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Field | Value |
---|---|
Gene ID | LotjaGi6g1v0207200 |
Transcript ID | LotjaGi6g1v0207200.1 |
Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
Description | Protein ENHANCED DISEASE RESISTANCE 2-like; TAIR: AT5G35180.2 ENHANCED DISEASE RESISTANCE protein (DUF1336); Swiss-Prot: sp|Q8VZF6|EDR2L_ARATH Protein ENHANCED DISEASE RESISTANCE 2-like; TrEMBL-Plants: tr|A0A072V707|A0A072V707_MEDTR Pleckstrin-like (PH) and lipid-binding START domain protein; Found in the gene: LotjaGi6g1v0207200 |
Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr6:50468897..50482046) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CCGAACAAGGGCCTTGTGTTTTGGTGGGAAAAACAAGGCGAACAATTCACTGTGTTTCTTCTTCATTCATTGTCATCTCA ATTCAATTTCAACTCAGGAGGATCAAAATGGAGGCGTTAAGTGGCGGAGCAGGTGGTGGCGGAGGCGGAGGAGGATCGGA AGAGAAAGGGATATTTGAATACTTCGGTTGGGTTTATCACCTTGGCGTGAATTCCATCGGCCACCAGTATTGCCACCTTC GTTTCCTTTTCATCAGGGGCAAGTGCGTCGCAATGTACAAGCGTGACCCTCACCAGAACCCTGACATTGTATTATTCCTC TATCTCTTCATCTTCCTTTCACTCCTTCATTCATTGCCCATCAAAATTATTCAATAACACCATAAAACTTTGAAGCCTTT TGCATTGTATTTGAATAAATTGTGCTTGCTGATTTGTTGATTTCAAATATTCAATGTTTTTATATTTTTCTAGTTTCCTA TGTCATTTCTGTTTTTGTTTTCTTCACTAATAGATAGATAGATATGGATATACCATGTTAAGTTGTTAACACTTTCGTTT TTATGCTCAGAAACCCATTAGGCAGGGAGTTGTAGGGCCTACACTGATGGTGGAGGATCTCGGGCGTCGAAAGGTCAACG ACGGGGTAAAACACTAGAATTTACATTTTTTTTATAGTCTTTACTCAGTTATGTTGTGATTTTAAGATATATATGTGTAT GTGTGTGTGTTTTGTTTAATTGTGAGTTTTTTTGGAAGCTAACTGTGTTTTGTTTTCTTCCACAGGATTTCTATGTGATA CGCTTTTACAATCGATTAGATGAGGACAGAAAGGGAGAAGTAAGTTTCAATCGTTTATTCTAATAATTGTTTCATTGATA GAAAGTTGCTTGTTGTACAGCATGTTTTTTTCCCCATTTCATCCACTTAGCTTGAATCCCATGGGTGACATGCTTCCTAT CTGTCTCCCTTTGCATTGTTTTGCAAGATGGATCCAAGATAGTTAGACTGTGCAACTTGTGATATGTTTTGATCCCAAAG TTTCATCTGAAAAACATTGCTATATTGCTCCTTTTCATAAACTTAAAGTTACTCCTACTTCATTCCCCTTTGATTCCAAA GTTTCTGTCCATGAATCAAGTTTATAATTTACTCATTCCTTCTTGTATATGGTTCCTTCTTGTATAAAAAAAAAAATATA CAAGAAGGACTGAGTAACTAGCTTTTGGGTGTAACCAGTAAGTATGATCAATACAAAGGTAAAAATATATGAAATCAAAG TAGCTTCATGGTGCAAACCTACTATAGATTTGTTATAAGAATTTTTTTACTGCACCCACCTCCATGAGTTTGTACACTTG TTGCTACCTCATCACACACAATATAGCTGAATATGTACGCTATACATCCATAGAACTTCTTATAGCAACATATTCTAGGC CTACATGTTACTTGAATTAGAAGGCACAGCCTAGATAATCTGTCACAGAACAATTTCAGATTAGAGAGGTTAGTGGAGGG AGAATAATGTTTTAGATACATTAAAGTCAAATAAACGGAAGAGAATTGTAGTTATATTAGTCCAACATTCTCTTCAAGTT GAGGGAACTTCATCCTAGGCCACAAACTTGAATTAATGTGCTAACGAGCTCTTATTCCATGAACTCTACTAGGAAATCAC CTAGAAAATAATTAACAATCAATAATAAAGATCTGCATTTGCACAATCCACATTAATTCTATATCAATTTTCTTGATCTC AAATCTAGATCTAATCAAATTTCCGAAACCAACTGAATCTCGCAGGTGATTCGAAACACAACTAAGAACACGGTCCTATA ATTTCAAACCATAGCTTGCCGAGATATCTTAAATTGAATCCAAATCTAGTTCTCTTTGGCTATGACCTTGGAAAAACTTC CACAACAAGCGAAAAAGGAATCTTCCTAAACAAGTTTTTAAAGAACTAAACAAATGAGAAGTAGTTATTTTCAAGTTCAG CTTTCCATCTTAAATAACTGCCATCAAAAGCTAAAATGAGAGTGGTAGCGATTTTATCTTGGTTGTTGGATAAACGATGT TGGTGGAGACCACACATTTATCGAGTTCCATCCTTGTTGTGGAGGATTGGCACCAAAGTGTTTCAAACTAGATTCCCATA ATTAAAATATGTAGTAGAAGCTAGCATTTGAAAGGTTAGGTTTAAAAGTCCAATAATAATCTATTTATCCAACAACTACA CTAGCATGCAAATGTATCTGAATTTGTCTGTAGGGAAGAGCTTATTCATTTGAAATTTAATTAAGCCCTCCATGTCATGC ATGCTGTAATCTTTTATTTATTCAGCATAAAAGTGAGATTTTTACGTAAATTTTCTTCAAGATTGCTTGTGCTACAGCTG GGGAAGCCCAAGGATGGATGGAAGCATTTGATCATGCCAAGCAACAGGTATGAGGATGTAATTGCGAGATTGCTCTTTTA ATGTGAATGTTCAATATGTTTTTAGTGTTAATCATTGTCACTGCCCAAGCCTGATTGTTATCAAATTTTGTGGTGTTAAT TTTTTTCAAATATAGGTTTCTATTGAATGTAAAGAATGAGAGTAGCCGTTTTTCTGGCCAGAATAATGTGGCATATCATG AAACTGAATCTGTATTTACCATAAATAAGAATTGTTCAATATATCCTCTTTGCAGGGTCAGTATGAGCTGACAAGAAGAG GCAGTGCCAGAGACAAACTAAACAAGGAAATGGAGTATGCCTTTTTTTTCCCTTCTTCACCTGGCATACACTTATGCAAA TATCTGGTGAAATAATATTTGTTTAACAGTACTTGTTATCTACTCTAATTGTTAATGGCTAATGACGTTTTAATGTCATA 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CATGAATGAAAAATTTATGATTGGATTTATCCTTATCCTTCTAGGTGCTTTTTGTTTGTGGTTCCAGGTATTAGAATTTT TGAGGATGTTTCTAGCCACAAGGTATGCATGTGCTCACGTTTTTGGAGCTTATTGATTATTCTGATTATCGCCATATATC TTCAAAACTAATTAGCTCTACATTCATGTATGTCATTCTAAAATAAGTTTTAAAGTTACTTGGCTTTATCTTGAATAATT TTTTTGCCAGTACTTCTCTCTCTGGATCACCTTTTTTCTTGAAAGGCTTAAAAATCCCAAGTTGCTTTAACATATGATCT TAAAAGTTTATATATTTCTTCTGGTGTGTGGATGCATGCACATATGCAAAACTGCTGTTTTTTAGGATAAAAAACGATTG TTAATTACAGGAACAACACAAGCAATGATTCATTGTAAGACAAATAGATTTCATGCCTAAAAACCGGGCAAACTTTGGTC ATAAATATAATTCTAAAGTGAATGTAAAGGAATAGGTTTCCAATTTTGGAATTAAACCAGATGGGCAACTTTTCCCCCTG AAATAGTCATTTGTGCTTTAAGACTCAAATTATTGTTTGATATGTGAAAAAGGTATTCCTTATTGTTGAAAGAGAAAAAA GAGACATTTGATACACAATGGAGAGATGGAATGTAATAAATTCAATAGGCTAAGAGTGCAGTACAACACAATACAAAGAC GTCTGGACCAACCAAGCCTATATTTTATGTCTTTGAAACTGCAGTTACAGCATTTGAAACAATTGAATGAGTATTTTGCT TCCCTATGCTGGGATAAGTTATATGTATATCTATTTTCTGCTTTGACATTCTTTTAATGCTTTGTAGACTGGTAAGGGTA TCCTCGCTAAGTCGGTTGGTGTTATTGATGCAACTGCAGATAGTGTTTTTGAAGTGTTTTTAAACACTGAGCGACAGCAA 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AAATGATACTTGTCAAACTAATATAACACCTCAGGAGTGAACTTTCTTTAATTTCATAGCATCCATCTCGCTTAATTTTA TGTAAATATCTCAGTCCTTCAGCACAACTGTTTGCTATTACTGTTTTGGTGGTGGTTGATGTTATCGTCCTAGCCTTGAT TGGCTTGGATCATAAGAAGCGATTCTTGGATTTGTTCGCTGGTTTATTTGGAATTGTTCTGTACTTTAACTTACTTGGTT GACTTATGCTGAGATATTTTTCATGTTGTATTGATGCAGCTATCTTGCTATTTCCAGCTATCCATAAGAAAAAGCCTCCC AGATCAGGCTTTCGACGTACAAAAATCAATCGTAAGATACATTATTTGCATAAGGAATTTAACTTCCTTTGTTGTTGGTG CACTTGCTTTTTGAATTTTTTGTTGATTCGTTTTGAAATATAAGTATCCTAGAAGCTTAAATGGTTTGAGACCAACCCAA CTTAGTAGTCAAGTCTCAACCTCCAATCTCATGCACAGTTAAAACTTAAAGCGACTCAAAGTTCAAACCACAAGCAGTAA ATAAGAAATTCATTAAGAAAAGTAGAAAGATTAATTGCAAAGAATTTGGAGTATAAGGGACCCTCTGTAACGTAAAAACA AAACAAAAACACGGGCAAAAGAGAAGAAAAACATAAATGAAGCAAAAGCTACCCAATTTCTCTATGTATTTGTCAAGAAA ATCCACAGAGAAGGCCATGCGCTTTATACCTAATCTTATTCCAAATTAGCTGTTGTTCCACCAAACCTCCTTAAAGATAC GAGAGTTATGCTTCAATCACATGCCGTAAAGTTTACCATGGATTGCAAAATGCCTCAAGTTAGACCTTATATAGACGCAT CTAGCTTGATAAATATATATGTTATCGTAAGACCTTGTATAGATTTAGTAAACATATCAGCTAGATGATCCTTAGTTCGT AGGAGAAGTCTTGTTGATACCTAAGAGGATTTTTTATTGGATGAAGATGAACTAACAATCAACTTCTTTGTGCTTTTGAT TTGAAAAAAGAATCAAGGCTGATTGATTATCACAAACAAGCTCCATAGGGCAAGAATTTTAGGCACAAAAATTTAGTAGT ATAAGCCATAGCATGATAATTTTCCCCTGTACTTGATCATGCAACAACAGTATACTTCTTGCTCTTCTATGAGATTAGGT TTCATAAAAAACCAGCACCAACTTAAGCTCCTCAATGTTGCATTGTGGTTTGTTCAGGTACGAAGGATGGTCATGATCAA TCATCTTGAACGTTTCCAAGCTATGAATAGACCCATACAACCACTGTATATCATCAGCATATACATTCAGGACCTTCTTC CAAACACAATTATGTTTTGTTAGGGTGGAGTGCACCACTAATTCGCCTTTTGCCACTCATCTTTCTTGGATGCAGCAATA TCAGTAACCATTTTAGTGAGGTGTTCGCAAAAACCTTAGCCTAAAACCATACTTTGCATTATGCTAGTCCAAATAGGAAT CAACAATGCATCATAAAACATTTTTCCAAGGTCCTATGGAAAATTCAACTTCATAAAATTGCCAAGCTAAACAACAAACT TCATAAAGAAACAGCAATGGAACAATGTAAGAACAGATGAAGAACTATTACGAGCTTGCCCCATATATATTGCACATATT TGGGGAAAATAGCCATATGTGGCCTGCAAACTTGCACCATGTCAATATTAATTCTACTATACCAATTCTAACAAGAGACT TGAACGGAGGAGTAGTGGTGCATGGTGTTAAGCTCATGAAAGAGTTACATTTCAAGTTTTTTTTTTAAATTTTGGGCTTC CTGAATTCTTTTGGCACTGCTTTTTTGGTCTCTTACGTACCTCTATATCATGGATAATGTTCAAGACTGAAGATTTTGAC ATTACATTTTTAGGTGTTCTACAAATTTTTGTATAAATTCATTTAATTTCCTTTGTTCTTCCCATTATAAGTTTCTTTCT TATTATGGAAAATGGGCAGATCAATTGACATTCTTACAACCTTGAAAATCTCTGATTTGGTTACTTGAACTCTATCAGAT TATTTCAAGTTGTTTTCTTATGGTAGAAACCATGTCTTGAATCTTAACCTTTCTTTAAATTCATAGCTTTCTGGAAACTC ATTAGAAGAAAAAGAAACAGAAAATATTACCCTTGACTAATTTTATCCCTGTATATGTTTTATTGCGGTGCAGCGTCTAC ATGGGAGATTAGACATTTGAACACACCTATGGGATCCAATGGACCAAGATGTTTAGTGACCCACACTTTAGAGATACACT CCCAATCCTGGCATCGATGGAAGAATAGCCAGTGCACAAAATTTGAGAAGAGCATCCCGTATGCATTGCTGAGCCAAGTG GCAGGTTAAGTAATTGAACTTTTTTTTTCATCTTGTATCTATCTGATCTCTACAATCATAGGAAATTTACACCATCAGAA GTATGTGATTTAAAGTTTAAACTACTCAAGCCTAGTCATTTAATCTGGGAAATAAATTTAGGTGTAGAACTTCTTTCTTT CTACATTTGATCTGGGAAAGGGGTTTTAGTGTTTTACCCAACTCGACCCCCAAAAGCTAGCTCAGAGGTGAACATTGCCC TACCATTTATGAGGACTTATTTAGTCATATATCTAGTCAATGTGGGATCTCAACAAATACAATTTACTTTTATAAACTAT ATACATTTTTTCCAACATAAATTATGCAATTAGCTTCTACTTGGTAGAAGGCTCATAATATTTTAAGGGGGTTTCCCTAA CAGATATGCTCACTGACTGGCCAGCTTTGCTTAAAATGCTATTTCCAACATTTTCCTCCACTTTTATTGAAACTTTCTTC TATTAACCTTAATCAACTTATTCTTTAATAATAATAAATGTAATTGGAAATTCCTGGAAATATTGTACTTATTTGGGACC GTATATGTGATGTGTGACCTTAATCTTCATATTAGACATGGCATTTGATCCCTGTTGTTAAAAAAATGGTAGGCCTAAGA GAATATATTGGAGCCAATCCGACACTCCACCAACAAGATGCCACTACTGTTGTTCATTCCAAAATCTCCAGCTTTTCTAT GTCCAGTGCTGAATATGAAGAAGATACAGAAGTCCAGGATGAGTTTTATGATGCAATTGCTGCTGAGTCATTTTCATCAG ATGAAGAAAGTGATGAGGAGGATGAGAAACTTGATAAGAAGGTTTCCTTGAATCCGCATGTCAACTACTATAAAGTCTAT GATAGGTTCTATAATTTAATACTTTCATCATAATTTTCAGGATCAGAGAGTAAAACTAAAGAATGTTTCATGGGCCATGA CGACCTTAGCTTTGAAGCAAACAGCAGGTCAGGTTTTTATTTGTTTCTTGTTATTTGTTATTTACAAGGGATAAAGGACT AAAATGCATTATAAATTCTCAAATTGTTTGTTTTTCGCTCAAACTTCCAGTATTAAATACTGTCATTCTGCTTGCAGCTC CAGATGTAAGAGAAGAATTAGATCCTCATACAAGTCCTGTCACAATTGATTCAAGTGACTTCAATGGTTCTTTACGACAA GGAAAGGATGATAACGACACAAATTGTTGGACTTCCCCTAGTGGTGAAAGATTTATGATTAGAGGAAAGAACTATCTGAA AGATAACTCTAAGGTGAGTTGACTATTTAAATTCATTGCTTATTTTTGGTTCCACTAGACACCATTTGGGTGGGATTTTC CTTTCACAGGTAGTTGGAGGAGAACCTCTTCTCAAGCTCATAGCCGTTGATTGGTTGAAAGTTGATAAATCTGTAGATAG AATTGCATTGCACAGTAGAAGTCTGGTTCAGGTAAAATTGATATCATAATATTTTGTATCTTAATATTCATATTGATTGT CATGATAGAGTTGGAGAAATTATTCTCAATATGGTTTAGATATGTTGATATGTGAAATTTATGTTCCTCTCAACCATTAA TAAACTCAAGCTTTTAAAATTCTCACGTTCATCTTCCGCAAAAATGGGATTTTTTTGGAAATCAGGTACTAGTTTAATGT CTCTGTGTTGGACCTTCATTATTTAAGAAGAGCTTTCTAACTGACTTTTCAGTTTGTGATTGTTATATATTTATTGAAAT GAGTTTTTTTGGGAGCTTAATTTTGGTATACTTTCTCACTTTTGCCACTCATGTAAAAGTGCTATATTCCTATATGTATA TAATTGCATTGCATCTCCTTAATTTCCTCTGTTACATGTCATTCTAATGTATGTAAGTTCTATATCATCTATTTTCACAG CCATACCTTTTCTGCTAATTTTTAAAACTAGCATTCTAGTTTATTTCATTTTCAATCCTGTGCATGCTGTAGGCTTAAGG CTCATGCAGTTGAAAATTGTGTATGTATGTTGTAATATTCTGGAAACCTAATTCTCGTGATTTTTGTTTCTTAGTATTTT ATATTAGAAGTCTTTACATGTATATTGTATAATACCTTCCCTTCTGAATTGCAGTCTGAAGCTGGGAAGAAGCTTCCATT TATCCTTGTATTCAATCTCCAGGTATGAATATGATTATTATTGTTTATCATGTACTTTAAGTGTATAAATTGTTGCAATG GGAGGTTTGATTTATGCTTATGAACCAGTTTATGGGGGCATTTTTTGTTTTGTTGTCAATCTCAGGTTCCAGCTAAACCA AACTACAGTTTGGTTCTACATTACGCATCTTACAGACCGATACATAAAGATTCCCTATTGGCTAAGTTTTTGGATGGAGA TGACATGTTCCGAGACTCAAGATTCAAACTAATTCCAAGTATAGTTAAGGTGTGTGATTCTCAATAAGTGTCATCATCAT ATGCTCTTTCTGATCCCTGATAGCATTGAGCAGTTAATGATTTCAAATGGGTACAGGGATATTGGATGGTCAAGCGAGCT GTTGGAACAAAAGCTTGCCTAATGGGGAAAGCTTTGACTTGTAAATACTTTAGACAAGACAATTTTTTGGAGGTAAAAGC CTCAATAGCAAGTTAAGAAGTAAAAATATAGTGATAACTAGTCTGATGGATTACACTTTGATGGCAATTTTGTGTATTAT GCAGATAGATGTGGATATTGGATCATCCTCTGTAGCTAGGAGTGTCGTTGGCCTTGTTCTCGGATATGTCACAAGCCTAG TCGTTGACCTTGCAATTTTGATAGAGGTTTGTACACATCACTGATATATGCCAATGTCACACATCTTTCTTGAATGAAAT AGCTACTTTATCCTCTACTGTTGTATCCCTTCTATACATGACATATACCATAAATCGCATATTGGCTAAAACTGAAGAGA GAAAAATAAAAATAAAAAAGGATTGCAAAATCTGAATGTTTCTAGGAGGGAAGGTGGTGAACTGATATGATATATTAAAC ATTAACTTAACCGAAAATCATTTTCAACTTCTGAAAGTTTCTTCTGTAAGAATAATGTAAACCATCCCTCTTTAGCCAAA CACTAATAATCAAACTAACACAAACTTTAAACTTGTTACAAATTATAGCCAATCTTTCTGTCTAACTAGTTATTTTAGCT GAGAATCATAAAGAAAATGTCAGATGAAAAAGTGTCTTAGTATTTGATGGAGTTAGAGGCTAGTTATTTAATGAAGCATG TTCACTTCTATTCCATTATAATGGAGTTGGAGGCTAGTAAGTAGTAGCATTGAATGAATTTACTCCTTATGACTGATGTC GAATTTGCAGGCAAAAGAAGAGGCTGAACTGCCAGAATACATTCTTGGAACTGTACGATTAAACCGCATAAGACTTGAAT CAGCTGTACAGCTAGAGGTTTGAGGTGTTCTGCCACAAGTATTAAATCGTCTGCAACTATTGCATTATTTGGCTGAAACT CTTTCAGTAACAGAGGGCTTAAATCAGAAAACGATAATCTGGTGAATTTTCTTCAAAAAGCACTCATCCCTTGTGGATTT TCTGCAGAACTGTGCTATATTAATGTATTTTACTTAGTTTTTTACTATTAACTGTCTTTTAGGCTTTCTCATCTGTTAGA AATAAGAAAAGAAATAGAGTGAAAATAAGAGATACAATAAGTAGGCTTTGTCTATTGTGGACTGAGAAATGCTTCTCTGC AAATAAGTCACATAAGGAGCATATTGTATACTAAATGTTAGTTGCAAAAACTTGATTCATGGGTGGATCAGTTCTTAACA TGATCTACCATAGAAGTGTCCCAATAAGTAATATGATGGTAAAAGGGTATGAGAAAAACAATTTGTGGGAAAACAGGATT ATGCTATTTTAAGTGTGTTAATTAATGGTTTCTTGGTTGTTTGTGTTCAAAGTTAACTTTTCACTATTCATTATACCTTT ATCTACCGAATCAATGTCTCATTATATCAG
CDS sequence (LotjaGi6g1v0207200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGAGGCGTTAAGTGGCGGAGCAGGTGGTGGCGGAGGCGGAGGAGGATCGGAAGAGAAAGGGATATTTGAATACTTCGG TTGGGTTTATCACCTTGGCGTGAATTCCATCGGCCACCAGTATTGCCACCTTCGTTTCCTTTTCATCAGGGGCAAGTGCG TCGCAATGTACAAGCGTGACCCTCACCAGAACCCTGACATTAAACCCATTAGGCAGGGAGTTGTAGGGCCTACACTGATG GTGGAGGATCTCGGGCGTCGAAAGGTCAACGACGGGGATTTCTATGTGATACGCTTTTACAATCGATTAGATGAGGACAG AAAGGGAGAAATTGCTTGTGCTACAGCTGGGGAAGCCCAAGGATGGATGGAAGCATTTGATCATGCCAAGCAACAGGGTC AGTATGAGCTGACAAGAAGAGGCAGTGCCAGAGACAAACTAAACAAGGAAATGGAGATCAATCTGGTAGGACATCGACCT AGAGTGAAGCGGTATACCTCTGGGTTGCGGAAGCTTATAAGAATTGGTCAAGGTCCAGAGACACTCTTACGGCTATCATC AAAGTTTTTTGGTAGTCCCGACGGATTTGAAGGGGACGGTGGAGATGCATTTGATGCACATCAGTGGAAATGTGTTCGTA CCATGGCTGGTATTAGAATTTTTGAGGATGTTTCTAGCCACAAGACTGGTAAGGGTATCCTCGCTAAGTCGGTTGGTGTT ATTGATGCAACTGCAGATAGTGTTTTTGAAGTGTTTTTAAACACTGAGCGACAGCAAAGATATGAGTGGGATATGTTGAT GGGTGACTTGGAGCTGATAGAGTCATATGATGGACATTACGATGTTGTGTATGGGACATACGATCCTAAGTATCTAACCC GGTGGCATTCAAAGCGAGATTTTGTCTTCTCTAGGCAATGGTTTCGAGCACAAGATGGAACATACACTATCTTGCTATTT CCAGCTATCCATAAGAAAAAGCCTCCCAGATCAGGCTTTCGACGTACAAAAATCAATCCGTCTACATGGGAGATTAGACA TTTGAACACACCTATGGGATCCAATGGACCAAGATGTTTAGTGACCCACACTTTAGAGATACACTCCCAATCCTGGCATC GATGGAAGAATAGCCAGTGCACAAAATTTGAGAAGAGCATCCCGTATGCATTGCTGAGCCAAGTGGCAGGCCTAAGAGAA TATATTGGAGCCAATCCGACACTCCACCAACAAGATGCCACTACTGTTGTTCATTCCAAAATCTCCAGCTTTTCTATGTC CAGTGCTGAATATGAAGAAGATACAGAAGTCCAGGATGAGTTTTATGATGCAATTGCTGCTGAGTCATTTTCATCAGATG AAGAAAGTGATGAGGAGGATGAGAAACTTGATAAGAAGGATCAGAGAGTAAAACTAAAGAATGTTTCATGGGCCATGACG ACCTTAGCTTTGAAGCAAACAGCAGCTCCAGATGTAAGAGAAGAATTAGATCCTCATACAAGTCCTGTCACAATTGATTC AAGTGACTTCAATGGTTCTTTACGACAAGGAAAGGATGATAACGACACAAATTGTTGGACTTCCCCTAGTGGTGAAAGAT TTATGATTAGAGGAAAGAACTATCTGAAAGATAACTCTAAGGTAGTTGGAGGAGAACCTCTTCTCAAGCTCATAGCCGTT GATTGGTTGAAAGTTGATAAATCTGTAGATAGAATTGCATTGCACAGTAGAAGTCTGGTTCAGTCTGAAGCTGGGAAGAA GCTTCCATTTATCCTTGTATTCAATCTCCAGGTTCCAGCTAAACCAAACTACAGTTTGGTTCTACATTACGCATCTTACA GACCGATACATAAAGATTCCCTATTGGCTAAGTTTTTGGATGGAGATGACATGTTCCGAGACTCAAGATTCAAACTAATT CCAAGTATAGTTAAGGGATATTGGATGGTCAAGCGAGCTGTTGGAACAAAAGCTTGCCTAATGGGGAAAGCTTTGACTTG TAAATACTTTAGACAAGACAATTTTTTGGAGATAGATGTGGATATTGGATCATCCTCTGTAGCTAGGAGTGTCGTTGGCC TTGTTCTCGGATATGTCACAAGCCTAGTCGTTGACCTTGCAATTTTGATAGAGGCAAAAGAAGAGGCTGAACTGCCAGAA TACATTCTTGGAACTGTACGATTAAACCGCATAAGACTTGAATCAGCTGTACAGCTAGAGGTTTGA
Protein sequence (LotjaGi6g1v0207200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MEALSGGAGGGGGGGGSEEKGIFEYFGWVYHLGVNSIGHQYCHLRFLFIRGKCVAMYKRDPHQNPDIKPIRQGVVGPTLM VEDLGRRKVNDGDFYVIRFYNRLDEDRKGEIACATAGEAQGWMEAFDHAKQQGQYELTRRGSARDKLNKEMEINLVGHRP RVKRYTSGLRKLIRIGQGPETLLRLSSKFFGSPDGFEGDGGDAFDAHQWKCVRTMAGIRIFEDVSSHKTGKGILAKSVGV IDATADSVFEVFLNTERQQRYEWDMLMGDLELIESYDGHYDVVYGTYDPKYLTRWHSKRDFVFSRQWFRAQDGTYTILLF PAIHKKKPPRSGFRRTKINPSTWEIRHLNTPMGSNGPRCLVTHTLEIHSQSWHRWKNSQCTKFEKSIPYALLSQVAGLRE YIGANPTLHQQDATTVVHSKISSFSMSSAEYEEDTEVQDEFYDAIAAESFSSDEESDEEDEKLDKKDQRVKLKNVSWAMT TLALKQTAAPDVREELDPHTSPVTIDSSDFNGSLRQGKDDNDTNCWTSPSGERFMIRGKNYLKDNSKVVGGEPLLKLIAV DWLKVDKSVDRIALHSRSLVQSEAGKKLPFILVFNLQVPAKPNYSLVLHYASYRPIHKDSLLAKFLDGDDMFRDSRFKLI PSIVKGYWMVKRAVGTKACLMGKALTCKYFRQDNFLEIDVDIGSSSVARSVVGLVLGYVTSLVVDLAILIEAKEEAELPE YILGTVRLNRIRLESAVQLEV
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
---|---|---|---|---|---|---|
PANTHER | 9 | 741 | 733 | 0.0 | – | |
PANTHER | 9 | 741 | 733 | 0.0 | – | |
Gene3D | 202 | 396 | 195 | 6.3E-29 | ||
SUPERFAMILY | 203 | 367 | 165 | 4.29E-30 | – | |
CDD | 208 | 392 | 185 | 3.74228E-33 | – | |
ProSiteProfiles | 209 | 362 | 154 | 20.095 | ||
Pfam | 227 | 373 | 147 | 6.3E-10 | ||
MobiDBLite | 448 | 467 | 20 | - | – | |
MobiDBLite | 489 | 526 | 38 | - | – | |
MobiDBLite | 501 | 526 | 26 | - | – | |
Pfam | 526 | 731 | 206 | 1.2E-65 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
---|---|---|---|---|
Molecular function | Lipid binding | Interacting selectively and non-covalently with a lipid. |
Expression pattern of LotjaGi6g1v0207200.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…