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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0236700 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0236700.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Pectin acetylesterase; TAIR: AT5G26670.1 Pectinacetylesterase family protein; Swiss-Prot: sp|Q66GM8|PAE10_ARATH Pectin acetylesterase 10; TrEMBL-Plants: tr|A0A151SS08|A0A151SS08_CAJCA Pectin acetylesterase; Found in the gene: LotjaGi5g1v0236700 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:54448346..54469618) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GTTCAGTTCATAATGAGTATGTTGCTTAGTTTACACGATTACATAATGTCGTGATTGTATGAAAAAGTAAAAGAAAACAT TATAATGAATAAAGAGAACATACAACAATTGTCCACAAGGATCTTGTCTCTGTTTCTCGACTTATGCTTTTGGCAGCTAC AACAAGATAGGGATAGGCTTCATTTTCTCCCAAGAGAAGAGAAAAACGACCAATGCTTCTAACTTACAAGGCAACAGAGA CACTGCCACTGAAGTGAAGAGTGTGATTAAATCAGTGAAGTAGTTGTTATAGCAGTGAAGTGGAGAGTGGCACAAACATG ATGACAATGAAGCTGTTTTTGATTGCATTTGTTTTTACATGCTTAGTTTCTGGGATTGTCTCCTCAAGATCTGTGCTTTC TGACTTAGAAAACGATGCTGTCTCAGCAAAGCCTTTCTCCTCACCACAACCTATTATGGTTAACCTCACTCTTATTCAAG GAGCTGATTCTAAAGGAGCTGGTCTGTCTCTCTCTTACTCTCCCACTCAAATAACTTAATTTGTCAGTGGCTTCTTTGTG TGATGTTCTTCTTTCTTTAAACTACATTCTGATTTCCTCTGTGATTAGTACTCAGTACTTGACATTGCATTCTTTGAAGT ATAGCCTGTGTGTTGAGGATATGAGCCATGCACAGTATGCCCTTTAATGAAATGCAGCATTTTGCAGTTAACCCATTTCT TGTTTCTGATTTTAAAACTGAATGCACTACATTTGAAAGCTGATCCTTTTAGGCCTACCTCGAATTTTAAAATTGTACAA GAGTTTATTCTAAATCTGTTTATTGAACCTACCCGTAAATGTTCAATTTTGCAAATTACACGCTCTAGATATTTAGCCCT AGACGTGAAAGGCGTGTTAAGGTCTCACGTTGACTAGAGAAACTGAGATAAGACCAAATAAGGCATTATAAAGGGTAGAA 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AACCTGGTTATCATTATTAATTTTCTTATGATGTGGACCATGTTTGCATCAGGTCCTAGCCAGTTTAGCCCCACCATCTG CTGACCCCCTTGGCTTTTGGAGTGACTGCAGATCAAACCATGCAAATTGTAACTCATCTCAAATTCAGTTCCTTCAAGGT GTTTATCAATCTCTACTAGTGTGAATTATGCACAGAAATTTATGTACATATCCCAAGACTTTGTGATTTTCCTATAATGA ATGATATATCAACTAATGTGAATCATACACAGAAAATGATGTGTAATAGCAGTTATCTGATTTCCTTGTAACATATTATA TCTCTTCTATGAAGCAGACTTCAGAAATCAAATGCTAGATGACGTGAAAAACTTCTCAAATTCATCTGAAAGTGGACTTT TCATAAATTCTTGTTTTTCTCATTGCCAGTCTGAGAGACAGGAGACATGGTTTGCGGATGACTCTCCCCTTATAGGGGAC AAGGTATGCTCAATTTAGATTTATGTTGTCTTAAGACGGTGCAGTTGGATTTAAGAAATTATGCGGGCTAATGGTAGTCC GTTATATCCTTAATAGAATGTTTGGATTAGTTTCTATTTCCTCGAAATCAATGACACCCAAAAGCTACTCATAAGCTTCT TCACATAATTGATTTTGTCATCAAAATCAATTGTAGAAGGGTTTCCAAACATGCACTTAGACTCCTCTCTTTTTCTTTCA GTTGGGGTAGTGGATATAGTTTGAAAAATAGCTACTTTTTTCTTTGTCCAAGATAAAAGTGAAGCATCTAGAATGCTGTG AACAACAGAGCCAGAGACCAACAAAAATTGAAGTCCAACTCTTTTTCATGAGAAGGGGAAGAACTATTAAAAAACTGATT TGTTTTCTTTTGAATATAAAAGTTTTATTAGTCCAACTCCAACATGAATGACATGAATGCCTTTGTTGAAATATTCACTT GTTCTGCTTTATGATCATTGCTCTTAGATAATAACAATGTTTTATTTTGCAGCCAATTGCTATTGCTGTTGGAGACTGGT ATTTCGATCGAGAAGCTGTCAAATCTATTGACTGTGCTTACCCCTGTGGCAACAATTGCCATAATCTGGTCTTTAATTGA GTCAAATTTTGTTGTCACTTGATATGGTAAAATATGGCATTTACACGTTCATCCTTGTAATTGCAATTTGTGTATTTGGC ATTCATTAATTGTTATGGAAGACCATTCTTGGCTGAGGATCATGTAATTGATCATCTATCATCTAAATTAGTATAATCGA ATATAGAAACATTCAATTAAGATGATAAATTAATGTGGATAGCTACTTGCTACAAATTCTTTTTTTTTCTGCATAATTAG AATATACTCTGGATGATTCTAATGTTAATGTCATCACAAGCTACATCACAAGCAACAATAATTAGCAAAGAAAGCTAGTA TATACTGCCAAAACTTCTCACAAGATAATCACACAATTACCATTATGTATTTACAGCCTCCATGGAAAAGCAATGGACTT TTGAGACAAAATTAGCACTCAAGTCATGTGCAGTATTTGGATGCAGATGCTGCAACCACATGTGCCCACATTTTTAGCCG AGCCTTCACATCTTTTGGATCATCACCTGAATTACAAAGTTTGGGAGAAAAGAAAAAGAGAGAAAACCTGTTAGAAAGAT CAGTTAATTCTTGTTGCTTAATTCAGATTAATCATGAATTGATCACCCTATGAAAAACTGTTAGAATAAGTAATGTCAAT GTGCTATTGAAAGACTTGAGTTATAATTGGAGTAGTGGCTAGCCCTAAGCAGAATCTAGTCTAGCCTAGTGACTCTAGTG TGTAGTTTAGTTACAATTGTGTGCTTGGAACAATGATAGATACACAATTAGGCACGTAAGGTTAGAATTCCTCAACATAT TTGGATCGACTTCTCTTTTATCATAATCAATTATGAAACACTTAAGCTTATTCCTAGAATTAGAAGTGTTTCCAAACATG CAGTCTGAAGAGAGCTTCAAACTTAGAATCATTCCTAGAATGAAAAATGTGAATCTAAGCAGTAAGAACAGTATTAACTA AAAAGAGTTGAAAAATTACCAGGACTAGAGATGCGCCAATTGGTGATGGGTGAAGAACCACCACTGCTAGTGTCAAGTGT GGAATTGGAGAGTGAAACAGAAAGACGAGAAGGCACTTCCAATTCAAAGCCAAGATCTTTACAAGCCTTCACTTCCTCCA AATCCATGCATAGTGATCTCCTACCACCTTTAGGCCTAGTTATCACCCATGTGCTCCCATTTCGATCACTTTCCCGACGC ATTCCCTTAACCACATGCTCCTCTTCCTCTTTCTCATCAATATTGCTCCTATTTTTCTCTGAACTGTTCCACATGCATGT CTCCTTTCTGATTCTCCTTTTCTTTGTTTTTTGTCCCTCATTGTCACTAGCAGAGTCCTTCACAGTCTGATTCAAATGAT AACAGAAACCACTCAACTCATTTTCAGAGTCAGAGCCATCAGAAGAAAACTCCCCATCAGCATCATCACCTTCCCCTTCC AAACTCTCAATTGACATACCTGACAAGTCCACAGCCAAAGCATCATCAAAATTATCATCATCATCAGCACCACACACTGT GCTGCTGGTACAAACAGAAAGCCTGGACAAGTTGTGGGGATGCAGATGGTGATCATGATCATGATGATGATCACCAATAT CATTTTCAAAGTCTTCATCTTGCAAAGAAGGGTGAAGCTGAAAGGCCATGTGGTCATTCATGGTGTAGTGCATATACCAG TAATTGTGTATTTTTTCCAAAAGAAAAAGTGAAGTGAAGAAAACAAGAAGGTAGGCAAGGTACTATAGCAGAGTGAGTGT TGGTGGTTAATTGTGTTATGGTGGCAGTGTGTGAGAGGAGAAGGGGAATTAAGAAGAGAAAAAGAGGCAAATGGAGCAGC GTTTGAAATTGTGTTGGGTATTTTGAATCATTATACGTTTCTCATTTCATGATAAGGCTTAGAACAATAGTAG
CDS sequence (LotjaGi5g1v0236700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGATGACAATGAAGCTGTTTTTGATTGCATTTGTTTTTACATGCTTAGTTTCTGGGATTGTCTCCTCAAGATCTGTGCT TTCTGACTTAGAAAACGATGCTGTCTCAGCAAAGCCTTTCTCCTCACCACAACCTATTATGGTTAACCTCACTCTTATTC AAGGAGCTGATTCTAAAGGAGCTGTTTGTTTAGATGGAACATTGCCTGGTTACCATTTGGACAGTGGATTTGGATCTGGT GCAAATAGCTGGCTTATTCATTTGGAGGGAGGAGGATGGTGTGACACCGTTAGAAACTGTGTTTATAGAAAAAGGACTCG TCGAGGTTCCTCTAAATACATGGAAAATCAAATACAATTCACAGGAATATTGAGCAATAAAGCTGAAGAAAACCCTGATT TCTATAACTGGAACAGAGTTAAATTAAGGTACTGTGATGGAGCATCCTTCAGTGGAGATAGTGAAAATGAGTCAGCAGAA CTTCAATTTCGAGGACAAAAAATCTGGCTAGCTGCAGTTGAGGAATTAATGTCCAAAGGAATGCAGGAAGCCAACCAGGC CCTTCTCTCTGGATGCTCAGCGGGTGGTTTGGCATCCATAATTCATTGTGATGAGTTCCAGAGCTTGTTTCCAAATTCTA CCAAAGTAAAATGTTTGAGTGATGCAGGGTTTTTTATTGATGCAGCTGATGTATCTGGTGGACGCACGTTGAGGAGTCTG TTTGAAGGAGTAGTTCAGCTACAGGAAGTTCAAAAAAATCTGCCTAAGAGTTGTCTCAACCAACAGGACGCAACTTCGTG CTTCTTTCCTCAAAACATTGTCCAACATCTTGAGACACCATTGTTTCTACTCAATGCTGCATATGATGCATGGCAGGTCC TAGCCAGTTTAGCCCCACCATCTGCTGACCCCCTTGGCTTTTGGAGTGACTGCAGATCAAACCATGCAAATTGTAACTCA TCTCAAATTCAGTTCCTTCAAGACTTCAGAAATCAAATGCTAGATGACGTGAAAAACTTCTCAAATTCATCTGAAAGTGG ACTTTTCATAAATTCTTGTTTTTCTCATTGCCAGTCTGAGAGACAGGAGACATGGTTTGCGGATGACTCTCCCCTTATAG GGGACAAGCCAATTGCTATTGCTGTTGGAGACTGGTATTTCGATCGAGAAGCTGTCAAATCTATTGACTGTGCTTACCCC TGTGGCAACAATTGCCATAATCTGGTCTTTAATTGA
Protein sequence (LotjaGi5g1v0236700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MMTMKLFLIAFVFTCLVSGIVSSRSVLSDLENDAVSAKPFSSPQPIMVNLTLIQGADSKGAVCLDGTLPGYHLDSGFGSG ANSWLIHLEGGGWCDTVRNCVYRKRTRRGSSKYMENQIQFTGILSNKAEENPDFYNWNRVKLRYCDGASFSGDSENESAE LQFRGQKIWLAAVEELMSKGMQEANQALLSGCSAGGLASIIHCDEFQSLFPNSTKVKCLSDAGFFIDAADVSGGRTLRSL FEGVVQLQEVQKNLPKSCLNQQDATSCFFPQNIVQHLETPLFLLNAAYDAWQVLASLAPPSADPLGFWSDCRSNHANCNS SQIQFLQDFRNQMLDDVKNFSNSSESGLFINSCFSHCQSERQETWFADDSPLIGDKPIAIAVGDWYFDREAVKSIDCAYP CGNNCHNLVFN
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| SignalP_EUK | 1 | 19 | 19 | - | – | |
| Phobius | 1 | 23 | 23 | - | – | |
| Phobius | 1 | 5 | 5 | - | – | |
| SignalP_GRAM_POSITIVE | 1 | 24 | 24 | - | – | |
| Phobius | 6 | 17 | 12 | - | – | |
| PANTHER | 7 | 411 | 405 | 5.5E-248 | – | |
| PANTHER | 7 | 411 | 405 | 5.5E-248 | ||
| Phobius | 18 | 23 | 6 | - | – | |
| Phobius | 24 | 411 | 388 | - | – | |
| Pfam | 43 | 391 | 349 | 1.8E-162 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Hydrolase activity | Catalysis of the hydrolysis of various bonds, e.g. C-O, C-N, C-C, phosphoric anhydride bonds, etc. Hydrolase is the systematic name for any enzyme of EC class 3. |
Expression pattern of LotjaGi5g1v0236700.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…