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Field | Value |
---|---|
Gene ID | LotjaGi2g1v0388100 |
Transcript ID | LotjaGi2g1v0388100.9 |
Related isoforms 9 | |
Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
Description | Isoflavone reductase homolog; TAIR: AT1G75280.1 NmrA-like negative transcriptional regulator family protein; Swiss-Prot: sp|P52575|IFR_MEDSA Isoflavone reductase; TrEMBL-Plants: tr|Q05JX7|Q05JX7_LOTJA Isoflavone reductase homolog; Found in the gene: LotjaGi2g1v0388100 |
Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:88441249..88462508) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TCAATTTTAAAATATTTTCTTAAAGCCGTCCCAATTCAATGAATTCGTAACACTAACTACCACAAAAAATAGCTGGACCA TTCCTTTGCTCCGCACAGCCCCAAAGTCACAAACACAGATTACTTTGATTTGAAGTTTAATCCTTTTGTTGCAATGGCAG AGAAGAGCAAGATCCTAGTCCTTGGAGGAACAGGTTACATTGGAAAATTCATAGTTGAGGCAAGTGTAAAAGAAGGGCAC CCCACGTTTGCTTTGGTTAGGGAGAGCACGGTCTCTCATCCTGACAAGTCAAAGCTTATTGAATCCTTCAAGAGCCAAGG AGTTACCCTGCTTTATGTTAGTGTCTTTCAATCACAGTTTCTTTTACACACAACTACCATTTCTAAGTCCAAATTCAAAT AAACTATTCTGATTTCTGACATGATTATTTCTCTGAATCTGATGTTGTAGGGTGATCTTACTGATCATGAAAGCCTTGTT AAGGCAATCAAGCAAGTTGATGTTGTGATCTCCACTGTAGGTGGACCACAGATTGATGACCAGCTGAAGCTTATAGCAGC AATCAAAGAAGCTGGAAACATCAAGGTGCACAAGTCTTCTTCTACAAAATAATAATTAAGTTTATATGCGTGTTTGGATG AACGTTGTTACAATCAATCAGTTATGGATAGAGTAGATTTTGGTAAAGTGTAGTGTGATTGAATTGATTTATGTTTAGAG TTTAGATACATTTATAAGAAAAATATTTTCGGAAAATAATGTTGGGGAATCCAATTGTGAAATTTCATGATTGGTCATAT CCACAACAAAATGGTGTTTAACTCTCATTTCATCACTGATCACTCATCAGAGGTTCCTCCCATCTGAATTTGGGCTGGAC GTTGACCGTCATCATGCAGTTGAGCCTGTGGTTAGCTTTTTTGAGCAAAAAGTGAAAATCCGGAGGGCAGTTGAAGCTGC 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CTTTCTGGCGGAGGAGGCGTGTATTTTTCAGGGGAGGCTTCCCTCTTTTTCTTTCTCCATAACCCAAAAATTTCTGGTTT ATGTCCTTAAGTTAATTTATTTGAGCAACTCTGTTTTGCTCTGTTCCTTGTCCTGTTCTTTGTTCTTTTTTCACTTTTCT GGGTTTGCGATTATGGGTTCTATGTGAGAAGAACAAAACGAAAACCTCTTTAATGTCACTTTTCTGGTTTACGTTTTGGA GTGAAATTGAAGAGGGTTAGATCTGATTGGAACAGTTCGTGAGTTTATTTTTTCCTCTTTCATTGTCGGTGGAATTTGTT TCTACTTTCTACTCTTTTTCTCCCCCTTTATTTTATTTTCTGGTGTGAAAACATAAAAGCAAATAGTTCTGTGTGCTGAA CAACTGTGAATTTTTCCAATCGTTCATGTTGAGATCTTTTGTTTTTTCATATGGGGTTTACTGTTTCGGTTGCCACCATT CGTTGCTTTGTCATGTGATTTTCAAAGTTTGATGCTTTTCAATTTTTCGTGATTGCCCTTTAAGTTTCCTAGTCGTTTCT TCTACTGGAGCATTGCTTTTTAGTTTTTTTTTTTCACTTTGCTCTTCAGTGTTCTGGTTCTAAAGCAATTCTTCAGAGTA AGTAAGCAAATGGTGAAGATAATGAAGAAGGATTAGAGTTAAAAAATTTAGGACTAAAGATTTGATTAGGGATTAAAGTT AAATAAATTAAGCTTTTCTTTAGAATTTTAAACAATTTTTTTTAATTAATTAGGTTTTTTTAATTTAAAAGAAAAATAAA TTCCACATCAGCTCATTAATCCCACGTGACCATGTCACATGGGGCCACCGGAGCTCCGGCGTTGATCCAGAGCTCCGGAG GGACCAAAACCAAACATTTTGGCAAAGGTTAGGGACTAAAACCCACCTTTACTCCGACGAGGGACGAAAACCAAGCATTT TGTAAAAGTTAGGGACAAAAACTTATTTAAGCCTAAAGTTTACAAAAAATACAGAATCAGTGGCCCCGATATGAAGACTA GTTGAAGGAGCCAATATGGACTAAAGAAGATGGCATTTGACTAGATGCATATCTGTTTAGTAGGTGTCAGGGGGTGGGTG GCTACACTGGGAACCTTATAAATACCAAGCAAAGTGTTGTTCTGTAACTCACTGCTTGTTTGATTACGTTCACTAGTGCC ACTACTGCTTGTGTTGTTAATTTCACAACAAATTAAGTTCTAATTGTTCTGATGGCACCACAAGACAGAATCCTTGTGAT CGGACCCACAGGAGCAATTGGAAGACATGTAATTTGGGCAAGTGTCAAAGCAGGAAACCCAACATACGCTTTGGTGAGGA AGAACAGTGTCACTATTGAGAAGCCAAAGCTCATCACAGCTGCTAATCCTGAAACCAAAGAAGAGCTCATCGACAACTTC AAAAGTTTAGGAGTTATTCTCCTAGAGGTATGTAAATATGTGACTTGAATATGTATATGAGTCTGTTTGATTGCGCGAAC ACTTATCGGAGCTTATTTGGTGCCTTTTTAGTAGATAAGCTCCAATAAGTGCTCTGTGTCCAAACAGGACATATATTCAT TTCAATTTTACAATTAATCTCAATTCTTCTGATTATGTTTGATTAATTGTGCATGATGCTGCAGGGTGACATAAGTGATC ATAATAGTTTGGTTAAGGCATTGAAGCAAGTTGATATTGTCATCTGCACAACAGGAAGACTTTTAATTCTAGATCAGGTC AAGATCATTGCAGCAATCAAGGAAGCTGGAAACATCAAAGTAACTAACTTATTTGTTCATTTTATTTAATAATTATCTCT GGTTCAATTTGCTTAGTGCTAATTGAATCTTGAATTTTGATGTGAAACAGAGGTTTTTCCCTTCTGAATTTGGGTTAGAT GTGGACCGCCATGAAGCAGTGGACCCAGTGAGGGAAGTTTTCGTCGAAAAAGCAGGAATCAGAAGAGTAGTGGAAGCTGA AGGAATTCCTTACACTTACCTCTGTTGCCATGCCTTCACTGGTTACTTCTTGCGTAACTTGGCTCAACTTGATGCCACTG TTCCTCCTCGTGACAAGGTCATCATTCTAGGAGATGGAAATGTCAAAGGTAATCATCTAACAATCACAAACATGAAACAC CTCAATTAGTCCATTCTAAACAGTTTTAGCACACACAGTAATGTTTGATGAATTGCTTCAATAAGGGTGTATATTGATTA TATATTTGATTTACTTGTTAATTTCAGGAGCTTATATCACTGAGGCAGATGTGGGGACTTTCACCGTCTTAGCCGCGAAC GATCCCAGAACATTGAACAAGGCTGTCCACATAAGACTCCCTGCTAATTATTTGACAGCAAATGAGATCATGGCATTGTG GGAGAAGAAGATTGGGAAGACTTTGGAGAAAACCTATGTTCCTGAGGAACAAGTTCTTAAGGACATCAAGGGTCAGTTAC AAAAACTCATTTTAATTAGACTTCACAATATTCAACTAAACATGAGTATTAATTATGTTACATACTTACATGCATCAATT TACTTAAATTAATTAATGATCTTGTTTTGATTTCTGATGTGGGTGTTTATGTTTTTGCAACAGAATCTGGTTTCCCTCAC AACTACCTATTGGCTCTGTACCACTCACAGCAGTTAAAGGGAGATGCAGTGTATGAGATTGACCCTGCCAAGGATGCTGA GGCTCATGAGCTTTACCCTGATGTCAAATTCACCACCGTAGATGAATATTTGAACCAGTTTGTCTGAATTTTGAGAAAAA AATGATTTATCAGGCTTTAAACTATTTCCATTGTTTGTTATTTGTGCCTGTCCTCTCGTGAATAATCACATCCCGTTGAT GTAATTCATTTTGAATAATATAATCTCTTTTGTCCTCCTATTGTATGGCTGCTCAGTGCTCACACTTGTTCATTGGACCT TTCTCCCGGCCACGGGACAAGAAAAAACAGGCAGGGGTGGAAATTAAATTAACATCACTA
CDS sequence (LotjaGi2g1v0388100.9) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCAGAGAAGAGCAAGATCCTAGTCCTTGGAGGAACAGGTTACATTGGAAAATTCATAGTTGAGGCAAGTGTAAAAGA AGGGCACCCCACGTTTGCTTTGGTTAGGGAGAGCACGGTCTCTCATCCTGACAAGTCAAAGCTTATTGAATCCTTCAAGA GCCAAGGAGTTACCCTGCTTTATGGTGATCTTACTGATCATGAAAGCCTTGTTAAGGCAATCAAGCAAGTTGATGTTGTG ATCTCCACTGTAGGTGGACCACAGATTGATGACCAGCTGAAGCTTATAGCAGCAATCAAAGAAGCTGGAAACATCAAGAG GTTTTTCCCTTCTGAATTTGGGTTAGATGTGGACCGCCATGAAGCAGTGGACCCAGTGAGGGAAGTTTTCGTCGAAAAAG CAGGAATCAGAAGAGTAGTGGAAGCTGAAGGAATTCCTTACACTTACCTCTGTTGCCATGCCTTCACTGGTTACTTCTTG CGTAACTTGGCTCAACTTGATGCCACTGTTCCTCCTCGTGACAAGGTCATCATTCTAGGAGATGGAAATGTCAAAGGAGC TTATATCACTGAGGCAGATGTGGGGACTTTCACCGTCTTAGCCGCGAACGATCCCAGAACATTGAACAAGGCTGTCCACA TAAGACTCCCTGCTAATTATTTGACAGCAAATGAGATCATGGCATTGTGGGAGAAGAAGATTGGGAAGACTTTGGAGAAA ACCTATGTTCCTGAGGAACAAGTTCTTAAGGACATCAAGGAATCTGGTTTCCCTCACAACTACCTATTGGCTCTGTACCA CTCACAGCAGTTAAAGGGAGATGCAGTGTATGAGATTGACCCTGCCAAGGATGCTGAGGCTCATGAGCTTTACCCTGATG TCAAATTCACCACCGTAGATGAATATTTGAACCAGTTTGTCTGA
Protein sequence (LotjaGi2g1v0388100.9) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MAEKSKILVLGGTGYIGKFIVEASVKEGHPTFALVRESTVSHPDKSKLIESFKSQGVTLLYGDLTDHESLVKAIKQVDVV ISTVGGPQIDDQLKLIAAIKEAGNIKRFFPSEFGLDVDRHEAVDPVREVFVEKAGIRRVVEAEGIPYTYLCCHAFTGYFL RNLAQLDATVPPRDKVIILGDGNVKGAYITEADVGTFTVLAANDPRTLNKAVHIRLPANYLTANEIMALWEKKIGKTLEK TYVPEEQVLKDIKESGFPHNYLLALYHSQQLKGDAVYEIDPAKDAEAHELYPDVKFTTVDEYLNQFV
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
---|---|---|---|---|---|---|
PANTHER | 1 | 307 | 307 | 2.4E-164 | – | |
PANTHER | 1 | 307 | 307 | 2.4E-164 | – | |
SUPERFAMILY | 4 | 281 | 278 | 5.24E-65 | ||
CDD | 6 | 302 | 297 | 7.36571E-93 | – | |
Gene3D | 7 | 291 | 285 | 5.6E-128 | – | |
Pfam | 7 | 238 | 232 | 4.1E-84 | ||
Gene3D | 152 | 302 | 151 | 5.6E-128 | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi2g1v0388100.9, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…