Your browser is unable to support new features implemented in HTML5 and CSS3 to render this site as intended. Your experience may suffer from functionality degradation but the site should remain usable. We strongly recommend the latest version of Google Chrome, OS X Safari or Mozilla Firefox. As Safari is bundled with OS X, if you are unable to upgrade to a newer version of OS X, we recommend using an open source browser. Dismiss message
Field | Value |
---|---|
Gene ID | LotjaGi1g1v0617400 |
Transcript ID | LotjaGi1g1v0617400.8 |
Related isoforms 10 | |
Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
Description | Cystinosin like; TAIR: AT5G40670.1 PQ-loop repeat family protein / transmembrane family protein; Swiss-Prot: sp|P57758|CTNS_ARATH Cystinosin homolog; TrEMBL-Plants: tr|I3T3G0|I3T3G0_LOTJA Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0617400 |
Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:116401585..116417873) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AAAGAAGCTATGTCATCATCTTGGAATTCAGAACCACTCCATGTTTCCTATGAAGCTCTGGGCTGGTTTGCTTTTGTTTG CTGGTCCATCAGTTTCTACCCACAAGTCATCTTAAACTTTCGAAGGAAAAGGTACCAACCCAAAAAGCAATATTTTATAT TATCATCATGTGATTCTCTCTACAAATTAATTAATTTCTAAATGATCTTGCTTTTTGTTTTTTGGTTATAGTGTGGTGGG GCTGAACTTTGATTTCATAGTGCTGAATCTGACCAAGCACACAGCCTATCTCATATACAATGCATCTTTGTACTTCAGCC CTGCCATTCAGAAACAGTACAGAGAGAAATATGGAGAGAAACAGGTTTGTTACGTTCTTGTTATTAGTACTGCTTTCCTA TTAGAAGCTAAATTGATGACTCAATTTCCTCTCTGTTTTAGATTAAAAATTGCTGATAATGTTAATGGTCCATGTTGAAC AAGGCACAATTTAGTATTAATGATATCAATTGATTTTTAAAAAATTCGCTTCTTTTTACCCCTCATTGAATCACCATGTG ATGTGATATATCTGCATTTCAGAAGATTTTAGTGGGTTTTTTTTTGGCTTAATAGTGAATTTCCACGTTAAAACTCCAAA ACATGTTGAAGTAGATTTTGGGTGCAGAGTTGATTTTGGATTTTAGTTAATTTGAAGAGGTTACTCATTGTACGAGTGGA AGCAAAACTAAACATGCATGTTGAGAAGTCCCGCATCAATTAGAGATGTAGCCAAAATAGTTGTTATAAAGGATAGACCA ACACTCTATTCCAATAGTTAAATGTTAGCAGAGTCTAACTTTAATTCTATATTGATTATTTCAGATGATACCTGTGGCGG CTAATGATGTTGCTTTCTCAATCCATGCCGTTCTTTTGACAGCAATTTCCCTGTTCCAGATTGCAATCTATGATGTTAGT GTTGTATTCCTTTTCATTGAGTTTTAAAATTTTCTTTGGAGGAATTTATGATACTCATCATGACAATGGTTATATTTTCG ACCGTGCAGCGTGGAAGTCAGAAAATCTCAAAAATCGCTTATGGGATCCTCCTTGTTGCGTGGTCGGTCGCTGCAGTGTG TTTCTTTATAGCCTTGCACAACCATCATTGGCTCTGGCTGCTCTCAATCTTCACGTATGTTGTCTGTTTTCATTTGTTAG TTAACTTTCCTGTTATGTATGATGGTATTTTAGAATTTCTTTCTGACTTGTGTTGAAACTAATCAACTTGCAGTGCAATC CAAATCTCTATGACGGTTATCAAATATATTCCCCAGGTTAGGATCAATTCAAATTTGTATAAATTCCTTATAATTTCTGT ATCCCCTATGTTTTTATTAATGCCTGTAATTCAGTTTGATTTCTGAGATATTATTTAACTGTTTTGTGAATTTTGAGATG CTTGTGCATAATCTGAATGGACTATTTTCCGAAGAATCAAAAAAATAATCTGAATGGACTTGAGGATTGTTTTCTATGTT TTCCTGGTCATAAAGTGAATGAAATTTCTTTTCCCTAAAGTTATGTTACTCATCTATCTTAACTCGTGTTGTTGAAAATA TTATAGGCAGTGATGAACTTCATGAGAAAAAGCACAGATGGATGGAGCATTGGCAACATTCTACTAGACTTTTCAGGAGG ATTAGGAAACTATTTACAAATGGCAATGCTATCAATAGATCAAGGTGTGTCACTATGATATACATTACTGAGCAATCTCC TTGTCTGAGATTAAAGTTTGAACTGACATAATTTTGAAATTTTCATCTTTGATTTTCAGGTTCTTGGGTGAACTTCTCTG GAAATATTGGAAAACTACTCATATCCCTGGTATATATCATACTTTTTCACTGTCAATCAACCCTCACCTTCTTTAAAATT GTATTCTGATTCCACAATTTTTCATTCCTTTTGTAAGAGAAAATGATTTTTTCTATAAAAATGCTACAAGCCTACAACTC AAGTTTATGAAATGCTTAAGCTCATATAACATTGCTAATATGCTAATTAACCATTGCAGATATCTGTATTCTTTGACATC CTCTTCATGATCCAACACTATCTACTATATCCTGCTTCAAAACGCAAATCAGAGACATCTCCTGACCTAGATAATCCCAA GTCTTCCAATAGGCAATTGTCTGATAATGTCTAGGATGTAACTTGTTTTACAATACTTCAAGGAATGAACTATTTCTAGC TATTTGCAATTTTTCCTATTGGGAGAAAATTAGATAGATATATATCCAACCCTTAAGTTGTAAATGCTATCATAGTCCAA TTACATTGAAGCAGCATCAAAGTCTTTAGTGTCCATTTGTTCTGTAAAATTTGATCCTCTATAGCCAATTTCTCTTTATC TCTTCTCCATCAGATATTTGAGCTATTAATTATATATCCGAGCTTTTTTTTGACGACTAGATATAAAATGAATGACTCTC TTACACTCTTTTTAACATATTCATTTCATTTTTTTAAACTTATGTGAGTTTCATTAAATTTTGAGTCTATTTTTTATCCA ATAAATTACATCGATCTATTTTTCTAACGGAATTACAGATCATCTTACTCCTAATTTCATGATATAGCAAACATTTTTTT TCACATGTATCTTTCATGGGAGGCAATCAATATGAGACGTTGCTTAAGAAAAATTAAATATGTACTCCCTCCGTTCCTAA ATAACTGACATTATTTCTAGCTAAATTTTGTTTTTAATTATCTGCCACTTTACAAAGTTCAAGAGAGCATTAATTATACT TTACCAATTGTACCCTTCATCTATTTATTGGTGGTAGAAAAGTTGAAAAGTAAGAATTAATATGAGAGATGAAGGGTATA GTAGGAAGTTAGATTGTAATTTTAATAAAACAAGAACATTAATTGTTATTTCTTAATACTTGTGCAACAACCTTAAAGTG TCAGTTATTTAGGAACAAAGGAGTATCATTTTAATCAACCATCTGTTAGTATAATATTCTAAGTAGGTGTAGTTTTAAAC TGAAAAGACCAAGATTAATTTGTTGTCAAAACATAAATTTAAATAATATTTAATTAAAAATACATATTATTTGATATTAC CATTGATATTGAAGAAGGATAGATCTTTCCCCGTAGGATAGCTCAAGTGTGGTAGGAGATGAGGGACATATAGATTGGGT GGGAAGGAATCCAGGAATCAATTCCTAGTGGATGCAATTTATATTTTAAATGTACAAAAAAAAATATATTGAAGAAGATG GATCTGTTGACCGGTTTATTTGAAAGCAAAAACGGTAGATTTTTACTGCGTGCAAAATATGGTGATGACGTTTCTAGGAG GCATACTTCCAATTGGTGGAAGGATCTCAATTTTGTGTGCTTTGGCAGTAGGGAGGGTAAATGGTATGAAGAGGGTGTTC GTCGTAAGGTAGGGGATGGAGGTGATGTTAATTTCTGGTATGATAAATGGCTTGGGGATGTTTCTTTGTGCTGTTTGTTT AGGCCATTATACCAAGCTTCTGCCCAGCAGAATCAAAAAGTCAAGGATATGGGTGTTTGGAATGTAGCAGGGTGGTCATG GAATTTTAGTTGGAATTCCCCTTTGGGTTTGGAACAGGAACAAATGCTAGTAGATCTGCAACAGCTGATACGTCATTTTG CTCCCAAACCAGGTTGATATATTGACTCTTGGAAGTGGGCACCGGACCAGTTTGGAGTTTACTCAGTAAAGTCTGCTTAT ATGTTTCTACTTAGAAATGTTTGTGTCCAAGGGATAATATTTTCAGATTATTGTGGTCTCTCAAAGCACCGTCGAATGCG ATAGCATTAGCTTGGAAGGTGTTGATTAATAGGGTCCAAACTAAGGTGAACTTGAACCAAAAGGGGTATTGATTTAAGTA GTGCATGTCCTTTATGCTCAACATCTGATGAGAGTACCGATCACCTTTTCTTCTCTTGTCCAATGGTGTGGAAGGTTTGG TCGAGGATCTCTGCATGGTTTGGCGTTTATTCTGTCCTCCCAACAGATAGTTATGGCCACTTTCTACAACATTTGGGAGT CATGGGATCTTTAAAGCATAGAACAGGGGGCTGGGTCGTGTGGCTTGCTGCTATAGTATGTATCTGGCAAGGGAGAAATT CTGCAGTATTTAGAAATATGCAATTTGATGTTTGTGCAGTTTTTGATTTGGTTCAGTTTAAAGCTTGGAGTTGGCTTAAG GCTAAGGTTCGCAGCTTTGACTACTCCCCGTTTGAATGGATCTCAAATCCTCAAGAGTGTCTCAAGGGAATGTGATGGGG CTTTTTTATCCAAGGTTGTGCTGATACAGTAGTCTTTCTGATTTATTTGTTGGTTGTTGGGTGTTTTACAGGGAGCCAGC CAGGCAATCAATTTTCATCTTTATTGGGTGGTAGCATCTTATGTCTCGTGTCTGTAGTTATTTTGGGGTACTAGCTTTCT ATATTTTTGTGCTGTTAGTATAGTATGATGAGACTTAGTTATCCATTTGCAGTTCTATTCTGTTTAGTGAATAGTCTCTC TTCTTTTCTTAGCTTTTTTCTCCTCCTCTTTGTATTTTGGGTTGGGCACCCCTTATGCTCCCTTAATATATTCTTTGGCT TATAAAAAAAAATATAAAACCTTAGAGTGCCGGTCAAAAACATGTTGAAATGGCTATTATTTACAGTACAAAGCCATGAT ACTATATGTACTATTGCTACAAGATATCTAGGAGTACCATGATCATTAGATATTACAACATAGGCTTAATTGCACATTTG CTCCCTCATCTTTCACAATTGTGCGAAGTCACTCCCTCATGTTTAAAATGAGCAGATTCTCTCCCTCATGTTTCAATTTG TGCAGCCGTTAGCTTCCCATCCAATTTCTAACGGAGTTGCTATTTTCACCTCTTCCTTTTACTAACCACACCCCTCAATC AGAAATAAAAATAAAGAAAAAAATAAAAGAAATAAGTTAAAAACAGAAAACAATATTTTTATAAAAGAAGAAAAAAACTA AATTCATCTTCATCTCCTCCCCATGATCTTCATCTTCTTCATGGTAAAAAAACCCAGAAAAATAAAACTTTAAAATAAAA CCCCACTCTTCCATCAAAATCTAACAAGTCACAATCCCAAATTCCGACAAGTCATCACATTGCTCAGATTTTCATCTTCA TCCATGAAGCAAGGAGAGTAACAAGATTTTCGGTTTTGCTGGCTGAAGAAGATGAAATTTGGGGTGGGTAGATGGTGGTG GTGTGTGGGTTTGTAGGTTGCGAGGTGGGTTGGGATGGGTTTCGGTTTTGCTGGCTGAAGAAGATGAGATTTGGGGTGGG TTGGTGGTGGTGGTGCGTGGGTTTTCTTTTCCCCTTTCTACTGGATTTTGGTGGTGCGTGGATTGGTTTCTGTTTTGATT GTATGTTATATCTTTTGTTTTTTTTAAAAGTGGGTTTAAATTGCTTTTATCAAGATTTATTGGGTTTATGATTTGAGGAT TTTTGGATGGTGTTGTTTGCTACTTTTTATGAAGATGAGAAGATGATAGAAGAATGATGAAGATTTTAAAGATAGAGAAA GAAGATGAATAAATCTGGAAAAAAAAAATTGAGGTATGCATTTTTTGGATTGAAGAACTTTGGATTTCTGGATTTTTTTT AAAAAAGATGAAGATGATGATGATGGAAGAAGATGAAGTTGTGTATGAATATTTATGGATTTTCAGAAATAGTTAGTTTT TGAAGATAGAAATTTATAATTTAGTGTAGGTGGTGCAGATAGTATAAAGGGAGGGTGAAAATAGCAACTGTCGTTAGTAA TTGGATAAAAAACTAACGGAGAGATCAAATTTTCACAAATTAAAACATGAGGGAGAGAATCTGCTCATTTTAAACATAGG GGAGGGACTTCGCACAATGGTAAAAGATGAGGGAGCAAATGTGTAATTAAGCCTACAACATATTATCATAGTTATAAAAC TCGGACCGAACCGGCCGGTTCGACCGGTTGAACCGGGAACCGGACCCCTTACCGGTTCGAGTCATCAATAAGATCGGACA AGCAATCAAACCGGTATAAACCGGTTTGGACCGGCCGGTTCAGGGGGTAAACCGGCCGAGTCGGCCGGTTTTTTGATGGA CCGGTCAGTCTTTTTATTTATTTATTTATTTCTGATTTTGCCTTTTTTTGTCAAAACTGTTTTTAATGGTCAAACTGTAA TTAATTTACATTCAATGTTAATTCTTTGGTCAAATGATATTCAATTGAGAATTATTTAAAAAAATTGTCATAGCTAGGAC TTGAACACAGGACCTAGAGGGAGGAAAGCTAATCTAAATTTCCACTACACCACTTTGCTTCTTGTTAGGAAGAATGCATA TTATTTTATATATATGATATACTATGGTTATATTTTAAATTATTATAATTTTTTAATATAAACCGAGTCAAGCAATCGAA CCAATGACCCAGTGGTTGAACCATTGACTCATTGACCCAGTGCCTCGACCGAGTCGATCACCGGTATAACACTGCATATT ATGATAAGAAGTTTCAAAAGTTAAAAGACATATATTTGTATCTCAAGAGAATGTATCCTCATGATCCCCCTCAGCAATTG TTTCCGGCCACTTCCTCCATATGGCTGAACTCCCAGAAATGGGTGGGTCTCTGGTCCTCGTGGTAATACTCCCTAGGTGT CCCAAGCTTCACTCCATATACTTCATCGCGTGGCTCACCCCCATGAGTTGTAATTCCATGGACCATTAATACTTATAGTT GACCGTAAATACTACCTTAAAGTGACATTTTTTTTTTTCATTTTACAACTATTTTATCTAAATTATTTGTTAATAAATTT TTTTGAAAGAAATAAATAAATTTATTTTAGGCAAAAGTTCAATATTTTACCTAAAAAGTGAATGTTAACTGGGTAGTAGG GGTAGTAATAACTGTTAAGAAAAAAAGTATTTATTTTTTATGATTTAGTCCTTTCTTATTAAATTTATGAGTAACTAAAT AAATTTATGATTTGATCCACTTGAGGTATCTTTCGGAGACATAAATATATTATACAATGATTAGTATTTTTACATTTATC AATTATTATATTATAAAAATCTAAATATTGAAATAATTTTAATTTGGGATGAAGTTAAAAAAGATTAGAAAATTATTATC TTATCTTATTAGGTTCTAACCACATCTCTCCATGATGATTAATTTTACATATAATAGATATAATATATGATAAGATAAGA TATAAGATTACATTACTATATCATACTAGCACAACAAATAATTTTATTTTTTTGTGTGCACAACAAATAAAGATATGATT ATATTATCTTACCATATCTTTTTATCCTGCAAAAACAAATCCTAAAATTAAAATAATAAGTAGTTGTTCTTCTCCCTTTT TCGGTTGAACTGTGTAAATGACACATAACATCTCTAGCAGGTTGAGGAGTGTGGCATAGAGACCGGGACATTGGCTAAAT TCACAATAGGGTTTGTATCTCCGTCCGTGAATGCGAATTGACTTTACTTTGGAAATTAAACACCGATCTTTAATGAGCAC AGCCTAATTATAGATCATACAAATGTTCCGATCGATTTTAGGAGTTACACATGAATAGTAAACTCAAACATGCTCCTTGG TCACAAATCCTGTCTCCATACACTCTCAGATTCATAATCCTAGAATAAACGGGTTTCTTTAAATTTAACGCCGATCCACG TTTGAGTCAACATGACACAAAATTAGATTGATGTGTTGGAATGTGTTACAACCTGGTAACTAATCACACTCCATTTTCTT TTGAACAGAGGCTATATATATTGGTATTGGTAATAGAGGTTCAAGAATCACATTTACGTGTGGGACAAAACTTCGACACT AGAAGAAAATATTGGGGGTCCACAACTCAATATACATTGAATTTGTTGGTTAATTTCTTCTACTTGAAAGTGAGGGAAAA AATCTGAGAAAGAAGCTATGTCATCATCTTGGAATTCAGAACCACTCCATGTTTCCTATGAAGCTCTGGGATGGTTTGCT TTTGTTTGCTGGTCCATCAGTTTCTACCCACAAGTCATCTTGAACTTTCGAAGGAAAAGGTACCAGCCCAAAAAGCAATA TTTTATATTATCATCATGTGATTTTCTCTACAAATTAATTAATCTTATAAATTATCTTGCTTTTCTTTTAGGCTTTCTTT TTATTTGGTTTTCTTTTGTGTTATAGTGTGGTGGGGCTGAACTTTGATTTCATAGTGCTGAATCTGACCAAGCACACAGC CTATCTCATATACAATGCATCTTTGTACTTCAGCTCTACCATTCAGAAACAGTATAGAGAAAAATACGGAGAGAAAGAGG TTTGTTCTTGTTATTAGTACTGATATGTCTGTTTTCCTTTTGGAAGCTAAATTGATGACTCAATTTCCTCTCTGTTTTAG ATTAAAAATTGCTGATAATGTTAATGGACAATGTTGAACAAGGCACAATTTAGTATTAATGATATCAATTTAGTTACTCT TTGTATGAGTGGAAGCAAAAGTGCAAAACTAAACATTCATGTCGAGAAGTCTCATATTGACTAGAGATATGATACGGCCA AAATAGTTCTTATAAAGGATGTATTAACCCTCCATCTCAATCAAGTTTTGGGGTAGCGTTAGGCCTAACCCAAATTGTAA TAGTGAGTCTAGCTTCTAAACGTTCAGAATTGATTCGGAACCTCTAATTGTCGATCTAAACACTGGTAGTTAAATGTTAG CAGAGATCTAACTTCTTTTCTTTATTGATTATTTCAGATGATACCTGTGGCAGCAAATGATGTTGCTTTCTCAATCCATG CTGTTCTTTTGACAGCAATTTCCTTGTTCCAGATTGCAATCTATGATGTTAGTGCTGTGTTCCTTTTCATTGAGTTTTTA TACAATGTTCTTTGGATTAATGTATGATATTCATCATGAAAGTGGATATATTTTCGGATTGTGCAGCGTGGAAGTCAGAA AATCTCTAAAGTTGCTTATGGGATCCTCCTTGTTGCGTGGTCGACCGCTGCAGTGTGTTTCTTTATAGCCTTGCACAACC ATCATTGGCTCTGGCTGCTCTCAATCTTCACGTATGTTGTGTGTTTTCATTTGTTACAAGTTAACTTCCTGTTGTGTATG ATGGTATTTTAGAATTTCTTTCTGACTTGTGTTGAAACTAATCAACTTGCAGTGCTATCCAAATCTCTATGACGGTTATC AAATATATTCCACAGGTTAGGATCAATTCAAATTTGTATAAATTCCTTTTTAATTTCTGTATCCCTATGTTTCTATTGAT GCCTGTAATGTTCAATTTGATTGCTGAGATTTTTATTAACTGTTTGAACTAAGTAGCCTATAAAAATGTGCTAGTGCTAT CATCAATGAACCTTTCTTTGAAATGCATGTGCATAATCTGAAGAAGAGCTACTTACTGACTTTTCTTTGATGTAGTGCTT GTTTTGATACACGATGGGAAACCATAGTGAAACCAAAATCACGAAGGACATAAGCAACTTCACTTAGCTTTCGCGGCTGT CCACCATGATTTTGGTCTCATCGTGGTTCTCACCTTGTATTCAGACATGCACATAACAATAGAGGATTGTTTTATGTTTC CTTGGTCAAAAGTGGACAAAATTTCTTTTCCCTAAAGTTATGTTACTCATCCATCTTAACACATTGTGTTGTGAATGTAG GCAGTGATGAACTTCATGAGAAAAAGCACAGATGGATGGAGCATTGGCAACATTCTACTAGACTTTTCAGGAGGGTTAGG AAACTATTTACAAATGGCAGTGCAATCAATAGATCAAGGTCTGTCACTGTCATAGACATTACTAGGCAATCTTCTTGTCT GAGTTTAAAGATTGAACTGACATAATTTTGAAATTTTCATCTTTGATTTTCAGGTTCTTGGGTGAACTTCTATGGAAACA TTGGAAAACTACTCATATCCCTGGTACGAATCATACTTCAATTTTTCTATATCAATCAGTACTCACCTTCTTTTAAGTTT TTATTCTGATCCACTATTTTTCCTTCCTTTTATTAGAGAATAAAATGAATTTCTTGGATAAAAATGCTACATGCCTAGTT GCCTACAATTCAAGTTTATAAACAGGGTCTTGGATTGAAAATCAAATGTTTAAGCTCATATAACATTGCTAACTGATGGA ATAAATCAACCATTGCAGGTATCTGTATTCTTTGACATCCTCTTCATGATCCAACACTATCTGCTATATCCTGCTTCAAA ACGCAAATCAAAGACATCTCCTGACCTTGATAATCCCAAGTCTTCAAATAGGCAACTGTCTGATAATGTTTAGGATGTAA CTTTTTTTTAATACTTCAAGGAATGAAATTTTCTAGCTATTTGCAAATTATCCTATTGGGAGAAAAATAGATAGAATATA TATATATCTTATTAATTAATCTGTGAAGTAGGCATATCCCGATTAGCTTTTCTCCAGTTATTAGATGAACAGATTAAAGG TTTCCCATGAGAAGAACATTTAAGTCATTTAAAATGTAAACTTGTTACTCCAATTTTAAACCAGTTTTAAGCAATAAGGC TGTCACGCGATCACGCCCATTGCCTGTGACTACCATGAACGACAGCTTTTGAAGATTAATTTGGGGAATGAATGTCTTGG TTTTGTGTTTATTGGATATTAGTGCTTATTGGTTCTATGTTCACGCTTGAAGATTCAATACTATTAGCCTTTGCCCTTTG GTGAAACTTGCAGAAATCATATCCAATGTCACATAGAGGATTAAGAAATGGGGCGCTAAAAGAAAATGGCTAGAGTCATT AACAAGGGAAGAAGGTCACGTGACTCACTAATCTGAACATATTACATCCTAGATTAAATGAGATCAATGGTGGAAAATTA GTGTAAGAGTGTAAGATTTATAAGAGTGTAAATTTAGCCCTGCTCTTGAAACTTATGTCAGTTTCATTAAATTGTCAGTC CTTTTTTATCCAGTAAATTACATGGATCTTACTCCTAATTTCATGAGAGCAAAATATATATTTTCACAGCACATTTATCT TTCACGGGAGCCAATCGGTATGAATCATTACTTAAGAAAAATCAAATATGGATCGTTTTAATCAACCACGTGTTAGTATA ATATTCTAAGTAGTTTTGAACTGAAAAGACCAAGATTAATTTGTTTTCAAAACATAAATCTAAATAATATTTAATTTTCA AAAAAATATTAAATTAAAAATAGGGTTAATCTTCAAATTAGTCATTGTATTTGTGTCGCCGTCTAAAGTAGATCTCTCGT CGGAAAAGTTATTGAAAATGATCGCACTTGTTATAAATTGTTTGGGGCAAGTCATCGTCGGAATCCGGAGCTCCGACGAG AGATGATTTGGCTAGCCGACATGGAATGAAAAAAATTAAAATATTTTACATGTCAGTTTTATTAATGTAATTAACAAAAT TAAACCCTAATTAACTAACTAACCCTAATCTAATTAACAAAATAAGTTTCCCCCCAAATTGTCTCCAAAATCCCCCTAGA ATTAACTCAAATTCCAAATCAGAACACCCTCAAATTTGAACCCTAATCGTTTTCCATCTTCAATCATCTTTCCTGAACCT CCATCGACATCATCTTCACCCCCAATTTTCATCATCTCATTAATTATTATCTTATTGGGGTCTAACCCGCCTCTCTTTGA GGATTAATTTTACATATAATGTACATAATGTAGGATAAGAGATAAAGTTATACGCTACAAGCACAACAAATAAGATATTA TTATTCTGTTATCTTACTTTATCTTTTTATTCTATGCATCAAAGAACCCAAAATTAAAACAATAAGTAGTTGTTATTTTC CCTTTATGGGTTCAACTGTATATATGACACATACCATCTCTAGCAGGTAGAGGAGTGTGGTATATAGAGAACAAGAAATT TTCATTTTAAAACTATTTTATCTAAATTATTTATTAATGAATTTATTTTATTGTTAATTTTAGTTCTTAATATTTGTCAT TAAAGTCAATTTTTAAGTTTATAATTTTTTTTATTTAATGTTTGGTAGTTTTTTTTACGGTCTAATTAATGTAGGTAGTT AAATAGTTTTTTTTCTCGTTACAATACAATTTTTCCATGTTTTTAATTTTATTATTTAATATATTTATTACAAACCAATT TTTTTTCTTAATGTATTTTGATAGAAAGGTAAAGAATTGTTATTACTTAATGTATTTAATTCAAAAATTCAAGATTTTAC ATATATATATTTTGATGATACGTAAAATTTAAAGTTAACTGGGGCAGCAGTAGTAATTGATAAGAAAAAAGTTATTCCTT TTGAGTTAAAAAAATATTCATTTTTTATGAATTAGTCGTTTTTTATTAAATTTATGAATAAATAAATAATTTTAACTTAG TAGCATTAATATATTATAATAATTAGTATTTTTATATTTATAAATTAGTATATTATTAATTATAAAAATCTATATATTGG AATAATTTTAATTTGGGATGAAGTTAAAAAGGGAATAGAAAATTGCTATTTTATCTTATTAGATTCTAACCACGCCTCTC CATGATGATTTTTTTTTGACGGAAAATTATCGGAAGAATATCCAAGAGGATACATGATTGAATACATGGAGGAACACATT GAAACCAAGACTCATCTCCATGATCCAGAGAATATTTTGCAGCACATCAGCTGATTTATTTGCTTGTCTAAAAACATGCA CAAAGGAAACAAAACTAAAACTAGAAACTAATAACTTTTTAAAATTCAGCTGCTACAAGCCCCAATTACGTGTTACTGGA CTTTGCCATTGGTTTGCTCTTTGATGACCAATTTACTATCTGATTCAACCATTACCTTGCTAAAACCATGTTGCATTGCC AACCGTAGTCCTTCCAATACTCCCATAAGCTCGGCAACAACCACTCCATGATGATTAATTTTACATATAATGGATATAAT ATGATAATATCTTTTTTTTAAAAAAAAAAATAAGAGATAAGATTACATTATTATATCTACTAGCACAATAAAATAAAATA AAAATATGTGTGCACAACAAATAAAGATATGATTGTGTTATCTTACCATATCTTTATATCCCCATAAAACAAATCCTAAA ATTAAAACAATAAGTAGTTGGTTCTTTTCCCTTTTTCGGTTGAACTGTGTACGTATAACATCTCTAGCAGGTTGAGGAGT GTGGTATAGAGAACGAGAAATTAGGTAAATTCACAATAGGGTTTGTACTTTGTATCTCCGTCCGTGAATGCATATTGAAT GCATATTCAACAATAGGTTTGTACTTTGGAAATTAAACACCGTTCTTTAATGAGCACAGCCTAATTATAGATCATACAAA TGTTCCGATTTTAGGAGTAACACATGAATAGTAAACTCAAACATGCTCCTTGGTCACAAATCCTGTCTCCATACACTCTC AGATTCATAATCCTAGAAAAAATGGTTTTCTTTAAATTTAACGCCGATCCACGTTTGAATCAACGTGACACAAAATTAGA TTGCTGTGTTGGAATGTGTTACAACCTGGTAACTAATCACACTCCATTTTCTTTTGAACAGAGGCTATATATATTGGTAT TGGTAATAGAGGTTCAAGAATCACATTTACGTGTGGGACACAACTGTGACACTAAAAGAGAATATTGGGGGTCCACAACT CAATATACATTGAATTTGTTGGTTAATTTCTTCTCCTTGAAAGTGAGGGAAAAAATCTGAGAAAGAAGCTATGTCATCAT CTTGGAATTCAGAACCACTCCATGTTTCCTATGAAGCTCTGGGCTGGTTTGCTTTTGTTTGCTGGTCCATCAGTTTCTAC CCACAAGTCATCTTGAACTTTCGAAGGAAAAGGTACCAACTCAAAAAGCAATATTTTATATTATCATCATGTGATTTTCT CTACAAATTAATTAATCTTATAAATTATCTTGCTTTTCTTTTAGGCTTTCTTTTTATTTGGTTTTCTTTTGTGTTATAGT GTGGTGGGGCTGAACTTTGATTTCATACTGCTGAATCTGACCAAGCACACAGCCTATCTCATATACAATGCATCTTTGTA CTTCAGCTCTACCATTCAGAAACAGTATAGAGAAAAATACGGAGAGAAAGAGGTTTGTTCTTGTTATTAGTACTGATATG TCTGTTTTCCTTTTGGAAGCTAAATTGATGACTCAATTTCCTCTCTGTTTTAGATTAAAAATTGCTGATAATGTTAATGG ACAATGTTGAACAAGCTAGGCACAATTTAGTATTAATGATATCAATTTAGTTACTCTTTGTATGAGTGGAAGCAAAAGTG CAAAACTAAACATTCATGTCGAGAAGTCTCATATTGACTAGGGATATGGTACGGCCAAAATAGTTCTTATAAAAGATGTA TTGACCCTCCATCTCAATCAAGTTTTGGGGTAGCGTTAGGCCAAACCCAAATTGTAATAGTGAGTCTAGCTTCTAAACGT TCAGAATTGATTCGGAACCTCTAGGTGTCGATCTAAACACTGGTAGTTAAATGTTAGCAGAGATCTAACTTCTTTTCTTT ATTGATTATTTCAGATGATACCTGTGGCAGCAAATGATGTTGCTTTCTCAATCCATGCTGTTCTTTTGACAGCAATTTCC TTGTTCCAGATTGCAATCTATGATGTTAGTGCTGTGTTCCTTTTCATTGAGTTTTTATACAATGTTCTTTGGATTAATGT ATGATATTCATCATGAAAGTGGTTATATTTTCGGATTGTGCAGCGTGGAAGTCAGAAAATCTCTAAAATCGCTTATGGGA TCCTCCTTGTTGCGTGGTCGATCGCTGCAGTGTGTTTCTTTATAGCCTTGCACAACCACCATTGGCTCTGGCTGCTCTCA ATCTTCACGTATGTTGTCTGTTTTCATTTGTTAGTTAACTTCCTGTTGTGTATGATGGTATTTTAGAATTTCTTTCTGAC TTGTGTTGAAACTAATCAACTTGCAGTGCTATCCAAATCTCTATGACGGTTATCAAATATATTCCACAGGTTAGGATCAA TTCAAATTTGTATAAATTCCTTTTTAATTTCTGTATCCCTATGTTTCTATTGATGCATCTAATATTCAATTTAATTGCTG AGATTTTTATGAACTGTTTGAACTAGGTAGCCTATAAGAATGTGCTACTGTAAACATCAAAGAATCATATTTTGAAATGC TTGTGCATAATCTGAAGAAGAACTACTAACTGATTTTGCTTTGACGTAGTGTGTGTTTAGATACACGGTGAAAAATCACA ATGAAGTTAAAATCATGTTGAACAGAACATAGAAGTAACTTCTCTTAGCTTTTGCGACTGTCCACCATGATTTTGGCCTC AATGTTGTTTTCACCGTGTATCCAGCACTTAATAATTGAGGATTTTTTTGTGTTTCCTTGGTCAAAAAGTGAATGAAATT TCTTTTCCCTAAAGTTATGTTACTCATCCATCTTAACACATTGTGTTGGGAAAATATTATAGGCAGTGATGAACTTCATG AGAAAAAGCACAGATGGATGGAGCATTGGAAACATTCTACTAGACTTTTCAGGAGGGTTAGGAAACTATTTACAAATGGC AATGCAATCAATAGATCAAGGTCTGTCACTGTCATATACATTAGTAAGCAATCTTCTGAGTTTAAAGTTTGAACTGATGA CATGATTTTGAAATTCTATCTTTGATTTTCAGGCTCTTGGATGAACTTCTACGGAAACATTGGAAAACTACTCATATCCC TGGTATAGATAATACTTTTTCTCTGTTAATCTCCACTCACCTTCTTCAAAATTGTATTCAGAGCCCACAATTTTTCATTC CTTTTGTTAGAGAAAATGAATTTTTTGTATAAAAATACAACAAGCCTACAATTCAAGTTTATCAAATGTTTAAGCTCATA TAGCTAATTTGCTAATTAACCATTGCAGGTATCTGTATTTTTTGACATCCTCTTCATGATCCAACACTATCTGCTATATC CTGCTTCAAAACGCAAATCAGAGACATCTCCTGACCTAGATAATCCCAAGTCTTCCAATAGACAATTGTCTGATAATGTC TAGGTTGTAACTTGTTTTACAATATTTCAAGGAATGAACTATTTCTAGCTATTTGCAATTTTTCCTATTGGGAGAAAATT AGATAGAATATATATCCAACCCTTAAGTTGTAAATGCTATTATAGTCCA
CDS sequence (LotjaGi1g1v0617400.8) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTCATCATCTTGGAATTCAGAACCACTCCATGTTTCCTATGAAGCTCTGGGCTGGTTTGCTTTTGTTTGCTGGTCCAT CAGTTTCTACCCACAAGTCATCTTAAACTTTCGAAGGAAAAGTGTGGTGGGGCTGAACTTTGATTTCATAGTGCTGAATC TGACCAAGCACACAGCCTATCTCATATACAATGCATCTTTGTACTTCAGCTCTACCATTCAGAAACAGTATAGAGAAAAA TACGGAGAGAAAGAGATGATACCTGTGGCAGCAAATGATGTTGCTTTCTCAATCCATGCTGTTCTTTTGACAGCAATTTC CTTGTTCCAGATTGCAATCTATGATCGTGGAAGTCAGAAAATCTCTAAAATCGCTTATGGGATCCTCCTTGTTGCGTGGT CGATCGCTGCAGTGTGTTTCTTTATAGCCTTGCACAACCACCATTGGCTCTGGCTGCTCTCAATCTTCACTGCTATCCAA ATCTCTATGACGGTTATCAAATATATTCCACAGGCAGTGATGAACTTCATGAGAAAAAGCACAGATGGATGGAGCATTGG AAACATTCTACTAGACTTTTCAGGAGGGTTAGGAAACTATTTACAAATGGCAATGCAATCAATAGATCAAGGCTCTTGGA TGAACTTCTACGGAAACATTGGAAAACTACTCATATCCCTGGTATCTGTATTTTTTGACATCCTCTTCATGATCCAACAC TATCTGCTATATCCTGCTTCAAAACGCAAATCAGAGACATCTCCTGACCTAGATAATCCCAAGTCTTCCAATAGACAATT GTCTGATAATGTCTAG
Protein sequence (LotjaGi1g1v0617400.8) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MSSSWNSEPLHVSYEALGWFAFVCWSISFYPQVILNFRRKSVVGLNFDFIVLNLTKHTAYLIYNASLYFSSTIQKQYREK YGEKEMIPVAANDVAFSIHAVLLTAISLFQIAIYDRGSQKISKIAYGILLVAWSIAAVCFFIALHNHHWLWLLSIFTAIQ ISMTVIKYIPQAVMNFMRKSTDGWSIGNILLDFSGGLGNYLQMAMQSIDQGSWMNFYGNIGKLLISLVSVFFDILFMIQH YLLYPASKRKSETSPDLDNPKSSNRQLSDNV
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
---|---|---|---|---|---|---|
Phobius | 1 | 11 | 11 | - | – | |
PANTHER | 3 | 259 | 257 | 8.0E-143 | ||
PANTHER | 3 | 259 | 257 | 8.0E-143 | – | |
Phobius | 12 | 30 | 19 | - | – | |
TIGRFAM | 13 | 244 | 232 | 1.7E-70 | ||
Pfam | 15 | 70 | 56 | 2.4E-19 | ||
TMHMM | 15 | 37 | 23 | - | – | |
SMART | 27 | 58 | 32 | 3.5E-7 | ||
Phobius | 31 | 41 | 11 | - | – | |
Phobius | 42 | 63 | 22 | - | – | |
TMHMM | 50 | 72 | 23 | - | – | |
Phobius | 64 | 93 | 30 | - | – | |
TMHMM | 87 | 109 | 23 | - | – | |
Phobius | 94 | 112 | 19 | - | – | |
Phobius | 113 | 123 | 11 | - | – | |
TMHMM | 122 | 144 | 23 | - | – | |
Phobius | 124 | 143 | 20 | - | – | |
Phobius | 144 | 148 | 5 | - | – | |
TMHMM | 148 | 170 | 23 | - | – | |
Phobius | 149 | 169 | 21 | - | – | |
Pfam | 153 | 208 | 56 | 7.2E-14 | ||
SMART | 166 | 197 | 32 | 4.9E-8 | ||
Phobius | 170 | 180 | 11 | - | – | |
Phobius | 181 | 203 | 23 | - | – | |
TMHMM | 183 | 205 | 23 | - | – | |
Phobius | 204 | 222 | 19 | - | – | |
TMHMM | 220 | 242 | 23 | - | – | |
Phobius | 223 | 244 | 22 | - | – | |
Phobius | 245 | 271 | 27 | - | – | |
MobiDBLite | 250 | 271 | 22 | - | – | |
MobiDBLite | 257 | 271 | 15 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi1g1v0617400.8, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…