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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi6g1v0162000 |
| Transcript ID | LotjaGi6g1v0162000.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Triose-phosphate transporter family protein; TAIR: AT1G06470.1 Nucleotide/sugar transporter family protein; Swiss-Prot: sp|Q8H184|PT106_ARATH Probable sugar phosphate/phosphate translocator At1g06470; TrEMBL-Plants: tr|I1N0T4|I1N0T4_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi6g1v0162000 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr6:44581166..44610335) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AGAAATGAATAATTAATTAAAAAGGATTAGCACTAATCGGTTGGCAATATTAACAAACAAAGTGGTTGGTGACTTGGGTT GTAAAGGTTTAAGACATTAACATCCCAAACCAATTCCTCAAATCGCCGAACCTAACCAAGGTTTCAGATCCAACGCACTC AGATCAGATCTCTGTTGTTCTTCATTTTTCTCAAAATAGCCCCAGGTTAGTTCCACGCTTGTTAAACATTACTTGTATTA ATCAAATTTCACGTTGGCATTCAACAAAATCCATGTGTTTGATTCAAAGATTGCATTTTAATCGAGCTTCTTCATGTTTG GGGCTTGCAAGCTAATTTTTAGTTCAAAGGGTGTTCATTTTGCTATCAAAGTGATGCTTTTTTATTCAGCTTCACGTTTC CTGGGTTTGAGCTGATTTTTGTTCAAATGGGTCATCAGGTATCATTCCTTTATGCTTAAATAGTAATGTGAATGACATTA CAAAACAACCCAGAATTTATATTTACCTAATTTTTGCCAAAAATTAATCTTTAGTTATTTTTAAGCATTATGGCACCAAT GGGTCTTAGGTAGCTGGGGGTATGTTGTTTTTTAATCAATTTCATATTCAATTGGAAGTTTGAAGAATTGTTATATTTGC TTTATGTTTTTCAGCAATTTGTACTGTGAATTCATTTGAATATAATTTGAGCAGATTTAGCCATCTCCAATGAGAATTTT GACTTGTCCATGTACAGGTCAAGCTGGTGTCCTTACTTTAATCTATCTAAGAGCTCTACAAGTTGGTTTATTTGGATTGG AATATATCCCGGTATCTTCTTCAGGCGTGAAGACGATATATATTTAGCTACTGACTATTTGTTGATCCCGACGTGATTTG ACGACGGGTTTGATTAAGAAGGCAGGTCCTGTGCCTGACAGCAGATTATGCATTAGCTGTGTTATGCACCCAAGTGAACT 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GTTCAAGGCTAGTAAGTGTGATCCCTCCTTGTTCACTTTGTCTTCACCAACTTGCTGCACATATGTTCTAGTATATGTGG ACGATATTATTATCACAGGAGGTTCTTCAGTCCTAATTCAACATCTTGTTGACAAACTGAATTCTTCTTTTGCTTTAAAA CAGTTAGGAAAACTTGATTATTTTCTTGGAGTTCAGGTTACACACTTGTCTGATGGCTCTTTGCTACTTAATCAGACCAA ATATATTGAAGATCTTCTTGAGAGAGCAAATATGTCTGAAGCCAATGCTCTGCCCACTCCTATGATTAGTAGCAGCAAAC TGTCAAAGTTTGGAGGTACTTGCATGAATGATCCCTTTCTCTATAGATCCATAGTTGGAGCATTGCAATATGCTACAATT ACCCGGCCGGATATCAGCTTTGCAGTCAATAAAGTCTGTCAATTTCTGTCTCAGCCTCATGATGAACATTGGAAGGCAGT TAAGAGAATTCTGCGGTTTCTTAAGGGTACCATTCATCATGGGTTGCTTTTTAAGCCTTTCTCTCTTGATCGTCCAGTAG CACTTCATGCCTACTGTGATGCAGATTGGGGTTCTGACCCGGATGATAGACGGTCAACTTCTGGCTCATGTGTGTTCTTT GGCCCCAATTTAGTGTCTTGGTCAGCTAAGAAGCAAACTTTGGTTGCTCGCTCAAGCACAGAAGCGGAATATAGGAGTCT GGCCAACATAGCAGCTGAGATTCTTTGGATTCAATCCTTGTTGACTGAGCTGCATATTCCCTTCCAAACACCAACAATTT TCTGTGATAACCTGAGCACCATAGCCTTGACTCTTAATCCGGTCCTTCACACTAGAACTAAGCATATGGAAATGGATCTT TTCTTTGTGAGAGAGAAGGTTCTCAATAAGACTCTTATTGTTCAGCATGTTCCTTCTCTTCTGCAGAAAGCGGATATCTT TACTAAAGCCCTCTCTTCAGAAAGGTTTCATGAGCTTAAGGACAAACTCAATGTGGTTGACAAATTTTCATTTGTCAAAC CACCTTGAGTTTGAGGGGGTATGTTAGAGTACATTGAGTTTGTATTTACTATGCTGCTGCATCATCTTTTGAGTAGTTAT GACAGCTGACATATCCAGCTGTTTGTATTCTCCTATTTATGTCAGCTGTTGGTAGGACTGTTCATGGTTCGGTTCTTTGC TTGAACCGAACCGAACCGAACCTGAACCAAAATTTTGGTTTGAGAGAACCGAACCGAACCGATATAGTATGGTTCGAACC GAACCGAACCGGTTTCAAATTTTGGTTAACCAGTTCGGTAAAATATGCATATTTATAGATGGTTCGAACCGAACCGAACC GATATACTATGGTTCGAACCGAACCGAACCTGAATTGGTAGTTGATATTTTGGTTCGGTTACCGAACCGGTTTTTCAATT TAGGTTCGTGTTCGGTTCGGTTCTTGAACGGTTCGGTTTTCGATTCGGTTCTTGGTTAGCTTCGGTTCTCAGAGAACCAT GAACAGTCCTAGCTGTTGGTATTCTCCTATTTATGTCAGCTGTATGTTACAGCTGTTGGCATTCTCCTGTTCTTCTATAT AAGGATATCTCATCTTCTGTAATCACTCAGATTATCAATAATACATTTTCTGTTATATTTCTATTTCTCTCTTCTCTCTC TCATTGCTTCTCTAATTCTAACAGAGAGGAGGCTTGGGTTGGTAAGGTTTGTGCAGGTTCAGTTTGTTCAAGTCCCAAAG ATTGGTATTCCAAAGTTTCAGTTGGATACCTGTATGATTGCTCCCCCTGAATGCCAACTTTGGTATAATAGGCTTGATTC TCAAAGAAAGTTACATCCATAGTGTGGTAGAATTTTTTAGTTATGGGAGAGTAGCACCTATATCCTTTTTGGTGGGGAGA ATAACCAAGAAAATTGCACTTGATAGACCTTGGGTCCAGTTTGCTACGGTGGGGGTTGAGGTTGTGGACAAAGGCTGAAC ATCCAAAGACTTTTAATGGAATGGAAGAAAGGATTTTGCTGGCTGGAAAGGTGGTTTGAAGTGTGGATAATGGGGTCTTA CAGTCAAGGATACGGGAAGGCATTCAGTTTATGAGATATGTGGCCGAAAGGACAGCTTCTCCCCAAAATTGTTTTGGAAC ATTAGTAGCCGACATGATTGATCTAGTCACTTCCAGAAGGTGTCTATTCTTCCTTTCCGCAACTCCATTCTGTTGGGGGG TGTCTACACAAGAACTTTGATGAACAATTCCAACCTTTTGAAGGTAGGAAGTTAGAGCAAGATTGTAATACTCACGACCA TTGTCAGTTCTAAGTATCTGAATCTTGCTTTGAAATTGTGTTTGCACCATGTTATGAAATACTTCAAAAATCTTCCCAAC TTCTGATTTTTCCTTCATTAGAAACACCCAAGTGACTCGTGTGTGATCGTCAATGAAGGTGACAAACCATCTTGAGCCAG TAATGTTGTGAACCCGTGAAGGTCCCCATACATCACTATGGATTAATGAGAAAGGTTGAGATGGTTTATATGGTTGTGGT GGGTAATGGCTGCGAGTATGCTTAGACAATTGGCAAGTTTCACACTGAAAATTCTTCTGGTTTTTATTGAATAATGAGGG AAAAATCTTTTCCAAGTACATGAAATTTGGGTGGCCTAATCTGTAGTGCCACAACATTACATCATTTTCACTACTTGGAA CTGTTGCTACTGCATAAGAATGGGTTTTCAATTCTTCTGATTTTTCAACTTTGAGGAGGTAGAGTCCAGCACACTCTTTA GCATTGCCAATCGTCTTCCCCGACTCCAAAATCTGAAATTCACACAGGTTATCAGAGAATTTAGCAACACATTTCAAATC TCTTTAATCTTGCTAATGGACAACAAGTTACAATCAAGTTTGGGCACATATAAAACTGATTCAAGTGTAATATGTGGGGA GATAATAACTGATCCTTTACCCATGACCTTAGAATGTGTTCCATCAGCTATTCGAACAGTGTAGTTATAGGGACAAGGAG AATAACTACTAAACAAAGTTAAGTCTCCAGTCATGTGATCTGAAGCTCCTGAGTCAATGATCCATGACTCTATTTTCCTT TGCTAGTGTTTAAGGCATATAAGAAATTACCTTTTTGAGCCACTGCAGCAGTACCACTTTTTCCTGCAGTTAACATGGTC TGCTGAAGGAGTTTTTGAAGAGTCTCCATTTGTTCTTTGCTGAATGGTGATGAATTAGATATTACCTCAGAGTTTTGGTG GTGAACCACAGTGTTTCCTCTGCCTTCCTTGCTTTTGAATTGTTTGGCTTCTGGAGGTTTTCCATATATACTCCAACAAT TCTCCTTGGTGTGGCCTGGCCTCTTGCATTGATCACACCAGGGGCGAGTTTTCTTTGTTAGTGGCTGAGGTTGGTTTCCT CTTGCTGCCATTGCAGAGCTTTCAGTGGATGGGGCTGAGATGGATGTCCCTAGCATGAGTTTCCTCCTGCTTTCTTCCCT TCTTACTTCTGAGAAAGCTTCCCGAATTTTTGGAAGTGGTTTAGTTCCAAGGATCCTTCCACGAACCTCATCAAGATCCT TGTTTAGTCCCAATAGGAACTTGTAAATTCTCTCTTTTCCGACCAGGTCCTTGTATTTCTTCTGATCCTCCGTACAACAC CATTTAACTTCTTCATATATGTCCAGTTGCTGCCAATGTCTGTTGAGTATGTTAAAATACTCAGTAACTGAGGATTCTTC CTGTCGAAGGTCATGGAGTATGCTTTTTATCTCAAACACAGCAGATGTATTGTCGACATCTGAGTACGTCTCCTTCACTG CATCCCATATATCTTTTGCAGTGTCATAGAACATGAAATTTTCACCAATTTCATTTGTCATGGTGTTGAGCAGCCATGTC ATCACTTGGCTGTTCTCAAGTTGCAATTTTTGAAGATTGGTGTCCCCTTTCTCAGGACACTTGGAATCTCCTGTGATGTA GCCTTCTCTTCCTGCACTTGGAATCTCCTGTAATGTAGCCTTCTCTTCCTTTTCCTTGGAGGAAGATCGTGACCGACCTT ACCCATTGGTTATAGTTCTGGCCATTCAACTTATGACCAGTGATAAGGTGAGTAAGCCCGTCGTGTGAGCTGGTCGGAAA TGATCCAGCCTCCGCCTTGAGTGACTCATCAGATTGTAGGTCTCCCATGGCTTGACGGTGCTAGGTTAGGGATGGTTCAG ATCGAGCTCTGATCTGATACCATGCGGAAAATGTATGATATTATATTGATAGGTAAAATGATACATGAGCAGTATTTATA GAATACAATTGACTAAAGACCTGGGCACTATTCTAGCCTAAAAATCAGGGAAAATATTCTCTCTATGAATGCTAATAACA TTAACATAAAAGTCCTAATTAGCTATACAAATCAGACTCTAATTATTCTAATTAGTGTGCTAATTAATTGCATTTGACTT TCAACAAGATGAATAGAAAGAACTTGGAAGAGCGAGGAGGATAAGAAGTCCTCCTTATTAAAACAAAACATAAAACAAAC TTGGAGAAAGATAAAATCAATGTCACAAAGCTTCCCATTTCCTCAACATATCTATTCGAGAAACCCATGAAAAGGGCCAT GAGCTTTGCACCAAATAGAGGCCAACTGCCTAATCTCTTCCAAAGGTAAGTAATTTGTCAAAGAATGTAAGAATGTATGA GGTACAGAGTTTGAGCAAATACCACACATTACACACCTATCAAGGGAGTGGGCTTTGTGTCGGCTACAAACTTGCAAAAA GTCAATTATGTTCAGTAAGTACTTCAAATTAAATACAAGACTTGATGTCTTGATCTTAGAGTTAAGTTTAGGATTTCCGG AATGGATTATCTAGAATTCAAGGAGTGAGGAACTGAAAAAAGATTCACTGAAAAAATCTCCAGAAGGATCAATGGACCAA CTTCTTTTGTCCAGATGAGAAGACAATTTAATATAATCAAGGAGGCCAAAGGGACACACATTAAAAAAGTTGAATTTCAG CTCAAGGGAACATGTGCATTGTCCCACTTCAAGCTCAATGAATTCTTGCATGACGGGGCGTGTTAGAAATATAATAAAAT CATTCATGTGTCTTCACTCAACAACTTAAGCTTTTGGAATAGTTAGTTCATGACAAAAAGGTAAAGGAAAACTATAGTCC AAACCAGTGAAACGGATTTAAATTTAAATGGCTTGTCACTAGACTTAATTTATATTTATGATAGAAAATATGACATCTTG TTATCCATGTTTTTTTACCCCACCTAGTGGGAAAAGGCTTTTGTTGTTATGTTCTTCATTTGAATATTTAGTGAGATTTA CTCTGTAAATTGCCATGTTCCAGTTTTCTTCCTCTGAAATTATCTCTTTATCTTCCTTGGAGCCTTTTGTTTTACCGCTT TATTTTCAAGTTAGAATTTCGTAAGCACTGTTATATTTCAGCAAAAAATTTATTTGATTTTTCAAATGACTTCAGGTTTG AAAAATCCACTTACCCTGATGAGCTATGTGAGTCCAGTAATGGCATTGGCAACTGCACTTCTTTCCCTTGCATTAGATCC ATGGGAAGAATTCCAAGAAAATGAGTACTTCAATAATTCACGGCATATTACTCGAAGTTTCTTGCTGATGATTTTTGGTG GAACACTTGCCTTTTTTATGGTAAGACTCCATATTCCATTTAAGATGCATATATATATATATATATATATATATATATAT ATATATTCTTTTATCCTACTTTTCCTGCCACCCACCCATGGGGGAGTTTAACAATTTTATACTTGTTAGTTATTGTTTGA CTTGTCTTAAACATGCTTTTGTTTGTTTACAGTCATATTTGTTAACTTGCAGTCTTTCGTTCTTTCCAACATTTGTATTT TTATCTTCTTGCAGGTACTAACAGAATATGTTTTGGTCTCAGTAACTAGTGCAGTCACGGTCACCATAGCAGGGGTTGTT AAGGAGGCCGTCACCATATTGGTATAAATTATGTTTTTAGATTAGTTCCATTTGTTGATATGGTTATTCAGTGGCTGCCC CTCTTATTATTTGATAGACTACCTAGTTTCACTTCCGCAGCTCCGTGGTTTATTTCTGACAAGCATACATTTTTGCAGCA CATTCTTTTATTTATCTATAATATTTACTTAGATTCTTGCTAAGTTCATTAGCATTCAAAAAAGAGCATTCATGAAACAG TTGCATAAAAAATCATTTATACAAATTTTCTTAATGAACAGACAGCTAGAAATCTTAAAATAAAGAAATTTGATATCTTG GTTCAGTTCTGATGTTACGCCATCTTGGTTCAGTTCAGTTCTGTTGTATTTATCTTTCTTTAATATTAAAGGTAATTTGG CCATTTGGTGGTGCAGTCTAGACTGACAAGTTTTGGGTTTAGGGTTTACTTAGTTATTCCACCACATGATAAAAAAAATC AGCATCCTAAGAGTAGACGAACTGCACATATAATTTGGACTTAGTCTAACCTAACCATCAAAAGCTAGCTAATAAGGTGA GGATTGCTCAAGCTTCAAGCCTTATATGTTCTACTTTAGCCATGTATATTTAGTTATTTTCATATCTTAACACACCACCC CTGACATCCATAGGTTCTGGAGCGCTGAGATTATAGGATTGATTTGGGTGGCCCAATACCAGATCTATGATAGGCTTTAA TACCATATGAGTTTTGGTCACTAAGGGGTGAGGATTGCCCTACCATTTTTAAGAACTACTTTAGTCATATCTCTAATAAA TGTGGGACCGTCAAAACACTCCCTCCTGCCCAGGAGTGAACTTTTGAAGCAAGAAGTTTGTAAAACTTAGTATCTGCAGG TGGCCCAATAACGGATCTATGATAAGCTCTGATATCATCTTAGACTGATTTATAATCCTAACTCTACCACAAAAGCCATA TTAGGGTTGAGGAATAGGATTGTCCTACTCCTACCCTTTATAAAAACTACTTTGATCATATCTCTAGTCAATTTAGAATC TCATCAGTCATATAGAGTTAGCAATTTCAATTTGATGTTGATACTGATGACGATGAATGAGAAACCAGTGTGAAACTTGA GCATGATTTCTCATTATATTTGATCATGTAGTGTTCAATGAGAAATCAGGTGCTTTTAGATTGTAAGTCCATTCAAAATA AAGAGTTTAGTTTTAAGTTTTAACCCAATATCAACGTAACTCCTCTTTAATATCTTATGTTTCATCTCAGCACAACAGTT TGTACTCTTAACTGATAATGTGTCAATACATGGTTGGATGATGGCTTAGAAAAGTTTTACATTACCAGGGGATTAAAATT AATTTAAAAATAAATACCCATTTGTTCTATATCTATCATGCTCATACTTATTGTTCTACTCATAAAACACTTTTTATGTT CCTGCTTTTGTTAAACCTTCTCACTTCCTGGTTGCTGATCGCATTGAACTTACTGTTCTAGTTTCATACTGTTTGTCTGT AGGTTGCAGTGTTGTACTTCCATGATGAATTTACTTGGTTGAAAGGATTCGGTTTATTAACCATTATCTTTGGTGTCAGC TTGTTTAATTGGTACAAGTAAGTCACCAACAGATGTATATTTCAAGCAACAATCTCTGATTTGTGATAATTCTTTTCTTA ACTTTTAATTTATGCTCTGCTACTCATACAAAAAATAATTTTATTCTTTTAACTGGTCTCGTTGGACTTTCTGTCTTACA AAACTTTGGCCATACTGATTACTGAGGGAGTTAATTGAATCATCATCATCATCATCATTATAATCTATTTTCCTACTTTT CCTACTTTCAAAGCCCCTTGGGATGTTATCTCATGCAGTGTAGAAACCGAGGCTTGTGGCATAAGAAGGGAATATTCTCA TTACTTTATAGTTTATATCATGCTTGCAGTTGTTTTTGCTAGTGCAGATAGCTTTCGTTTTTTAAAGTTTCAGTGCTGCA TCATTTGCTGAGTGCTGGAGTTGTTGTTCATGGCTTTATGCTAATGGATTTTAGGGCCTCCTTAGTTCTTACTCTGCATT TTCCTTTTGTTCCTTGCATATTTCAGTTATTTTTAATTAATACTTTAACTTCAATTGAAAAGTAAATATAATTAAACGGT TTCTTATATTTATTAATTTTTCGTCATTAGTTTAATAATAACTTCTTTTTATCACAATTTTTTTTCTATTCACTCTACTT TAATGAAACGACCTTTGTATGATATGTAAAACTATGGAACTGCTAATCTTCCGACTTTATAGCTTAAGTTACAACATGAT GCTGTGTAAATGTTGTAGACCTACTATCTTTGTTTATTGAAGTTATACCAATGTTTTGTGCCTAATACTTCCTTTCAATT TAATTCTAGTCATGAATCATTACTTTTTATAATTCCAGATATCAGAAGCTTCAGAAGGGCCATGTAGGTGACAGTGCGGC AGAGCAGCATACAAGAGATTCTGCAGCCAAATATGTTATTCTTGAGGAGATGGATGAACAAGATGATGGCATCTGAAACC TATATAGACCAAACAATTTAAGTCCAAGTAAGCCTTTTCTTGAAGCCGGTTAAGTTTTTTTTTTTTTTTGATAAGCCAAG AATTATATTGATGTGAAGTACAAGGGGTACTTCAACCCAATACAAGAAGATAGAAAGAACAAGTAACATGAAAAGCTAGA AAGATAATTACTGCTCAAAATTACAATGGAACAACCCCTTGGAAGCTAGACTTAATAAATAAAGCCTCATTAAAATCTCA CTAGGAAAACCCTCTTGGGAAAAACCTAGCAAGGAAAAAGAGTACAATATTTATACTATATTTGAAGCCGGTTAAGTGAT GCATGTCAATCTAATATTTTATGATTTCACAAGTCACTTCATACTCTAGTATTCATCCTGATGCAGCAGATGCTTCATGT TCCTAGAATCCTGCTAATGAGACTACCTTGATTCGTGTATTGTAGAAAAAATTGAAGGCGGGAATCATTTAGTTTCAATT TTCAATTGTAACAAATTTCCTTATTTTGCAATGGCAAGGAAATTTGCAATGCTAGAAAACGTCAATTTAAGGCAGAAACT CTAATATAAGTAGAGAATATTTGCCCTTCCTTTGATTATAATTCTTCTTGTTGCAGTTTACTGTTTTGTACTGAAGTCTG TTCTCCTGAATTGTATATATTGAGCAATGATTTCCAAATGCCAAAGAGCACGGAACTAAACTTCAGCGAATTGCTTGTTG GCCTGCGCTATCTCATCTTTTCAGCATTCACATGTTCATGTTCATGTTTCGTTGAATTGTGATGCCAAAGCTCGTTCAGA ACTTTTCAGTAAGCTAATTTTCAAGATATACGGCAAGCCTGCGACCAACATCAATGCCAATTGTTTCTTCTATTCTATCA GAATAATAAGTGCTTGGTCAGTTACAGATTTTGGCATTCTTTGGAGCTGATCAGATTTTGTTGTAGATCACAACAGGTTG TTAATTGATCAATGTTCTTCATTTATGCTTTCAAGTGTTGTATGAAATTTTATTTTTTGTCATCCTAAAAGCAGTTCTTA ATTTCTTACAACACTTCAGAAAATCTAAGCATTAGTTTCATTGTTCCACTAGGCATAGCATAAACCCTCTCATTATGCGG GAGGATGGGGGGGGGGGGGAGCTGGAAAAAGTACAATTAGGATGTGAAGTGCTGGAACCCAAAATCAAGTATATATGACA ATTCGTTGAATAATCTCTCTATACACTTAATGGAGATGGACATAGAAAAATTGGTGGTGGTATAAATCAATTGGGTAAGT GTCAAATATTATGTAAAATTAGTGATAGCCACACATTAATTTTATATTGTCAATAGAATATGTAACAGGTGCTATTTTAA TGCTCATGCAATCAAGTTATTCATGACATGAAATGTGCTTGCCATTCAAGATATTAGAGCATCTCTAATGCAAGGTTATT ATCATTTCTCTAGTTTTCTTTTTTTGAAATTCAACTCTCCACAACCTCCCAAACATCTTGAGACCCAAGCAAGGCCTTCA TCCGGCGACACCAATTATCATAATTTTCTTTGGCAAAAGACGAGGGAATTGGAACATACTTAAATCATTGCTTGCCATTT CTCTACTCAACATGTGTTTCTCTCTCCCTTCTTATAACCTAAGCTTTGTTCCCACTTTGTTGGAAAATAAAATATGGAGG GTATAGAAAATGAGGAATTGTATTATTTTACCACACATATTACATGAGTTGAATCTATTTATAATAGTCTACTTAAACAA AATACTAAATAGAGATAATGGTAATTAAATTTGAATTTTATCCAATCTTAATCTACTTTTGTTTTCTTTGAGGAATTAGA CGATAATTGTAAAATATAAATAAATATAACCAAGTAGATTAGTATAATGGTTTAGCAAATGATTGAGGTTCAAATCCTAA CTCCTATGAATAGTAAAAAAAAAAAACCATTTGCTAGCCCCTACTCCTTCGTGCGTTGACTATAAAGCGATGAATTAATC TCACGATTATTCGGTGTGGAGATACCTTGATAATATATATATATATATTGTTCGGGTTTCACCAAACCCAAACCCATATT GGGTTTTACCCTGTTAAATCGGGTTGGATTCAGGGAGGTACTCACGTGTTCGAGTTATATTGTGATCCCTAGTAACTAAG AGAAATTGGCCTCCTCCAAACCGCACTAACCAACTAGCAGTCACACCATATATACAAAAGAAAATGGCGGAGTCATGGCC GCCACTGCCATAGGTGTTATTAGTGTTTAGGTAAGAGGAAGAGAATGATTCAAAACTGATTCGAAAACTTTTGCAGTACC AAATTTTATGCAAAATCTGACTAGGATTACTACGTGAACTAGTGATGATT
CDS sequence (LotjaGi6g1v0162000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGTTCAGAGTGAATTGGAGTTTGAGAGCAGTGAATTTTCAGTGATTAGTGATATTGGTAGTGAAAGCTTAGGCTCTGG CATTCGTAGAGAACTATCGTTTTCCGGTTGGTATGATGAGGATGGAAGGGTCCATTTGGATCAGCAATTAAGTAATGAAG ATGTTTGTGTAGAAGAAGACTCTGATTTTGAGTTACCTTTTCCTTATAACAATGAGCTGCAAAGCAGACATTTAGATAGA GAGAGATTCTTTTACCAAAAGTATCAGCAAAGGTGTTTGCAAATGAATGGTTCTGGTGCCATGGATGATGATTCTATTTC TCAGATAAATAATGGTTCTGTAAAGTATGTTCCTTTTGACATTGAAAACGACCCTGAAAGGGGAGCAATTGGTGTTGACT CCAACATTTCTGTGGGTGTTGATGGAACTTTGGGAAAAGGCTCCCAGGATACTATTTCTGTAGCAAATATATTGAAGACG TTGTTTTTCATATTCATGTGGTACACTTTCAGTCTATTTTTGACCTTGTACAATAAAAGTCTGTTAGGAGATCATATGGG GAAGTTTCCAGCTCCTTTTTTAATGAATTGTGTCCACTTTGTAATGCAAGCTGTTTTATCAAAATTCATCACCTGGTTTT GGTCTGAGAGGTTTGAGACTAACGTTGTCATGTCCTGGAGGGATTACTTTTTGAGAGTTGTACCAACTGCTCTTGGAACA GCGATGGATGTGAACTTGAGCAATGCATCTCTAGTTTTCATCTCTGTCACATTTGCTACCATGTGTAAATCTGCTGCTCC GATTTTTCTCCTTCTGTTTGCTTTTGCTTTCAGGTTGGAGACACCAAGCTTTAAACTATCAGGCATCATCTTAGTCATCT CCATTGGCATATTACTAACAGTTGCAAAAGAGACAGAGTTTGAATTTTGGGGATTTGTACTTGTTATGCTTGCTGCTGTT ATGTCTGGATTTCGCTGGTGTATGACTCAAATCCTTTTGCAGAAAGAAGCCTATGGTTTGAAAAATCCACTTACCCTGAT GAGCTATGTGAGTCCAGTAATGGCATTGGCAACTGCACTTCTTTCCCTTGCATTAGATCCATGGGAAGAATTCCAAGAAA ATGAGTACTTCAATAATTCACGGCATATTACTCGAAGTTTCTTGCTGATGATTTTTGGTGGAACACTTGCCTTTTTTATG GTACTAACAGAATATGTTTTGGTCTCAGTAACTAGTGCAGTCACGGTCACCATAGCAGGGGTTGTTAAGGAGGCCGTCAC CATATTGGTTGCAGTGTTGTACTTCCATGATGAATTTACTTGGTTGAAAGGATTCGGTTTATTAACCATTATCTTTGGTG TCAGCTTGTTTAATTGGTACAAATATCAGAAGCTTCAGAAGGGCCATGTAGGTGACAGTGCGGCAGAGCAGCATACAAGA GATTCTGCAGCCAAATATGTTATTCTTGAGGAGATGGATGAACAAGATGATGGCATCTGA
Protein sequence (LotjaGi6g1v0162000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MVQSELEFESSEFSVISDIGSESLGSGIRRELSFSGWYDEDGRVHLDQQLSNEDVCVEEDSDFELPFPYNNELQSRHLDR ERFFYQKYQQRCLQMNGSGAMDDDSISQINNGSVKYVPFDIENDPERGAIGVDSNISVGVDGTLGKGSQDTISVANILKT LFFIFMWYTFSLFLTLYNKSLLGDHMGKFPAPFLMNCVHFVMQAVLSKFITWFWSERFETNVVMSWRDYFLRVVPTALGT AMDVNLSNASLVFISVTFATMCKSAAPIFLLLFAFAFRLETPSFKLSGIILVISIGILLTVAKETEFEFWGFVLVMLAAV MSGFRWCMTQILLQKEAYGLKNPLTLMSYVSPVMALATALLSLALDPWEEFQENEYFNNSRHITRSFLLMIFGGTLAFFM VLTEYVLVSVTSAVTVTIAGVVKEAVTILVAVLYFHDEFTWLKGFGLLTIIFGVSLFNWYKYQKLQKGHVGDSAAEQHTR DSAAKYVILEEMDEQDDGI
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 156 | 156 | - | – | |
| PANTHER | 91 | 474 | 384 | 6.3E-198 | – | |
| PANTHER | 91 | 474 | 384 | 6.3E-198 | – | |
| TMHMM | 155 | 177 | 23 | - | – | |
| Phobius | 157 | 177 | 21 | - | – | |
| Pfam | 159 | 458 | 300 | 4.4E-29 | ||
| Phobius | 178 | 188 | 11 | - | – | |
| Phobius | 189 | 214 | 26 | - | – | |
| TMHMM | 192 | 214 | 23 | - | – | |
| Phobius | 215 | 250 | 36 | - | – | |
| Phobius | 251 | 277 | 27 | - | – | |
| TMHMM | 251 | 273 | 23 | - | – | |
| Phobius | 278 | 283 | 6 | - | – | |
| TMHMM | 283 | 302 | 20 | - | – | |
| Phobius | 284 | 303 | 20 | - | – | |
| Phobius | 304 | 308 | 5 | - | – | |
| Phobius | 309 | 332 | 24 | - | – | |
| TMHMM | 309 | 328 | 20 | - | – | |
| Phobius | 333 | 343 | 11 | - | – | |
| TMHMM | 343 | 365 | 23 | - | – | |
| Phobius | 344 | 365 | 22 | - | – | |
| Phobius | 366 | 384 | 19 | - | – | |
| Phobius | 385 | 407 | 23 | - | – | |
| TMHMM | 386 | 408 | 23 | - | – | |
| Phobius | 408 | 413 | 6 | - | – | |
| TMHMM | 412 | 434 | 23 | - | – | |
| Phobius | 414 | 435 | 22 | - | – | |
| Phobius | 436 | 440 | 5 | - | – | |
| Phobius | 441 | 460 | 20 | - | – | |
| TMHMM | 441 | 460 | 20 | - | – | |
| Phobius | 461 | 499 | 39 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi6g1v0162000.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…