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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi6g1v0032100 |
| Transcript ID | LotjaGi6g1v0032100.5 |
| Related isoforms 4 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | HEAT repeat-containing protein 6; TAIR: AT4G38120.3 ARM repeat superfamily protein; Swiss-Prot: sp|A9JRI0|HEAT6_DANRE HEAT repeat-containing protein 6; TrEMBL-Plants: tr|A0A0S3S9G8|A0A0S3S9G8_PHAAN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi6g1v0032100 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr6:6013190..6044996) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AAAGTCAGGGCATCAGATTCAGATGGAGTTTGAACTTGTAGCTTCTAAGTGCAAAAGCTCGCAGTGTTTGCTGAATCGAT TTCCACCGAAGGCATGCGCGACGAGAAGAAGCTAGCAACCGCCGTTTAGCGACAGTTTCTTCTCTCATGGCGGGAACGGG ATTCGGCGCAGCAGCGCCGTCGCCACTGGTCAGGACGTGGAGGACTTCCTTCCTGTCGCTGAGGGATGAAACCCTAACGA CCCCTCCTCGCACTTCTTCTACTCCTCAAATGCTCCAGAATCTCATTTTCTCGCATTCTCATGCTCTGGTTTCTGCCGCC ACCGAACTTCCCTCTCACGAGGTATCTTCTTCAACACACCAATGCATTCTTCGCTTTCTTCTCATTTCCCTTAATTATCG ATCTTACTATTTGCTGTTTGAAATTTTCTTTCAGGTTTTGTCAGACGTTTTGTTCTTGATGGATTTGGTTGCTGCTACTT CTTCCGATGAAGACGATTGTAGTCATATCTATACTCATGCATCACGCTTGGTATCGGTTTTGCTTTCTTGGTTTCCAGTT CTTTTGTTTGTAAATTTGCTACTTTAATTCGTTAATGTTAGTATTTTTTTTTTTTAAATCATTTCGCGAAGTGATTATTC TTCTTGTGTTCTTGTCGCAGATCCATGATATTTGTGGTCGCGTGTCTATGGATATGAATTTATCCTCTTTCAGTAGAGTT CTTAACTGTTTTGGGAAGATGATAGATCTTTCTCTCCGAAAAGGTGCTAATCGTGATGAGTTAACTGGAACTAGCGGTGC TGCTACGATAGTTCCTGCTATTGAATGCTTGAAGGCTATCAGGTTTTTTCATGCTTCTTAATAGAATCGATCCTTGACGC ATCTTGAGTAGGCATTATATGGACCTGTCCTTTTTTTTGGTAGTTGTTATGCTGTAGTCGTAGTTTCAGTAGGTTATTTT 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CDS sequence (LotjaGi6g1v0032100.5) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
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Protein sequence (LotjaGi6g1v0032100.5) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
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Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 779 | 779 | - | – | |
| PANTHER | 15 | 846 | 832 | 3.1E-219 | – | |
| MobiDBLite | 327 | 353 | 27 | - | – | |
| MobiDBLite | 332 | 348 | 17 | - | – | |
| SUPERFAMILY | 400 | 839 | 440 | 3.17E-12 | ||
| Pfam | 403 | 580 | 178 | 5.9E-46 | ||
| Phobius | 780 | 801 | 22 | - | – | |
| Phobius | 802 | 854 | 53 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi6g1v0032100.5, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
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