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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0235700 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0235700.3 |
| Related isoforms 7 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Paladin; TAIR: AT3G62010.1 metal ion-binding protein; Swiss-Prot: sp|Q9ULE6|PALD_HUMAN Paladin; TrEMBL-Plants: tr|A0A0R0E9V4|A0A0R0E9V4_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0235700 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:54384195..54401410) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AAGATGTCGATACCGAAGGAGCCAGAGCAGGTGATGAAGCTAAGAGGAGGATCGGTTTTGGGGAAGAAAACCATTCTCAA AAGCGACCATTTCCCTGGTTGTCAGAACAAGCGTTTGTATCCTCACATCGATGGCGCTCCCAATTATCGCAAGGTAACTA CTACTCTTCTTCTTCTGCTTCCAATTCATTCCAACCTTGCATTGATTACTCTGAACTTTGATTTTCAATTTTCGTTGCTC GCTTTGTTAGGCTGAGTCGTTACATGTTCACGGTGTTGCGATCCCAACCACTGATGGAATCAGAAATGTTCTTCAGCATA TCGGTGCTCAGACCAAACGGAAGGGAGTTCAAGTTCTTTGGATTAGCCTTCGTGAGGAACCGGTACTGTATTGCCATTCT GTGCTTTTCAGCTTCAAATTTGAAATTGAAGTTTCCTGCATATATATATGCTATACAGAAATGAATTGAAATTTGCAGTG TAATCATGAATATGTTTGTTTGGTAATTAGGTCTTAGTGAGCTCATTCTTATGGATGGCATTTTAATTGAACCTTATTTT TAGCTCTGAATATGATTATGGATGCTCTGATTAGATTATTTTCTTTAGAGCACGCCTTCTGAGTTTTCATTCTTGTGGAT GGCATTTTAATTTTTAATTTTTAATTGAATCTTATGTTTAGTTCTGAATCTGGTTATTCATGCTGTGGTTAAATTCTTTA GAGCATGTCTTCTGAGTTTAGTTCTTTTTTTTTTTTTGAATTTAGCTTGTGTACATTAATGGGCGCCCGTTTGTTTTGCG TGATGTGGAGAGGCCGTTTTCCAACCTCGAGTATACGGTATGTTCTGGTGAAATTCTTGTTGCTTTGGATTTTTTATGTT CTTTGGGACTTTGCGGTTGGTGTTTTTGAGGTTTGTCGCGTTCCGGAGGTGGTTGTTAATCGAATGTGACCCGTGTTGTG 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CDS sequence (LotjaGi5g1v0235700.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTCGATACCGAAGGAGCCAGAGCAGGTGATGAAGCTAAGAGGAGGATCGGTTTTGGGGAAGAAAACCATTCTCAAAAG CGACCATTTCCCTGGTTGTCAGAACAAGCGTTTGTATCCTCACATCGATGGCGCTCCCAATTATCGCAAGGCTGAGTCGT TACATGTTCACGGTGTTGCGATCCCAACCACTGATGGAATCAGAAATGTTCTTCAGCATATCGGTGCTCAGACCAAACGG AAGGGAGTTCAAGTTCTTTGGATTAGCCTTCGTGAGGAACCGCTTGTGTACATTAATGGGCGCCCGTTTGTTTTGCGTGA TGTGGAGAGGCCGTTTTCCAACCTCGAGTATACGGGAATTAATAGGGAAAGAGTTGAACAAATGGAAGATCGTTTGAAAG AAGATATTCTGACGGAAGCGGCCAGATATGGTCATAAGATCCTTGTCACTGATGAACTGCCAGATGGTCAGATGGTGGAC CAATGGGAATCGGTGTCATCTAATTCTGTGAAGACACCACTAGAGGTGTACCAGGAATTGCAAGTGGAAGGATACCTTGT TGACTATGAACGTGTTCCTATAACTGATGAAAAATCCCCAAAGGAACTGGATTTTGATATTTTGGTTCATAAAATTTCAC AAGCCGATGTAAAAACAGAGATAATTTTTAATTGTCAAATGGGGCGTGGACGGACTACAACTGGAATGGTCATTGCAACT CTGGTTTACCTCAATCGAATTGGATCTTCTGGTATTCCAAGAACCAATTCAGTTGGTAGAGTTTCTCAATGTTTGACTAA TGTTGCTGACTATATGCCTAACTCAGAGGAGGCAATTCGGAGGGGAGAATATGCAGTCATCAGAAGCTTGATTCGGGTGT TAGAGAACTTACGTGAAGCAATTGCCACCTATCGCAATAGCATTTTGCGGCAACCAGATGAGATGAAAAGGGAGGCATCA CTTTCTTTTTTTGTGGAGTACTTGGAGAGATACTACTTTTTAATATGTTTTGCTGTATACTTACATTCAGAAATGGCTGC TCACCGTTCAAGTTCGGGTGGCCATAGTAGTTTTGCTGACTGGATGCGAGCTAGGCCGGAGCTCTATAGCATTATTCGCA GGTTGCTGAGGAGAGATCCAATGGGTGCACTTGGATATTCCAGTTTGAAACCATCACTAGAGAAGATTGCGGAGTCTACA GATGGCCGCCCTTCTGAGATGGGCGCAGTTGCAGCCTTGAGAAATGGTGAGGTTCTTGGCAGTCAAACTGTTCTAAAAAG TGATCATTGTCCTGGATGTCAAAATCCAAGATTACCTGAGAGAGTAGAGGGGGCGCCTAATTTCAGAGAAGTTCCTGGGT TTCCAGTTTATGGAGTGGCAAATCCAACTATCGATGGTATTCGTTCTGTGCTTCATAGGATTGGTAGCTCTAAAGGTGGG CGCCCAGTACTTTGGCATAATATGAGAGAAGAACCTGTTATTTACATTAATGGGAAACCATTTGTTCTTCGTGAAGTTGA AAGACCATACAAAAACATGTTGGAATACACGGGTATTGGTCGTGAAAGGGTTGAGAAAATGGAAGCTCGATTAAAAGAAG ATATACTACGGGAAGCGGAACGGTATGGTAGTGCCATAATGGTTATTCATGAAACAGATGATGGGCATATATATGATGCA TGGGAGCATGTTACCTCTGATGTGATTCAAACTCCACTTGAAGTTTTTAAAAGCCTGGAGGCTGATGGATTTCCCATTAA GTATGCACGTGTTCCAATCACTGATGGAAAAGCTCCTAAAAGTTCTGATATTGACACAATGACATTAAATATTGCCTCTG CTTCAAAGGACACTGCTTTTGTTTTCAATTGTCAGATGGGTAGGGGTAGAACAACCACAGGTACTGTGATAGCTTGCCTT GTGAAACTTCGAATCGATTATGGGAGGCCCATTAAAATACTGGGGGATGACGTGGCCCGAGAAGAATTGGATGGAGGTTC CTCGAGTGGAGATGAAGTTGGTGGTTATGTTACTGCATTAACTCCTGATAATTTGCTAATAAAAGATGACAAACAAAATC ATGTTTTTGGTATAAATGACATCCTCTTGTTATGGAAGATAACAGCTTATTTTGATAATGGGGCGGAGTGTCGTGAGGCC TTAGATGCTATCATTGATAGATGTTCTGCACTTCAAAACATTCGCCAAGCTGTTCTGGAATATAGAAAAGTATTCAATCA ACAGCATGTTGAGCCAAGGGTAAGAAGGGTGGCATTAAATCGTGGCGCTGAGTACCTGGAACGATACTTCCGTCTTATTG CTTTTGCAGCATATCTTGGAAGTGAAGCATTTGATGGGTTTTGTGGACGAGAATCCAGAATGACATTTAAGAATTGGCTG CATCAGAAGCCAGAGGTGCAGGCTATGAAATGGAGCATAAGATTGAGACCAGGGCGATTTTTCACTGTCCCTGAAGAACT GAGAGCACCACAAGAGTCTCAGCATGGAGATGCGGTGATGGAAGCTGTTGTCAAGGCCCGAAGTGGTACAGTTTTGGGAA AAGGCTCCATACTGAAAATGTATTTCTTTCCTGGTCAAAGAACTTCCAACCAAATACAAATCCCTGGTGCACCACACGTT TACAAGATTGATGAGTACTCTGTGTATAGCATGGCAACCCCAACCATCTCTGGTGCCAAGGAGATGTTGGTATATTTGGG TGCTAATCCTAAGGTGAAAACCTCAGCTGCTCGAAAAGTAGTATTGACTGATCTTAGAGAGGAAGCAGTTGTCTATATCA AGGGTACTCCCTTTGTTCTAAGGGAGTTAAACAAGCCCGTTGATACACTAAAGCATGTCGGAATCACTGGTCCTATGGTG GAGCACATGGAAGAACGGTTGAAAGAAGATATACTAGCCGAGATTAGACAGTCTAGTGGTCTGATGCTGTTTCACCGTGA AGAATACAATCCTTCAACAAATCAGTCTAATGTGGTTGGATATTGGGAAAACATTATTGCAGATGATGTGAAAACACCCG CAGAAGTATATTCATCTTTGAAAGATGAGGGATGTGATATTGTCTATCAGAGGATACCGTTAACAAGGGAGAGAGATGCT CTAGCCTCTGATATTGATGCAATACAATACTGTAAAGATGACTCTGCAGAGAGTTACCTTTTTGTATCACACACAGGTTT TGGGGGAGTTGCATATGCAATGGCCATCATCTGTATTAGACTCGGTGCAGAAGCCAACTTCACATCCAAAGTCCCGCCTC CACTGTTTGGACCACGCCAAGGTGCAGCAACTGAAGAGAACTTTCCCTCCCGAGCTTCTAGTGAAGAAGCACTGAAGATG GGTGACTATCGTGACATTCTGAGCCTTACAAGAGTCCTCATACACGGTCCCCAAAGCAAAGCAGATGTGGACAGTGTTAT TGAAAGATGTGCAGGCGCAGGGCATCTACGAGATGATATTATTTATTATAGTAAAGAATTTGAGAAGTTTACCGATGGTG ATGACGAGGAACGTGCGTATCTTATGGACATGGGAATCAAGGCTTTGAGGCGGTATTTTTTCCTTATCACATTCAGATCT TATCTTTACTGCACCTCTCCTTCCAATATGGAATTTGCTGCTTGGATGGATGGAAGACCTGAGCTTGGTCATCTATGCAA CAATCTTAGAATTGATAAATAA
Protein sequence (LotjaGi5g1v0235700.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MSIPKEPEQVMKLRGGSVLGKKTILKSDHFPGCQNKRLYPHIDGAPNYRKAESLHVHGVAIPTTDGIRNVLQHIGAQTKR KGVQVLWISLREEPLVYINGRPFVLRDVERPFSNLEYTGINRERVEQMEDRLKEDILTEAARYGHKILVTDELPDGQMVD QWESVSSNSVKTPLEVYQELQVEGYLVDYERVPITDEKSPKELDFDILVHKISQADVKTEIIFNCQMGRGRTTTGMVIAT LVYLNRIGSSGIPRTNSVGRVSQCLTNVADYMPNSEEAIRRGEYAVIRSLIRVLENLREAIATYRNSILRQPDEMKREAS LSFFVEYLERYYFLICFAVYLHSEMAAHRSSSGGHSSFADWMRARPELYSIIRRLLRRDPMGALGYSSLKPSLEKIAEST DGRPSEMGAVAALRNGEVLGSQTVLKSDHCPGCQNPRLPERVEGAPNFREVPGFPVYGVANPTIDGIRSVLHRIGSSKGG RPVLWHNMREEPVIYINGKPFVLREVERPYKNMLEYTGIGRERVEKMEARLKEDILREAERYGSAIMVIHETDDGHIYDA WEHVTSDVIQTPLEVFKSLEADGFPIKYARVPITDGKAPKSSDIDTMTLNIASASKDTAFVFNCQMGRGRTTTGTVIACL VKLRIDYGRPIKILGDDVAREELDGGSSSGDEVGGYVTALTPDNLLIKDDKQNHVFGINDILLLWKITAYFDNGAECREA LDAIIDRCSALQNIRQAVLEYRKVFNQQHVEPRVRRVALNRGAEYLERYFRLIAFAAYLGSEAFDGFCGRESRMTFKNWL HQKPEVQAMKWSIRLRPGRFFTVPEELRAPQESQHGDAVMEAVVKARSGTVLGKGSILKMYFFPGQRTSNQIQIPGAPHV YKIDEYSVYSMATPTISGAKEMLVYLGANPKVKTSAARKVVLTDLREEAVVYIKGTPFVLRELNKPVDTLKHVGITGPMV EHMEERLKEDILAEIRQSSGLMLFHREEYNPSTNQSNVVGYWENIIADDVKTPAEVYSSLKDEGCDIVYQRIPLTRERDA LASDIDAIQYCKDDSAESYLFVSHTGFGGVAYAMAIICIRLGAEANFTSKVPPPLFGPRQGAATEENFPSRASSEEALKM GDYRDILSLTRVLIHGPQSKADVDSVIERCAGAGHLRDDIIYYSKEFEKFTDGDDEERAYLMDMGIKALRRYFFLITFRS YLYCTSPSNMEFAAWMDGRPELGHLCNNLRIDK
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 2 | 1090 | 1089 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 2 | 1090 | 1089 | 0.0 | – | |
| SUPERFAMILY | 8 | 246 | 239 | 3.09E-29 | ||
| CDD | 14 | 300 | 287 | 1.7599E-70 | – | |
| Gene3D | 26 | 272 | 247 | 5.8E-67 | ||
| Pfam | 88 | 242 | 155 | 3.5E-52 | – | |
| SMART | 88 | 243 | 156 | 1.8E-77 | – | |
| Coils | 287 | 307 | 21 | - | – | |
| SUPERFAMILY | 411 | 643 | 233 | 8.25E-26 | ||
| CDD | 414 | 728 | 315 | 8.52329E-72 | – | |
| Gene3D | 426 | 652 | 227 | 6.1E-67 | ||
| Pfam | 486 | 642 | 157 | 9.6E-53 | – | |
| SMART | 486 | 642 | 157 | 1.2E-72 | – | |
| SUPERFAMILY | 841 | 1046 | 206 | 7.77E-11 | ||
| CDD | 847 | 1150 | 304 | 9.3445E-23 | – | |
| Gene3D | 859 | 1087 | 229 | 1.5E-35 | ||
| SMART | 923 | 1081 | 159 | 5.8E-56 | – | |
| Pfam | 924 | 1079 | 156 | 3.1E-31 | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi5g1v0235700.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…