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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi6g1v0019700 |
| Transcript ID | LotjaGi6g1v0019700.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Sporulation protein RMD1; TAIR: AT5G13610.1 sporulation RMD1-like protein, putative (DUF155); Swiss-Prot: sp|Q03441|RMD1_YEAST Sporulation protein RMD1; TrEMBL-Plants: tr|A0A151SFS1|A0A151SFS1_CAJCA Sporulation protein RMD1; Found in the gene: LotjaGi6g1v0019700 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr6:3506884..3531156) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CTGAAAATAATAATAAAAAAGGGTTAGTTGAAGTGTATGATCGTCTCACACTCTCACCCTCCTTGTTTGTGTGTTGTGAC TGCAACCCAAAACAAAAGATGTGGCGCACCTTAGACACCACCCATTTCACCCTCAAAACCCTGCGCCTTCGCTCCTTCCT CTTCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCACCACCAACATTTCATGTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTCGCTTTCACTGCATCAC TCATTTCTCACTCTCACACTTTTCTTCCTCTTCCTCCACCAGCACACTGTAATATCCAACATGTTTCGTTCTCCACCACC AGCACCCGCCATTTTGGCCCCTCCGCCGTCGTGCGCTGCGTTTCGTCATATCCGACGCTCGACTGGAACGACGCCGTTTC ATGCTCCGAGGTTGATGCCGATGCAAATGCCAGTGATTCAACGCTTGAAGACCAAGATTCCAAGCCTTCCATACCCGTTA GAGCCTTCTTCTTCTCTACCAGGTATCTCATAGCAATTTTATTTATTTTATTTTATTTCTGGGTTAAGCAATTCATGGTT AATTTTCATTTTATTTGTTTTCTTGGGTTTTGTTGCTGTTAATTTGAAATTCAAAACAGAAAAATTCGAATGAGCTGTTT TCAAATGTTCTTATTAGGTGATTTTATTTACCAATATTACATTTTTTAAAACATATTCTAGACCCATGAAAATAAAAGAA AAGAAGAGTTTCAGAAAACAGAATAATTGTTTTGGATGAAACACTTGAATCCAAAGGAATGACAAAATAAATATTATAGT GTGTGAATGTTAGGCATATGTGTTTGATAAAAAACTGATGTTTTAGAATTAAATTGGGAACAGATTGTCTATGCATTTGA ATCATGTTGCCAATAATTCATTGTCATGTATTGGTCATATTCACACACGTTCACGTGACATGTAGTGAATGGTGATTGCC 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TTCCTACAGCCACTACCCATCCCTACTCAGGTATGGACTGACATTTCCATGGATTTCATTGGGGGGCTACCTAAAACCAT GGGGAAAGACACAATACTGGTATTAGTGGACAGATTCACCAAGTATGCTCACTTCTTTGCACTCTCACACCCTTATAATG CAAAAGAAGTTGCAGAACTCTTTATCAAGGAGGTAGTCAAACTACATGGATTTCCTACATCCATAGTCTCTGATAGAGAC AGAGTTTTCCTAAGCACCTTCTGGACAGAACTATTCAAATTAGCAGGAACCAAATTGAAATTTAGTTCTGCATACCACCC ACAAACAGATGGACAGACTGAGATTGTAAACAAATGTGTGGAGACCTATCTTAGGTGTATGACTGGGACCAAACCCAAAC AGTGGCCTAAGTGGTTGTGTTGGGCAGAATTTTGGTACAACACCAACTACCACTCTGCCATCAAAACCACACCCTTCAAA GCATTATATGGGAGGGAAGCACCTGTGATCATCAAGGGGACTGATTCTTTAACTTCAGTAGAGGAAGTTGAAAGGATGAC TGCTGAGAGGAACTTACTTCTGAAAGAGCTCAAAGAAAATCTGGAAAAGGCCCAGAACAGAATGAAACAGCAGGCCAATA GACACAGGAGAGATGTGCAGTTTGAGATTGGGGACATGGTATATCTCAAGATACAGCCTTATAAGCTCAAAAGCCTGGCT AAAAGGAAAAATCAGAAGCTTAGTCCAAGGTACTATGGACCCTTTTTAGTGATAGACAAGATCAATCCTGTTGCTTACAA GTTGCAATTACCAGAGGGCAGTCTAATCCATCCAGTATTTCACATTTCCTTGCTCAAGAAGGCAATTAATGAGGGAACTC CTTGCCAACCATTACCCAGCTCATTAACAGAAGATTGGGAGCTCTTAGTAGAACCAGAAACTATTCTAGGAACAAGACAG AAGGAGAATGGGAGCATTGAAGTTTTGGTTAGATGGAAAGATCTTCCAACTTTTGAAGATTCCTGGGAAGACTACACTGC TCTGCTGGAACAATTCCCTAATCATCACCTTGAGGACAAGGTGATTCTTCAAGGGGGGAGAGATGTTGCAAACCCACACT CTAGGCCCAGATTTGGCAAAGTCTATGAGAGGAGGCCCAAGCAAGGGACAGCTGTACCTGAAGATCCACCTTCTAGAAGC TTGGATCCCAAGATAACCGACTAATGAGGTGGCAACACACACATGGGTGAGGGGGGGACCATAGGGTATCAACCTAGGGA ATATATGTTGGTTTGGAGAGAGAGTGAGGTAGGCAGAAATTAGTCTGGACTGGGAGAGATTGAGCACTCTCGAATTGCTC AAGTTTATCTTGTTATTTTCTTCCTTGTATTTCCCTAAACACTGCTTCTGGGTTCATACCAGAGGATTCAGTGCCTTAAT AGCATTCAATCTTCTTCTTTCCTATTACATTTTTCTGGTACCCAACATCTTACAAAATTTAGTGTAATACATTGTAGGTT TTATAGTTTTGGGGTAATTTTCTTTAAGCTTAGCGGTAGCATTTCTTTTTTATCACAAGTCACTTTGAAAATATTCCTCC ATTTCATCTACCTTGCCTGGATATATGATTGATATCATATGGACTATGTGCAATGGGAGAGAGATCACAAGGGGACGGCA GAGAAGGAAGATGAGTTTTTATGATGTGGAAATCCACATAAAAATTATCTTTCTGAAGAACTAAATATAGGTATGAAAAT TTCCTTAAACAGTACATTGAAATCAAATTTTGAAAAACAATGTTTAATGATTCATTTTGAATTTGTTTCCCAGAGACTAG GAAGGGAACATGAGTAAACCATTTGGGAGAGGAGAGAGAATATAGGGAAATCTGAACTCAAGTTATTGAGTTTTAAATTT CATTGTATGTGTGTGTTTGTATGTATATTTGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTATGTATCTATGTCTGTGTGT ATACTGTATACATGTATGTACGAAAACATGATTACTTGATTGGATTAGATACATTCCACAATTAATTATGTGGTTTAAAT ATAATAGTTTGACACTGATAGGTACATTGAGTTAGTTACTTAGTTAGAGGGTTACTGAGCCATGTTGCTTTTAAATAAGA GTGAGTTAGAGAGCATTAGTCATCTTTTGGGATCACTATGTAATTGGGAATTAGGGAGAGTGGCTTGGTCTCTTGGTTTA CTCAGCATTGTTGTAGTTCTCTATTATAGAATAATATTTGTTTCTTGGTTGGTTCCTTTTATTGATATCAGAGGCTCAGA GCACCGATTCAGGTGCCCTGGCCGTGAAAATCCTTCAGCAAACAGCATCTGAAGTAGATGGCTGGAAACATAAGGGAGGA TTACATGGGTTGTTCATTGTCACCACAAGTGAAGGAAGTAGGTGCACTTCTGAGAATTGTGGAACGAGATGGAAGATTGG AGAAAGGAAGATGTGAGAAGGCAGAAGGAGGAACAAGAAAAGAAAGAATTGGCAGCCACAGGGGAGGCATAGCAAGTGGC AGCGGAGGCAGATATAGTAGTCTTGAGTCTCATGATGATGGAGAACCAGGAGGAGGACGAAACAGGGGTCATTGTCCTCA TTCAGCAGTTGTAAGACGGTTTGTCAATGGTGGAAATCCGGACGCAAATCTTTCGAAGGTGGAAGAAGGAGGAATTCACC GTTCTATTCATGGTAGAGTCAAATATTTGACCATAAGGCTGAAGCCCAAAATACTAACAAATGGGGGTCAGATGGAATGG GCTTTTAGGGAAAGGTTCTATGCTGCCAGAAAAGGGATTTAGGTGGGAGGAGGAATTTTGGGATTTGGTTTTAATGCCAT CCTTATAGATATTCATCTCAACCCCTTCCGCACTTTTAATGTGCTGAATGTATACTTTGTGTACTGCACTTATAAGTGGG GTATGTAATTGATTCCCGCACTTAGAAGTGCGGTAAAATTGAGTCACGAGAAAATGAGTGGGTGGCATTAAAATCAGTTC CCAGGAATTTTTGTGATTTTCCCTGTTTTCTAATTTTAGGCTTGTATTCAGAGATTGTTCCCTATGTTCAGGATATTGGT CCAACACATCATACATAGCTTACTATTCACAATGGGAGCTTAGCTATAGATTGGACTTGTGCCCAGTTCCAGACCTTCTA ACCCATTGGCAATCAAGTGCTATGTCATGCAAACCTAATGTTTCTGCTGAATTAGGAGCTGGGTTTCAAAATGTAATTGT CACCATTGGGTCGTTGGAATAACTGTTCATTTTTGTAGCTTGTATTCAGTCCTTCACCTTGAGGACAAGGTGAATTTTCA GGGGCGGACTATTGATAGGTACTTACTACTTAAGAGTTATTTACTCAGAGGGTTTGTGAGGCATGTTGCCAAGAGTGAGT TAGAGAGCACTAGTCATCTTTTGGGATCATTGTGTAATTGTGAATTAGGAAGAGTGGCTGAGTTGGTTTACTCAGCATTG TTGTAGTTCTCCGTTATAGAATAATTTCTGTTTCTTGGCTCGTTCCTTTCAGAAACCTGATATTAATTAATTTTATCTCA TATGGAAGTGTATGTGAGCACACAATCATGACGATCAGGGTTAAATTTAACTACAATGATCTTGACACATGGTTGTTAAT GGTGGATGGCGGCCTATGGCAGAGAGCCAAAAACCTGCCATATATGACAAATAATGTCGGCCTTTGGTAGAATATGGCGC ATTATGGCAGGATCTCACCCATGGTTGGAGCCAAAAAAAAACTGTCATGGCGCGCCATGACCGATATTTGATAACACTGG ATTGACCACCTGTGTATGAGATGATTGCATTAAATACTGACTGTACAATATATGGATTGTCAAAATTGAAAGTTATTTGA TAAAGTCATGTGGCCATGTTTAAATGTAATGGTTACAATCTACTCCTTATCTCTCACGACAAAAGATACTCGTAGTTGAT ACTTCCACGCACACGCATGCACACACACTCTCTCTCTGTCAGATTTCGAAGTTAGAGTCACTTTATATGGGCTTCGTCGA ACTTTAGAAATTTTAAATGGTTTTTGCAGATCAGATATTGCTTGGAAAGATGCCAAATATGGTCAGATATGGGAATATCT CAGGGATGAATTTGAATTGACTCAGAGATTTGCAAGTCTTGATTTCAAGTTGAAATTTGTGGAGGTGTAACTTTTATCTT GGAAACACATTTTCTCACTTGATTCTCTCTATCTAGGTTTTCTATTGATTTTTTACTTTGTATTTGTAACTTTCCCCCCT CTCAAATTTGCAGCACAATATCCGGTTTCTACAAGAAATTCTTCAAAATAGGAAATCTGATTTCCTAGAGTGGCTCATTA TTGCATTGATTGGTGCTGAGATTCTTTTGTCTCTCTATGACATTATTCAACGGTCTCCCATGAAACTTTAGTAGCATGAT TTCTGCTGGTAAGCATGGCCAGCGTGCTTTTGAAGGAGTGTAGCTTCCTAGCACTTGGAGCTACTCATTAGTTTAAGATA TTGGTGGCCCATGCTCTTGTAAATAGCTATTTGAAACCCTTCAACGTAGTTCTTTAGCAGTCAGTTTGTATAACTGAAAT CTATTACTGCATATTTTGTTGTAATGTAATTTTTGTCTATTGCATCAATAAATTATTCTGTTCAATTTTGAGAACCCAGA GCGTTGCTAATTTTGATGACCTATTACTGATCAGAATGATAGGTTAATTCCTGTGCTTATGAATCTCTTTTAGAACTCTT GCACTTGCCACACAAGAATGTATTAACTTTAGGTAACATTTGAAATGGAAATGAAGCGAAAGAGTAGTTTGTTCTATTCT CACTAATCTCATTTTTTCAGTGGAGATAAATGTGTTATGTTCTAGGTAGCATGTGTTCACTAACTTTAGGTAACATTTGT GCATTTTGCTCTGCGGCTGGGAAGGAGTTAGTGCTCCATGCAATTTTGCTTAGCCTCTCTGCCCACGACGTCTAGTTCGC TCCTCCCATCTTAGTGAATGTTTTTGGAACTTCTTACAAAAGAAAAAGATAGTCCCTCTCAAAAGAAAGAAAAAGAGAAA GAAGAAAAAGGAGAGCCAAAAGATTAATTTGTATAAATTAATCAAGCATCATACAAAACCTAAGTAGATGAAGCGAAACA ATTGAAGAAAGAATTCATGGAAGAACTAGCAAGTGCTTGATTAGTGAAAGAAGAATGCAATTGATTAAGAGAAACAAATA ATTGTACCTAGACAAGTGTAACCTGTAATTGAAGAAGTATAAGAATTTATAGAATAATGTGGACTGGGATAACCCTAAGT TGTGTGGTATGTGATGTCTAGCGGTGATGTTAAACATCATGATTTATCGTAGAGATAACACCCGGTTCGTGACCTCGACA AAGGAGACAAGCATTGAACTCTCTGACTCTCTGAGTAGATGAGGACTTGGATAAGGAGCGCCTTCAGACTCCTTGAGGAC CTGCATTGGAATCTAGGTTAGCGAGGAGAGGTTACCTCTTGGCTGCTGGCTAGAGTTGTGCTATAATTCCTGTCTGGAAT GAGAAAGAGAATGAAAGAAATCTAGAGTACTATGTTTTGAGACCCGGTATTTGGTTGAAGAGAGAAAAGGGGTGGGCCTA CCATGTTGGAGTGAGAGATAATTATGATTTGTTAATTAAGTGAAATATTAAGTTAGAGGCCACCGAATTAGTTTTAATTA ACTTTCTGAGAACAAATATATTGAATTAAAGGAAAGAAAGCGTGGAGCTGAGGAAGGGAAGAGGAGGAGATGATGGAGAA AGTGTAGGTGCGATGGTTAATGGTGGTGGCTCGCCGGAAACAATGGTTGGGAGAAAGTGTGGTGGCTGGGAAGAGGAGGA TGAAGTTGAAGAAGATGGGAAAGGAGGGAATGATTAAGTTTGGTGAAATAGATTTTTTAGCGACTAAAGTGAATGTGAAA GTTTCACGTGAACCGCCTATGTGGACTAATGAC
CDS sequence (LotjaGi6g1v0019700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTGGCGCACCTTAGACACCACCCATTTCACCCTCAAAACCCTGCGCCTTCGCTCCTTCCTCTTCTCTTCTTCTTCTTC TTCTTCCACCACCAACATTTCATGTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTCGCTTTCACTGCATCACTCATTTCTCACTCTCACA CTTTTCTTCCTCTTCCTCCACCAGCACACTGTAATATCCAACATGTTTCGTTCTCCACCACCAGCACCCGCCATTTTGGC CCCTCCGCCGTCGTGCGCTGCGTTTCGTCATATCCGACGCTCGACTGGAACGACGCCGTTTCATGCTCCGAGGTTGATGC CGATGCAAATGCCAGTGATTCAACGCTTGAAGACCAAGATTCCAAGCCTTCCATACCCGTTAGAGCCTTCTTCTTCTCTA CCAGTGTTGATTTAAAAAGCTTGGTGGAGCGGAACAAACCAAACTTTGTCACACCCTCGTCACGGATGACTAATTATGTA GTTCTTAAGTTTGGTGAAGTTTGTGATTCCAAGGGTATGGGTACTTGTTTCTTGAATGGAAGCAGTGGCTGTTACATGGT GGTTTTTCAGTATGGATCCATTGTATTGTTTAATGTCCCCGAGCATGAGGTTGATGGCTATCTGAAAATTGTTAAGAAGC ACGCGTCTGGTTTGCTTCCTGAAATGAGAAAGGACGAGTATGAAGTAAGAGAAAAACCAGCTTTAAGCACATGGATGCGA GGAGGACTAGATTACATAATGTTACAATACTTGGACGTTGATGGAATTCGAACTATTGGTAGTGTTCTAGGTCAAAGTAT TGCTCTTGATTACTATGGACGACAGGTTGATGGAATGGTTGCAGAATTTACAGACATAAACCGTGAGATGGAAGCAACTG GAAAATTCAAAATGCAGAGGAAAAAACTTTTTCAGTTGGTGGGCAAAGCAAATTCAAATCTTGCTGATGTGATTCTAAAG CTCGGACTATTTGAGAGATCAGATATTGCTTGGAAAGATGCCAAATATGGTCAGATATGGGAATATCTCAGGGATGAATT TGAATTGACTCAGAGATTTGCAAGTCTTGATTTCAAGTTGAAATTTGTGGAGCACAATATCCGGTTTCTACAAGAAATTC TTCAAAATAGGAAATCTGATTTCCTAGAGTGGCTCATTATTGCATTGATTGGTGCTGAGATTCTTTTGTCTCTCTATGAC ATTATTCAACGGTCTCCCATGAAACTTTAG
Protein sequence (LotjaGi6g1v0019700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MWRTLDTTHFTLKTLRLRSFLFSSSSSSSTTNISCSSSSSSFAFTASLISHSHTFLPLPPPAHCNIQHVSFSTTSTRHFG PSAVVRCVSSYPTLDWNDAVSCSEVDADANASDSTLEDQDSKPSIPVRAFFFSTSVDLKSLVERNKPNFVTPSSRMTNYV VLKFGEVCDSKGMGTCFLNGSSGCYMVVFQYGSIVLFNVPEHEVDGYLKIVKKHASGLLPEMRKDEYEVREKPALSTWMR GGLDYIMLQYLDVDGIRTIGSVLGQSIALDYYGRQVDGMVAEFTDINREMEATGKFKMQRKKLFQLVGKANSNLADVILK LGLFERSDIAWKDAKYGQIWEYLRDEFELTQRFASLDFKLKFVEHNIRFLQEILQNRKSDFLEWLIIALIGAEILLSLYD IIQRSPMKL
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| SignalP_GRAM_POSITIVE | 1 | 36 | 36 | - | – | |
| Phobius | 1 | 380 | 380 | - | – | |
| PANTHER | 23 | 402 | 380 | 1.7E-166 | – | |
| PANTHER | 23 | 402 | 380 | 1.7E-166 | – | |
| Pfam | 186 | 356 | 171 | 4.7E-29 | ||
| Phobius | 381 | 402 | 22 | - | – | |
| Phobius | 403 | 409 | 7 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi6g1v0019700.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…