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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi2g1v0115800 |
| Transcript ID | LotjaGi2g1v0115800.3 |
| Related isoforms 3 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Type I inositol-1,4,5-trisphosphate 5-phosphatase; TAIR: AT1G71710.1 DNAse I-like superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q8H0Z6|IP5P3_ARATH Type IV inositol polyphosphate 5-phosphatase 3; TrEMBL-Plants: tr|K7MHP0|K7MHP0_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0115800 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:42791855..42808402) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AACCCAATTAAATTCCACGATCACAGCTTCCAAATCTTGAGAACAAAAAGTAGCACATTCTTTCAGCTCCAACTTGTATT TTCTCATCTCTCTATATTTCTTCTTCTTCAAGTATTGCTTCTATATTCATCTTAATTGTCTCATCCATTCTTAACAGAGA TGAAGCAAAAGCCACCACACGATCAACAGGTGCTGTTTTTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGATGGCTTGTTGTT GTTGCTATGTTTAGTGGTGTTATTGGGATTTGTTGATTTTGGGGGAAATGAGGAAAATTGCAGAGAACATGGGCTGAAAT CTGTTGTTTCGGTTGGTCATGCATACAGCTCTTCTGGGCGAGAGTGGTCATGCGCAAATGGCTCAACATGCGGACCAACG AGTCTGATTACAGTGCTGATCCTGAGGATGATGATGATGATGAAAGTGATTCAGACAATGAAGGTGAGTCATGGGTGATT GGTTGTGTTTGTTCATTCTAGTGTGTGTGTTTTTCATTTTGGAAGATTGGGGAAGTGGGATTCTGTGGATTTTGTTAATT TCATTAGAATTGAGAAATTTGAGAATTTAGGTGAATGTCAATTGTAAACTGGTTTGATAAGCCAAAATTGAGATTTTTCT GGGTATTACAGGCTGTGTTTGATTTTCTCTTTTTGTGTTTTGGCTGTTGAAGTCTCACTGTAAGCTTGGTGTGTTATGCA GAGTGGGGAAGACAGTCGCGGTTTATGGTCAACAGAGGTGGTGAAGCTCCACTTGAATCAAATGGTGACTTTTTCCAGAC ATGAAGCTCTAAACTGTTTTACTATGAACTGCAAAGTTTTATTCATTTTCTCTTACATATCTTCAAAGATTGCATAAGGC TTTTCAGTGGATGCCAGAATGTTAGATCTATTTAGTTCTGATACTAGGATTTGTTGTTGCTTACTTGTCAGTTTGGACAA 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CDS sequence (LotjaGi2g1v0115800.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGAAGCAAAAGCCACCACACGATCAACAGAGAACATGGGCTGAAATCTGTTGTTTCGGTTGGTCATGCATACAGCTCTT CTGGGCGAGAGTGGTCATGCGCAAATGGCTCAACATGCGGACCAACGAGTCTGATTACAGTGCTGATCCTGAGGATGATG ATGATGATGAAAGTGATTCAGACAATGAAGAGTGGGGAAGACAGTCGCGGTTTATGGTCAACAGAGGTGGTGAAGCTCCA CTTGAATCAAATGATTTTGTTCCAAGGTTAAGGAGACAAAAGTCATCAACTTATAGATCTCAGTATATAAACACGAAGGA TTTGAGGGTATGTGCTGGAACATGGAATGTTGGAGGTGAACTTCCACCTGATGACCTAGATATTGATGAATGGCTTGGTG TCAGTGAACCAGCTGACATCTATGTCCTCGGTCTTCAAGAGATTGTACCCTTGAATCCTGGTAACATATTTGGTGCAGAA GATACTGGTCCTGTTCAAAAATGGGAGAATATTATTCGGGAAGCACTTGATAGAGTTCGACCTACAGCATCAAGGATAAA ATGCTTCAGTGACCCTCCATCTCCATCAAAATTTAAGCCATCAGATGATATCCCAGATATAGAAGATGAATTATTATTTG AAAGTGATAGTGATGTTGGCGAGGAAATCCATCCTTTGGTTGAAGAACAGACTATTTGTGATGGAGGTACAAATGGATTA ACCACAGGTAAAATCGTGAAAGCCAATTTATTGGCTTCCAATGCCACTGATACTGCCAACTCTCGTATTCCGGTTAACAT TGATTTACGGAGACAGTTTTCTTTTCCAAAGAGGTTTGATAGGCTACAAGTTTCATCAGAAAATATGGATACATCATTTT CCCAACAGACCACTAAATTAACCAGAATGCTAAGTGGGTCTGAAAGAATTGGTTTGAGCTGGCCAGAGCCTCCGCTACAT CTTCTATCCCAGCGTGTTTTGGAGAGACCAACTTCTTTTAAATCAGTCAAATCCTTTAAATCATCGAAGTCATTTAAAAC ATATAGTTCTTTCAAGTCAATTATGGATGAAATACCAGTAATAGGTTTTCTTCCTGAAGTTGATCTTGAAGCTTTAATGA AGCGGAAAAGAAGATCATCATATGTAAGGATTGTGAGCAAGCAGATGGTTGGAATTTTCATCACCGTATGGGTTCGTCGG AGCTTGCGCAAACATATTCAGAATTTAAAGGTTTCAACTGTTGGTGTCGGTCTTATGGGCTATATTGGTAACAAGGGATC AGTATCTGTCAGCATGTCCATATATCAGACGCTTTTTTGTTTTGTATGCAGTCACCTTACATCTGGTGAAAAAGAAGGAG ATGATCTTAAAAGAAATGCTGATGTTCATGAAATTCATCGTAGAACACATTTTCAATCACTCTCTTATATTGGACTTCCC AAAACAATCCTGGATCATGAAAGGATAATTTGGTTGGGTGATCTGAATTACCGAATCAACTTATCAAATGTGGAAACAAG AGCTCTCGTCTCAAAAAAACAGTGGTCAAAATTGATTGAGAAAGACCAGCTTATACGAGAACTCAGAAGTGGTGTATTTG GAGGATGGTCAGAAGGCATATTAAACTTCCCACCAACTTATAAATATGAGGTTAATTCCGATAAGTACTATGGAGATGAT CCCAAGGTTGGGAAGCGTGCACCAGCATGGTGTGATCGTATTCTTTCATATGGCAAGGGGATGAGGTTACTGAGTTACAG AAGGTCTGAGCTCAAACTGTCTGATCACAGACCCGTGAGCGCCACATATGTGGTCGAGGTTGAGACGTTCTCTCCGAGGA AGCTACAGCGAGCCCTGACTTTTACTGATGCGGAGATCGAAAATGAAGCAAATTTAGGTATCTGGAATTAG
Protein sequence (LotjaGi2g1v0115800.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MKQKPPHDQQRTWAEICCFGWSCIQLFWARVVMRKWLNMRTNESDYSADPEDDDDDESDSDNEEWGRQSRFMVNRGGEAP LESNDFVPRLRRQKSSTYRSQYINTKDLRVCAGTWNVGGELPPDDLDIDEWLGVSEPADIYVLGLQEIVPLNPGNIFGAE DTGPVQKWENIIREALDRVRPTASRIKCFSDPPSPSKFKPSDDIPDIEDELLFESDSDVGEEIHPLVEEQTICDGGTNGL TTGKIVKANLLASNATDTANSRIPVNIDLRRQFSFPKRFDRLQVSSENMDTSFSQQTTKLTRMLSGSERIGLSWPEPPLH LLSQRVLERPTSFKSVKSFKSSKSFKTYSSFKSIMDEIPVIGFLPEVDLEALMKRKRRSSYVRIVSKQMVGIFITVWVRR SLRKHIQNLKVSTVGVGLMGYIGNKGSVSVSMSIYQTLFCFVCSHLTSGEKEGDDLKRNADVHEIHRRTHFQSLSYIGLP KTILDHERIIWLGDLNYRINLSNVETRALVSKKQWSKLIEKDQLIRELRSGVFGGWSEGILNFPPTYKYEVNSDKYYGDD PKVGKRAPAWCDRILSYGKGMRLLSYRRSELKLSDHRPVSATYVVEVETFSPRKLQRALTFTDAEIENEANLGIWN
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 11 | 11 | - | – | |
| PANTHER | 7 | 631 | 625 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 7 | 631 | 625 | 0.0 | – | |
| Phobius | 12 | 32 | 21 | - | – | |
| TMHMM | 13 | 32 | 20 | - | – | |
| Phobius | 33 | 380 | 348 | - | – | |
| MobiDBLite | 43 | 65 | 23 | - | – | |
| MobiDBLite | 47 | 62 | 16 | - | – | |
| Gene3D | 86 | 190 | 105 | 1.8E-15 | ||
| SUPERFAMILY | 87 | 624 | 538 | 1.55E-65 | ||
| Pfam | 113 | 596 | 484 | 2.6E-12 | ||
| SMART | 278 | 611 | 334 | 2.7E-53 | ||
| Gene3D | 350 | 632 | 283 | 5.1E-88 | ||
| Phobius | 381 | 398 | 18 | - | – | |
| Phobius | 399 | 636 | 238 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Biological process | Phosphatidylinositol dephosphorylation | The process of removing one or more phosphate groups from a phosphatidylinositol. |
Expression pattern of LotjaGi2g1v0115800.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…