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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi2g1v0388100 |
| Transcript ID | LotjaGi2g1v0388100.7 |
| Related isoforms 9 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Isoflavone reductase homolog; TAIR: AT1G75280.1 NmrA-like negative transcriptional regulator family protein; Swiss-Prot: sp|P52575|IFR_MEDSA Isoflavone reductase; TrEMBL-Plants: tr|Q05JX7|Q05JX7_LOTJA Isoflavone reductase homolog; Found in the gene: LotjaGi2g1v0388100 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:88435752..88462508) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TCAATTTTAAAATATTTTCTTAAAGCCGTCCCAATTCAATGAATTCGTAACACTAACTACCACAAAAAATAGCTGGACCA TTCCTTTGCTCCGCACAGCCCCAAAGTCACAAACACAGATTACTTTGATTTGAAGTTTAATCCTTTTGTTGCAATGGCAG AGAAGAGCAAGATCCTAGTCCTTGGAGGAACAGGTTACATTGGAAAATTCATAGTTGAGGCAAGTGTAAAAGAAGGGCAC CCCACGTTTGCTTTGGTTAGGGAGAGCACGGTCTCTCATCCTGACAAGTCAAAGCTTATTGAATCCTTCAAGAGCCAAGG AGTTACCCTGCTTTATGTTAGTGTCTTTCAATCACAGTTTCTTTTACACACAACTACCATTTCTAAGTCCAAATTCAAAT AAACTATTCTGATTTCTGACATGATTATTTCTCTGAATCTGATGTTGTAGGGTGATCTTACTGATCATGAAAGCCTTGTT AAGGCAATCAAGCAAGTTGATGTTGTGATCTCCACTGTAGGTGGACCACAGATTGATGACCAGCTGAAGCTTATAGCAGC AATCAAAGAAGCTGGAAACATCAAGGTGCACAAGTCTTCTTCTACAAAATAATAATTAAGTTTATATGCGTGTTTGGATG AACGTTGTTACAATCAATCAGTTATGGATAGAGTAGATTTTGGTAAAGTGTAGTGTGATTGAATTGATTTATGTTTAGAG TTTAGATACATTTATAAGAAAAATATTTTCGGAAAATAATGTTGGGGAATCCAATTGTGAAATTTCATGATTGGTCATAT CCACAACAAAATGGTGTTTAACTCTCATTTCATCACTGATCACTCATCAGAGGTTCCTCCCATCTGAATTTGGGCTGGAC GTTGACCGTCATCATGCAGTTGAGCCTGTGGTTAGCTTTTTTGAGCAAAAAGTGAAAATCCGGAGGGCAGTTGAAGCTGC 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CTTTCTGGCGGAGGAGGCGTGTATTTTTCAGGGGAGGCTTCCCTCTTTTTCTTTCTCCATAACCCAAAAATTTCTGGTTT ATGTCCTTAAGTTAATTTATTTGAGCAACTCTGTTTTGCTCTGTTCCTTGTCCTGTTCTTTGTTCTTTTTTCACTTTTCT GGGTTTGCGATTATGGGTTCTATGTGAGAAGAACAAAACGAAAACCTCTTTAATGTCACTTTTCTGGTTTACGTTTTGGA GTGAAATTGAAGAGGGTTAGATCTGATTGGAACAGTTCGTGAGTTTATTTTTTCCTCTTTCATTGTCGGTGGAATTTGTT TCTACTTTCTACTCTTTTTCTCCCCCTTTATTTTATTTTCTGGTGTGAAAACATAAAAGCAAATAGTTCTGTGTGCTGAA CAACTGTGAATTTTTCCAATCGTTCATGTTGAGATCTTTTGTTTTTTCATATGGGGTTTACTGTTTCGGTTGCCACCATT CGTTGCTTTGTCATGTGATTTTCAAAGTTTGATGCTTTTCAATTTTTCGTGATTGCCCTTTAAGTTTCCTAGTCGTTTCT TCTACTGGAGCATTGCTTTTTAGTTTTTTTTTTTCACTTTGCTCTTCAGTGTTCTGGTTCTAAAGCAATTCTTCAGAGTA AGTAAGCAAATGGTGAAGATAATGAAGAAGGATTAGAGTTAAAAAATTTAGGACTAAAGATTTGATTAGGGATTAAAGTT AAATAAATTAAGCTTTTCTTTAGAATTTTAAACAATTTTTTTTAATTAATTAGGTTTTTTTAATTTAAAAGAAAAATAAA TTCCACATCAGCTCATTAATCCCACGTGACCATGTCACATGGGGCCACCGGAGCTCCGGCGTTGATCCAGAGCTCCGGAG GGACCAAAACCAAACATTTTGGCAAAGGTTAGGGACTAAAACCCACCTTTACTCCGACGAGGGACGAAAACCAAGCATTT TGTAAAAGTTAGGGACAAAAACTTATTTAAGCCTAAAGTTTACAAAAAATACAGAATCAGTGGCCCCGATATGAAGACTA GTTGAAGGAGCCAATATGGACTAAAGAAGATGGCATTTGACTAGATGCATATCTGTTTAGTAGGTGTCAGGGGGTGGGTG GCTACACTGGGAACCTTATAAATACCAAGCAAAGTGTTGTTCTGTAACTCACTGCTTGTTTGATTACGTTCACTAGTGCC ACTACTGCTTGTGTTGTTAATTTCACAACAAATTAAGTTCTAATTGTTCTGATGGCACCACAAGACAGAATCCTTGTGAT CGGACCCACAGGAGCAATTGGAAGACATGTAATTTGGGCAAGTGTCAAAGCAGGAAACCCAACATACGCTTTGGTGAGGA AGAACAGTGTCACTATTGAGAAGCCAAAGCTCATCACAGCTGCTAATCCTGAAACCAAAGAAGAGCTCATCGACAACTTC AAAAGTTTAGGAGTTATTCTCCTAGAGGTATGTAAATATGTGACTTGAATATGTATATGAGTCTGTTTGATTGCGCGAAC ACTTATCGGAGCTTATTTGGTGCCTTTTTAGTAGATAAGCTCCAATAAGTGCTCTGTGTCCAAACAGGACATATATTCAT TTCAATTTTACAATTAATCTCAATTCTTCTGATTATGTTTGATTAATTGTGCATGATGCTGCAGGGTGACATAAGTGATC ATAATAGTTTGGTTAAGGCATTGAAGCAAGTTGATATTGTCATCTGCACAACAGGAAGACTTTTAATTCTAGATCAGGTC AAGATCATTGCAGCAATCAAGGAAGCTGGAAACATCAAAGTAACTAACTTATTTGTTCATTTTATTTAATAATTATCTCT GGTTCAATTTGCTTAGTGCTAATTGAATCTTGAATTTTGATGTGAAACAGAGGTTTTTCCCTTCTGAATTTGGGTTAGAT GTGGACCGCCATGAAGCAGTGGACCCAGTGAGGGAAGTTTTCGTCGAAAAAGCAGGAATCAGAAGAGTAGTGGAAGCTGA AGGAATTCCTTACACTTACCTCTGTTGCCATGCCTTCACTGGTTACTTCTTGCGTAACTTGGCTCAACTTGATGCCACTG TTCCTCCTCGTGACAAGGTCATCATTCTAGGAGATGGAAATGTCAAAGGTAATCATCTAACAATCACAAACATGAAACAC CTCAATTAGTCCATTCTAAACAGTTTTAGCACACACAGTAATGTTTGATGAATTGCTTCAATAAGGGTGTATATTGATTA TATATTTGATTTACTTGTTAATTTCAGGAGCTTATATCACTGAGGCAGATGTGGGGACTTTCACCGTCTTAGCCGCGAAC GATCCCAGAACATTGAACAAGGCTGTCCACATAAGACTCCCTGCTAATTATTTGACAGCAAATGAGATCATGGCATTGTG GGAGAAGAAGATTGGGAAGACTTTGGAGAAAACCTATGTTCCTGAGGAACAAGTTCTTAAGGACATCAAGGGTCAGTTAC AAAAACTCATTTTAATTAGACTTCACAATATTCAACTAAACATGAGTATTAATTATGTTACATACTTACATGCATCAATT TACTTAAATTAATTAATGATCTTGTTTTGATTTCTGATGTGGGTGTTTATGTTTTTGCAACAGAATCTGGTTTCCCTCAC AACTACCTATTGGCTCTGTACCACTCACAGCAGTTAAAGGGAGATGCAGTGTATGAGATTGACCCTGCCAAGGATGCTGA GGCTCATGAGCTTTACCCTGATGTCAAATTCACCACCGTAGATGAATATTTGAACCAGTTTGTCTGAATTTTGAGAAAAA AATGATTTATCAGGCTTTAAACTATTTCCATTGTTTGTTATTTGTGCCTGTCCTCTCGTGAATAATCACATCCCGTTGAT GTAATTCATTTTGAATAATATAATCTCTTTTGTCCTCCTATTGTATGGCTGCTCAGTGCTCACACTTGTTCATTGGACCT TTCTCCCGGCCACGGGACAAGAAAAAACAGGCAGGGGTGGAAATTAAATTAACATCACTAAATAAAATTTTCAGTGACTA CAAAATTATATAACATTTATTATTAGCAATTATGTAAAATTTAAATCATGCAAAATAACATATATTTCATAAAACTAGAC ATGACATGTGCATTTCCTTTCAATAATCAAAATTATGCTACAACAAATACCATCAATTGTCTTAAGCTTCGGTTATTTTC CAAGCTTGCTTTCCAAATAATATTTAGATGTACTAGAGATTGGTTCTTGCTATCCTTAATATTTGACAGATATATGAGGA GAGACGATAATTTTCCTTCAAGGACAATGTACTCCTTCTTCATTGATTTTCTTACATTTACAAAACCCATCAGCTATAAA TGCAGTTGTTGTCTGGTTCATTCTTGCCAAAGAGATAACACGATAGACAATAAATACCATCATTCTCAAGTGAGTGCACC AACCAGCATGAATGTGCTTCGAACCAATAAGCTTGAAATTGTTAACATTATCAACTTCTCATAAAAAAAGAAATTATATA TTTCTTGATTGATATTGACCGACCTTGAGATAAACACAATGGATTTCATTTCTTTGATTAAAAGGAAACTCAAATTATTG CACGCAATCTAAGATCACAATCTAATCAATAGCACCCATTTTTATAGCTACATTATTCTACATTTTGAAGGTCATTCATC TTGTGGTGGAATATTTAAGCATGTACTAACATTTAATGATATAGCAGTAGTTTGAGGTTGATTGCCATCATTGAACTCAT TCTTCTTAAAGAATTAATCAATAGTTTTTTGAATTGACAAATTTCAACAGCATTGTGAAAAGATCGTTGTGCAGCTGTTA TTCCCTACATATGTCCTTGATCTATGCGATTTGGGAGACTAGAAGTCATCTTATTTTTAAGGGTGTCCAACCTTCACACG AGCGACTTATGACAAGCACTTCATCCTTAATGGTTTCGTCCCACTCCCGTAAGATCAAATGCACATTCCATCGTGGGCTT CCTTCCTCTTGGCAACGACCTTCTGATGATGTTGCGAAGGTTAATTTTGACGCGTCGTGAAGGACGCACGCTTGGGGCTC GTTGCTCGCGATCACTTCAGGGAGGTCTTGGTTGCTGTGTGGGCTTGTCCTTTGAATATGTTGTGTGGACTTGTCCTTTG CTTCTGACTTAGGCTTCTGAAAAGTGCGCTTTGAGACAAATAGCTTGCAACTTTACGGTGTTCGTTATTATAGGAGGGTG CATGATCAACTTGTATTTTGTTTTTGTTATTAATGATTGTAGATACTTAACTTCAGCTTTTGATTTTTTTTTTCCTTTGT TCGTTGTTCTAGTAACTACTATGTTGTAAACTACCTAACTAATTAAAACCGCCTATTTTTTTCTCACTTCTATTTGAGTT GAAGAGGCGCCTCCAAGTGACCTCCACCCCACATGTTCGGTTTGATGTAATAGCTTCTTCTATGTTTGTTTGATCATTTT ATTAATAAATTTCTTTCAAATAATTTTTTTTTGTAAGTTTGTCACTTTGTCTACTCAATTAGTGTATAATTATTAATATC ATATTTTTTTATTGTAGTCAATTATTAAGGAAGGGTGGTTCAAGTATTCATCACACATTATTTTTTCTTCTATCTTATTT TCACTCGTTTCTCTTTTTTATATATTTCATTACATTACATTATCTAGCACGTACCTTTCATTTTCCCCTCTAATCGTTCT ATCTCTCTTAAGATATAATTATATTTAAAATATGAAAATAGCATTATCCACTACTGTGGAAGAGTCCAATCGTCGGTGGA CGACAGCGTCACCATTTGAACAATTTCTTATTATCATGTGGTGAAGTGAGGGTAGCTTAGTTATACTTACTACCTACCAA TACTAATTAGAGCAAGAATTAGAGACATAAACAATATTATGATGAAGAACATCAGAACTGTGACTTTTCAGCATGGGCTG CTCATGTCTAACGTTAGACCACGAAATTATGTGTTTTTTTATCCCTTTCTTCTTTCTGTTCAATATTTGTAATATTTTTA TGTAAAAGTGATTCATGGTTTGAACGTTCCGTTGTTTGATTTATGACTTCCTTTTCATGCGAAAAAGAAAAGTACTCACT AATCAGACCATCTTCTTGTTCATTAATTTGATAAAACAATTATTATTTTTAATCCAAACATTCAATCATATTGCACCGTA TCACTGAAAAATATATCAACTAAGTGTTAATCTAGCTAGTGATAAATAAGTTAGACCCATAAAATAAGAGTAGAAGTTAT CTTGAAAATAACATTTGTTGATGAAAATATACAACCCTTTCGGTAAGAGTTAGGGAACATATATATTGGGGTGAGGGGGT TCAAAGATTAATTCATAAAGGGTGCAATTTATCTTTCCGATGTAAAAAAAAAATACAACATTTTCTTGAATGGGTGATAA CATCGGTCAAAAATATCACCAAAAATGTTATCGGAAGAATTACTCCTTTCTCTCACCAACTCATATGTCCCCTAACTCCT ACCACTTGAGTTATCTTACGAGGACAGTAGATAGATAGTAAACTCTGGATATATGGTGAGATTTATTTTATTTAATAATA ATGAATATGTTACATGTAATATAATACGTAATAGTTTCAACTTAATAGTTTTAAAATTAATTATGAGATAATTAAGCTAC AAAGTTAACTTCAACAAGTGAAATATGAGATTCTATAGTTGAACTTCACATTATCACTTATAGATTCACTTTCTCTCGTT AATTAATTAATAAATGTATCTATATATATATATATATAAATATAAATCATTTTACTTAAAGTCGCTTTTTGCATAATCAA TTTTAAAAAAAAATCATAATCAATTTTTTTGACGAAAAAGAGAAGCTACATTAATCAATTTTAGCTTATTAATTAGTTTT GGCAGGGTCTGGCTTGTAATTGGGTGGGTTTTAACTGTCTGGTGTTTGTGCCTTGCGTCTGGTGAGTGCATGGACCTGAT TTGGGTTGATTTTTGTATTTTTATTTTTTCTCCTTTCTCTTCTTATATTTGGGATTAGTACCCCTTGTGCTAAATTTGAA TACAATTCTTTGGTTTATCAAAAAAAAAAAACAATTAAACAAAGTCTCATCTTCATGCGTCAACGAAAATTTAGCAAGAG TATGCTGTACGCGCAACATTATTAGCTTTTCTATACACATGAATTAAAACTAACAGAATTGAAATTAGAAACCAAGGCAA TTTTAATCAAAATAAAAAGGGTTAATCCATAAACCATATTTTTAGTTTATTCCTAACATTTTTTGATTGTATTCCTAACA TTTAATACATATATTATTTAGAACGTACTCCTTATTTGATAAAATTAATTTGCAAACAAACCACTTTTAACTTGTGAACT AATGTTGTCTTGATTCATAAATGAAGTCATCAATTTTATATAGAATTAATGTTTACTAGATAAATTCAAAGTTCAAACAG AGTGGCAGTAATCGAGTAGAGACAGTGCTTGAAGGAGCCAATTTAGACTAGAAGGCTGCCGATGGCGACTGGCGTCGTCA TGAGGAAAATCAAAATGTATAGTAATTGACTCAATAATATGGTTGGTGCCATGCTACACTGTCTAGGAACCTTATTATAA ATACCAAGCAAAGTGTTATTCTTTGCACCACAACCACAGCACTCTCACTACTTCTTTTGTTAAGTAGCAAAACACACTAG TGTTGTGCTTGTCTCTTGTGTTGTTAATTTCACAACAAATTAAGTTCTAATTGTTCTGACTTCTGATGGCACCACAAGAC AGAATCCTTGTGATCGGACCCACAGGAGCAATTGGAAGACATGTAATTTGGGCAAGTGTCAAAGCAGGAAACCCAACATA CGCTTTGGTGAGGAAGAACAGTGTCACTATTGAGAAGCCAAAGCTCATCACAGCTGCTAATCCTGAAACCAAAGAAGAGC TCATCGACAACTTCAAAAGTTTAGGAGTTATTCTCCTAGAGGTATGTAAATATGTGATTTGAATATGTATATGAGTCTGT TTGAATGCGCGAACACTTATTTGCTGTTTTTTTTAGTAGATAAGCTCCAATAAGTGTTATGTAGTCCGTATCCAAACATG ACCTATATTCATTTCAATTTTACAACTAATCTCAAACTAGTTCACTGTTCTGATTCTGTTTGATTAATTGTGCATGATGC TGCAGGGTGACATAAGTGATCATGAAAGTTTGGTTAAGGCAATGAAGCAAGTTGATATTGTCATCTGCACAACAGGTAGA CTTCTAATTCTAGATCAGGTCAAGATCATTGCAGCAATCAAAGAAGCTGGAAACATCAAGGTAACTTAATTATTTATTCA TTGGCTATAATTATCTCTGGTTCAATTTGCTTAGTGCTAATTGAACCTTGAATTTTGATGTGAAACAGAGGTTTTTCCCT TCTGAATTTGGGTTAGATGTGGACCGCCATGAAGCAGTGGACCCAGTGAGGGAAGTTTTCGTCGAAAAAGCAGGAATCAG AAGAGTAGTGGAAGCTGAAGGAATTCCTTACACTTACCTCTGTTGCCATGCCTTCACTGGTTACTTCTTGCGTAACTTGG CTCAACTTGATGCCACTGTTCCTCCTCGTGACAAGGTCATCATTCTAGGAGATGGAAATGTCAAAGGTAATCATCTAACA ATCACAAACATGAAACACCTCAATTAGTCCATTCTAAACAGTTTTAGCACACACAGTAATGTTTGATGAATTGCTTCAAT AAGGGTGTATATTGATTATATATTTGATTTACTTGTTAATTTCAGGAGCTTATATCACTGAGGCAGATGTGGGGACTTTC ACCGTCTTAGCCGCGAACGATCCCAGAACATTGAACAAGGCTGTCCACATAAGACTCCCTGCTAATTATTTGACAGCAAA TGAGATCATGGCATTGTGGGAGAAGAAGATTGGGAAGACTTTGGAGAAAACCTATGTTCCTGAGGAACAAGTTCTTAAGG ACATCAAGGGTCAGTTACAAAAACTCATTTTAATTAGACTTCACAAATCACAATATTCAACTTTACATGAGTATTGATTA TGTTACATACTTACATGCATCAATTTACTTAAATTAATTAATGATCTTGTTTTGATTTCTGATGTGGGTGTTTATGTTTT TGCAACAGAATCTGGTTTCCCTCACAACTACCTATTGGCTCTGTACCACTCACAGCAGTTAAAGGGAGATGCAGTGTATG AGATTGACCCTGCCAAGGATGCTGAGGCTCATGAGCTTTACCCTGATGTCAAATTCACCACTGCAGATGAATATTTGAAC CAGTTTGTCTGAATTATGAGGAATGCGTTTCTTTCACTCTGCAGATTGCTCAATAAAACCACTGTCCCCTTTTTTTGCCT TTTGAAAAAATAGCTTAAATTCTGATGTACCTCTACTGTTGTATTCTCTTCAATAATTCCTCCTCATTGATGTAATCTTC TACCAAACAAAATAATATTCTATATGTTCTCAAATTT
CDS sequence (LotjaGi2g1v0388100.7) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCAGAGAAGAGCAAGATCCTAGTCCTTGGAGGAACAGGTTACATTGGAAAATTCATAGTTGAGGCAAGTGTAAAAGA AGGGCACCCCACGTTTGCTTTGGTTAGGGAGAGCACGGTCTCTCATCCTGACAAGTCAAAGCTTATTGAATCCTTCAAGA GCCAAGGAGTTACCCTGCTTTATGGTGATCTTACTGATCATGAAAGCCTTGTTAAGGCAATCAAGCAAGTTGATGTTGTG ATCTCCACTGTAGGTGGACCACAGATTGATGACCAGCTGAAGCTTATAGCAGCAATCAAAGAAGCTGGAAACATCAAGAG GTTTTTCCCTTCTGAATTTGGGTTAGATGTGGACCGCCATGAAGCAGTGGACCCAGTGAGGGAAGTTTTCGTCGAAAAAG CAGGAATCAGAAGAGTAGTGGAAGCTGAAGGAATTCCTTACACTTACCTCTGTTGCCATGCCTTCACTGGTTACTTCTTG CGTAACTTGGCTCAACTTGATGCCACTGTTCCTCCTCGTGACAAGGTCATCATTCTAGGAGATGGAAATGTCAAAGGAGC TTATATCACTGAGGCAGATGTGGGGACTTTCACCGTCTTAGCCGCGAACGATCCCAGAACATTGAACAAGGCTGTCCACA TAAGACTCCCTGCTAATTATTTGACAGCAAATGAGATCATGGCATTGTGGGAGAAGAAGATTGGGAAGACTTTGGAGAAA ACCTATGTTCCTGAGGAACAAGTTCTTAAGGACATCAAGGAATCTGGTTTCCCTCACAACTACCTATTGGCTCTGTACCA CTCACAGCAGTTAAAGGGAGATGCAGTGTATGAGATTGACCCTGCCAAGGATGCTGAGGCTCATGAGCTTTACCCTGATG TCAAATTCACCACTGCAGATGAATATTTGAACCAGTTTGTCTGA
Protein sequence (LotjaGi2g1v0388100.7) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MAEKSKILVLGGTGYIGKFIVEASVKEGHPTFALVRESTVSHPDKSKLIESFKSQGVTLLYGDLTDHESLVKAIKQVDVV ISTVGGPQIDDQLKLIAAIKEAGNIKRFFPSEFGLDVDRHEAVDPVREVFVEKAGIRRVVEAEGIPYTYLCCHAFTGYFL RNLAQLDATVPPRDKVIILGDGNVKGAYITEADVGTFTVLAANDPRTLNKAVHIRLPANYLTANEIMALWEKKIGKTLEK TYVPEEQVLKDIKESGFPHNYLLALYHSQQLKGDAVYEIDPAKDAEAHELYPDVKFTTADEYLNQFV
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 307 | 307 | 3.3E-164 | – | |
| PANTHER | 1 | 307 | 307 | 3.3E-164 | – | |
| SUPERFAMILY | 4 | 281 | 278 | 5.24E-65 | ||
| CDD | 6 | 302 | 297 | 3.6514E-92 | – | |
| Gene3D | 7 | 291 | 285 | 1.5E-127 | – | |
| Pfam | 7 | 238 | 232 | 4.1E-84 | ||
| Gene3D | 152 | 302 | 151 | 1.5E-127 | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi2g1v0388100.7, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…