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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi6g1v0035200 |
| Transcript ID | LotjaGi6g1v0035200.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein; TAIR: AT2G32170.1 S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q80UY1|CARME_MOUSE Carnosine N-methyltransferase; TrEMBL-Plants: tr|I1LXK8|I1LXK8_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi6g1v0035200 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr6:6618801..6628999) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CTCTCACAAACCATGTGGAGGAGACCAAGTTACACTAGTTAACTCACACTGGCTAAACTGAAAACAAGAACACAAACCAC ATTCAGTCCGTTTTTGAAAATATTGTGCAGTGATGGAAGAGTCAGAGGAGGATCGTCGTCGCCAGCTTGAAGAAGCTCTC GAAATCCAATCCCTTAGACGCATCATCAGTGCTTACCTCAAGTACATTCCTTTTCTTCTCTAATTGGAACGATGATTCGT TAAACGATTTTCTGATTCTAGGTTTCTCCAAGAAGCTTTCTTTATTGTTTATTTTTATAGGTTTTTAAGATTTTTCGATA AATTTTCTGTCTTCTGTTGCTGATGCTATGCATGGAATCAATTGACAAATGCACACACGGTCATAAGTATATAATGCTTC CAAAACACTATGAAATTCTCTATCTGTATTGGTAAATTGTTATGATGATCCATTATATTTTGTTCATTTATGTTACACTA ATCTGACAATAGTAGTAGTTGTAGTATTTTTATTTTGTTTCTATCATACTACTTATAATTCAGGATGTACGTATAATGTC TTTTTAATGGAAGTAACACGAACCTTTCGTTTCACTGACTTCTTATGCAGCTATCCTGATGCCGCCGAGAGGGATGTTAG AAGATACGAGAGATCTTTTAGGAAGCTTCCACCTGCCCATAAGGTATTTTTCTCCACTGCATCTGCTTGATGTCCCTGTT GCAAAACATTGATGCTCCACTGTGCATTTCCTAGTGTATGGGTTCCGTGCTGTTTGCTGTTACAATAACTTTGTTATGAA CTTTGTGGAACAATGGTATTCCTTGTCGTTTTACTGTTTTCACTGACTTTTTGCATCTGCATGAGCTTGTGCAAGACTTG TACTCTCTGACCAGCTCTGACTTGAAGGACTGAGCATGCTGAACTTTTACTGGTTATTGTCGATATGGACGCCAAGGATT GACACTTGGTCTTGATTATGTTTGTATTAGAATATGGCTGGTTATTGAAAGAATTTGAATGGAATTGTGGGACTAATCAG TCTACACTCGCATAAATTTGTTCTATGTGAAGGATGTATTATATAAATTATTAACTCCTAAATTAGAGCACCAATTGACT GTACTAATTCCATTCTTTTGTTGCTGTCATAATTGCTTCCAGTGATTTCTGTTAATTCATTTGTTCCCTTGTTTACTGCA CCTTTTTCTTATGTTTGTAGGCTTTGTTATCTCATTATCCTCTAAAGTTTCAAAGATTGCGCAGGTACATTTTGCATACT CTTTATCTTTGCTTTATAATTTCTCTCTTTCTTATATCTTGTAAAGGATACAAGAATGCTGAGATGTTCTGAAGTTGATG CTAATGATACTTTATTTAAGGAATAAGACTCAGACTCACTACTGCATAATTACTTCCCTAGATGATTTTCATTCCCTCTT TAAAAAACAGAAAACTTCTGGAGAATTTAATGCCTTTGATTCTTAAAAGCACGTAAAAACTGTTTTAAACTTTAAGCTTC ATTATATAACTATCAAGTCTGGTGTAATTAGGTTTTCAGCTTATGCATATTCTCTCTCTGTCTCTCTGGTATTTAGACCT TCAACAGCGGCAACTCTTAACAATGTGTACCGATCAACCATTGCCCTCCTATAAAAAATATGTTTATTTAATAGATGATA TTTATTTATTAATGGAGAAACCGAGCTTGATTGAAGATTTAACCCTGATGTTTCAAATCTTAGACTTTCGTGGTTTGTTG TGATTTTCAATGTTGCAGGTGTATTGCGATGAATTCTCATTTCATATTCAGCATGCTTCAGGTAAGGACAAACTCCTTTT GTGGTTAATTTCTTTTTTTTGTTGGTAGTATTTGATATATGCATGATGAAATTTTGTAGGCATTTGAGCCTCCGCTTGAT ATGAGCCAGGACGTTGATTTAAGTGAAGATCCACATACTGAAGATGCTCATAAATATCATACAGTCTCTGAAGGGCTTAA TTCTTGTTCATGTGAATCAGCCCCATTGAGAATAACATGTTCTGTATCTGATCAACATGGTTGTGTGGAAGGTAGCAATG ATACATGCAGATCATCAGTACTACTGCATCCGAATGAGGTTTCTACTGAATTCATGGCTCTGATCCTTTTTTGATTCAGT AGATAAGAACTGTAATGTTTCATTGGCACTATGATTGTTTTTTTCATTTAGAAATTTGACCCTGTAGATAACAACAGGAA GTGAACATTGAGAGTGACCGTCAGCCAAATATCGGGAGCCATCTTCCAAGCTTGACGGATACCAAAGAGACTAGTGAATA TGGTGAAAGTGCTATTCCTGATTCCGATGACAGTGTAATTCGTACTTGTCTATTTCTATTTTAAATTTCCTATTTTTTAT AGTTTCTATCTAAGCAGGTTGTATGTTGTCCAAGTTCCTTGTGCTAAATTGGTGTTGCTGATATGACTATTCTTAAAAGC TCGACACATTTCAGATTAATTGCTTAAAGCTAAACTTCACACTTCACTGTTGGTTATACCTTCTTGAACTTTGGCACATT CATTTTCAAGTATAATTTTTGTTACCTTCATTAAAGCCTGTCCTGTTCTATTGGCACTTCACTGTTGGTTATACCTTCTT CTCTCTGTTTCTATGTCTCAGATTTGTTTCCAAACTATCAAAGTTTATGCATAACAATTAAATGAAAACAATTGAGTCAT TTTTACCTGGAGACAGTACTAGAAACTAGTTCGGAATCCCATTTGGTTCATCCTTTTTGTGTGAGTTTTCTGTCAAGGAA TGAATTGAAAGTTCAAGGGAATAGTAATCTACTTAATTCATCTGTATATAGGGGACTTACAATTTATAGGATTAGGCCAC 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TACACGCTGTCCCTTTCTGCATCAATAGGTTCAACCACAAGCATGTAAGAATAATTTTTATGCTGCCTAACTTTTGGTAG TTGCTTCCATTTAGCTTTTTATTATGGACCCAGGGAAATCTATAATAAATTGAAATATATAATACATGGTCCAGAGACTC TTTCATTGCCATGAAGTTTTGTCTGTCAAAATACTAACTTTAGGGAAAGTTCTTCTATATTCAGTTCAGTAGTTTGATGA AAAAAGATTATAGTTCTCAACTAATTTTGTGATCATATGGAATATACATTCTTATCAAAAAAAGAAATTGAGCTCATCTT TAAATCATTGCATGGCCTGGACAGCAGACAACTTAGGGCTTCAAAATAAATGTTATTTTGATCGCTCTATTTATGAACTA ACATTTGTAATGAAAGTGATCTTTTGCTGCTGCAGACACTGTAGAGTTTGATTATTGCCCATTTGCCTTATCATTGCTTC CTATTATGCAATATTCCTTAGTACAAGTTTCAAATGAAGTGATTATGATATATGGTTTTGCTAATTATACACATTTTATT TCTGCTTTTGCCTCAGGTGCGATGCGTAATAAGGAATTTAGTTAGGGACTGGGCAGCAGAGGTACGGCTTTCTTTTATGT TGCTATTATTTAAAATTTTAATTATGATTCTGCTTGTTTATTTGTTGTTTTTTTAAAGAAAGTTTTTTGAAATTTATGGT GGACATATTAAAAACTTGATTTGCTGCCTGCAATTTTCTTCTGCAATTGTATTTTATTAGGGTAAAAAAGAACGTGATCA GTGCTACAAGCCTATCCTTGAAGAGCTCAATAACCTATTTCCTAATCGCAGTAAAGAGAGGTAGCCCTTAATACTCTTGA TACCAATAGAAAGTTCTCGTATGGTTGAAGATTGTTTGCATAATTTGTTTTTCACTAAATGCATGAAATTTCTCAAACAG TCCACCTGCTTGTTTAGTTCCTGGTGCTGGACTTGGTCGACTGGCTTTGGAGATCTCCTGTTCAGGTTCTTGTGTATTGT CAGGCTTTCATTCGGATTGTGTTTAGATATACTTCTTTCCCAACTAAATGAACTAATACATCATGTTATGATGCAGGATT TATCAGTCAGGGAAATGAATTTTCATACTACATGATGATATGCTCTAGTTTTATTCTTAACCAGTAAGAATAAGGGTTCT GTCTTTCATTCTGATTTTGTTAATGTTACATGACGTACCTATTTGTTTTGAAGTCAGAAAGTAATGATAGCTTTTTTTAT TTGTTGCTGTTTTGTTCTCAACGAATTGGCTTTATGGATAATTTAAGTTCCCAAACTGCTGGTGAGTGGGCTATATATCC TTGGATTCACAGCAATTGCAATTCATTGTCAGAAAGTGATCAACTTCGTCCTGTTTCAATACCAGATATTCATCCAGCCA GGTACATACATTGATTCTTTTAATAATATAGTTCCTCATTTGATATCAAACTGATGGGAAGATCTTTGTAAATGAGAAAC ACCACTGAGTGATCAATATAAAAGGGCTCCCTTTGCAAATCTCCCAAGGAGAATCTATGTAACTTTTGAGCACCAAAATG AGACTAAGACCACCTTTCCCAGTTATGCTAAGGAAAGTGATCTTCCACTTAGAAGTTTATGTATTCCTTTCTATCTAAAG ACCCAAATGGCACAACATAACAGACTACTGTAAAAAAAATTCTTCCTTGCTTCGGCCAAACCAGTTAAGGTCCGAGTTTT GGGAACATAATTCATTATTTTTATGAATTAATAAGCACTGATACAGCTGGGTTATCCTTGTAATACTTGCACTTGACACT TCAAATAAGTAATGCTAGGATATAAAAAGATATATTACTACATGATCATATCTTAGAGTAATTTAGGGTAATTCAGATTA 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CAGTTAAATTTAAACCATATCACTGCTGCACAAGTCTCTTGCGTGTAATCAATTATTTCACCCTAAATTTGTAAATATGA TTGAGGGAGCGTGGCACATGGATCCACCCCTTTATTGTTTGGAGAGTAATTAATCTTGAACATATTTAACCTGACATTAT AATTCCTCCTGTACACACCTGTATTTAATTATGATATAAAAACCTACCCCTATGGTGATTACTAACACTGCTTTCAATGA CCATGCAGGTGCATGGGATGCAGTTGTTACATGCTTCTTTATCGATACTGCTCACAATGTTGTTGAGTACATTGAAATAA TTTCGCGCATTTTGAAAGATGGGGGAGTAAGTTCCTTCATATTCCAAATTGATCTGTTTATCTCTCTTATTTCCTCCCCT TCCATATGTTCTCTTTGCTTCTTGCTTTCTCACTTTGATGTTGTCTTTCATACTTGGTGACATCCACGACAGATTTGGAT AAATTTGGGGCCTCTACTTTATCACTTTGCGGACATGTATGGACAAGAAGATGTAAGATTCAATTATTGTTTTCACGTAA AATATATCATCACATGCTTGGAGTGTATTACCTTAATCTGAAATTTGTCTGCAGGAAATGTCCATCGAATTGAGTTTGGA AGATGTTAAAAGGATTGCATTGCATTATGGATTTGAATTTGAGGTAATCTCATATGAATTGAATTAATGCCACTAGTAGT TTAAACAAGTGACTAATATTTGCATAATGTTAACATGAATTGCAGAAAGAAAGAACTATTGAGACAACATACACGACAAA TCCAAGATCAATGATGCAAGTAAGCTTCTAATTGCACACATCCACCCTGTTATTTCTTCTTTTCTTATTCACCTATAGTC TTGTTAAATCTCCAAGATATATGCATCTTAAGTTTATTGTTGGATGTTTCAATTCGGAAATTCTAAATCTCTTTATGAAA GTATAGCTATGGATTGATATTTTTTATTCTACTAACTGGTTCTTACTTTGTGATATATAATCTCTACATAGAAAGATAGA TTTGGGTCTTAGGAAATCTTCATTTGGTAGTTGGTAGTTACATATTAAGGATACAGTTTTGTTCACACTTCACTTAAAAG AGTAAATGGAGTGGAGAGATGAGAGAGATAGGAAGAAAAGATAGATAATGTAAAAGATGTGATGGGTGATATGATTGAAA GAGAAGAGAGAGAGAGAGATTGAAAATAAGGTGTAAATGAAGTGGAAGTGTGAATGAGTCATAGCTCTACATAGTAACGA AGGTATAATGTTCCATTTTGGGGATGAAAATCTTATGCTCCTAAATGGTGTCTCGTTTCCTATTTCAACAAATGAAATTA TTTCATGTCAATTAAAAAATTTCATGGATGATGGATATGACATTTATAACCTTATGTGGGTACTTTTTTATTCAAATGAC AAATTCGTTAGTTTTTTTTTAAAGCAATTATTGAAATAAGATAGTTGAGAAACAACCCATTTCACATGGGCATAATAACC AAGCCAACAAAAGAAGCTAGCAAAAACCCAACCACTTACAATTTCATTAGTGAGACATGGAATGAGACACTATTTGGAGA GAGAGGATCTTGATCCGCAATTGGGTGATCCTCAACTACACCAAACAAAGTTTCTTAGTTTGGACGTTTTCCCCATCCAT TAGAATCTTAACAAATCATTAATAATGTATCTTCTGATAGCATTTGTTAGTATGCTAAAAGGTTTGTGATCCTCTTTGCA GAATCGTTACTTTGCTGCATTTTGGACAATGAGGAAAAAATCCGGATCAGTGCAGCAGCAGCAGGAGGCCTGAAAATGGG GAACTCCATTGGAAGGAAATGCAAAGTTTCTACACAAAGTTGAAACATGAAACTAGCAAAAGAAACCTGGATTTTCAGTC CTGGAAGCCCTTGCAGCAAGAAGCAGTACATGCTCCTTGTTCACCTTTTGCAAAGACCTCAATCAACTTCTTATCAACAT TCAGAAAAGGACATTTTAAACACCTCAAGAATAACAACACATATTAGGGGAAGCCTATGCTTTGACACTCTAGCGAGAAA GTATCATCTCTTTGGCATTTTTAGCATTCTATAAGTTCTACATTGTTATGTATTCGCATCCTTTAATACTGGAGATATCA GTGGGGTGAGTCTCCGTGTGCTTTTGATTGGCTATATAATATATTTAGTAATTTGAGAATTTCCTCAAGCAATACGATTT TACCAGTCCCAGCAGAGCCTGTGATGAACACGGATTTGCCCTGAGGGATGGCAGACAAAATATGCTTCTGCTCGTTTCCC CATTGTTGTGTTATAAGTGTAACATGCACTTGTGATTGTTATTTATTGTATTGTTCTTTGAGAAATGTGAATGGCGTTAA TTGGTTGGAGGAATGTGTTTTTATTTTTATTTATTAAGTGAAAATGAAATACTTTTTTTCCTATTTCAAAGATTTGTGCT AAGTTAATAAAAGTACCAAAATATGGCTTTTATTGTTTT
CDS sequence (LotjaGi6g1v0035200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGAAGAGTCAGAGGAGGATCGTCGTCGCCAGCTTGAAGAAGCTCTCGAAATCCAATCCCTTAGACGCATCATCAGTGC TTACCTCAACTATCCTGATGCCGCCGAGAGGGATGTTAGAAGATACGAGAGATCTTTTAGGAAGCTTCCACCTGCCCATA AGGCTTTGTTATCTCATTATCCTCTAAAGTTTCAAAGATTGCGCAGGTGTATTGCGATGAATTCTCATTTCATATTCAGC ATGCTTCAGGCATTTGAGCCTCCGCTTGATATGAGCCAGGACGTTGATTTAAGTGAAGATCCACATACTGAAGATGCTCA TAAATATCATACAGTCTCTGAAGGGCTTAATTCTTGTTCATGTGAATCAGCCCCATTGAGAATAACATGTTCTGTATCTG ATCAACATGGTTGTGTGGAAGGTAGCAATGATACATGCAGATCATCAGTACTACTGCATCCGAATGAGGAAGTGAACATT GAGAGTGACCGTCAGCCAAATATCGGGAGCCATCTTCCAAGCTTGACGGATACCAAAGAGACTAGTGAATATGGTGAAAG TGCTATTCCTGATTCCGATGACAGTGTCACAGTCAACTCACGGCAACAATGGTTGGATCCTTCTTTACAGTTAAATGTTC CTTTAGTTGATGTAGATAAGGTGCGATGCGTAATAAGGAATTTAGTTAGGGACTGGGCAGCAGAGGGTAAAAAAGAACGT GATCAGTGCTACAAGCCTATCCTTGAAGAGCTCAATAACCTATTTCCTAATCGCAGTAAAGAGAGTCCACCTGCTTGTTT AGTTCCTGGTGCTGGACTTGGTCGACTGGCTTTGGAGATCTCCTGTTCAGGATTTATCAGTCAGGGAAATGAATTTTCAT ACTACATGATGATATGCTCTAGTTTTATTCTTAACCATTCCCAAACTGCTGGTGAGTGGGCTATATATCCTTGGATTCAC AGCAATTGCAATTCATTGTCAGAAAGTGATCAACTTCGTCCTGTTTCAATACCAGATATTCATCCAGCCAGTGCAGGAAT TACTGAAGGCTTTTCCATGTGTGGAGGTGACTTTGTTGAAGTCTACAGTGATTCAAGCCAAGTAGGTGCATGGGATGCAG TTGTTACATGCTTCTTTATCGATACTGCTCACAATGTTGTTGAGTACATTGAAATAATTTCGCGCATTTTGAAAGATGGG GGAATTTGGATAAATTTGGGGCCTCTACTTTATCACTTTGCGGACATGTATGGACAAGAAGATGAAATGTCCATCGAATT GAGTTTGGAAGATGTTAAAAGGATTGCATTGCATTATGGATTTGAATTTGAGAAAGAAAGAACTATTGAGACAACATACA CGACAAATCCAAGATCAATGATGCAAAATCGTTACTTTGCTGCATTTTGGACAATGAGGAAAAAATCCGGATCAGTGCAG CAGCAGCAGGAGGCCTGA
Protein sequence (LotjaGi6g1v0035200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MEESEEDRRRQLEEALEIQSLRRIISAYLNYPDAAERDVRRYERSFRKLPPAHKALLSHYPLKFQRLRRCIAMNSHFIFS MLQAFEPPLDMSQDVDLSEDPHTEDAHKYHTVSEGLNSCSCESAPLRITCSVSDQHGCVEGSNDTCRSSVLLHPNEEVNI ESDRQPNIGSHLPSLTDTKETSEYGESAIPDSDDSVTVNSRQQWLDPSLQLNVPLVDVDKVRCVIRNLVRDWAAEGKKER DQCYKPILEELNNLFPNRSKESPPACLVPGAGLGRLALEISCSGFISQGNEFSYYMMICSSFILNHSQTAGEWAIYPWIH SNCNSLSESDQLRPVSIPDIHPASAGITEGFSMCGGDFVEVYSDSSQVGAWDAVVTCFFIDTAHNVVEYIEIISRILKDG GIWINLGPLLYHFADMYGQEDEMSIELSLEDVKRIALHYGFEFEKERTIETTYTTNPRSMMQNRYFAAFWTMRKKSGSVQ QQQEA
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Coils | 2 | 22 | 21 | - | – | |
| PANTHER | 3 | 480 | 478 | 1.8E-178 | ||
| MobiDBLite | 158 | 195 | 38 | - | – | |
| MobiDBLite | 161 | 185 | 25 | - | – | |
| SMART | 207 | 476 | 270 | 2.5E-160 | ||
| Pfam | 210 | 475 | 266 | 1.9E-113 | ||
| SUPERFAMILY | 225 | 466 | 242 | 2.38E-10 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi6g1v0035200.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…