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LotjaGi6g1v0225600.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi6g1v0225600
Transcript ID LotjaGi6g1v0225600.1
Related isoforms 1
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description DENN domain-containing protein; TAIR: AT5G35560.1 DENN (AEX-3) domain-containing protein; Swiss-Prot: sp|Q6NXD8|DEN5B_DANRE DENN domain-containing protein 5B; TrEMBL-Plants: tr|I1MHF0|I1MHF0_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi6g1v0225600
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr6:53129262..53141435) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

ACAGTATCTTGTTAACAAGTGTGAATGGTAGTCGGCAGCATCCAATGAAATGATCCAAACAAAACACAGAAGAAGCTCAA TCCTCGTTGGCCCCAAACAACAATCACCATTTCGTTCCGACGAGGGTTCTATTTCATCATACACTTTGTTTCTGCTACTC CATCCATCCCACAGATTCAATTCAATTGCAATTTCAATCTCAATTTACCCTAACTAATTTACCATCTCACAAAATTTTCC CCCAATTTCCCCAAACAAGTTGATGAATTAATTATTAAATTATCTTCAACATCACTACTACTTTTCTCCCTCCAATCCCC TTTTCTCTTCATACCCGCCTCATTTCTCTCTCTCTAAAATCCCCTTTTGTTTCAAGGTGAGCAGCTTCCTCTCTTTTCTG AGTTTTTCAATTTCAGATGTCATGATTCTGTTCAATTCAATTTTCATCTGTTTCTTCCCCCCTTTCCTGAATTAGAAACG GCTTTCTGATTTTTCATTTTTTACCTTGTTCTGTTTTTTAATTTTCCCCTGCTTCAGTTCATCTAAATTTTTAATTTTTA TGCAAATCATACAGTTTTGTACTTTTGGGTATTACTGTATTAGCCATCTGTGTTTTTCAGTTTGTGTAACAGACTGAGTG GATAATGAAACAAGGAAAGTTACAGGAGAAGCTTTGGATAAATTTTGAGTATGATTAAGGATTTTATGTGATATTGGGGT CAAAAAAGTTCATTTTTTTTATAAATATTTGAGCTTGTTGGTTGAAGGCAAGTTTGATTGATGTGGTAGCTAGCTTGGGG AGAAATGGAACCATGTGATTGTGGACCCAGTACAAGCTTAGATTCATTTATTGATTTGCTTTTGTTGTTCAGTTGGTGTC ATTGAATAGTATGCTACTGCCACTTTTCAACTGCTCAATATCAACTATTTTTCAAGGGTGGATTGCTATGAATAGCTAAT 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CCCTTGGTGACTTTGCTTTGTATTTGCTGTGGTTTCTTTTTGTTTTTTTTTTCTTTGGTTGCTTTCTTTACCGAGAATTA CTTATTCTTCTTTTTCTTTGTATTATTTATTTCTTTCTAATAAGTTTCTTTTGAGTAATGATACATACACACCTCACTTT CTCTTCCATCTCATTTCCACCTATTTTTCTTCCTATCTCTCTCTGCATTTCCTGTCACATCACATATCATTCATTTCTCT CTCATTTCTACCTAATCTCCCAAGGTGGAGGTGGAATTGGTATGTTAAGTGAACATTATTCGTTTCTTTTACTATCCAAA CAAATTTTCTTTAATATGGATCATGTGAATATGTAATCTATATAGACTACCTCATTTAGTGTGATAAAGCTTTTGTTTAT GTTTATGTATCCAAACAAATTCTAATGTGTTTACAGTTATCTATTAGAGTGGCTATGTAATTATCGTCCCTTTCTACTAA GTGATTCATGTAAGATATATGGTCTGCTTTATGCAGCTTCTGAGTTTCACCTTGTAAAGATAAAGATAGAAATCTTAGGA CTGATTAGCACTCATTTCTTATTAGCATGCAGTTGAAACTAATGGTCTGCTTTTTGCAGTATTCAAGGTTCACCTTGTGA AGACAGGAACTTTAGGAGTGATGCTGATGATACCGAGACAGAAGAGGCTTCAATCTCGGGCCAAGAGGATTTAAATGACC TACATGATATTCTTGAATGGGCTAAGGTTTGTAATTTTAAATCCACCTTGTGCTGGTATTTTTTCCTGGTCTTTGTGATG ATATTATATTGCTGATATTATTTTACCAATTCCCAGGCAAATAACTGTGGACCGTTACAGATTATAAGCGAGTATTATCG TTTAAGTGTTCCTGCAAGGGGCTCAGCACTTACCTTCCGTCCTTTGGAGCACCTTCATCACCTGGAATATCACAGACCAG CTGAGACAGTTCTTCATCTTGCTGGTTCAACTGTTGATTTGAAATCTTGCAGTACGCGTCTTGAATTTGCTGAGGTTTGA TTGTGGAATGTGGATTAGATTGCTTTGTTTCTATTTAAGATCTAGGATTTGAGTTTTCAGAGCTGTACTGTATTTGATGG TCATATGCTTTGATAAACGAGTACGTCAATTTGCTTGTTCTTCTCACTTCTCAGGCACATATCTCCCTTCTGGCTGAGGA GGAGGCAACTTCATTATCTATATGGGCTGTAGCGTGCATGTGTGGTACCTTGAGGCTTGAAAATGTAGGTTCTGGTTTGG CCTATGATTTTATGAAGTTCATGTTCTTCTGCCATATAGTATTACTATCATGCATGCCTGATTGTGAGACCCATTGTTTA TGGAGATTTATCACTATTAGTAACCATTGCTTTTAGATCTAAAGAGAAGATCTGATTTATTATGGGTTTAGTATCCTCAA CTGTAACCAAATTAGGGGCAAATTATGCATTTTGATTTCTGTATGACTTAATGTTAATGTGGTTGACCCCTAGAGCTGTA ATGTAGTTATCTGTAGTTAACAGTTTCATAATGATTGTCCTGGAACTTTACACTGTCATGTTGGTCTGAATGTTTGTATG TCTGTTCTGCAGGTTTTAACATTGTTTGCAGGAGCTCTACTGGAGAAGCAGATAGTGATTGTCTGTTCTAATTTGGTATG TGCTGTGCCTCAATATAAGCTATTAATGATCTTTGTCAAGATAATTTATCTTCCTATTAAATTTTTATATTGATGCAATT GTATCCGAGTCTTTGTTTATATACTTTTATATGATTTTATCCTTTAAATTCGTTGTTATTCCTTTATTAACAGGCCTCTA TTGGGAACAGTAGTACTTGAATTTGTAATTTGGTTATATCATTTTTGTCCTGTTGAGGCATATTATATCAGCCACTTTGC TCTTTATTTTTAATGTACAAGTCATGTTAATTGTTTTCAGATCTTGCAAGTGTGCTTATCCTGTATTTTACAAATTAGTC ACTTAAATGAATTATGAATAGCTATGCAGTTCTTGAGACCCGATCATTGCTCATCTTACTTGAATTGTTGATATTTTATC AAAGTCCTTGATGGAAACATTTTACGTCTTTCATGATCAGGGAATCCTGTCTGCTTCAGTTTTATCAGTTATTCCACTAA TCCGGCCCTACCAATGGCAAAGCCTGCTTATGCCGGTTTGAAATCTCTCTTAAGTTTTGGAGTGAATATTATATTTCATA TTTTTTATTTCCCTTTTCCACTTTATAGTGTTTGATAATAACTTGCTCTTGCAGGTTTTACCAAATGACATGCTTGAGTT TCTGGATGCTCCTGTCCCTTACATAGTGAGTATTCAATTTTTGCTTTTACTGTTCAAGAATAATATCTGCTTCAAGTCAT GCAATGACTATTTAGTATTTACTTATTTATTTGCATCTAAAATTTATTTGTTCTTTTAAATCCATGCTCTGTGTTGTGCT TGCTCGCCATTATTACTTTGAACAGATATGAATTTATTGCTGGGGAGCTTATTAAACCTATATGATATCATCTTCCACAA ACTGGAACATAAAATTGATTTTTTGTGGTGTGGTTTAAAATTTGGCTTTAACTGTTTTAATCTTTCCCTTTTGTATTGAT GATACGATATCTGAATCTGACTGGCTACAAAATTAATTCTCTAGGTTGGTATCAGGAACAAGACCAATGAAATTCAGTCA AAGTTAACCAATGTTATTTTGGTTGATGCCAATAAAAATCAGGTGTGTAATTTTCTTTCCCAGTTTTCCAATGCCAATAA AAACCAAGTATTTTCCCCCAACAATTAAATATTTACAGAAATAGTATACATGAACTCTTTTTTCCTATATACATAGTTGA TTCATTATAGGATTACTATAATTTGCTTGTGATATGCAGTTAAGTCTATGTTTGTTAAAAAATATTCTGATGTTTGAGCT TATGATCCCCCCCCCTGCTTACAGCACATTACAAACAGTTGAAGTAAACTGTTCATTCTGAATGGATCTTATTGTTTTTA AGCTATAAACTAAGATGAAAGATTGTTTCTTAAGAGGATATTATGTGAATTCATGAAATTTGCTCTTCATGTTATCTTTT TTATTTATTTTTTATGTATCTTTACTTTATTTGAGTCATAGAGAGACACATTTTTTACACCGTTCTTTTGCAATAGGTGA AGTCACCAACGGTACCTCAACTGCCAAGACAGAAAGAGCTAATCTCTTCTTTACGTCCTTATCATGCAACTCTTGTGGGA GAAAGTTACTTGGGTAGGAGAAGACCGGTGTACGAATGCACGGAAGTGCAGGTACGCCCTTATTTATAATCTCATCGTTA TACATTACCCTTCCTTATATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGGTCATTTAGTTATTCATGTGTCTTAGTGTCTA GTAATTCAATATTGTGCATTTAAGCAATTCAAGCAGTTTTTTTGGTCTACATATTATTTCCATATCAAATTGTTGACAAC CATGTCATCATGTTTTATATCATGTTTTTTGCTTTTTCCACAGACAGAAGCTGCCAAAGGGTTCTTATCGGTGTTAAGGT CTTATTTGGATTCCCTTTGCGGTAACATCCGTTCTCATACGATAACCAATGTACAATCCAATGACGATAAGGTCTATACT CTTGTCTTGATGGTTAACTGAATTAGACAGTTTTTATAAGAATTCTGTTAGAAGAATTTGATCATGAACCAACTTGGACT TCCTTTATGAAAAAAGAAACTAATATTTACTTTGTAGTCAATCCCTACCCTGTTATGGAGTGGTTAATATTTTGTGATTA ATTGATCCTCTTTTTTTTTATTTTAGTAAATTGGTCTAAATTTATAATTCTTTCTTTGATATAAGAAACATCAAAGTTCT TCAAGGGAAAATCATTTCAGATAATTGAACTGCAATACCTTATTTTCCTGATAGTTCTTTGTTGACTATAATTTGAAGTT CGATAGATCAAATAAGATACAGCTCACACAAGCTAGATAATTTAAGTGTATGCTCCAACTTTTTCCACTCTCTCTACAAA TTATACTTGTAATTGGCTTTTGTTCAAGTGGCAAGTAATGAAAGGTATATGATTGTATTCTTAAGCTCAATATGAAAAAT TAAAACAATTATTGAATCAAGATTATGTAAATTTAGTTGTTGTAAAAGGCATAAGCATATCATTTCATCATTAATGAACA TTAAAACTTGCTTTGCATATAACATATTTTACCAAGTATTTTGAAAGTATGATGTCTTGTACCTTCAGGTATCCTTGCTT TTGAAGGAGAGTTACATTGACTCATTCCCTTATCGTGATCGGGCTTTCATGAAGGTACGGTTTGTGAACTTTACATCATA CGTTGTGTTGATGCAAGCAAATTTTTATTTTTATTTACTTTCTGGTTTTGAGCGATCTGGACTGACGTGCATATATTTGA TTACCCAGTAGTTTACCTCCCAGTAGTTAGGATATAATTCAAACTTCATAATTGTCATTCCAATCTTTACACAGCTTTTC TGTTGGGTATTATTCTCAGATTTCTAATGCGGATTGTTTCTCCTTTGTTGCCTTGTGTCAAGCAGCTTTTTGTGGATACA CAGCTCTTCTCTGTGCACACAGATCTTGTTCTCTCATTCTTCCAAAAGGAATAGGACTGGAATGCAATACATTATGGGAA TATTGTTGCCATAGAAAGCTTGAACGCAAGTTCAGTGTTGTATAATTTCTCTAAATTATGAGCTAAATTTTGTCTCCTTA CATGCATCTCAAATTTTATTTTTCAGTGCCTTGGGCGTTCTGTAGAACCTGTACATACTGCATAGTGAGAAATAATTCAA GCTTTAATTATATAGGGTTTCATTTTATGTAAATGACAATTTTCATACACCAAAAGTAAAAGTTGTGCTTTATCTCAGGC TTTTTGGCTCTTCTTGAAAGCTATCACTGGTTCTGGAACCCTTTTACTTATTACTGAAACTGTGTTTGTGATCGAAGGCA GCATGATCTGAAGATTTGTGTAGCTCTTTTAAATGATTTCAGATATTTAATGCAGGTTGTAACCGATGTGCAATTACACT TTTCAAGCATACTCTTGGTCTTACCTTTATATAGCATTACTCATCACAATGAATAAAATGTATAGCTTTGTAATGAAGTG TGTGGGATCAGGGATTCAGTGTTCTCCTGTTGGAACATTTTCATGTTGAAATTTTGTGCCTATCTCTTTCACAATGTTTA TTATATAGGTAAGACTCTAAATATTTACTAAGGGAGGGACAAATATACTATATGTCACTTCACATTATTAAATGATATGA GATAATCATAATAGTGGGTGGTATGGTTATATGATAAATCAAAAGTTAGTAATCATTTAATACTAGGGGTAAATGTTTTT CATTTGTGTTTCAT 

CDS sequence (LotjaGi6g1v0225600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGACTGGAATTGCAAAGGAGGAAGAGTCAGGGAGTCCTAGTTGGGGTGCTTCTTTTTTTACACAGACAACAGAGGATGT AGCTAAAGCTGTCGCTGCTGCTATGAATTCTGAAAGGCCATCTGTGATATATTCATCTAAAACTGATCATGGGGGTAGTC AGCTTCAAAGGCTGCAGAGTCAAGTTACTAAATTGATAAAAGGATTTTCTGGCACTTCTGAAGTTAAATATGCAAATTAC AATCCAGAAATCCTGACAAGTCAGAAGCGTCAATGGGCTGCCAACTTTCATTTGCAGTACATGGATCATAAGTCTTGGAA GGAGCCATCAAGGCTGTTTGAAAGCATGGTGGTTGTTGGACTTCATCCTAATTGTGATATTCAGGCACTGCAAAGACAAT ATATTGATAGAAAGTCTGAAGGCTCTGGTAAATTGAGAAGTGCACTTGGTTACCATAATCAATCCCGTGTAGAGCCTAAT CTTGAACCTCAGGTCTTATTTGCTTACCCTCCAGACAAGCAGCTGCCTCTTAAAGATAAGGATCTTTTTTCTTTCTGCTT CCCTGGAGGCCTGGAGGTTAATGCTGTGGAGAGAACCCCTTCCATGAGCGAGTTGAATGAAATTCTTTTTGGGCAGGAAC ACCTTAAACAAAGGGATCTGTCTTTTGTATTTAGGTTACAGGGTGCTGATAATTCAACACTTTACGGATGCTGTGTCCTA GTTGATGAGCTAGTGCAAAAACCATCCGGATTGCTCTCCCTGATTTTGGACAAGCAGTCATCTCACTCTTCATTGAGACG CCATATAATAACCACAAAGAGATGTTACTGCATTCTTTCAAGGCTCCCATTTTTTGAATTGCACTTTGGTGTATTGAACA GCATCTTCATGCAAGAAAGGTTAGAGTGGTTGACAAGCAGTGTTGAAGATTTAAATTTAGAAATTGTTGAAGGTAGTTAT GATGAAGAAAATTCAGGGGAAAATTCAGAGTGTGTGTTGATGAATGATAGACCAACAGAAGACAGAGATGACGATAATCC AACAATTTCTCAATCAAAGCTAGGAAGTTCCCTACCCGAAAACATTGAAGGTGATAGTAGTCATCTAGAGAAACAAATGG TTAATGAGGAGCTGCATACATTTAAGGAGGGAGTCAATAATGACACTGTTGTCCCAATTGATCCTGAACCTGATATAAAA ACTGCCAAAGAAGAATCTGGCTGTAAAAATGCTGAAGATAGTGATCTGTGTCGAGATGCTTTTGTTACAAACAAACAGTC AGAAGATAGGCGCTTACCAAATGCTATTTTGCCACTCTTGCGCTATTGCCAGTATGAAAGCTCTGAATCTTCCTGCAGTA TTCAAGGTTCACCTTGTGAAGACAGGAACTTTAGGAGTGATGCTGATGATACCGAGACAGAAGAGGCTTCAATCTCGGGC CAAGAGGATTTAAATGACCTACATGATATTCTTGAATGGGCTAAGGCAAATAACTGTGGACCGTTACAGATTATAAGCGA GTATTATCGTTTAAGTGTTCCTGCAAGGGGCTCAGCACTTACCTTCCGTCCTTTGGAGCACCTTCATCACCTGGAATATC ACAGACCAGCTGAGACAGTTCTTCATCTTGCTGGTTCAACTGTTGATTTGAAATCTTGCAGTACGCGTCTTGAATTTGCT GAGGCACATATCTCCCTTCTGGCTGAGGAGGAGGCAACTTCATTATCTATATGGGCTGTAGCGTGCATGTGTGGTACCTT GAGGCTTGAAAATGTTTTAACATTGTTTGCAGGAGCTCTACTGGAGAAGCAGATAGTGATTGTCTGTTCTAATTTGGGAA TCCTGTCTGCTTCAGTTTTATCAGTTATTCCACTAATCCGGCCCTACCAATGGCAAAGCCTGCTTATGCCGGTTTTACCA AATGACATGCTTGAGTTTCTGGATGCTCCTGTCCCTTACATAGTTGGTATCAGGAACAAGACCAATGAAATTCAGTCAAA GTTAACCAATGTTATTTTGGTTGATGCCAATAAAAATCAGGTGAAGTCACCAACGGTACCTCAACTGCCAAGACAGAAAG AGCTAATCTCTTCTTTACGTCCTTATCATGCAACTCTTGTGGGAGAAAGTTACTTGGGTAGGAGAAGACCGGTGTACGAA TGCACGGAAGTGCAGACAGAAGCTGCCAAAGGGTTCTTATCGGTGTTAAGGTCTTATTTGGATTCCCTTTGCGGTAACAT CCGTTCTCATACGATAACCAATGTACAATCCAATGACGATAAGGTATCCTTGCTTTTGAAGGAGAGTTACATTGACTCAT TCCCTTATCGTGATCGGGCTTTCATGAAGCTTTTTGTGGATACACAGCTCTTCTCTGTGCACACAGATCTTGTTCTCTCA TTCTTCCAAAAGGAATAG 

Protein sequence (LotjaGi6g1v0225600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MTGIAKEEESGSPSWGASFFTQTTEDVAKAVAAAMNSERPSVIYSSKTDHGGSQLQRLQSQVTKLIKGFSGTSEVKYANY NPEILTSQKRQWAANFHLQYMDHKSWKEPSRLFESMVVVGLHPNCDIQALQRQYIDRKSEGSGKLRSALGYHNQSRVEPN LEPQVLFAYPPDKQLPLKDKDLFSFCFPGGLEVNAVERTPSMSELNEILFGQEHLKQRDLSFVFRLQGADNSTLYGCCVL VDELVQKPSGLLSLILDKQSSHSSLRRHIITTKRCYCILSRLPFFELHFGVLNSIFMQERLEWLTSSVEDLNLEIVEGSY DEENSGENSECVLMNDRPTEDRDDDNPTISQSKLGSSLPENIEGDSSHLEKQMVNEELHTFKEGVNNDTVVPIDPEPDIK TAKEESGCKNAEDSDLCRDAFVTNKQSEDRRLPNAILPLLRYCQYESSESSCSIQGSPCEDRNFRSDADDTETEEASISG QEDLNDLHDILEWAKANNCGPLQIISEYYRLSVPARGSALTFRPLEHLHHLEYHRPAETVLHLAGSTVDLKSCSTRLEFA EAHISLLAEEEATSLSIWAVACMCGTLRLENVLTLFAGALLEKQIVIVCSNLGILSASVLSVIPLIRPYQWQSLLMPVLP NDMLEFLDAPVPYIVGIRNKTNEIQSKLTNVILVDANKNQVKSPTVPQLPRQKELISSLRPYHATLVGESYLGRRRPVYE CTEVQTEAAKGFLSVLRSYLDSLCGNIRSHTITNVQSNDDKVSLLLKESYIDSFPYRDRAFMKLFVDTQLFSVHTDLVLS FFQKE 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 1 805 805 0.0
Phobius 1 604 604 -
PANTHER 1 805 805 0.0
SMART 109 242 134 2.3E-5
ProSiteProfiles 143 805 663 22.507
Pfam 163 240 78 2.7E-9
SMART 271 679 409 1.1E-39
MobiDBLite 319 365 47 -
MobiDBLite 334 348 15 -
MobiDBLite 349 363 15 -
MobiDBLite 387 407 21 -
MobiDBLite 450 480 31 -
Pfam 566 678 113 1.5E-24
Gene3D 578 711 134 1.8E-32
Phobius 605 626 22 -
Phobius 627 805 179 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

Unable to find any GO terms for the transcript with the identifier.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi6g1v0225600.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…