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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0355800 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0355800.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Wuschel-related homeobox protein; TAIR: AT4G35550.1 WUSCHEL related homeobox 13; Swiss-Prot: sp|O81788|WOX13_ARATH WUSCHEL-related homeobox 13; TrEMBL-Plants: tr|A0A0L9U178|A0A0L9U178_PHAAN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0355800 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:67094021..67110469) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CAAACCTTTGCTGACTTTTCTGTTTCTCTGTCATCAAAATCATCTGTTAGACAGAGAGAGGGGCAGCAGAAAAAAGAGTC ACAGATGGTGAACTTGATGGAATGGAAGGATCAGTTGCAGATGTGGCAGCAGCAGAATGGGAATGTGAATGTTGGTGTCC AGAGGGAAATGATGTATGTGAAAGTGATGACTGATGAACAGTTGGAAACTCTGAGGAAACAAATTGCAGTTTATGCCACC ATTTGTGAGCAACTCATTGAGATGCACAGAACATTCTCAACTCAGCAGGATCTTGCAGGTCTTTCACTTTTATTCTGTTC CTCCTATTTGTTTTTTTGGTGAAAAATGTTTAATTATGAACTGATCATAATTCATTAGTGACCAATATTTATTGTTCCTA AATTGGGAATTTCCATCTATATTGTCAGAAAAATACACATAACTTTGGGCTTTGACAAGAGAACCCTTCAAATTTTCAAT TTTAGTTACAAACCTTCTGTTTCAATATCAGGTTCTGTGCATTTTCAGTTGCAAAGCAGGTACATAATGGTAGAGCTTTG TTCTAAGTACAATTTATTTGTTATTCTGCAAATTCCCATTCATATCCTGTTACCTACCCATGTTGCTTGTTAAATCAAAG CCTTCAATGTTAAGGTTTGTGGGACTCCAATTAGTTTCTCTTGACCAGTTTTGTCAGTTAGATTTGTCCACATCATATTT AATTGCATTTAAAGTACCAGCCTGTTGATTTAAGTTTTCTTTTAAGCCAACTTGATTCCACTTGCCAGAAAATTACATTG CAAAATATCATAAACACTTCATTAGTTCAATTTTAATAAGAGGGACATATATGATATAACTAGAAATTAAACCCGTGCGT TGCACGGGTATGTTTTTAAGTTTTGTTGTTCATTATTTTTTTAAAAGGTTAAAAAGCTGTTAAATTGATGAAAATGTAGA 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CDS sequence (LotjaGi5g1v0355800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGTGAACTTGATGGAATGGAAGGATCAGTTGCAGATGTGGCAGCAGCAGAATGGGAATGTGAATGTTGGTGTCCAGAG GGAAATGATGTATGTGAAAGTGATGACTGATGAACAGTTGGAAACTCTGAGGAAACAAATTGCAGTTTATGCCACCATTT GTGAGCAACTCATTGAGATGCACAGAACATTCTCAACTCAGCAGGATCTTGCAGGGGTTAGGCTAGGAAATATATACTTT GACCCATTGATGACATCTAGTGGCCACAAATTAACATCCAGACAGAGGTGGAATCCTACGCCCATTCAGCTTCAGATTCT TGAGAGTATATTTGATCAGGGAAATGGAACTCCAAATAAGGAAAAAATCAAGGAGATGGCTGCTGATCTGGTCCAGCATG GCCAAGTTTCTGAAACAAATGTCTATAATTGGTTCCAGAATAGGCGTGCTCGATCGAAAAGAAAACTACAAAATGTGGCA CCTAGTACCACTGAATCAGAAGCAGACACTGAGGTTGATTCTAAGGACAGGAAGACAAAGCCAGAGGAATTTTATTCCCA GCAAAATAATGTAACTACTGAGGTTGATTTGCAGTGCTTGAATGATTCAGGTTCTAATAATAAACCATATTCAATGTTCC CATCAGATGGAAGTCTAAGCTCCACAAGAAAATTGAGTCATGTACCTGTTTTTGATGGGGTGCTATCAAACTCAAGGAGT GACTATCAAACTGGGAAAATGGGAGAAGATGAAAGTTACAATTTATACAAGCAAGCAGGAGACTATAATATGGAGGGTAG ATATTTAGGTTAA
Protein sequence (LotjaGi5g1v0355800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
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Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 5 | 266 | 262 | 8.3E-108 | – | |
| PANTHER | 5 | 266 | 262 | 8.3E-108 | – | |
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| SMART | 92 | 159 | 68 | 3.0E-12 | ||
| CDD | 94 | 155 | 62 | 2.87582E-13 | ||
| Pfam | 94 | 154 | 61 | 1.3E-17 | ||
| MobiDBLite | 153 | 181 | 29 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | DNA binding | Any molecular function by which a gene product interacts selectively and non-covalently with DNA (deoxyribonucleic acid). |
Expression pattern of LotjaGi5g1v0355800.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…