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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0133500 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0133500.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein; TAIR: AT3G10200.1 S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q84TJ0|PMT6_ARATH Probable methyltransferase PMT6; TrEMBL-Plants: tr|V7BKG9|V7BKG9_PHAVU Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0133500 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:31381843..31393116) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CCGACTCATATTTTACCTAGCTGAGCTCTTACCACTTAAGTACCATTCGGGCGTGACACGGAATTCTAATTCAAACTAAA CAACCACTAAACTAATAAGAAGAAAAAGAAAAAAAGGAAAAAGCGAAGTAAATTTCACCGATCTGAAAGGCTTGGATGCA CACAACTCCAAGCTCTCTTTCTCCCTCCACCACAATGCTCAGATTCAGCGTCTTCCTCTGTTTTCTTTCTCTCTGAACCA TTTTTACAACGAAATCCAGTTGTTGCAGTGAAGAAGAAGAAGAAGGAAGTAGGAACAAAAATGGGAGGTTTTGCCATTGG TTCTGCCTTTGATTCCAAATCTGGGCAGATTATAATGGCTTCTTTGCTTTTGATGATTGTTTCCTTTTATGCTGGCACCA TGTTTGGCAACAATGCTCCCCTTTACATATCTCAGCTCCCTGCCCCTTCTTCTTCTTCAAATTCTACTGCCAACAGTGCC TCATCCAATGGTAAGTAACCTCTTCAGCTCAACTCAAGTTCAATTTTTCGGAATTCTTGATTAGGGTTTCACATTATGGT AGCAATTTCTAATAATTTCATACTAATTTCTCTAAAATATGCTTCTGTTACTAATAATATCAGCTTTTACATTGAGTATT TGATTTTTATTTTAATGGGTAGGAAGATATCAATGTCATTAAGCATTTTCAAATTGTTAGATTCGAGTTAGTGGATATCA ATAGTAGTGTCTTCTATTTGGAATGAATGATTTTAATGCTGTAAAACCCAAGTAGCGTGCTCTTCTCCAAATGGTATCAA CATGTGATTTATTTAAAGACCTTGATTGAGTTCCAAACAGTTTTCAATTACATATCTGGGGGAGGTATCACTGAGTGTAT TATTTGAAAACTTTTGTTGAAAGTTGAAACATGTACTTTCCTATTGCTGCTTTATGACTGATATACGAATATTTCTAACT CTTGTAGGCACTTCCAGATTTGCAAATAAAGTTGCTCTGACTTACCGCAAAACTCCTCTAGTAATTCCTGAAACTGGAAT AGATGTATGCCCTTTGAGGTTCAATGAGTATATTCCCTGCCATGATGTTTCGTATGTGGCAACATTGATCCCAAACCTTG ATGTTTCTAGAAAAGAAGAATTAGAGAGACACTGTCCTCCACTTGAAAAGCGCTTATTTTGCTTGGTTCCACCACCAAAG GATTATAAAATACCTATCAAATGGCCTATTAGCAGGGATTATGTTTGGCGAAGTAATGTGAATCACACACATCTTGCAGA AGTCAAAGGAGGCCAAAATTGGGTCCATGAGAAAGGCCAGCTCTGGTGGTTTCCTGGTGGTGGTACCCATTTCAAGTATG GGGCATCTGAGTACATAGAGAGGTAGCTGTATTTCACTCATTTCTGTTTCCTATTTTCATTTTCTCTAAGGATAGCTGAT GATTTCTTTTTCCTCCAATTAAATAAGCTTATATAGGAAGCATCAGTTGAGGATGATTATATGAAACTGATAAAATGAAT TCTTTTTTCAAACAATGCTAGATGTCAATTTTTATCCTTTTAATACTGCTTATGTTGAATATTATTGGATCTATGCAATG ATTTAGAATACCAAGAAAAAAAATATAAATTGCGTATCTTTTTGAAGACCAAATGAAATCAACTACCTTCAACAATGAAC ACTCTAAGACAAGATCTTCCTCTCGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTGGTTGAAACCTTAACAGAAGAGTGTGCAA TCAGTGTATCTTGGTTATATGATATGACAGTAATCATAGTTTCCACCTATCATGGACCCTAAGTTACTTGGCCTACACCA CAGTTCACCACACTTACTAATTGGGCTCAGCTCCAATAAACATATATACATGGCATCTCAAACCCATAATATATCACATA 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CGTGGTAATTAGTTATTTGATGGCTTTACAAATGCAGGCTTGGACATATGATTACAAATGAGGCTGGCGATCTGCGTTCT GCAGGGGTAGTTCAAGTTCTGGATGTTGGCTGTGGTGTGGCCAGCTTTTCAGCTTATCTTCTTCCCTTGAATATAAAAAC CATGTCCTTTGCCCCCAAGGATGGTCATGAAAATCAGATTCAATTTGCATTAGAGCGAGGGATTGGTGCTATGATCTCTG CTTTGTCCACAAAACAACTGCCATATCCTACTGGTTCATTTGAAATGATTCACTGTTCAAGATGTCGTATAGATTTTCAT GAGAATGGTATTTGGCTTTCCTAATTATGTTTTTATATTGGCATTCAATTGTACCTTTAAATTGGCAGATGATTTCATAT TGACAACAAATGTTTGTATATATTAGCTGACAGCTTACTTAATATTTTGTGGTCAAAAAATAAAAATTCAATGTGGTTTA TTTACTCTTGTTGAGTAAAATGGTACTTTGGTCTGTCCATAGAAATGTATGTCACTTGCAATTTAGTTGGTGTCAGTATA TGTGTACGATTCAGTCCTTACGCAATCCAAACTCGTTTCTTGTTAATGCATGCCTGAGATTGCAACTAGAGTAGCATGAA ACAAGTTTGACTCACTTCACTACCAAATTGTGATATTTTCAGGGACCAATATGTCAGTCTATTCTCTATTCATGTATTAC TGCGGTGCTCCGAAGTTGCTTGGTTTTGTTTCTGTTTCAGCCCTTTAAAAGTTACTAATTAAGTTGATCACAGGCCAATC AATGCATTGTAACTCATTGTTATAAGTCTTTGTATCTCTTCTTTTAATATTGATCTTAATTATTATGTTTGAAATCTGTC CCTGACCATGTGTTGATAATTTGATATTAATCTCCGTTGTTGATATTTCTTTTGGGGCCGCCATTATGAATTATATCAAT TGCTTAGCTGTTGAACTGTGTGACATTTTAACATTGTTTTGGTCTGGTTTGTGCATTCCGTTATACTTCCTTTGTTGGAG AATTATATTTTTAAGATATGACACTTTGAAAGCACTTTGCATTTTTAAGGCTTAAATGCAAGGAATCCCCTCCAACTATT GGTCATTTCAAAACTCAACAACCTGGCACCCTGAACTTTCCAAATCATACACTGATGCGTAAATTTAACCCCATGTGCAT GTGCAGGAAAGCCCACCAACCCTCTTATTGTGTTAATTCATTTTGTTTTCTGCAGATGGGGTTTTGCTGAAGGAGTTGGA TCGCCTTCTTCGCTTCAATGGGTATTTTGTATATTCAGCTCCACCTGCTTATAGAAAAGATAAAGATTATCCTGTCATTT GGGATAAGTTGGTGAATTTAACTGCAGCTATGTGCTGGAGACTCATAGCTCAAAAAATTCAGACAGCTATATGGATTAAA GAAAATAATCCGTCATGCTTTCAGAAAATGGTAGAACAAAAGCTTATAAATGTCTGCGATGCTGTTGATGATTCTAAACC TTCATGGAATATCCCACTCAAGAATTGTGTACAAGTTAGAAATTCTAACTCAGATTCTTACAAGCTTCCTGCAAGTCATG AGCGCTTTTCAGTGTTTTCTGAATACCTGAACAAGATAGGTGTGCCCCTTCTCTTTAAATAAATGCATGAAGCTAGTTTC CACATTTTACATTTTCCTTCTTAAATTATGCTTTTCAACCTATCAAACTGTTGTGCCTTGTAACACAGCACACATCTAAA CTCAGATATTGTCATGAACCAACTATCCTAAAGGTTTAAGTTGGGTGAAAACACAGGAATGATTTTATATTATATTTCTA ATAGTCTTTGAGGATTATTGTTTATTGATCTTAAATGATTGTTTTAATGAAAACCTCATATTGTAACATATATCATGTGT 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TCAAACTCCCACTTTTCTATCTCTTTCGGGTTCCACACACTTAAAGCAGTGAACAACATTTTCCTAGAAAGAGCATCCAC GGCTGAATTTTCTTTTCTCAGTGATGAATGATGATAGTGAATTTCGAAACATACCCAATGAGCTTGGTGGCCCATTTAAA CTGTTCCTCACTAATTGATCATTGAGGAATTTCAAGCTCATTAGGTCTACGAATTATAATCCTCCTTCCTATTTAGTAAT GTCTTCAAAATGCCGTCAATGAAAAAACCAATACATATTTCCTCAAAACAGTCTCAAAACTTCATTCATTAATCCTTGAA AAGCAGAGGGAGCATTGGTCAGCCTAAAAGACATGAGAAGGAATTCATAGTGTGCCTCATGAGTTATAAAAGCTGTTTTA TCTATATGTCCTTATCTTGCATCCTAATTTGACGGTATCCTGATTTGAGGTCCAGCTTAGGAAACATGGAAGCTCCTGCT ACTTCATCCAATAATTCCTCAATAACTGGTATTGGAAATTTATTGGGAATTGTGATTGGGCCATCTTTTTTCTTAACCAA GATTACAGGACTTGAAAAAGGACTTCCACTTGATCTGATTATTCCAGCTTGCAACATTTCTTGAACCAACTTCTCAATCT CATTTTTCTGATGTTCGTGGCCATATGGCTTGACGTTGCGAATAGCAGAACCTTCTTGTAAAATAATTGCATGATCTTGT CTTCTTTTTCGAGGTATCGAATTGTTGAAGCAACTCCTCCACTGGGCATGGAATTAAAGCATCCCCACTGCTGTTTTCCA GAATACCATGACCATTGCTGTTTTCCAGAATACCCTCACAGTCCAGAACAAACTCCTTCTCCAAAAATTTCAGCATTGAT TTTTCTGTTGCTACTGACTTTGATAAAGCTAGTTCTTCTTTGATCTCCACTTCCTTTCCTCCCATCTAGACTTTCATAGT 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AAAAGAAATATAGTTTCGAGGTGTAGGATTAGTGTAAAAGGTGTGCTCTTGATTTTCTGGATAAATTATTCATATCAACA AATATGTAGTTGAGCACTTCCTCAAATTGTCTATATGATGTCTGTGTTCTCTTGATGATCTTGTACATATTGGTATGGAT ATAGAAAGACATTCTCTGCTCTGTGTCCTGTTTTTAAGTTGAGATTGGTAAGAATCTATTAGAAATTAGGAGGCCTATAC TCAACCACAAAAGCTAGCTCAAGAGTTGAGGTTTGCACTACCCTTATAAAGCTTATCTTGGCTCTATCTCTAGCCAATGT GGGACTTCTAACACACCCCCTCACGTCCAGGATTGAACAGACTGGAACGTGGGATTAACAACGGGTGGCCCAATAATGGG AGGTCTCCACAACAAATGGATCTAGGATAGGCTCTGATACCATATTAGAAATTGGGAGGCCTATACTCAATCACAAAAGC TAGCTCAAGAGTTGAGGTTTGCACTACCCTTATAAAGCTTATCTTGGCTCTATCTCTAGCCAATGTGGGACTTCTAACAG AATCAACACATTCAAATCAAAAGGAAAACTATTGCTTAACCGTTCAATTGGGAATTATAATAAATAAGATAGATATTTGC TCATTGTTACGAATACGAAGGAGAAATGAAAGACTTTGGGCTTCTATTATTAATTACCTCTTGTTTTTAATTGATTAAAA CTTGTTTCCTTACGTTTCTTGTGTGTGAACCATCGTAACAAATAGCAGGACTCAGTAAGATAAAACACTCTGGTGCACTC AATTGTCCCTTTCTATATAATCTGATGATCATTTAACCTCCTGAACAACAGGTGTAAGTCCAGATGAATTTACATCAGAT ACTCTCTTTTGGCAAGATCAGATTCGTCATTACTGGAGATTGATGAATATCAAGGAGACAGAAATACGCAATGTGATGGA TATGAATGCCTTTTGTGGTGGATTTGCTGTTGCATTAAATACTTTTCCTGTTTGGGTAATGAATGTAGTTCCTGCAAATA TGAACAACACGTTATCTGGAATATACAACCGGGGTCTTATTGGAACTTTCCATGATTGGTAAGGCTTTACGGGTGATATC CTAATTTGTAGTTACTTGTTTAATGTGTATTTATATTTCGAGAAATGCTAGCAACACACTCTTGTGAACAAACTGTTTGA CACATTCCATGTTATTGATTTATTTTAAAAAAAGTCAACACATTTTTTGAAAACTGAGACAAATGTGTTTACTTTTTTTA AAGTAGGCCAATCATATGGAGTGTGTTGAGTGTATGACTAGCACTCCTCTTATATTTATTATTAGTTGACTGAAGCTAAT ATAGAAATCTTTACATTAGGTGTGAGCCATTTTCTAGTTATCCTCGGACATATGATCTTTTACATGCCAACCACCTCTTA TCCCGCTACAAAACACAAGGGGAAGGTTGCTTGTTGGAGGATATCATGTTGGAGATGGATCGTCTTATACGACCCCTGGT AATCACTTTTCTGAAAGGTTATCTTCATGGTGCTGTGCATATGAAATCATAGTTCATGTGACTGAAATGAAAATAATGAT TTTAGTAAAATCTGATGTAAATGCTTACATATGTATGAAAATTTCTGTTCATGCTTGCTTGATTAGATGCAAAGACATCA TTTTACAGAAATGTCCGACCCTGAAGATTTGATCATTTACCATGAGTCCTTTGATTAAACAAAGTGATACGAACTGGATG ATAATTGGAGCCTTCTTTCTATTTTGGGGTACAAGACACATAGAATTTATTGTTGCATAATGTAGTTGCAAATATATGTC TATTTGTGTACATATACATTCAACTATGTAAAGAGAGGAAAAGGATTCATTATTTCTCTCCCACCTTAATCCCCTTTTGA CCTTATTTCTCCCTATGTTTTTATGGTATGAGTCATAAAGTTCATAACTCGCTGCTCACTTATGATGTGCAGGGATTTAT TATCATTAGGGACGAGGAACCTATCTTGTCAAGAATCCAAGAGGTAGCCCTAAAATTCTTGTGGGAGGTAGAGTCACATT TGCTAGAAAACAAAGAAAAGAAGATGGAAACTGTTCTAATTTGTAGAAAAAAGTTTTGGGCAATCGTCTAGGGAGATTTG ACTTACAAGCTTCTTCCAAGATGGAATTGTTTTTAAACTCTGCTAATTTGTAATGTGTAAGTGTTCTTTATTTACTTTGT TCATTGCTTGATGATCATTTGGTGTACATGTCTAGAGGGCACAATGTGTAAAATTGTACATGATTTGACTCCCACTTTAG TAAAAAAAAAAAAAAGCCTCCCACTTTAGCGACTAGGAATAGAAAATTTAATTTCCCTGTCCCTGTGCTTTAATCTTTGT TTTTTTTTTGTTCTTTCTACATGCATGAATATTAAAGATAAATGTATAAATCAAGTTAGTTTGGAGTCTCTTTAATTTGA AGCTCTTGTTACAATAATTAGCCTTCCAAAGTAAGTCTTTAAAATGGCTATAATTAATGTAATAATATTCGGGTGATATT AATGTCTATGCTGGCTTTTATCGAATGACGACTCAATTAATATAGTATAAATTATAGGATGATAATAATAATCT
CDS sequence (LotjaGi5g1v0133500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGGAGGTTTTGCCATTGGTTCTGCCTTTGATTCCAAATCTGGGCAGATTATAATGGCTTCTTTGCTTTTGATGATTGT TTCCTTTTATGCTGGCACCATGTTTGGCAACAATGCTCCCCTTTACATATCTCAGCTCCCTGCCCCTTCTTCTTCTTCAA ATTCTACTGCCAACAGTGCCTCATCCAATGGCACTTCCAGATTTGCAAATAAAGTTGCTCTGACTTACCGCAAAACTCCT CTAGTAATTCCTGAAACTGGAATAGATGTATGCCCTTTGAGGTTCAATGAGTATATTCCCTGCCATGATGTTTCGTATGT GGCAACATTGATCCCAAACCTTGATGTTTCTAGAAAAGAAGAATTAGAGAGACACTGTCCTCCACTTGAAAAGCGCTTAT TTTGCTTGGTTCCACCACCAAAGGATTATAAAATACCTATCAAATGGCCTATTAGCAGGGATTATGTTTGGCGAAGTAAT GTGAATCACACACATCTTGCAGAAGTCAAAGGAGGCCAAAATTGGGTCCATGAGAAAGGCCAGCTCTGGTGGTTTCCTGG TGGTGGTACCCATTTCAAGTATGGGGCATCTGAGTACATAGAGAGGCTTGGACATATGATTACAAATGAGGCTGGCGATC TGCGTTCTGCAGGGGTAGTTCAAGTTCTGGATGTTGGCTGTGGTGTGGCCAGCTTTTCAGCTTATCTTCTTCCCTTGAAT ATAAAAACCATGTCCTTTGCCCCCAAGGATGGTCATGAAAATCAGATTCAATTTGCATTAGAGCGAGGGATTGGTGCTAT GATCTCTGCTTTGTCCACAAAACAACTGCCATATCCTACTGGTTCATTTGAAATGATTCACTGTTCAAGATGTCGTATAG ATTTTCATGAGAATGATGGGGTTTTGCTGAAGGAGTTGGATCGCCTTCTTCGCTTCAATGGGTATTTTGTATATTCAGCT CCACCTGCTTATAGAAAAGATAAAGATTATCCTGTCATTTGGGATAAGTTGGTGAATTTAACTGCAGCTATGTGCTGGAG ACTCATAGCTCAAAAAATTCAGACAGCTATATGGATTAAAGAAAATAATCCGTCATGCTTTCAGAAAATGGTAGAACAAA AGCTTATAAATGTCTGCGATGCTGTTGATGATTCTAAACCTTCATGGAATATCCCACTCAAGAATTGTGTACAAGTTAGA AATTCTAACTCAGATTCTTACAAGCTTCCTGCAAGTCATGAGCGCTTTTCAGTGTTTTCTGAATACCTGAACAAGATAGG TGTAAGTCCAGATGAATTTACATCAGATACTCTCTTTTGGCAAGATCAGATTCGTCATTACTGGAGATTGATGAATATCA AGGAGACAGAAATACGCAATGTGATGGATATGAATGCCTTTTGTGGTGGATTTGCTGTTGCATTAAATACTTTTCCTGTT TGGGTAATGAATGTAGTTCCTGCAAATATGAACAACACGTTATCTGGAATATACAACCGGGGTCTTATTGGAACTTTCCA TGATTGGTGTGAGCCATTTTCTAGTTATCCTCGGACATATGATCTTTTACATGCCAACCACCTCTTATCCCGCTACAAAA CACAAGGGGAAGGTTGCTTGTTGGAGGATATCATGTTGGAGATGGATCGTCTTATACGACCCCTGGGATTTATTATCATT AGGGACGAGGAACCTATCTTGTCAAGAATCCAAGAGGTAGCCCTAAAATTCTTGTGGGAGGTAGAGTCACATTTGCTAGA AAACAAAGAAAAGAAGATGGAAACTGTTCTAATTTGTAGAAAAAAGTTTTGGGCAATCGTCTAG
Protein sequence (LotjaGi5g1v0133500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MGGFAIGSAFDSKSGQIIMASLLLMIVSFYAGTMFGNNAPLYISQLPAPSSSSNSTANSASSNGTSRFANKVALTYRKTP LVIPETGIDVCPLRFNEYIPCHDVSYVATLIPNLDVSRKEELERHCPPLEKRLFCLVPPPKDYKIPIKWPISRDYVWRSN VNHTHLAEVKGGQNWVHEKGQLWWFPGGGTHFKYGASEYIERLGHMITNEAGDLRSAGVVQVLDVGCGVASFSAYLLPLN IKTMSFAPKDGHENQIQFALERGIGAMISALSTKQLPYPTGSFEMIHCSRCRIDFHENDGVLLKELDRLLRFNGYFVYSA PPAYRKDKDYPVIWDKLVNLTAAMCWRLIAQKIQTAIWIKENNPSCFQKMVEQKLINVCDAVDDSKPSWNIPLKNCVQVR NSNSDSYKLPASHERFSVFSEYLNKIGVSPDEFTSDTLFWQDQIRHYWRLMNIKETEIRNVMDMNAFCGGFAVALNTFPV WVMNVVPANMNNTLSGIYNRGLIGTFHDWCEPFSSYPRTYDLLHANHLLSRYKTQGEGCLLEDIMLEMDRLIRPLGFIII RDEEPILSRIQEVALKFLWEVESHLLENKEKKMETVLICRKKFWAIV
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 16 | 16 | - | – | |
| PANTHER | 8 | 605 | 598 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 8 | 605 | 598 | 0.0 | ||
| Phobius | 17 | 36 | 20 | - | – | |
| Phobius | 37 | 607 | 571 | - | – | |
| Pfam | 97 | 601 | 505 | 2.4E-199 | ||
| SUPERFAMILY | 123 | 330 | 208 | 2.67E-19 | ||
| Gene3D | 194 | 372 | 179 | 3.2E-10 | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Methyltransferase activity | Catalysis of the transfer of a methyl group to an acceptor molecule. |
Expression pattern of LotjaGi5g1v0133500.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…