Your browser is unable to support new features implemented in HTML5 and CSS3 to render this site as intended. Your experience may suffer from functionality degradation but the site should remain usable. We strongly recommend the latest version of Google Chrome, OS X Safari or Mozilla Firefox. As Safari is bundled with OS X, if you are unable to upgrade to a newer version of OS X, we recommend using an open source browser. Dismiss message
| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0777700 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0777700.1 |
| Related isoforms 4 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | WD repeat-containing protein-like protein; TAIR: AT3G05090.1 Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q05B17|WDR48_XENTR WD repeat-containing protein 48; TrEMBL-Plants: tr|A0A151TXJ1|A0A151TXJ1_CAJCA WD repeat-containing protein 48; Found in the gene: LotjaGi1g1v0777700 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:134979244..134990553) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AGAATAAATTTGGACACCCATGTCCGATACCCTTCACTTTCTCTCTCCTCCATGTTAATCTGCAAAATCACTTTCTCTCT CCATAGTTGAAACTTCAGCTTCTTCAGAACAACAAAACCAAGCAGAAAAAAAGTGCTTCAAGTTCATCACTGATCATCAC GGTTAGTGCTTCACCTTTCGCTTCCACTGTTCCATCTTCTCCTTCTGCAGCTTGATTTCGTTTCTTCAGATTGTTCACTC TTTCCGATTCTAGACAAGATTTTCTTTTCTTTTTGCATCTTGTACTAAGCTGGTCTTAGCTCACAGCGTTGAACTCATGA TCGAGCTGGTTAATCTGTGTGAAAGTTTGTGCTTTTTTGTTTTTCTGACATTTTTTCCCTTCTACTTCTGTATCGGGTAT GATTTGGGGTATTGGGTAGCTTCATCTGGTTCAGCCTGCTATGTCTTATAGGTTTATGTTTGGTGATTCATTAGAAAAAT TTGGCTTTTTGGTTTAATTCAAACTGGGTCCTGGTGGTTTTGATATGCAATTGCCAATTGTGCTTTGACTGGTTGTTCAG AATCTCAGGTAGTATAGAAAATATGGTTTTGGATTTCAGCTGGATACTGAGGTTACTATGGTATGGTTGCAAGAGATGAA CTAGTTGATGAAGGGATTGGAATTGTAGATTTTGGTGACATTAGTTGGGATATTGGGATTTGAGAAGACCATGGTAGAAA ATAAATGATACTACTACTTAGTACTTAGCTACTGATACAAAGATTTATCAGTGGTAGTTTATTTAATCTAAGAGCTTCAG GTTATGCGGTTTGGCGGGTTTTCCTAATGGCTAATGCATGTCTGAATATGGCTTCAGTTGAGGTGTTTGGATTTGTCTTT ATTGCATCCCTTGAAATGTTTCTAAGTAGGTTTCTTTAATTGGAAACTTGGAATTGTTTTATTTCATTTTTACTCTTGGG AATGCTATTTATTTATGTGTGCTGTAATAGATTTTGCAATGCACCGCGTGGGTAGTGCGGGTAACACAAGCAATTCAACT CGCCCTCGTAAGGAGAAGAGATTTACCTATGTGTTGAATGATTCTGATGGTACAAAGGTGAACTTGCGATTTCTTTATAT TAAGAACAGTCAAGTTTCTTGCTTGCTTATTGTAGTGGCATTTTTTATCCCTATGAATTTTTTATCTTGATATTGTGCCT CTAAAGCTGTTAACTAGTTTAGACTAATTGGGTTGTTGTTAAATAAACGCATGTAAATTTGCCTTTGAAACTGCAGTTTC CCCTCCTTGAATGATTAGTGACATCAAATTTGTCCTCAAATGATAATATTTGGTCATTGCATCACATCAATTTAGTCATA GTAAACAGTATGTGGCTGATTTTGATGTTAAAAACCTATAATTTGAATACAAATTTGATGTAATAATCTTTCGACGGCAA AGTTGATGTTATAATAAATTTTACAAGACCAAAATGGAAATATAAATTTTAGCATTATTCGCCTCTCAACAGTAGAGACA TGGACCCTTTTGTGGGTTGCATATTTCCCCTTCATTTTTTTAATATTTATCCAATAGTTTCGTTCATGGTTCGTATAGTA CTTGACTTCTTTCTGCTAGATACTTAGAATTTTGCTTTGAATATTGAATGTTTTCTTACTTCTTAGTTGCATTTTTCTAC CTTCATTTGATAGTTGGCTCTTTTCTGCAGCATTGTGCAGGCATAAATTGTTTGGCTCTACTTACATCTGCGGCATCTGA TGGGTCTGATTATCTCTTCACTGGGAGCCGTGATGGAAGGCTAAAACGATGGGCGCTGGCTGAGGATGCAGTGACATGCT CTGCTACCTTTGAATCTCATGTGGATTGGGTAATCTTTATATTTATTTTTTCTTTTTAATTTTTCTTCCCTTCCAATCTT AAGATGACATTATTTTAAGAACATCTGGAGTCTGGAGCACAGAAAGACTTTATTGACATGTGCATAGCAAAATAAGATAC AGTTGGTTAGATAAATGTTATTTTTATTCTTGCAGGTTAATGATGCTGTTCTTGTTGGTGATAATACACTCGTTTCTTGT TCTTCAGATACAACTCTTAAGGTTTATTGATTGCTAAATTTTATTTGATCTGATCAGTCCTTGCTACTGCAATGGTACCA GTACTAAAATGATTTACTCCTTTTGTTTTCGCTGGGTTGCTGTGTGTTAATGCTAGACATGGAATGCCTTCTCTGTTGGA TCTTGTACCAGGACGCTCCGCCAACACTCTGATTACGTTACTTGTCTTGCAGCAGCAGGAAAAAATGTAATGTTCTTCAG GCTTCATAGTTTTCTTAGGTGTATCAAGAAAGAGTTCCTTATATTGTTTTTGCATGAAACACATGTAATCTGATGGATAT TTTGGTTGAATTATAACTTTGTATTGTATATTGTCAAATCCATTCTCTGATCCTTTAATAGTGTTATGCATTTTAGTGCA ATATTGTTGCCTCTGGTGGCCTTGGTGGGGAGGTTTTTATATGGGATCTCGAAGGTGCGCTTGCTCCAGTCTCTAAGTGC AATGATGCTGCGGTTGATGAATCCTCAAATGGGATCAATGGTTCTGGCAACTCACTACCTTTGTCAAACATACGTACTAT CAGCTCAAGCAATAGTATATCCGTGCACACTACTCCAACTCAGGGGTACATTCCAATTGCTGCCAAAGGACATAAGGAGT CTGTTTATGCATTGGCAATGAATGAAGGTGGAACAGTTCTTGTCTCTGGTGGCACAGAAAAGGTACAAATGGAATATGCT CTGACAGTCCGACTTATTGAGCCTTCTTTACTTTTGGAATGTTAAGACGAGGTTATTGTCTGAAGTATAGTAGCTTGAAT TTTGTTGGGTTGATTATGGGAGACCTTGACAATTTCTTCTTTTATTTATTTATTTCTTTGGGGGATTTCTAGGTTATTCG TGTCTGGGACCCAAGATCAGGATCAAAGACTTTAAAGCTAAGAGGGCATGCAGATAACATCAGGGCCCTGCTTCTGGATT CTACTGGCAGGTTGTAGAGTGGTTATCTAAGTTTAGCTGCAAATTTTCAGTTGACATTTATATTTTGAAGTTAGTAACTT GCTTTGTCCTTTACTTATTTGTAATTTTTTATTTTCATAAACTCTCTCTCTCTCACACACACACACACAGAAGATCTTTA TTTTATGCATTTATATGTTTTCCTACAACATATAGATAACTATGCTCATGAGCGACGTATAATACTTTAATTGGCTGTTA CAGTGTACTGCTATTTAATAGTCAGTATGGTGAATGAAATGCTGTTGGGTTTTGTTTGCTACTGTAGGCTGCCATGCCTC CTTTCATTGGATAGAATTGCTAGCGCAAATTAAGTATTTTTTTTATAAATAACATGTCTGCTATAATATTTGTAACATTC ATTACTGCAGGTATTGTTTATCAGGATCTTCAGACTCTATGATAAGGTAATGATTCATATGGCGTGCAAGTATTTCTTTT GATTTTTTGTGTGGTTGAGTTTTAACCTGTCCAATTTTCCTCATAGGCTTTGGGATATAGGTCAGCAAAGATGTTTGCAT ACTTATGCTGTTCATACAGATTCTGTTTGGGCCCTTGCCAGCACCCCAACATTTAGTCATGTTTATAGCGGTGGGAGAGA CTTTTCAGTGAGTTCGACTTTTCATTAAAATAGCATTCATGCTATTTTTCCATTACCGTAACTCTAATATATGTGACATC TCATTCTATTTAACTAGTGAAGCTCATATTCTAATGCCTAATACTTTTATACCTTAAGTTATACTTGACAGACTTGCAAA CAAGAGAGAGTAGTTTACTTTGCACAGGCGAGCACCCTATTCGTCAATTGGCTTTGCATGATGATAGCATATGGGTTGCA TCAACGGATTCTTCAGTTCATAAATGGCCTGCTGAAGGATCCAACCCTCAAAAGATTTTCCAAAGAGGCAATTCTTTTTT AGCTGGAAACTTGTCATTTTCAAGAGCAAGGGTGTCACTAGAAGGATCTACCCCTGTATGTTACTTTTATTTGAGAAACA AACCGTCCATATTAATTTTCTATTATTTCATCTTCAAAATGTTGTGTTCCTCTTGGAAGTAATAATACCTGTTTCATATG TAAATGGAGAATGCTAGTGAGTGCCCTAGGAGCACTTGTTAAAGAAACAATATTCAAGAAAATGAAAATTATCTTGAAAA TGAAAAAAAAAATCAAATTTAACTCTTTTAAAGGTCCTAAATAGATTTATACATGAAGAATGGTAGTTTACATATCCCAT TTCCCATATTATTGCTTTGTGAATATGAAGGAGTTTGTATTCTAAGCAAGTTTTGTTAAGAAAAGAAAAAATCGTTTTGG TTCTTTCTGTTTTGGGGAACTAATATTGTCCATTTTGTTTACAAATTGTCAATAGGTTCCTATATATAAAGAACCTGCCT TAACTATTGTTGGCAACTCTGCAATTGTGCAACATGAAGTTTTAAATAATAAAAGACATGTGCTGACGAAGGTAATAATG GTGTTTTTTTCATGCCATTAGGCCATCCGTGCTTATACTGTCTGTTAATAATCTTTGTCTGTTATGACTCTTGGTGTAGG ATACATCTGGTTCAGTGAAGTTGTGGGAGATTACTAAAGGTGTTGTGGTTAAAGATTATGGAAAGGTGACAACCGGTTGC ATTTTCATTTGGTAACTTACGTTGCGATCCGTTTGCTTATGAAGGAGCTTTGCTTTAATGAATGATATTTGCAAATTTCA ACTATATTTGATAGGGCTATTTTGTTGGTTCATAATAGCTCATGCTTTGCTTTCGAATTATTTAGGTTTCATTTAAGGAG AAAAAGGAAGAGCTATTTGAGATGGTATGATTATTGAATTTTATTTGTAATTATACTTTACATTTTTTAAGAAAAATAAT GATTTAAAATAGTTTTTTAGTTCTGGCTGGATTTTATTTTTCTTTCGGTGCTGCTTCAGGTAAGCATTCCCGCATGGTTC ACAGTGGATACCAGGCTTGGAAGTTTGTCAGTCCATTTGGACACTCCCCAATGCTTTTCTGCGGAGATGTACTCAGTAGA TCTTAACATTGCAGGCAAGGCTGAAGATGATAAGGTAATGGCTTCATTGTTGTAAGCAATTTACCTACCCTTATCTTAAA TTCCTTATTGTATTGATTTTGCTCCTAGTTTTTAGTATGCTGTAACAGTTAGTGTCAACTTTATGCGACTATTTGGTTGT TATTATTGACTATAATGAGTGTTTTCAGGTTTATTTAATTGTTAGCATTCAGCTTCATGTACGTGCCATTTATTATATTC AGTGGCATGAAACCATCTTCCTATCTTAGTCTCTATTGTTTCTCAATCAGAAATGTTTCCTCTCATGAGAGGATCAGTAT CACACACATGGAGTATTTTAAGTCATATTTCTGTTGAACTGGCATTAGCAGTGTTATATTATACACTTCTGTAGTTTCAA CTTTCAAGAAATGAGATTCATGCATATAATGGAAGTATGAGAATGTTTTCAGTAGTGTACTGTCAACAATCCAACTTAAT GCTTGTTATTCTGCAGGTTAATTTGGGTCGAGAAACCCTTAAAGGACTATTGGTTCATTGGTTGAGAAAACGAAAGCAAA GAATGGGATCCCCAGCTCCAGCTAATGGGGAATTATTATCTGGGAAGGATATTGCCTCTAGAAGTATTATCCATTCAAAA GTTGAGGTTGATGGTAGTTCTGAGAGTGATGCTATGGTCTATCCTCCATTTGAATTCTCAGTTACTTCCCCTCCTTCCAT TGTTACTGAGAGCACTCATGGAGCTCCGTGGAGAAAAAAGATTACTGATTTAGATGGAACAGAGGATGAGAAAGACTTCC CCTGGTGGTGTCTGGACTGTGTTTTGAATAATCGGTTAACTTCTAGAGAAAATACGAAGTAATTTTTTGCCTTCCTCTTC ATTTTTCCCTCCCTAAATGGTTGCATTGATGCGTGGTGGTTTTTGAAAGGAAGAAACCACACTCATGAAAATTTCAATAC TTTTTCAATGAAGCACAATTGTTGCTGAATTCTATGATAGTGATGATCATAGACAATGTTTTGATGATTCATAGTTTCTG TGAGCCTTGTTTTCTGAATGTGAATTTGACTCAAGTTATATGGTGGTACTTAACGCTGCTTTTCTAATTGACATCAATTG CTGTGGTTAACTTAGTATATATTGCTCGTCTTTCTATGTGTTGGTCACGGCTATATCTTACTTCTGTAGATATAGACCAA TGGAAATTGTCTATGAAGAAGTATGATAGCATTTTTTAGCATGATTATCATTGGTCTCAGATCAGTTACGAAATGTTCTT TTTTATATAGTTTCTTTTGTGATAACCTCTGCAGGTGCAGTTTCTATTTGCATCCATGTGAAGGCTCTCCAGTCCAGATC CTCACACAAGGGAAGCTAAGTGCCCCACGTATATTAAGAATAAACAAAGTGAGTTTTGATTTTCATATTTATATTAATTG ACAATTCAGAAATATTAATTTTGTTAATAATTTTTACATGTGTCGTTTATTTTGGTCATGCTTTCCAAAAAGGATTAGTA TGTTTTATTTCGAAAATCAGTTTTTTTTTGGGTGTTTGCGTGGACTCTGTAGGCATATTTTCCCCAGTTGATAATACATT TCTGAATGATCAACTTAGCTTTCCTTTTTTGTTGCTTAGGTTATTAATTATGTAGTAGAAAAGATGGTGCTCGATAAACC TTTAGATAACTTACATGCCGATGGTAGTTTTGCCCCTGGACTTGCTGGGTCACAGTCACAGCATCTAGCAGTTGGGGATG GATCTTTCAGATCTGGATTTAAGCCCTGGCAAAAGCTTAAACCTTCTATCGAAATATTGTGCAACAATCAGGCAAGTTCT TTGTTCTCTTACATGCAGTCTTATGACAGTGGATATAAATAGTTTTCTGGATGCTGAAATCTAGCAAGTTCATGCTTTAG TTTTCTCTAGCTGGCTTACTTATCAATTCACGTATATGCTTTCTAGATTCTTTTCCATTCATGCATATACCATTTATGGT CTCCCACTGTGGTGTTTTCTGTATGTCATTGAGTACATCATATATCCTGAAAATTATGTACTTTCGCATTTTAGATCATA AACTTATAGTTGCAACTTTGACTAACTTCTAGAATCATGATGTAGGATGAATTGACAATCTTTTCAGTAGCCTTAAATCT GCTTTAAATATTCTTGGTTTTATTATTCCTAAAATCAGCTCAATGTGCCTTTTACCTATGATTTCAAATGATTGATTGAC AACTGTGCTTCATTTCCAGCAACAAACATGCTTCTTTTAGCACACATTTATAGTCTGATTATTGGATGTGATAAGATGAG GATATAATGAGACTTCTTTAGACTTAAATTCTTCATCTGTTCTGTTGATATGCCTTCGATTATGAAGTTCTGTTCCTGCC TGATGTTGTACGCATCTAGGTGAAGCCTAATGATGGTTATATTGTAGTCTTAAAATTTAGGCTTAAATAAGTTTTTGGTC CCTAACCTTTACCAAATGCTTGGTTTTCGTCTCTCACCGGAGCAAAGGTGGGCTTTAGTCCCTAACCTTTGTCAAAACGT TTGGTTTTCATCCCTCCGGAACTCTGGGTCAACGCCGGAGCTCCGGTGGCTCATGTGGCAATGCCACATGGGATTAATGA GGCCAGGTGTTAATTTTTTTTTTAATTAATAACAAATTAACTCACTAATTAAAAACACTTAACCCACTAATTAAAAACCT CAAAGAAACTAAACACACTTTCTTCATTAGATCTGGAAAAATCTCTTCATCTTCATATGCCCATTCATCCTTAATCCTCC CCCGCTTATAAAAAAAAAAAAATCCTTAATCCTCCCCCTTCATCCCTTTTCTCTGATAACTCTAAATTAAATAATAAAAC CCCACCTTCAAACCTCAATTTCAATCTGTTCATCTTCAAACCCCATTTCATCACATGTTTTGGGTCAATTTTTTCAACCA AAGGGAAAAGCTTCAAGTATCCACCGTCTTCACCATCAACACAGTCCTCCTCCATCTTTTTCATTCTGATCCCAAATGCT TTGAAGGTCACACCTTTCCTCTTCAACCCTTCAAATCCCAACTCAAATGCATCCAAACCCATCAAACCCTTCTAAGCCAT CGTTTCCCCGGAGCTCGCCTCACCAAATCCATAAACAACCAAAGGCCAGATTGTCCCCACCGTGACTCTAACAGATCAAG AACCAGGACGAAGAAATCGAGCAGACCGAGAGCCTGGTTCTCTATTTTCTCTTCTCTGTTCGATTTTCTGGGTTTTTGGT GAAGCTCGATGGTCATGGTGGTGGAACAAGGTGGCTTTAGTGAGAAAGGGGTGACTTTCTGACGGAGGAGGCGTTATGTT GGTGAAGTCGCGTTCTGGAGGGCTGGTGGTTTTGATGTGCGTTTGTAAAAACGCATAAACACAGATCTGTAGCAAAACTT GCCTTCCAGCGAAAGGGATAAATTTGAGCGGTGGGTGTTGGGCGTTGGCGTTTGCACACATCTGTTCGCATACCTCTGTG TAGCTTTTCGTATGATTTGGGGTGGCAAATTCATTGTTGTTCTGTTGAGAATTTTAGGAGAGGGGCCTCTCCACATCTTG ATTCAGTCTGTTTCAATTCAGTTCGCTTGATTCAATTCAGTTCTAGCACATTTTCCATGTATTATGCTTGATTCAATTAT GTTTCAATTGGATTTGGTTGAAGGAAAGGGAAAAATTGGTTTTTGTTTCTTGTTGTTTTTGGATTTCTTGATGCTTCTTT ATTTGTTTCCAGATTTTGTGTTGTTGATTTATTGGAGATTAATATGAAGGAGAATTAGATATTAATGATTTAATTAAAAT TAAGATAAATAAGTTAATATTTTTTTTATTTTTAGAATTTTAAACAATTTTTTAAAAAAAATTAATTAGTTTTTTTGTTA ATTTAAATGAAAAAACAAATTCCACGTCAGCTTATTAATCTCATGTGGCATTGCCACATAGGCCACCGGAGCTCCGGCGT TGACCCAGAGCTCCGGAGAGATGAAAACCAAACGTTTTGGTAAAGGTTAGGGATCAAAAACTTATTTAAGCCTAAAATTT ATCATAGAGTTCCTGTTTGTACTTCCGTTTAATTATTCTTGTGTATGTTCTAATTAAGTTTTTGAACTTATAATGACAGA GCTCTCTTTTTTAGTGAAAGAAAATATTATTGACTAGATGGTGTTTTATTTTATTTACACTGGTCATTTCTTTAAGTAAG GTAGATTTAGTGAACTGTTTTGTTTATTTCCAGGTGTTATCTCCTGAAATGAGCTTAGCCACAGTACGAGCTTATATATG GAAGAAATCAGATGACCTGGTCCTAAATTACAGAGTGGCTCAAGGCAGGTGATCACAAATTGCATATGCATCAGAGGTGG GTAATCTTGAGCTTTGCTTAGCGTTTATAAACTACAATATGATATTGATGCTTTAATGGCTTTCACTCCTTTTGTTTTTG TTTTTTGTTTTTTTTTAATATAGTTTACAGCAAGGAGAAGTTCTTTTTTGGGATAGTATTTCTTTTTTCAATTGATGTAT ATGTCGATAAAAGAAATCTGAGGTGATGAGAGACCTAATCTTTGTCAAACAATCTGCTCTGCTCAAATTGGATGAAATAA TTACTACAAGTTTTACATGTGTGCAAACGGTCATTATTGGTATCACAAATAACTAAAATGTTTTGGATGAATTACTTAAC CATTTTTTTTTTCTTACAATGCTTTAAGTTTTATCAATAAAAGAACAATAATTAGTTTTATTTTCTTTCTATTAAAATAT ATATACTTGATTTATGTTGTCTTAGCATGAGATGCAGACTATATTATGATTTATACTTGCAGGTTTTCTATGCTTGTGTA AAATACCCCCAAGCACCGGTTCTTCTTTTGTTGCGTGCATTGGTTGGTGGCATCGTAAGAATTTTGTAAATTCTGAGCTC TTATTTATCACCAAATTTAGTAACATTCTCTAAACCTGCTTGGATAGTTTTTTTCTTTAGTGGAGAGCTGTTACTGTAAA TTTTGAATATATCTAGCTGGTGTGCATAATCTTCATCTGGCATGATCAAGATTTTTAATCGATTCTGTTGAGAATCACTG GGAGTCATACTGGTATATTGGTTTTTTTTAGGAATCAGGTAGTAAATTTAGAGATGACAACTAAAACATTGTAAATCTGA ATTGTGCGTTAAATACCTGGCCTTTGAAATTCTGTTCTCCAGGCTCCAGGGCATGTTCGCATCCCTCCGGACATTTTCCT TAATAAAATTTGTTCATTGTTAATTGCTATCAATATTGTTATCAAGTTCAAATTAGTCATTTAGTGGAGTTCTCAGCTAA TCCTTTATTTTTATCCTGTATTTTCCCCCCTTTCCTGTGTATGTATATTTGAGTATATTCAATATGCTATCCTAAGATGA GGCACTGTTATTAGGCATTAAAATTTAGTGAAGCTATGACTGTAGTAGTTGTAGCGTTAGCATTATTGGCTTTGAAATTT TTAAGTTAAAACTATACTCATTGTACTAACGGTAAATCTTATGGAAATGGATATTGGATGAAATGAAATTGGGTCATACT TCTGCGAGTCAATATACCAGGTGGTGGTTGTCATATTTCTATTCATTTTTAATCAAGTATTAGCAAGAAACATGCCATGT TCTATTAGTACAAGAATGCGACTGTCATTTCTTAAAAATTTAAAAATGGTGTAGAACTAGCTTTTATATAGTACAGTGTG GATCAATATTTTTTCGTGTGAAAACTCTCTCATGTCAACACTAATATGACCATACTTTTAAGTCAGGTACACCATCCGGT CATTATTATAAGCAAAAGTTGACCACATACATCATTTATTAAATGAATTTAAAAATCTAACTTTTGCTTATAATAGTGAT CGGAGGGTGTATGTTTACAATGAAGCTTGTGTGTGTTCTTATTAAAGTTGCACATGTTCTAAGATGGGAAAACATGATGA AAGCAATAAATGGTAGTTGCTGCCTTAAAATATTAAACCCAACATTCAATTACAAAAATTACAAAACAGCAACAAAGATC CTTCTGAGTGAGAAGCCCACTACCTTCTGAGTGAGAAGCCCACTACCGTCCCTCGAGGAGACCGATTAAAAAAATATGTC TCATTAAAACCTTACCAGAAAAAACTCCTT
CDS sequence (LotjaGi1g1v0777700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGCACCGCGTGGGTAGTGCGGGTAACACAAGCAATTCAACTCGCCCTCGTAAGGAGAAGAGATTTACCTATGTGTTGAA TGATTCTGATGGTACAAAGCATTGTGCAGGCATAAATTGTTTGGCTCTACTTACATCTGCGGCATCTGATGGGTCTGATT ATCTCTTCACTGGGAGCCGTGATGGAAGGCTAAAACGATGGGCGCTGGCTGAGGATGCAGTGACATGCTCTGCTACCTTT GAATCTCATGTGGATTGGGTTAATGATGCTGTTCTTGTTGGTGATAATACACTCGTTTCTTGTTCTTCAGATACAACTCT TAAGACATGGAATGCCTTCTCTGTTGGATCTTGTACCAGGACGCTCCGCCAACACTCTGATTACGTTACTTGTCTTGCAG CAGCAGGAAAAAATTGCAATATTGTTGCCTCTGGTGGCCTTGGTGGGGAGGTTTTTATATGGGATCTCGAAGGTGCGCTT GCTCCAGTCTCTAAGTGCAATGATGCTGCGGTTGATGAATCCTCAAATGGGATCAATGGTTCTGGCAACTCACTACCTTT GTCAAACATACGTACTATCAGCTCAAGCAATAGTATATCCGTGCACACTACTCCAACTCAGGGGTACATTCCAATTGCTG CCAAAGGACATAAGGAGTCTGTTTATGCATTGGCAATGAATGAAGGTGGAACAGTTCTTGTCTCTGGTGGCACAGAAAAG GTTATTCGTGTCTGGGACCCAAGATCAGGATCAAAGACTTTAAAGCTAAGAGGGCATGCAGATAACATCAGGGCCCTGCT TCTGGATTCTACTGGCAGGTATTGTTTATCAGGATCTTCAGACTCTATGATAAGGCTTTGGGATATAGGTCAGCAAAGAT GTTTGCATACTTATGCTGTTCATACAGATTCTGTTTGGGCCCTTGCCAGCACCCCAACATTTAGTCATGTTTATAGCGGT GGGAGAGACTTTTCATTATACTTGACAGACTTGCAAACAAGAGAGAGTAGTTTACTTTGCACAGGCGAGCACCCTATTCG TCAATTGGCTTTGCATGATGATAGCATATGGGTTGCATCAACGGATTCTTCAGTTCATAAATGGCCTGCTGAAGGATCCA ACCCTCAAAAGATTTTCCAAAGAGGCAATTCTTTTTTAGCTGGAAACTTGTCATTTTCAAGAGCAAGGGTGTCACTAGAA GGATCTACCCCTGTTCCTATATATAAAGAACCTGCCTTAACTATTGTTGGCAACTCTGCAATTGTGCAACATGAAGTTTT AAATAATAAAAGACATGTGCTGACGAAGGATACATCTGGTTCAGTGAAGTTGTGGGAGATTACTAAAGGTGTTGTGGTTA AAGATTATGGAAAGGTTTCATTTAAGGAGAAAAAGGAAGAGCTATTTGAGATGGTAAGCATTCCCGCATGGTTCACAGTG GATACCAGGCTTGGAAGTTTGTCAGTCCATTTGGACACTCCCCAATGCTTTTCTGCGGAGATGTACTCAGTAGATCTTAA CATTGCAGGCAAGGCTGAAGATGATAAGGTTAATTTGGGTCGAGAAACCCTTAAAGGACTATTGGTTCATTGGTTGAGAA AACGAAAGCAAAGAATGGGATCCCCAGCTCCAGCTAATGGGGAATTATTATCTGGGAAGGATATTGCCTCTAGAAGTATT ATCCATTCAAAAGTTGAGGTTGATGGTAGTTCTGAGAGTGATGCTATGGTCTATCCTCCATTTGAATTCTCAGTTACTTC CCCTCCTTCCATTGTTACTGAGAGCACTCATGGAGCTCCGTGGAGAAAAAAGATTACTGATTTAGATGGAACAGAGGATG AGAAAGACTTCCCCTGGTGGTGTCTGGACTGTGTTTTGAATAATCGGTTAACTTCTAGAGAAAATACGAAGTGCAGTTTC TATTTGCATCCATGTGAAGGCTCTCCAGTCCAGATCCTCACACAAGGGAAGCTAAGTGCCCCACGTATATTAAGAATAAA CAAAGTTATTAATTATGTAGTAGAAAAGATGGTGCTCGATAAACCTTTAGATAACTTACATGCCGATGGTAGTTTTGCCC CTGGACTTGCTGGGTCACAGTCACAGCATCTAGCAGTTGGGGATGGATCTTTCAGATCTGGATTTAAGCCCTGGCAAAAG CTTAAACCTTCTATCGAAATATTGTGCAACAATCAGGCAAGTTCTTTGTTCTCTTACATGCAGTCTTATGACAGTGGATA TAAATAG
Protein sequence (LotjaGi1g1v0777700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MHRVGSAGNTSNSTRPRKEKRFTYVLNDSDGTKHCAGINCLALLTSAASDGSDYLFTGSRDGRLKRWALAEDAVTCSATF ESHVDWVNDAVLVGDNTLVSCSSDTTLKTWNAFSVGSCTRTLRQHSDYVTCLAAAGKNCNIVASGGLGGEVFIWDLEGAL APVSKCNDAAVDESSNGINGSGNSLPLSNIRTISSSNSISVHTTPTQGYIPIAAKGHKESVYALAMNEGGTVLVSGGTEK VIRVWDPRSGSKTLKLRGHADNIRALLLDSTGRYCLSGSSDSMIRLWDIGQQRCLHTYAVHTDSVWALASTPTFSHVYSG GRDFSLYLTDLQTRESSLLCTGEHPIRQLALHDDSIWVASTDSSVHKWPAEGSNPQKIFQRGNSFLAGNLSFSRARVSLE GSTPVPIYKEPALTIVGNSAIVQHEVLNNKRHVLTKDTSGSVKLWEITKGVVVKDYGKVSFKEKKEELFEMVSIPAWFTV DTRLGSLSVHLDTPQCFSAEMYSVDLNIAGKAEDDKVNLGRETLKGLLVHWLRKRKQRMGSPAPANGELLSGKDIASRSI IHSKVEVDGSSESDAMVYPPFEFSVTSPPSIVTESTHGAPWRKKITDLDGTEDEKDFPWWCLDCVLNNRLTSRENTKCSF YLHPCEGSPVQILTQGKLSAPRILRINKVINYVVEKMVLDKPLDNLHADGSFAPGLAGSQSQHLAVGDGSFRSGFKPWQK LKPSIEILCNNQASSLFSYMQSYDSGYK
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 734 | 734 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 1 | 734 | 734 | 0.0 | – | |
| Gene3D | 13 | 179 | 167 | 7.1E-22 | ||
| SMART | 19 | 68 | 50 | 2.7 | ||
| ProSiteProfiles | 31 | 339 | 309 | 35.541 | ||
| SUPERFAMILY | 34 | 452 | 419 | 2.79E-62 | ||
| CDD | 34 | 368 | 335 | 5.30682E-49 | – | |
| SMART | 73 | 111 | 39 | 9.1E-4 | ||
| ProSitePatterns | 98 | 112 | 15 | - | ||
| PRINTS | 98 | 112 | 15 | 1.6E-5 | ||
| SMART | 115 | 155 | 41 | 1.7E-5 | ||
| Pfam | 116 | 155 | 40 | 0.0051 | ||
| ProSiteProfiles | 122 | 157 | 36 | 8.537 | ||
| SMART | 207 | 246 | 40 | 9.4E-4 | ||
| ProSiteProfiles | 214 | 255 | 42 | 14.418 | ||
| Pfam | 215 | 246 | 32 | 0.012 | ||
| PRINTS | 233 | 247 | 15 | 1.6E-5 | ||
| SMART | 249 | 288 | 40 | 2.3E-6 | ||
| Pfam | 252 | 288 | 37 | 2.3E-4 | ||
| ProSiteProfiles | 256 | 297 | 42 | 14.585 | ||
| PRINTS | 275 | 289 | 15 | 1.6E-5 | ||
| ProSitePatterns | 275 | 289 | 15 | - | ||
| SMART | 291 | 330 | 40 | 3.0E-4 | ||
| Pfam | 293 | 328 | 36 | 0.1 | ||
| SMART | 333 | 369 | 37 | 120.0 | ||
| Pfam | 613 | 732 | 120 | 1.1E-12 | ||
| CDD | 634 | 733 | 100 | 2.70554E-18 | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0777700.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…