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Field | Value |
---|---|
Gene ID | LotjaGi6g1v0225600 |
Transcript ID | LotjaGi6g1v0225600.1 |
Related isoforms 1 | |
Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
Description | DENN domain-containing protein; TAIR: AT5G35560.1 DENN (AEX-3) domain-containing protein; Swiss-Prot: sp|Q6NXD8|DEN5B_DANRE DENN domain-containing protein 5B; TrEMBL-Plants: tr|I1MHF0|I1MHF0_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi6g1v0225600 |
Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr6:53129262..53141435) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ACAGTATCTTGTTAACAAGTGTGAATGGTAGTCGGCAGCATCCAATGAAATGATCCAAACAAAACACAGAAGAAGCTCAA TCCTCGTTGGCCCCAAACAACAATCACCATTTCGTTCCGACGAGGGTTCTATTTCATCATACACTTTGTTTCTGCTACTC CATCCATCCCACAGATTCAATTCAATTGCAATTTCAATCTCAATTTACCCTAACTAATTTACCATCTCACAAAATTTTCC CCCAATTTCCCCAAACAAGTTGATGAATTAATTATTAAATTATCTTCAACATCACTACTACTTTTCTCCCTCCAATCCCC TTTTCTCTTCATACCCGCCTCATTTCTCTCTCTCTAAAATCCCCTTTTGTTTCAAGGTGAGCAGCTTCCTCTCTTTTCTG AGTTTTTCAATTTCAGATGTCATGATTCTGTTCAATTCAATTTTCATCTGTTTCTTCCCCCCTTTCCTGAATTAGAAACG GCTTTCTGATTTTTCATTTTTTACCTTGTTCTGTTTTTTAATTTTCCCCTGCTTCAGTTCATCTAAATTTTTAATTTTTA TGCAAATCATACAGTTTTGTACTTTTGGGTATTACTGTATTAGCCATCTGTGTTTTTCAGTTTGTGTAACAGACTGAGTG GATAATGAAACAAGGAAAGTTACAGGAGAAGCTTTGGATAAATTTTGAGTATGATTAAGGATTTTATGTGATATTGGGGT CAAAAAAGTTCATTTTTTTTATAAATATTTGAGCTTGTTGGTTGAAGGCAAGTTTGATTGATGTGGTAGCTAGCTTGGGG AGAAATGGAACCATGTGATTGTGGACCCAGTACAAGCTTAGATTCATTTATTGATTTGCTTTTGTTGTTCAGTTGGTGTC ATTGAATAGTATGCTACTGCCACTTTTCAACTGCTCAATATCAACTATTTTTCAAGGGTGGATTGCTATGAATAGCTAAT AAATTTCAAGTTCTATCTTAAAAGATTCTTTTTTTTTAAGCATGTCAATTATTGGTTCTTGGCAGTTGCTGTTCTTGGTG ATTTGTTGGTGTGCTGGTTTATTGCCACCACTATGCTTCATATTGGTTTGCATATTATTTAGTCATTAGGATTTCAGAAT CAGAATGGATTTGAGATTTGTTGTACCCTTATTCCTGCTATACATTCTTTGAATTGCTGTTGCTTCTGAGAGAATTTTAT TTTTCTGAGTCATCATTTGTCATGTTTAGGAAGGAATAAATGACTGGAATTGCAAAGGAGGAAGAGTCAGGGAGTCCTAG TTGGGGTGCTTCTTTTTTTACACAGACAACAGAGGATGTAGCTAAAGCTGTCGCTGCTGCTATGAATTCTGAAAGGCCAT CTGTGATATATTCATCTAAAACTGATCATGGGGGTAGTCAGCTTCAAAGGCTGCAGAGTCAAGTTACTAAATTGATAAAA GGATTTTCTGGCACTTCTGAAGTTAAATATGCAAATTACAATCCAGAAATCCTGACAAGTCAGAAGCGTCAATGGGCTGC CAACTTTCATTTGCAGTACATGGTAGTATCTTCTGATTGAATTTTCATTTCTCTTTTGACCATAATATACCATAAAGAAA CTTAAGCTGGTTGTTAAGTTAGGATTTTTCACCTTTAGTTTTGAATGCTTGTTTACGTTGTTCTTCCTTTGGTAGTTTGG CCATCAGTTACTTATTTGAACTTTCAATTTTGAACCAGCATATAGATATACACATCTTTCTTCTTGCCACATACCATTAT CAGTTTTTGGCACACCAACTCATTAACTAAGTTGTCTTTATATTGTTCTCAAACACTGATACACTTGTATTTGAGTTCTC AGGATCATAAGTCTTGGAAGGAGCCATCAAGGCTGTTTGAAAGCATGGTGGTTGTTGGACTTCATCCTAATTGTGATATT CAGGCACTGCAAAGACAATATATTGATAGAAAGTCTGAAGGCTCTGGTAAATTGAGAAGTGCACTTGGTTACCATAATCA ATCCCGTGTAGAGCCTAATCTTGAACCTCAGGTTTTGATCATTGGTTAAAGAGAGTTAATATCATGATTGTATTACTTAT TAGAATTGTGATAATTATTCTTACTGCCTCTGGACATTATTACTACTGTGACCACTACGACTTTCATTGACCACTGTCTT TAATATTAGTTTGTCTTCTCATGTATCAGTATCATGAACACTATATTCAATTTTTTTCCAGGTCTTATTTGCTTACCCTC CAGACAAGCAGCTGCCTCTTAAAGATAAGGATCTTTTTTCTTTCTGCTTCCCTGGAGGCCTGGAGGTTAGATGTTAAGCT TAATGAACTTTTATCTTTAATCCTATTGCTATCCTTGTTATATTATTATTACTATTATTATTATCAGTATTGCTATGATC ATCATCATTTATATTATGTTCAGATAGAGTAAGATCAAACACAAATTACCTCTAGCATTAAGTAATTCTTTTGTAGAAAA GAAAATGATCAGGAAGAAGTCATAGATTTTGAGATATTTTTTCCTTCTCTTTTAAGGTTTTTTTTCTACTTTATCTTACC GTGTCGGTTTGTCTATCTTCTGCAGTATTATCTTTTGTTTTTAACGAGTTTGAATTTATTGCTATTGTTATTTTGAAAGC TAAAAACATAACTTGTGGCATCTTGGTATAGCTTAAGAGGCAAAAGGTTGGGTGGGGGTTGGATAGAAGTGTAAGGCTTG ACTCTCATGAAAGCCTAAAGTACTAAGAGAACATCCCTTGCTTAACAAATAAACATGCTCATTTTCAGAGTGTAGAAACT GCATCCTGACGAATCAGAGTGTTCACTCCCGGTATTTAATTTTTGCATCAATTGTAGTTGAAGTATGTGTATGTACAGTG AAGTATGTGCATGTACAGTGAGTCATGTGTAGGATTTTGTGTTGTCGGTCCTTAACTCCATATACTTATTTTTCATGTAA GAAACTTGCAAAGAGCTTTTACTTAGGTTTTTACATTTTCCTGGATGTGATTGTAGGTTAATGCTGTGGAGAGAACCCCT TCCATGAGCGAGTTGAATGAAATTCTTTTTGGGCAGGTATTTATGCAATATTATGCTTCCATAAATACTATGCATTTGGC AAATTGTTTTCATGATCAATATTGGCTTGAGTTTTTGCCTTCCTCTTTTCAGTATTTGATCAGTTATTACTTATTAACAA ACCTTCTGAAATGGTATATCTCTTTGTCAATCTGGTTGCCTTGCATCTACAGATTCATTGTTTATAGACCTAGTAACTAT AAAGACATTTTACTCTTGCATGCTGTTTATTTCTTGAAAATGGGAAGATATCATGTTTCAGTTTCTTGAAATTAAGGACA CCATTTAATAATAACTTTCCTTTCAGGTTTATGATTCCTTATGATAGATGTGCTTTTAGTGGATCTCTTTTCATAGAGAC ACATGTTTCAGGGTCTGGTTCCCGTGTCATTTATGCTTGCTTTATGCTAAGCGTGTCTTGCTGAAGGCTTGTTACCGTTT ATGTGCAAACAATTTGGGTTTTTTTTATCACGTTTTTGTTTGTCATATACAAAGTACTAACTATGTGAATGCTTTGTTGT CAGAATTTCATTTAATTGTAAGTGTTGATGGCTAATTTATTTGATGACAGAGGAATATGTAAGCTTTGAAACACTGGTAC CTGTTCTTATGTTTGTGTATTGATTTTTGCAGGAACACCTTAAACAAAGGGATCTGTCTTTTGTATTTAGGTTACAGGTA ACTGAAGTGATCTAATTGATACTTTGTTTTAACTTTGTTACTCTTGCAGCTGTTGTTTATGCAAGTGCTATGATGACTGT ATTTCTTTGTGGACTTTTGTTATCTATCTACCTATCTATCTTTTGCGAATATCATCACACTCTAAGGATGGCCATTGGAC CACAAGCAACCTTTTCATGAGTTGTTCTAGAACTATATATGCAATAATCGGCATCGAATATACATTTTTTTTCTTTCCAC TGTGTCATTCTACCTTATTCTTAACAAATATTATTTGGAAATTTTCTGAAAAGGAGTTATTTGAAAAAAAATAGTAAGGA TTATTAACCACTTAATTGTTTAGCAAAATTCTTAGTGGCTAAATAATAATTTACCACAAACCTCTTCAGTTATAAGTATG CTTATTTTCTTAATTGATTCATTACTTCAACTATTTAATAGTCTGCCTCTAGCTCTTAACTGTATGTCTCCCTAATTAGA TTCTATTGTTCATAATAATCTTACTTCGTTTTGGGTTTTTTTTAATGCGCAGGGTGCTGATAATTCAACACTTTACGGAT GCTGTGTCCTAGTTGATGAGCTAGTGCAAAAACCATCCGGATTGCTCTCCCTGATTTTGGACAAGCAGTCATCTCACTCT TCATTGAGACGCCATATAATAACCACAAAGAGATGTTACTGCATTCTTTCAAGGCTCCCATTTTTTGAATTGCACTTTGG TGTATTGAACAGGTAAGTACTTATAATAGTCCTGCGTTCCCTCTCCTGAAGAGGGGTGAGATGTTGAAGAAATTTGCAAT TTTGTTGTCATTTTTCTTATTAATTTTTAGAATGATGGTTTTCTTTGTGTCATCATCTATTGTGTCATGTATGCACCATA GCAGAATAAATGTCTAGTAAATTCTTTTGATCTAGTGATCTTTTATGGGGTTAATCTGGAGTACTTTCTGGAATCTATAT GTGCTTGTATTTTATATGTTTTGTAAAATTGAACTGTCAGTTAGTCCGTGTAATTGCTTAAGTATACTATATAGGCATTT TTCGGTTACAAATGAAGGCGTAAACTGATATCTGCATTTCTTTAATTAATAGACCACGAAACTGGGGTTAGGGTTGAGAA AAGGGTTTAATTAGCAATGTTATATATAAATAGATTTTCAGTAGTCATGTAGATGTAGTACTCATCACTTCTTTCCCAAA TTGACAGTTATCTTTTTCTTTTTTACTCATTTAAAAAAAAGGGTAAAAACTAATCTTACAATGACTGCTGGGCAAATGTT ATAAAGGGTTGTATTACATACTATAGGAGTATTGAAAAAGTTTCTGTTCTATAGACATGAAACATGTAATATGGGCTGAA AACACATACCACAAAATAGGTTGCTGGTGGGGAAGAAAGTCAAGTTCATCGATGACCAAAGATTAGGTGATGCAGGGAAT ATATTGGGTGAAAAGTAATTGAAAATGTTATAAGATTCCTGGGAGCTAAGATGTAGTTTGTTCCAACATAAATTTGGTTT TGTGCAAAGAGGAGTAATTGTTACTATTGTACAAAGGGGAATAAATTTGTCTTTACTTTTTGTCTTTCATCTGTCCCCCA GCTTTTGATTTCAAATGCTTGTGAGTGGTTATTATTTTCATACCCTTTTCACAGCCTTTTCTGATGAAGTTAATAGTTAA GTAGTCAAAGATAAAGTGGAATATTTTTCACTTTTTAGATTTTCGATGTTATATAAAGATTAAGAATCAGAAGACATGAC GAGAAACCATTAAAGAAAGACCTTACTCTAAGTCTTATTACTGAAAATATGGTTTTTGGTAGAGCCCTGTGGATTGATCT TGTAGCTAACTCTGATATATTTTGTAATGCGTGTTCATTTTCGCTGTTTTAATTTTTTGGTAGCTTACATAATGATATGA TGGCTTGTTGTCTGTTATCTGGTTTTTTGACTGAAATTATTCGAATTATGCGTAAGACACACACATACTCATTGTATTGG TATGTGTGATATTTAGAATAGTTTGCTTTTTAGCATGTCAGATTATACTATAATTATTATGTTTTTTCTCATCTTATTTT GGTATTATCTCTGTAGCATCTTCATGCAAGAAAGGTTAGAGTGGTTGACAAGCAGTGTTGAAGATTTAAATTTAGAAATT GTTGAAGGTAGTTATGATGAAGAAAATTCAGGGGAAAATTCAGAGTGTGTGTTGATGAATGATAGACCAACAGAAGACAG AGATGACGATAATCCAACAATTTCTCAATCAAAGCTAGGAAGTTCCCTACCCGAAAACATTGAAGGTGATAGTAGTCATC TAGAGAAACAAATGGTTAATGAGGAGCTGCATACATTTAAGGAGGGAGTCAATAATGACACTGTTGTCCCAATTGATCCT GAACCTGATATAAAAACTGCCAAAGAAGAATCTGGCTGTAAAAATGCTGAAGATAGTGATCTGTGTCGAGATGCTTTTGT TACAAACAAACAGTCAGAAGATAGGCGCTTACCAAATGCTATTTTGCCACTCTTGCGCTATTGCCAGTATGAAAGCTCTG AATCTTCCTGCAGGTACATGACATTGTGATTTTCCTGTGCATTTAAGTCAGTATTTATATGATAGCGACATTAAATAATG GAGCTTACATGTCATCACTGATTTCATGGATCTTTTCTTTTTAATCAAATCTGAAGTAGTAAGAACAAAAATTTATTTTG TGCATGAATCTGTTGAATGTGCAATTTGATGAACTTCCTTCATAGGCTTAAAGATTTTTCTGTTATTTGCTTATTCAATA ACTTTATTTAACAGCAGCATGGATTTTGATTTATGAAATGTCAGTGCTTGGCATAAAGAAGTATGTGTCATCGTTACTAT ATATTCTTTGGTGTATTCTTGTGAGTTCCCCATGGAATGAATTAATGTGGTTTAATGTAGACGTTCTGTGATAGTAGCTA CCCTTGGTGACTTTGCTTTGTATTTGCTGTGGTTTCTTTTTGTTTTTTTTTTCTTTGGTTGCTTTCTTTACCGAGAATTA CTTATTCTTCTTTTTCTTTGTATTATTTATTTCTTTCTAATAAGTTTCTTTTGAGTAATGATACATACACACCTCACTTT CTCTTCCATCTCATTTCCACCTATTTTTCTTCCTATCTCTCTCTGCATTTCCTGTCACATCACATATCATTCATTTCTCT CTCATTTCTACCTAATCTCCCAAGGTGGAGGTGGAATTGGTATGTTAAGTGAACATTATTCGTTTCTTTTACTATCCAAA CAAATTTTCTTTAATATGGATCATGTGAATATGTAATCTATATAGACTACCTCATTTAGTGTGATAAAGCTTTTGTTTAT GTTTATGTATCCAAACAAATTCTAATGTGTTTACAGTTATCTATTAGAGTGGCTATGTAATTATCGTCCCTTTCTACTAA GTGATTCATGTAAGATATATGGTCTGCTTTATGCAGCTTCTGAGTTTCACCTTGTAAAGATAAAGATAGAAATCTTAGGA CTGATTAGCACTCATTTCTTATTAGCATGCAGTTGAAACTAATGGTCTGCTTTTTGCAGTATTCAAGGTTCACCTTGTGA AGACAGGAACTTTAGGAGTGATGCTGATGATACCGAGACAGAAGAGGCTTCAATCTCGGGCCAAGAGGATTTAAATGACC TACATGATATTCTTGAATGGGCTAAGGTTTGTAATTTTAAATCCACCTTGTGCTGGTATTTTTTCCTGGTCTTTGTGATG ATATTATATTGCTGATATTATTTTACCAATTCCCAGGCAAATAACTGTGGACCGTTACAGATTATAAGCGAGTATTATCG TTTAAGTGTTCCTGCAAGGGGCTCAGCACTTACCTTCCGTCCTTTGGAGCACCTTCATCACCTGGAATATCACAGACCAG CTGAGACAGTTCTTCATCTTGCTGGTTCAACTGTTGATTTGAAATCTTGCAGTACGCGTCTTGAATTTGCTGAGGTTTGA TTGTGGAATGTGGATTAGATTGCTTTGTTTCTATTTAAGATCTAGGATTTGAGTTTTCAGAGCTGTACTGTATTTGATGG TCATATGCTTTGATAAACGAGTACGTCAATTTGCTTGTTCTTCTCACTTCTCAGGCACATATCTCCCTTCTGGCTGAGGA GGAGGCAACTTCATTATCTATATGGGCTGTAGCGTGCATGTGTGGTACCTTGAGGCTTGAAAATGTAGGTTCTGGTTTGG CCTATGATTTTATGAAGTTCATGTTCTTCTGCCATATAGTATTACTATCATGCATGCCTGATTGTGAGACCCATTGTTTA TGGAGATTTATCACTATTAGTAACCATTGCTTTTAGATCTAAAGAGAAGATCTGATTTATTATGGGTTTAGTATCCTCAA CTGTAACCAAATTAGGGGCAAATTATGCATTTTGATTTCTGTATGACTTAATGTTAATGTGGTTGACCCCTAGAGCTGTA ATGTAGTTATCTGTAGTTAACAGTTTCATAATGATTGTCCTGGAACTTTACACTGTCATGTTGGTCTGAATGTTTGTATG TCTGTTCTGCAGGTTTTAACATTGTTTGCAGGAGCTCTACTGGAGAAGCAGATAGTGATTGTCTGTTCTAATTTGGTATG TGCTGTGCCTCAATATAAGCTATTAATGATCTTTGTCAAGATAATTTATCTTCCTATTAAATTTTTATATTGATGCAATT GTATCCGAGTCTTTGTTTATATACTTTTATATGATTTTATCCTTTAAATTCGTTGTTATTCCTTTATTAACAGGCCTCTA TTGGGAACAGTAGTACTTGAATTTGTAATTTGGTTATATCATTTTTGTCCTGTTGAGGCATATTATATCAGCCACTTTGC TCTTTATTTTTAATGTACAAGTCATGTTAATTGTTTTCAGATCTTGCAAGTGTGCTTATCCTGTATTTTACAAATTAGTC ACTTAAATGAATTATGAATAGCTATGCAGTTCTTGAGACCCGATCATTGCTCATCTTACTTGAATTGTTGATATTTTATC AAAGTCCTTGATGGAAACATTTTACGTCTTTCATGATCAGGGAATCCTGTCTGCTTCAGTTTTATCAGTTATTCCACTAA TCCGGCCCTACCAATGGCAAAGCCTGCTTATGCCGGTTTGAAATCTCTCTTAAGTTTTGGAGTGAATATTATATTTCATA TTTTTTATTTCCCTTTTCCACTTTATAGTGTTTGATAATAACTTGCTCTTGCAGGTTTTACCAAATGACATGCTTGAGTT TCTGGATGCTCCTGTCCCTTACATAGTGAGTATTCAATTTTTGCTTTTACTGTTCAAGAATAATATCTGCTTCAAGTCAT GCAATGACTATTTAGTATTTACTTATTTATTTGCATCTAAAATTTATTTGTTCTTTTAAATCCATGCTCTGTGTTGTGCT TGCTCGCCATTATTACTTTGAACAGATATGAATTTATTGCTGGGGAGCTTATTAAACCTATATGATATCATCTTCCACAA ACTGGAACATAAAATTGATTTTTTGTGGTGTGGTTTAAAATTTGGCTTTAACTGTTTTAATCTTTCCCTTTTGTATTGAT GATACGATATCTGAATCTGACTGGCTACAAAATTAATTCTCTAGGTTGGTATCAGGAACAAGACCAATGAAATTCAGTCA AAGTTAACCAATGTTATTTTGGTTGATGCCAATAAAAATCAGGTGTGTAATTTTCTTTCCCAGTTTTCCAATGCCAATAA AAACCAAGTATTTTCCCCCAACAATTAAATATTTACAGAAATAGTATACATGAACTCTTTTTTCCTATATACATAGTTGA TTCATTATAGGATTACTATAATTTGCTTGTGATATGCAGTTAAGTCTATGTTTGTTAAAAAATATTCTGATGTTTGAGCT TATGATCCCCCCCCCTGCTTACAGCACATTACAAACAGTTGAAGTAAACTGTTCATTCTGAATGGATCTTATTGTTTTTA AGCTATAAACTAAGATGAAAGATTGTTTCTTAAGAGGATATTATGTGAATTCATGAAATTTGCTCTTCATGTTATCTTTT TTATTTATTTTTTATGTATCTTTACTTTATTTGAGTCATAGAGAGACACATTTTTTACACCGTTCTTTTGCAATAGGTGA AGTCACCAACGGTACCTCAACTGCCAAGACAGAAAGAGCTAATCTCTTCTTTACGTCCTTATCATGCAACTCTTGTGGGA GAAAGTTACTTGGGTAGGAGAAGACCGGTGTACGAATGCACGGAAGTGCAGGTACGCCCTTATTTATAATCTCATCGTTA TACATTACCCTTCCTTATATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGGTCATTTAGTTATTCATGTGTCTTAGTGTCTA GTAATTCAATATTGTGCATTTAAGCAATTCAAGCAGTTTTTTTGGTCTACATATTATTTCCATATCAAATTGTTGACAAC CATGTCATCATGTTTTATATCATGTTTTTTGCTTTTTCCACAGACAGAAGCTGCCAAAGGGTTCTTATCGGTGTTAAGGT CTTATTTGGATTCCCTTTGCGGTAACATCCGTTCTCATACGATAACCAATGTACAATCCAATGACGATAAGGTCTATACT CTTGTCTTGATGGTTAACTGAATTAGACAGTTTTTATAAGAATTCTGTTAGAAGAATTTGATCATGAACCAACTTGGACT TCCTTTATGAAAAAAGAAACTAATATTTACTTTGTAGTCAATCCCTACCCTGTTATGGAGTGGTTAATATTTTGTGATTA ATTGATCCTCTTTTTTTTTATTTTAGTAAATTGGTCTAAATTTATAATTCTTTCTTTGATATAAGAAACATCAAAGTTCT TCAAGGGAAAATCATTTCAGATAATTGAACTGCAATACCTTATTTTCCTGATAGTTCTTTGTTGACTATAATTTGAAGTT CGATAGATCAAATAAGATACAGCTCACACAAGCTAGATAATTTAAGTGTATGCTCCAACTTTTTCCACTCTCTCTACAAA TTATACTTGTAATTGGCTTTTGTTCAAGTGGCAAGTAATGAAAGGTATATGATTGTATTCTTAAGCTCAATATGAAAAAT TAAAACAATTATTGAATCAAGATTATGTAAATTTAGTTGTTGTAAAAGGCATAAGCATATCATTTCATCATTAATGAACA TTAAAACTTGCTTTGCATATAACATATTTTACCAAGTATTTTGAAAGTATGATGTCTTGTACCTTCAGGTATCCTTGCTT TTGAAGGAGAGTTACATTGACTCATTCCCTTATCGTGATCGGGCTTTCATGAAGGTACGGTTTGTGAACTTTACATCATA CGTTGTGTTGATGCAAGCAAATTTTTATTTTTATTTACTTTCTGGTTTTGAGCGATCTGGACTGACGTGCATATATTTGA TTACCCAGTAGTTTACCTCCCAGTAGTTAGGATATAATTCAAACTTCATAATTGTCATTCCAATCTTTACACAGCTTTTC TGTTGGGTATTATTCTCAGATTTCTAATGCGGATTGTTTCTCCTTTGTTGCCTTGTGTCAAGCAGCTTTTTGTGGATACA CAGCTCTTCTCTGTGCACACAGATCTTGTTCTCTCATTCTTCCAAAAGGAATAGGACTGGAATGCAATACATTATGGGAA TATTGTTGCCATAGAAAGCTTGAACGCAAGTTCAGTGTTGTATAATTTCTCTAAATTATGAGCTAAATTTTGTCTCCTTA CATGCATCTCAAATTTTATTTTTCAGTGCCTTGGGCGTTCTGTAGAACCTGTACATACTGCATAGTGAGAAATAATTCAA GCTTTAATTATATAGGGTTTCATTTTATGTAAATGACAATTTTCATACACCAAAAGTAAAAGTTGTGCTTTATCTCAGGC TTTTTGGCTCTTCTTGAAAGCTATCACTGGTTCTGGAACCCTTTTACTTATTACTGAAACTGTGTTTGTGATCGAAGGCA GCATGATCTGAAGATTTGTGTAGCTCTTTTAAATGATTTCAGATATTTAATGCAGGTTGTAACCGATGTGCAATTACACT TTTCAAGCATACTCTTGGTCTTACCTTTATATAGCATTACTCATCACAATGAATAAAATGTATAGCTTTGTAATGAAGTG TGTGGGATCAGGGATTCAGTGTTCTCCTGTTGGAACATTTTCATGTTGAAATTTTGTGCCTATCTCTTTCACAATGTTTA TTATATAGGTAAGACTCTAAATATTTACTAAGGGAGGGACAAATATACTATATGTCACTTCACATTATTAAATGATATGA GATAATCATAATAGTGGGTGGTATGGTTATATGATAAATCAAAAGTTAGTAATCATTTAATACTAGGGGTAAATGTTTTT CATTTGTGTTTCAT
CDS sequence (LotjaGi6g1v0225600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGACTGGAATTGCAAAGGAGGAAGAGTCAGGGAGTCCTAGTTGGGGTGCTTCTTTTTTTACACAGACAACAGAGGATGT AGCTAAAGCTGTCGCTGCTGCTATGAATTCTGAAAGGCCATCTGTGATATATTCATCTAAAACTGATCATGGGGGTAGTC AGCTTCAAAGGCTGCAGAGTCAAGTTACTAAATTGATAAAAGGATTTTCTGGCACTTCTGAAGTTAAATATGCAAATTAC AATCCAGAAATCCTGACAAGTCAGAAGCGTCAATGGGCTGCCAACTTTCATTTGCAGTACATGGATCATAAGTCTTGGAA GGAGCCATCAAGGCTGTTTGAAAGCATGGTGGTTGTTGGACTTCATCCTAATTGTGATATTCAGGCACTGCAAAGACAAT ATATTGATAGAAAGTCTGAAGGCTCTGGTAAATTGAGAAGTGCACTTGGTTACCATAATCAATCCCGTGTAGAGCCTAAT CTTGAACCTCAGGTCTTATTTGCTTACCCTCCAGACAAGCAGCTGCCTCTTAAAGATAAGGATCTTTTTTCTTTCTGCTT CCCTGGAGGCCTGGAGGTTAATGCTGTGGAGAGAACCCCTTCCATGAGCGAGTTGAATGAAATTCTTTTTGGGCAGGAAC ACCTTAAACAAAGGGATCTGTCTTTTGTATTTAGGTTACAGGGTGCTGATAATTCAACACTTTACGGATGCTGTGTCCTA GTTGATGAGCTAGTGCAAAAACCATCCGGATTGCTCTCCCTGATTTTGGACAAGCAGTCATCTCACTCTTCATTGAGACG CCATATAATAACCACAAAGAGATGTTACTGCATTCTTTCAAGGCTCCCATTTTTTGAATTGCACTTTGGTGTATTGAACA GCATCTTCATGCAAGAAAGGTTAGAGTGGTTGACAAGCAGTGTTGAAGATTTAAATTTAGAAATTGTTGAAGGTAGTTAT GATGAAGAAAATTCAGGGGAAAATTCAGAGTGTGTGTTGATGAATGATAGACCAACAGAAGACAGAGATGACGATAATCC AACAATTTCTCAATCAAAGCTAGGAAGTTCCCTACCCGAAAACATTGAAGGTGATAGTAGTCATCTAGAGAAACAAATGG TTAATGAGGAGCTGCATACATTTAAGGAGGGAGTCAATAATGACACTGTTGTCCCAATTGATCCTGAACCTGATATAAAA ACTGCCAAAGAAGAATCTGGCTGTAAAAATGCTGAAGATAGTGATCTGTGTCGAGATGCTTTTGTTACAAACAAACAGTC AGAAGATAGGCGCTTACCAAATGCTATTTTGCCACTCTTGCGCTATTGCCAGTATGAAAGCTCTGAATCTTCCTGCAGTA TTCAAGGTTCACCTTGTGAAGACAGGAACTTTAGGAGTGATGCTGATGATACCGAGACAGAAGAGGCTTCAATCTCGGGC CAAGAGGATTTAAATGACCTACATGATATTCTTGAATGGGCTAAGGCAAATAACTGTGGACCGTTACAGATTATAAGCGA GTATTATCGTTTAAGTGTTCCTGCAAGGGGCTCAGCACTTACCTTCCGTCCTTTGGAGCACCTTCATCACCTGGAATATC ACAGACCAGCTGAGACAGTTCTTCATCTTGCTGGTTCAACTGTTGATTTGAAATCTTGCAGTACGCGTCTTGAATTTGCT GAGGCACATATCTCCCTTCTGGCTGAGGAGGAGGCAACTTCATTATCTATATGGGCTGTAGCGTGCATGTGTGGTACCTT GAGGCTTGAAAATGTTTTAACATTGTTTGCAGGAGCTCTACTGGAGAAGCAGATAGTGATTGTCTGTTCTAATTTGGGAA TCCTGTCTGCTTCAGTTTTATCAGTTATTCCACTAATCCGGCCCTACCAATGGCAAAGCCTGCTTATGCCGGTTTTACCA AATGACATGCTTGAGTTTCTGGATGCTCCTGTCCCTTACATAGTTGGTATCAGGAACAAGACCAATGAAATTCAGTCAAA GTTAACCAATGTTATTTTGGTTGATGCCAATAAAAATCAGGTGAAGTCACCAACGGTACCTCAACTGCCAAGACAGAAAG AGCTAATCTCTTCTTTACGTCCTTATCATGCAACTCTTGTGGGAGAAAGTTACTTGGGTAGGAGAAGACCGGTGTACGAA TGCACGGAAGTGCAGACAGAAGCTGCCAAAGGGTTCTTATCGGTGTTAAGGTCTTATTTGGATTCCCTTTGCGGTAACAT CCGTTCTCATACGATAACCAATGTACAATCCAATGACGATAAGGTATCCTTGCTTTTGAAGGAGAGTTACATTGACTCAT TCCCTTATCGTGATCGGGCTTTCATGAAGCTTTTTGTGGATACACAGCTCTTCTCTGTGCACACAGATCTTGTTCTCTCA TTCTTCCAAAAGGAATAG
Protein sequence (LotjaGi6g1v0225600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MTGIAKEEESGSPSWGASFFTQTTEDVAKAVAAAMNSERPSVIYSSKTDHGGSQLQRLQSQVTKLIKGFSGTSEVKYANY NPEILTSQKRQWAANFHLQYMDHKSWKEPSRLFESMVVVGLHPNCDIQALQRQYIDRKSEGSGKLRSALGYHNQSRVEPN LEPQVLFAYPPDKQLPLKDKDLFSFCFPGGLEVNAVERTPSMSELNEILFGQEHLKQRDLSFVFRLQGADNSTLYGCCVL VDELVQKPSGLLSLILDKQSSHSSLRRHIITTKRCYCILSRLPFFELHFGVLNSIFMQERLEWLTSSVEDLNLEIVEGSY DEENSGENSECVLMNDRPTEDRDDDNPTISQSKLGSSLPENIEGDSSHLEKQMVNEELHTFKEGVNNDTVVPIDPEPDIK TAKEESGCKNAEDSDLCRDAFVTNKQSEDRRLPNAILPLLRYCQYESSESSCSIQGSPCEDRNFRSDADDTETEEASISG QEDLNDLHDILEWAKANNCGPLQIISEYYRLSVPARGSALTFRPLEHLHHLEYHRPAETVLHLAGSTVDLKSCSTRLEFA EAHISLLAEEEATSLSIWAVACMCGTLRLENVLTLFAGALLEKQIVIVCSNLGILSASVLSVIPLIRPYQWQSLLMPVLP NDMLEFLDAPVPYIVGIRNKTNEIQSKLTNVILVDANKNQVKSPTVPQLPRQKELISSLRPYHATLVGESYLGRRRPVYE CTEVQTEAAKGFLSVLRSYLDSLCGNIRSHTITNVQSNDDKVSLLLKESYIDSFPYRDRAFMKLFVDTQLFSVHTDLVLS FFQKE
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
---|---|---|---|---|---|---|
PANTHER | 1 | 805 | 805 | 0.0 | – | |
Phobius | 1 | 604 | 604 | - | – | |
PANTHER | 1 | 805 | 805 | 0.0 | – | |
SMART | 109 | 242 | 134 | 2.3E-5 | ||
ProSiteProfiles | 143 | 805 | 663 | 22.507 | ||
Pfam | 163 | 240 | 78 | 2.7E-9 | ||
SMART | 271 | 679 | 409 | 1.1E-39 | ||
MobiDBLite | 319 | 365 | 47 | - | – | |
MobiDBLite | 334 | 348 | 15 | - | – | |
MobiDBLite | 349 | 363 | 15 | - | – | |
MobiDBLite | 387 | 407 | 21 | - | – | |
MobiDBLite | 450 | 480 | 31 | - | – | |
Pfam | 566 | 678 | 113 | 1.5E-24 | ||
Gene3D | 578 | 711 | 134 | 1.8E-32 | ||
Phobius | 605 | 626 | 22 | - | – | |
Phobius | 627 | 805 | 179 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi6g1v0225600.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…