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Field | Value |
---|---|
Gene ID | LotjaGi1g1v0064600 |
Transcript ID | LotjaGi1g1v0064600.2 |
Related isoforms 3 | |
Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
Description | MD-2-related lipid recognition domain-containing protein / ML domain-containing protein; TAIR: AT3G11780.1 MD-2-related lipid recognition domain-containing protein / ML domain-containing protein; Swiss-Prot: sp|Q54SW1|Y2179_DICDI Putative phosphatidylglycerol/phosphatidylinositol transfer protein DDB_G0282179; TrEMBL-Plants: tr|I3T113|I3T113_LOTJA Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0064600 |
Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:8959052..8972365) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATCATTATTTATTCATGTACAAATGATGCCAAGTACAGTAGTCACCGATGTTCACGCGCTCCATAGCCATGGCGGTTCAC TCTACTTCAACGCTTTACCTTGTTCTCTGCTTATCATCCACCGTTTTGCTGCTACTTTCTTCTTCTCATGCACAAGCTCA GTCCCTCAAATACTGTGGTAATTAACTAAACTAGCTACCTTTACTCTTCAAACTTTTAGTTCATGATTTTGTTTTGTTTA TATAATTCTTCAACATTCATCATTGATATGCCTCATACTTAGTTTTGCAATACTTGAGAGCTTCCTGTTTGAGATTGCAT GTTGCAAGTAGGGAGAGAAACATAGAGTGACTGACTCAGCTGCCATTTCTGGTATTAATAGCTGAGATGAAAAACGGTAG AAATAGAACCCCTTTGTGGAATTAGGGAACCTGTTTAATTTGCTTGGACAATATAAACCCCTATCAGAAGACATGGGGTC AAAGGCTGTCATGTGCGTGTCACGTGATTACACTGTGTTGTTTAGTTTTTTTTTTGTTTTTTGTTACAAAGAAATGTTAG TTGTTAGTTATTAGTAAATTAGTTCCTTTACCAGGGTTTGAACCCTGACCCTTCACCCTTCAATATCCTTCATTTCCCTT AGCTCACCCACCCCACCCACAATGTGTTGTTTAGTGGTTTTGTTGTTGAATTGTTAGTTAGTTTGAAATGTTCACTGGTT TAATTACAAGTGGGTAGTTAAACCAAAATGCAAACTTCTTTGCAATTTGGGTCGGCAACTTGGCATGCCTGGCGGTTAGA CCCCGGTTTGAGCCTCACCCCAAGGGCGCGGGTTTGAATCCCCTAGAGATCTCTGACGCTCCAGCTAGCTACTGGAGTGG GTCTCGACTGGCCTCCACAGAGGTAATAGAGGAGATAATCCTCCTCCGTTGGAGATTCTCAGTATGTCATTGGCAACCTG TTCCGTAGGCCTGGGGTGCCTCTCCAAGCCCTACCATTTTTTTACAACAAAAAAAAAGTTGTGTAATTCACCAATTCTAG TTAATTTATTGATTGTTCAGCACTAGTTGAAAAATTTTCAAGTTCTATGGTGATGTATTATTTTTTTATTTTCACTATTT TGTTTTGGGGGCCTAGCTCTTGCATTATTGTTAGTTTTTTATTCTTTGTTATTGTAGTTAGCTCTTGGTTTATTGATTTG AAGTTTGTATATGTATGGTATGCAGATAAGAATGCAGACTATGCTGTGAAGGTGAGTGGAGTGGAAATATTACCTGACCC AGTGGTGAGAGGAGTGCCGTTCACCTTTAAGATCGCAGCTTATACTGGTGACACTTCTCTTTCTAATTCTAATTAGTTTT TCCCCCCTCCTCCCGCCATGCTTTGTCTTTGTATCATTGTATGTTTGTGTGACACTTATGCTTTACAAAATTTCAAGAAT GAACTTTAATAATTAGTGGAAATGTAATTGATTATCTGTCAAGCAGGTGAACCAATTCCCAGTGGTGATTTACTATATGA AATTTCATATGCTGGGATAGAAGGAGAACCTGCTACATTTCTCCATGATCTCTGTGAGGAAGCACCTTGTCCTGTTCCTG CAGGCCACTTTAAGCTTGTTCATACCGAATTATTACCCTCGGTTACCCCACCGGTAAGTCTCATTTTACCAAGGTCACGC TTGTAAGAGCTTATTGGAGCTTATTTTATAGCATAAGCGCTTTTGCTACTGTTTGTGAGCGCTTTTGTATATAGTTTATG CATTTCTATAAGCTGTTTTGAATTAATTTCAAAAGCTGTTCAGATTAACTTATGAATAAGAGCTAATATTTATCTATAAC CTATTTTCAGCTTATTTTGTTGAAGCAAGTATAATGCATACAGTTAGTTAGGCTCAGTAGGATTAACTAGTGTATAGTTA ATGAGTGCTATATATAGTACACAGTGTAACTGAGTTTGTGAGTGCTATCAATAAACAATTAATCAATTTTCTCTCAAGAC TTATCTCTCTCTAGCTTTCTCTCTCGCTCTCTCTCTCTCTAGAGAACCTTCTGGTTCTAACAGTGGTATCAAGAGCTCAT CGATCAGGAGCCTGTGGTGGTGCCCAGGGCGGTGCAAGGTGGTGCTGCGGCGGCGCAAGGAGTTCCAGTGGCGGAGCTCA AGGCAGAGATCAACGGGTTGCGAGAATTGAAGAGAATTCAAGAAGAATCGAAGAACAGAGGGCGATGTCGAAATCGAATT CGCTTCCGATGATTCTTCCTACTCTCGATGGGAAGAATTATGATCATTGGAGTGTCCAGATGAAAGCAATTTTCGGATTC CAAGAGTGCCTTGAGGTTGTTGAATCTGGGTTTGAAGAAATCACTGAATCTTCTTCTGAAACCCAGAAATCTGCACACAG TGAAGCCAAGAAGAAGGATTGCAAGGCAACTTTCTTGATTCATCAGTGCGTTGATGTTGCAAATTTTGAGAAGATCTCAA AGGCAAAATCTTCAAAAGAAGCATGTGAGATATTGGAGAAAAGTCATTCTGGGTTGGCAAAGGTGAAGAAGGTTAGACTC CAGACGATGAGGAGGCAATATGAACTGCTTCAGATGGAGGAGCAAGAATCTATTGCAGAATACTTCACCAGAATCAGAAG CTTGACCAACCAGATGAAGACCTATGGTGAGAGCATGCCAGATCAAGGAATTGTTGAAAAGGTACTCAGAACCCTTACTC CTAAATTTGATCATGTAGTGGTAGCAATAGAGGAATCTAAGTTTTGGTTTGAATAATTGTGAGCTAGTGGCAGTGCATTC TACCTACTTCTTAGTTTATTTTTTTCACCTTCCAGGGGTCGTACTATAGACTAAATACGCAAAGAGCTTGATTATCTACC AATTGTGTCATACATTGTTTTTATTTTTTCGTCTATTGTTTTTCCATTTACAATTAAAATAACATAATTACTCGTATTAT GTCCATTGTAATAATTCTGTCATTATAAGTGATTTTATATTATTATTATATTCAAACGATATATATTTTTAATAACTAGA GTATACTATTGTTTTCAAACATAAACACATTCTCTCAAACTTAATGTTAACAAACTCAAATTTTCAAACTTAATTTTATC TAACCCAGTTTTATCAAACTTTAAATCCCCCTAGAGGAAAGAGGCAGAAAACAAGAAAGGACTGAAAGAAGAAGGAAAAT AAAATAGAAGTAGGAAAGCCCATAAAGAAGAAAGGAGTTCCCATGGGAGGAGTAAAATGAGAGTCACTTTTACGAGTAAA TGATAAAGTAAATCATCATAATCATTAAAATTAATTTACTTTAAAAAGTCGATAAAACAACTTAAACCATTGTAAGAATG TCTTAACAACCCTTTAAAGTGAGAGACTCAGACCATATACAATGGTTGTTTAATTTTGATGTTGAAGAGTGTTGAACATT GTTGAAGTGATGCAATGGTTGTTGAGGAGTGTTTAGAGGAGAGAGAACCGGCTGAATTGTTGAAGAAATTCAACAATGTT GAGAGGAGAGAGGGACGCCACGTGGCGCCCTCTGAATGGCTCGGTCAGGCGCGTGCAATACACGCGCCGACAGGGAGCGT GAGCTGCAGTCTTGGAGAGAGAAAACGTGATGGTGGATATGTCCTGACACGTGTCATTTTCTGATTGGTTCCCCGGATTT TCTTTTACCCTTATCTTTTGAGCTCAATTATCTGATAAAAAAAAATTATCTGGAAAAAAAAATTATACCAAAATTCGTGA TATTTTTTTCTCTATAAATAGAGACTTGGTTTGTTTGATTTGGACACAGAAAAAAAAACCAAGTTTTCACCATCTTATTA TCTCTCTCACCATCTTATTTATCTATCAATTAGCATTTGTTTTGAAATGGATCACAACAATCCCCATTTCAACACCCAGA ATTCTTCAAACAACCCATTTTACAACTAAAATCCCAACAACTATGAAGATCCAAAATCAAATTTCTTACCAACGTCCTCA AAATCCAAACTATTATCAAGTCCCACATCAAATCTCCAACCAACGTCCTCAAAATCCAAACTATTATCAAGTCCCACATC AAATCTCCAACCAACGTCCTCGAAATCCAAACTATTATCCAGATCCAAATCAATATTCGTACCAACCTCCTCAAAACATA CAAAATTTTAACCAGTCATCACTTGCTCCAAACTCTCATCCATCTTATGGATCTGTGAGATATTCATCTCAAACACCCCA GTCTAGTGGTTATATGCTAGTGGTTCCTGAAAATTTTCCGAGTGTTGATGTGTCGGAATTTCCGGAATTTTCAACACAAG TCAATCTTGGTGGCGGGTCAGCTGATAATGAAGTCAATGAAGTCACTCCTAAGAGCAAAAAAACCGTTTCACCCGCATGG AACACTGCACAAAATCTAGTGCTAATTAGTGGGTGGATTAATTGTGGAACAAGCAGTGTTGTCGGAAGAAACCAGAAAGG AGAAACATTTTGGAGAGATATTGCTGAGTATTGTAATGAGCATTGCTCATTCGATCCTCCGCGCGATTGGGTTGCCTGCC GAAACCGTTGGAATTATATGAACGCAAGATTGGGTAAATGGATTGGCGCTTATGATAGCGCTAAGCGTGAGCAACGAAGC GGTTGGTCGGAGGATGATGTTATCGCAAAAGCGCAGGAATTATTCGCAAGTGGGAAGATTGGTCAATTTACTTTCATGGA AGAATGGCGCGCTCTTCGTGATCAACCACGTTTTTGTAGTCAGGTAGGAGGAAATAGTGGCTCGAGAAGTAGTGGATCTA AGAGATCACACGACAGTGATGCAAGTGGCTCAAACTCTATAGGATCAGTTCCTCGTCCAATGGGTAGGGAGGCAGCTAAA AAAAAGAGTAAAAAGAAAATTAGAGAAGATGCCGACGAGGTGGTGGACAAAGAGTGGGATTCTTATATCCATTTCAAGGA GAAAGAGCTTGAAAAATTGGAAAAGATAGCATCGGTGCAAGCAGAGACTAACGAATTGATGAAAGAGAAGACTAATGCGA TGAAAGAGAAGACTAATGCTAAGAAAGTTAGTATGTATCTAAAGCTAACTTCGGAAGAGCATCTCAGTGACCGTAAGAAA GAGTTGTTAGAGCAGTTGTCCAAAGAGCTATTTGGAAATTAATTTCAAGCGAGTCTTTGTCTGTATTCGGTCAAACTTGT CAGTGGTGTGAAGTCTGTAGTGTTTGCTTTAATGTTTGCTTTAATAATTTTTAAGTGGTGACAGCTATGTAATGTTTGCT TTAATGTATGGGTAACTGTGTTTGAATATGTACCACTCAATTCGAATCTTGTCCTTTTCCGATAATTAACTCTGGTTGAT AACTTATTTCAAATCCGCCAGTGGTGTCAAGTCTGTAGTGTTTGCTTTAATAATTTGCCCGTGGTGTCAAGTCAGTAGTG TTTGGCTTTAATAATTCTCGGGTAACTGTGTTTGAATATGTACCACTCAATTCGAATCTTGTCCTTTTCGATAATTAACT CTTGTTGATAACTTATTTCAAATCCGCCAGTGATGTCAAGTCTGTAGTGTTTGCTTTAATAATTTGCCCGTGGTGTCAAG TCAATAGTGTTTGACTTTAATAATTCTCGGGTAACTGTGTTTGAATATGTACCACTCAATTCGAATCTTGTCCTTTTCCG ATAATTAGCTCTGGTTGATAACTTATTTCAAATCCGCCAGTGGTGTCAAGTCTGTAGTGTTTGCTTTAATAATTTGCCCA TGGTGTCAAGTCAGTAGTGTTTGCCTTTAATAATTCTCGGGTAACTGTGTTTGAATATGTACCACTCAATTCGAATCTTG TCCTTTTCCGATAATTAACTCTGGTTGATAACTTATTTCAAATCCGCCACTCAACCACCATTCAATGTACCTATATATAT GGACTCATAGATCCATTGATGTACCAATATCCCAAATCTCTTCCAATCTACTTCAAATTTCACAAAAAATGGATCCATCT GATTGCCCTTTTGATCTTGAAGCATACATTCAAAATAGTCAAATTGAAGAAGCTTATGTACTCAACCGATTTAGAGAGCG TCGAAGAAAAATTCGAGAAGATACTGCACCTCGTAGTAGAAAATATCTCGGTAGAGATCATACAGAGGCAAACCAGAGAC TAATTGGCGACTACTTTGCCAATGAGCCTACATATGACGATGCAATGTTTCGTCGTCGGTACCGGATGCAAAAACATCTT TTCCTTCGAATCGTTGGTGACCTTTCAAGTAGTGATAACTACTTCACCCAACGCGTTGATGCAGCCAATAAACAAGGTAT ATCACCCTTAGCAAAATGTACCACAGCAATGCGAATGTTAGCATATGGTGTGGCAGCAGATGCGGTCGATGAGTACATCA AAATTGGAGGTACTACAGCATTGGAGTGTTTACGTAGATTCTGTAAAGGAATCATACGATTGTATGAGCAACAGTACCTG AGAGCACCAACCCAAGAAGACCTGCAAAGAATACTACATGCTAATGACATGCGGGGGTTCCCAGGCATGATCGGGAGTAT TGACTGCATGCACTGGGAGTGGAAAAATTGTCCTAAAGCATGGGAAGGTCAATTTACTAGAAGGGATAAGGGAACCACAA CAGTTATTCTTGAAGCAGTTGCAACTTATGACCTATGGATCTGGCATGCCTTTTTTGGATGTCCTGGAACGTTGAACGAC ATAAACGTTCTAGATCGATCACCAGTGTTTGATGACGTGGAACAGGGAAAGACTCCAGCTGTGAATTTCTTTGTGAATGG TCGTCCCTATAATATGGCATACTATCTAGCCGATGGTATCTATCCTTCTTATCCAACTTTCGTCAAAACGATTAGACTTC CTCAAAGTGAACCCGATAAGTTATTTGCAAAAGTTCAGGAGGGATGTCGGAAGGACATCGAACGTGCATTTGGAGTTCTT CAAGCTCGTTTTAAAATCATCCGTGAACCAGCTCGCTTGTGGGACATAGATGACTTGAGTATCATTATGAGGTCATGCAT CATATTACATAATATGATTGTCGAGGATGAACGAGATTCATATGCTCAACTTTGGACCGATTTTGAGCAATCTGGGGAAG GTGGATCTAGTACACAGCAACCATACTCGACCGAGGTTTTACCCGCTTTTGCAAATCATGTGCGTGCTAGATCCGAGTTG CGTGATTCAAATGTTCATCATGAACTGCAAGCAGATCTAGTGAAGCACATCTGGGTAAAGTTTGGAATGTCTCAGGATTG AAGATGATTTGTATCGTACTATTTACGTTATTTGTGTGTTGTGTGCTTAGTTTTCCCTTGTCTTGCATTTTAAGATATTG TGTGCTTAGTTTGTTATCTTGCATTTTATTTTAAGAAAATAAAATAAATTCTTGTATGCTTAGTTTGTTGTCTTGCATTT TAAGTTAAGAAAAAAAAATTATAGTCTATATTTTTTTAAAAAAAGTCTATATTTAAAAAAAAAAACAAATTGTTAAGTGT TTATTGTTTTAATTTAATTTAAATCGATAATTGTAATTTTATGTAATTATAAAAACAAAAATATAAAATTAAATAAAAAT GTGAAATAAAAAAGTGGTGGGGTAGGGTGAGTGGTGAGTGGTGGGGTAGGGTGTTGAGAGTTAAACAAAACCATTGGAGT GGGTAATTGTTGAAAGTTTGTCGAATTTGAGAAAAAAGATGATGTTGAGTGTTGGGAAGAGAAAAAGTGGGGTAGAAAAG GGTTAAACAAAACATTTTTTGTTTAACCATTGTATATGGTCTCACTTTAGAACTTAGAAGAACTAGACAGGGGTGGAAAA ATTTCTCCACGCTATTAGATTTGTGGCGCTTCTTTAGAGTTCATGTTTATTGCACTATTGCAGAACTATCAATTGTCATT AGCCCGGATTTTTCATGCTAAACGTCTTTCATAAAGTAAATTTGATATTGTTGGCCAAGAATCCATAATCCATAGTATAT ATATTCAGGAAAAGATCTCAGTCCCAAAATGTATGATGTGGCATTCACTGATTGGCTAATATTCTACTGAATCCTATGTG TCACTTCATCCTCCATTCTTCTTTCTCCTCCTTTCTTCTTCTCCCATATTAAATGGGTAATCCTCTTTTATTTTAGGATC TGTTTCTCAGTTTCAAAAAAAGGATTTGTTTCTCTCTTTCTCTCTCATTTTCGGCGTTCTCTCTCTCTCGACATCAATCT GTTTCCTCCCTCGCTTGAGATCACCATCCCTCCATTACCATCCATCCCAGTCGCAGCTCTCCCCACGGTGCGACGTTGAC GACCCAACTCTCCTCGCAAAGTCTGTAACAGAGCAAGGTCCTCGACCGAGAATCATCGTCGTCAGAGCTTCTCCTCGCTC TGCTCCAGTAACTCCGTTAGAATCCTTCAAATCTCCGATTTCGATTGTGGATGACAAGGTATGAGTCTACACTCTACACA TATTACTATTGCGGTTACAACTTCAATTTGATAATCCAGATTACTATTGCGGTTACGGCTTCAATTTGATAATCCAGATT ACTTCCTTTTGATAATTTTGAGTTCTTTCCTATTTTCGAACAGATTGGAGACTAAAAAATGCAATCCAGAAGTCGCTACT CACAGCCACACTGAGCTCTCACCCCATGGTCCATTAGAACTACTTCAAACCCTAATTTTGAGCCGCCAAGCCCATATATT CTTCCCTAATTTTGGAACTCCGGCTGAAAATGGAATCCCGTTAGTTTCTCCCGGTAATTCTTCTCTTAGAAATTAGTGTT TTTGAATTCAAATTTGTTCTTGACCGTAAAATACTTCCCCCATTAATTGATTACTTGACTATATTCGCTTTCAATTGTTT CCTTTCTTGAGTGGAAATTTAAGAAAGTTAATTATCGGTATCAATTAGTTCATATTTATGTTTCTACTTTCTAAGCGCCT ATATATATTGCTACTTCTGCATTGTCCTTCGCACATTTGATATTTTATATTTTTCAGATCAGTGTTTATTTTGAGTCTGA GGTTTTGTTTTTCTTTTCTTGACTGTGTTGATTATCGAAGCAGCTTACTAAGGTGTCTGAACGGGAAGAACATTCAGGGT ATTCCATGTGAGAACTTGAACATCACAAAATATGATTGAAGACTGAGCATAGGAAGAGCTATACGCAGGTTGAGATTCTC TCAAGACTTCTCCCTTAATATTCTTTGAATCTGTTGATCTCACTGACTTATCATTTTTCTTTGAATCTTTTACTATCATA AAGGTATGGAGAGACTACTATTGTGTTTATTTATGCTAAGTATATGTCTCTCATGTAAAATCTTACCAATTCCTTTTACC CTTTTGTCTGTGATTTCGCTGGTGCCCTTTTGGCCAGATGGTTATTCTGACCTTCTTTTACTTATCAGTAAAAACGTTTT CCTTTTGTTCTCTTTTTCTGTTTATAGGTTTATAGGTTGCATTGCATATGTTCTCTGTTTCCATGACTGATTGATTCATG CGTCCTCTTCACTTCTGTTATCACACAGGGAAGATGTTCTCTGAGGAGCCGGATAGAGATGGTGATAGCCAAGTAACTCT TTCAGGTACCATTTTCACCTTCCAATTAAGCCACAAACAAAATTTCAAAAGCAGCATAATTTATTTTTAAGGGGCATTTT GCTAATAAAATTTCAAGGGGCATTTTTCTATTAAAAATTTTAATTCAAGATCTCACCAAAACTGATTGTTTTGCTATACA TACGTTTCTCAATTAATTTAGTTCCTTTCTAACCTGTTGATGGCATTGAGGAATTAAATCATTCACTATCCTTGACCCAC TGCCTATATTCCCTAATTTTCATCTTTACAGGCGGGTAGGTGTTTAGAACTGAATCCTCCTCTTCACCGTGGATGCCATT ATGACCTCATCGCCATCTCATGTATGTCCAAGCATGATTTTTTTTATTCCTTTTAAAAAAAAAATTGGTGATTTGCTCCA TTGTCAAGGACATGACTGTTGCTAATTTAGTATGCATTTAGGAGAAACCTTTTGAACTTTAATATACTGGTCACCAGATT TTGATTGATGGATTTCACTTTTTTGATAATGATATTAAGGGTTTCCCCCTATAGCCATAACCCCGTCAATTACTTACGGG TTATTCTATATTGCCTGTGAAGTGATAACATAACGAAGCGCTTAACTAAGTGGAGTTTCTTTTGAAATTATGCAGGTCGC ATGGGTATTGGGAGAAGCACAAAATGATTGGTGGAAATCATGTAGACAAGCAAGAGGATTAAGGAGAAAAAGAAAACATG CAGGTGCAATGCGTTTATATCTATCTATATCATATCATTGTGATGCTAAACACTGCATTAGAGAACAAATGTGTCTTATA GTCTTAATTCTGCATTTTTTCTTATTTTACGCCGAATACTGCATGAGCCTCATTTACTTTGGTTTTATTAGTTCCTAATT AAAATTACTTCTTTAAGTTTTATAGTATTTTTATCTGCAATCACAAATAGTTTAACTTAACTGATATTAATTGTACATAC CTTACTTTTAAAGCTTCAACAGCAAGTTTGACATCTGAAGATCTAACTTTGACCATCAACTCCAATGAGCTCTTTCGTTT GTTTTGCTGAGTTTTTATGAAGAGTGAATGATGAAAGAGGTCTTGGAGACACCGGGGGAGTAGAGATTCATGTCTATTAT GGATGAAAACTAGAAACAAAGTTATGATGGTGAAGCTCAAACAGTTTCTATGAGTGATCTTTGATTGAAAGGTACTTATT GTTCATTTTGCAGAAAAACTATAAGGATTGGATTTGAAGGCAATGGTTTTATTAGTTCTTCAATTATTGAATATGTCATG TCCCTTCTGCCTCAATGAATTGGACCATTTCAAGTTGTTACTCTTTTGACTCTTATTTATTTATGATTAGCAGTTAAATA TTGTGCTCTCTTTTATTTGTTCTAAAGTTCTTCTCTTCTGTTTTGTATGTTATTGCTTGAAATGCAAAAAATGTTGCAGT AGCTGCGTGTTTAGAAGGAGAAAGCTCTTTAGGACTATGGATCAGCTGCTGGAACAGAAGGAAAATGATCTTGAAAGTCA TGGCCTGGAGCAGGAGAAGCTTCACTTTGAGATGTACTGTTTCTGTTGGGGTTAGCTATGTCTACATATATAGAGCTTAA CTGGACATGGTAAGTTGGTAGAGTACTTGAAACCTATTCTTCCTATTGATAGTGGTAAAACTGAAATTTAAGATCTGTAT GGTTAAAGTGTGATAGGATCAAGGTTTTATATAATAGTGTGGTTTTGTTGAATTGTTGTAGAATGAGTTCAATTCCATTA ATGGAATGGAGAAAAGCTCTCAAATAGATGAGTGTCTGAACCAATTGGAAAGAAATTTCATGTGAGAAGATGAATCTCTA CTATGTTACATACATTATATATTACAACAGAAGAATTCAAGGCATTAAATAGAGTTATCTTTGATTAGAGAAGAAGCCTA TTAGCTTATTCAAGCCTTTTTATCTTTGATTATATTTTTAAGACTTTTTAGTCCTTCTAAGTTCTATGTCTTTGGCTTCT ATGTATCTTTAAGATTTTTGGGTTAAATACCAGATAGATTTTTTCCTTAATTTATAGGTTGAAGAAAATATCGGCAAGTT TGCAATGACAGGTTTACTCCCATCGCTGATCGGGGTGGTTACCTTCGAGACTCGCACGATATCGCTCATATCAGTGCTGC ATGTGTTAGAGGAAAACTGATGTAGCTTTGATTTTATTACTTTATTTTTGGTATAGTTCTCTATCTGACTGACTTTCTCT TGCATTTTTTTCCTCAAGGATGGTCCTTTGCTCTATTGTCAAGGACATGATTGTTGCTGATTTAGTTTGCATTTAGGAGA AACCTTTTGAACTTTGATATACTGGTCTAGATTTTGATTGATGGATTGTTACTTTTTGGATAATGATATTAATGGTGACA TAGCGAAGTGCTAAACTAAATGGAGTAATTTCTTGCAGAATGAGCTCAACTCCATTAAGGAAATGGAGAAAATTTCAAAT AGATGAGCCTGAACCAATTGGAAAGAAGTTTCATGTGAGAAGATGAATCTCTACTATGTTACATATTAATACATAAGAAT TCAAGGCATTAAATAGAGTTATAATTGATTAGAGAAGAAGCCTTTTAGCTTATTGGCTTTATGGATGTTATAAGAAACGA GGTGGATCAGGATACTACTGAGACAACTTTCTCCAAGGTGTGTTATTTGATGAAGTCTGGGCCTGGAGGCTGAAAATGGC ACTAATAGAGAATAAACTTGAGTATAATGTCATTAGTTTTTAAATAAATTTTTAAAGGCATTGTAGTTACATTGTTATTA GGATTGTATGTTCATTCTTGAACAGAGAGTGACTGAGCAATAGGATAAGGAAGGATCTGAAGTTGTTTTAGAGGATGAAG TGCGAACTCAGACTAATTAATCTCTCTCTATCTGTTTGTATGTTTTATGAGTTCAGGTTGAGATTGGTCATTTGTATTCT GTCTCAAGAACTTTTGGATGCACCGGCTCAAGTGTGCAGGTGATTGCATAAAAGAAATGGAGGGAATTGGGTAATGTATT CAGGATCTCAGCTATGATACCTTAGTAATTATTATGTGGCACATCTGAGCTATTCTTAGCAATTCTTATGATAAGATAGA CATGTTCCCTTGCTATGTTGAATATGTATTTATATAGTGTGATGCCAATCTATTCGTTTATTCCAAAAACTGAAAGTGAA CTTGGTTGTCCTTAGTGTTATAAATATTGTGATGAAATATTTGGAAATTAATAGAATAAAAGGTGGTTGAGTTAATAAAA ATAAAATTGTAGGGTTGTTATGATAAGATAAAGATTGAATGCAATGTAAACATGGTAAGGTAGACATGCCGATAGTTTAT GTCTCAAGATGATGGTTTCAAGAAACTATGATAAACTCGCTTATGTTTCTTTCAGGTTCTCTACCATGATGAATGCATTG ACATAGAAGCACTTATGTTAGATGACTTCAAGACTTGGGACTTTCATGGCTAATGTTGGAAAAACTTGAAGTATTTGAAA TATTAGATTCAGAGTAGTTATTAAATTGCAGGAGTTAGATCACCCATTGTTGTATTTTGGTTTTTTTTTTACTATGAAAA GCTAGGATCATTTAAATTCAGTCATTTTTGTAAGAACCAATGTAATTAGTGTGGTCCATTCATGAATCTCTTTCAATGAA ATTATCCCTGCAGGGTCTTTGTTACATGTTTTCA
CDS sequence (LotjaGi1g1v0064600.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTTCACGCGCTCCATAGCCATGGCGGTTCACTCTACTTCAACGCTTTACCTTGTTCTCTGCTTATCATCCACCGTTTT GCTGCTACTTTCTTCTTCTCATGCACAAGCTCAGTCCCTCAAATACTGTGATAAGAATGCAGACTATGCTGTGAAGGTGA GTGGAGTGGAAATATTACCTGACCCAGTGGTGAGAGGAGTGCCGTTCACCTTTAAGATCGCAGCTTATACTGGTGAACCA ATTCCCAGTGGTGATTTACTATATGAAATTTCATATGCTGGGATAGAAGGAGAACCTGCTACATTTCTCCATGATCTCTG TGAGGAAGCACCTTGTCCTGTTCCTGCAGGCCACTTTAAGCTTGTTCATACCGAATTATTACCCTCGGTTACCCCACCGA TTGGAGACTAA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0064600.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MFTRSIAMAVHSTSTLYLVLCLSSTVLLLLSSSHAQAQSLKYCDKNADYAVKVSGVEILPDPVVRGVPFTFKIAAYTGEP IPSGDLLYEISYAGIEGEPATFLHDLCEEAPCPVPAGHFKLVHTELLPSVTPPIGD
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
---|---|---|---|---|---|---|
SignalP_GRAM_POSITIVE | 1 | 37 | 37 | - | – | |
SignalP_GRAM_NEGATIVE | 1 | 37 | 37 | - | – | |
Phobius | 1 | 17 | 17 | - | – | |
Phobius | 1 | 37 | 37 | - | – | |
SignalP_EUK | 1 | 37 | 37 | - | – | |
PANTHER | 8 | 133 | 126 | 1.6E-51 | ||
PANTHER | 8 | 133 | 126 | 1.6E-51 | – | |
TMHMM | 10 | 32 | 23 | - | – | |
Phobius | 18 | 29 | 12 | - | – | |
Phobius | 30 | 37 | 8 | - | – | |
SUPERFAMILY | 38 | 134 | 97 | 5.6E-13 | ||
Phobius | 38 | 136 | 99 | - | – | |
Pfam | 39 | 133 | 95 | 1.3E-8 | ||
SMART | 40 | 136 | 97 | 0.0094 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi1g1v0064600.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…