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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi6g1v0303000 |
| Transcript ID | LotjaGi6g1v0303000.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | WAT1-related protein; TAIR: AT1G25270.1 nodulin MtN21 /EamA-like transporter family protein; Swiss-Prot: sp|Q4PT23|WTR6_ARATH WAT1-related protein At1g25270; TrEMBL-Plants: tr|I3SDE6|I3SDE6_LOTJA WAT1-related protein; Found in the gene: LotjaGi6g1v0303000 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr6:62044491..62055336) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AGTTAGTGCTTGCATAAATTTCAGTTTTTCTATTCCTCATTCACTATAGTATCACACTGTCTTTTTAAGTGAAATTTAAT CCCATTTTTAGAGTGGGACGTTGCCTTGGCCAGTCGCAGTGGTGTCACTGACTAAAAATGAAGGACATTGGCAATGTGGT GCAGGGGTTGAAGCCAACGTTGCTAATGGTGGTGGTGCAAATAGCATTTACTGGGCTGTATGTGCTGCTAAAGCTCGCCG CAGACGATGGCATGAGCTTAACGGTGCTTACTGCCTACAGAAATGTATTTGCTACAGCTTTCATAGCTCCACTTGCTCTC ATCATTGAATGGTTCGTTCCTTCTTCAATTGATAATAACTGCATTAGTTATGGCTCCAACTGATATGCTTTTGGTTGTCC ATGAATTACGTTATCAGGAAGAAGAGGGCAAAGATGAATTGGACAGTGCTGTTTCAGTCATTTCTATGCGGTTTATTTGG GTATGTAATTAATGTCATGTTCCTTTATATATATCATTTCATTGATGCTCCTTATGGATCAAATTTAGAAGCACTGATAC TTGCATTAATTTCTTTCACGTATCTTGATATTCATTTGCAAAGTACTCAACTCAATCTTTCTTCTTTCACACTCCTAGTT TATATACTCATAACTAATTTAGTACATCTTCTAAATAAGTTGTCTTACATATAATCTTAGCATTGTATAAGATATGCCGT CTTCGAAGCAAATAAGAATAAATTGTCCTCTTGGAAGCAAAAGTCTCACTCTTTCGGGGGCGTATCTGCCTTATTAAATC GTTATCTTCCTTACTCTTGGTTTTTATTTCTTTCTTCAAAAGTCCTAAATGTGTTGCTAAAGTTCATAAGCGATCCAAAG TAGGTTCTTATGGGGAGGGGATGAGGAGCTTGGGTTAAATGGGATAGTGTGTGCTGTTCAAAAGAAACTAGGGGGCTGGG AATTAGGGATTTGGAGATATTTAATAAAGCGTTTCTTGGGAAATGGAGATGGGGGTTAGTTAGTGAACAAGATATATTAT GGTACAGGACGCAGGGTATTAAAAGCTAAATATGTGGTTGCTGTTGAGGGTGGCCAGGAATGAGACTTAAAAAACGGGTC ATTTTGGTGGAGGGATGTGGGGAGTGCATGTGGGAGTGAGGGGGGGGGGGGGGTGTAGCTGGTTTGAGAACAACATTGGA AAGAAAATTGGGTATGGGGAAAAGGTGAAGTTTTGGCATGACGCATGGGTAGGGAAGAGAGATTAAAAATATAATACAAG AGATTGTAGGATATTTCCGATCAACAACATCATATAGTGAGTGAGATTTGATAAATGGGTGGCGGGAGCTTGGGTCTGAG AATTTAAATGGAGAACACTGTTGTTTGAATGGGAGAAACAATTGTATGCAAGTTTGATGTGGGATATAAAATAAATTCAC TTGAAGCACGAGGTTGAGGGTATGTGGTGTTGGAATGCAAATGCAACAGGGAGTAATTCTGTAAAATTGGCATATGTTGT GATTCATGATTGAGATTGCCAAATTGACAAAGCTCTTTTCAGAAATCTATGGAAGGTCGTGGCTCCATCCAAGGTCAATG CTTTTGTTTGGCATGTTATGTTGGATAGGATTCAAATGAAGACTAATTTGAGAAAGGAAAATATAATCAATTCTGAATTA GAATGCTTATGTTCATTTTGTCATATTGAGGAAGAAACCACAAGTCATCTTCTATTGATGTGTTTGATTTCTTCAATTAT ATGGATCATCTGTTACAAGTGGCTGGGTTTTCAAACTTCATTACCTGCATATGCTGTTTCTCATTGGCTCATTGAGTGAG GAAAACAAGTTAGCTTGGCAGACAGTTTGGGTTGCAGTGGTTTGGTCCCTATGGATTCTTAGAAATAGTTTTTTATTTCA 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TCGTTCGTGTATCTTGTACAAAAAAATTCTTAATATTAAAGAGAATTCATTTTCCTTATTCAACATTTGTCAGATTGGAA AAAATAAATCTAAAAACGACAGCAGGGAAGGCTAAGATAGTGGGTACAATAACTGGAATTGGTGGGGCAATGGTACTGAC TTTGGTTAGAGGCAAGGAAATCAAGATAGGGTCCTTCCACATTAACATTTTGCATCACCAAAACGGCACGCACCCACACG CTAGTACCGGTGATAACCTCTTGGGTGCTCTTTGCAGCCTAGCCTATTGCACCTCTTATGCATTGTGGCTCATAGTTCAG GTCTGTTTAATTTGGTTTAGCAACTAATCTTTTGTTTTGTGATAATTAGTTCCTTTCTATTATGTGGCTGTTCTTTGCAT GTATTATTACTACAACAATTTTTAATAAGCAATATTTATTTAACATAAAAAAAAAACAATATCTACTTATTAACTCTTTG ATCTTGAATTAATGTGTCTCAGAAAAAGATGACTAAAAGGTACCAGAGTCATTACACAAGCACCGCGTTAATTTCGTTTT GGGCTTCAGTGCTATCCATTGTGTTTGCTCTTTGCATTAAGAGAGATTGGAGTGAGTGGAGGTTGGGTTGGAATATTAGA CTCCTAACTGTTGCTTATGCGGTATGCTACTCGCTTAATAATTATAATTATTATAATACATATCATCCATGCATCTGCTT GATGAATTTGAATCCTCTACAGCAGATATTTTCTGCAGCTCCTTCCTGCATAATCATAGACATTGCTTTTTTCAATTAAT GGTTAAGATCAGTCTAAGAATAAAGATTATTAAATTATTAAAATTATGGTTAGTTGTCTGCTGCAGAGACTGCAGAGGCA GTAGAGGATCCAAATTCCATTAATTATGTATGGTACTAAGTAAATTTATATATAATACTATTCTATGGCTTTTTTTCTTT 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AAAAATCCACAAATCTTATATTTATGGTATTATAATATTATTTAACTGCATGCACTGATATTTCACAATATATTTAGTAT ATTTTAGGATTAAATATATTTTTAGTCCCTGTATATAGGGTGAAATCTAAATTGGCCCCTCAAAATTTTGCAACGTTACT AGTCCCTCAAGCATTTTTTTTAATTTGAATAAGTCCTTGTGATGTTCTCCAGCCTACATGGTAAGCCTGCCTAGTAGGGT TGTCCACATAGACTTTTTGCATCAGTTTTGGTCCTTTCAAAAAAAAAGTTCGTCAGATTGGGTCCATTCTCCTCCCCTTC TTCTTACTCAAATCCTAGCACCACCTTCCCTGGTTGCGGTCATGACTCCACCACCATGGGGACTTCTTGGGAGTTCCCAA GTTTTCATGAATAAGATTGTTTTCTTCTTCCAAGAAAAAAGAACTTCTTCTCCATTGGGACTCTACTCTCTCAATGTGGT TTCTCCTTTACTAGGTGAAATTGTCTCATTTTCACATTTAGAAAAGGAAAAAAATCTGTTCACACCCTAAATTCATCTAA AACAGAGAGAAATTGGAATAGAAGATCGAGAAATGAGTGATGTGTTAGGAATGGAAGAGAGAGATATGAAGAGAAAGTGG GTGAAAAGAGGATGGAAAAGTAAATGGAGTTGGAGTGTGAATGTATCAAAATTAAAAATAATTAGTGATTATTAGTCGAT ACACAATTGTATTCTCTCTTGAGGTTTGAAAATACCTTGGGATGATGCAAATGGCATTGGGCTGCTTTATGAACTTTTAT TTAAAATCTTGGAAAAATAAACGGTCTTGATACTTAGACCCTTAGATTGCGACGTCTATGGGACACAGATTTTTGGTGTA TCTTAACCCCCCTGTATGTTAAAAAAACCGTTGAAAGTTTTATAGCACATGATCTTGTGGTTCAGAGTTGGGTGTAAATG GTCATCTTTGGTGTTGCGTTTGGAGGTTAATTATAAGGAATGCACTATGTGAATTGAGTGTCTTGTTCAATTAGTGTATT TTGGTGGTGTGGGCTTCTTGGTCATGGGTAGCACTATTGTAGTATTGGTTCAGTTGGATCTTCAGTGAGGGAGACTCACG TTTTTGGTGTCATGCAATTACAGCATGTTTTCTTTTTCAGAATCTTTGTGCCAGTTTGGAGGTTTCAAATATTTGTCCTT GCATTGGTGGATGCTGGAGTTTGGTCGGTGTTTGTGTTCTGTTTGTATTTGGTGGGTGTTCTGCATTTACTTTATACTGC CATGACTACCAGAGGAGGTGTTCTGGAAGTATTCATATCAGCTTGGGTATCTTTGTCCCCATTGAGTAGACTGTTTCTCA TCATATTATGAAACTTTTGTATTTAAAAAAAATCTAGCCATATGGTGACTTGAGAAACAAACAAATTAAGTTAGTCCGCA TGGCCGGTCCCCTAGACGCCGCAGTGTTTCACCTCATGGTCGCAGCTACAGCAGGTCACCACCTCCTTACCGTGCTCGTG AGGAGGTGCCTTATTCTAATGGAAATGGGCTTAGGGAAAGGCACCGAAGCAGAAGTTGATTTTAAATTTGGTAACTGCAA TTAAGAGGACAGTGAGATTTTGTTAATGTAGTGGTGCTTGGACTTGCAGTATGTGTCTGTTTTGTTGGGCAACGCCCTGA GTTTCTACTCTTGTATTTGATTAGATACTTTATTGATGTCTCAGGTAATGTTTCTTTTTTCTATGCAAGAATGCTTGTAG TCTAGTTGCATGTCCATTAAGGTTGTTGCTACTATTTGTTAGAGATTCTGATCTTTCTAAGACATATGCTTGGCTACTCT AAAAAAAATGGATGTAAGGTAGACAACTTTTTTTGAAAAGTTAGTGTTTTAACTCGTTTAATATCTCTGCTTTAGTTTTA TTTCACTGTCATATTATATTTCTGTTTTTTTCCTTATCACACTATCATTATAATTAATAGTTGTAGAGAAAGTGCAACAT TAAACGGTGCAAACAAATACAGGCTAATTTTGGATATCAGTTGCACTCATACAAGATGACGTTAGCACGCACTAAAGTAA CCTGAATCTTATTATATATAGCTCTAGCACTCAGTTTCTCTATCTCTCATTCACCACTATCACACTGTCTTATGTGAAAT TTAAGCCCATTTTCAGAGTTGGACGTTGGTGTGACCAGTGGTAGTGGTAACCTGTGACACTTACTAAAGATGAAGAAGAT TGGCAATGTGGTGCAGGGTTTGAAGCCAATGATGCTAATGGTAGCAGTGCAGGTATCATATGTTGGGGCAAATGTACTGT ACAAGCTGGCCATAAACGATGGCATGAGCTTGAGGGTGGTTATTGCCTACCGCTATGTATTCGCTACAGCTTCTATAGCT CCACTTGCGCTCATTCTTGAAAGGTTAATTCAATCTTCAATTAATAAGATTATTTGAGAAAAATCCTTTGAAGAGCGTGT CTTTTCATTGCTAGTTGTAGAAAAATGAGAAGCCATAGCAATATTAAAACACCCCATAACATAGATATATCCAGCTGATA TGATTTTTGTCATCCATGAATGTTAACAGGAAGAAGAGGTCAAAGATGACTTGGAATGTGCTGTTTCAGTTATTTCTGTG CGCTTTATTTGGGTATGTATGTAGTGTCATGTTTATTGATATGCTCCTTTATTGTATATCATCATTTGATTGATGCTCTT CAATTTAGTTTGGAACGAATTTTGAAGCACCAGTACTTGCATTAATTTCTTTCACGTATCCTGTTATTCATTTGTGAATT ATTCAACTCAATCTTTCTTCTTTCACTCGTACATATATTGCCACATATATTTGCAAAGTTTGAGTTAGATTTCTGTTCCA AAGTTCAAGCATACAACATCTAAACAAAACCATGTACTGATTAGATAAAGTAATATCTACAGATTTGATACATTCACACT CAGCTTCTCTTCTATCTCACTTCCACCCACTTTCTCTTCTTATCTCTTTATGTTTTTACTATCACATCACATATTATATG ACTCATTGCTCTCTCTTGTATTCCTATCTCTCTCTGGATGGGAGTGAAGTTGTGGTGTTAACTATGAAGTAAGATCTTAG TTTAATTTTTTTAAGATTCTAGTTAAAATTTCCTATCACATCACATGTCATAAATCTAATTTTGGAGATCTCCATTAATC GCATTTAACTTTTTAATGCTAACTTCATAACATATCTTAAAGTACTAGGAGTCTGTTTGGACACAAACTGAAAAGCACAT ATTGGAACTTATCTACTAAAAAACACTAGATAAGCTCTGATAGCTGCTCTAATTTGGTCCACATCCAAAAGATCATAGAT AAGACATGTTATCTATTACTTCGTTAAAGTGACACTGAGGTTAACTTTGATTTGATTTGATTTGATTATGCAGAGGAGTA TTAACTCAAAATTTCTACTTAGAGTCCCTGGTTTTAACTTCGGTAACGTTTGCATCCGCCATGTCCAACCTTGGATCCGC TATAACCTTTATCATGGCCGCTTCCTTCGGGTAAATAACCATTGCTTTAATTTTACTTTACTAAAATTCTATTTTCAACT TCTTCTAATTCAAACTAATGCTCTCTTATTTACCAAAAAAAAAAAAAACTAATGCTCTCTTTTCCTCGGATTTGTCTATC AAGTGGAAAAATTAGATGGACTGCTAGTGTAATCCAGGTATCAAATGACTTTCAGAAAATTTTATAATACCCTTTTGGAT CAATTTCTTTACCAAACAATTATAAGATCACAAAATTATTTGAATGGAAGTTTCAATAACAAAGTTTATGTCTTTTAACT TAGTGGAGTATTTTTTGTATGATTACTTACCTCATTTTCATCCTCTGACCCAACCATATTCATTTGTGTATCTTGTACAA AAAAATTCTTCATATTAAAGAGAATATTCCTCATTTAACATGTCCTCAGATTGGAAAAAGTCAATTTGAAAACGGCAGCA GGTAAAGCTAAGATAGTGGGTACAGTAACTGGAATTACTGGGGCAATGGTACTGACTTTGGTTAAAGGCATGGAAATCAA AATGGGGTCCTCCCACGTACATCTTTTGCATCACCAAAACGGTGCGCACCCTCACGCTAATACCGGTGGTACCGGTAAGA ACCTCTTGGGTGCTCTTTTCAACCTAGCCAGTAACATCGCTTTCTCATTGTGGCTCATAATTCAGGTCAGTTTAATCTTT TATTTTGTGATGAGTTAGTTCCTTTGTATTTTTTGTATGTATTGTTACTACAACGAGTAATAACCATTGTTTTGTTTTAT TTGCTTTTTAATTAATGTGTCTCAGAAAAAGATAACTGACAAGTACCAGAGTCATTACACAACCACCACGTTGATATCGT TTTGGGCATCAGTGATATCCATTGTGTTTGCTCTTTGCACTGAGAGGGATTGGAGTCAGTGGAGGCTGGGTTGGAATGTT AGATTATTAACTGTTGCTTATGCGGTATGCTATTCGCTTAATAATTATATTAATATAATGCTGACTTTAAGCAATCATCA TAATTATATATGAATTGTACTGGTGTAGGGTATAGTGGTTTCTGGACTGGTGGTGGTTGTACTTTCATGGTGTATCCAAA TGAGAGGCCCGTTGTATGTATCTGTTTTCAATCCCCTGGGGCTTGTGATTTTGGCCTTCGCTTGTTCTCCGCTATTGAAC GAGAACATATACCTTGGAAGGTACGTATTATTAGAAGTTAGTACATTTCTTATTCTGTTTTGCCAGCAGTTGTTAGTTTT ACTCGTTCTGTTATTAGTTTCACAATTAGTCAAAGCAGTTACTTAGCTTAGTGCTATATATAGTTGAAGTGTACTATTGA TTCATTCAGAATAAGAAATTACATTCTCAAACACTCTCTGTTCAATCTTCTGTTACGTATCTAGGTTTTTCTTGTTATTT TCACAATATAGTCTCATAGAGTACCATGCTTATGATGTTTTGTATTGCTTTTTATATATAGCTTAATTGTTCACATACAA GTATGTAGCTCTGAAATTTTAATCATTGGAGTTAATTTCAGCATTAATCCATTTAGTTTCAAGAATATTTGTTACTTAAT TTCAGCATCATTGGAGCAGTGTTGATTGTCTGTGGCTTATATGCGGTTATATGGGGTAAAAGCAAAGAGATGAAGATAAG TCCATTGGTGTCTTCTAATGAATCGGATACGGTTGAAATAGTCTTGAGATCTACAGGACCAGAAGAGAAAAGCAACAAGA ATATTGGTATACAAGTGATTAGGGATGATGAAGATTTACCAGCAGATGGACATGAAGAGCTAAGTACTGCACATGTCCAC AATCAAGAAAAAGAATAAAGTCTTAGTAATATAGTGCCTGAATAATTCAACTCTCTAACTTCTGCTGATAGAGATTGATA GTGACACTCATTCGTGTATGTATGTACATGCATAAAGTCAAGTGGCTACTTCATCTATTTCCACCCATAAGGCATAAATA TAGTTGGCATTTACTGATTCACCTGATTTCAGCAAGGAGTTAAAGCACATAATGAAAGTGGCCAAGAAATATCCAAAAAA AGAAATTGGCCTAGTGTGTGTGTGGGTGTTAATACTACCAAATGAAGGAATATGCCCCATGATGCATTTTTAGAAAGCTT AGACAGTATAATTAACAGTTGGAGTGTGATTGAGGATGAGGGGTGCAGTTCTCATCTTAGTTGTTAATTTCACTGTCCCT AAAATTTACTAATATATTTCTTAGTGGCATTTACTGTCTTGCATTCACATGCTTATATCACAATCAACATAGCTCCAACG GGAAGCATGTTTGGTGCAAGCACGAAAGCTAGGTAGTTTCAATAGTTATGACCAAATTTATCATGGAATCTGATCTTGCA TGTCTAGTCTAGGTGTGTGCTAAACTGTCGTTTAACCAAATATGTATGTATATGTATTAAACCTGAATTTCCATTTTTAA GTTTTATGAAGTCTCATTATTATTTCACAAAGTTTATGAGTTCGGC
CDS sequence (LotjaGi6g1v0303000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGAAGGACATTGGCAATGTGGTGCAGGGGTTGAAGCCAACGTTGCTAATGGTGGTGGTGCAAATAGCATTTACTGGGCT GTATGTGCTGCTAAAGCTCGCCGCAGACGATGGCATGAGCTTAACGGTGCTTACTGCCTACAGAAATGTATTTGCTACAG CTTTCATAGCTCCACTTGCTCTCATCATTGAATGGAAGAAGAGGGCAAAGATGAATTGGACAGTGCTGTTTCAGTCATTT CTATGCGGTTTATTTGGAGGAGCATCTCAAATTTTTTACCTAGAGGGTTTGGCTTTAACTTCGGTAACGTTTGCAACTTC CATGTCCAACCTTGCACCAGCCATAACCCTTATCATAGCTGTTTCCTTCAGGTAA
Protein sequence (LotjaGi6g1v0303000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MKDIGNVVQGLKPTLLMVVVQIAFTGLYVLLKLAADDGMSLTVLTAYRNVFATAFIAPLALIIEWKKRAKMNWTVLFQSF LCGLFGGASQIFYLEGLALTSVTFATSMSNLAPAITLIIAVSFR
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 14 | 14 | - | – | |
| TMHMM | 7 | 29 | 23 | - | – | |
| PANTHER | 9 | 123 | 115 | 3.3E-47 | ||
| PANTHER | 9 | 123 | 115 | 3.3E-47 | – | |
| Pfam | 13 | 123 | 111 | 1.3E-10 | ||
| Phobius | 15 | 34 | 20 | - | – | |
| Phobius | 35 | 45 | 11 | - | – | |
| TMHMM | 44 | 63 | 20 | - | – | |
| Phobius | 46 | 63 | 18 | - | – | |
| SUPERFAMILY | 47 | 123 | 77 | 7.45E-7 | – | |
| Phobius | 64 | 74 | 11 | - | – | |
| TMHMM | 75 | 94 | 20 | - | – | |
| Phobius | 75 | 93 | 19 | - | – | |
| Phobius | 94 | 98 | 5 | - | – | |
| Phobius | 99 | 123 | 25 | - | – | |
| TMHMM | 104 | 123 | 20 | - | – | |
| Phobius | 124 | 124 | 1 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Cellular component | Membrane | A lipid bilayer along with all the proteins and protein complexes embedded in it an attached to it. | ||
| Cellular component | Integral component of membrane | The component of a membrane consisting of the gene products and protein complexes having at least some part of their peptide sequence embedded in the hydrophobic region of the membrane. | ||
| Molecular function | Transmembrane transporter activity | Enables the transfer of a substance, usually a specific substance or a group of related substances, from one side of a membrane to the other. |
Expression pattern of LotjaGi6g1v0303000.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…