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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0249100 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0249100.2 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein; TAIR: AT1G55770.1 Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor superfamily protein; Swiss-Prot: sp|P83326|PMEI_ACTDE Pectinesterase inhibitor; TrEMBL-Plants: tr|G7JIK7|G7JIK7_MEDTR Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor; Found in the gene: LotjaGi5g1v0249100 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:55766755..55783225) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GCATTTTCTATTATTGGATATGCTTTGGTTCTTAGTTTCTCATTATGGTAGATGTGCATTGTAATTTTGGCTCATTGTAA AGGGTGTTCTTGAAAAACATTGAACGATTCCCTGCATTTTGTAGAAATGTTTTGTTAAAGTCTCTTCAATCTTTTTGGTT CTATCACCAAACGCGTAGGTCAACTGATACGAGGTTGTTATACTTATGAAGGGTTCTTGAATTCAAGTCTCTGTGAATAC AGCTGCATTGCATACTTAGTAGGGAGAGTTTTGCTACCCATAGTGTCATTTGGTTCATACAAGATTGTATCACTAAATAA TACATGTGGTTTACATTTTGTAGAGAAATTGAGTGTTCGGTAGTGTTTATACCGGTATCAAAAGGATTCGTGCCCAAGCA ATGAATGATCAGAGTAACACCTTCAAAACTCAGCTTTGTCATGATGTCGCAGCGTGAGGGTGCTTGCAAAAGGAACTCTA ACGCCTAAGTCAGTAGAGACTTTGACAGGATAATTGTATGGTTGAGAGTGCCTACCTGATGAACAATACATTCCTCTTTT TATAGTGCCAACTCTATTGTCAGGCATCCTAAGGTGCTTGTATCAATACTTTTTATATAAAGGTTGAAAAGGAACCAAAT TTGCTTAATCTTGAAAGTGTGAGGACTTAATTAGCTCAAAAGTACTTAATTTGAAAAAGGGGCCACTCCTTGGGTGCCTT TGTTCCCAGTCTCTCCTCTCCCAAGTTCTCTTGAGTCTTCAGACCTTCTCCTCGCATTCTCTTGTATTTCCTCTTCATTC CCAGATCCGGTGTTTAAAATCCTGGAAGCTCTTTCATCTCGCAGGTAATTTTCTTAATATGTTTTATTTTCAATTTTCAT ATATAACACGCTCTTCAATTCTAAATTCTCATTCCACAGTGTCTGATTCTTATCTAAATTGTTATATCCAACATGCTAAC 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GATGTCTTCACAAGTCACATTAGGCACTAAAAACAATTTGCACACTAAATTGGTTTAACTAAATCCAAACTATACCTCAA GGAAATGGTAAATAAAGATTAAATTCTAAAAAACTATTGTGCAGCGGAAAACTATTGAGCAGAACTTCGGATTGTAGAGA GTAGAATATTTTTTTTCTTTAAGCATAAGATTCATCATACGTTATCAAATATAGAAAGCTGTTGAGAAAATAACTCCTAG AAGCATTTTTCCTAAAACCACATGAGTGCAGACTATACTTCTAAAGTTTAGTTATGAAATGCCACATCAGTTGTATTGAA TTAAAGTTTTATTGAAAATGCTTTAGCATTGTAATTTTCTATCAGTGTCATAGTAGTTGATTTCATCTAAAGCAATTTAT ATAAGTTAAAAAAGAAGCAGTAAGCGAGTGAGTAGTCTTTTTTTGTCCTACTTGCTTTATTATGTCTGTTGAATATCTGT TAGTATTTAGTTTATTATTAGTCCTATCTCATTGAGATATAGTTAATATTTGTTTATCTATTTTAGATTAGTATCTATTT AAATAGAGATGATATCTATTTAATTAGAGATAGGTTTAGAGAGATTTAGTTTCTTTCTATTTCTTTATTAGTCTATATAT ATTGTAGTCTTTAGTCAAGTATTATCAATGAAATATACAAGTAATATTTTATCAAATTCAAGTAATGTTGAGGATTGAGT ATATCATTTACATTTGTTGATGATTCTATGACTGCCATTTGTGTATGTGATTGTGATTGTGAATGAGATGGGAATAGCTA ATTTAGGATATATATGTAAGTAGGCAGTTACAGTGAGTTTATACAGATTTTAAGTATCAAGCACAAGAGTCTATGTGGTT GTTATCTATCTATCTATATATGTGTGTGTGTGTGTGTATTTAGAGAGAGAATCATGAAAAGTATCTCTTACCTGTTGGAC 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TGGTATCCATCACTAGATGGCAGAACACATTACCTGCTCTGTTTAAGCTATAACTTTATGTGTTGTATCAGAATTGTTAT TGTCAAATGAAACTTTTTACATTTTTGAACTGCTCATTTTGGCCAACAATTCCCTAAGCAAGAAAAATCAAACTAAGTTG AACTTCCATCACTAACCTTTGCTCTGATTAGTCCATCAGTTTGAAACTCCCAATCCATGATATAGTCATAGTTCGCCACT GCTACTGCAATCCGAACCACTAGGGACACCTTTGGCCTCACTTCCGTAACCTACCAAAACATCATGAATTCAAGTTAAAA TGTATGTATCGAAATGAAAATATCACTGCGCATGCAGATTAACAAGTTAAAGATAAAATCTTTAGAACCTGGGCAAAGAG GACTTAAATTTTCTAAAATGAGTTATTCACTTTACATAGAAAAGTAAGGAGTTAGAATTAACTAAAAAAATGAAGGGATT TCTAGCTTGTTATACATGTGCCAATTTAATCTATGACTATAAACCCTCACTTTCCTAACTAAAATTAAGCTTTCAGTTTA GAGTACAAAAAAACTACCAACACTTATAACTTCATGAAACCATAATTAAACACTAGCAGTATGTGTTAGTTCATATTGGC ATGAGTGAAGTACTTACCATCATGCCAGTGATGGGACACTCAGTATGCCGCCACGCAATGTCACCAGAATATCTCTCAAA AATGCAAATCACATTGGGTTGGACATAGGGTGTTCCATCAGCAGAGGCAAACACAGCATCCATGTAGTATGCATTCCTTG GGCAATCATTCAAGGGGTCTAGAGGCATTGCCTGCAACCCAAATCCATACTCACCCGCATCCATGTATGTCTTAAAGTAC CACCCATCAGTGGGATCCATGTAAGGCACAAATAGCTCAGATGTGAACCCTTTGTACATGACATTTCTCAGCTTTGATGT ATCTGGGTCTCTCACCTTAGCTTGAGAAATGATGGTCCCAGCTCTTGGGTCAGGTTTCACATGAAATTCCCAGTTCGCCC ATTTAACTAAGTTCCCCTCAACTGTGAAGCTTGGACCTTTTGGTTGTTCCAAGGATATTGGATTTACTAGATTAAACTCT CCATTGAGCTTCTGAATGGAGTAGCGATAGTCAGTGTTAATGCCTTTGGCCACAGGAATGTTCTTGCCTTGATCTGAAAT GGATACCACTTCTTTCCTGTCCATGTCAACCAGCACAGTTAGCCCCTCAATGGGTTTCATGTAGAAATTCACAGTGCCTT CTCTGGAATAGCACTGCACCTTGATAAACCTTGTGTTTTCTTCCACTGGTGTCCCATACCACCCTGAAGAGATTGGCAGG CATGCAAGGTCTGCCATATTGACACCGCGTTGAGTAATCGTGCGGTTGAACTCATTGCTCTTCAAGGGAACGTCAAGTAC CGCCCACATCTCCTCCATAGTCATGATGGGGTACCCGGAAACCGTCTTTGTTTCATGGCTGGTCACCGTGCTTGTGCTGA GGTCTACGGTGAGCATGTGAGTGACACCCTGCACAATTGCAACTACAGAAGCTTTCCTTGGTGGGAGGGGATCACCTTTT TCCCATCTCAGGACAAGTTTTTTGTCTGGTTCTTCAAGGACAATGGAATTGAGAGTGTAGCTGGATGTGGACTTAAAGAG AGGGTGAGTGGAGAGGATAGTGCGAACCTTGTTGAATTCTTGGATGGTTAGAGGGTCTAGAGGGTGGTGAGGAGCATCGG ATTCATGGTTTTGCTTTTTGGAGGATAATGTAGGTTTCTTGATCAGATTAGACTCTGATGAAGAATGAATCCTGTTCTTT GAGGTGCACCATCCAGAGTTGCAGTCTAGAGCCTCCTTGTTGGGGAATGATGGAAGGAGAAGCCGAGTTGTTACAAGCAA AACTAGTGCTACACTGATTGAAAGAACCAGAAAGCGCAACAAGTTTCTAGAATCCATGGATATCACTCTCTGTCAAGAAG AATGAGTTTTTGCATATGATACTTGTTCCTTTAGTAGAAATTATATAGAGAGGCTGCCCAGTTCTTACAAATGGGAGTTG GTCATGTGATTCCTGCATAGAGATTTGGAAATAGCATAGTTTAGTCAGCTAAACAAAGTATAGTAGGAATCTTAATTCAC TATGACCCCCTGCTCATACAGAATCTCTGTCTCCCCACTAGTCCATTTGACAGCAACCAAAGACACTTGTTATTAAATAG ATTTGCAGTAACAATTACTTGAAAATAGTATAGTAAAAAAGCAAAATTCACATTTTTTTTCTTTTGCAGAGACACATGCA GTGTAATAGTAGATAAGCCCCACAGAAATTGAGTACCCACTTAAACAAGTCATGATCACTTCATTGAACAGACAAATTAA GACTATATCACCACAGGTAACAACTAATGAAAAAACATGCACAACATCAGCAGCTGAAACATCTTGCAAAAGAATCATAC TCATAACAGTTTCACAGTATCCAAAATCACAACTTCAGTAACTTTTTTGTTTTAGTTTTTCAGCTCCACCATGAAAACAT AAACCACTAACTGAGATTGAAAGATACAAGTTTCCATACATGACTGCAAGTTAAAATTTAGAACAGAGATAAGAACTAAT GTCACCACTCACCTGCGACCAGAGCTATGCATAGCTGATCACCCAAATCCTCACTTCTCCTCTCCTCTTTGGCTTCTTTT GCCTTTAGATATTTGGCTATGACTAGTCTTATGTTTCTATTATAGCACAGAAAAGTCCAAGAATCTGTGACTGTGATGAA ACGGTGAAGTTGAGGTCTACCAAATCTGACGTAGTGAATTGTCTTTGCTGCTGATAGTGCGCGATGAGGATTGAAAATAT 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GAAAAAATCCATGTGGATACCATTTGCTGACTAGGCTCGCCATTGAACCGTTGACTAGTCAAAATTGAGCAAAATGACTT AATTTGATTAAAAAAATAATTCAGGGATTAAATTTCAAAGAAAAATTTTCTAGAGACCCAATTTGATTCCCTTTACAATC TCAAGGACCAAAAACATATTTAAGCCTATAAAAAAAATAACAAATTACTATTAAAAGTTTGAAAATACATCATATTGTGG GGGCACTTTCTACTTTGTGGGGGGGGCATTTTCTACTGTGAGCGGATAACATAACACTTACTATCTTAATACTCTAGTAT ACCATGACTATATTTTTAAAATCATGCGAGATATTGATAATGTAGGACTAAATTAATGTAGATGAATCATATATTTGAAT ATGTTATGTGTTTAAATCATTAGAATGCAAAAAGGTTCAACAATGAAATATAATCCCAACAAGTTCTCATACCTATTGTT TCTCAATCATTTTACATGTTTTCATTTATATTTTAATGTTTCAATAAGCCAACAATCAATTTATTGTGAATCTTTCATTT GAATATGCAAGCTATGAACGACATCAATATCACATCTCATATTGAGGACGATGAACTCGAATTTGCTCTTTATCAACAGG TGAACATCTTGTTGGGGGAGACAGGGGAGCCTATGGGCCGAGGAGCAAGACACCAAGAAATATCGACGCCACATCTTAAC TCAAAACCTTAAGGCATTAGGTTTATGAGTCCATCTCCTTATAAACTCTCCCTCTTACCTTGACTTCTTTGATGTGAGAC TTGACTCTAACACTTGATTCCAACACATCTAATAATAATTATTAGATTTTTTTTATAATACTTTAACTCTTATTTGTTTT ACAAGTATTATTTTAAATTCTGATTATATTCACATAATTTTCACAACACGCAGAATGTCTAGTAGTGTAGCCGAAAATAG 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TTCATGGAGCAAATAGAGAGAGCCGAGACACCAATGTTAATTAGTGTTATCTTTGGGTTGAAACAAGTCTTACATTATTA TGTTATGTATTCAACATAGCAAATCATAAATGTAAACTTAAAATAACACCAATTATTTTATTAAAGACAGT
CDS sequence (LotjaGi5g1v0249100.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGAAACCATTGCAAAACGTTGTTTATCGCTGATCTTGATGACAACATGCCTCATTTTAGTGCATCACCAAACCGCTGC AGCTAAGGAACTCAAAGGCAAAAAGCTAATTGAAAAAGTATGTGCAGACACACCTGACAAGGCTGCCTGCATTAAGGTGC TATCTTCGGACCCAACAAGCGCAAAAGCCAGCCTAACAGATCTAGCAATGATGTCGCTGAAGATGGCGGCGGCAAACGCG ACGGGGATACTAACCGACGCCAAGATGATGATTGATAATCCTGATTTGGACCCTGATGTTCAACAGGGCTTGGCTGACTG CAAGGAGACGTTGTTGGATGCTGAGGGTCAGCTTGAGGACACTGTCGCGGCGCTTTTGAGTGGTGCCAAACATGATGCTC AGCTGTGGCTGCGCGCGGCGCTGGCCGCCATTGATACCTGTGATGCGTCGATCCCCGGTGCTGATGATGTTCTCTCTAAG AAGAGTGTTGGGTTTCGCCAGTTGTGCAATATTGCCTTGGCCATCAGCAAGGCCCTAGCTCATGAATCCTAA
Protein sequence (LotjaGi5g1v0249100.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
METIAKRCLSLILMTTCLILVHHQTAAAKELKGKKLIEKVCADTPDKAACIKVLSSDPTSAKASLTDLAMMSLKMAAANA TGILTDAKMMIDNPDLDPDVQQGLADCKETLLDAEGQLEDTVAALLSGAKHDAQLWLRAALAAIDTCDASIPGADDVLSK KSVGFRQLCNIALAISKALAHES
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| SignalP_GRAM_POSITIVE | 1 | 28 | 28 | - | – | |
| Phobius | 1 | 7 | 7 | - | – | |
| SignalP_EUK | 1 | 28 | 28 | - | – | |
| Phobius | 1 | 28 | 28 | - | – | |
| SignalP_GRAM_NEGATIVE | 1 | 28 | 28 | - | – | |
| TIGRFAM | 8 | 179 | 172 | 6.9E-34 | ||
| Phobius | 8 | 20 | 13 | - | – | |
| Phobius | 21 | 28 | 8 | - | – | |
| Phobius | 29 | 183 | 155 | - | – | |
| SMART | 32 | 175 | 144 | 1.2E-24 | ||
| Gene3D | 33 | 181 | 149 | 1.2E-32 | ||
| SUPERFAMILY | 34 | 179 | 146 | 4.19E-29 | ||
| CDD | 36 | 179 | 144 | 2.33955E-41 | – | |
| Pfam | 36 | 175 | 140 | 2.4E-26 | ||
| PANTHER | 40 | 177 | 138 | 1.2E-30 | – | |
| PANTHER | 40 | 177 | 138 | 1.2E-30 | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Enzyme inhibitor activity | Binds to and stops, prevents or reduces the activity of an enzyme. |
Expression pattern of LotjaGi5g1v0249100.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…