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LotjaGi5g1v0249100.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi5g1v0249100
Transcript ID LotjaGi5g1v0249100.1
Related isoforms 2
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein; TAIR: AT1G55770.1 Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor superfamily protein; Swiss-Prot: sp|P83326|PMEI_ACTDE Pectinesterase inhibitor; TrEMBL-Plants: tr|G7JIK7|G7JIK7_MEDTR Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor; Found in the gene: LotjaGi5g1v0249100
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr5:55766755..55782831) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

CAAGCAATGAATGATCAGAGTAACACCTTCAAAACTCAGCTTTGTCATGATGTCGCAGCGTGAGGGTGCTTGCAAAAGGA ACTCTAACGCCTAAGTCAGTAGAGACTTTGACAGGATAATTGTATGGTTGAGAGTGCCTACCTGATGAACAATACATTCC TCTTTTTATAGTGCCAACTCTATTGTCAGGCATCCTAAGGTGCTTGTATCAATACTTTTTATATAAAGGTTGAAAAGGAA CCAAATTTGCTTAATCTTGAAAGTGTGAGGACTTAATTAGCTCAAAAGTACTTAATTTGAAAAAGGGGCCACTCCTTGGG TGCCTTTGTTCCCAGTCTCTCCTCTCCCAAGTTCTCTTGAGTCTTCAGACCTTCTCCTCGCATTCTCTTGTATTTCCTCT TCATTCCCAGATCCGGTGTTTAAAATCCTGGAAGCTCTTTCATCTCGCAGGTAATTTTCTTAATATGTTTTATTTTCAAT TTTCATATATAACACGCTCTTCAATTCTAAATTCTCATTCCACAGTGTCTGATTCTTATCTAAATTGTTATATCCAACAT GCTAACTATTTCAGCTGCATATAAAATCGATTTATAACTGAGATTTCTTCCCTCAATACTTTCATTTAAGAATTTAGATA GTGATTGAAGTACTACAGACACTATGATCAAATTCAACAGTACAGATTTTACAATATCTTTTCTATTTGGTTAATACAAG ATAGATATATTCTACAACTTCTACATGATAGTTGAAGTTAGATCATTACCTTTTCGAATTATTTAAAGCTGAGTTTTGTC ATTGTTCAATTCATACATGTAGCAATACTTAAGCTAAGATGGAATCTCAAGATGAACCTTGTGCCTTGCAAACAGGTAAA TCTTCTTTGAAATTGGGAGCAATTCTAAGGATGGGATTTCTCTCAAAGAAATTCGCAGGCTTCAGTTCGAAACTTGACGA 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CACACAAGCAGTCCGCAATTTTAAAGCAAATATGACTTGTTCAATTCTAGTGGTTCATATTTCATAATTCCTACTAAAAT CTATTTGGATTGGTAACTAGGTCCACTCTTCTTGTTCTCTAGCTGACACGTGAGTTTGGCTGTACTGAAGTTCAGAAATT CTAATGTCTTGTTATGATTAAAAAAACTCTCCAAATGATAAGGTCTCCATCTTTTGTGAATGCCTGGACTTTACAAGTAT CCTTACGCATGATAAGGTTTCTTTTTAATCCACTCTCCTCTGATAGTGAGAGGAGAATAGATAAGAGAATGGATACCAGT TTTAACGTGGCTCACTGCTTAACAAAGACTACATGAACAATTAGCTGAGGAACAAGCAAGAATGGCTGTGATTTAGCTGT TGAATTGCTGCGAACTGGCTCTGAAATAACTTAAATTACTGTCGTTTTAGCTTCGGATATAACTATAATTAGCTGTGAAT TGACTGAGTTAGCTATGGACTTTGCTGCAAAATTGGTTTTCAAATTAGCTGTGAAACTACCTGTCGAAACAGCGAGTTAA CTATGAAATAAACTGCGAATGGCTATCGAGTTGGCTGTGAATTAGCTTTGAATTGGATGCATTTTGGCCAAATAGCTCTC GTACTAGAAAGTTGGCTGCAAAATTTGGACCGTATAAAATTAAGCGGTACTGATTGACAGAACCAGGAAGCGCAACAATT TTCAAGCATCCATGGAAGTTCTTTCTCCTCACATGTAACTTTCTTCTTCTTCGTTCGCAGGCGGCAGGTCCCGTGTATTT ACTCTTGGAAGCTCTTTCACCTCACAGGTAACTTTCTTCCTATTGTTCATGAATTTGGGAAATTTCACCCCTTTCCTCAC ATGCTCTTTAATCACTGACCTTTTTCTTTAATCCTTTACAGAGTCTAAATTCTTATTCTATAAGGTCTGATTCTTTTCTA 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ATTTATATAAGTTAAAAAAGAAGCAGTAAGCGAGTGAGTAGTCTTTTTTTGTCCTACTTGCTTTATTATGTCTGTTGAAT ATCTGTTAGTATTTAGTTTATTATTAGTCCTATCTCATTGAGATATAGTTAATATTTGTTTATCTATTTTAGATTAGTAT CTATTTAAATAGAGATGATATCTATTTAATTAGAGATAGGTTTAGAGAGATTTAGTTTCTTTCTATTTCTTTATTAGTCT ATATATATTGTAGTCTTTAGTCAAGTATTATCAATGAAATATACAAGTAATATTTTATCAAATTCAAGTAATGTTGAGGA TTGAGTATATCATTTACATTTGTTGATGATTCTATGACTGCCATTTGTGTATGTGATTGTGATTGTGAATGAGATGGGAA TAGCTAATTTAGGATATATATGTAAGTAGGCAGTTACAGTGAGTTTATACAGATTTTAAGTATCAAGCACAAGAGTCTAT GTGGTTGTTATCTATCTATCTATATATGTGTGTGTGTGTGTGTATTTAGAGAGAGAATCATGAAAAGTATCTCTTACCTG TTGGACCACACTTGAAGGTTATCATCGCCTCTACTCTGATAAACAAATAAGCCACCAGCCCATTGCTCACTCTTGTTGTA AGGAGTGACCCATAGTTGGTTGTTTGTAAAAGCTGCTCTCTTCTGTGGTGGATCATCATGATCTAGCAGACTAGCTGCTG TGGCACTGGGAACCAATTTGAACCCAACAGGGTTTCCTACCCTTGTCTTCTTGGATGGGTTGACCACATGAAACTCAGAT GGATCATAGAGTTTAAACTTTATTTGAGCATCTTTCTCTGTCTTTGCAACATTTTTCACAGCTTTTAGGTAGCTCTTTCT AGGTGATTCTCCTGGAGAGGTCTCTTGCTTCTTGATATTTACATTGACAAATGAATTCTCAGAGCCATCAATGTCCATAT 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AAAGAGGACTTAAATTTTCTAAAATGAGTTATTCACTTTACATAGAAAAGTAAGGAGTTAGAATTAACTAAAAAAATGAA GGGATTTCTAGCTTGTTATACATGTGCCAATTTAATCTATGACTATAAACCCTCACTTTCCTAACTAAAATTAAGCTTTC AGTTTAGAGTACAAAAAAACTACCAACACTTATAACTTCATGAAACCATAATTAAACACTAGCAGTATGTGTTAGTTCAT ATTGGCATGAGTGAAGTACTTACCATCATGCCAGTGATGGGACACTCAGTATGCCGCCACGCAATGTCACCAGAATATCT CTCAAAAATGCAAATCACATTGGGTTGGACATAGGGTGTTCCATCAGCAGAGGCAAACACAGCATCCATGTAGTATGCAT TCCTTGGGCAATCATTCAAGGGGTCTAGAGGCATTGCCTGCAACCCAAATCCATACTCACCCGCATCCATGTATGTCTTA AAGTACCACCCATCAGTGGGATCCATGTAAGGCACAAATAGCTCAGATGTGAACCCTTTGTACATGACATTTCTCAGCTT TGATGTATCTGGGTCTCTCACCTTAGCTTGAGAAATGATGGTCCCAGCTCTTGGGTCAGGTTTCACATGAAATTCCCAGT TCGCCCATTTAACTAAGTTCCCCTCAACTGTGAAGCTTGGACCTTTTGGTTGTTCCAAGGATATTGGATTTACTAGATTA AACTCTCCATTGAGCTTCTGAATGGAGTAGCGATAGTCAGTGTTAATGCCTTTGGCCACAGGAATGTTCTTGCCTTGATC TGAAATGGATACCACTTCTTTCCTGTCCATGTCAACCAGCACAGTTAGCCCCTCAATGGGTTTCATGTAGAAATTCACAG TGCCTTCTCTGGAATAGCACTGCACCTTGATAAACCTTGTGTTTTCTTCCACTGGTGTCCCATACCACCCTGAAGAGATT GGCAGGCATGCAAGGTCTGCCATATTGACACCGCGTTGAGTAATCGTGCGGTTGAACTCATTGCTCTTCAAGGGAACGTC AAGTACCGCCCACATCTCCTCCATAGTCATGATGGGGTACCCGGAAACCGTCTTTGTTTCATGGCTGGTCACCGTGCTTG TGCTGAGGTCTACGGTGAGCATGTGAGTGACACCCTGCACAATTGCAACTACAGAAGCTTTCCTTGGTGGGAGGGGATCA CCTTTTTCCCATCTCAGGACAAGTTTTTTGTCTGGTTCTTCAAGGACAATGGAATTGAGAGTGTAGCTGGATGTGGACTT AAAGAGAGGGTGAGTGGAGAGGATAGTGCGAACCTTGTTGAATTCTTGGATGGTTAGAGGGTCTAGAGGGTGGTGAGGAG CATCGGATTCATGGTTTTGCTTTTTGGAGGATAATGTAGGTTTCTTGATCAGATTAGACTCTGATGAAGAATGAATCCTG TTCTTTGAGGTGCACCATCCAGAGTTGCAGTCTAGAGCCTCCTTGTTGGGGAATGATGGAAGGAGAAGCCGAGTTGTTAC AAGCAAAACTAGTGCTACACTGATTGAAAGAACCAGAAAGCGCAACAAGTTTCTAGAATCCATGGATATCACTCTCTGTC AAGAAGAATGAGTTTTTGCATATGATACTTGTTCCTTTAGTAGAAATTATATAGAGAGGCTGCCCAGTTCTTACAAATGG GAGTTGGTCATGTGATTCCTGCATAGAGATTTGGAAATAGCATAGTTTAGTCAGCTAAACAAAGTATAGTAGGAATCTTA ATTCACTATGACCCCCTGCTCATACAGAATCTCTGTCTCCCCACTAGTCCATTTGACAGCAACCAAAGACACTTGTTATT AAATAGATTTGCAGTAACAATTACTTGAAAATAGTATAGTAAAAAAGCAAAATTCACATTTTTTTTCTTTTGCAGAGACA 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AGCAGATGATGGCCACGTAGATTATTTCGCATCAATTTTAGTCCCTGTAAATTTATAAATCATACTTTTAGTCTCTCTTC TTCTACCACCATCTTCTTCTTCTTCCACCACCATCTTCTTCCTCTTCCACTTTCATCTTTTTTTCTTCTTCAATTCTCAT CCAAATGTTGAAATTCTTGTTCCTTTAAGCTTCTAGGCACTTGCATGCTTCATCTTCTTCCTCTTTCATCTTTATCATCT TCTTCCATAATTTTAATTTTTAAGAATATAACCAACAAATTTTAACTTGCAGATGAGAATTACATCCATGTATGTTTACA GTAATCATATAAATTGCTGTAATTTTTTTCTTAATTTGCTGGTTATGGATTGAGGAGGAAGAGGAACATAAAGAGAATGA AGGAGGTAAATGAGTGTGGGAAAAAGATTATGGGTTAAAGGTTGTGGTCTGAAAACATTCAGGGCAGAGGATGAAGGAGG TTGATGAAGAAGGTAGAGTACTGTGGTAGTGGAAATGAGGGATTGAAAATATGATTCAAAAAACTATCATAGACAAAAAT TGATGTGAAAAAATCCATGTGGATACCATTTGCTGACTAGGCTCGCCATTGAACCGTTGACTAGTCAAAATTGAGCAAAA TGACTTAATTTGATTAAAAAAATAATTCAGGGATTAAATTTCAAAGAAAAATTTTCTAGAGACCCAATTTGATTCCCTTT ACAATCTCAAGGACCAAAAACATATTTAAGCCTATAAAAAAAATAACAAATTACTATTAAAAGTTTGAAAATACATCATA TTGTGGGGGCACTTTCTACTTTGTGGGGGGGGCATTTTCTACTGTGAGCGGATAACATAACACTTACTATCTTAATACTC TAGTATACCATGACTATATTTTTAAAATCATGCGAGATATTGATAATGTAGGACTAAATTAATGTAGATGAATCATATAT TTGAATATGTTATGTGTTTAAATCATTAGAATGCAAAAAGGTTCAACAATGAAATATAATCCCAACAAGTTCTCATACCT ATTGTTTCTCAATCATTTTACATGTTTTCATTTATATTTTAATGTTTCAATAAGCCAACAATCAATTTATTGTGAATCTT TCATTTGAATATGCAAGCTATGAACGACATCAATATCACATCTCATATTGAGGACGATGAACTCGAATTTGCTCTTTATC AACAGGTGAACATCTTGTTGGGGGAGACAGGGGAGCCTATGGGCCGAGGAGCAAGACACCAAGAAATATCGACGCCACAT CTTAACTCAAAACCTTAAGGCATTAGGTTTATGAGTCCATCTCCTTATAAACTCTCCCTCTTACCTTGACTTCTTTGATG TGAGACTTGACTCTAACACTTGATTCCAACACATCTAATAATAATTATTAGATTTTTTTTATAATACTTTAACTCTTATT TGTTTTACAAGTATTATTTTAAATTCTGATTATATTCACATAATTTTCACAACACGCAGAATGTCTAGTAGTGTAGCCGA AAATAGGAAAGCCATGAGTGATCAAAATTCATCCCATGTTCTTGAACTCTCTCTATCCCCAAATTAAGCTTTGGAAGGAA ATAAATAACCATCCAAAACAGAGGGCCAAGCGCATCTCTCCCATTACGACCACTTAACCTTCCTCTGAGCAGTTTATAAA CAGAAACCAACATTGCATTACAGAATACTAGACAAAAAAAAATGGAAACCATTGCAAAACGTTGTTTATCGCTGATCTTG ATGACAACATGCCTCATTTTAGTGCATCACCAAACCGCTGCAGCTAAGGAACTCAAAGGCAAAAAGCTAATTGAAAAAGT ATGTGCAGACACACCTGACAAGGCTGCCTGCATTAAGGTGCTATCTTCGGACCCAACAAGCGCAAAAGCCAGCCTAACAG ATCTAGCAATGATGTCGCTGAAGATGGCGGCGGCAAACGCGACGGGGATACTAACCGACGCCAAGATGATGATTGATAAT CCTGATTTGGACCCTGATGTTCAACAGGGCTTGGCTGACTGCAAGGAGACGTTGTTGGATGCTGAGGGTCAGCTTGAGGA CACTGTCGCGGCGCTTTTGAGTGGTGCCAAACATGATGCTCAGCTGTGGCTGCGCGCGGCGCTGGCCGCCATTGATACCT GTGATGCGTCGATCCCCGGTGCTGATGATGTTCTCTCTAAGAAGAGTGTTGGGTTTCGCCAGTTGTGCAATATTGCCTTG GCCATCAGCAAGGCCCTAGCTCATGAATCCTAATTCGAGCTGGTAGGAATTAGGATCTTTATGAGCCATAAAGGCAAAAC TCTTTCGTATAAAATATTTAACGTAGCTGTATTTACAAAGACCTCTTAACTAGAATTTCTCAGCACGTTGGTTTTGTACT TTTATTTAGTAGATCATAATATTGAATATTGAACTATATATGTTGTTGGTGGTTTGTTTTGTACTTTGAAGAGAAATGCA TAAGAATTCATGGAGCAAATAGAGAGAGCCGAGACACCAATGTTAATTAGTGTTATCTTTGGGTTGAAACAAGTCTTACA TTATTATGTTATGTATTCAACATAGCAAATCATAAATGTAAACTTAAAATAACACCAATTATTTTATTAAAGACAGT 

CDS sequence (LotjaGi5g1v0249100.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGAAACCATTGCAAAACGTTGTTTATCGCTGATCTTGATGACAACATGCCTCATTTTAGTGCATCACCAAACCGCTGC AGCTAAGGAACTCAAAGGCAAAAAGCTAATTGAAAAAGTATGTGCAGACACACCTGACAAGGCTGCCTGCATTAAGGTGC TATCTTCGGACCCAACAAGCGCAAAAGCCAGCCTAACAGATCTAGCAATGATGTCGCTGAAGATGGCGGCGGCAAACGCG ACGGGGATACTAACCGACGCCAAGATGATGATTGATAATCCTGATTTGGACCCTGATGTTCAACAGGGCTTGGCTGACTG CAAGGAGACGTTGTTGGATGCTGAGGGTCAGCTTGAGGACACTGTCGCGGCGCTTTTGAGTGGTGCCAAACATGATGCTC AGCTGTGGCTGCGCGCGGCGCTGGCCGCCATTGATACCTGTGATGCGTCGATCCCCGGTGCTGATGATGTTCTCTCTAAG AAGAGTGTTGGGTTTCGCCAGTTGTGCAATATTGCCTTGGCCATCAGCAAGGCCCTAGCTCATGAATCCTAA 

Protein sequence (LotjaGi5g1v0249100.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

METIAKRCLSLILMTTCLILVHHQTAAAKELKGKKLIEKVCADTPDKAACIKVLSSDPTSAKASLTDLAMMSLKMAAANA TGILTDAKMMIDNPDLDPDVQQGLADCKETLLDAEGQLEDTVAALLSGAKHDAQLWLRAALAAIDTCDASIPGADDVLSK KSVGFRQLCNIALAISKALAHES 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
SignalP_GRAM_POSITIVE 1 28 28 -
Phobius 1 7 7 -
SignalP_EUK 1 28 28 -
Phobius 1 28 28 -
SignalP_GRAM_NEGATIVE 1 28 28 -
TIGRFAM 8 179 172 6.9E-34
Phobius 8 20 13 -
Phobius 21 28 8 -
Phobius 29 183 155 -
SMART 32 175 144 1.2E-24
Gene3D 33 181 149 1.2E-32
SUPERFAMILY 34 179 146 4.19E-29
CDD 36 179 144 2.33955E-41
Pfam 36 175 140 2.4E-26
PANTHER 40 177 138 1.2E-30
PANTHER 40 177 138 1.2E-30

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Enzyme inhibitor activity Binds to and stops, prevents or reduces the activity of an enzyme.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi5g1v0249100.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…