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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi2g1v0141500 |
| Transcript ID | LotjaGi2g1v0141500.3 |
| Related isoforms 3 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Tripeptidyl-peptidase 2; TAIR: AT4G20850.1 tripeptidyl peptidase ii; Swiss-Prot: sp|F4JVN6|TPPII_ARATH Tripeptidyl-peptidase 2; TrEMBL-Plants: tr|V7C4F5|V7C4F5_PHAVU Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0141500 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:51484889..51505042) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATGCCTTGCTCTTCCTTCAGTACTGGCGGCGATAACGGCGGCGATAACAGCGGCAAGAAAAGCGATGGTTCTTCTCTCCG TAATTTCAAGCTGAACGAGTCAACCTTCTTGGCTTCACTCATGCCGAAGAAAGAAATCGCCGCAGATCGATTCATCGACG CTCACCCTACCTACGATGGCCGCGGTGCTCTCATCGCTATCTTCGGTAACTTCCCCTACCCCTTTGACTCCCATTTCTCT GATCATTTTGTTTCTCTTTGAATTGATTTTGACTTATCATGCTTTGTGCTGTGCTTGAATTAATCTACTTATCATGCTTT TTTTGATTGTTTAACTTGATTCCATTGAAGAATTGTATATTTTGCATATGAATAATGGTGTAAAATGAGTTCAGTTGCAA TTCTCTGCTACTAAAATGTTTGTTGGGGTTATAAATCTATTGTTTGAATTCTGATGTGTTATACTGTAATTGCAAGTGAT TTGTGTTGCGAAGTTGTTCAATGATTCGATATGCATGTTTACAGATTCTGGTGTAGACCCGGCTGCGGATGGATTACAGA TTACCTCGGACGGGAAACCGAAAATTCTTGATGTCATTGATTGGTAAAGAAAACTATTTCATTTTGGTCTTTTAGCTGAT GCTTCTTTTGGTGTTTTGACTGGTTTTCGAATAAAGATAAGATATCTTACCTTTTCTTTCTTCAGCACCGGGAGCGGAGA TGTTGATACCTCAAAGGTGGTGAAGGCTGATGCTGATGGTTGTATTAGTGGGGCATCTGGTTAGTCCTATGGAATATTGC GTAGTCTGTTTGTATGATTACAAATAATTATGGTCAGACATTCTTCAATATATTGTAGCATTTGCTCAAGAGGTATTCGG AAAAAGAAACTACACACTCAGCTTGTGATGATGTAGCTCCTTGTTTGCTGCTGAAGCTAGACAATTATTATTATTCTTGA 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AAAAGTTAATTCTTTGTTTATAAATGAATGGTGCACTACTTTCACAATGCACAGTGGTACTTGAGAATTGAGAATAAATT TCAACGGATATCCTTATGAATTGCTCTATTTATTTGTACTTAGCATACTGATTTTGTGTGTTTCCTTTCTTAAGGAATTG TTAGTTTGATTTCTGTTTTAATGTTCTGTTCTTTCTTTCCAATTTACCAAAAAAAGCATACTGATTTTTTTATCATACAT GAAAAAACAAATCCAACATTTATTTACATTAGTAAAAATGAACTATTGGACCATTTTCTAGAATACTAATGTTTCCAATG CTTAATTTCTATCTCACTGTAGAATATCAAGAAAAAGTTTGAGTCAGCTCGAGACCAGTTAGCAGAGGCACTTTACCAGA AGGGGCTTGCGCTGGCAGAGATCGAGTCTTTAAAGGTTAGAGCTTCTATTCTTTTTTTCTCTTCAGCTATCATAATATGA AAACATGCTAAGCAATGTGAAGAACCTGGCAGATGATATTTCAGAAGTCAGTTTCATTTGTCATGTTAGGTTGATAGAGA ACTTCGATCCAAAGTAGCTGTTTAAAGCAGTAGTGCTTGGTCTTGTAAAAATATTCAAAATATCTTGAAGAATAGGATAT CCTTGCAAACTAAGATCAAAATTGAATTATTCTTCTCATGTGCAAACCACGCCTATTATGTATATATAATTTCTTGTAAA TCAGCAGTTGTCGTCGGCATGATATTACCAATATTGTTGCCCACAAGTACTATATACTATAGCTATTGCTATTGAAGTCA ACAGCTTTTCACATTCAGGCTCCTATGGTTATTTTGAACTTACTCATGCATTATACTTCGTGAGAAAATGTCAAAGGAGT CCGTAGTTATTTTTCCATTATGATAATTGTAACATATAGTTATTTTTTCTATCGAATAAAAGTTGGCAGACTTGACTTGG TGTATATTGTCAAAGGACGTAGATAAGTTCTTGGCTTTGGAGGCGGGGACAGGAGGTGCAAGAAAAGATGTGGACAATGA GCAATCTACAGATGATGGCAGCCATCCAGATTCGTTCGAAGAGAATTTTCAAGAACTGAGGAAATGGGTTGATGTAAAGT CACCTAAATATGGAATCCTCTTAGTAACACGCGAGAGGCGTTCTCAAAGGCTTGGGACAGCGTTAAAGGTATTTTCTTTT GCAAGTCATTGCATTGGTTGCTGCATGGATGATAATTGACCAATTTATTAATTACTAACAGTATCATATGACATGCTGGT GTCTATTCAAGTTCAAAGACCGAAAGTTCTCGTTGCTCCTTAATAAGAGATTATTTTTGGATAGTTAAATATTATCTTTG TGGTAAAAACTGACCAAAACATTGAACAACATTTATTCATAGTTTAATGGTCGAAAAGGAGGAATTAATTGTGTTTTCAA TTTTTTTATAATATAAATAAGAAACATAATGAAAATATAATTTTTGTTCATAACAGGTAATATGATTGTATTCAAAGTTT AGTCGATGTAACATTCAAAAGTTGTAACATTATGAATTACATCATGACAATATTTCAAATAAGCACCTGGTTTACACCTG AGTGGTCGGTTTTTCAGTTGAATGCGCCGGTATGATCCAGTCCAGTTTCGTGATTGATAGATAAAGTTGTGTTTATGTGG AAGCTTACTTTATGCTTTTAATGATGATATGTGATGAGGGAAGGGGCATTGATTAGATAAATTACTATGATTCAGGTACT GTGTGACATAATTCAAGATGATGCAGAGCCTGCCAAGAAGAAATTCTATGAACTAAAGCTCTCTTTGCTTGATGAGATTG GATGGACACATTTAGCAACTTATGAGAGACAATGGATGCTTGTGCGTTTCCCTCCAAGCTTGCCCCTTTTCTAG
CDS sequence (LotjaGi2g1v0141500.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGCCTTGCTCTTCCTTCAGTACTGGCGGCGATAACGGCGGCGATAACAGCGGCAAGAAAAGCGATGGTTCTTCTCTCCG TAATTTCAAGCTGAACGAGTCAACCTTCTTGGCTTCACTCATGCCGAAGAAAGAAATCGCCGCAGATCGATTCATCGACG CTCACCCTACCTACGATGGCCGCGGTGCTCTCATCGCTATCTTCGATTCTGGTGTAGACCCGGCTGCGGATGGATTACAG ATTACCTCGGACGGGAAACCGAAAATTCTTGATGTCATTGATTGCACCGGGAGCGGAGATGTTGATACCTCAAAGGTGGT GAAGGCTGATGCTGATGGTTGTATTAGTGGGGCATCTGGGGCATCTCTGGTTATCAATACTTCGTGGAAAAATCCTTCTG GTGAATGGCATGTGGGCTATAAATTGGTTTATGAGCTCTTTACAGAAACATTGACTTCTCGTTTGAAGAAAGAAAGAAAG AAAAAGTGGGATGAGAAAAACCAGGAGGATATTGCAAGGGCTGTTAAACAGCTTAATGATTTTGATAAGCAACACATCAA GGTGGATGATGCGAAACTTAAAAGGGTTCGTGAAGATCTCCAGAATAGGCTTGATCTTCTGAGAAGGCTTTCTGAGAGCT ATGATGATAAAGGGCCAGCTATAGATGCTGTTGTCTGGCATGACGGAGAGGTCTGGAGAGTTGCTCTTGACACACAAAGT CTTGAGGATGATCCTGATTGTGGGAAGCTTGCCAATTTTGTGCCTTTAACTAATTATAGGATTGAGAGGAAGCATGGCGT CTTCAGCAAATTAGATGCTTGTACATTTGTTGTTAATGTGTATAATGATGGAAATGTCTTAAGTGTTGTAACAGACTGTT CTCCCCATGCCACCCATGTTGCCGGTATAGCTAGTGCTTTCCACCCGAAGGAGCCCTCACTGAATGGAGTTGCACCTGGC GCACAATTAATATCTTGCAAAATTGGCGATTCTCGCTTAGGTTCAATGGAAACTGGAACTGGTTTGACTCGGGCACTGAT AGCTGCTGTGGAGCATAAATGCGATCTTATCAACATGAGTTATGGTGAAGCAACATTACTGCCAGACTATGGACGCTTCA TTGACCTAGTGAATGAAGCGGTGAACAAGCACCGTCTGATATTTGTGAGCAGTGCTGGTAATAGTGGGCCAGGATTGAGC ACTGTCGGTGCACCCGGCGGTACAGCTTCGAGTATTATAGGAGTTGGTGCATATGTTTCTCCTGCTATGGCTGCTGGTGC TCATTGTGTTGTTGAACCTCCATCTGAGGGGCTTGAATACACATGGTCGAGCCGAGGACCAACAGCTGATGGAGACCTTG GTGTTTGTATAAGTGCTCCTGGTGGTGCTGTTGCTCCTGTTCCTACATGGACTCTTCAACGACGTATGCTGATGAATGGG ACATCTATGGCATCACCTTCAGCCTGTGGAGGAATAGCATTGCTCATAAGTGCAATGAAGGCTGAAGGAATTGCTGTGAG TCCATATAGTGTGAGGAAGGCTCTTGAGAATACGTCAGTTCCCATAGGTGATTTACCTGAGGATAAGCTATCCACTGGAC AAGGGCTTATGCAAGTTGACAAGGCTTTCGAATATATACAGAAGTGTCAAAATATTCCATGTGTTTGGTATCAAATAAAC ATCAATCAATCGGGAAAAACAAATCCTTCATCAAGGGGCATCTACCTTAGAGAGCCTAGTGCTTGTCGACAATCGACTGA GTGGACAGTGCAAGTTAGTCCCAAATTTCATGAAGATGCCAGCAACTTTGAGGAATTGATTCCATTTGAGGAGTGCATTG AGTTACAATCTACTGGAGAGACCATTGTGAAGGTCCCTGACTATCTATTGCTTACTCATAATGGTCGCACCTTCAATGTA GTTGTAGATCCTTCCAATCTATGTGATGGTCTTCATTATTATGAGGTCTATGGTATTGACTGCAAAGCTCCATGGCGTGG TCCTCTTTTCAGAATTCCAATTACCATAACAAAGGCCAAGGCTGTAACTAACCAGCCTCCACAAGTTTCATTTTCAAATA TGTTATTTCAACCAGGCCATATAGAAAGGAGATACATAGAAGTGCCACATGGTGCGTCTTGGGCTGAAGCAACAATGAAA ACATCAGGATTTGACACAGCTCGAAGATTTTATTTGGACGCTGTTCAGATGTGCCCATTGCAAAGACCTTTGAAATGGGA GAGTGTTGCAACGTTTCCTTCCCCTGCTTCCAAAAGCTTTGCCTTTAGGGTAGTAAGTGGTCAGACATTGGAATTAGTCA TTGCTCAGTTTTGGTCAAGCGGCATAGGAAGTCATGATACTGCCAGTGTGGATTTTGAGGTTGCGTTTCATGGGATAAAA GTCAACCAAGAAGTCATACTTGATGGTAGTGAGGCGCCAGTCAGACTTGATGCTGAAACACTACTGGGGTCTGAGGAACT TGTGCCTGTGGCTATTCTAAACAAGATTAAGGTCCCATATCGACCAATAGATTCTAAGATTAGTGCACTTTCAACAGATC GTGACAAGCTGCCCTCTGGAAAGCAGATACTAGCACTGACTTTGACGTACAAGATTAAATTGGAAGATGGAGCAAAAGTG AAACCTCAAATACCATTACTAAATAACCGGATATATGACACTAAATTTGAGTCTCAGTTCTTTATGATTTCTGACTCAAA TAAGCGCGTATATTCATGTGGAGATGTCTATCCAAGCTCTTCTAATCTTCCCAAAGGAGAATATAATTTACAGCTATACT TGAGGCATGACAATGTGCAGATTTTGGAAAAGATGAGGCATTTGGTGTTATTCATTGAGCGGAATTTGGAAGAGAAGGAT GTTATTCGGTTAAGCTTTTTCTCTCAACCTGATGGCCCACTGATGGGAAATGGTTCCTTCAAGTCCTCAATGTTATTTCC AGGAATTAAAGAAGGACTATATCTTGGTCCACCACCAAAAGAAAAGCTTCCCAAGAATTCTCCACTAGGATCTGTTTTGG TAGGGGCAATTTCATATGGGAAACTATCACTTGCTGATCAAGGGGAGAGTAAAAATCCAGAAAAGCACCCTGCAGCGTGT TCGATTACTTATATAGTTCCCCCAAATAAGGTCGATGAGGACAAGGGAAAAGGTTCTTCCTTATCTTCCAAGAAGGCTGT GTCTGACCGTATAAAAGAAGAGGTAAGGGATGCAAAAATAAAAGTTCTGGGAAGCCTAAAACAAGAAACTGATGAAGAGC GTGTGGAGTGGAAAGAGCTATCTGCCTTGCTTAAATCAGAATATCCAAAGCACACTCCATTGCTTGCAAAGATTTTGGAA GGTTTAGTTTCTAGGAGTAATATCAAAGACAAAATTCAACACGATGAAGAGGTGATCGATGCAGCCAATGATGTGATTGA CAGTATTGACTGCGAAGAGTTAGCCAAATTCTTTGCACTAAAAAATGATCCAGAAGATGAGGAAGCAGAGAATATCAAGA AAAAGTTTGAGTCAGCTCGAGACCAGTTAGCAGAGGCACTTTACCAGAAGGGGCTTGCGCTGGCAGAGATCGAGTCTTTA AAGTTGGCAGACTTGACTTGGTGTATATTGTCAAAGGACGTAGATAAGTTCTTGGCTTTGGAGGCGGGGACAGGAGGTGC AAGAAAAGATGTGGACAATGAGCAATCTACAGATGATGGCAGCCATCCAGATTCGTTCGAAGAGAATTTTCAAGAACTGA GGAAATGGGTTGATGTAAAGTCACCTAAATATGGAATCCTCTTAGTAACACGCGAGAGGCGTTCTCAAAGGCTTGGGACA GCGTTAAAGGTACTGTGTGACATAATTCAAGATGATGCAGAGCCTGCCAAGAAGAAATTCTATGAACTAAAGCTCTCTTT GCTTGATGAGATTGGATGGACACATTTAGCAACTTATGAGAGACAATGGATGCTTGTGCGTTTCCCTCCAAGCTTGCCCC TTTTCTAG
Protein sequence (LotjaGi2g1v0141500.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MPCSSFSTGGDNGGDNSGKKSDGSSLRNFKLNESTFLASLMPKKEIAADRFIDAHPTYDGRGALIAIFDSGVDPAADGLQ ITSDGKPKILDVIDCTGSGDVDTSKVVKADADGCISGASGASLVINTSWKNPSGEWHVGYKLVYELFTETLTSRLKKERK KKWDEKNQEDIARAVKQLNDFDKQHIKVDDAKLKRVREDLQNRLDLLRRLSESYDDKGPAIDAVVWHDGEVWRVALDTQS LEDDPDCGKLANFVPLTNYRIERKHGVFSKLDACTFVVNVYNDGNVLSVVTDCSPHATHVAGIASAFHPKEPSLNGVAPG AQLISCKIGDSRLGSMETGTGLTRALIAAVEHKCDLINMSYGEATLLPDYGRFIDLVNEAVNKHRLIFVSSAGNSGPGLS TVGAPGGTASSIIGVGAYVSPAMAAGAHCVVEPPSEGLEYTWSSRGPTADGDLGVCISAPGGAVAPVPTWTLQRRMLMNG TSMASPSACGGIALLISAMKAEGIAVSPYSVRKALENTSVPIGDLPEDKLSTGQGLMQVDKAFEYIQKCQNIPCVWYQIN INQSGKTNPSSRGIYLREPSACRQSTEWTVQVSPKFHEDASNFEELIPFEECIELQSTGETIVKVPDYLLLTHNGRTFNV VVDPSNLCDGLHYYEVYGIDCKAPWRGPLFRIPITITKAKAVTNQPPQVSFSNMLFQPGHIERRYIEVPHGASWAEATMK TSGFDTARRFYLDAVQMCPLQRPLKWESVATFPSPASKSFAFRVVSGQTLELVIAQFWSSGIGSHDTASVDFEVAFHGIK VNQEVILDGSEAPVRLDAETLLGSEELVPVAILNKIKVPYRPIDSKISALSTDRDKLPSGKQILALTLTYKIKLEDGAKV KPQIPLLNNRIYDTKFESQFFMISDSNKRVYSCGDVYPSSSNLPKGEYNLQLYLRHDNVQILEKMRHLVLFIERNLEEKD VIRLSFFSQPDGPLMGNGSFKSSMLFPGIKEGLYLGPPPKEKLPKNSPLGSVLVGAISYGKLSLADQGESKNPEKHPAAC SITYIVPPNKVDEDKGKGSSLSSKKAVSDRIKEEVRDAKIKVLGSLKQETDEERVEWKELSALLKSEYPKHTPLLAKILE GLVSRSNIKDKIQHDEEVIDAANDVIDSIDCEELAKFFALKNDPEDEEAENIKKKFESARDQLAEALYQKGLALAEIESL KLADLTWCILSKDVDKFLALEAGTGGARKDVDNEQSTDDGSHPDSFEENFQELRKWVDVKSPKYGILLVTRERRSQRLGT ALKVLCDIIQDDAEPAKKKFYELKLSLLDEIGWTHLATYERQWMLVRFPPSLPLF
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| MobiDBLite | 1 | 26 | 26 | - | – | |
| PANTHER | 19 | 1281 | 1263 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 19 | 1281 | 1263 | 0.0 | – | |
| CDD | 40 | 522 | 483 | 0.0 | ||
| ProSiteProfiles | 43 | 543 | 501 | 24.673 | – | |
| Gene3D | 43 | 137 | 95 | 1.3E-8 | ||
| SUPERFAMILY | 48 | 554 | 507 | 8.51E-53 | ||
| Pfam | 60 | 525 | 466 | 1.9E-78 | ||
| PRINTS | 60 | 79 | 20 | 6.0E-11 | ||
| Coils | 190 | 217 | 28 | - | – | |
| Gene3D | 228 | 553 | 326 | 5.0E-72 | ||
| PRINTS | 292 | 305 | 14 | 6.0E-11 | ||
| PRINTS | 479 | 495 | 17 | 6.0E-11 | ||
| ProSitePatterns | 480 | 490 | 11 | - | ||
| Gene3D | 557 | 690 | 134 | 1.4E-35 | – | |
| Pfam | 822 | 1006 | 185 | 2.4E-59 | ||
| Coils | 1169 | 1189 | 21 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Serine-type endopeptidase activity | Catalysis of the hydrolysis of internal, alpha-peptide bonds in a polypeptide chain by a catalytic mechanism that involves a catalytic triad consisting of a serine nucleophile that is activated by a proton relay involving an acidic residue (e.g. aspartate or glutamate) and a basic residue (usually histidine). | ||
| Biological process | Proteolysis | The hydrolysis of proteins into smaller polypeptides and/or amino acids by cleavage of their peptide bonds. | ||
| Molecular function | Tripeptidyl-peptidase activity | Catalysis of the release of an N-terminal tripeptide from a polypeptide. |
Expression pattern of LotjaGi2g1v0141500.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…