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LotjaGi2g1v0311600.3

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi2g1v0311600
Transcript ID LotjaGi2g1v0311600.3
Related isoforms 2
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Phospholipid-transporting ATPase; TAIR: AT1G59820.1 aminophospholipid ATPase 3; Swiss-Prot: sp|Q9XIE6|ALA3_ARATH Phospholipid-transporting ATPase 3; TrEMBL-Plants: tr|I1KXN1|I1KXN1_SOYBN Phospholipid-transporting ATPase; Found in the gene: LotjaGi2g1v0311600
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr2:78563439..78578586) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

AAAGGCCATTTTATGTCTATCAAGTATGAATTAAACAAGTTCCTAGTGATCACCAACATGATTGAACAGTAATGGCATTC TGTATGAAATATTTTGCATCTTTAGTATTTCTGTGTTTTACTGAACTTATACATTGAAAGAAGATGGCCTAGCACTGTGC TTACAAATTGTCTAAGGAGTATATACACCTAGGTTCCTTAGTATTCTGTTTGCATGATTCCAGATATTGGAATTCATATT ATACATGTCACATAGCTTGATTTAAGAAGTTTGAGTTTTTGATCAATGGATGTCCTTTATGTTAGGGGAACTCAATATCG ACTACAAAGTACAACGTTTTCACTTTTCTCCCAAAAGGATTGTTTGAACAGGTAACTTACTTCTAAGCTTTTTGATTCTT GAGAATTGAGAGTGTGTGAGATGCATTTAGTTTCCATATTTTTTTTAAACAATATGACCTTTACCTGCCATTATATGAAT TGTCACTGTTTGGAACCTGTATTCCTAACAAGTTTTTTCGGAGTACGCATGATAATTCTTGCAGATAACATGTTTTTTTT GTCTTTATGGTATCATATATTTGAGCACTTTACACAATTTTTTTTTTTAATTATTTAATCAATCTGGTTGGGTCTAAGTA GATATGTGTATTAAGGATACCACCCAGGTTGAGGAGTATCATTTTTATGGTGACAATTTTTTTTAAGGCATTCTATTCAT TGCTGATTACATCATTAAACTAATCATTGCTCTTAAATTAGCATTCTTCCCATCAACATTGGTCTAAAATCACGGTGCTG AAGTCGAATGGTTATTTGATTTTTGCTTTGTGCTCAGAGAAAATGGTTTGTGTCTTTGTTTTCAATCACGTGTAGTTAGA GAAATACGTGCTCAAAATTATTTATTACTATTTTGTCTTTAAATTAATTTATGCCTATCTAAGGCAAATGATAACACTGG 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TACGCTCTATGGGACATTAGGTCGAACATAGAAAAGGATGAATCACTTTTGTATGGAATTTACATGAAGCGTTTTATTAA ATATTCAACTTGAGTCATGTTTTGGAAGTCAGCTTGTTAAAAAAGAAAAAGTGTCTTAGTTTCAACCTTCAAGAACTTGT TAATTTTTAACATGGATGTTTAACTGCTAATATTGTTGCTGTATTATGATCTTTCACGTCAATCATAATATGTTTTGCAC TTTAACGCCATAATCAATTTATTTTATGAACATGCGACCGAAGCATGCCTCTTAAATGAGAATCTTATGTCATAACTGCA TGTATGGTTGCAACAGATAGCTTGGAAGACAGGATGAGTGTAAAAATTAATGTAATTCATTGATAACTATGTTTTTGTGG TCCCTGTTTATGTTTATTCAGTTTAGTTTCTCTGGTTACAGGGTTCAGAGATGGTTCTTCCCTTATGATTATCAGATAAT TCAAGAGATGCACAAACATGAGAATGATGACACCGGCAGGGCACAACTGCTAGAGACAGGGGACCGGCTTTCTCCATCTG AGGGAAGGAGCTATGCCCTATCTCAACTATCACGTGAGACAACAAAGCACACTGGGTTCACTTTTGACTCACCTGGTTAT GAGTCATTTTTTGCCGCACAGTTTGGTGTACATGCCCCACAAAGGGCCTGGGATGTTGCAAGACGAGCAAGTATGAGATC TCGGCCAAAGATTGTACAGAAAAAGTAA 

CDS sequence (LotjaGi2g1v0311600.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGCAATAAACAATGGTACGATAGATGTACTGCGAGATCGAGAATGGGTGTCTATACCCTGGAAAAAGTTGCAAGTTGG TGACCTAGTCAAGGTTAAGCAGGATGAATTCTTTCCTGCAGATCTGCTTTTCCTGGCTAGTACAAATGTTGATGGTGTCT GCTACATTGAGACAGCTAATTTGGACGGGGAAACCAATTTGAAGATTAGGAAAGCATTGGAAAAGACTTGGGATTACTTT ACTCCAGAGAAGGCATCTGAGTTCAAAGGTGAAATTCAGTGTGAACAACCAAACAACTCATTATATACCTTCACTGGGAA TCTTATAATTCAAAACCAAACTCTTCCTGTCAATCCAAATCAACTGTTGTTGCGAGGATGCAGTCTCAGGAATACAGAAT ATATTGTTGGGGTTGTTATTTTTACAGGACATGAAACAAAGGTGATGATGAATTCTATGAATGTTCCTTCCAAAAGAAGT ACATTGGAGAGGAAGCTTGACAAGCTCATACTCACTCTTTTTGCAACTCTCTTTGTGATGTGTTTTATAGGAGCCATAGG CAGTGCTATTTTTGTAAACAAGAAGTACTTTTATTTACATCTTGAATCATCAGAGGAGGGCTCAGCACAGTTTGACCCCA GAAACAGATTTTTGGTTTTCCTTCTGACTATGTTTACCCTCCTCACTTTATACTCAACAATCATCCCTATTTCACTTTAT GTATCGATAGAGATGATCAAATTTATTCAGTCCACTCAATATATTAACAAGGACTTGCACATGTACCATTATGAAACCAA TACCCCAGCATTGGCCAGAACATCAAATCTGAATGAAGAGCTTGGGCAGGTGGAATACATTTTCTCTGACAAGACTGGAA CTTTAACAAGAAACTTAATGGATTTCTTCAAGTGTTCAATTGGGGGAGAGATCTATGGTAATGGCGTGACCGAAATTGAG AAGGGAATAGCAGAGCGTAGTGGCATTAAAATTAAGGAAAATGTCTCACCAAATGCAGTGCGAGAGAGGGGTTTTAATTT TGATGATGCTAGGCTTATGAGAGGAGCTTGGAGGAATGAGCCGAATCCTGATAGCTGCAAGGAATTCTTCAGATGCCTTG CTATATGCCATACTGTGCTTCCCCAGGGGGATGAGTCCCCTGAGAAGATCTGCTATCAAGCTGCATCACCTGATGAGTCT GCTTTGGTAATTGCTGCGAAGAACTTCGGTTTTTTCTTTTACAGACGCACGCCTACGATGATATATGTTCGTGAATCTCA TGTTGAGAAAATTGGTAAAATTCAAGAAGTCTCGTATGAGATTTTGAATGTGCTTGAGTTTAACAGTACAAGGAAGCGTC AATCTGTTTTATGCCGTTATCCAAATGGGAGGCTTGTATTGTACTGTAAGGGTGCTGATTCTGTAATCTATGAAAGATTA GCAGATGGTTATAATGATATTAAAAAAGTGACTAGGGAGTATTTGGAACAATTTGGATCTTCTGGACTACGCACATTATG CCTGGCTTACAAAGAATTACATCCTGATGTTTATGAAAGCTGGAATGAGAAGTTCATCCAGGCCAAATCTTCTCTACGTG ATCGGGAAAAGAAGTTAGATGAGGTGGCAGAACTTATAGAAACTGATCTCATTTTAATTGGTAGCACTGCCATAGAGGAC AAGCTTCAAGATGGAGTACCAGCCTGCATAGATATTCTTCAAAGAGCTGGCATTAAAATTTGGGTGCTCACAGGGGACAA GATTGAAACAGCAATTAATATTGCCTGTGCATGCAATTTAATAAACAATAAGATGAAACAGTTTATTATCAGTTCAGAAA CTGATGCAATTAGAGAAGTTGAAGACAGGGGGGACCAAGTAGAAATTGCACGGTTTATTAAAGAAGAAGTGAAGAAAGAA CTGAAGAAGTGCTTTGAAGAAGCAAAAAGCCATTTTAGCTCTCTATCTGGACCAAAATTAGCACTTGTAATTGATGGAAA ATGTCTAATGTATGCATTGGATCCTAGTTTGCGAGTCATGCTGCTGAATTTGAGTTTGAATTGTCATACAGTTGTTTGCT GCCGCGTTTCTCCTTTACAGAAAGCACAGGTCACGCGTTTGGTCAAGAAAGGTGCACAAAAAATAACACTTAGTATTGGT GATGGAGCCAATGATGTTAGCATGATCCAAGCTGCTCATGTTGGCGTTGGGATAAGTGGATTGGAGGGGATGCAAGCTGT GATGGCAAGTGATTTTGCCATTGCACAGTTTCGTTACCTTGCAGATTTGCTGCTTGTTCATGGCCGGTGGTCATATCTTC GAATATGCAAGGTGGTGACTTACTTCTTTTACAAGAATCTCACATTCACTCTTACTCAGTTTTGGTTTACCTTTCAAACT GGGTTTTCTGGCCAGAGATTTTATGATGATTGGTTTCAGTCATTATATAATGTTATCTTCACAGCACTTCCTGTGGTCAT TGTTGGACTATTTGACAAGGATGTCAATGCATCTCTATCCAAGAAGTATCCTGAACTATACAGGGAGGGAATAAGAAATG TATTTTTCAAATGGAAAATTGTGGCTATATGGGCCTTCTTTTCTGTCTACCAGTCTTTAATATTCTTCTATTTTGTGAGT TCGTCCAGTTTAAGTGCTAAAAATTCAGCAGGCAAGACATTTGGACTCTGGGATGTCAGCACAATGGCCTTCACATGTGT TGTAGTAACAGTCAACTTGCGAGTTCTTATGATTAGTAATTCAATCACAAGATGGCACTACATTAGTGTTGGTGGAAGTA TATTAGCGTGGTTTATTTTTGTTTTAATAGATTCAGTGATCAGCACTCCTTATGATCGACAGGAGAATGTGTATTTTGTC ATATATGTCTTGATGAACACATTATATTTCTACCTCACACTAATTCTTGTCCCTGCCGCGGCACTTTTTGGTGACTTTGT GTACCAAGGGGTTCAGAGATGGTTCTTCCCTTATGATTATCAGATAATTCAAGAGATGCACAAACATGAGAATGATGACA CCGGCAGGGCACAACTGCTAGAGACAGGGGACCGGCTTTCTCCATCTGAGGGAAGGAGCTATGCCCTATCTCAACTATCA CGTGAGACAACAAAGCACACTGGGTTCACTTTTGACTCACCTGGTTATGAGTCATTTTTTGCCGCACAGTTTGGTGTACA TGCCCCACAAAGGGCCTGGGATGTTGCAAGACGAGCAAGTATGAGATCTCGGCCAAAGATTGTACAGAAAAAGTAA 

Protein sequence (LotjaGi2g1v0311600.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MAINNGTIDVLRDREWVSIPWKKLQVGDLVKVKQDEFFPADLLFLASTNVDGVCYIETANLDGETNLKIRKALEKTWDYF TPEKASEFKGEIQCEQPNNSLYTFTGNLIIQNQTLPVNPNQLLLRGCSLRNTEYIVGVVIFTGHETKVMMNSMNVPSKRS TLERKLDKLILTLFATLFVMCFIGAIGSAIFVNKKYFYLHLESSEEGSAQFDPRNRFLVFLLTMFTLLTLYSTIIPISLY VSIEMIKFIQSTQYINKDLHMYHYETNTPALARTSNLNEELGQVEYIFSDKTGTLTRNLMDFFKCSIGGEIYGNGVTEIE KGIAERSGIKIKENVSPNAVRERGFNFDDARLMRGAWRNEPNPDSCKEFFRCLAICHTVLPQGDESPEKICYQAASPDES ALVIAAKNFGFFFYRRTPTMIYVRESHVEKIGKIQEVSYEILNVLEFNSTRKRQSVLCRYPNGRLVLYCKGADSVIYERL ADGYNDIKKVTREYLEQFGSSGLRTLCLAYKELHPDVYESWNEKFIQAKSSLRDREKKLDEVAELIETDLILIGSTAIED KLQDGVPACIDILQRAGIKIWVLTGDKIETAINIACACNLINNKMKQFIISSETDAIREVEDRGDQVEIARFIKEEVKKE LKKCFEEAKSHFSSLSGPKLALVIDGKCLMYALDPSLRVMLLNLSLNCHTVVCCRVSPLQKAQVTRLVKKGAQKITLSIG DGANDVSMIQAAHVGVGISGLEGMQAVMASDFAIAQFRYLADLLLVHGRWSYLRICKVVTYFFYKNLTFTLTQFWFTFQT GFSGQRFYDDWFQSLYNVIFTALPVVIVGLFDKDVNASLSKKYPELYREGIRNVFFKWKIVAIWAFFSVYQSLIFFYFVS SSSLSAKNSAGKTFGLWDVSTMAFTCVVVTVNLRVLMISNSITRWHYISVGGSILAWFIFVLIDSVISTPYDRQENVYFV IYVLMNTLYFYLTLILVPAAALFGDFVYQGVQRWFFPYDYQIIQEMHKHENDDTGRAQLLETGDRLSPSEGRSYALSQLS RETTKHTGFTFDSPGYESFFAAQFGVHAPQRAWDVARRASMRSRPKIVQKK 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Phobius 1 168 168 -
TIGRFAM 2 1005 1004 0.0
Gene3D 2 151 150 3.9E-8
CDD 3 879 877 0.0
SUPERFAMILY 6 149 144 7.98E-19
Pfam 7 244 238 6.3E-10
PANTHER 84 1089 1006 0.0
PANTHER 84 1089 1006 0.0
SUPERFAMILY 153 997 845 1.14E-36
Phobius 169 192 24 -
TMHMM 169 191 23 -
Phobius 193 216 24 -
Phobius 217 241 25 -
TMHMM 219 241 23 -
Phobius 242 777 536 -
SFLD 270 770 501 0.0
SFLD 270 770 501 0.0
SUPERFAMILY 276 761 486 1.59E-33
PRINTS 288 302 15 1.7E-5
ProSitePatterns 290 296 7 -
SUPERFAMILY 295 557 263 2.4E-22
Pfam 393 479 87 8.7E-11
Gene3D 417 539 123 3.7E-18
Gene3D 550 759 210 7.7E-54
TIGRFAM 692 798 107 4.7E-32
PRINTS 719 738 20 1.7E-5
Pfam 747 997 251 3.7E-80
Phobius 778 796 19 -
TMHMM 778 797 20 -
Phobius 797 815 19 -
TMHMM 812 831 20 -
Phobius 816 835 20 -
Phobius 836 855 20 -
Phobius 856 879 24 -
TMHMM 860 879 20 -
Phobius 880 893 14 -
Phobius 894 913 20 -
TMHMM 894 916 23 -
Phobius 914 924 11 -
TMHMM 925 947 23 -
Phobius 925 947 23 -
Phobius 948 958 11 -
Phobius 959 983 25 -
TMHMM 962 984 23 -
Phobius 984 1091 108 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Nucleotide binding Interacting selectively and non-covalently with a nucleotide, any compound consisting of a nucleoside that is esterified with (ortho)phosphate or an oligophosphate at any hydroxyl group on the ribose or deoxyribose.
Molecular function Magnesium ion binding Interacting selectively and non-covalently with magnesium (Mg) ions.
Molecular function ATP binding Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator.
Biological process Phospholipid transport The directed movement of phospholipids into, out of or within a cell, or between cells, by means of some agent such as a transporter or pore. Phospholipids are any lipids containing phosphoric acid as a mono- or diester.
Cellular component Integral component of membrane The component of a membrane consisting of the gene products and protein complexes having at least some part of their peptide sequence embedded in the hydrophobic region of the membrane.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi2g1v0311600.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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