLLVKEQITEF NRLLKQHAELSQLQSAAVASLPNSNGSHIPPLSQNPSCYAVEQGSATAKPENVQHAVDSRLHNMFSNDVSSLNTSMHAVV EMSAHANRIASPSSMRSAQSSSMGLIQGINGGMIKSEPGYSGSPSYIFGPDSTVLDACPTIGDGTVTSFTSVNSNSHSMN GALLDLDISSFGVLGQISRNLSLSDLTADFSQSSDIMESYPRCPYLATNENFLES
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 2 | 291 | 290 | 2.0E-112 | – | |
| PANTHER | 2 | 291 | 290 | 2.0E-112 | ||
| TIGRFAM | 14 | 70 | 57 | 1.4E-21 | ||
| Pfam | 17 | 68 | 52 | 6.9E-24 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi5g1v0132900.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…