Your browser is unable to support new features implemented in HTML5 and CSS3 to render this site as intended. Your experience may suffer from functionality degradation but the site should remain usable. We strongly recommend the latest version of Google Chrome, OS X Safari or Mozilla Firefox. As Safari is bundled with OS X, if you are unable to upgrade to a newer version of OS X, we recommend using an open source browser. Dismiss message
| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0157100 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0157100.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | DNA topoisomerase 2-binding 1; TAIR: AT1G77320.3 transcription coactivator; Swiss-Prot: sp|Q6ZQF0|TOPB1_MOUSE DNA topoisomerase 2-binding protein 1; TrEMBL-Plants: tr|A0A0R0FVP4|A0A0R0FVP4_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0157100 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:29157069..29168949) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ACTATACAAGCTGTGCTTCTTGCCTTCTTCCCAGCAGATACACATCCTAATTCCTAAATCCAAACTCAATTTCCCGCTTT TTCCTCTTTAGCACAACGCGCCGCGACACTTCTTCACTTCACAGTTCACTCCTCTTCTTTTATTCCTCTCATTCCCCCTT TTCAAACAACAAGTGAAGCGACTGCGAAAGCTTCACACGCTGCAAGATGTCGAAGCCAAAGCCATTCCACGGCGCGAACG TCTTCATGTCGCGGAACTTGGTGCCGCCGGAAGTCTTCGACGCGCTTCACGACGCCGTCAAAAACAACGGTGCCGAAATC CACCTCTGCTGCGACCCTTCCCGCAACGGCGCCTCCGATTACCACATCATTTCCTGCAGCAAACATGTAAATTCCTCAAT TCCTCTCTCAATTTCCGCGTTTTCTACCATCATTGTTGTGATTTTTCTTCCTTGGTTTGCAGGAGAAGTTCGATGATCTT AAATCCAAGGGCTGTAAATTGCTAGGTATGTTAATTGATGCTATGGCTTAACAATCTGAGTATCTGATTGATGGTTGAAA TAATGAAATGGTTCTTAATGTTTGTGTTAGGTTTTTGTTTTGGAATTTAATAACCATTTAGTGATACTCTAGTTGCCGAA GGATAACTCGAGTGGTAAGAGATGTGGGACATATGGGTTGGGGAGGGGAAGGTCCAGGGACCAAATCCCCTAGGAGGGAA ATTTGGCCGATCCAAAAAATAAAAAATAAAAAATTCAATGATACTCTATATATGCATTAGTTGTTGTGTTGGTTTCTATA GTGGAAGTTGAAATCAGTGCTGTTCATGAGTTTTTTGTTTCATTTATTTTTTTTCTTATTGGGGCAGGTCCTAGATGTGT TCTTTCTTGTGCTAGAGAACAAAGGCCACTGCCTAAAAAGGGCTTCACTTGTTGCCTTGCTATGGAAGGAGTCAAACTAC TTGCCTCTGGCTTTGATGCCGACGAAAAGGTATTGTGGTTGTTGTCCATGTTTGCGTGTTTCTATATTGAGTTTTTCTTT GGTTGTCTGCGGTAAGGTCGACGAGTACCCTATATGGCTCACTTTTTTTGTCACCATTGTGGTGAAGGGCTAGCTGGCTC TCTCTGGGTTGCATATTTTCTCTTCTGGAGGGTGTAAAGAAAAGGAGGCCGGAGAAAGATGAATAAATATTTATTTCTAG AAGAAATACTTTAGCTTCAATTCAGAGTTATAAGAACCTCTTCTTAAGACATACAACTTCCTATTTTGAATATTGTTACT AATTTAGTTATTATTTAGTGCCATTCATATTTGAGTATTTTTTTTGGTGTTTTTCATTCAACGGATAAAATATTGATATG TTTGTTCCGTTCCTAGTTTTGGCTCTCCTAATCTTGATTAAAATTTTGTTGCGATTTTGCCCAAGTCTAATCGGTTTTCA GTTTTTTTTTTTTTTGTCTTGGTGCCTATTCCTTCACTCATCCCCCTTCTTAATTTTGCTCGGCCTGGCTGTTTTGATGT ATGTGACCCTGCAGGTTAAGATAGAAGAGTTAGTGACTGAAATGGGGGGAATTCTACACACAAAAGCGTCACTGGATTTG AACTTTATCATTGTGAAAAATGTTTTAGCTGCAAAGTACAAGGTTTGTACATGAAGATTTCCATCTTATTCTTAATTATC AAATATGTTTTTTTTGTTATTATTACGGGCAAGTTGGTATTATCTTTCTGTCTTATTATGTTGTATTTTATTCCAATTCC TATTTGGTTCATATGCTACATATTATTTTCTAATTGCTCAATGTATCACATACAAAGATAAAGAACTCCTATTAAATTCA ATTAAAAAGCTAATCTTATTGCTTAAAATTTCTTAAAGGGAGTAACAAAGCTTTTGATATATGGGAGGAACCTCTTGGAC TTGGTCATAGTTGGTGTTAATTGGCACTGTTATTGGCTAGTAATATAGGAAGTACCTTTAAGTTTTTTACCCTCATTGTC ATGTTTATATTTAGGACTGTTTGGTATTATACATGCTTTAATCTCTTTCAGCAATTACATTCAAAGTTAATGTTCTTCAA CCTTTTTTGAGAATCTTCAAATAATAACTGATTGTTTTTCAGATTGGAAGCCTATGTTGGTTCATAGGTTGTTTTATTCT ATGAACACCATAAAATTAGACAAGGATCATAAAAGAATACAACACCAATAGTAAAAACCAAAACTTATTCTTTAGGTGGA GTTAACTACATGGATCAGTTCAGGAAATTTACTAACAATCGAAATTCCAACTAAAACTAGTCAGAGCATATAAATATTAT GCTCTTAAATTATTGTAAATGCAGCTAATTCAATGGCCTCTTAGAGACTTGGTAGAGACATTTATTAGTTGGTCATTCAA GTTGACAAAACTGGTAGCAATGTCACATGATAAGATCTTCATTTAGATCGAACAACAATCCACTTCCTTATGTTTACTCC TTGTTAGAAATATAATATAAAACTATTCATATGCATTCACCTAATAGCTTACATCACTTTATGTGTGGCAGTGGGCTTTG AATATCCTGAAGAAGCCAATAGTTACTTATGAATGGTTAAAGCAATGCTCAGATGAGCATCGTGTTGTTCCTCAAGAGTC ATACAAGGTCCTTCCTTTCTCCGGGTTAAGGATTTGTGTAACTGGAATCCCAGCAGGTTGTAACTTATCTGGCTGCTAGT GTTGGTCATTATAGAATGCTTCTGTGCTGGATGCTAAGTTGCTTGAGTTTTAGCAGATAAGCGCAAAGAGATGGAAAAGC TTATTTTACAAAATGGTGGAAAATACTCTGCGGAACTGACAAAGAATTGCACACATTTGATTTCTAATATATCCTTCTGA ATTTCCAATTAAATGATGTTTTTCCCGTTTTTCATGCAAATATACCTGTAATTTGGAAAGAGGAAAACATGCATCGTTGG TTTTTGGTTACTACTTCAAATGTCAAGATGCGTAAGTGTCTTCATAATATTTCTTTCAGGTCATTTTTATAGTCAGATCA TCAGCTTCTTGGTAGAGCCTCAAGCCTGCGTTAACAGTTTCTTTATTTTGCACGAAGCAAAGTATCTGCTTTTTGAGGTT GTAATGCTACACATGTATCCTGCTTATTGATAATCAGTTGACAAAAGGAATGACCTATTGCCTATTAGAGAGCATCCAGT GTTTCTCTTATCATTATATTGAAACCACACCTCCCCTCATATTAACAAATTCTGTAGACATTTTGAGTTTAAACAAGTGA GAACTGAGGTTCATTTTGACAAGACTATGGCACTACCTGCTTTGATGCTTTGGTCCTTGGTATTATACTATTATTCAACT ATTTGTTTTTTTGTTAATCTTAATTGCTCAGAGTGAATGACACATTATTTATATATTTTTTCGAACAGTCAGCAATCAAT TTTCTCATTGCTTTTTTATTTCTACTCTTGTTGGCAAAATTGAAGTTCATATCTTGTTTCACAGTAGCTGTATTCATGAA CCTGTTAAGGAGATATGTTCCAGTATATGAGATTTTATAAGTTAATTTTTTATTTTACTTGTCTCAGTGTCCCCTATTGC ATTGCTTTAGTACTTAAATAACCTACTTCACTTACAAACTGTGTAAAAGTTCGAAAGTATGTTCCTTATTTGCTGTGCAT TAGATCCTCTATGACTAAGTAATTCAGTATTTAATCTCAAAGATCTGTTATTGTGGTTTCAACATGGTGTATATTGGTGT TCTTAACTGTTCTTACGCTCCTGAAGGCGACAAATATAAGGTGGCTAAACGTTGGGGCCACATCTGTATAGTGACTAGTA AATGGTTCGATCAATCTATTGCTCGAAGAGGTAACATCTATGCTTTAATAACTTATGTTGCAATACCTTGCAGGTTTTGA ACTAAACAATAGGACTCCACTTCTTAGAATATTAGTCTTATTATGGTGTTTAAGTCTTATAACGTGAAGAGTTATTGGGC TGGGCTTATACTACTGAACTTGTAATTGAATCAGATTCCATTTTGGTCCTTTAGAGATATGTGCAACATGGCATTGGTTC TCCATTCATCAGCAATATAAAGTTGGTCGCTTGATGATAATTAACGTCATTGTTTATGTTAAGAACCAGCAAATTTGATA TTGCGTATATCTTTGACCAATTGGATATTTGTAAATGGAGGAGCAATGTGATGTTGCATATCCTTGGAGGATTAAATATG AAAGGGAGGAGTTTAAGGTCAGTGTTTTGTATCAGTAAACAATTATTCAGAGTCCTGCTATTAAAAATTCTTTTTTTTTT TATCCTTTACATCTCATCTCATCTCAACCTCACCTATCTGACTCCAGTTTTTATTTATTTGAATTTTTTGAATGGACAGC ATGTCTAAATGAGGAGTCTTACCCTGTTCAAAGTGGGTCTATATCTTCACTTAAAGTAACTAGGGACTTCACAGTGCAAC ATAGCCAAGAGAGGGATTTTGGGAACTCACAATCTGTGGCAACCTCAAGAGCTATGGATTCAAATATGCCAGTCTTTTCT GGTGCTGAGTCTATGGATCTAGAAGCTAAACAGTCAGAACATATGTCCTCTTCTTTAAATGCTCCTTTATTTGTTAAAGA GGCAGATCCTGAAGCACCTCCATTACATACCAGTAATGAATTGAACTTTGATGGTGCTGTTGCGAATGATTCTGAATCTG ATGATAATGACCTGTACTTATCAGACTGCAGAATATTACTTGTTGGTTTTGAAGCTTCTGAAATGCGGAAATTAGTTAAT ATGGTGCGTAAAGGTGGAGGATCCCGATATATGTCTTTTAATGACAAGCTGACACACATAGTTGTTGGGAATCCTACTGA AATGTAAGTTTATTCTGACATTATGAAAATTTATGGGTACATATAATTTCTGAGTTTCTTGAATTTGTATTAAATTATTA CCAGTATCAATGTTGGCAAATCTTATTCCTTATCTATAATTTATGATTGATCTTCACATGCATTTGTGTTATTCAAGGGA AAAGAAGGATGTAAGGAGCCTTGCTGCTTTGGGTGTCATTCATGTTGTTAAAACCTCATGGCTTGAAGATTGTGACCGTG AAAAGAAGGAGGTCACTGTTCTTCAGAGACACATCGCAAATGATACACTTCTTCCCAAAGGTCTGTTATTATGATGTTCA CGTTTGTGGTCTGTGTCTATTCTTAGTCATGTTCATGCTGCAGAATGCTTTGGTTAATCTATTAGATTTTTCTTAAGTAG TTTGTGAATATGCTTCTATTGAATTCTTGATATTTTATTTGTTCTCTGATTTCCTAAACTCAGCTAGCACAGCAAAAGGA GCAGTAACACGGATCACGTCCATTAATCAAGGTAAAAGCTCTGGCTTTCATCAAAGCTTGCAGACTGATCAGGTAGTGAA TATTATGGAATCTAGAGTAGTAGTGCCAGAATGTTCAAAGAAAAGCAAAGAAGAGAAACCAGATATGGGTATAAGTGCTC TCACATCAAGTAAAGCAAAGGGCAAAACTATGTCGCAAAATCAACCTCCTGATAATAAATTGAAGGTACAAAAGATGACG CAACACGACTCTAGTGTTCTACACGTGAAGACAACAAATGTTTTCAGAGGGAAAACATTTTGTTTCTCAAATCTATTTCC TGAAGAAAGGGTAAGCTATTTGGATATCTATAACTATAAAGATGGATATAACATACTTGTGCACTAGAATTGAGTTGCAA TGTGAGGTATCAATACAATAGAACTTTGAAAGATTGTAGTGGGAGAACCGGATTAAAGAATCTTGGATGTTGTACTTCGA GAAATATATCTGGAAAGATACACTTGAACTATTCATTTGGTGAACTTTAGGATTGACGTAGGCTTTAAGAATCTTGGTGC AGCTTATCCCAGAGTTGATAAGCATGCCGACAATAAATCTTCTTTGTTAAAGTCGGACTTGAAATTGAAAATTACAGCCA AGAAAGAAAAAAGTGCATCATGCCTCTCGTAATCTAGGTATTCTTCATTGACTTTAACTGTTGAGAAGTCCCGCATCGAC TAGAGATATGGCCAAAATAGGACTTATAAGGGTAGAGAAACCATCACCCGCGATAGTGGTGTCGCTCTTATTGGCGACGG ACTTGACGGAGATCCAGTGTTAGCCATGAGCTCTGAGAACTAAACTTTTGGTACCATGTAGAAGTTCAAGAGAGAAGATA GAAAATGTAGAACTGATTGTATTAATGATGAAAGGAGTCCAGCTACAAAATTATTTAGTGATCTTAATCAGTTGAGCTTA ACAGACTTAGCTGAATGAAACTAACTGTTTACAGTTGTAAGTGACTAACAAAACCTAGGGGTGTTATCAGTTACACCCAA GAGCACTAATCACTATACTCTATTAGTTCAAGACAAAGGAGACTACTTATTGTTCTGAGTTTAAGCCTGGGAGGTTCTTG TGTGTGAGAGCATGTTAGCGATGTAATATAAAAACCATGCACGCATCATTACCTTAGCAACTTAAGGTTTTGAGATAGTT GGATTAAGAAAATTAGAAAAACAAACACAAGATTTCAATTAACAAAAAGAAGTCTCAATTGCTGATATTCACTGTCTCAA AGAAAGTTTATTTTTTTCTGCAATTGTCAAGCATTTGCTAAGGTTACTCAAAATTGGGTCAAGTAATTAGTTTTTGTTTA TCGCGAGTATAATGATATGTCAATATTCCTTTTCTGTTAACTATAAAATGTGCATTGTAGTATTTGTTTACCTTTGTCCC AGTTTGATTGCTATATGTAAACATATTTTTCTATTGCACTGCAAGAGGTACACATATATGTTCAATGATGTTTAATTTAG TTTTGATCTCTTCTGCCAGAGAGCTGAGGTTATTCAATGGATAAGTCAAGGGGGAGGAGAGATAATAAGTGAGAAAACAA GAAAGAGTGTCCACTATACTATTGAGTGTCATGGTGTAACACCCAGGTTGAAAGGTGATCATGAAGGTTGCTATATTTCC AGTCACTGGATACGATCTTGTTTGGAGGTAAGCCTGACTAGTCAAAAATGCAATTTTCCTTTTTCGGGGTTATTTTCAGT ATTCTTATCTTCTGCATTTTCAGGTGCTCATTTGGTTATGGATCTTGATTTATATATTGAATAAACAAGGAAGGAAAAAC ATGCTTTGCCTCAACTGTTTCAAGTTGTTATCTCAAATTTGCAAGTAATAGGAAGTAAATAATGATTGAATCTGATGAAA CTTAGATCCAATTATACATGGTTACAAGAGCTTGGCACTCTGGGTCATGTGATCCATATTTTATATTCCTTCCTATCTAC GGAATGCAGAAATTGAAGTTTAAGATTGTGATGAAACTTTGGAGCTTTTTCTTTGATAGCATGATAGGCTTGCCTTTTTG GACATATACTATATCAATAATGAATTATATATGTATATTATCTTAATTAATAATATTATGATAATATTTTTACATATAGG TTTATTGATCTATTTTACATGTAGGCTTATTTTAGTTAGTCTATTAGCCTATTAGTTCGCTGGCCTAGACTTGCTTTAGT ATATCTTAGCGTGCTGGCCTATTTACAGATAGGCTTGTTGGCCTATTTAAAGGCCTAAGGCTACCCGGTCAGATCCTACT ATAAAAAAATAGGCCAAGCTTAGGTCAGACTTAGACAATAAACTTTTTAAGTAGACCTATTTAGGCAAAGCCTGACCTGG CCTATTCATACCCCTAGGCATATCTTGATTGAATTTCATTATTTTCTATCAAATTCCCTCTGTTCTTTGCAACTTGTAGA CTACATTTTTTGTATGATTTGTCAGTAAGTGTTTACATTTTTTGTATGATTTATCAGTAAGTGTTTATATTCCCGTCGTT GACTTTTATTGTGTTATTTTGAATATATGGGTTCTTTCTCATTCCTTATATTTGCATAAAAATAACTAAGAATGGTCTTC TACGGCATGGCACTCTCCTAATTGATGAACCTAGGATATTCCTTTAGGGCAGAGTACTCCTTTGATTGGGGTGAAAGTCT AGGTAGAGAACCTAAATCGCCTAAGGGGTATTTAATAAAATTATTTATAACCCAAAGCAAAAATCTTGGATAAAATTAGA ATACTAATCAAATATCATAGCTCAATCCTAATTAAATATAAGTCTTAATCCAATATAAAATCCTAGATGAAACCTAATTA AATATAGGATCTTTAAAAATAATAAAATATTTCTCAAGTAAGTAAATTTTAAATTCTAATATAAACATTATAAATTCAAA ACTCTCACATAAAAAAATCCTTTGAAATGGTTCTCCATTTTTCGTCAATAATGCTGTTCATGCTTATTGACTACTTTTGA ATAGTTTTGGCTCTTTTTCAAGAACTTGCTACCTTGATACATACTGAAATTATTTTAAAACCCAACAAAAAGTTCTCCTT CACTGAAACTAAGTTCTGCTTAGTATTATAGAAATGGAGCAGAACTGCAGAATGAATTAAATGATAAAGAGATACTATGA AGAAAAATAATAGTTAGAGCTGATTTGTCAGATTCTGCCCTCCCTGGCCTAAGCCACTTAACCTTCTCCAAAATCATGCT AGCCTCCCCTACTCCCCCCCCCCCCTCCCCCTCCTCCTTATTCATTTTACTCTCATAAATTGCATAAGTTCCATCTCCGA TTCTATGGCCACATGTACTATCTTTAACACTCCCTCCACCGCATCCACTTTCTTTACTTGGACATATTTTCCCCTCTCCC CTTACAAACACCTACCAGCTCGTTTCCCTTTTTCTTTTTTCTTCTCTGGTATAAATAAGTTACAGGCCCATCAGACCATC TGTCTTTTGTCATCAATTGTAAATCATCAATCTAGTCATGATAATTAGTCTTCTGTTGTAAGATAAATTCATGAATGTTG TTCATATTTTATTGCTATTTATCTTTTTTCTTTATGGTGATTGTACGAAACTAATTATTTCAAACACTTGCACCCTTTTC GGAGAAGCTCAGCAAATTTTTTTATTTGTGACTGAAAATTTGTAAATCATTGATGTAGTTATGGTTACACTAATTATGAT GATGATGATGATGTATTCATGATGATTTTTGTTTTTTGTTGTGAGTTGGATTCTTTGCAAATTTGATGTTCCCTTGCATA CTAAATTGTGATTGTGTTTCCTTGTTTTTGTTCAAGGATGGATCCTTGCTGGATGTTGATAGTCACATTCTTTATTCTCC ACTTCCCTGCTGTGTTCCGTTGCCTGGGTTTGAAAGCTTCCGATTTTGTGTTTCACAATATGAGGAGAAAGACAGAATTC TTCTTAGGAACTTGTGTTTTGTTCTAGGAGCTAAATTTGTGGAGAAGTTGACTAAGAAGGTCACCCATTTATTATGTAAA TTCACCAATGGGCCCAAGTACGACGCTGCTTGTAAGTGGGGGATCCGATCAGTTACATCTGAATGGATATTTGAATGTGT GAAACAGGTAATATATTTATACTGGTTGTGTAAAGGGAAAGCTCAAATAATTTCTTTGTCCGTAGGCATTTTGTTAAGAG TACATGTCTACATTCATTTTATGATATTACATACTTTTGATATGGGAAAAAAGTCCTTATCCATAGCAATTTTTTTTTCC AGAATAGAGTTGTTGCCATCGACCAATTTTTACCCAAGGAAGTCACTGCTCAAGACCAAGAGGCAGGAGTTTGCACTGTG AGTCAATTTCCTACCCAGGCTGTTCGAATGATAAGTGACATGCCCTCCCAGTTTCCAAGTCAGTCTCAAAGTTTGGGAAG TGCAGCGAGTAAAAATGTATTTTGTGAAGTTGGGAATCATGGGGCTGATTATACAGCATCAAGTACTTCTAGCAAAAGGG CTAGGCATGATAAGGTGCCTTCTGCTATAAATTCAGGTACTCATGTCAATGACATGAACAATACTGAAGAAAATTTGGTT AAAGATGCAGGGGAGATTTCTCATGCTGTTCCTGATGTTGCTTCTGCAATTGAGGACTTGTTAGAGCAGACAAGTAAGGT AAAAGTGCTGATTTGTTATTGATATGGTATGTAGAGAGATACTTTATAGAATTTGTTTACTCCAGTTTGTCTGAAGTATT TGTGCTTAACTCCGCTCTTTCTCTTACCCCAAAGATACATGATCAGAGGCCTCCAGAGAGTACTGGGTGTGAACGAAGTG TATCCTTAAGTGTGATCATTTTCATTAAGTTGTACTTTATATTATAATATTTTAAATAGTTTTGGTAGGTAGTTGTGACC CTTGATAGTATAATAGATATACTCATCTGATTGTCCAGTCCTTGGTGAAGACAATTCAAATCCTCATACTACCTTTGGGT TATCTAAACACTCGCTAAACAGGTTAGCTTGTTTCGGTTCTCTGTTTAAAATTTATCTTTCTGTTTTCATCTCACATTAT AATTTTCAGCTTCAGCAGCAATTTTTACATGTCTACTAGATGTGTGTAAAACTTCTTTTTTGTCGGTAATGTGTACCTTG ATCAAAAGGTTTAAAGTTTAAACTGTTTTCAATTGCAAGTTAATGATTCATGTTGATGACAATGTAAACAATACTGGAAG CATCATGCATATCTTTTTCATCTTTGTCTAAATCAATACTGACCTTATGTTCTTAGAAGTTTCAGAAAAGATGACAAGGG TGAGGCATCTGAAGACAGAAGAAGAGCAGGAATATATGATGGCTTTAGTGAAACACAAACAGACTCTCAGGTTACGTTTA AGTTCAGCAAATACTTAGTCTATCTCATGGGAACAAGATATAGATACCTTATGCGCAGACTGTTGACTAAATGACAAGTC AAAGTATACTGGGTGCATGTCATTTCACTTTTTTCATAACCTTATCCTGATTACAAGTTCTTTATACTTATCATGCAGGT TGTTAGTTATGAAGAAGATTTGTCAGGAAGGCAAATGCTTATAGAGAGAGTCCGAATTCGAAGTAGCATGCCCTCAAGTA CCATGAAGGAAGATTTCAGTTGAGCAGTTTCCTTATTTGATCATGATGGTATAGCTGAGCTTACAAGCTAAGGCATAAGA ATCTGCCATGCTTCATAATCAGCATATGATAAAAATAAATTCAATTCTATTTGTTATACCTATATGTTTGAAGTTTTTGT TTTTGATTTGAGAAGCGGCACTCCTAGTTCTCTAGAATTAGTTTGAAAAGTGTAAAGAAAATGGCAGGGGTGTTGTGTTT CAAGTGATTATTTTTGTAACTAGCAAATAGAAACTAGAGCCAGGGAAAAAGAAAAGAGTGGTTATTGAATCACGCCTACC TAGTGCCAATCTAACGGATTGTCAAGTAACTTAAGAACAGCTCTCTTTGTTGTTGTTATTTTAGTGAGCCAAGTTTCATG AATGAGGTTGTCTAAATGACCCATGATAAAGTTTGGGTTAAATAACCCATCATTAAATCACATTTGAGATAAATGAGTTG TAAATAAATTAATAAATAAAATATAGAAATTCCAACTCACTTATTTCCAATATGATTGGATGATGGGTTATTTAACCCAA ACTTTATCATGGGTCATTTAGACAATCACTTCATGAATTAGCAATTTCTGTTGGAATGGCTGTTCGGATTAGATAAGAAT GCTTTTCAGTAATCTGAAATCACTACATTTATGGTGAATGGTGATATCTAATGGCTTTTCATTAAGAACCATTGATTACG CTATCTTTTATTGACGTTGAGGGTGTCAAGAATCAACTTATCTCAAGGATTTAAACATTAATGAGGCCAGCTGAAGAGTG GCAATTTTTTTATGAGATGGCAGAGATCAAACTGATGAGAT
CDS sequence (LotjaGi1g1v0157100.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTCGAAGCCAAAGCCATTCCACGGCGCGAACGTCTTCATGTCGCGGAACTTGGTGCCGCCGGAAGTCTTCGACGCGCT TCACGACGCCGTCAAAAACAACGGTGCCGAAATCCACCTCTGCTGCGACCCTTCCCGCAACGGCGCCTCCGATTACCACA TCATTTCCTGCAGCAAACATGAGAAGTTCGATGATCTTAAATCCAAGGGCTGTAAATTGCTAGGTCCTAGATGTGTTCTT TCTTGTGCTAGAGAACAAAGGCCACTGCCTAAAAAGGGCTTCACTTGTTGCCTTGCTATGGAAGGAGTCAAACTACTTGC CTCTGGCTTTGATGCCGACGAAAAGGTTAAGATAGAAGAGTTAGTGACTGAAATGGGGGGAATTCTACACACAAAAGCGT CACTGGATTTGAACTTTATCATTGTGAAAAATGTTTTAGCTGCAAAGTACAAGTGGGCTTTGAATATCCTGAAGAAGCCA ATAGTTACTTATGAATGGTTAAAGCAATGCTCAGATGAGCATCGTGTTGTTCCTCAAGAGTCATACAAGGTCCTTCCTTT CTCCGGGTTAAGGATTTGTGTAACTGGAATCCCAGCAGATAAGCGCAAAGAGATGGAAAAGCTTATTTTACAAAATGGTG GAAAATACTCTGCGGAACTGACAAAGAATTGCACACATTTGATTTCTAATATATCCTTCTGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0157100.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MSKPKPFHGANVFMSRNLVPPEVFDALHDAVKNNGAEIHLCCDPSRNGASDYHIISCSKHEKFDDLKSKGCKLLGPRCVL SCAREQRPLPKKGFTCCLAMEGVKLLASGFDADEKVKIEELVTEMGGILHTKASLDLNFIIVKNVLAAKYKWALNILKKP IVTYEWLKQCSDEHRVVPQESYKVLPFSGLRICVTGIPADKRKEMEKLILQNGGKYSAELTKNCTHLISNISF
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| SMART | 4 | 86 | 83 | 180.0 | ||
| PANTHER | 14 | 230 | 217 | 1.9E-73 | – | |
| Gene3D | 31 | 94 | 64 | 1.8E-7 | ||
| SUPERFAMILY | 59 | 183 | 125 | 5.48E-20 | ||
| SMART | 97 | 174 | 78 | 5.7E-4 | ||
| Gene3D | 98 | 183 | 86 | 4.9E-17 | ||
| ProSiteProfiles | 100 | 184 | 85 | 15.482 | ||
| CDD | 103 | 170 | 68 | 3.43477E-9 | – | |
| Pfam | 105 | 170 | 66 | 1.2E-6 | ||
| ProSiteProfiles | 182 | 233 | 52 | 11.921 | ||
| Gene3D | 184 | 232 | 49 | 6.0E-14 | ||
| SMART | 184 | 233 | 50 | 78.0 | ||
| SUPERFAMILY | 186 | 230 | 45 | 3.66E-12 | ||
| CDD | 186 | 230 | 45 | 1.37406E-19 | – | |
| Pfam | 190 | 230 | 41 | 1.1E-12 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi1g1v0157100.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…